Maxwell
FTDNA: 170511, BigY2: 170511Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 170511 | BigY2 170511 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
22474546-C-A | 20312660-C-A | BY38173 | DYZ19 | *** | + | |||||
21235982-G-A | 19074096-G-A | BY131326 | Y | Y | + | + | ||||
9375462-G-C | 9537853-G-C | BY78862 | Y | + | + | |||||
56879882-G-C | ** | |||||||||
13558180-C-A | 11402504-C-A | ** | ||||||||
13255225-T-C | 11099549-T-C | ** | ||||||||
13295563-T-C | 11139887-T-C | ** | ||||||||
13495849-A-T | 11340173-A-T | ** | ||||||||
13520746-T-C | 11365070-T-C | ** | ||||||||
13588744-C-A | 11433068-C-A | ** | ||||||||
11022207-CT-C | ** | |||||||||
13805065-T-TCAAACGGAATGGAA | 11684359-T-TCAAACGGAATGGAA | ** | ||||||||
13805067-G-GA | 11684361-G-GA | ** | ||||||||
13809559-G-T | 11688853-G-T | ** | ||||||||
13936403-G-A | 11815697-G-A | ** | ||||||||
13987314-T-G | 11866608-T-G | ** | ||||||||
14115003-T-A | 11994297-T-A | ** | ||||||||
14124927-C-A | 12004221-C-A | ** | ||||||||
14228862-T-C | 12108156-T-C | ** | ||||||||
13233522-C-A | 11077846-C-A | ** | ||||||||
10994800-T-C | ** | |||||||||
11018731-C-A | ** | |||||||||
10889317-C-G | ** | |||||||||
10840135-C-A | ** | |||||||||
10844875-C-T | ** | |||||||||
10861402-C-G | ** | |||||||||
10872870-A-G | ** | |||||||||
10876128-C-A | ** | |||||||||
10889303-C-CGGATG | ** | |||||||||
10922285-C-G | ** | |||||||||
14230198-C-A | 12109492-C-A | ** | ||||||||
10922297-C-CCTTT | ** | |||||||||
10922308-C-A | ** | |||||||||
10934391-C-T | ** | |||||||||
10936431-C-A | ** | |||||||||
10974278-C-A | ** | |||||||||
10993111-T-G | ** | |||||||||
14230181-TG-T | 12109475-TG-T | ** | ||||||||
14281140-G-C | 12160434-G-C | ** | ||||||||
14270005-G-A | 12149299-G-A | ** | ||||||||
14933533-G-T | 12821598-G-T | ** | ||||||||
14765825-A-ATG | 12653894-A-ATG | ** | ||||||||
14765829-G-GCA | 12653898-G-GCA | ** | ||||||||
14858670-T-TC | 12746736-T-TC | ** | ||||||||
14863046-A-T | 12751112-A-T | ** | ||||||||
14919340-C-G | 12807405-C-G | ** | ||||||||
14919383-A-G | 12807448-A-G | ** | ||||||||
14953528-A-T | 12841602-A-T | ** | ||||||||
14697030-C-T | 12585096-C-T | ** | ||||||||
14959568-A-C | 12847643-A-C | ** | ||||||||
14967169-G-A | 12855244-G-A | ** | ||||||||
15061663-T-C | 12949755-T-C | ** | ||||||||
15115536-C-G | 13003623-C-G | ** | ||||||||
15127831-T-C | 13015918-T-C | ** | ||||||||
15145197-T-A | 13033284-T-A | ** | ||||||||
14765816-A-G | 12653885-A-G | ** | ||||||||
14627066-C-T | 12515134-C-T | ** | ||||||||
14270061-C-A | 12149355-C-A | ** | ||||||||
14458557-CCA-C | 12337830-CCA-C | ** | ||||||||
10808766-C-G | ** | |||||||||
14308280-T-G | 12187574-T-G | ** | ||||||||
14341971-G-C | 12221266-G-C | ** | ||||||||
14347979-C-T | 12227274-C-T | ** | ||||||||
14379393-G-A | 12258689-G-A | ** | ||||||||
14428246-C-A | 12307521-C-A | ** | ||||||||
14464269-A-G | 12343542-A-G | ** | ||||||||
14611714-C-A | 12499920-C-A | ** | ||||||||
14501177-T-G | 12389382-T-G | ** | ||||||||
14509306-C-A | 12397511-C-A | ** | ||||||||
14509469-C-T | 12397674-C-T | ** | ||||||||
14539158-T-C | 12427359-T-C | ** | ||||||||
14547203-C-A | 12435404-C-A | ** | ||||||||
14552282-G-T | 12440483-G-T | ** | ||||||||
14557455-T-A | 12445656-T-A | ** | ||||||||
10829256-C-T | ** | |||||||||
10808717-G-A | ** | |||||||||
10808752-T-C | ** | |||||||||
7864187-T-C | 7996146-T-C | ** | ||||||||
7418387-A-T | 7550346-A-T | ** | ||||||||
7448442-G-T | 7580401-G-T | IR1_L | ** | |||||||
7664155-C-A | 7796114-C-A | ** | ||||||||
7724705-C-A | 7856664-C-A | ** | ||||||||
7783268-C-T | 7915227-C-T | ** | ||||||||
7853127-C-A | 7985086-C-A | ** | ||||||||
8001942-G-C | 8133901-G-C | ** | ||||||||
7360611-T-C | 7492570-T-C | FT303537 | ** | |||||||
8085690-T-G | 8217649-T-G | ** | ||||||||
8093271-G-T | 8225230-G-T | ** | ||||||||
8167051-G-T | 8299010-G-T | ** | ||||||||
8214856-A-G | 8346815-A-G | ** | ||||||||
8276173-A-T | 8408132-A-T | ** | ||||||||
8342851-A-C | 8474810-A-C | ** | ||||||||
7418384-C-A | 7550343-C-A | ** | ||||||||
7360588-G-A | 7492547-G-A | ** | ||||||||
8673879-T-C | 8805838-T-C | ** | ||||||||
7258934-G-T | 7390893-G-T | ** | ||||||||
7116002-A-T | 7247961-A-T | ** | ||||||||
7155431-C-A | 7287390-C-A | ** | ||||||||
7158990-G-T | 7290949-G-T | ** | ||||||||
7197499-A-T | 7329458-A-T | ** | ||||||||
7209935-C-A | 7341894-C-A | ** | ||||||||
7215877-T-G | 7347836-T-G | ** | ||||||||
7258958-T-C | 7390917-T-C | ** | ||||||||
7360582-G-A | 7492541-G-A | FT99140 | ** | |||||||
7264895-A-T | 7396854-A-T | ** | ||||||||
7264913-T-C | 7396872-T-C | ** | ||||||||
7304555-C-A | 7436514-C-A | ** | ||||||||
7304566-C-G | 7436525-C-G | ** | ||||||||
14914702-C-T | 12802769-C-T | ** | ||||||||
7319024-C-A | 7450983-C-A | ** | ||||||||
7359163-T-A | 7491122-T-A | ** | ||||||||
8669852-G-A | 8801811-G-A | ** | ||||||||
8679552-C-A | 8811511-C-A | ** | ||||||||
10808732-C-T | ** | |||||||||
10756946-A-G | ** | |||||||||
10663590-T-C | ** | |||||||||
10664449-C-T | ** | |||||||||
10671604-C-G | ** | |||||||||
10678044-C-TCCCATTCCATTCCAT | ** | |||||||||
10692091-A-C | ** | |||||||||
10746258-C-A | ** | |||||||||
10757700-C-T | FT416842 | ** | ||||||||
10655238-C-G | FT428229 | ** | ||||||||
10763254-T-A | ** | |||||||||
10767423-A-T | ** | |||||||||
10786248-C-G | ** | |||||||||
10788513-C-T | ** | |||||||||
10801181-T-A | ** | |||||||||
15167984-T-C | 13056070-T-C | ** | ||||||||
10662014-C-A | ** | |||||||||
9975253-T-C | 10137644-T-C | ** | ||||||||
8733674-C-A | 8865633-C-A | ** | ||||||||
9412081-A-C | 9574472-A-C | ** | ||||||||
8762105-A-T | 8894064-A-T | ** | ||||||||
8776748-C-T | 8908707-C-T | ** | ||||||||
9025137-T-C | 9187528-T-C | ** | ||||||||
9397959-T-C | 9560350-T-C | ** | ||||||||
9397971-G-C | 9560362-G-C | ** | ||||||||
9399898-C-A | 9562289-C-A | ** | ||||||||
9421237-C-A | 9583628-C-A | ** | ||||||||
9926708-C-A | 10089099-C-A | ** | ||||||||
9499575-T-A | 9661966-T-A | ** | ||||||||
9503949-A-G | 9666340-A-G | ** | ||||||||
9507927-A-G | 9670318-A-G | ** | ||||||||
9511394-T-C | 9673785-T-C | ** | ||||||||
9583253-G-T | 9745644-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9847373-T-C | 10009764-T-C | ** | ||||||||
9925368-C-A | 10087759-C-A | ** | ||||||||
15151474-G-A | 13039561-G-A | ** | ||||||||
15206044-T-G | 13094130-T-G | ** | ||||||||
15202389-A-T | 13090475-A-T | ** | ||||||||
22056098-C-A | 19894212-C-A | ** | ||||||||
21772480-C-A | 19610594-C-A | ** | ||||||||
21824645-A-G | 19662759-A-G | ** | ||||||||
21875884-A-G | 19713998-A-G | ** | ||||||||
21891030-G-A | 19729144-G-A | ** | ||||||||
22022647-C-A | 19860761-C-A | ** | ||||||||
22037577-G-C | 19875691-G-C | ** | ||||||||
22092865-G-A | 19930979-G-A | ** | ||||||||
21566531-C-A | 19404645-C-A | ** | ||||||||
22124095-T-C | 19962209-T-C | ** | ||||||||
22659545-T-A | 20497659-T-A | ** | ||||||||
22793965-T-C | 20632079-T-C | ** | ||||||||
22914527-T-C | 20752641-T-C | ** | ||||||||
22914673-C-T | 20752787-C-T | ** | ||||||||
22970280-C-A | 20808394-C-A | ** | ||||||||
21653573-C-A | 19491687-C-A | ** | ||||||||
21455996-T-G | 19294110-T-G | ** | ||||||||
22991099-GC-G | 20829213-GC-G | ** | ||||||||
19538354-C-A | 17426474-C-A | ** | ||||||||
19254370-T-A | 17142490-T-A | ** | ||||||||
19274645-C-A | 17162765-C-A | ** | ||||||||
19303340-C-A | 17191460-C-A | ** | ||||||||
19388349-C-A | 17276469-C-A | ** | ||||||||
19410214-C-A | 17298334-C-A | ** | ||||||||
19449428-G-A | 17337548-G-A | 23×A | ** | |||||||
19677905-C-CTCG | 17566025-C-CTCG | P5_Prx | ** | |||||||
21390671-C-A | 19228785-C-A | ** | ||||||||
20458305-G-T | 18296419-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20833665-AG-A | 18671779-AG-A | P4_Gap | ** | |||||||
21029480-T-G | 18867594-T-G | P4_Dst | ** | |||||||
21043006-C-T | 18881120-C-T | ** | ||||||||
21043923-C-A | 18882037-C-A | ** | ||||||||
21148493-G-T | 18986607-G-T | ** | ||||||||
22991081-C-T | 20829195-C-T | ** | ||||||||
22997478-A-T | 20835592-A-T | ** | ||||||||
19052007-G-C | 16940127-G-C | ** | ||||||||
25898444-C-A | 23752297-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
21780459-G-A | ** | |||||||||
24276940-A-AT | 22130793-A-AT | P3_b1 | ** | |||||||
24353294-C-CA | 22207147-C-CA | P3_t1 | ** | |||||||
24518519-G-T | 22372372-G-T | ** | ||||||||
24876794-A-G | 22730647-A-G | g1 | ** | |||||||
25592932-A-T | 23446785-A-T | P1_gr1 | ** | |||||||
26153811-A-G | 24007664-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
23789264-T-C | 21627378-T-C | ** | ||||||||
26228707-T-TC | 24082560-T-TC | P1_Y1 | ** | |||||||
27869120-C-A | 25722973-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28560171-T-G | 26414024-T-G | ** | ||||||||
28624453-G-C | 26478306-G-C | ** | ||||||||
28658375-A-G | 26512228-A-G | ** | ||||||||
56844740-C-T | ** | |||||||||
21777806-A-AC | ** | |||||||||
23623284-G-T | 21461398-G-T | ** | ||||||||
23082092-A-G | 20920206-A-G | ** | ||||||||
23420530-C-T | 21258644-C-T | ** | ||||||||
23126840-A-G | 20964954-A-G | ** | ||||||||
23128102-C-A | 20966216-C-A | ** | ||||||||
23204420-G-C | 21042534-G-C | ** | ||||||||
23205055-G-A | 21043169-G-A | ** | ||||||||
23255319-C-T | 21093433-C-T | ** | ||||||||
23396080-T-A | 21234194-T-A | ** | ||||||||
23449044-A-G | 21287158-A-G | ** | ||||||||
23522512-G-T | 21360626-G-T | ** | ||||||||
23449049-G-C | 21287163-G-C | ** | ||||||||
23449052-A-T | 21287166-A-T | ** | ||||||||
23449065-A-C | 21287179-A-C | ** | ||||||||
23449066-T-G | 21287180-T-G | ** | ||||||||
23449096-G-A | 21287210-G-A | ** | ||||||||
23459588-A-T | 21297702-A-T | ** | ||||||||
23459719-G-C | 21297833-G-C | ** | ||||||||
19137502-T-C | 17025622-T-C | ** | ||||||||
18929946-G-A | 16818066-G-A | ** | ||||||||
6971732-A-G | 7103691-A-G | ** | ||||||||
16421165-A-T | 14309285-A-T | ** | ||||||||
16006912-T-C | 13895032-T-C | ** | ||||||||
16037096-C-A | 13925216-C-A | ** | ||||||||
16184044-T-C | 14072164-T-C | ** | ||||||||
16278674-A-G | 14166794-A-G | ** | ||||||||
16307656-A-T | 14195776-A-T | ** | ||||||||
16354623-A-G | 14242743-A-G | ** | ||||||||
16478332-C-A | 14366452-C-A | ** | ||||||||
15911449-G-A | 13799569-G-A | ** | ||||||||
16488948-C-A | 14377068-C-A | ** | ||||||||
16562684-A-T | 14450804-A-T | ** | ||||||||
16605737-C-A | 14493857-C-A | FT279469 | ** | |||||||
16667190-T-C | 14555310-T-C | ** | ||||||||
16742951-A-T | 14631071-A-T | ** | ||||||||
16783719-T-G | 14671839-T-G | ** | ||||||||
16004206-TA-T | 13892326-TA-T | ** | ||||||||
15743602-T-C | 13631722-T-C | ** | ||||||||
17004537-G-T | 14892657-G-T | ** | ||||||||
15412927-C-A | 13301047-C-A | ** | ||||||||
15238923-C-A | 13127009-C-A | ** | ||||||||
15260092-C-A | 13148176-C-A | ** | ||||||||
15264740-GGGGA-G | 13152829-GGGGA-G | ** | ||||||||
15264754-T-G | 13152843-T-G | ** | ||||||||
15365870-C-A | 13253990-C-A | ** | ||||||||
15365919-A-G | 13254039-A-G | ** | ||||||||
15433597-A-T | 13321717-A-T | ** | ||||||||
15739337-C-T | 13627457-C-T | ** | ||||||||
15475184-G-T | 13363304-G-T | ** | ||||||||
15499433-C-T | 13387553-C-T | ** | ||||||||
15499460-T-A | 13387580-T-A | ** | ||||||||
15579971-G-A | 13468091-G-A | ** | ||||||||
15595650-G-A | 13483770-G-A | ** | ||||||||
15595652-G-A | 13483772-G-A | FT242975 | ** | |||||||
15662318-C-A | 13550438-C-A | ** | ||||||||
17004534-G-C | 14892654-G-C | ** | ||||||||
17004541-A-G | 14892661-A-G | ** | ||||||||
18895725-A-T | 16783845-A-T | ** | ||||||||
18390112-A-C | 16278232-A-C | P6_Gap | ** | |||||||
17961015-A-C | 15849135-A-C | ** | ||||||||
18093840-C-A | 15981960-C-A | FGC56201 | ** | |||||||
18106610-T-C | 15994730-T-C | ** | ||||||||
18150652-T-A | 16038772-T-A | ** | ||||||||
18381681-A-T | 16269801-A-T | P6_Gap | ** | |||||||
18381703-A-C | 16269823-A-C | P6_Gap | ** | |||||||
18422736-A-T | 16310856-A-T | P6_Gap | ** | |||||||
17716677-C-A | 15604797-C-A | ** | ||||||||
18454986-C-A | 16343106-C-A | P6_Dst | ** | |||||||
18480257-A-T | 16368377-A-T | P6_Dst | ** | |||||||
18529102-T-C | 16417222-T-C | P6_Dst | ** | |||||||
18539166-C-A | 16427286-C-A | ** | ||||||||
18542328-A-T | 16430448-A-T | ** | ||||||||
18789671-A-G | 16677791-A-G | ** | ||||||||
17851799-A-C | 15739919-A-C | ** | ||||||||
17600460-C-A | 15488580-C-A | ** | ||||||||
17014691-C-A | 14902811-C-A | ** | ||||||||
17414812-G-A | 15302932-G-A | ** | ||||||||
17103597-G-T | 14991717-G-T | ** | ||||||||
17126141-C-A | 15014261-C-A | ** | ||||||||
17201839-C-A | 15089959-C-A | ** | ||||||||
17213208-C-A | 15101328-C-A | ** | ||||||||
17319772-T-A | 15207892-T-A | ** | ||||||||
17366826-C-A | 15254946-C-A | ** | ||||||||
17440832-A-G | 15328952-A-G | ** | ||||||||
17545418-T-C | 15433538-T-C | FT305413 | ** | |||||||
17461922-A-G | 15350042-A-G | ** | ||||||||
17467021-T-A | 15355141-T-A | ** | ||||||||
17470800-C-A | 15358920-C-A | ** | ||||||||
17484597-A-G | 15372717-A-G | ** | ||||||||
17491985-T-G | 15380105-T-G | ** | ||||||||
17511608-C-A | 15399728-C-A | ** | ||||||||
17544726-C-T | 15432846-C-T | FT76761 | ** | |||||||
7085975-G-T | 7217934-G-T | ** | ||||||||
7314497-T-C | 7446456-T-C | ** | ||||||||
10846985-C-A | ** | |||||||||
23475354-C-A | 21313468-C-A | ** | ||||||||
5601052-C-A | 5733011-C-A | ** | ||||||||
10808609-T-C | ** | |||||||||
7288186-C-A | 7420145-C-A | ** | ||||||||
2758235-C-A | 2890194-C-A | ** | ||||||||
15212395-C-A | 13100481-C-A | ** | ||||||||
6808158-G-C | 6940117-G-C | ** | ||||||||
10661725-A-T | ** | |||||||||
15865585-A-T | 13753705-A-T | ** | ||||||||
22045455-C-A | 19883569-C-A | ** | ||||||||
19393320-C-A | 17281440-C-A | ** | ||||||||
20101648-G-T | 17989768-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
13527592-C-A | 11371916-C-A | ** | ||||||||
10944038-T-C | ** | |||||||||
4144109-C-A | 4276068-C-A | ** | ||||||||
17751998-C-A | 15640118-C-A | ** | ||||||||
13855549-T-TTTAAA | 11734843-T-TTTAAA | ** | ||||||||
8214860-G-T | 8346819-G-T | 21×T | ** | |||||||
13855551-G-GAACAT | 11734845-G-GAACAT | ** | ||||||||
24513635-C-A | 22367488-C-A | ** | ||||||||
10961135-CCACTGCAGGA-C | ** | |||||||||
16478255-C-A | 14366375-C-A | ** | ||||||||
6368798-G-T | 6500757-G-T | ** | ||||||||
15682402-C-A | 13570522-C-A | ** | ||||||||
13809512-T-C | 11688806-T-C | ** | ||||||||
13252295-C-A | 11096619-C-A | ** | ||||||||
10961120-G-C | ** | |||||||||
27829225-C-T | 25683078-C-T | P1_Y2 | ** | |||||||
4448972-C-A | 4580931-C-A | ** | ||||||||
11009759-C-A | ** | |||||||||
22963397-T-G | 20801511-T-G | ** | ||||||||
22173697-C-A | 20011811-C-A | ** | ||||||||
7643047-G-A | 7775006-G-A | ** | ||||||||
19187638-A-AT | 17075758-A-AT | ** | ||||||||
13936400-C-A | 11815694-C-A | ** | ||||||||
11669068-C-A | ** | |||||||||
14101073-G-T | 11980367-G-T | ** | ||||||||
10922301-C-T | ** | |||||||||
10798188-G-T | ** | |||||||||
16324111-C-A | 14212231-C-A | ** | ||||||||
17414804-C-G | 15302924-C-G | ** | ||||||||
11015800-T-C | ** | |||||||||
15081268-C-A | 12969358-C-A | ** | ||||||||
11015806-G-C | ** | |||||||||
16279517-C-A | 14167637-C-A | ** | ||||||||
22662354-A-T | 20500468-A-T | ** | ||||||||
11015805-G-A | ** | |||||||||
13866869-A-T | 11746163-A-T | ** | ||||||||
13857044-C-A | 11736338-C-A | ** | ||||||||
13855564-T-C | 11734858-T-C | ** | ||||||||
15791279-C-A | 13679399-C-A | ** | ||||||||
19187603-C-T | 17075723-C-T | ** | ||||||||
21614729-TAA-T | 19452843-TAA-T | 11×A | ** | |||||||
14492596-G-A | 12380793-G-A | Y36285 | ** | |||||||
15779933-C-A | 13668053-C-A | ** | ||||||||
19187555-C-T | 17075675-C-T | ** | ||||||||
19226496-C-A | 17114616-C-A | ** | ||||||||
22792499-C-A | 20630613-C-A | ** | ||||||||
18194469-A-G | 16082589-A-G | ** | ||||||||
4898123-T-G | 5030082-T-G | ** | ||||||||
14581139-C-A | 12469339-C-A | ** | ||||||||
6945999-C-A | 7077958-C-A | ** | ||||||||
3987577-C-A | 4119536-C-A | ** | ||||||||
2649572-A-G | 2781531-A-G | ** | ||||||||
21884642-C-A | 19722756-C-A | ** | ||||||||
3274832-G-T | 3406791-G-T | ** | ||||||||
7131402-CCG-C | 7263361-CCG-C | ** | ||||||||
14286889-G-T | 12166183-G-T | BY197232 | ** | |||||||
11028110-C-A | ** | |||||||||
6329231-TA-T | 6461190-TA-T | IR3_Dst | 8×A | ** | ||||||
22732930-C-A | 20571044-C-A | ** | ||||||||
6971715-T-G | 7103674-T-G | ** | ||||||||
6971711-T-C | 7103670-T-C | ** | ||||||||
14143971-A-T | 12023265-A-T | ** | ||||||||
10023004-C-A | 10185395-C-A | ** | ||||||||
6971731-CA-C | 7103690-CA-C | ** | ||||||||
7649108-C-A | 7781067-C-A | ** | ||||||||
21446259-G-C | 19284373-G-C | ** | ||||||||
22811779-G-C | 20649893-G-C | ** | ||||||||
7420638-A-G | 7552597-A-G | ** | ||||||||
19523401-C-A | 17411521-C-A | ** | ||||||||
4254804-C-A | 4386763-C-A | ** | ||||||||
9908432-C-A | 10070823-C-A | ** | ||||||||
11015825-A-C | ** | |||||||||
10786047-A-C | FGC77886 | ** | ||||||||
10889289-A-T | ** | |||||||||
18549395-CA-C | 16437515-CA-C | 8×A | ** | |||||||
5246817-C-A | 5378776-C-A | ** | ||||||||
21253940-G-T | 19092054-G-T | ** | ||||||||
14815206-C-A | 12703277-C-A | ** | ||||||||
8321490-T-C | 8453449-T-C | ** | ||||||||
19758848-C-A | 17646968-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
4472467-C-A | 4604426-C-A | ** | ||||||||
17339069-G-A | 15227189-G-A | ** | ||||||||
10745812-G-T | ** | |||||||||
10831466-C-A | ** | |||||||||
5904890-C-A | 6036849-C-A | ** | ||||||||
6816702-C-A | 6948661-C-A | ** | ||||||||
3833626-C-G | 3965585-C-G | ** | ||||||||
7853116-C-A | 7985075-C-A | ** | ||||||||
19361272-C-A | 17249392-C-A | A16883 | ** | |||||||
17831225-G-T | 15719345-G-T | ** | ||||||||
10958256-C-A | ** | |||||||||
18923259-C-A | 16811379-C-A | ** | ||||||||
28463862-C-A | 26317715-C-A | ** | ||||||||
21262318-C-A | 19100432-C-A | ** | ||||||||
10964044-C-A | ** | |||||||||
3833631-T-G | 3965590-T-G | ** | ||||||||
10682658-T-A | ** | |||||||||
19448340-C-A | 17336460-C-A | ** | ||||||||
4416886-T-A | 4548845-T-A | ** | ||||||||
18779456-C-A | 16667576-C-A | ** | ||||||||
17158565-G-T | 15046685-G-T | ** | ||||||||
24585691-A-AC | 22439544-A-AC | P3_t2 | ** | |||||||
15956509-C-A | 13844629-C-A | ** | ||||||||
14234602-C-A | 12113896-C-A | ** | ||||||||
15863094-G-T | 13751214-G-T | ** | ||||||||
15595608-C-CT | 13483728-C-CT | 9×T | ** | |||||||
18196489-TCAAA-T | 16084609-TCAAA-T | ** | ||||||||
14041588-C-A | 11920882-C-A | ** | ||||||||
16897642-TC-A | 14785762-TC-A | ** | ||||||||
4064004-C-A | 4195963-C-A | ** | ||||||||
6090482-C-A | 6222441-C-A | ** | ||||||||
8036204-C-A | 8168163-C-A | ** | ||||||||
13215557-C-A | 11059881-C-A | ** | ||||||||
22056105-C-A | 19894219-C-A | ** | ||||||||
7152806-C-A | 7284765-C-A | ** | ||||||||
3951419-C-A | 4083378-C-A | ** | ||||||||
22991070-A-T | 20829184-A-T | ** | ||||||||
10929870-A-C | ** | |||||||||
13488957-G-GGT | 11333281-G-GGT | ** | ||||||||
5785801-C-A | 5917760-C-A | ** | ||||||||
15324115-G-A | 13212233-G-A | ** | ||||||||
4405409-G-T | 4537368-G-T | ** | ||||||||
5392335-G-T | 5524294-G-T | ** | ||||||||
5365984-G-T | 5497943-G-T | ** | ||||||||
5290872-A-T | 5422831-A-T | ** | ||||||||
5191229-T-A | 5323188-T-A | ** | ||||||||
5159380-G-T | 5291339-G-T | ** | ||||||||
4998574-A-G | 5130533-A-G | ** | ||||||||
4918413-C-G | 5050372-C-G | ** | ||||||||
4872624-A-G | 5004583-A-G | ** | ||||||||
4771958-C-A | 4903917-C-A | ** | ||||||||
4650590-C-T | 4782549-C-T | ** | ||||||||
4626322-C-A | 4758281-C-A | ** | ||||||||
4503170-A-C | 4635129-A-C | ** | ||||||||
4435207-G-T | 4567166-G-T | ** | ||||||||
4212618-A-C | 4344577-A-C | ** | ||||||||
5443822-G-C | 5575781-G-C | ** | ||||||||
4201553-A-T | 4333512-A-T | ** | ||||||||
4197108-T-A | 4329067-T-A | ** | ||||||||
4070115-G-A | 4202074-G-A | ** | ||||||||
4069468-G-T | 4201427-G-T | ** | ||||||||
3883505-G-T | 4015464-G-T | ** | ||||||||
18390117-T-G | 16278237-T-G | P6_Gap | ** | |||||||
3834697-A-T | 3966656-A-T | ** | ||||||||
3688635-C-T | 3820594-C-T | ** | ||||||||
3686945-A-T | 3818904-A-T | ** | ||||||||
3662699-ATAT-A | 3794658-ATAT-A | ** | ||||||||
3616881-C-A | 3748840-C-A | ** | ||||||||
3603268-C-T | 3735227-C-T | ** | ||||||||
3546031-C-A | 3677990-C-A | ** | ||||||||
3409602-CCATG-C | 3541561-CCATG-C | ** | ||||||||
5443728-C-A | 5575687-C-A | ** | ||||||||
5708598-C-A | 5840557-C-A | ** | ||||||||
3187022-C-T | 3318981-C-T | ** | ||||||||
6580431-T-C | 6712390-T-C | FT269357 | ** | |||||||
6920657-G-T | 7052616-G-T | ** | ||||||||
6882018-C-G | 7013977-C-G | ** | ||||||||
6878004-G-T | 7009963-G-T | ** | ||||||||
6856649-C-A | 6988608-C-A | ** | ||||||||
6822569-C-G | 6954528-C-G | ** | ||||||||
6808096-C-G | 6940055-C-G | ** | ||||||||
6807796-C-G | 6939755-C-G | ** | ||||||||
6790105-A-T | 6922064-A-T | ** | ||||||||
15799197-T-C | 13687317-T-C | ** | ||||||||
6756986-C-A | 6888945-C-A | ** | ||||||||
6730351-C-G | 6862310-C-G | ** | ||||||||
6694903-T-C | 6826862-T-C | ** | ||||||||
6693414-T-C | 6825373-T-C | ** | ||||||||
6654976-G-T | 6786935-G-T | ** | ||||||||
6514134-G-T | 6646093-G-T | ** | ||||||||
5799922-T-C | 5931881-T-C | ** | ||||||||
6446868-A-G | 6578827-A-G | ** | ||||||||
6403509-G-T | 6535468-G-T | ** | ||||||||
6357896-T-C | 6489855-T-C | ** | ||||||||
6310808-T-C | 6442767-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6310788-G-GAAA | 6442747-G-GAAA | IR3_Dst | 11×A | ** | ||||||
6293362-TG-A | 6425321-TG-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6293235-G-T | 6425194-G-T | IR3_Dst | ** | |||||||
6273790-T-TA | 6405749-T-TA | IR3_Dst | 8×A | ** | ||||||
6242134-T-C | 6374093-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6173637-A-G | 6305596-A-G | IR3_Dst | ** | |||||||
5971703-A-C | 6103662-A-C | ** | ||||||||
5904392-C-A | 6036351-C-A | ** | ||||||||
5887723-C-A | 6019682-C-A | ** | ||||||||
5858576-C-A | 5990535-C-A | ** | ||||||||
3272767-G-A | 3404726-G-A | ** | ||||||||
3285037-T-C | 3416996-T-C | ** | ||||||||
3186977-C-T | 3318936-C-T | ** | ||||||||
21281627-C-A | 19119741-C-A | ** | ||||||||
13486565-G-T | 11330889-G-T | ** | ||||||||
15397237-G-T | 13285357-G-T | ** | ||||||||
17323269-CGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG-C | 15211389-CGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG-C | 13×GAAG | *** | ** | ||||||
11018170-C-T | ** | |||||||||
11659235-T-C | ** | |||||||||
14278445-C-A | 12157739-C-A | ** | ||||||||
13927892-C-A | 11807186-C-A | ** | ||||||||
24872021-G-T | 22725874-G-T | IR1_R | ** | |||||||
21092222-T-A | 18930336-T-A | ** | ||||||||
10800795-T-C | ** | |||||||||
17372111-G-A | 15260231-G-A | FT377989 | ** | |||||||
3625983-C-A | 3757942-C-A | ** | ||||||||
10037944-C-A | 10200335-C-A | ** | ||||||||
17004533-G-T | 14892653-G-T | ** | ||||||||
10767760-C-A | ** | |||||||||
20326037-G-C | 18164151-G-C | P5_Dst | ** | |||||||
21012302-C-A | 18850416-C-A | P4_Dst | ** | |||||||
19382234-C-A | 17270354-C-A | ** | ||||||||
19275288-C-A | 17163408-C-A | ** | ||||||||
22097040-C-A | 19935154-C-A | ** | ||||||||
3287113-C-A | 3419072-C-A | ** | ||||||||
23196622-C-A | 21034736-C-A | ** | ||||||||
7083810-C-A | 7215769-C-A | ** | ||||||||
13237544-C-A | 11081868-C-A | ** | ||||||||
14933552-G-A | 12821617-G-A | ** | ||||||||
22814986-C-A | 20653100-C-A | ** | ||||||||
8854326-C-A | 8986285-C-A | ** | ||||||||
18390105-A-C | 16278225-A-C | P6_Gap | ** | |||||||
13233118-C-A | 11077442-C-A | ** | ||||||||
3186967-G-A | 3318926-G-A | ** | ||||||||
16181467-C-A | 14069587-C-A | ** | ||||||||
10971744-G-T | ** | |||||||||
2805524-T-G | 2937483-T-G | ** | ||||||||
15185283-C-T | 13073369-C-T | Z20541 | ** | |||||||
6930608-C-A | 7062567-C-A | ** | ||||||||
14914718-G-T | 12802785-G-T | ** | ||||||||
2687997-C-T | 2819956-C-T | ** | ||||||||
2702320-A-T | 2834279-A-T | ** | ||||||||
2702322-TA-T | 2834281-TA-T | ** | ||||||||
2805528-T-C | 2937487-T-C | ** | ||||||||
17339067-A-C | 15227187-A-C | Y9021 Z19822 | ** | |||||||
2810394-C-T | 2942353-C-T | ** | ||||||||
2970066-A-G | 3102025-A-G | ** | ||||||||
3047576-A-T | 3179535-A-T | ** | ||||||||
3110332-T-C | 3242291-T-C | ** | ||||||||
3178744-C-T | 3310703-C-T | FT172357 | ** | |||||||
3186965-T-G | 3318924-T-G | ** | ||||||||
17770663-C-A | 15658783-C-A | ** | ||||||||
20655445-A-T | 18493559-A-T | P4_Prx | ** | |||||||
10889302-C-A | ** | |||||||||
16842037-C-A | 14730157-C-A | ** | ||||||||
15151482-T-A | 13039569-T-A | ** | ||||||||
17490200-C-A | 15378320-C-A | ** | ||||||||
2687982-G-A | 2819941-G-A | FGC13333 | FGC68245 | ** | ||||||
24523401-C-A | 22377254-C-A | ** | ||||||||
10794434-C-A | ** | |||||||||
59026043-C-T | 56879896-C-T | ** | ||||||||
22189286-C-A | 20027400-C-A | *** | ||||||||
13940106-C-A | 11819400-C-A | *** | ||||||||
22774690-T-C | 20612804-T-C | *** | ||||||||
22675648-C-A | 20513762-C-A | *** | ||||||||
23952717-A-G | 21806570-A-G | *** | ||||||||
28711639-G-A | 26565492-G-A | *** | ||||||||
14276423-TAA-T,TA | 12155717-TAA-T,TA | 13×A | *** | |||||||
17868993-C-A | 15757113-C-A | *** | *** | |||||||
13652151-T-C | 11496475-T-C | *** | ||||||||
24450687-C-A | 22304540-C-A | *** | ||||||||
24472411-T-A | 22326264-T-A | *** | ||||||||
10017453-C-T | 10179844-C-T | *** | ||||||||
23597366-A-G | 21435480-A-G | *** | ||||||||
23010942-CT-C | 20849056-CT-C | *** | ||||||||
9908359-C-A | 10070750-C-A | *** | ||||||||
6953290-C-A | 7085249-C-A | *** | ||||||||
21714617-C-T | 19552731-C-T | *** | ||||||||
13217364-T-A | 11061688-T-A | *** | ||||||||
14965446-A-C | 12853521-A-C | *** | ||||||||
7869005-T-A | 8000964-T-A | *** | ||||||||
21201564-C-A | 19039678-C-A | *** | ||||||||
18827903-C-A | 16716023-C-A | *** | ||||||||
15470814-C-A | 13358934-C-A | *** | ||||||||
13488739-G-T | 11333063-G-T | *** | ||||||||
13798790-G-T | 11678084-G-T | *** | ||||||||
13652177-GGAATG-G,GGAATC | 11496501-GGAATG-G,GGAATC | *** | ||||||||
13652168-G-C | 11496492-G-C | *** | ||||||||
13294411-G-T | 11138735-G-T | *** | ||||||||
11031293-C-A | *** | |||||||||
8108356-CAA-C,CA | 8240315-CAA-C,CA | 15×A | *** | |||||||
22201059-G-T | 20039173-G-T | *** | ||||||||
10969848-G-A | *** | |||||||||
10926803-C-A | *** | |||||||||
15584691-C-A | 13472811-C-A | *** | ||||||||
10918322-C-A | *** | |||||||||
10895821-C-CTGTCCACTCA | *** | |||||||||
2651891-T-C | 2783850-T-C | *** | ||||||||
10747965-C-A | *** | |||||||||
3836785-C-A | 3968744-C-A | *** | ||||||||
4201508-C-A | 4333467-C-A | *** | ||||||||
6763725-T-A | 6895684-T-A | *** | ||||||||
8139766-C-A | 8271725-C-A | *** | ||||||||
15365949-G-T | 13254069-G-T | *** | ||||||||
19057895-G-A | 16946015-G-A | *** | ||||||||
16308515-A-T | 14196635-A-T | *** | ||||||||
14036783-C-A | 11916077-C-A | *** | ||||||||
20352229-G-T | 18190343-G-T | P5_Dst | *** | |||||||
10895842-A-T | *** | |||||||||
19409465-T-C | 17297585-T-C | *** | ||||||||
18812322-C-A | 16700442-C-A | *** | ||||||||
18242638-C-A | 16130758-C-A | *** | ||||||||
2803572-C-A | 2935531-C-A | FGC61514 | *** | |||||||
17923177-A-G | 15811297-A-G | *** | ||||||||
17885824-C-A | 15773944-C-A | *** | ||||||||
17652060-G-A | 15540180-G-A | *** | ||||||||
13944703-C-A | 11823997-C-A | *** | ||||||||
15538261-C-A | 13426381-C-A | *** | ||||||||
18793579-G-T | 16681699-G-T | *** | ||||||||
19415799-C-A | 17303919-C-A | *** | ||||||||
16302272-C-A | 14190392-C-A | *** | ||||||||
16264885-C-A | 14153005-C-A | *** | ||||||||
16134294-T-C | 14022414-T-C | *** | ||||||||
18848547-G-T | 16736667-G-T | *** | ||||||||
15745536-G-T | 13633656-G-T | *** | ||||||||
15859437-CTTTTTTT-C | 13747557-CTTTTTTT-C | 17×T | *** | |||||||
11030177-C-A | *** | |||||||||
15620516-C-A | 13508636-C-A | *** | ||||||||
14768636-C-A | 12656705-C-A | *** | ||||||||
13858577-A-C | 11737871-A-C | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
---|---|---|---|
Manual | 21100421-C-T | 18938535-C-T | 8T |
Manual | 14507698-A-G | 12395903-A-G | 1G |
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: 170511 | 10403308 | 7493399 | 7565578 |
Kit: 170511 | 9323795 | 7601840 | 7519918 |
Used in age calculations | 10403308 | 7601840 | 7565578 |
Counts of SNPs | 2 | 1 |
Big Tree Main Page