Black
FTDNA: 665959, BigY3: 665959, BigY2: 665959Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 665959 | BigY3 665959 | BigY2 665959 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
18013954-A-ATG | 15902074-A-ATG | P7_Dst | 9×TG | A* | ||||||
26340217-C-T | 24194070-C-T | P1_Y1 | A* | |||||||
18267702-G-A | 16155822-G-A | Y101811 | + | + | + | |||||
14851455-A-G | 12739521-A-G | FT94612 | Y | Y | + | *** | ||||
17284725-CG-C | 15172845-CG-C | ** | + | |||||||
16013071-G-T | 13901191-G-T | Y | + | |||||||
17951306-T-TA | 15839426-T-TA | * | *** | |||||||
15400167-C-A | 13288287-C-A | 14×A | ** | |||||||
19415501-C-T | 17303621-C-T | Y8743 FGC22598 | ** | |||||||
16240818-C-A | 14128938-C-A | M9888 | ** | |||||||
18155590-C-A | 16043710-C-A | FT330762 | ** | |||||||
28798624-C-T | 26652477-C-T | ** | ||||||||
13857815-G-T | 11737109-G-T | ** | ||||||||
13857939-T-C | 11737233-T-C | ** | ||||||||
13857809-C-T | 11737103-C-T | ** | ||||||||
18511600-A-G | 16399720-A-G | P6_Dst | ** | |||||||
18758870-A-T | 16646990-A-T | MF4927 | ** | |||||||
14644922-C-A | 12532991-C-A | Y91885 | ** | |||||||
13488958-G-GTA | 11333282-G-GTA | ** | ||||||||
16309039-A-T | 14197159-A-T | ** | ||||||||
19189597-G-A | 17077717-G-A | ** | ||||||||
2744845-C-A | 2876804-C-A | ** | ||||||||
23098040-C-A | 20936154-C-A | ** | ||||||||
10959190-G-C | ** | |||||||||
24475160-G-T | 22329013-G-T | ** | ||||||||
18810729-C-A | 16698849-C-A | ** | ||||||||
4557640-C-A | 4689599-C-A | ** | ||||||||
14977299-T-C | 12865374-T-C | ** | ||||||||
15477275-G-A | 13365395-G-A | ** | ||||||||
19132532-C-A | 17020652-C-A | ** | ||||||||
11021302-C-A | ** | |||||||||
15364056-T-G | 13252176-T-G | ** | ||||||||
13215411-C-A | 11059735-C-A | ** | ||||||||
16220755-C-A | 14108875-C-A | ** | ||||||||
22340038-A-G | 20178152-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
10687499-C-A | ** | |||||||||
13898879-C-T | 11778173-C-T | ** | ||||||||
28777842-C-A | 26631695-C-A | ** | ||||||||
10962755-A-C | ** | |||||||||
11022668-T-C | ** | |||||||||
20028102-G-A | 17916222-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
3990650-G-A | 4122609-G-A | ** | ||||||||
19745027-C-T | 17633147-C-T | P5_Prx | ** | |||||||
7013558-C-A | 7145517-C-A | ** | ||||||||
56846791-A-G | ** | |||||||||
15193505-C-A | 13081591-C-A | ** | ||||||||
10803670-T-C | FT431919 | ** | ||||||||
15585043-C-A | 13473163-C-A | ** | ||||||||
10773169-C-T | ** | |||||||||
19361209-C-A | 17249329-C-A | ** | ||||||||
10932727-C-A | ** | |||||||||
13460891-G-A | 11305215-G-A | ** | ||||||||
3440259-C-A | 3572218-C-A | ** | ||||||||
22040945-C-A | 19879059-C-A | ** | ||||||||
3271456-G-T | 3403415-G-T | FT409520 | ** | |||||||
21422059-A-C | 19260173-A-C | ** | ||||||||
16516400-C-A | 14404520-C-A | ** | ||||||||
21972245-C-A | 19810359-C-A | ** | ||||||||
17372219-C-A | 15260339-C-A | ** | ||||||||
3165008-A-T | 3296967-A-T | ** | ||||||||
3990640-T-G | 4122599-T-G | ** | ||||||||
8807140-C-A | 8939099-C-A | ** | ||||||||
10962747-T-C | ** | |||||||||
10959243-T-C | ** | |||||||||
56844633-G-T | ** | |||||||||
21515858-G-A | 19353972-G-A | ** | ||||||||
25966257-T-A | 23820110-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
8712102-C-A | 8844061-C-A | ** | ||||||||
18328810-A-G | 16216930-A-G | P6_Prx | ** | |||||||
2729687-A-T | 2861646-A-T | ** | ||||||||
15080683-C-A | 12968773-C-A | ** | ||||||||
14570755-CAT-C | 12458955-CAT-C | ** | ||||||||
15364039-G-A | 13252159-G-A | ** | ||||||||
15179007-T-A | 13067093-T-A | ** | ||||||||
28756973-CA-C | 26610826-CA-C | ** | ||||||||
23723534-G-A | 21561648-G-A | ** | ||||||||
17486324-C-A | 15374444-C-A | ** | ||||||||
10827892-C-A | ** | |||||||||
20348016-T-TA | 18186130-T-TA | P5_Dst | ** | |||||||
11008988-C-A | ** | |||||||||
16528166-C-A | 14416286-C-A | ** | ||||||||
19271409-C-A | 17159529-C-A | ** | ||||||||
11004432-T-C | ** | |||||||||
17478965-C-A | 15367085-C-A | FT403685 | ** | |||||||
5216307-C-A | 5348266-C-A | ** | ||||||||
18211068-C-A | 16099188-C-A | ** | ||||||||
10797713-A-G | ** | |||||||||
14779502-C-A | 12667572-C-A | ** | ||||||||
27979802-T-TC | 25833655-T-TC | P1_Y2 | ** | |||||||
10767452-C-A | ** | |||||||||
19489331-C-A | 17377451-C-A | ** | ||||||||
18728718-C-A | 16616838-C-A | ** | ||||||||
10812821-C-A | ** | |||||||||
10671989-C-A | ** | |||||||||
7385876-C-G | 7517835-C-G | FT121351 | ** | |||||||
10878024-G-T | ** | |||||||||
14356375-C-A | 12235670-C-A | ** | ||||||||
18354115-G-A | 16242235-G-A | P6_Prx | ** | |||||||
19496190-C-A | 17384310-C-A | ** | ||||||||
28485777-C-A | 26339630-C-A | ** | ||||||||
11004392-T-C | ** | |||||||||
20001321-G-A | 17889441-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
19187414-G-TT | 17075534-G-TT | ** | ||||||||
8290700-C-A | 8422659-C-A | ** | ||||||||
2665580-G-T | 2797539-G-T | ** | ||||||||
2682856-A-G | 2814815-A-G | ** | ||||||||
2699497-C-T | 2831456-C-T | ** | ||||||||
2730086-C-T | 2862045-C-T | ** | ||||||||
2853411-A-G | 2985370-A-G | ** | ||||||||
2853418-C-T | 2985377-C-T | ** | ||||||||
2853422-T-C | 2985381-T-C | ** | ||||||||
2853423-G-T | 2985382-G-T | ** | ||||||||
2959941-C-A | 3091900-C-A | ** | ||||||||
2960094-A-G | 3092053-A-G | ** | ||||||||
2974239-C-A | 3106198-C-A | ** | ||||||||
2981294-G-T | 3113253-G-T | ** | ||||||||
3128674-G-A | 3260633-G-A | ** | ||||||||
3131647-A-T | 3263606-A-T | ** | ||||||||
3178364-C-T | 3310323-C-T | ** | ||||||||
3250664-T-A | 3382623-T-A | ** | ||||||||
3271479-G-T | 3403438-G-T | ** | ||||||||
3331012-G-T | 3462971-G-T | ** | ||||||||
3332408-T-C | 3464367-T-C | ** | ||||||||
3344051-T-A | 3476010-T-A | ** | ||||||||
3367113-G-T | 3499072-G-T | ** | ||||||||
3490432-G-T | 3622391-G-T | ** | ||||||||
3490464-C-A | 3622423-C-A | ** | ||||||||
3593268-C-T | 3725227-C-T | ** | ||||||||
3688385-T-C | 3820344-T-C | ** | ||||||||
3732064-A-G | 3864023-A-G | ** | ||||||||
3732125-T-A | 3864084-T-A | ** | ||||||||
3817443-C-A | 3949402-C-A | ** | ||||||||
3940545-C-A | 4072504-C-A | ** | ||||||||
3950785-C-A | 4082744-C-A | ** | ||||||||
3986199-C-T | 4118158-C-T | ** | ||||||||
3990632-C-A | 4122591-C-A | ** | ||||||||
3992281-C-A | 4124240-C-A | ** | ||||||||
4049100-C-A | 4181059-C-A | ** | ||||||||
4094282-C-T | 4226241-C-T | ** | ||||||||
4094352-C-G | 4226311-C-G | ** | ||||||||
4094415-A-G | 4226374-A-G | FT93629 | ** | |||||||
4138993-A-G | 4270952-A-G | ** | ||||||||
4164636-A-G | 4296595-A-G | FT255694 | ** | |||||||
4169383-C-A | 4301342-C-A | ** | ||||||||
4261288-G-T | 4393247-G-T | ** | ||||||||
4301333-T-G | 4433292-T-G | ** | ||||||||
4326021-C-A | 4457980-C-A | ** | ||||||||
4433716-G-A | 4565675-G-A | ** | ||||||||
4510020-G-A | 4641979-G-A | ** | ||||||||
4533619-T-A | 4665578-T-A | ** | ||||||||
4630819-G-T | 4762778-G-T | ** | ||||||||
4804380-A-G | 4936339-A-G | ** | ||||||||
4804382-C-A | 4936341-C-A | ** | ||||||||
4804392-G-C | 4936351-G-C | ** | ||||||||
4804480-C-A | 4936439-C-A | ** | ||||||||
4926230-G-C | 5058189-G-C | ** | ||||||||
4937214-AT-A | 5069173-AT-A | ** | ||||||||
4957718-A-G | 5089677-A-G | ** | ||||||||
4957722-T-G | 5089681-T-G | ** | ||||||||
4957723-G-T | 5089682-G-T | ** | ||||||||
4957725-G-A | 5089684-G-A | ** | ||||||||
4957727-TC-T | 5089686-TC-T | ** | ||||||||
4959961-C-A | 5091920-C-A | ** | ||||||||
5263053-C-A | 5395012-C-A | ** | ||||||||
5316899-C-A | 5448858-C-A | ** | ||||||||
5446888-C-A | 5578847-C-A | ** | ||||||||
5557390-C-G | 5689349-C-G | ** | ||||||||
5560099-T-C | 5692058-T-C | ** | ||||||||
5587283-C-A | 5719242-C-A | ** | ||||||||
5653540-C-A | 5785499-C-A | ** | ||||||||
5653558-C-A | 5785517-C-A | ** | ||||||||
5666474-G-C | 5798433-G-C | ** | ||||||||
5690007-C-A | 5821966-C-A | ** | ||||||||
5746300-C-A | 5878259-C-A | ** | ||||||||
5749654-G-T | 5881613-G-T | ** | ||||||||
5842112-C-A | 5974071-C-A | ** | ||||||||
5845247-C-T | 5977206-C-T | ** | ||||||||
5869605-C-A | 6001564-C-A | ** | ||||||||
5890133-G-T | 6022092-G-T | ** | ||||||||
5937236-CTCTCTCTATA-C | 6069195-CTCTCTCTATA-C | ** | ||||||||
5995730-A-G | 6127689-A-G | ** | ||||||||
5999453-C-A | 6131412-C-A | ** | ||||||||
6003808-C-A | 6135767-C-A | ** | ||||||||
6074039-C-T | 6205998-C-T | FT379225 | ** | |||||||
6074061-A-T | 6206020-A-T | ** | ||||||||
6090153-G-T | 6222112-G-T | ** | ||||||||
6179897-T-TG | 6311856-T-TG | IR3_Dst | ** | |||||||
6236143-A-AG | 6368102-A-AG | IR3_Dst | ** | |||||||
6427348-T-G | 6559307-T-G | ** | ||||||||
6478608-A-C | 6610567-A-C | ** | ||||||||
6582404-T-C | 6714363-T-C | ** | ||||||||
6645497-CA-C | 6777456-CA-C | ** | ||||||||
6773792-T-C | 6905751-T-C | ** | ||||||||
6784647-C-A | 6916606-C-A | ** | ||||||||
6917088-C-A | 7049047-C-A | ** | ||||||||
7048464-A-G | 7180423-A-G | ** | ||||||||
7053686-C-A | 7185645-C-A | ** | ||||||||
7053691-T-A | 7185650-T-A | ** | ||||||||
7086867-A-G | 7218826-A-G | ** | ||||||||
7110982-A-C | 7242941-A-C | ** | ||||||||
7135196-C-A | 7267155-C-A | ** | ||||||||
7143305-C-A | 7275264-C-A | ** | ||||||||
7155423-C-A | 7287382-C-A | ** | ||||||||
7160862-G-A | 7292821-G-A | ** | ||||||||
7164451-A-G | 7296410-A-G | ** | ||||||||
7164468-A-G | 7296427-A-G | ** | ||||||||
7167194-A-G | 7299153-A-G | ** | ||||||||
7197554-C-T | 7329513-C-T | A8469 | A8469 | ** | ||||||
7214537-C-A | 7346496-C-A | ** | ||||||||
7242557-A-G | 7374516-A-G | ** | ||||||||
7253911-T-A | 7385870-T-A | ** | ||||||||
7301600-C-A | 7433559-C-A | ** | ||||||||
7306405-A-G | 7438364-A-G | ** | ||||||||
7336950-T-C | 7468909-T-C | ** | ||||||||
7338902-C-A | 7470861-C-A | ** | ||||||||
7371921-A-C | 7503880-A-C | ** | ||||||||
7371938-C-A | 7503897-C-A | ** | ||||||||
7443981-A-C | 7575940-A-C | ** | ||||||||
7534585-G-C | 7666544-G-C | ** | ||||||||
7650503-C-A | 7782462-C-A | ** | ||||||||
7756794-G-A | 7888753-G-A | ** | ||||||||
7866095-T-G | 7998054-T-G | ** | ||||||||
8056351-G-T | 8188310-G-T | ** | ||||||||
8076179-C-A | 8208138-C-A | ** | ||||||||
8140593-C-A | 8272552-C-A | ** | ||||||||
8218029-C-T | 8349988-C-T | ** | ||||||||
8281740-C-T | 8413699-C-T | ** | ||||||||
8661722-T-G | 8793681-T-G | ** | ||||||||
8673874-A-G | 8805833-A-G | ** | ||||||||
8691928-T-G | 8823887-T-G | ** | ||||||||
8699676-G-C | 8831635-G-C | ** | ||||||||
8738914-G-C | 8870873-G-C | ** | ||||||||
8761985-A-G | 8893944-A-G | FT20119 | ** | |||||||
8807492-G-A | 8939451-G-A | ** | ||||||||
9040743-C-G | 9203134-C-G | ** | ||||||||
9063302-C-A | 9225693-C-A | ** | ||||||||
9063649-G-T | 9226040-G-T | ** | ||||||||
9465349-T-G | 9627740-T-G | ** | ||||||||
9712928-A-AC | 9875319-A-AC | IR3_Prx | ** | |||||||
9712950-A-T | 9875341-A-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9731642-G-T | 9894033-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9957830-T-C | 10120221-T-C | ** | ||||||||
9962177-G-C | 10124568-G-C | ** | ||||||||
9962234-G-T | 10124625-G-T | ** | ||||||||
9978015-G-T | 10140406-G-T | ** | ||||||||
10026291-A-T | 10188682-A-T | ** | ||||||||
10042985-C-A | 10205376-C-A | ** | ||||||||
10651959-T-C | ** | |||||||||
10653024-C-T | ** | |||||||||
10654515-T-C | ** | |||||||||
10654519-C-T | ** | |||||||||
10654915-C-A | ** | |||||||||
10663189-C-A | ** | |||||||||
10666166-C-A | ** | |||||||||
10671946-A-T | ** | |||||||||
10678753-A-T | ** | |||||||||
10679498-C-A | ** | |||||||||
10684043-G-T | ** | |||||||||
10688699-T-A | ** | |||||||||
10690118-A-C | ** | |||||||||
10691034-A-AC | ** | |||||||||
10691036-TC-T | ** | |||||||||
10746530-C-A | ** | |||||||||
10748293-A-ATTCCT | ** | |||||||||
10750278-C-A | ** | |||||||||
10750479-A-C | ** | |||||||||
10750905-G-T | ** | |||||||||
10751939-C-A | ** | |||||||||
10757341-A-C | ** | |||||||||
10758487-A-C | ** | |||||||||
10758939-T-C | ** | |||||||||
10763633-C-T | ** | |||||||||
10769246-T-G | ** | |||||||||
10769323-T-G | ** | |||||||||
10773152-C-T | FT430572 | ** | ||||||||
10773393-T-C | ** | |||||||||
10773398-A-C | ** | |||||||||
10774086-A-G | ** | |||||||||
10777721-C-T | ** | |||||||||
10785761-C-A | ** | |||||||||
10790218-C-T | ** | |||||||||
10797688-T-G | ** | |||||||||
10797725-T-TCCTTC | ** | |||||||||
10804754-T-A | ** | |||||||||
10809220-T-C | ** | |||||||||
10811170-C-T | ** | |||||||||
10811923-A-C | ** | |||||||||
10812183-CTCCAT-C | ** | |||||||||
10823381-A-T | ** | |||||||||
10823771-C-G | ** | |||||||||
10831204-C-A | ** | |||||||||
10831715-C-T | ** | |||||||||
10833480-A-C | FT433288 | ** | ||||||||
10833830-C-A | ** | |||||||||
10834367-A-C | ** | |||||||||
10834425-C-A | ** | |||||||||
10834507-T-C | ** | |||||||||
10835483-T-G | ** | |||||||||
10836331-A-G | ** | |||||||||
10836893-A-G | ** | |||||||||
10843200-C-G | ** | |||||||||
10845578-A-T | ** | |||||||||
10846658-C-A | ** | |||||||||
10847392-C-A | ** | |||||||||
10856663-A-C | ** | |||||||||
10857582-C-A | ** | |||||||||
10858367-C-A | ** | |||||||||
10859220-C-G | ** | |||||||||
10885089-CTCCTT-C | ** | |||||||||
10887150-C-T | ** | |||||||||
10890168-C-A | ** | |||||||||
10892400-C-A | ** | |||||||||
10893065-C-A | ** | |||||||||
10904165-T-A | ** | |||||||||
10911708-A-C | ** | |||||||||
10926515-C-A | ** | |||||||||
10927522-C-T | ** | |||||||||
10932659-C-G | ** | |||||||||
10933721-C-A | ** | |||||||||
10938213-G-T | ** | |||||||||
10943587-A-G | ** | |||||||||
10944698-A-C | ** | |||||||||
10945736-C-T | FT437680 | ** | ||||||||
10945741-G-T | FT106475 | ** | ||||||||
10945752-T-C | ** | |||||||||
10945767-G-C | ** | |||||||||
10947014-A-C | ** | |||||||||
10947016-T-A | ** | |||||||||
10947022-G-C | ** | |||||||||
10947029-G-C | ** | |||||||||
10947031-T-A | ** | |||||||||
10947041-A-C | ** | |||||||||
10947042-T-C | ** | |||||||||
10951174-T-C | ** | |||||||||
10954813-C-G | ** | |||||||||
10954815-C-T | FT438063 | ** | ||||||||
10958031-C-A | ** | |||||||||
10958119-C-G | ** | |||||||||
10958802-A-C | ** | |||||||||
10958861-C-T | ** | |||||||||
10959133-A-C | ** | |||||||||
10959143-A-G | ** | |||||||||
10967645-A-G | ** | |||||||||
10971509-C-A | ** | |||||||||
10976218-C-A | ** | |||||||||
10980229-C-A | ** | |||||||||
10981058-C-A | ** | |||||||||
10981404-A-C | ** | |||||||||
10984906-T-A | FT218733 | ** | ||||||||
10991194-C-A | ** | |||||||||
11010906-T-C | ** | |||||||||
11010987-T-C | ** | |||||||||
11019635-C-A | ** | |||||||||
11020656-C-A | ** | |||||||||
11021319-C-A | ** | |||||||||
11021799-T-A | ** | |||||||||
11022604-T-A | ** | |||||||||
11027373-C-A | ** | |||||||||
11030387-A-G | ** | |||||||||
11034845-A-C | ** | |||||||||
11038009-C-T | ** | |||||||||
11038117-C-A | ** | |||||||||
13215367-C-A | 11059691-C-A | ** | ||||||||
13218523-T-A | 11062847-T-A | ** | ||||||||
13233453-C-A | 11077777-C-A | ** | ||||||||
13441717-C-A | 11286041-C-A | ** | ||||||||
13505133-T-A | 11349457-T-A | ** | ||||||||
13512959-C-A | 11357283-C-A | ** | ||||||||
13520458-C-A | 11364782-C-A | ** | ||||||||
13522114-G-T | 11366438-G-T | ** | ||||||||
13571984-G-T | 11416308-G-T | ** | ||||||||
13712210-G-A | 11556534-G-A | ** | ||||||||
11646022-T-A | ** | |||||||||
11646920-C-A | FT406668 | ** | ||||||||
11654823-C-T | ** | |||||||||
11654979-A-T | ** | |||||||||
11655048-A-C | ** | |||||||||
11655163-A-T | ** | |||||||||
11655187-A-T | ** | |||||||||
11658377-T-G | ** | |||||||||
11667976-A-G | ** | |||||||||
11672486-T-G | ** | |||||||||
13854567-G-A | 11733861-G-A | ** | ||||||||
13885643-T-C | 11764937-T-C | ** | ||||||||
13932989-C-A | 11812283-C-A | ** | ||||||||
13933062-C-A | 11812356-C-A | ** | ||||||||
13933071-A-G | 11812365-A-G | ** | ||||||||
13936353-C-A | 11815647-C-A | ** | ||||||||
13937235-C-T | 11816529-C-T | ** | ||||||||
13937355-C-T | 11816649-C-T | ** | ||||||||
13938070-T-C | 11817364-T-C | ** | ||||||||
14005986-T-A | 11885280-T-A | FT179748 | ** | |||||||
14029121-C-A | 11908415-C-A | ** | ||||||||
14068587-C-A | 11947881-C-A | ** | ||||||||
14068944-T-A | 11948238-T-A | ** | ||||||||
14099788-C-G | 11979082-C-G | ** | ||||||||
14136038-C-A | 12015332-C-A | ** | ||||||||
14176406-A-G | 12055700-A-G | ** | ||||||||
14283989-A-G | 12163283-A-G | ** | ||||||||
14295603-T-C | 12174897-T-C | ** | ||||||||
14345022-T-G | 12224317-T-G | ** | ||||||||
14382799-G-T | 12262095-G-T | ** | ||||||||
14420197-C-A | 12299472-C-A | Y91388 | ** | |||||||
14428062-A-G | 12307337-A-G | ** | ||||||||
14458366-G-T | 12337639-G-T | ** | ||||||||
14490411-A-T | 12369680-A-T | ** | ||||||||
14546408-C-A | 12434609-C-A | ** | ||||||||
14557971-C-A | 12446172-C-A | ** | ||||||||
14626995-G-C | 12515063-G-C | ** | ||||||||
14627199-C-A | 12515267-C-A | ** | ||||||||
14700138-C-A | 12588204-C-A | ** | ||||||||
14717208-G-T | 12605276-G-T | ** | ||||||||
14755710-C-A | 12643779-C-A | ** | ||||||||
14776911-C-A | 12664980-C-A | ** | ||||||||
14776920-A-T | 12664989-A-T | ** | ||||||||
14789425-C-T | 12677496-C-T | ** | ||||||||
14815885-C-A | 12703956-C-A | ** | ||||||||
14959982-T-C | 12848057-T-C | ** | ||||||||
15011564-T-C | 12899652-T-C | ** | ||||||||
15012778-A-T | 12900866-A-T | ** | ||||||||
15066219-T-G | 12954310-T-G | ** | ||||||||
15113566-T-C | 13001653-T-C | ** | ||||||||
15127885-A-T | 13015972-A-T | ** | ||||||||
15127900-C-A | 13015987-C-A | ** | ||||||||
15168883-G-C | 13056969-G-C | ** | ||||||||
15233974-G-A | 13122060-G-A | ** | ||||||||
15247504-C-G | 13135590-C-G | ** | ||||||||
15247506-G-A | 13135592-G-A | ** | ||||||||
15247516-T-G | 13135602-T-G | ** | ||||||||
15280726-A-T | 13168825-A-T | ** | ||||||||
15324130-C-T | 13212248-C-T | ** | ||||||||
15324210-G-A | 13212328-G-A | ** | ||||||||
15398358-G-T | 13286478-G-T | ** | ||||||||
15428416-G-T | 13316536-G-T | ** | ||||||||
15477277-G-A | 13365397-G-A | ** | ||||||||
15491942-T-C | 13380062-T-C | ** | ||||||||
15536544-C-T | 13424664-C-T | ** | ||||||||
15636741-C-A | 13524861-C-A | ** | ||||||||
15650561-C-A | 13538681-C-A | ** | ||||||||
15655572-TA-T | 13543692-TA-T | ** | ||||||||
15679796-C-A | 13567916-C-A | ** | ||||||||
15748052-C-T | 13636172-C-T | FT154013 | ** | |||||||
15756339-G-C | 13644459-G-C | ** | ||||||||
15834309-G-C | 13722429-G-C | ** | ||||||||
16021007-T-G | 13909127-T-G | ** | ||||||||
16033565-C-A | 13921685-C-A | ** | ||||||||
16033730-C-A | 13921850-C-A | ** | ||||||||
16053456-T-C | 13941576-T-C | ** | ||||||||
16054800-C-A | 13942920-C-A | ** | ||||||||
16070712-T-G | 13958832-T-G | ** | ||||||||
16070789-C-A | 13958909-C-A | ** | ||||||||
16073167-T-C | 13961287-T-C | ** | ||||||||
16277756-A-G | 14165876-A-G | ** | ||||||||
16319567-C-A | 14207687-C-A | ** | ||||||||
16418587-A-G | 14306707-A-G | ** | ||||||||
16431038-C-A | 14319158-C-A | ** | ||||||||
16481065-A-C | 14369185-A-C | ** | ||||||||
16481079-C-G | 14369199-C-G | ** | ||||||||
16489986-C-A | 14378106-C-A | ** | ||||||||
16590876-A-T | 14478996-A-T | ** | ||||||||
16702374-GC-G | 14590494-GC-G | ** | ||||||||
16814695-C-A | 14702815-C-A | ** | ||||||||
16896247-A-T | 14784367-A-T | ** | ||||||||
17028842-G-C | 14916962-G-C | ** | ||||||||
17032653-C-T | 14920773-C-T | ** | ||||||||
17032771-A-G | 14920891-A-G | ** | ||||||||
17032776-A-G | 14920896-A-G | ** | ||||||||
17032778-T-C | 14920898-T-C | ** | ||||||||
17115174-G-C | 15003294-G-C | ** | ||||||||
17122384-C-A | 15010504-C-A | ** | ||||||||
17126058-T-A | 15014178-T-A | ** | ||||||||
17126499-T-G | 15014619-T-G | ** | ||||||||
17151390-AG-A | 15039510-AG-A | ** | ||||||||
17151394-T-TA | 15039514-T-TA | ** | ||||||||
17151402-A-T | 15039522-A-T | ** | ||||||||
17151405-C-T | 15039525-C-T | 9×T | ** | |||||||
17203303-A-G | 15091423-A-G | ** | ||||||||
17215948-G-A | 15104068-G-A | ** | ||||||||
17302165-C-A | 15190285-C-A | ** | ||||||||
17302212-G-C | 15190332-G-C | ** | ||||||||
17302224-A-G | 15190344-A-G | ** | ||||||||
17385326-C-A | 15273446-C-A | ** | ||||||||
17426865-T-A | 15314985-T-A | ** | ||||||||
17428348-C-A | 15316468-C-A | ** | ||||||||
17538366-G-T | 15426486-G-T | ** | ||||||||
17548623-C-A | 15436743-C-A | ** | ||||||||
17622701-C-A | 15510821-C-A | FGC69976 | ** | |||||||
17669640-C-A | 15557760-C-A | ** | ||||||||
18022304-C-T | 15910424-C-T | ** | ||||||||
18037852-A-G | 15925972-A-G | ** | ||||||||
18042865-G-A | 15930985-G-A | ** | ||||||||
18042894-C-A | 15931014-C-A | ** | ||||||||
18071522-C-A | 15959642-C-A | ** | ||||||||
18090099-A-G | 15978219-A-G | ** | ||||||||
18106708-C-A | 15994828-C-A | ** | ||||||||
18108650-G-A | 15996770-G-A | ** | ||||||||
18151936-C-A | 16040056-C-A | ** | ||||||||
18173266-C-A | 16061386-C-A | ** | ||||||||
18174959-G-T | 16063079-G-T | ** | ||||||||
18187432-A-C | 16075552-A-C | ** | ||||||||
18401271-C-A | 16289391-C-A | P6_Gap | ** | |||||||
18779293-T-C | 16667413-T-C | ** | ||||||||
18844264-T-G | 16732384-T-G | ** | ||||||||
18864732-C-T | 16752852-C-T | ** | ||||||||
18997278-G-C | 16885398-G-C | ** | ||||||||
19009257-C-A | 16897377-C-A | ** | ||||||||
19023197-A-C | 16911317-A-C | ** | ||||||||
19023285-A-G | 16911405-A-G | ** | ||||||||
19055496-A-T | 16943616-A-T | ** | ||||||||
19056262-T-C | 16944382-T-C | ** | ||||||||
19088421-T-A | 16976541-T-A | ** | ||||||||
19122064-C-A | 17010184-C-A | ** | ||||||||
19168694-T-G | 17056814-T-G | ** | ||||||||
19189582-G-A | 17077702-G-A | ** | ||||||||
19218363-G-T | 17106483-G-T | ** | ||||||||
19271580-T-G | 17159700-T-G | ** | ||||||||
19296988-C-T | 17185108-C-T | ** | ||||||||
19410037-G-C | 17298157-G-C | ** | ||||||||
19476502-C-A | 17364622-C-A | ** | ||||||||
19496067-A-T | 17384187-A-T | ** | ||||||||
19610432-C-A | 17498552-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19741021-C-G | 17629141-C-G | P5_Prx | ** | |||||||
19838993-A-G | 17727113-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
19873756-C-G | 17761876-C-G | P5_Prx | ** | |||||||
19966541-T-A | 17854661-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19966543-T-A | 17854663-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
20216470-T-TC | 18054584-T-TC | P5_Dst | ** | |||||||
20255056-C-A | 18093170-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
20409529-G-T | 18247643-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20535031-A-T | 18373145-A-T | P5_Dst | ** | |||||||
20693693-T-C | 18531807-T-C | P4_Prx | ** | |||||||
20809875-G-A | 18647989-G-A | P4_Gap | ** | |||||||
20840823-C-T | 18678937-C-T | P4_Gap | ** | |||||||
21201324-T-A | 19039438-T-A | ** | ||||||||
21207810-C-A | 19045924-C-A | ** | ||||||||
21305022-T-C | 19143136-T-C | ** | ||||||||
21382717-G-A | 19220831-G-A | FT253828 | ** | |||||||
21392714-G-T | 19230828-G-T | ** | ||||||||
21394108-C-A | 19232222-C-A | ** | ||||||||
21394556-C-A | 19232670-C-A | ** | ||||||||
21422154-C-T | 19260268-C-T | ** | ||||||||
21488696-A-T | 19326810-A-T | ** | ||||||||
21505581-T-G | 19343695-T-G | ** | ||||||||
21589436-G-A | 19427550-G-A | ** | ||||||||
21617728-C-A | 19455842-C-A | ** | ||||||||
21709243-A-G | 19547357-A-G | ** | ||||||||
21709250-G-A | 19547364-G-A | ** | ||||||||
21709257-A-G | 19547371-A-G | ** | ||||||||
21769977-C-A | 19608091-C-A | ** | ||||||||
21773973-A-C | 19612087-A-C | ** | ||||||||
21807113-C-G | 19645227-C-G | ** | ||||||||
21836485-A-G | 19674599-A-G | ** | ||||||||
21884445-C-A | 19722559-C-A | ** | ||||||||
21945244-T-A | 19783358-T-A | ** | ||||||||
22040976-T-A | 19879090-T-A | ** | ||||||||
22077009-C-A | 19915123-C-A | ** | ||||||||
22088862-G-T | 19926976-G-T | ** | ||||||||
22089967-C-A | 19928081-C-A | ** | ||||||||
22101029-A-C | 19939143-A-C | ** | ||||||||
22167865-A-T | 20005979-A-T | ** | ||||||||
22167876-T-G | 20005990-T-G | ** | ||||||||
22167884-A-G | 20005998-A-G | ** | ||||||||
22167889-A-G | 20006003-A-G | ** | ||||||||
22167886-GAGAC-G | 20006000-GAGAC-G | ** | ||||||||
22167904-A-G | 20006018-A-G | ** | ||||||||
22340050-T-A | 20178164-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
22340052-C-T | 20178166-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
22518504-T-G | 20356618-T-G | ** | ||||||||
22587930-T-A | 20426044-T-A | ** | ||||||||
22613967-G-T | 20452081-G-T | ** | ||||||||
22696061-C-A | 20534175-C-A | ** | ||||||||
22765619-C-T | 20603733-C-T | ** | ||||||||
22783109-T-A | 20621223-T-A | ** | ||||||||
22787198-C-A | 20625312-C-A | ** | ||||||||
22803990-A-T | 20642104-A-T | ** | ||||||||
22811932-A-T | 20650046-A-T | ** | ||||||||
22811948-A-T | 20650062-A-T | ** | ||||||||
22836735-C-A | 20674849-C-A | ** | ||||||||
22962177-C-A | 20800291-C-A | ** | ||||||||
22991687-A-T | 20829801-A-T | ** | ||||||||
23006642-G-A | 20844756-G-A | ** | ||||||||
23007771-G-T | 20845885-G-T | ** | ||||||||
23019742-C-A | 20857856-C-A | ** | ||||||||
23047577-A-G | 20885691-A-G | ** | ||||||||
23059625-G-T | 20897739-G-T | ** | ||||||||
23123149-T-G | 20961263-T-G | ** | ||||||||
23137473-A-G | 20975587-A-G | ** | ||||||||
23143013-T-C | 20981127-T-C | ** | ||||||||
23200783-C-A | 21038897-C-A | ** | ||||||||
23277346-A-G | 21115460-A-G | ** | ||||||||
23291304-C-A | 21129418-C-A | ** | ||||||||
23315913-C-T | 21154027-C-T | ** | ||||||||
23476006-GTT-G | 21314120-GTT-G | 11×T | ** | |||||||
23773821-C-A | 21611935-C-A | FTB38830 | ** | |||||||
23779877-A-T | 21617991-A-T | ** | ||||||||
23788206-T-C | 21626320-T-C | ** | ||||||||
23802379-G-A | 21640493-G-A | ** | ||||||||
23818266-G-T | 21656380-G-T | ** | ||||||||
21755469-G-T | ** | |||||||||
21755497-G-C | ** | |||||||||
21755568-A-C | ** | |||||||||
24244652-C-T | 22098505-C-T | P3_b1 | ** | |||||||
24264510-T-C | 22118363-T-C | P3_b1 | ** | |||||||
24405079-T-G | 22258932-T-G | ** | ||||||||
24406250-G-A | 22260103-G-A | ** | ||||||||
24407198-A-C | 22261051-A-C | ** | ||||||||
24432829-C-A | 22286682-C-A | ** | ||||||||
24434962-T-G | 22288815-T-G | ** | ||||||||
24446786-G-C | 22300639-G-C | ** | ||||||||
24446794-G-C | 22300647-G-C | ** | ||||||||
24602337-TTG-T | 22456190-TTG-T | P3_t2 | ** | |||||||
24629546-G-T | 22483399-G-T | P3_t2 | ** | |||||||
24931840-G-C | 22785693-G-C | g1 | ** | |||||||
25514628-T-TTA | 23368481-T-TTA | P1_gr1 | ** | |||||||
25561029-G-T | 23414882-G-T | P1_gr1 | ** | |||||||
25966397-G-C | 23820250-G-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26026437-A-G | 23880290-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26047495-C-A | 23901348-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26204654-G-A | 24058507-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26248201-T-A | 24102054-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26453076-T-TA | 24306929-T-TA | P1_Y1 | ** | |||||||
26834665-GAGAA-G | 24688518-GAGAA-G | P1_g2 | 4×AGAA | ** | ||||||
27737589-A-T | 25591442-A-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27737591-A-C | 25591444-A-C | P1_Y2 | ** | |||||||
27737597-A-T | 25591450-A-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27737598-TG-T | 25591451-TG-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27737604-TA-T | 25591457-TA-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27737618-T-A | 25591471-T-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27872567-G-C | 25726420-G-C | P1_Y2 | ** | |||||||
27979924-G-T | 25833777-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
28461580-C-A | 26315433-C-A | ** | ||||||||
28468415-AT-A | 26322268-AT-A | ** | ||||||||
28468424-ATT-A | 26322277-ATT-A | ** | ||||||||
28485771-C-A | 26339624-C-A | ** | ||||||||
28506258-C-G | 26360111-C-G | ** | ||||||||
28510986-A-T | 26364839-A-T | ** | ||||||||
28537018-C-A | 26390871-C-A | ** | ||||||||
28650095-C-T | 26503948-C-T | ** | ||||||||
28661720-A-C | 26515573-A-C | ** | ||||||||
28708449-C-A | 26562302-C-A | ** | ||||||||
28724813-C-A | 26578666-C-A | ** | ||||||||
28727852-C-A | 26581705-C-A | ** | ||||||||
28744662-C-A | 26598515-C-A | ** | ||||||||
28808641-A-G | 26662494-A-G | ** | ||||||||
56841349-G-A | ** | |||||||||
56846462-C-A | ** | |||||||||
56846655-G-T | ** | |||||||||
56847655-C-A | ** | |||||||||
7055-C-T | ** | |||||||||
11268-A-G | ** | |||||||||
19088-A-T | ** | |||||||||
19675-G-T | ** | |||||||||
19698-G-A | ** | |||||||||
19731-A-T | ** | |||||||||
19741-C-T | ** | |||||||||
6247039-A-G | 6378998-A-G | IR3_Dst | ** | |||||||
10092899-T-C | 10255290-T-C | ** | ||||||||
6202144-T-C | 6334103-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6687207-GA-G | 6819166-GA-G | ** | ||||||||
7318515-T-C | 7450474-T-C | ** | ||||||||
15909754-C-T | 13797874-C-T | 18×AT | ** | |||||||
19512699-T-C | 17400819-T-C | ** | ||||||||
19709529-G-A | 17597649-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
21119645-C-T | 18957759-C-T | ** | ||||||||
22468325-A-G | 20306439-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
22996997-T-A | 20835111-T-A | ** | ||||||||
22997001-T-C | 20835115-T-C | ** | ||||||||
26144303-A-AG | 23998156-A-AG | P1_Y1 | ** | |||||||
13860079-A-C,T | 11739373-A-C,T | *** | ||||||||
16720464-C-T | 14608584-C-T | Z12293 | *** | |||||||
13845688-C-T | 11724982-C-T | FT276863 | *** | |||||||
13845689-T-G | 11724983-T-G | *** | ||||||||
13461083-G-A | 11305407-G-A | *** | ||||||||
4438156-C-A | 4570115-C-A | *** | ||||||||
22224257-C-A | 20062371-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
22289224-A-C | 20127338-A-C | DYZ19 | *** | |||||||
22316519-C-G | 20154633-C-G | DYZ19 | *** | |||||||
22479277-A-T | 20317391-A-T | DYZ19 | *** | |||||||
24314532-A-T | 22168385-A-T | P3_t1 | *** | |||||||
25103995-G-A | 22957848-G-A | g1 | *** | |||||||
14394468-TA-T,TAA | 12273764-TA-T,TAA | 16×A | *** | |||||||
13940153-CATAAATAA-C,CATAA | 11819447-CATAAATAA-C,CATAA | 11×ATAA | *** | |||||||
23421129-G-C | 21259243-G-C | *** | ||||||||
13461082-A-G | 11305406-A-G | *** | ||||||||
13461099-G-C | 11305423-G-C | *** | ||||||||
20829702-G-A | 18667816-G-A | P4_Gap | *** | |||||||
10991291-T-A | FT56488 | *** | ||||||||
13878513-A-T | 11757807-A-T | FTB32984 | *** | |||||||
14701989-C-A | 12590055-C-A | *** | ||||||||
8881059-CAAA-C | 9013018-CAAA-C | 14×A | *** | |||||||
10941626-G-T | *** | |||||||||
13643086-C-A | 11487410-C-A | *** | ||||||||
16679130-A-T | 14567250-A-T | *** | ||||||||
23189865-GA-G,GAA | 21027979-GA-G,GAA | 13×A | *** | |||||||
56842440-C-A | *** | |||||||||
3966962-G-T | 4098921-G-T | *** | ||||||||
9930134-GCCCGCCCCT-G | 10092525-GCCCGCCCCT-G | *** | ||||||||
3606145-A-G | 3738104-A-G | *** | ||||||||
4527492-C-A | 4659451-C-A | *** | ||||||||
6347736-A-T | 6479695-A-T | *** | ||||||||
6368184-T-C | 6500143-T-C | *** | ||||||||
7240675-A-G | 7372634-A-G | *** | ||||||||
7970860-CTTTT-C | 8102819-CTTTT-C | 12×T | *** | |||||||
8350819-C-A | 8482778-C-A | *** | ||||||||
8661604-C-A | 8793563-C-A | *** | ||||||||
9015662-C-A | 9178053-C-A | *** | ||||||||
9836888-GTTTTTTTTT-G | 9999279-GTTTTTTTTT-G | 20×T | *** | |||||||
10029358-C-G | 10191749-C-G | *** | ||||||||
10657221-A-T | *** | |||||||||
10663424-CCACCTCACTCCACTC-C,CCACTCCATTA | *** | |||||||||
10664947-G-T | *** | |||||||||
10671642-C-A | *** | |||||||||
10775258-C-A | *** | |||||||||
10951008-ATCCAT-A | *** | |||||||||
10972453-C-T | *** | |||||||||
10987483-C-A | *** | |||||||||
10989988-C-A | *** | |||||||||
11017488-C-A | *** | |||||||||
13488992-T-C,G | 11333316-T-C,G | *** | ||||||||
13856751-T-A | 11736045-T-A | *** | ||||||||
14376507-C-A | 12255803-C-A | *** | ||||||||
15762033-G-T | 13650153-G-T | *** | ||||||||
17950875-T-G | 15838995-T-G | *** | ||||||||
19330311-C-T | 17218431-C-T | *** | ||||||||
19345484-C-A | 17233604-C-A | *** | ||||||||
21068487-C-A | 18906601-C-A | *** | ||||||||
21469275-C-A | 19307389-C-A | *** | ||||||||
21491113-T-C | 19329227-T-C | *** | ||||||||
21584159-T-A | 19422273-T-A | *** | ||||||||
22085508-T-A | 19923622-T-A | *** | ||||||||
22167839-T-G | 20005953-T-G | *** | ||||||||
22538714-TA-T | 20376828-TA-T | *** | ||||||||
22814091-C-A | 20652205-C-A | *** | ||||||||
23373247-C-A | 21211361-C-A | *** | ||||||||
23421133-C-T | 21259247-C-T | *** | ||||||||
23421148-C-A | 21259262-C-A | *** | ||||||||
23421151-C-G | 21259265-C-G | *** | ||||||||
23997697-C-A | 21851550-C-A | *** | ||||||||
56841601-T-A | *** | |||||||||
16013074-G-T | 13901194-G-T | *** | ||||||||
13571739-T-C | 11416063-T-C | *** | ||||||||
25030227-A-G | 22884080-A-G | g1 | *** | |||||||
3451654-A-G | 3583613-A-G | *** | ||||||||
10079963-C-T | 10242354-C-T | *** | ||||||||
13250239-A-G | 11094563-A-G | *** | ||||||||
16013062-G-GGT | 13901182-G-GGT | 8×T | *** | |||||||
17944933-A-AT | 15833053-A-AT | *** | ||||||||
21697573-C-T | 19535687-C-T | *** | ||||||||
22477609-G-A | 20315723-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
24417004-G-A | 22270857-G-A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.