Russell
BigY3: 133769, FTDNA: 133769, BigY2: 133769Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | BigY3 133769 | FTDNA 133769 | BigY2 133769 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
56834263-C-A | A* | |||||||||
56832651-C-A | A* | |||||||||
6040928-C-CA | 6172887-C-CA | 12×A | A* | |||||||
6092837-G-A | 6224796-G-A | A* | ||||||||
6228911-C-G | 6360870-C-G | IR3_Dst | A* | |||||||
13937313-C-T | 11816607-C-T | FT216188 | Y | Y | + | |||||
4056275-C-T | 4188234-C-T | + | ||||||||
9154466-G-T | 9316857-G-T | BY78611 | Y | + | + | + | ||||
7820539-A-C | 7952498-A-C | BY67942 | Y | Y | + | + | + | |||
7820526-G-A | 7952485-G-A | BY67941 | Y | Y | + | + | + | |||
3685768-G-T | 3817727-G-T | FT214292 | + | |||||||
22669462-A-G | 20507576-A-G | BY139902 | Y | Y | + | + | + | |||
18938836-T-A | 16826956-T-A | BY124937 | Y | Y | + | + | + | |||
21932534-G-T | 19770648-G-T | FT218090 | Y | Y | + | ** | ||||
21361611-T-C | 19199725-T-C | BY132340 | Y | Y | + | + | + | |||
28691266-A-G | 26545119-A-G | FT218708 | + | |||||||
5608174-CACAT-C | 5740133-CACAT-C | * | ||||||||
15080594-T-G | 12968684-T-G | ** | ||||||||
14985062-C-A | 12873130-C-A | ** | ||||||||
14967281-C-A | 12855356-C-A | ** | ||||||||
14909620-C-A | 12797687-C-A | ** | ||||||||
15145091-AGGAG-A | 13033178-AGGAG-A | ** | ||||||||
14788818-G-T | 12676889-G-T | ** | ||||||||
14779487-T-G | 12667557-T-G | FTA39293 | ** | |||||||
15080587-C-A | 12968677-C-A | ** | ||||||||
15178317-A-G | 13066403-A-G | ** | ||||||||
14724414-C-A | 12612482-C-A | ** | ||||||||
15210923-T-A | 13099009-T-A | ** | ||||||||
15222050-A-G | 13110136-A-G | ** | ||||||||
15287891-C-A | 13175990-C-A | ** | ||||||||
15363864-T-A | 13251984-T-A | ** | ||||||||
15423366-T-G | 13311486-T-G | ** | ||||||||
15432863-A-C | 13320983-A-C | FT101903 | ** | |||||||
15434309-G-A | 13322429-G-A | ** | ||||||||
15446760-A-C | 13334880-A-C | ** | ||||||||
15490562-G-A | 13378682-G-A | ** | ||||||||
15496417-C-A | 13384537-C-A | ** | ||||||||
14779480-TA-T | 12667550-TA-T | ** | ||||||||
14485198-G-T | 12364467-G-T | ** | ||||||||
14689058-C-A | 12577124-C-A | ** | ||||||||
14226404-A-C | 12105698-A-C | ** | ||||||||
13958324-G-A | 11837618-G-A | FT81855 | ** | |||||||
14009260-T-A | 11888554-T-A | ** | ||||||||
14046787-G-A | 11926081-G-A | ** | ||||||||
14073168-G-T | 11952462-G-T | ** | ||||||||
14153200-T-C | 12032494-T-C | ** | ||||||||
14175556-C-A | 12054850-C-A | ** | ||||||||
14177934-C-A | 12057228-C-A | ** | ||||||||
14187334-G-A | 12066628-G-A | ** | ||||||||
14205027-C-A | 12084321-C-A | ** | ||||||||
14273086-G-T | 12152380-G-T | ** | ||||||||
14609612-A-T | 12497814-A-T | ** | ||||||||
14310379-C-A | 12189673-C-A | FTA23397 | ** | |||||||
14379445-A-C | 12258741-A-C | ** | ||||||||
14470310-A-G | 12349579-A-G | ** | ||||||||
15612246-A-G | 13500366-A-G | ** | ||||||||
14495576-T-C | 12383773-T-C | FT126709 | ** | |||||||
14500048-G-T | 12388253-G-T | ** | ||||||||
14500088-G-T | 12388293-G-T | ** | ||||||||
14585804-A-T | 12474004-A-T | ** | ||||||||
14593073-C-A | 12481273-C-A | ** | ||||||||
15600164-T-C | 13488284-T-C | ** | ||||||||
15790533-AACCC-A | 13678653-AACCC-A | ** | ||||||||
15612318-C-A | 13500438-C-A | ** | ||||||||
16612673-G-T | 14500793-G-T | ** | ||||||||
16278018-G-T | 14166138-G-T | ** | ||||||||
16312540-T-G | 14200660-T-G | ** | ||||||||
16319636-T-A | 14207756-T-A | ** | ||||||||
16340992-A-T | 14229112-A-T | ** | ||||||||
16341118-C-A | 14229238-C-A | ** | ||||||||
16349912-T-A | 14238032-T-A | ** | ||||||||
16485841-C-A | 14373961-C-A | FT329998 | ** | |||||||
16568208-T-A | 14456328-T-A | ** | ||||||||
16568246-C-A | 14456366-C-A | ** | ||||||||
16625847-G-A | 14513967-G-A | ** | ||||||||
16271890-C-A | 14160010-C-A | ** | ||||||||
16648420-C-G | 14536540-C-G | ** | ||||||||
16760121-C-A | 14648241-C-A | ** | ||||||||
16999371-C-G | 14887491-C-G | ** | ||||||||
17012881-T-C | 14901001-T-C | ** | ||||||||
17013243-A-G | 14901363-A-G | ** | ||||||||
17030612-A-C | 14918732-A-C | ** | ||||||||
17038488-C-A | 14926608-C-A | ** | ||||||||
17039220-C-A | 14927340-C-A | ** | ||||||||
17181482-CTAAAACACTAAAAACAATT-C | 15069602-CTAAAACACTAAAAACAATT-C | ** | ||||||||
16276162-A-C | 14164282-A-C | ** | ||||||||
16171417-T-C | 14059537-T-C | ** | ||||||||
15680116-T-C | 13568236-T-C | ** | ||||||||
15918607-C-G | 13806727-C-G | ** | ||||||||
15698524-C-A | 13586644-C-A | ** | ||||||||
15709291-C-A | 13597411-C-A | ** | ||||||||
15712005-A-C | 13600125-A-C | ** | ||||||||
15733025-C-G | 13621145-C-G | ** | ||||||||
15739822-AGCAAT-A | 13627942-AGCAAT-A | ** | ||||||||
15786069-A-C | 13674189-A-C | ** | ||||||||
13907921-A-C | 11787215-A-C | ** | ||||||||
15860265-A-T | 13748385-A-T | ** | ||||||||
15873526-A-C | 13761646-A-C | ** | ||||||||
15936881-A-G | 13825001-A-G | ** | ||||||||
16089664-C-A | 13977784-C-A | ** | ||||||||
15940221-G-T | 13828341-G-T | ** | ||||||||
16010717-C-A | 13898837-C-A | ** | ||||||||
16016428-G-C | 13904548-G-C | ** | ||||||||
16016431-T-G | 13904551-T-G | ** | ||||||||
16039307-A-G | 13927427-A-G | ** | ||||||||
16039329-C-A | 13927449-C-A | ** | ||||||||
16056203-T-G | 13944323-T-G | ** | ||||||||
16057395-C-A | 13945515-C-A | FT109253 | ** | |||||||
16057396-A-C | 13945516-A-C | ** | ||||||||
16066616-C-T | 13954736-C-T | ** | ||||||||
13929440-C-A | 11808734-C-A | ** | ||||||||
11676332-G-C | ** | |||||||||
13902846-T-C | 11782140-T-C | ** | ||||||||
10776457-T-A | ** | |||||||||
9998683-A-G | 10161074-A-G | ** | ||||||||
10009437-C-A | 10171828-C-A | ** | ||||||||
10029263-T-G | 10191654-T-G | ** | ||||||||
10063610-G-C | 10226001-G-C | ** | ||||||||
10624432-C-A | ** | |||||||||
10667039-C-CGGAAG | ** | |||||||||
10673825-C-G | ** | |||||||||
10747422-C-G | ** | |||||||||
10769463-T-A | ** | |||||||||
10781828-T-C | ** | |||||||||
9963391-T-G | 10125782-T-G | ** | ||||||||
10792228-A-C | ** | |||||||||
10795162-C-A | ** | |||||||||
10818697-A-T | ** | |||||||||
10818710-C-G | ** | |||||||||
10822518-C-T | ** | |||||||||
10826827-T-A | ** | |||||||||
10826843-CCATTT-C | ** | |||||||||
10826854-C-T | ** | |||||||||
10829045-C-A | ** | |||||||||
9998602-G-T | 10160993-G-T | ** | ||||||||
9955463-GC-G | 10117854-GC-G | ** | ||||||||
10829254-A-G | ** | |||||||||
9069962-T-A | 9232353-T-A | ** | ||||||||
8762008-C-A | 8893967-C-A | ** | ||||||||
8766422-G-A | 8898381-G-A | ** | ||||||||
8776696-C-A | 8908655-C-A | ** | ||||||||
8812083-T-C | 8944042-T-C | ** | ||||||||
8974841-G-T | 9137232-G-T | ** | ||||||||
8983593-T-G | 9145984-T-G | ** | ||||||||
9015956-C-A | 9178347-C-A | ** | ||||||||
9055538-G-T | 9217929-G-T | ** | ||||||||
9063803-C-A | 9226194-C-A | ** | ||||||||
9171584-A-G | 9333975-A-G | ** | ||||||||
9918230-G-T | 10080621-G-T | ** | ||||||||
9307700-C-A | 9470091-C-A | ** | ||||||||
9415936-C-A | 9578327-C-A | ** | ||||||||
9415948-C-A | 9578339-C-A | ** | ||||||||
9474167-T-C | 9636558-T-C | ** | ||||||||
9527367-T-TG | 9689758-T-TG | ** | ||||||||
9595082-GCTTTTTTT-G | 9757473-GCTTTTTTT-G | IR3_Prx | ** | |||||||
5415322-G-C | 5547281-G-C | ** | ** | |||||||
9885041-T-C | 10047432-T-C | ** | ||||||||
9891045-T-A | 10053436-T-A | ** | ||||||||
9892729-C-A | 10055120-C-A | ** | ||||||||
10829079-T-C | ** | |||||||||
10829261-C-T | ** | |||||||||
13887490-T-C | 11766784-T-C | ** | ||||||||
13724655-A-G | 11568979-A-G | ** | ||||||||
13453275-A-T | 11297599-A-T | ** | ||||||||
13453290-A-G | 11297614-A-G | ** | ||||||||
13457610-T-C | 11301934-T-C | ** | ||||||||
13473429-C-A | 11317753-C-A | ** | ||||||||
13482524-G-A | 11326848-G-A | ** | ||||||||
13515998-T-C | 11360322-T-C | ** | ||||||||
13597547-C-A | 11441871-C-A | ** | ||||||||
13642613-A-G | 11486937-A-G | ** | ||||||||
13695499-C-T | 11539823-C-T | ** | ||||||||
11648447-A-G | ** | |||||||||
13402587-C-A | 11246911-C-A | ** | ||||||||
11648542-T-C | ** | |||||||||
11659136-G-T | ** | |||||||||
11666064-G-T | ** | |||||||||
17224470-A-G | 15112590-A-G | ** | ||||||||
11676354-C-T | ** | |||||||||
11677635-A-G | ** | |||||||||
13838375-T-C | 11717669-T-C | ** | ||||||||
13858746-A-C | 11738040-A-C | ** | ||||||||
13858788-T-A | 11738082-T-A | ** | ||||||||
13446740-AACTC-A | 11291064-AACTC-A | ** | ||||||||
13309742-A-T | 11154066-A-T | ** | ||||||||
10829269-A-C | ** | |||||||||
10962913-C-A | ** | |||||||||
10829283-ATTCCT-A | ** | |||||||||
10829294-C-A | ** | |||||||||
10829329-C-A | FT90204 | ** | ||||||||
10829351-C-T | ** | |||||||||
10829668-T-G | ** | |||||||||
10830843-G-T | ** | |||||||||
10841906-C-T | ** | |||||||||
10874905-G-T | ** | |||||||||
10932656-A-C | ** | |||||||||
10962929-A-G | ** | |||||||||
13304389-T-C | 11148713-T-C | ** | ||||||||
10962934-A-T | ** | |||||||||
10987914-C-A | ** | |||||||||
11021324-T-C | ** | |||||||||
11021329-C-G | ** | |||||||||
13194284-C-G | 11038608-C-G | ** | ||||||||
13194296-A-C | 11038620-A-C | ** | ||||||||
13195920-G-T | 11040244-G-T | ** | ||||||||
13215900-A-C | 11060224-A-C | ** | ||||||||
13278580-C-G | 11122904-C-G | ** | ||||||||
13294214-A-C | 11138538-A-C | ** | ||||||||
17217087-G-A | 15105207-G-A | F21498 | ** | |||||||
17576229-A-G | 15464349-A-G | ** | ||||||||
17230519-A-C | 15118639-A-C | ** | ||||||||
23838924-G-C | 21677038-G-C | ** | ||||||||
23448994-C-A | 21287108-C-A | ** | ||||||||
23475408-T-G | 21313522-T-G | ** | ||||||||
23475411-T-G | 21313525-T-G | ** | ||||||||
23516437-G-T | 21354551-G-T | ** | ||||||||
23625457-C-A | 21463571-C-A | ** | ||||||||
23773400-C-A | 21611514-C-A | ** | ||||||||
23802252-T-A | 21640366-T-A | ** | ||||||||
23817378-G-A | 21655492-G-A | ** | ||||||||
23817872-G-T | 21655986-G-T | ** | ||||||||
23848133-A-C | 21686247-A-C | ** | ||||||||
23373144-TA-T | 21211258-TA-T | ** | ||||||||
23881859-C-T | 21719973-C-T | ** | ||||||||
23885201-TG-T | 21723315-TG-T | ** | ||||||||
24148068-T-G | 22001921-T-G | P3_b1 | ** | |||||||
24210697-G-A | 22064550-G-A | P3_b1 | ** | |||||||
24363633-CTTTTTT-C | 22217486-CTTTTTT-C | 16×T | ** | |||||||
24459300-C-A | 22313153-C-A | ** | ||||||||
24503044-T-C | 22356897-T-C | ** | ||||||||
24910927-A-C | 22764780-A-C | g1 | ** | |||||||
24910936-G-C | 22764789-G-C | g1 | ** | |||||||
23380978-C-T | 21219092-C-T | ** | ||||||||
23345595-A-T | 21183709-A-T | ** | ||||||||
25521095-G-C | 23374948-G-C | P1_gr1 | ** | |||||||
23091516-C-G | 20929630-C-G | ** | ||||||||
22167310-GA-G | 20005424-GA-G | ** | ||||||||
22183067-T-C | 20021181-T-C | ** | ||||||||
22303554-C-A | 20141668-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22855055-G-A | 20693169-G-A | ** | ||||||||
22965207-C-T | 20803321-C-T | ** | ||||||||
23002846-T-G | 20840960-T-G | ** | ||||||||
23036894-A-C | 20875008-A-C | ** | ||||||||
23049745-G-A | 20887859-G-A | ** | ||||||||
23049775-A-G | 20887889-A-G | ** | ||||||||
23105990-A-C | 20944104-A-C | ** | ||||||||
23321559-T-G | 21159673-T-G | ** | ||||||||
23105997-T-C | 20944111-T-C | ** | ||||||||
23193210-G-A | 21031324-G-A | FGC54657 | ** | |||||||
23198859-G-T | 21036973-G-T | ** | ||||||||
23199928-A-T | 21038042-A-T | ** | ||||||||
23200048-G-T | 21038162-G-T | ** | ||||||||
23255920-C-A | 21094034-C-A | ** | ||||||||
23263744-G-GA | 21101858-G-GA | ** | ||||||||
23273939-T-C | 21112053-T-C | ** | ||||||||
23291247-T-A | 21129361-T-A | ** | ||||||||
23291305-C-T | 21129419-C-T | ** | ||||||||
25421534-C-A | 23275387-C-A | P2_r2 | ** | |||||||
25881891-T-C | 23735744-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
22122851-A-C | 19960965-A-C | ** | ||||||||
5114718-T-C | 5246677-T-C | ** | ||||||||
56756835-A-T | ** | |||||||||
56830296-T-TCATTTCCTTA | ** | |||||||||
56846437-G-T | ** | |||||||||
56848458-G-C | ** | |||||||||
31860-G-C | ** | |||||||||
19610124-CTT-C | 17498244-CTT-C | P5_Prx | 32×T | ** | ||||||
18353713-T-C | 16241833-T-C | P6_Prx | ** | |||||||
14564948-G-A | 12453148-G-A | ** | ||||||||
4848342-T-TAA | 4980301-T-TAA | 10×A | ** | |||||||
6374322-C-A | 6506281-C-A | ** | ||||||||
28768273-A-G | 26622126-A-G | ** | ||||||||
8754443-G-A | 8886402-G-A | ** | ||||||||
16167357-C-CAT | 14055477-C-CAT | P8_Dst | ** | |||||||
17843152-C-T | 15731272-C-T | ** | ||||||||
18287938-A-T | 16176058-A-T | P6_Prx | ** | |||||||
18891020-A-G | 16779140-A-G | ** | ||||||||
20790966-A-AC | 18629080-A-AC | P4_Prx | ** | |||||||
20798747-A-G | 18636861-A-G | P4_Prx | ** | |||||||
27641436-A-G | 25495289-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
28749026-A-G | 26602879-A-G | ** | ||||||||
28788550-T-A | 26642403-T-A | ** | ||||||||
28764859-C-A | 26618712-C-A | ** | ||||||||
26100558-C-T | 23954411-C-T | P1_Y1 | ** | |||||||
28519580-A-T | 26373433-A-T | ** | ||||||||
26204657-T-G | 24058510-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26228728-G-GT | 24082581-G-GT | P1_Y1 | ** | |||||||
26292438-G-T | 24146291-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26379328-T-A | 24233181-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27507522-G-T | 25361375-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27507700-G-T | 25361553-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27595891-T-C | 25449744-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28016120-A-AG | 25869973-A-AG | P1_Y2 | ** | |||||||
28513481-C-A | 26367334-C-A | ** | ||||||||
28538633-A-C | 26392486-A-C | ** | ||||||||
28756984-A-G | 26610837-A-G | ** | ||||||||
28613791-G-GT | 26467644-G-GT | ** | ||||||||
28618260-T-G | 26472113-T-G | ** | ||||||||
28621364-G-A | 26475217-G-A | ** | ||||||||
28653378-A-G | 26507231-A-G | ** | ||||||||
28660794-T-A | 26514647-T-A | ** | ||||||||
28714442-A-G | 26568295-A-G | ** | ||||||||
28714459-T-C | 26568312-T-C | ** | ||||||||
28724808-A-C | 26578661-A-C | ** | ||||||||
28729284-G-T | 26583137-G-T | ** | ||||||||
28734918-C-A | 26588771-C-A | ** | ||||||||
22134143-G-T | 19972257-G-T | ** | ||||||||
22052778-C-A | 19890892-C-A | ** | ||||||||
17254783-T-A | 15142903-T-A | ** | ||||||||
18731461-A-G | 16619581-A-G | ** | ||||||||
18278107-G-C | 16166227-G-C | P6_Prx | ** | |||||||
18296602-G-A | 16184722-G-A | P6_Prx | ** | |||||||
18346457-G-T | 16234577-G-T | P6_Prx | ** | |||||||
18388348-G-T | 16276468-G-T | P6_Gap | ** | |||||||
18434863-GA-G | 16322983-GA-G | P6_Dst | ** | |||||||
18565015-T-A | 16453135-T-A | ** | ||||||||
18632360-C-A | 16520480-C-A | ** | ||||||||
18673687-C-A | 16561807-C-A | ** | ||||||||
18731437-C-G | 16619557-C-G | ** | ||||||||
18794274-A-C | 16682394-A-C | ** | ||||||||
18266208-C-A | 16154328-C-A | ** | ||||||||
18799982-A-T | 16688102-A-T | ** | ||||||||
18910963-T-G | 16799083-T-G | ** | ||||||||
18929902-C-A | 16818022-C-A | ** | ||||||||
18932671-C-T | 16820791-C-T | ** | ||||||||
18932791-T-C | 16820911-T-C | ** | ||||||||
18947890-T-C | 16836010-T-C | ** | ||||||||
18989721-G-A | 16877841-G-A | ** | ||||||||
19031368-C-T | 16919488-C-T | FTA5314 | ** | |||||||
19067974-C-G | 16956094-C-G | ** | ||||||||
18268052-C-A | 16156172-C-A | ** | ||||||||
18239019-C-A | 16127139-C-A | ** | ||||||||
19235776-C-A | 17123896-C-A | ** | ||||||||
17716772-A-C | 15604892-A-C | ** | ||||||||
17326737-A-T | 15214857-A-T | FGC41815 | ** | |||||||
17343060-A-C | 15231180-A-C | ** | ||||||||
17464835-G-T | 15352955-G-T | ** | ||||||||
17466760-T-A | 15354880-T-A | ** | ||||||||
17505052-G-T | 15393172-G-T | ** | ||||||||
17534628-G-T | 15422748-G-T | ** | ||||||||
8735648-C-T | 8867607-C-T | ** | ||||||||
17692015-G-A | 15580135-G-A | ** | ||||||||
17713966-A-T | 15602086-A-T | ** | ||||||||
17726044-G-T | 15614164-G-T | ** | ||||||||
18212660-C-A | 16100780-C-A | ** | ||||||||
17741444-G-T | 15629564-G-T | ** | ||||||||
17802165-GT-A | 15690285-GT-A | ** | ||||||||
17850106-G-T | 15738226-G-T | ** | ||||||||
17860029-G-T | 15748149-G-T | ** | ||||||||
17876571-C-A | 15764691-C-A | ** | ||||||||
17997772-G-T | 15885892-G-T | P7_Gap | ** | |||||||
18059946-C-A | 15948066-C-A | ** | ||||||||
18153833-C-A | 16041953-C-A | ** | ||||||||
18174898-T-G | 16063018-T-G | ** | ||||||||
18194470-C-A | 16082590-C-A | ** | ||||||||
19091570-C-G | 16979690-C-G | ** | ||||||||
19247118-C-A | 17135238-C-A | ** | ||||||||
22018081-G-A | 19856195-G-A | ** | ||||||||
21668780-A-T | 19506894-A-T | ** | ||||||||
21189667-TC-A | 19027781-TC-A | ** | ||||||||
21207591-G-C | 19045705-G-C | ** | ||||||||
21267547-C-A | 19105661-C-A | ** | ||||||||
21376663-T-C | 19214777-T-C | ** | ||||||||
21383460-C-T | 19221574-C-T | ** | ||||||||
21384939-C-A | 19223053-C-A | ** | ||||||||
21412297-TAC-T | 19250411-TAC-T | ** | ||||||||
21446291-T-C | 19284405-T-C | ** | ||||||||
21544679-C-A | 19382793-C-A | ** | ||||||||
21695049-G-A | 19533163-G-A | ** | ||||||||
21139658-A-T | 18977772-A-T | ** | ||||||||
21720473-C-A | 19558587-C-A | ** | ||||||||
21771631-C-G | 19609745-C-G | ** | ||||||||
21856672-C-A | 19694786-C-A | ** | ||||||||
21890859-A-G | 19728973-A-G | ** | ||||||||
21895525-A-G | 19733639-A-G | ** | ||||||||
21926559-C-A | 19764673-C-A | ** | ||||||||
21947234-C-T | 19785348-C-T | ** | ||||||||
21956277-G-T | 19794391-G-T | ** | ||||||||
21984038-C-A | 19822152-C-A | ** | ||||||||
21154063-C-G | 18992177-C-G | ** | ||||||||
21115832-G-A | 18953946-G-A | ** | ||||||||
19304696-C-A | 17192816-C-A | ** | ||||||||
19531489-C-G | 17419609-C-G | ** | ||||||||
19304738-G-A | 17192858-G-A | ** | ||||||||
19369432-T-G | 17257552-T-G | ** | ||||||||
19379629-G-T | 17267749-G-T | ** | ||||||||
19389719-A-AT | 17277839-A-AT | ** | ||||||||
19433161-A-G | 17321281-A-G | ** | ||||||||
19459152-G-A | 17347272-G-A | ** | ||||||||
19510211-T-G | 17398331-T-G | ** | ||||||||
19510286-T-TA | 17398406-T-TA | ** | ||||||||
19517682-C-G | 17405802-C-G | ** | ||||||||
19537808-C-T | 17425928-C-T | ** | ||||||||
20850693-G-GTATGTA | 18688807-G-GTATGTA | P4_Dst | 12×TA | ** | ||||||
19663295-G-T | 17551415-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19718023-A-AT | 17606143-A-AT | P5_Prx | ** | |||||||
20019167-A-C | 17907287-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
20019187-T-TG | 17907307-T-TG | P5_Prx | ** | |||||||
20022346-C-A | 17910466-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
20322185-T-TG | 18160299-T-TG | P5_Dst | ** | |||||||
20322208-A-G | 18160322-A-G | P5_Dst | ** | |||||||
20340177-C-T | 18178291-C-T | P5_Dst | ** | |||||||
20614691-T-C | 18452805-T-C | P4_Prx | ** | |||||||
20629094-C-CCT | 18467208-C-CCT | P4_Prx | ** | |||||||
8761496-A-C | 8893455-A-C | ** | ||||||||
9884983-G-A | 10047374-G-A | ** | ||||||||
10663391-ACT-A | ** | |||||||||
2778393-C-A | 2910352-C-A | ** | ||||||||
20693838-C-A | 18531952-C-A | P4_Prx | ** | |||||||
14871359-C-A | 12759429-C-A | ** | ||||||||
21235175-C-A | 19073289-C-A | ** | ||||||||
10667014-C-CGGGTTA | ** | |||||||||
6756897-A-G | 6888856-A-G | ** | ||||||||
13695476-G-A | 11539800-G-A | ** | ||||||||
22077357-TAAA-T | 19915471-TAAA-T | 14×A | ** | |||||||
10685614-C-A | ** | |||||||||
23997507-C-A | 21851360-C-A | ** | ||||||||
14296296-C-A | 12175590-C-A | ** | ||||||||
3883368-GA-G | 4015327-GA-G | 11×A | ** | |||||||
18906289-C-A | 16794409-C-A | ** | ||||||||
7195306-GCAA-G | 7327265-GCAA-G | ** | ||||||||
21363071-C-A | 19201185-C-A | ** | ||||||||
7081390-C-A | 7213349-C-A | ** | ||||||||
21464536-C-CAA | 19302650-C-CAA | 19×A | ** | |||||||
10657412-T-A | ** | |||||||||
17735527-C-A | 15623647-C-A | ** | ||||||||
21505574-G-T | 19343688-G-T | ** | ||||||||
8728129-C-A | 8860088-C-A | ** | ||||||||
19847697-A-T | 17735817-A-T | P5_Prx | ** | |||||||
5785350-C-A | 5917309-C-A | ** | ||||||||
4928762-A-G | 5060721-A-G | ** | ||||||||
2817890-CA-C | 2949849-CA-C | 9×A | ** | |||||||
19125080-C-A | 17013200-C-A | ** | ||||||||
6147492-A-G | 6279451-A-G | IR3_Dst | ** | |||||||
4302143-C-A | 4434102-C-A | ** | ||||||||
23345659-C-A | 21183773-C-A | ** | ||||||||
6492558-C-A | 6624517-C-A | ** | ||||||||
3922978-C-A | 4054937-C-A | ** | ||||||||
5415322-G-GTATC | 5547281-G-GTATC | ** | ||||||||
10894676-C-A | ** | |||||||||
5366481-C-A | 5498440-C-A | ** | ||||||||
24447109-GA-G | 22300962-GA-G | ** | ||||||||
56848457-C-T | ** | |||||||||
4081613-C-A | 4213572-C-A | ** | ||||||||
14819702-C-A | 12707769-C-A | ** | ||||||||
15859473-G-T | 13747593-G-T | ** | ||||||||
20793454-AT-A | 18631568-AT-A | P4_Prx | ** | |||||||
56742724-A-G | ** | |||||||||
19128784-C-A | 17016904-C-A | ** | ||||||||
9423100-C-A | 9585491-C-A | ** | ||||||||
11026089-A-T | ** | |||||||||
22165188-G-A | 20003302-G-A | ** | ||||||||
24597815-T-TG | 22451668-T-TG | P3_t2 | ** | |||||||
16305914-G-C | 14194034-G-C | ** | ||||||||
18564359-C-A | 16452479-C-A | ** | ||||||||
10842561-T-C | ** | |||||||||
6784595-C-A | 6916554-C-A | ** | ||||||||
6756907-TC-T | 6888866-TC-T | ** | ||||||||
6129493-C-A | 6261452-C-A | ** | ||||||||
26161193-T-C | 24015046-T-C | BY226704 | P1_Y1 | ** | ||||||
22739620-G-A | 20577734-G-A | ** | ||||||||
17885665-G-T | 15773785-G-T | ** | ||||||||
7319186-C-A | 7451145-C-A | ** | ||||||||
2791522-G-T | 2923481-G-T | ** | ||||||||
4929363-C-A | 5061322-C-A | ** | ||||||||
23564719-C-A | 21402833-C-A | ** | ||||||||
8735139-C-A | 8867098-C-A | ** | ||||||||
10987761-T-G | ** | |||||||||
7101027-G-T | 7232986-G-T | ** | ||||||||
17889848-C-A | 15777968-C-A | ** | ||||||||
5267085-G-A | 5399044-G-A | ** | ||||||||
23438782-C-A | 21276896-C-A | ** | ||||||||
2813724-C-A | 2945683-C-A | ** | ||||||||
26228735-TC-T | 24082588-TC-T | P1_Y1 | ** | |||||||
7535998-C-G | 7667957-C-G | ** | ||||||||
7536049-A-C | 7668008-A-C | ** | ||||||||
28722245-C-A | 26576098-C-A | FT106442 | ** | |||||||
14776844-C-A | 12664913-C-A | ** | ||||||||
17310916-G-T | 15199036-G-T | ** | ||||||||
8631410-G-TT | 8763369-G-TT | ** | ||||||||
8124910-G-A | 8256869-G-A | ** | ||||||||
13463995-G-C | 11308319-G-C | ** | ||||||||
3389126-A-T | 3521085-A-T | ** | ||||||||
4444781-G-T | 4576740-G-T | ** | ||||||||
7418404-C-A | 7550363-C-A | ** | ||||||||
10826824-T-C | ** | |||||||||
10925475-A-C | ** | |||||||||
15787951-C-A | 13676071-C-A | FTB77995 | ** | |||||||
22869070-C-A | 20707184-C-A | ** | ||||||||
15556659-C-A | 13444779-C-A | ** | ||||||||
11021615-T-G | ** | |||||||||
10887954-C-A | ** | |||||||||
28519629-C-A | 26373482-C-A | ** | ||||||||
10818712-C-G | ** | |||||||||
23255242-C-A | 21093356-C-A | ** | ||||||||
15927780-C-A | 13815900-C-A | ** | ||||||||
10877703-C-A | ** | |||||||||
18825660-T-A | 16713780-T-A | ** | ||||||||
23337379-G-T | 21175493-G-T | ** | ||||||||
10890283-C-A | ** | |||||||||
21262728-C-A | 19100842-C-A | ** | ||||||||
17946956-C-T | 15835076-C-T | ** | ||||||||
19476624-C-A | 17364744-C-A | ** | ||||||||
22165201-TC-T | 20003315-TC-T | ** | ||||||||
3651351-G-T | 3783310-G-T | ** | ||||||||
6147529-C-A | 6279488-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
16121685-A-AC | 14009805-A-AC | P8_Prx | ** | |||||||
10776463-G-A | ** | |||||||||
22868690-C-A | 20706804-C-A | ** | ||||||||
23438869-A-G | 21276983-A-G | ** | ||||||||
7861245-C-A | 7993204-C-A | ** | ||||||||
23377863-A-T | 21215977-A-T | ** | ||||||||
15276865-T-G | 13164954-T-G | ** | ||||||||
15406889-G-A | 13295009-G-A | ** | ||||||||
22811936-C-A | 20650050-C-A | ** | ||||||||
10759900-C-CATTTG | ** | |||||||||
21550129-C-A | 19388243-C-A | ** | ||||||||
8389597-G-A | 8521556-G-A | ** | ||||||||
21079138-C-A | 18917252-C-A | ** | ||||||||
21153765-G-T | 18991879-G-T | ** | ||||||||
13893559-C-A | 11772853-C-A | ** | ||||||||
19071416-C-A | 16959536-C-A | ** | ||||||||
28547523-C-A | 26401376-C-A | ** | ||||||||
6241007-T-A | 6372966-T-A | IR3_Dst | ** | |||||||
15556689-A-C | 13444809-A-C | ** | ||||||||
7994270-C-A | 8126229-C-A | ** | ||||||||
14147003-C-A | 12026297-C-A | ** | ||||||||
15179192-C-A | 13067278-C-A | ** | ||||||||
15650430-C-A | 13538550-C-A | ** | ||||||||
10860873-G-T | ** | |||||||||
4561546-C-A | 4693505-C-A | ** | ||||||||
10962915-T-A | ** | |||||||||
14147840-C-T | 12027134-C-T | ** | ||||||||
23633394-A-T | 21471508-A-T | ** | ||||||||
5191260-C-A | 5323219-C-A | ** | ||||||||
16944523-C-A | 14832643-C-A | Y97759 | ** | |||||||
15179009-T-C | 13067095-T-C | ** | ||||||||
10887974-C-G | ** | |||||||||
10962940-T-C | ** | |||||||||
18297576-C-T | 16185696-C-T | P6_Prx | ** | |||||||
19392991-C-A | 17281111-C-A | ** | ||||||||
20404486-G-A | 18242600-G-A | P5_Dst | ** | |||||||
14470799-C-A | 12350068-C-A | ** | ||||||||
7270323-G-T | 7402282-G-T | ** | ||||||||
19444189-C-A | 17332309-C-A | ** | ||||||||
20815801-C-A | 18653915-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
3833529-C-A | 3965488-C-A | ** | ||||||||
28555653-C-A | 26409506-C-A | ** | ||||||||
7358234-C-A | 7490193-C-A | ** | ||||||||
28797863-GAGTGA-G | 26651716-GAGTGA-G | ** | ||||||||
10880369-C-A | ** | |||||||||
3680465-C-A | 3812424-C-A | ** | ||||||||
15423464-G-T | 13311584-G-T | ** | ||||||||
13453288-C-G | 11297612-C-G | ** | ||||||||
21935159-C-A | 19773273-C-A | ** | ||||||||
14398522-C-A | 12277818-C-A | ** | ||||||||
13453286-T-C | 11297610-T-C | ** | ||||||||
7270311-T-G | 7402270-T-G | ** | ||||||||
21824969-C-A | 19663083-C-A | ** | ||||||||
10759888-CGCA-C | ** | |||||||||
17310936-A-T | 15199056-A-T | ** | ||||||||
6756887-T-A | 6888846-T-A | ** | ||||||||
17843131-A-G | 15731251-A-G | YFS033077 FGC7778 BY10428 AM00897 | ** | |||||||
23002848-G-T | 20840962-G-T | ** | ||||||||
3033106-ATT-A | 3165065-ATT-A | 9×T | ** | |||||||
17100327-A-G | 14988447-A-G | ** | ||||||||
2718903-GA-G | 2850862-GA-G | ** | ||||||||
15940211-T-G | 13828331-T-G | ** | ||||||||
28550011-G-T | 26403864-G-T | ** | ||||||||
10691387-C-A | ** | |||||||||
15940224-G-T | 13828344-G-T | ** | ||||||||
26248117-T-A | 24101970-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
14216519-C-A | 12095813-C-A | ** | ||||||||
5449169-C-A | 5581128-C-A | ** | ||||||||
7162159-C-A | 7294118-C-A | ** | ||||||||
14230297-T-A | 12109591-T-A | ** | ||||||||
17461966-C-A | 15350086-C-A | ** | ||||||||
14022075-C-A | 11901369-C-A | ** | ||||||||
10663395-CTTT-C | ** | |||||||||
22950165-A-G | 20788279-A-G | ** | ||||||||
6828928-T-G | 6960887-T-G | ** | ||||||||
10987754-C-A | ** | |||||||||
6294750-A-G | 6426709-A-G | IR3_Dst | ** | |||||||
5807272-C-A | 5939231-C-A | ** | ||||||||
5812270-C-A | 5944229-C-A | ** | ||||||||
5855579-A-G | 5987538-A-G | ** | ||||||||
5967645-C-G | 6099604-C-G | ** | ||||||||
6037882-T-A | 6169841-T-A | ** | ||||||||
6085963-A-T | 6217922-A-T | ** | ||||||||
6102445-C-A | 6234404-C-A | ** | ||||||||
6294757-A-AG | 6426716-A-AG | IR3_Dst | ** | |||||||
6040775-G-A | 6172734-G-A | ** | ||||||||
6461538-A-G | 6593497-A-G | ** | ||||||||
6506720-C-A | 6638679-C-A | ** | ||||||||
6542965-T-A | 6674924-T-A | ** | ||||||||
6626973-G-C | 6758932-G-C | ** | ||||||||
6757840-T-G | 6889799-T-G | ** | ||||||||
6762851-C-A | 6894810-C-A | ** | ||||||||
6916267-A-T | 7048226-A-T | ** | ||||||||
6916285-A-G | 7048244-A-G | ** | ||||||||
5742767-G-A | 5874726-G-A | ** | ||||||||
5663551-A-G | 5795510-A-G | ** | ||||||||
6997966-A-T | 7129925-A-T | ** | ||||||||
5317039-A-G | 5448998-A-G | ** | ||||||||
4995957-C-A | 5127916-C-A | ** | ||||||||
6923168-C-A | 7055127-C-A | BY62214 | ** | |||||||
5155284-T-C | 5287243-T-C | ** | ||||||||
5180580-TAA-T | 5312539-TAA-T | ** | ||||||||
5219550-AT-A | 5351509-AT-A | ** | ||||||||
11022582-C-A | ** | |||||||||
5314236-T-G | 5446195-T-G | ** | ||||||||
5322145-G-T | 5454104-G-T | ** | ||||||||
5654872-G-T | 5786831-G-T | ** | ||||||||
5336837-A-T | 5468796-A-T | ** | ||||||||
5336894-T-C | 5468853-T-C | ** | ||||||||
5366454-T-G | 5498413-T-G | ** | ||||||||
5446905-C-A | 5578864-C-A | ** | ||||||||
5449894-G-T | 5581853-G-T | ** | ||||||||
5523619-A-C | 5655578-A-C | ** | ||||||||
5583986-A-T | 5715945-A-T | ** | ||||||||
5622773-T-G | 5754732-T-G | ** | ||||||||
6996694-T-A | 7128653-T-A | ** | ||||||||
7016140-T-C | 7148099-T-C | ** | ||||||||
4926240-T-C | 5058199-T-C | ** | ||||||||
8013486-A-T | 8145445-A-T | ** | ||||||||
14108905-C-A | 11988199-C-A | ** | ||||||||
7536053-A-C | 7668012-A-C | ** | ||||||||
7536057-A-C | 7668016-A-C | ** | ||||||||
7650698-C-A | 7782657-C-A | ** | ||||||||
7690080-C-A | 7822039-C-A | ** | ||||||||
7776572-C-A | 7908531-C-A | ** | ||||||||
28613791-G-T | 26467644-G-T | A7895 | ** | |||||||
8080558-G-T | 8212517-G-T | ** | ||||||||
7536020-G-A | 7667979-G-A | ** | ||||||||
8080559-A-G | 8212518-A-G | ** | ||||||||
8167259-G-T | 8299218-G-T | ** | ||||||||
8635406-T-C | 8767365-T-C | ** | ||||||||
20404474-AG-A | 18242588-AG-A | P5_Dst | ** | |||||||
8665765-C-T | 8797724-C-T | ** | ||||||||
8671445-T-A | 8803404-T-A | ** | ||||||||
8672079-C-A | 8804038-C-A | ** | ||||||||
8705937-C-A | 8837896-C-A | ** | ||||||||
7536022-G-C | 7667981-G-C | ** | ||||||||
7535995-A-T | 7667954-A-T | ** | ||||||||
7016145-C-T | 7148104-C-T | ** | ||||||||
7167264-C-A | 7299223-C-A | ** | ||||||||
7029551-G-A | 7161510-G-A | ** | ||||||||
7045431-C-A | 7177390-C-A | ** | ||||||||
7045678-T-A | 7177637-T-A | ** | ||||||||
7058948-G-A | 7190907-G-A | ** | ||||||||
7103311-A-AC | 7235270-A-AC | ** | ||||||||
28609551-TC-T | 26463404-TC-T | ** | ||||||||
7105074-G-A | 7237033-G-A | ** | ||||||||
7142546-C-A | 7274505-C-A | ** | ||||||||
7224046-A-C | 7356005-A-C | ** | ||||||||
7534537-C-T | 7666496-C-T | ** | ||||||||
7236445-G-A | 7368404-G-A | ** | ||||||||
7255287-T-C | 7387246-T-C | ** | ||||||||
7255939-T-G | 7387898-T-G | ** | ||||||||
7303114-G-C | 7435073-G-C | ** | ||||||||
7411333-T-G | 7543292-T-G | ** | ||||||||
7456749-G-T | 7588708-G-T | IR1_L | ** | |||||||
8125017-A-G | 8256976-A-G | ** | ||||||||
5622647-CTGTT-C | 5754606-CTGTT-C | 7×TGTT | ** | |||||||
15728789-G-T | 13616909-G-T | ** | ** | |||||||
11676347-G-T | ** | |||||||||
3155495-A-T | 3287454-A-T | FTB13825 | 11×T | ** | ||||||
3365579-G-T | 3497538-G-T | ** | ||||||||
3086570-G-T | 3218529-G-T | ** | ||||||||
3134824-T-C | 3266783-T-C | ** | ||||||||
4926238-G-T | 5058197-G-T | ** | ||||||||
3251893-A-G | 3383852-A-G | FT109639 | ** | |||||||
3284583-T-G | 3416542-T-G | ** | ||||||||
6757776-A-G | 6889735-A-G | ** | ||||||||
11676341-C-G | ** | |||||||||
10829318-A-T | ** | |||||||||
3407934-C-A | 3539893-C-A | ** | ||||||||
3525211-T-A | 3657170-T-A | ** | ||||||||
3547553-T-G | 3679512-T-G | ** | ||||||||
10837862-A-T | ** | |||||||||
8479561-C-T | 8611520-C-T | ** | ||||||||
3582072-T-A | 3714031-T-A | ** | ||||||||
3086562-A-C | 3218521-A-C | ** | ||||||||
3033102-T-G | 3165061-T-G | ** | ||||||||
3595697-C-A | 3727656-C-A | ** | ||||||||
2696482-C-A | 2828441-C-A | ** | ||||||||
3193186-A-AT | 3325145-A-AT | 10×T | ** | |||||||
10826893-C-T | ** | |||||||||
58979464-A-T | 56833317-A-T | ** | ||||||||
8739746-G-T | 8871705-G-T | ** | ||||||||
9732842-C-A | 9895233-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
17576239-T-C | 15464359-T-C | ** | ||||||||
2696548-C-A | 2828507-C-A | ** | ||||||||
2975518-G-A | 3107477-G-A | FT120254 | ** | |||||||
2697387-C-A | 2829346-C-A | ** | ||||||||
2758807-C-A | 2890766-C-A | ** | ||||||||
2769215-C-A | 2901174-C-A | ** | ||||||||
2790318-TGA-T | 2922277-TGA-T | ** | ||||||||
19678820-T-C | 17566940-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
10818760-C-T | ** | |||||||||
2915648-G-T | 3047607-G-T | ** | ||||||||
3847201-CT-C | 3979160-CT-C | ** | ||||||||
3593292-G-T | 3725251-G-T | ** | ||||||||
3601024-G-T | 3732983-G-T | ** | ||||||||
4100526-C-A | 4232485-C-A | ** | ||||||||
4889370-A-G | 5021329-A-G | ** | ||||||||
4841390-C-A | 4973349-C-A | ** | ||||||||
4827682-C-A | 4959641-C-A | ** | ||||||||
4700313-C-G | 4832272-C-G | ** | ||||||||
6454538-C-A | 6586497-C-A | ** | ||||||||
4582453-T-A | 4714412-T-A | ** | ||||||||
4511506-A-T | 4643465-A-T | ** | ||||||||
4511495-G-T | 4643454-G-T | ** | ||||||||
4491817-C-A | 4623776-C-A | ** | ||||||||
4353796-C-G | 4485755-C-G | ** | ||||||||
4336994-C-A | 4468953-C-A | ** | ||||||||
4302856-C-T | 4434815-C-T | ** | ||||||||
24671175-C-A | 22525028-C-A | P3_b2 | ** | |||||||
4120061-C-T | 4252020-C-T | ** | ||||||||
4123700-G-A | 4255659-G-A | ** | ||||||||
16319644-A-T | 14207764-A-T | ** | ||||||||
3867741-G-T | 3999700-G-T | ** | ||||||||
3688469-T-A | 3820428-T-A | ** | ||||||||
3706778-C-A | 3838737-C-A | ** | ||||||||
3724467-G-C | 3856426-G-C | ** | ||||||||
3782463-C-A | 3914422-C-A | ** | ||||||||
3849460-T-A | 3981419-T-A | ** | ||||||||
3852284-A-G | 3984243-A-G | ** | ||||||||
4094683-G-C | 4226642-G-C | ** | ||||||||
13584271-C-A | 11428595-C-A | ** | ||||||||
3933185-C-A | 4065144-C-A | ** | ||||||||
3936898-A-G | 4068857-A-G | ** | ||||||||
4046469-T-C | 4178428-T-C | ** | ||||||||
4049883-G-C | 4181842-G-C | ** | ||||||||
4078530-G-T | 4210489-G-T | ** | ||||||||
56861835-A-AT | *** | |||||||||
23741943-G-T | 21580057-G-T | *** | ||||||||
56826507-C-A | *** | |||||||||
23037237-ATTTT-A,ATTT | 20875351-ATTTT-A,ATTT | 20×T | *** | |||||||
21146261-G-A | 18984375-G-A | *** | ||||||||
56831874-A-G,T | *** | |||||||||
8343894-G-T | 8475853-G-T | *** | *** | |||||||
17175161-G-T | 15063281-G-T | *** | *** | |||||||
56830055-C-CTCCAT,CTCCATTCCAT | *** | |||||||||
22259637-C-G | 20097751-C-G | DYZ19 | *** | |||||||
3514522-C-CT | 3646481-C-CT | 16×T | *** | |||||||
58979428-C-T | 56833281-C-T | *** | ||||||||
25246296-GCTT-G | 23100149-GCTT-G | P2_r1 | 5×CTT | *** | ||||||
7990792-C-A | 8122751-C-A | *** | ||||||||
13714841-AGAATG-A | 11559165-AGAATG-A | 7×GAATG | *** | |||||||
22339889-G-C | 20178003-G-C | DYZ19 | *** | |||||||
22450086-A-G | 20288200-A-G | DYZ19 | *** | |||||||
6605511-TTATATATA-T | 6737470-TTATATATA-T | 14×TA | *** | |||||||
16786206-A-T | 14674326-A-T | *** | ||||||||
24165696-G-T | 22019549-G-T | P3_b1 | *** | |||||||
13462373-G-A | 11306697-G-A | *** | ||||||||
13480308-C-G,T | 11324632-C-G,T | *** | ||||||||
56861831-A-AC | *** | |||||||||
13600982-GATATAT-G | 11445306-GATATAT-G | 10×AT | *** | |||||||
24523450-C-A | 22377303-C-A | *** | ||||||||
17387292-GTGTA-G | 15275412-GTGTA-G | *** | ||||||||
12730473-AT-A,ATT | 21×T | *** | ||||||||
13997771-CT-C,CTT | 11877065-CT-C,CTT | 17×T | *** | |||||||
15993681-G-A | 13881801-G-A | 10×TA | *** | |||||||
24381896-C-T | 22235749-C-T | *** | ||||||||
13194672-C-T | 11038996-C-T | PF464 | *** | *** | ||||||
56829963-T-TACTAA | *** | |||||||||
6024536-T-TTGTG | 6156495-T-TTGTG | 15×TG | *** | |||||||
8728267-A-G | 8860226-A-G | *** | ||||||||
10987808-C-T | *** | |||||||||
15546037-C-A | 13434157-C-A | *** | ||||||||
13543673-A-G | 11387997-A-G | *** | ||||||||
13857522-A-G | 11736816-A-G | FT107564 | *** | |||||||
14352878-C-A | 12232173-C-A | FTB28438 | *** | |||||||
14484806-G-T | 12364075-G-T | *** | ||||||||
2860009-A-T | 2991968-A-T | *** | ||||||||
2758868-G-A | 2890827-G-A | *** | ||||||||
2980426-C-T | 3112385-C-T | *** | ||||||||
15531541-C-A | 13419661-C-A | *** | ||||||||
10971059-C-T | *** | |||||||||
13475110-T-A | 11319434-T-A | *** | ||||||||
15791467-C-A | 13679587-C-A | *** | ||||||||
15867989-TA-T | 13756109-TA-T | *** | ||||||||
13475555-G-T | 11319879-G-T | *** | ||||||||
9354161-C-A | 9516552-C-A | *** | ||||||||
10987893-C-A | *** | |||||||||
5569242-A-G | 5701201-A-G | FT248050 | *** | |||||||
16406883-C-T | 14295003-C-T | *** | ||||||||
7076612-CAAAAAAAAAAA-C | 7208571-CAAAAAAAAAAA-C | 29×A | *** | |||||||
13485910-G-C | 11330234-G-C | *** | ||||||||
13454608-A-G | 11298932-A-G | *** | ||||||||
17020723-C-A | 14908843-C-A | *** | ||||||||
9943412-A-C | 10105803-A-C | *** | ||||||||
8852253-C-A | 8984212-C-A | *** | ||||||||
8901412-G-A | 9033371-G-A | *** | ||||||||
8649517-C-A | 8781476-C-A | *** | ||||||||
7832033-T-A | 7963992-T-A | *** | ||||||||
7568869-G-T | 7700828-G-T | *** | ||||||||
9706641-G-A | 9869032-G-A | IR3_Prx | *** | |||||||
9900476-G-A | 10062867-G-A | *** | ||||||||
9900480-A-G | 10062871-A-G | BY198260 | *** | |||||||
7272212-T-C | 7404171-T-C | *** | ||||||||
5313412-A-G | 5445371-A-G | *** | ||||||||
10669298-C-G | *** | |||||||||
10673872-C-T | *** | |||||||||
6942596-C-T | 7074555-C-T | *** | ||||||||
6759452-C-A | 6891411-C-A | *** | ||||||||
10987866-C-CTGCAT | *** | |||||||||
10987879-C-G | *** | |||||||||
11024662-C-A | *** | |||||||||
13236398-C-A | 11080722-C-A | *** | ||||||||
16818971-GTATATATATA-G,GTATATA | 14707091-GTATATATATA-G,GTATATA | 21×TA | *** | |||||||
21425374-A-G | 19263488-A-G | *** | ||||||||
7646952-C-T | 7778911-C-T | *** | ||||||||
10776532-C-T | *** | |||||||||
21427848-G-T | 19265962-G-T | Y31820 | *** | |||||||
21527044-G-T | 19365158-G-T | *** | ||||||||
9784746-T-A | 9947137-T-A | *** | ||||||||
22303516-C-A | 20141630-C-A | FT455593 | DYZ19 | *** | ||||||
17678650-A-G | 15566770-A-G | *** | ||||||||
3759181-C-A | 3891140-C-A | *** | ||||||||
10673908-C-A | *** | |||||||||
22199273-C-A | 20037387-C-A | *** | ||||||||
22528307-C-A | 20366421-C-A | *** | ||||||||
21220339-T-C | 19058453-T-C | *** | ||||||||
22812131-A-T | 20650245-A-T | *** | ||||||||
10776517-C-CGTGTTA | *** | |||||||||
15285902-C-A | 13174001-C-A | *** | ||||||||
15969954-CATA-C | 13858074-CATA-C | *** | ||||||||
2960059-C-T | 3092018-C-T | *** | ||||||||
10987815-A-T | *** | |||||||||
8891001-G-A | 9022960-G-A | *** | ||||||||
10911672-C-G | *** | |||||||||
10789381-A-G | *** | |||||||||
20804890-TATATATATATATATATATATATATACAATTTC-T,TATATATATATATATATATATATACAATTTC | 18643004-TATATATATATATATATATATATATACAATTTC-T,TATATATATATATATATATATATACAATTTC | P4_Gap | *** | |||||||
17128502-A-G | 15016622-A-G | *** | ||||||||
10785656-C-A | *** | |||||||||
19128798-G-T | 17016918-G-T | *** | ||||||||
17424960-C-A | 15313080-C-A | *** | ||||||||
21224989-C-A | 19063103-C-A | *** | ||||||||
17081312-A-AAT | 14969432-A-AAT | *** | ||||||||
17929443-G-T | 15817563-G-T | *** | ||||||||
10845667-C-A,G | *** | |||||||||
10814447-C-A | *** | |||||||||
18108539-C-A | 15996659-C-A | *** | ||||||||
19036796-C-T | 16924916-C-T | *** | ||||||||
15957869-T-C | 13845989-T-C | *** | ||||||||
18384471-T-G | 16272591-T-G | P6_Gap | *** | |||||||
10673852-C-CTATTA,G | *** | |||||||||
19034756-CAAA-C,CAA | 16922876-CAAA-C,CAA | 15×A | *** | |||||||
19429689-C-A | 17317809-C-A | *** | ||||||||
19300667-TGGGTG-T | 17188787-TGGGTG-T | *** | ||||||||
11651824-C-A | *** | |||||||||
19528719-G-T | 17416839-G-T | *** | ||||||||
14557804-C-A | 12446005-C-A | *** | ||||||||
15859465-C-T | 13747585-C-T | *** | ||||||||
19135814-CTG-C | 17023934-CTG-C | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: 133769 | 10438738 | 7507140 | 7567877 |
Kit: 133769 | 9285565 | 7601430 | 7524705 |
Kit: 133769 | 14940786 | 9373134 | 8321217 |
Used in age calculations | 14940786 | 9373134 | 8321217 |
Counts of SNPs | 7 | 8 |
Big Tree Main Page