Moore
BigY3: 289565, FTDNA: 289565, BigY2: 289565Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | BigY3 289565 | FTDNA 289565 | BigY2 289565 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
28442337-C-T | 26296190-C-T | P1_gr2 | A+ | |||||||
22550892-T-C | 20389006-T-C | Y | Y | A* | ||||||
25520576-G-A | 23374429-G-A | P1_gr1 | A* | |||||||
58994473-G-T | 56848326-G-T | A* | ||||||||
20766511-G-A | 18604625-G-A | P4_Prx | A* | |||||||
25979863-G-A | 23833716-G-A | P1_Y1 | A* | |||||||
18363138-T-C | 16251258-T-C | P6_Prx | A* | |||||||
5353631-T-C | 5485590-T-C | FT241580 | + | |||||||
17497776-T-C | 15385896-T-C | Y99330 | Y | Y | + | ** | ||||
4245824-T-G | 4377783-T-G | FT241292 | + | |||||||
15899421-A-G | 13787541-A-G | Y95069 | Y | Y | + | + | + | |||
15793946-G-A | 13682066-G-A | PF3734 CTS4745 | Y | + | ||||||
18209102-G-A | 16097222-G-A | Y | Y | *** | * | |||||
15964692-A-C | 13852812-A-C | ** | ||||||||
15770250-G-T | 13658370-G-T | ** | ||||||||
15873433-C-A | 13761553-C-A | ** | ||||||||
15898973-C-A | 13787093-C-A | ** | ||||||||
15710363-A-G | 13598483-A-G | ** | ||||||||
15906002-C-G | 13794122-C-G | ** | ||||||||
15940261-C-T | 13828381-C-T | ** | ||||||||
15665687-C-A | 13553807-C-A | ** | ||||||||
15741139-G-A | 13629259-G-A | ** | ||||||||
13857413-C-A | 11736707-C-A | ** | ||||||||
16075921-A-G | 13964041-A-G | ** | ||||||||
16196202-G-A | 14084322-G-A | ** | ||||||||
16221474-C-A | 14109594-C-A | ** | ||||||||
16279560-C-A | 14167680-C-A | ** | ||||||||
16302409-C-A | 14190529-C-A | ** | ||||||||
16427629-A-G | 14315749-A-G | ** | ||||||||
16428535-C-T | 14316655-C-T | ** | ||||||||
16463930-C-A | 14352050-C-A | ** | ||||||||
16474627-C-A | 14362747-C-A | ** | ||||||||
16545388-T-A | 14433508-T-A | ** | ||||||||
16645642-C-T | 14533762-C-T | ** | ||||||||
16399852-C-A | 14287972-C-A | ** | ||||||||
15579963-G-A | 13468083-G-A | ** | ||||||||
15619852-C-A | 13507972-C-A | ** | ||||||||
15374487-C-A | 13262607-C-A | ** | ||||||||
15151402-C-A | 13039489-C-A | ** | ||||||||
15178034-C-A | 13066120-C-A | ** | ||||||||
15179356-T-G | 13067442-T-G | ** | ||||||||
15202166-C-A | 13090252-C-A | ** | ||||||||
15252760-C-A | 13140846-C-A | ** | ||||||||
15258560-C-G | 13146644-C-G | ** | ||||||||
15280343-T-C | 13168442-T-C | ** | ||||||||
15280361-C-A | 13168460-C-A | ** | ||||||||
15354990-C-A | 13243109-C-A | ** | ||||||||
15403568-T-C | 13291688-T-C | ** | ||||||||
15606998-C-A | 13495118-C-A | ** | ||||||||
15406927-T-A | 13295047-T-A | ** | ||||||||
15410394-A-G | 13298514-A-G | ** | ||||||||
15410531-G-T | 13298651-G-T | ** | ||||||||
15468631-C-A | 13356751-C-A | ** | ||||||||
15496967-T-C | 13385087-T-C | FTB10974 | ** | |||||||
15542644-C-T | 13430764-C-T | ** | ||||||||
15542647-T-A | 13430767-T-A | ** | ||||||||
16826482-C-A | 14714602-C-A | ** | ||||||||
15592820-A-G | 13480940-A-G | ** | ||||||||
15592821-G-T | 13480941-G-T | ** | ||||||||
16707622-C-A | 14595742-C-A | Y97083 | ** | |||||||
16952975-C-A | 14841095-C-A | ** | ||||||||
16848580-T-C | 14736700-T-C | ** | ||||||||
17770219-C-A | 15658339-C-A | ** | ||||||||
17692080-A-T | 15580200-A-T | ** | ||||||||
17718291-G-A | 15606411-G-A | ** | ||||||||
17721059-C-T | 15609179-C-T | ** | ||||||||
17723010-A-T | 15611130-A-T | ** | ||||||||
17723017-G-A | 15611137-G-A | ** | ||||||||
17760437-C-A | 15648557-C-A | ** | ||||||||
17770203-G-A | 15658323-G-A | ** | ||||||||
17770210-G-C | 15658330-G-C | ** | ||||||||
17770213-A-T | 15658333-A-T | ** | ||||||||
17770718-C-A | 15658838-C-A | ** | ||||||||
17568487-C-A | 15456607-C-A | ** | ||||||||
17819517-C-A | 15707637-C-A | ** | ||||||||
17860790-G-T | 15748910-G-T | ** | ||||||||
17864116-C-A | 15752236-C-A | ** | ||||||||
17882814-C-A | 15770934-C-A | ** | ||||||||
17930882-G-T | 15819002-G-T | ** | ||||||||
17963639-G-A | 15851759-G-A | ** | ||||||||
18036559-A-C | 15924679-A-C | ** | ||||||||
18094209-C-A | 15982329-C-A | ** | ||||||||
18108684-T-C | 15996804-T-C | ** | ||||||||
17598010-C-A | 15486130-C-A | ** | ||||||||
17561319-C-A | 15449439-C-A | ** | ||||||||
16860721-C-A | 14748841-C-A | ** | ||||||||
17139693-C-A | 15027813-C-A | ** | ||||||||
16886984-C-A | 14775104-C-A | ** | ||||||||
16904531-C-A | 14792651-C-A | ** | ||||||||
16920004-C-A | 14808124-C-A | ** | ||||||||
15133365-T-G | 13021452-T-G | ** | ||||||||
17004648-CT-C | 14892768-CT-C | ** | ||||||||
17018874-C-A | 14906994-C-A | ** | ||||||||
17071270-T-A | 14959390-T-A | ** | ||||||||
17100346-C-A | 14988466-C-A | ** | ||||||||
17135973-C-A | 15024093-C-A | ** | ||||||||
17152786-T-G | 15040906-T-G | ** | ||||||||
17560523-C-A | 15448643-C-A | ** | ||||||||
17159437-T-A | 15047557-T-A | ** | ||||||||
17251045-T-C | 15139165-T-C | ** | ||||||||
17277362-C-A | 15165482-C-A | ** | ||||||||
17295962-C-A | 15184082-C-A | ** | ||||||||
17306755-T-A | 15194875-T-A | ** | ||||||||
17309952-T-C | 15198072-T-C | FGC22840 | ** | |||||||
17330258-C-A | 15218378-C-A | ** | ||||||||
17375472-T-A | 15263592-T-A | ** | ||||||||
17444830-A-G | 15332950-A-G | ** | ||||||||
17470783-C-A | 15358903-C-A | ** | ||||||||
15138223-A-G | 13026310-A-G | ** | ||||||||
14867176-C-A | 12755246-C-A | ** | ||||||||
15111555-G-T | 12999642-G-T | ** | ||||||||
13998276-C-T | 11877570-C-T | ** | ||||||||
11671536-G-A | ** | |||||||||
11675064-C-A | ** | |||||||||
13821478-G-A | 11700772-G-A | ** | ||||||||
2783733-AC-A | 2915692-AC-A | ** | ||||||||
13884182-T-A | 11763476-T-A | ** | ||||||||
13888525-G-A | 11767819-G-A | ** | ||||||||
13888622-A-C | 11767916-A-C | ** | ||||||||
13894188-A-G | 11773482-A-G | ** | ||||||||
13929821-C-A | 11809115-C-A | ** | ||||||||
14041046-C-T | 11920340-C-T | ** | ||||||||
11645677-A-T | ** | |||||||||
14079794-G-T | 11959088-G-T | ** | ||||||||
14088448-T-C | 11967742-T-C | ** | ||||||||
14191247-C-A | 12070541-C-A | ** | ||||||||
14191423-A-C | 12070717-A-C | ** | ||||||||
14212226-A-G | 12091520-A-G | ** | ||||||||
14224499-A-C | 12103793-A-C | ** | ||||||||
14234705-C-A | 12113999-C-A | ** | ||||||||
14339136-C-T | 12218431-C-T | ** | ||||||||
14340902-A-T | 12220197-A-T | ** | ||||||||
11658302-C-A | ** | |||||||||
13588515-C-A | 11432839-C-A | ** | ||||||||
14366582-T-G | 12245877-T-G | ** | ||||||||
11022981-C-A | ** | |||||||||
10998681-A-C | ** | |||||||||
10998713-T-A | ** | |||||||||
10998722-CA-C | ** | |||||||||
10998726-TCTCG-T | ** | |||||||||
10998744-T-C | ** | |||||||||
11000524-C-T | ** | |||||||||
11000789-A-T | ** | |||||||||
11013146-G-T | ** | |||||||||
11022954-C-CACCACTCCAG | ** | |||||||||
11027406-C-A | ** | |||||||||
13588510-C-T | 11432834-C-T | ** | ||||||||
13197114-C-A | 11041438-C-A | ** | ||||||||
13224743-C-A | 11069067-C-A | ** | ||||||||
13298517-T-G | 11142841-T-G | ** | ||||||||
13322106-C-A | 11166430-C-A | ** | ||||||||
13445395-C-A | 11289719-C-A | ** | ||||||||
13456938-A-G | 11301262-A-G | ** | ||||||||
13463477-C-A | 11307801-C-A | ** | ||||||||
13474034-A-C | 11318358-A-C | ** | ||||||||
13523621-T-C | 11367945-T-C | ** | ||||||||
13584738-C-A | 11429062-C-A | ** | ||||||||
14354413-G-T | 12233708-G-T | ** | ||||||||
14369610-G-T | 12248906-G-T | ** | ||||||||
15093603-C-A | 12981691-C-A | ** | ||||||||
14825973-G-C | 12714040-G-C | ** | ||||||||
14694682-T-C | 12582748-T-C | ** | ||||||||
14711905-G-T | 12599972-G-T | ** | ||||||||
14714702-A-C | 12602769-A-C | ** | ||||||||
14724403-C-A | 12612471-C-A | ** | ||||||||
14754094-T-G | 12642163-T-G | ** | ||||||||
14780962-C-T | 12669032-C-T | ** | ||||||||
14785512-G-A | 12673582-G-A | ** | ||||||||
14785528-A-AG | 12673598-A-AG | ** | ||||||||
14811078-C-A | 12699149-C-A | FT151055 | ** | |||||||
14825976-T-C | 12714043-T-C | ** | ||||||||
14693856-T-C | 12581922-T-C | ** | ||||||||
14825983-G-A | 12714050-G-A | ** | ||||||||
14825986-T-C | 12714053-T-C | ** | ||||||||
14825987-G-A | 12714054-G-A | ** | ||||||||
14825992-A-AT | 12714059-A-AT | ** | ||||||||
14825999-T-C | 12714066-T-C | ** | ||||||||
18191337-C-A | 16079457-C-A | ** | ||||||||
14988780-T-C | 12876846-T-C | ** | ||||||||
14993884-G-T | 12881969-G-T | ** | ||||||||
14994375-C-A | 12882460-C-A | ** | ||||||||
15012784-T-A | 12900872-T-A | ** | ||||||||
14693860-T-C | 12581926-T-C | ** | ||||||||
14618708-C-A | 12506906-C-A | ** | ||||||||
14377059-A-G | 12256355-A-G | ** | ||||||||
14521787-C-A | 12409988-C-A | ** | ||||||||
14394464-C-A | 12273760-C-A | ** | ||||||||
14464277-T-G | 12343550-T-G | ** | ||||||||
14470484-T-C | 12349753-T-C | ** | ||||||||
14470588-C-A | 12349857-C-A | ** | ||||||||
14483424-T-G | 12362693-T-G | ** | ||||||||
14485251-G-T | 12364520-G-T | ** | ||||||||
14502319-C-A | 12390524-C-A | ** | ||||||||
14513307-A-C | 12401512-A-C | ** | ||||||||
14519434-C-A | 12407635-C-A | ** | ||||||||
14530458-A-T | 12418659-A-T | ** | ||||||||
14584646-T-A | 12472846-T-A | ** | ||||||||
14551613-A-G | 12439814-A-G | ** | ||||||||
14551617-A-G | 12439818-A-G | ** | ||||||||
14566601-T-C | 12454801-T-C | ** | ||||||||
14566604-G-C | 12454804-G-C | ** | ||||||||
14566686-C-G | 12454886-C-G | ** | ||||||||
14566688-T-C | 12454888-T-C | ** | ||||||||
14566689-T-G | 12454889-T-G | ** | ||||||||
14570778-T-G | 12458978-T-G | ** | ||||||||
14579558-T-C | 12467758-T-C | ** | ||||||||
14581127-G-T | 12469327-G-T | ** | ||||||||
18166092-T-C | 16054212-T-C | ** | ||||||||
18540224-C-A | 16428344-C-A | ** | ||||||||
18195290-C-A | 16083410-C-A | ** | ||||||||
23523637-G-T | 21361751-G-T | ** | ||||||||
23128496-T-C | 20966610-T-C | ** | ||||||||
23185928-G-T | 21024042-G-T | ** | ||||||||
23272505-T-C | 21110619-T-C | ** | ||||||||
23272518-C-T | 21110632-C-T | ** | ||||||||
23272519-A-G | 21110633-A-G | ** | ||||||||
23317928-C-G | 21156042-C-G | ** | ||||||||
23360540-C-A | 21198654-C-A | ** | ||||||||
23419022-T-C | 21257136-T-C | ** | ||||||||
23419540-G-C | 21257654-G-C | ** | ||||||||
23572499-G-T | 21410613-G-T | ** | ||||||||
22920660-C-G | 20758774-C-G | ** | ||||||||
23654846-C-A | 21492960-C-A | ** | ||||||||
23808732-C-A | 21646846-C-A | ** | ||||||||
23817818-G-T | 21655932-G-T | ** | ||||||||
23997628-G-A | 21851481-G-A | ** | ||||||||
23997711-C-T | 21851564-C-T | ** | ||||||||
23997729-C-A | 21851582-C-A | ** | ||||||||
24309055-T-C | 22162908-T-C | P3_t1 | ** | |||||||
24376203-C-A | 22230056-C-A | ** | ||||||||
24404265-C-T | 22258118-C-T | ** | ||||||||
23122625-C-A | 20960739-C-A | ** | ||||||||
22920647-C-T | 20758761-C-T | ** | ||||||||
25108822-A-T | 22962675-A-T | g1 | ** | |||||||
22366315-T-A | 20204429-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
22227940-G-C | 20066054-G-C | DYZ19 | ** | |||||||
22230713-T-C | 20068827-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22240964-A-T | 20079078-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
22241585-C-A | 20079699-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22287089-T-G | 20125203-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
22287096-T-A | 20125210-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
22340069-CT-C | 20178183-CT-C | DYZ19 | ** | |||||||
22345736-T-C | 20183850-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22351208-T-G | 20189322-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
22516055-C-A | 20354169-C-A | ** | ||||||||
22920631-GA-G | 20758745-GA-G | ** | ||||||||
22522726-C-G | 20360840-C-G | ** | ||||||||
22594406-AC-A | 20432520-AC-A | ** | ||||||||
22594422-C-G | 20432536-C-G | ** | ||||||||
22675564-T-C | 20513678-T-C | ** | ||||||||
22800753-C-A | 20638867-C-A | ** | ||||||||
22808923-C-A | 20647037-C-A | ** | ||||||||
22810670-G-A | 20648784-G-A | ** | ||||||||
22876341-G-C | 20714455-G-C | ** | ||||||||
22896131-C-A | 20734245-C-A | ** | ||||||||
22916898-G-A | 20755012-G-A | ** | ||||||||
24595286-A-G | 22449139-A-G | P3_t2 | ** | |||||||
25866399-G-A | 23720252-G-A | BY226435 | P1_Y1 | 9×A | ** | |||||
22218859-C-CT | 20056973-C-CT | DYZ19 | ** | |||||||
10526-A-G | ** | |||||||||
28798018-G-C | 26651871-G-C | ** | ||||||||
28798021-C-T | 26651874-C-T | FT462084 | ** | |||||||
56830057-C-A | ** | |||||||||
56833539-A-G | ** | |||||||||
56838885-C-A | ** | |||||||||
56842418-T-A | ** | |||||||||
56847257-G-T | ** | |||||||||
56849463-C-A | ** | |||||||||
56850050-C-A | ** | |||||||||
19906-T-C | ** | |||||||||
28767213-C-A | 26621066-C-A | ** | ||||||||
30952-A-AGAAT | ** | |||||||||
30976-G-T | ** | |||||||||
9634374-CA-C | 9796765-CA-C | IR3_Prx | 6×AAAT | ** | ||||||
8379358-T-C | 8511317-T-C | ** | ||||||||
8724133-T-C | 8856092-T-C | ** | ||||||||
8724136-GTT-G | 8856095-GTT-G | ** | ||||||||
13361705-C-T | 11206029-C-T | ** | ||||||||
14464627-CA-C | 12343900-CA-C | ** | ||||||||
19629170-A-G | 17517290-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
20989149-A-G | 18827263-A-G | P4_Dst | ** | |||||||
28797972-AGAAAG-A | 26651825-AGAAAG-A | ** | ||||||||
28765547-TC-T | 26619400-TC-T | ** | ||||||||
25931653-A-AT | 23785506-A-AT | P1_Y1 | ** | |||||||
27775447-T-TG | 25629300-T-TG | P1_Y2 | ** | |||||||
25937793-A-G | 23791646-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26100872-T-C | 23954725-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26135004-C-A | 23988857-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26229952-T-G | 24083805-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26286199-A-AT | 24140052-A-AT | P1_Y1 | ** | |||||||
26656690-G-T | 24510543-G-T | P1_g2 | ** | |||||||
27527227-T-C | 25381080-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
27610060-G-T | 25463913-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27610080-A-C | 25463933-A-C | P1_Y2 | ** | |||||||
27810394-A-G | 25664247-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
28660938-C-A | 26514791-C-A | ** | ||||||||
27840536-T-C | 25694389-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
27906679-A-C | 25760532-A-C | P1_Y2 | ** | |||||||
27906802-A-G | 25760655-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
28005239-A-G | 25859092-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
28480997-T-C | 26334850-T-C | FT374293 | ** | |||||||
28481011-T-C | 26334864-T-C | ** | ||||||||
28481011-T-TA | 26334864-T-TA | ** | ||||||||
28497362-T-C | 26351215-T-C | ** | ||||||||
28591215-C-A | 26445068-C-A | ** | ||||||||
28660058-C-A | 26513911-C-A | ** | ||||||||
22218867-G-A | 20056981-G-A | FGC78830 | DYZ19 | ** | ||||||
22166566-A-T | 20004680-A-T | ** | ||||||||
18232202-C-A | 16120322-C-A | ** | ||||||||
19415925-C-T | 17304045-C-T | ** | ||||||||
19058042-C-A | 16946162-C-A | ** | ||||||||
19088543-C-A | 16976663-C-A | ** | ||||||||
19251391-C-A | 17139511-C-A | ** | ||||||||
19256354-C-A | 17144474-C-A | ** | ||||||||
19280872-C-A | 17168992-C-A | ** | ||||||||
19333271-T-C | 17221391-T-C | ** | ||||||||
19356865-T-C | 17244985-T-C | ** | ||||||||
19392976-T-C | 17281096-T-C | ** | ||||||||
19399953-C-A | 17288073-C-A | ** | ||||||||
19435775-A-G | 17323895-A-G | ** | ||||||||
18986493-C-A | 16874613-C-A | ** | ||||||||
19435778-T-C | 17323898-T-C | ** | ||||||||
19517298-C-A | 17405418-C-A | ** | ||||||||
19518655-A-T | 17406775-A-T | ** | ||||||||
19535583-G-C | 17423703-G-C | ** | ||||||||
19558874-T-G | 17446994-T-G | ** | ||||||||
19560187-A-G | 17448307-A-G | ** | ||||||||
19600441-A-G | 17488561-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
19600450-T-TGG | 17488570-T-TGG | P5_Prx | ** | |||||||
19663418-A-C | 17551538-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
19019543-C-A | 16907663-C-A | ** | ||||||||
18966065-T-A | 16854185-T-A | ** | ||||||||
19663436-G-T | 17551556-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
18739472-GAC-G | 16627592-GAC-G | ** | ||||||||
18255026-A-T | 16143146-A-T | ** | ||||||||
18345950-ACAT-A | 16234070-ACAT-A | P6_Prx | ** | |||||||
18385211-C-A | 16273331-C-A | P6_Gap | ** | |||||||
18443033-T-C | 16331153-T-C | P6_Dst | ** | |||||||
10997031-CTTT-C | ** | |||||||||
18589818-C-A | 16477938-C-A | ** | ||||||||
18596493-T-A | 16484613-T-A | ** | ||||||||
18685445-C-A | 16573565-C-A | ** | ||||||||
18717835-T-A | 16605955-T-A | ** | ||||||||
18793498-C-T | 16681618-C-T | ** | ||||||||
18961460-C-A | 16849580-C-A | ** | ||||||||
18804482-GA-G | 16692602-GA-G | ** | ||||||||
18814887-C-A | 16703007-C-A | ** | ||||||||
18853940-A-G | 16742060-A-G | ** | ||||||||
18874369-A-G | 16762489-A-G | ** | ||||||||
18891312-T-C | 16779432-T-C | F23016 | ** | |||||||
18891322-A-G | 16779442-A-G | F23017 | ** | |||||||
18891326-C-T | 16779446-C-T | ** | ||||||||
18910881-T-C | 16799001-T-C | ** | ||||||||
18915339-C-A | 16803459-C-A | ** | ||||||||
18937346-C-A | 16825466-C-A | ** | ||||||||
19663433-G-T | 17551553-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19693218-C-A | 17581338-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
22133872-G-T | 19971986-G-T | ** | ||||||||
21556798-AT-A | 19394912-AT-A | ** | ||||||||
21201376-C-A | 19039490-C-A | ** | ||||||||
21285519-C-A | 19123633-C-A | ** | ||||||||
21306851-C-CT | 19144965-C-CT | ** | ||||||||
21306853-CT-C | 19144967-CT-C | ** | ||||||||
21315437-C-A | 19153551-C-A | ** | ||||||||
21462624-C-A | 19300738-C-A | ** | ||||||||
21477121-C-A | 19315235-C-A | ** | ||||||||
21514070-A-C | 19352184-A-C | ** | ||||||||
21551430-G-C | 19389544-G-C | ** | ||||||||
21558722-CAAAAAAA-C | 19396836-CAAAAAAA-C | 16×A | ** | |||||||
21132681-GTTTTTTT-G | 18970795-GTTTTTTT-G | 18×T | ** | |||||||
21558796-T-C | 19396910-T-C | ** | ||||||||
21677088-C-A | 19515202-C-A | ** | ||||||||
21690196-T-C | 19528310-T-C | ** | ||||||||
21697300-T-C | 19535414-T-C | ** | ||||||||
21738464-A-G | 19576578-A-G | ** | ||||||||
21824913-C-A | 19663027-C-A | ** | ||||||||
21836261-C-A | 19674375-C-A | ** | ||||||||
21920763-C-A | 19758877-C-A | ** | ||||||||
21932631-C-A | 19770745-C-A | ** | ||||||||
22030000-C-A | 19868114-C-A | ** | ||||||||
21182383-G-A | 19020497-G-A | ** | ||||||||
21105548-G-T | 18943662-G-T | ** | ||||||||
19693273-C-G | 17581393-C-G | P5_Prx | ** | |||||||
20291727-A-AC | 18129841-A-AC | P5_Dst | ** | |||||||
19693302-T-TG | 17581422-T-TG | P5_Prx | ** | |||||||
19873594-T-C | 17761714-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
19936154-T-G | 17824274-T-G | P5_Prx | ** | |||||||
20065170-T-A | 17953290-T-A | P5_Gap | ** | |||||||
20215891-G-A | 18054005-G-A | P5_Dst | ** | |||||||
20215895-G-T | 18054009-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20215903-C-T | 18054017-C-T | P5_Dst | 21×AT | ** | ||||||
20215906-A-ATC | 18054020-A-ATC | P5_Dst | ** | |||||||
20253870-T-TTC | 18091984-T-TTC | P5_Dst | ** | |||||||
20470205-C-G | 18308319-C-G | P5_Dst | ** | |||||||
21090184-C-A | 18928298-C-A | ** | ||||||||
20510914-G-T | 18349028-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20778746-A-G | 18616860-A-G | P4_Prx | ** | |||||||
20815840-A-G | 18653954-A-G | P4_Gap | ** | |||||||
20840837-C-A | 18678951-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
20842440-G-A | 18680554-G-A | P4_Dst | ** | |||||||
20842535-AAAG-A | 18680649-AAAG-A | P4_Dst | ** | |||||||
21043948-C-A | 18882062-C-A | ** | ||||||||
21073204-G-A | 18911318-G-A | FT371049 | ** | |||||||
21077080-A-C | 18915194-A-C | ** | ||||||||
21090167-C-A | 18928281-C-A | ** | ||||||||
10998010-T-G | ** | |||||||||
13859169-G-T | 11738463-G-T | ** | ||||||||
10997024-CCA-C | ** | |||||||||
3076960-C-A | 3208919-C-A | ** | ||||||||
28645812-C-A | 26499665-C-A | ** | ||||||||
14192996-C-A | 12072290-C-A | ** | ||||||||
21133488-T-A | 18971602-T-A | ** | ||||||||
22176376-C-A | 20014490-C-A | ** | ||||||||
2701441-T-G | 2833400-T-G | ** | ||||||||
2745923-A-T | 2877882-A-T | ** | ||||||||
2752699-C-A | 2884658-C-A | ** | ||||||||
2884274-G-T | 3016233-G-T | ** | ||||||||
3112189-G-A | 3244148-G-A | ** | ||||||||
21663249-C-A | 19501363-C-A | ** | ||||||||
3229591-C-A | 3361550-C-A | ** | ||||||||
3559777-A-G | 3691736-A-G | ** | ||||||||
3587315-G-T | 3719274-G-T | ** | ||||||||
3587328-G-C | 3719287-G-C | ** | ||||||||
3846562-T-G | 3978521-T-G | ** | ||||||||
3846663-A-C | 3978622-A-C | ** | ||||||||
3865928-C-T | 3997887-C-T | ** | ||||||||
3990661-T-C | 4122620-T-C | ** | ||||||||
4133371-T-C | 4265330-T-C | ** | ||||||||
17802104-T-A | 15690224-T-A | ** | ||||||||
22914673-C-A | 20752787-C-A | FT44081 | ** | |||||||
4223925-A-G | 4355884-A-G | ** | ||||||||
21238163-A-G | 19076277-A-G | ** | ||||||||
10851002-C-T | ** | |||||||||
17548721-C-A | 15436841-C-A | ** | ||||||||
15084802-C-A | 12972892-C-A | ** | ||||||||
10945263-T-C | ** | |||||||||
3047601-C-A | 3179560-C-A | ** | ||||||||
6770828-C-A | 6902787-C-A | ** | ||||||||
28815141-A-C | 26668994-A-C | ** | ||||||||
5358827-C-A | 5490786-C-A | ** | ||||||||
28498030-C-A | 26351883-C-A | ** | ||||||||
13481970-C-A | 11326294-C-A | ** | ||||||||
10645895-C-A | FT428089 | ** | ||||||||
56835864-C-A | ** | |||||||||
14805941-C-A | 12694012-C-A | ** | ||||||||
8379449-A-T | 8511408-A-T | ** | ||||||||
14721470-C-A | 12609538-C-A | ** | ||||||||
10669483-C-T | ** | |||||||||
10669485-A-T | ** | |||||||||
10801055-T-C | ** | |||||||||
10801067-G-T | ** | |||||||||
4178526-T-C | 4310485-T-C | ** | ||||||||
4223953-T-G | 4355912-T-G | ** | ||||||||
9194475-C-A | 9356866-C-A | ** | ||||||||
5926919-G-A | 6058878-G-A | ** | ||||||||
5469493-G-T | 5601452-G-T | ** | ||||||||
5609661-C-A | 5741620-C-A | ** | ||||||||
5755995-G-T | 5887954-G-T | ** | ||||||||
5829697-GA-G | 5961656-GA-G | ** | ||||||||
5905870-G-A | 6037829-G-A | ** | ||||||||
5905880-G-A | 6037839-G-A | ** | ||||||||
5905889-T-A | 6037848-T-A | ** | ||||||||
5911802-A-C | 6043761-A-C | ** | ||||||||
6461518-C-A | 6593477-C-A | ** | ||||||||
5444973-G-T | 5576932-G-T | ** | ||||||||
6492131-TA-T | 6624090-TA-T | ** | ||||||||
6510772-A-C | 6642731-A-C | ** | ||||||||
6520062-C-A | 6652021-C-A | ** | ||||||||
6698938-T-G | 6830897-T-G | ** | ||||||||
6698940-T-C | 6830899-T-C | ** | ||||||||
6698967-G-C | 6830926-G-C | ** | ||||||||
6778952-C-A | 6910911-C-A | ** | ||||||||
6792548-G-A | 6924507-G-A | ** | ||||||||
6816542-T-C | 6948501-T-C | ** | ||||||||
5459721-C-A | 5591680-C-A | ** | ||||||||
5418223-C-A | 5550182-C-A | ** | ||||||||
4245409-C-T | 4377368-C-T | ** | ||||||||
4614857-C-T | 4746816-C-T | ** | ||||||||
4270728-G-T | 4402687-G-T | ** | ||||||||
4275001-A-G | 4406960-A-G | ** | ||||||||
4334994-G-T | 4466953-G-T | ** | ||||||||
10990166-C-G | ** | |||||||||
4439178-G-T | 4571137-G-T | ** | ||||||||
4470331-T-A | 4602290-T-A | ** | ||||||||
4523807-A-G | 4655766-A-G | ** | ||||||||
4527535-C-A | 4659494-C-A | ** | ||||||||
4538652-A-G | 4670611-A-G | ** | ||||||||
4752176-C-A | 4884135-C-A | ** | ||||||||
5376319-G-A | 5508278-G-A | ** | ||||||||
4874876-C-A | 5006835-C-A | ** | ||||||||
4951677-G-T | 5083636-G-T | ** | ||||||||
4957559-A-G | 5089518-A-G | ALK117 | ** | |||||||
4966325-C-A | 5098284-C-A | ** | ||||||||
5059678-ACCC-A | 5191637-ACCC-A | ** | ||||||||
5170201-C-A | 5302160-C-A | ** | ||||||||
5195833-C-T | 5327792-C-T | ** | ||||||||
5221004-A-G | 5352963-A-G | ** | ||||||||
5242805-A-G | 5374764-A-G | ** | ||||||||
10850990-CTGTCA-C | ** | |||||||||
16952563-C-A | 14840683-C-A | ** | ||||||||
6919889-C-A | 7051848-C-A | ** | ||||||||
6732544-C-A | 6864503-C-A | ** | ||||||||
7310571-C-T | 7442530-C-T | 21×T | ** | |||||||
10836496-C-A | ** | |||||||||
10959033-G-T | ** | |||||||||
22023223-A-G | 19861337-A-G | ** | ||||||||
13705506-G-C | 11549830-G-C | ** | ||||||||
28798022-A-G | 26651875-A-G | ** | ||||||||
10669517-T-G | ** | |||||||||
10669537-T-G | ** | |||||||||
7650234-C-A | 7782193-C-A | ** | ||||||||
14549307-C-A | 12437508-C-A | ** | ||||||||
10990176-A-C | ** | |||||||||
15138214-A-G | 13026301-A-G | ** | ||||||||
15138219-T-C | 13026306-T-C | ** | ||||||||
16090443-C-A | 13978563-C-A | ** | ||||||||
10892591-T-C | ** | |||||||||
10892599-A-G | ** | |||||||||
2745922-T-C | 2877881-T-C | YP5410 | ** | |||||||
21986411-C-A | 19824525-C-A | ** | ||||||||
22340038-A-G | 20178152-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
14754095-GA-G | 12642164-GA-G | ** | ||||||||
14351450-C-A | 12230745-C-A | ** | ||||||||
56839480-G-A | ** | |||||||||
24511197-T-C | 22365050-T-C | ** | ||||||||
14295751-C-A | 12175045-C-A | ** | ** | |||||||
22351189-C-G | 20189303-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
7197570-A-T | 7329529-A-T | 19×T | ** | |||||||
17071135-C-CGAAG | 14959255-C-CGAAG | 5×GAAG | ** | |||||||
21012235-C-G | 18850349-C-G | P4_Dst | ** | |||||||
22962202-G-T | 20800316-G-T | ** | ||||||||
28797996-G-T | 26651849-G-T | FGC62089 | ** | |||||||
13610952-C-A | 11455276-C-A | ** | ||||||||
8462064-CAAAAAAAAAAAAA-C | 8594023-CAAAAAAAAAAAAA-C | 26×A | ** | |||||||
6816545-TG-T | 6948504-TG-T | ** | ||||||||
22044072-C-A | 19882186-C-A | ** | ||||||||
7886381-C-T | 8018340-C-T | K119 | ** | |||||||
22351200-C-T | 20189314-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
22241507-C-A | 20079621-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
17770227-C-T | 15658347-C-T | FT98676 | FT98676 | ** | ||||||
18138428-G-T | 16026548-G-T | ** | ||||||||
21072375-C-A | 18910489-C-A | ** | ||||||||
5785654-T-A | 5917613-T-A | 24×A | ** | |||||||
14007528-C-A | 11886822-C-A | ** | ||||||||
11657092-C-A | ** | |||||||||
14007238-C-A | 11886532-C-A | ** | ||||||||
28724419-G-A | 26578272-G-A | ** | ||||||||
10944638-A-C | FT437649 | ** | ||||||||
17361057-T-A | 15249177-T-A | ** | ||||||||
18520341-G-T | 16408461-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
7723759-C-A | 7855718-C-A | ** | ||||||||
10658372-C-A | ** | |||||||||
22230717-G-A | 20068831-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
14468840-T-A | 12348109-T-A | ** | ||||||||
5905890-C-A | 6037849-C-A | 27×A | ** | |||||||
19745015-A-C | 17633135-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
10060613-C-A | 10223004-C-A | ** | ||||||||
13926636-C-A | 11805930-C-A | ** | ||||||||
6282260-A-C | 6414219-A-C | IR3_Dst | ** | |||||||
8002423-C-T | 8134382-C-T | ** | ||||||||
8774550-G-A | 8906509-G-A | ** | ||||||||
8774551-AT-A | 8906510-AT-A | ** | ||||||||
17770220-C-T | 15658340-C-T | ** | ||||||||
17770232-C-G | 15658352-C-G | ** | ||||||||
21946450-C-A | 19784564-C-A | ** | ||||||||
14192021-C-A | 12071315-C-A | ** | ||||||||
6461087-TA-T | 6593046-TA-T | 9×A | ** | |||||||
26047483-T-C | 23901336-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
9952239-C-A | 10114630-C-A | ** | ||||||||
5828950-T-C | 5960909-T-C | ** | ||||||||
10669466-T-TTCTTTTGCACTCGTC | ** | |||||||||
14697030-C-A | 12585096-C-A | ** | ||||||||
14593700-C-A | 12481900-C-A | ** | ||||||||
9077188-G-T | 9239579-G-T | FT34160 | ** | |||||||
14339128-G-T | 12218423-G-T | ** | ||||||||
15278959-C-A | 13167058-C-A | ** | ||||||||
10808628-C-T | ** | |||||||||
15653248-C-A | 13541368-C-A | ** | ||||||||
7196503-A-G | 7328462-A-G | ** | ||||||||
7922272-C-A | 8054231-C-A | F16442 | ** | |||||||
21152400-C-A | 18990514-C-A | ** | ||||||||
7132974-G-A | 7264933-G-A | ** | ||||||||
21237249-C-A | 19075363-C-A | ** | ||||||||
10851004-C-T | FT434099 | ** | ||||||||
56832092-C-A | ** | |||||||||
17517199-C-A | 15405319-C-A | ** | ||||||||
18573484-T-C | 16461604-T-C | ** | ||||||||
5853452-G-T | 5985411-G-T | ** | ||||||||
15406922-G-A | 13295042-G-A | FT336135 | ** | |||||||
14465288-C-A | 12344561-C-A | ** | ||||||||
22191605-C-A | 20029719-C-A | ** | ||||||||
10939567-G-C | ** | |||||||||
6833349-A-T | 6965308-A-T | ** | ||||||||
4375627-G-T | 4507586-G-T | ** | ||||||||
6944882-T-A | 7076841-T-A | ** | ||||||||
10652647-G-T | ** | |||||||||
6945928-C-A | 7077887-C-A | ** | ||||||||
9956378-A-AAG | 10118769-A-AAG | 8×AAG | ** | |||||||
9968372-A-G | 10130763-A-G | ** | ||||||||
10006010-C-A | 10168401-C-A | ** | ||||||||
10032837-C-A | 10195228-C-A | ** | ||||||||
10057905-T-A | 10220296-T-A | ** | ||||||||
10625737-C-A | ** | |||||||||
10648139-T-A | ** | |||||||||
10653306-C-A | ** | |||||||||
9805302-T-C | 9967693-T-C | ** | ||||||||
10654962-G-T | ** | |||||||||
10671677-A-C | ** | |||||||||
10679132-A-G | ** | |||||||||
10692221-C-A | ** | |||||||||
10752285-A-C | ** | |||||||||
10752300-A-C | ** | |||||||||
10764249-C-A | ** | |||||||||
10767983-G-T | ** | |||||||||
9942078-A-G | 10104469-A-G | ** | ||||||||
9768429-T-C | 9930820-T-C | ** | ||||||||
10769470-C-A | ** | |||||||||
9408432-C-A | 9570823-C-A | ** | ||||||||
8715180-A-C | 8847139-A-C | ** | ||||||||
8746210-C-A | 8878169-C-A | ** | ||||||||
8774540-A-G | 8906499-A-G | ** | ||||||||
8774542-A-G | 8906501-A-G | ** | ||||||||
8911502-A-C | 9043461-A-C | ** | ||||||||
8911505-A-C | 9043464-A-C | ** | ||||||||
9109596-G-T | ** | |||||||||
9025581-C-A | 9187972-C-A | ** | ||||||||
9414575-T-G | 9576966-T-G | ** | ||||||||
9735790-T-C | 9898181-T-C | IR3_Prx | ** | |||||||
9414664-G-T | 9577055-G-T | ** | ||||||||
9423100-C-A | 9585491-C-A | ** | ||||||||
9427928-T-G | 9590319-T-G | ** | ||||||||
9479510-T-G | 9641901-T-G | ** | ||||||||
9540268-T-C | 9702659-T-C | IR3_Prx | ** | |||||||
9618310-T-G | 9780701-T-G | IR3_Prx | ** | |||||||
9674067-A-G | 9836458-A-G | IR3_Prx | ** | |||||||
9734971-T-C | 9897362-T-C | IR3_Prx | ** | |||||||
10769452-T-C | ** | |||||||||
10770657-G-C | ** | |||||||||
8635362-C-A | 8767321-C-A | ** | ||||||||
10945268-T-C | ** | |||||||||
10917169-C-G | ** | |||||||||
10925703-C-A | ** | |||||||||
10930794-T-G | ** | |||||||||
10938217-T-C | ** | |||||||||
10938978-C-A | ** | |||||||||
10939562-C-A | ** | |||||||||
10945227-A-T | ** | |||||||||
10945243-CTCCATTCCGT-C | ** | |||||||||
10951028-C-G | ** | |||||||||
10893727-A-G | ** | |||||||||
10956713-C-T | ** | |||||||||
10964800-TC-T | ** | |||||||||
10965679-G-C | ** | |||||||||
10969857-C-A | ** | |||||||||
10978284-A-C | ** | |||||||||
10982147-T-C | ** | |||||||||
10982184-C-A | ** | |||||||||
10987768-C-G | ** | |||||||||
10911318-G-T | ** | |||||||||
10880774-G-T | BY11465 | FT87717 | ** | |||||||
10770916-C-A | ** | |||||||||
10805782-A-C | ** | |||||||||
10774054-C-T | ** | |||||||||
10780334-A-G | ** | |||||||||
10787401-C-T | ** | |||||||||
10789572-C-A | ** | |||||||||
10792319-C-T | ** | |||||||||
10804775-C-CATTCCCCTGCACTCGGGTTG | ** | |||||||||
10804799-C-A | ** | |||||||||
10804806-A-G | ** | |||||||||
10808663-T-TTCCAC | ** | |||||||||
10874132-A-C | ** | |||||||||
10821765-T-C | ** | |||||||||
10821808-A-T | ** | |||||||||
10825286-A-C | ** | |||||||||
10841036-C-A | ** | |||||||||
10843151-G-T | FT371308 | ** | ||||||||
10847518-T-C | ** | |||||||||
10848289-C-A | ** | |||||||||
10848347-C-A | ** | |||||||||
10849881-G-T | ** | |||||||||
8706800-C-A | 8838759-C-A | ** | ||||||||
9943443-G-A | 10105834-G-A | ** | ||||||||
8399351-A-G | 8531310-A-G | ** | ||||||||
7195216-A-C | 7327175-A-C | ** | ||||||||
7152537-C-A | 7284496-C-A | ** | ||||||||
7152543-G-A | 7284502-G-A | ** | ||||||||
7935784-G-T | 8067743-G-T | ** | ||||||||
7935760-G-A | 8067719-G-A | ** | ||||||||
7222260-T-C | 7354219-T-C | ** | ||||||||
7152544-G-A | 7284503-G-A | ** | ||||||||
7152552-G-A | 7284511-G-A | MF1674 | ** | |||||||
7702367-C-A | 7834326-C-A | ** | ||||||||
7534440-A-G | 7666399-A-G | ** | ||||||||
7155441-C-A | 7287400-C-A | ** | ||||||||
7425186-T-G | 7557145-T-G | ** | ||||||||
7425153-C-A | 7557112-C-A | ** | ||||||||
7182358-C-A | 7314317-C-A | ** | ||||||||
7402079-T-A | 7534038-T-A | ** | ||||||||
7401102-A-G | 7533061-A-G | ** | ||||||||
8022720-C-A | 8154679-C-A | ** | ||||||||
7331341-T-C | 7463300-T-C | ** | ||||||||
7206791-G-A | 7338750-G-A | ** | ||||||||
7204791-C-A | 7336750-C-A | ** | ||||||||
7251033-C-A | 7382992-C-A | ** | ||||||||
7281732-A-C | 7413691-A-C | ** | ||||||||
7306315-C-A | 7438274-C-A | ** | ||||||||
7200520-T-A | 7332479-T-A | ** | ||||||||
7197561-A-T | 7329520-A-T | ** | ||||||||
7400179-T-G | 7532138-T-G | ** | ||||||||
7197558-C-T | 7329517-C-T | ** | ||||||||
7384751-C-A | 7516710-C-A | ** | ||||||||
7196497-C-T | 7328456-C-T | ** | ||||||||
7385795-C-A | 7517754-C-A | ** | ||||||||
7196496-G-A | 7328455-G-A | ** | ||||||||
7397500-C-T | 7529459-C-T | ** | ||||||||
8002446-T-C | 8134405-T-C | ** | ||||||||
7886440-C-A | 8018399-C-A | FT251257 | ** | |||||||
7142253-C-A | 7274212-C-A | ** | ||||||||
8153557-C-A | 8285516-C-A | ** | ||||||||
8100485-A-C | 8232444-A-C | ** | ||||||||
7142299-C-A | 7274258-C-A | ** | ||||||||
7108465-C-T | 7240424-C-T | ** | ||||||||
8045283-A-G | 8177242-A-G | ** | ||||||||
8100517-A-C | 8232476-A-C | ** | ||||||||
7101020-G-T | 7232979-G-T | ** | ||||||||
7152523-C-T | 7284482-C-T | ** | ||||||||
8046413-A-G | 8178372-A-G | ** | ||||||||
8095352-C-A | 8227311-C-A | ** | ||||||||
8170453-C-A | 8302412-C-A | ** | ||||||||
7035654-A-C | 7167613-A-C | ** | ||||||||
8379545-C-A | 8511504-C-A | ** | ||||||||
7152529-A-AT | 7284488-A-AT | ** | ||||||||
7947843-T-A | 8079802-T-A | BY176511 | *** | |||||||
58980937-C-CATTCCATTCCACTCCACTCCATTCA | 56834790-C-CATTCCATTCCACTCCACTCCATTCA | *** | ||||||||
16719751-C-A | 14607871-C-A | *** | ||||||||
4444540-G-T | 4576499-G-T | *** | ||||||||
3790876-GTGTATA-G | 3922835-GTGTATA-G | *** | ||||||||
10657349-C-CTGCTT | *** | |||||||||
17361058-C-A | 15249178-C-A | 25×A | *** | |||||||
17389846-A-G | 15277966-A-G | *** | ||||||||
7101194-C-A | 7233153-C-A | *** | ||||||||
5828990-C-T | 5960949-C-T | *** | ||||||||
16458160-A-G | 14346280-A-G | *** | ||||||||
7947844-A-G | 8079803-A-G | BY176512 | *** | |||||||
26100827-G-T | 23954680-G-T | P1_Y1 | *** | |||||||
14765303-TCA-T | 12653372-TCA-T | *** | ||||||||
18740816-T-C | 16628936-T-C | *** | ||||||||
11643711-A-T | *** | |||||||||
5412115-A-T | 5544074-A-T | *** | ||||||||
9774604-C-G | 9936995-C-G | *** | ||||||||
11650385-T-A | *** | |||||||||
16514304-ATGTG-A,ATG | 14402424-ATGTG-A,ATG | 18×TG | *** | |||||||
22621887-G-A | 20460001-G-A | *** | ||||||||
13815538-CAATGA-C,GAATGG | 11694832-CAATGA-C,GAATGG | *** | ||||||||
8398840-C-CAA | 8530799-C-CAA | 17×A | *** | |||||||
22164547-CAAAAA-C,CAAAA | 20002661-CAAAAA-C,CAAAA | 19×A | *** | |||||||
13639645-G-A | 11483969-G-A | BY86810 | *** | |||||||
14163584-CA-C | 12042878-CA-C | *** | ||||||||
10937135-C-G | *** | |||||||||
3206062-T-C | 3338021-T-C | *** | ||||||||
16057664-A-T | 13945784-A-T | *** | ||||||||
15994985-C-A | 13883105-C-A | CTS5059 AM00250 AMM205 | *** | |||||||
13455054-C-G | 11299378-C-G | *** | ||||||||
9655083-G-A | 9817474-G-A | BY34286 HU583 | IR3_Prx | *** | ||||||
6427604-C-A | 6559563-C-A | *** | ||||||||
5059739-G-C | 5191698-G-C | *** | ||||||||
3790801-GGTGT-G | 3922760-GGTGT-G | 9×GT | *** | |||||||
13463320-C-T | 11307644-C-T | *** | ||||||||
16786201-T-A | 14674321-T-A | *** | ||||||||
22973869-TAAA-T | 20811983-TAAA-T | 17×A | *** | |||||||
13463330-T-A | 11307654-T-A | *** | ||||||||
21468745-ATTT-A,AT | 19306859-ATTT-A,AT | 25×T | *** | |||||||
6665057-TAA-T | 6797016-TAA-T | 12×A | *** | |||||||
16040967-AT-A,ATT | 13929087-AT-A,ATT | 14×T | *** | |||||||
5248637-TTC-T | 5380596-TTC-T | *** | ||||||||
5252341-A-G | 5384300-A-G | *** | ||||||||
5770338-CTTT-C,CTT | 5902297-CTTT-C,CTT | 25×T | *** | |||||||
58988604-T-A | 56842457-T-A | *** | ||||||||
28632340-C-A | 26486193-C-A | *** | ||||||||
10937145-T-C | *** | |||||||||
7347007-A-G | 7478966-A-G | *** | ||||||||
17130630-C-A | 15018750-C-A | *** | ||||||||
7947426-G-A | 8079385-G-A | *** | ||||||||
58982169-G-T | 56836022-G-T | *** | ||||||||
13461921-C-T | 11306245-C-T | *** | ||||||||
5288928-G-A | 5420887-G-A | 5×TAA | *** | |||||||
7063005-C-T | 7194964-C-T | *** | ||||||||
5270693-CTTTTTT-C | 5402652-CTTTTTT-C | 22×T | *** | |||||||
56830535-CATTCTGCTGA-C,CATTCT | *** | |||||||||
56830858-TC-T | *** | |||||||||
56833267-A-T | *** | |||||||||
5756851-G-C | 5888810-G-C | *** | ||||||||
24446649-T-C | 22300502-T-C | *** | ||||||||
7316369-C-A | 7448328-C-A | *** | ||||||||
24446635-C-A | 22300488-C-A | *** | ||||||||
14730396-CA-C,CAA | 12618464-CA-C,CAA | 18×A | *** | |||||||
9524391-T-C | 9686782-T-C | FT40276 | FT41136 | *** | ||||||
21227397-TG-T | 19065511-TG-T | *** | ||||||||
21230045-G-A | 19068159-G-A | *** | ||||||||
6989140-T-C | 7121099-T-C | *** | ||||||||
15452656-C-A | 13340776-C-A | *** | ||||||||
14745434-A-T | 12633503-A-T | *** | ||||||||
14252142-C-A | 12131436-C-A | FT5197 | *** | |||||||
19240781-T-C | 17128901-T-C | *** | ||||||||
9519812-T-TTTTCTTTCTTTC | 9682203-T-TTTTCTTTCTTTC | 17×TTTC | *** | |||||||
19138966-C-A | 17027086-C-A | *** | ||||||||
15486221-C-A | 13374341-C-A | *** | ||||||||
7938942-A-G | 8070901-A-G | *** | ||||||||
21572243-T-A | 19410357-T-A | *** | ||||||||
9811222-A-G | 9973613-A-G | *** | ||||||||
14624290-CAC-C,CAT | 12512490-CAC-C,CAT | *** | ||||||||
9811243-G-T | 9973634-G-T | *** | ||||||||
9907265-A-G | 10069656-A-G | *** | ||||||||
10776090-C-A | *** | |||||||||
21128225-C-A | 18966339-C-A | *** | ||||||||
22722384-G-T | 20560498-G-T | *** | ||||||||
7947848-C-A | 8079807-C-A | BY176513 | *** | |||||||
15140655-GA-G | 13028742-GA-G | 9×A | *** | |||||||
15192707-C-A | 13080793-C-A | *** | ||||||||
8199238-C-A | 8331197-C-A | *** | ||||||||
15271047-GAA-G,GA | 13159136-GAA-G,GA | 19×A | *** | |||||||
8163882-C-A | 8295841-C-A | *** | ||||||||
15336705-C-T | 13224823-C-T | *** | ||||||||
23827574-T-G | 21665688-T-G | *** | ||||||||
7947826-T-A | 8079785-T-A | *** | ||||||||
14809664-GT-G | 12697735-GT-G | 10×T | *** | |||||||
22775161-A-G | 20613275-A-G | *** | ||||||||
14831754-C-T | 12719821-C-T | *** | ||||||||
9047786-C-A | 9210177-C-A | *** | ||||||||
2791284-A-G | 2923243-A-G | *** | ||||||||
21069984-T-C | 18908098-T-C | *** | ||||||||
23827571-T-G | 21665685-T-G | *** | ||||||||
19322119-A-G | 17210239-A-G | *** | ||||||||
9498800-A-G | 9661191-A-G | *** | ||||||||
9935044-C-A | 10097435-C-A | *** | ||||||||
3626508-G-T | 3758467-G-T | *** | ||||||||
23096696-C-T | 20934810-C-T | *** | ||||||||
22518753-TAAA-T | 20356867-TAAA-T | 14×A | *** | |||||||
23004108-C-A | 20842222-C-A | *** | ||||||||
22904198-C-A | 20742312-C-A | *** | ||||||||
18596417-C-A | 16484537-C-A | *** | ||||||||
23263701-C-A | 21101815-C-A | *** | ||||||||
7349578-C-A | 7481537-C-A | *** | ||||||||
4561358-T-C | 4693317-T-C | *** | ||||||||
16040834-C-A | 13928954-C-A | *** | ||||||||
8690663-C-A | 8822622-C-A | *** | ||||||||
6768885-CT-C,CTT | 6900844-CT-C,CTT | 17×T | *** | |||||||
18239099-C-A | 16127219-C-A | *** | ||||||||
16205317-C-T | 14093437-C-T | *** | ||||||||
23844912-G-T | 21683026-G-T | *** | ||||||||
16302492-A-T | 14190612-A-T | *** | ||||||||
13909732-C-A | 11789026-C-A | *** | ||||||||
18096477-G-A | 15984597-G-A | FT330736 | *** | |||||||
24003034-A-T | 21856887-A-T | *** | ||||||||
10942758-A-T | *** | |||||||||
13463454-C-A | 11307778-C-A | *** | ||||||||
15842557-CTTTTT-C | 13730677-CTTTTT-C | 13×T | *** | |||||||
7870405-C-A | 8002364-C-A | *** | ||||||||
15663963-G-A | 13552083-G-A | *** | ||||||||
10010981-A-G | 10173372-A-G | *** | ||||||||
7825651-C-A | 7957610-C-A | *** | ||||||||
14552019-C-A | 12440220-C-A | *** | ||||||||
4088201-C-A | 4220160-C-A | *** | ||||||||
16519298-C-A | 14407418-C-A | *** | ||||||||
15336694-T-G | 13224812-T-G | *** | ||||||||
18864931-T-G | 16753051-T-G | *** | ||||||||
10647794-C-A | *** | |||||||||
15663976-A-G | 13552096-A-G | *** | ||||||||
18758843-TTCCC-T | 16646963-TTCCC-T | *** | ||||||||
10776093-T-TC | *** | |||||||||
6775874-C-A | 6907833-C-A | *** | ||||||||
22564219-C-A | 20402333-C-A | *** | ||||||||
22255456-A-G | 20093570-A-G | DYZ19 | *** | |||||||
22598853-C-A | 20436967-C-A | *** | ||||||||
22775163-G-C | 20613277-G-C | *** | ||||||||
10686620-C-G,T | *** | |||||||||
22902108-C-CAA | 20740222-C-CAA | 17×A | *** | |||||||
9236-C-T | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: 289565 | 10385469 | 7469740 | 7537146 |
Kit: 289565 | 9239307 | 7555498 | 7481213 |
Kit: 289565 | 14840594 | 9305703 | 8259352 |
Used in age calculations | 14840594 | 9305703 | 8259352 |
Counts of SNPs | 5 | 4 |
Big Tree Main Page