Cobb
FTDNA: 325133, BigY2: 325133Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 325133 | BigY2 325133 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
14435413-C-G | 12314686-C-G | Y | *** | A* | |||||
28816780-T-A | 26670633-T-A | A* | |||||||
15065586-C-T | 12953678-C-T | BY99533 | Y | Y | + | + | |||
22808264-C-T | 20646378-C-T | BY140915 | Y | Y | + | + | |||
13858573-T-A | 11737867-T-A | DYZ17 | ** | ||||||
14582105-C-A | 12470305-C-A | M1827 | ** | ||||||
22258178-C-T | 20096292-C-T | DYZ19 | ** | ||||||
24283294-G-A | 22137147-G-A | P3_t1 | ** | ||||||
22815505-G-T | 20653619-G-T | 20×T | ** | ||||||
24283305-T-A | 22137158-T-A | P3_t1 | ** | ||||||
24283299-G-A | 22137152-G-A | P3_t1 | ** | ||||||
14484961-G-T | 12364230-G-T | ** | |||||||
9793445-A-AT | 9955836-A-AT | 10×T | ** | ||||||
16016872-C-A | 13904992-C-A | ** | |||||||
10959744-A-C | FT438260 | ** | |||||||
10971897-TATTCC-T | ** | ||||||||
28521114-C-A | 26374967-C-A | ** | |||||||
19362624-C-A | 17250744-C-A | ** | |||||||
3706691-C-A | 3838650-C-A | ** | |||||||
20332031-G-A | 18170145-G-A | P5_Dst | ** | ||||||
17092594-C-A | 14980714-C-A | ** | |||||||
7263666-C-A | 7395625-C-A | ** | |||||||
23555899-C-A | 21394013-C-A | ** | |||||||
18155618-C-A | 16043738-C-A | ** | |||||||
10861053-C-A | ** | ||||||||
17950763-C-A | 15838883-C-A | ** | |||||||
28635926-C-A | 26489779-C-A | ** | |||||||
7636008-T-A | 7767967-T-A | ** | |||||||
10023767-C-A | 10186158-C-A | ** | |||||||
10974816-G-C | ** | ||||||||
11028101-G-A | ** | ||||||||
7828981-C-A | 7960940-C-A | ** | |||||||
15743840-C-A | 13631960-C-A | ** | |||||||
23258417-C-A | 21096531-C-A | ** | |||||||
11028114-C-A | ** | ||||||||
11028151-A-AC | ** | ||||||||
11028154-C-CAAAT | ** | ||||||||
21082189-C-A | 18920303-C-A | ** | |||||||
13856326-T-TCAAAG | 11735620-T-TCAAAG | DYZ17 | ** | ||||||
13856338-G-T | 11735632-G-T | DYZ17 | ** | ||||||
10748177-T-G | ** | ||||||||
6666378-C-A | 6798337-C-A | ** | |||||||
22598280-C-A | 20436394-C-A | ** | |||||||
10959727-A-T | ** | ||||||||
10744453-A-C | ** | ||||||||
22205682-C-A | 20043796-C-A | ** | |||||||
28612196-C-A | 26466049-C-A | ** | |||||||
17781594-C-A | 15669714-C-A | ** | |||||||
7132840-T-A | 7264799-T-A | ** | |||||||
24458704-G-A | 22312557-G-A | ** | |||||||
15262428-C-A | 13150512-C-A | ** | |||||||
17755376-C-A | 15643496-C-A | ** | |||||||
3345880-C-A | 3477839-C-A | ** | |||||||
17302065-T-A | 15190185-T-A | ** | |||||||
9385072-C-A | 9547463-C-A | ** | |||||||
7167622-C-A | 7299581-C-A | ** | |||||||
5956899-C-A | 6088858-C-A | ** | |||||||
8501547-C-A | 8633506-C-A | ** | |||||||
21550069-C-A | 19388183-C-A | ** | |||||||
7257980-G-A | 7389939-G-A | ** | |||||||
8052007-C-A | 8183966-C-A | ** | |||||||
28700357-C-A | 26554210-C-A | ** | |||||||
18263846-G-A | 16151966-G-A | ** | |||||||
13858540-G-T | 11737834-G-T | DYZ17 | ** | ||||||
26275950-C-T | 24129803-C-T | P1_Y1 | ** | ||||||
22896116-A-C | 20734230-A-C | ** | |||||||
24472458-T-C | 22326311-T-C | ** | |||||||
9231576-G-A | 9393967-G-A | ** | |||||||
18714096-C-A | 16602216-C-A | ** | |||||||
56850940-A-T | ** | ||||||||
56850949-C-G | ** | ||||||||
23037232-A-T | 20875346-A-T | ** | |||||||
23037236-G-T | 20875350-G-T | ** | |||||||
23434510-C-A | 21272624-C-A | ** | |||||||
15217468-C-A | 13105554-C-A | ** | |||||||
6869574-G-C | 7001533-G-C | ** | |||||||
5200587-G-T | 5332546-G-T | ** | |||||||
6791222-C-A | 6923181-C-A | ** | |||||||
16962699-C-T | 14850819-C-T | ** | |||||||
10808478-G-C | ** | ||||||||
10808497-G-T | ** | ||||||||
10808499-G-T | ** | ||||||||
10808506-G-T | ** | ||||||||
10808515-C-T | ** | ||||||||
10808526-C-G | ** | ||||||||
10808534-C-G | ** | ||||||||
10808546-C-A | ** | ||||||||
10808552-A-T | ** | ||||||||
10808562-A-T | ** | ||||||||
10808566-C-CAT | ** | ||||||||
2773714-T-A | 2905673-T-A | ** | |||||||
10651605-T-C | ** | ||||||||
10651628-G-C | ** | ||||||||
10651632-T-C | ** | ||||||||
10651646-G-T | ** | ||||||||
17517126-C-A | 15405246-C-A | ** | |||||||
7608520-C-A | 7740479-C-A | ** | |||||||
22258355-C-A | 20096469-C-A | DYZ19 | ** | ||||||
16665766-A-G | 14553886-A-G | ** | |||||||
2892568-A-G | 3024527-A-G | ** | |||||||
17580888-C-T | 15469008-C-T | ** | |||||||
27714369-A-C | 25568222-A-C | P1_Y2 | ** | ||||||
16623654-G-T | 14511774-G-T | ** | |||||||
10685316-C-A | ** | ||||||||
8013364-C-A | 8145323-C-A | ** | |||||||
15338789-C-A | 13226907-C-A | ** | |||||||
7635975-T-C | 7767934-T-C | BY35177 | BY35178 Y134399 | ** | |||||
9056935-C-A | ** | ||||||||
10887190-C-A | FT435574 | ** | |||||||
6330102-A-C | 6462061-A-C | IR3_Dst | ** | ||||||
10745765-A-C | ** | ||||||||
23360558-C-A | 21198672-C-A | FT220723 | ** | ||||||
10805277-G-T | ** | ||||||||
11004392-T-C | ** | ||||||||
21220273-G-C | 19058387-G-C | ** | |||||||
15280312-C-A | 13168411-C-A | ** | |||||||
14743928-C-A | 12631997-C-A | ** | |||||||
18539107-A-C | 16427227-A-C | ** | |||||||
14566688-T-C | 12454888-T-C | ** | |||||||
15712015-C-A | 13600135-C-A | ** | |||||||
24611993-A-AT | 22465846-A-AT | P3_t2 | ** | ||||||
13858532-A-G | 11737826-A-G | DYZ17 | ** | ||||||
13858552-A-T | 11737846-A-T | DYZ17 | ** | ||||||
13858557-A-G | 11737851-A-G | DYZ17 | ** | ||||||
10926748-C-A | ** | ||||||||
19337404-C-A | 17225524-C-A | ** | |||||||
13326227-C-A | 11170551-C-A | ** | |||||||
28499975-C-A | 26353828-C-A | ** | |||||||
27762780-CA-C | 25616633-CA-C | P1_Y2 | ** | ||||||
13858519-G-A | 11737813-G-A | DYZ17 | ** | ||||||
18803997-C-A | 16692117-C-A | ** | |||||||
18384482-G-A | 16272602-G-A | BY121517 | P6_Gap | ** | |||||
7313043-C-A | 7445002-C-A | ** | |||||||
14981705-C-A | 12869781-C-A | ** | |||||||
10940751-C-A | ** | ||||||||
10807387-G-T | ** | ||||||||
8043153-T-C | 8175112-T-C | ** | |||||||
21677515-C-A | 19515629-C-A | ** | |||||||
7617689-C-A | 7749648-C-A | ** | |||||||
18328686-G-T | 16216806-G-T | P6_Prx | ** | ||||||
17330286-C-A | 15218406-C-A | ** | |||||||
10059509-C-A | 10221900-C-A | ** | |||||||
6666446-C-A | 6798405-C-A | ** | |||||||
22815498-C-T | 20653612-C-T | ** | |||||||
17028811-C-A | 14916931-C-A | ** | |||||||
6459909-C-A | 6591868-C-A | FT71762 | ** | ||||||
10979657-G-T | ** | ||||||||
14300698-C-A | 12179992-C-A | ** | |||||||
10900550-C-A | ** | ||||||||
6926247-C-A | 7058206-C-A | ** | |||||||
10661401-C-A | ** | ||||||||
10778276-C-T | ** | ||||||||
17933997-C-A | 15822117-C-A | ** | |||||||
6736357-C-A | 6868316-C-A | ** | |||||||
9377965-C-T | 9540356-C-T | ** | |||||||
22598277-G-A | 20436391-G-A | ** | |||||||
7425269-C-A | 7557228-C-A | ** | |||||||
16486623-C-A | 14374743-C-A | ** | |||||||
16464465-C-A | 14352585-C-A | ** | |||||||
28478846-C-A | 26332699-C-A | ** | |||||||
16904706-T-A | 14792826-T-A | ** | |||||||
21493035-G-A | 19331149-G-A | FT381276 | ** | ||||||
7063852-C-G | 7195811-C-G | ** | |||||||
23397188-C-A | 21235302-C-A | FTA13452 | ** | ||||||
14442992-C-A | 12322265-C-A | ** | |||||||
19706174-C-A | 17594294-C-A | P5_Prx | ** | ||||||
13856356-T-G | 11735650-T-G | DYZ17 | ** | ||||||
15478808-C-A | 13366928-C-A | ** | |||||||
7257860-C-A | 7389819-C-A | ** | |||||||
15220928-C-A | 13109014-C-A | ** | |||||||
22774688-C-A | 20612802-C-A | ** | |||||||
22228091-T-C | 20066205-T-C | DYZ19 | ** | ||||||
18793570-G-T | 16681690-G-T | ** | |||||||
9516767-AG-A | 9679158-AG-A | ** | |||||||
16104188-G-C | 13992308-G-C | P8_Prx | ** | ||||||
15686870-A-G | 13574990-A-G | ** | |||||||
8776750-C-A | 8908709-C-A | ** | |||||||
24371788-C-A | 22225641-C-A | ** | |||||||
20230154-A-AC | 18068268-A-AC | P5_Dst | ** | ||||||
10850098-G-T | ** | ||||||||
17716591-C-A | 15604711-C-A | ** | |||||||
9991803-C-A | 10154194-C-A | ** | |||||||
10651649-T-C | ** | ||||||||
10778279-T-C | ** | ||||||||
24244621-GT-G | 22098474-GT-G | P3_b1 | ** | ||||||
10796945-T-A | ** | ||||||||
19476777-C-A | 17364897-C-A | ** | |||||||
23343645-C-A | 21181759-C-A | ** | |||||||
13236260-T-A | 11080584-T-A | ** | |||||||
23037225-A-T | 20875339-A-T | ** | |||||||
28613068-C-A | 26466921-C-A | ** | |||||||
7871467-AT-A | 8003426-AT-A | ** | |||||||
14803044-C-A | 12691115-C-A | ** | |||||||
23045918-C-A | 20884032-C-A | ** | |||||||
6979793-C-A | 7111752-C-A | ** | |||||||
7534528-A-T | 7666487-A-T | ** | |||||||
15280185-C-A | 13168284-C-A | ** | |||||||
4769527-C-A | 4901486-C-A | ** | |||||||
10956802-TCCA-T | ** | ||||||||
14540829-G-T | 12429030-G-T | ** | |||||||
5359622-G-T | 5491581-G-T | ** | |||||||
26073037-G-T | 23926890-G-T | P1_Y1 | ** | ||||||
26275953-C-T | 24129806-C-T | P1_Y1 | 16×T | ** | |||||
15358753-T-C | 13246872-T-C | ** | |||||||
18636728-A-G | 16524848-A-G | ** | |||||||
7437604-C-G | 7569563-C-G | ** | |||||||
16926932-C-A | 14815052-C-A | ** | |||||||
10778336-T-C | ** | ||||||||
7100753-C-A | 7232712-C-A | ** | |||||||
10804725-G-A | ** | ||||||||
17713946-C-A | 15602066-C-A | ** | |||||||
10744438-G-GCACTC | ** | ||||||||
2888866-G-T | 3020825-G-T | ** | |||||||
2690600-C-A | 2822559-C-A | ** | |||||||
2730109-T-G | 2862068-T-G | ** | |||||||
2753801-C-A | 2885760-C-A | ** | |||||||
2762721-TA-T | 2894680-TA-T | ** | |||||||
2767973-C-G | 2899932-C-G | ** | |||||||
2778517-A-T | 2910476-A-T | ** | |||||||
2799486-C-A | 2931445-C-A | ** | |||||||
2810390-GAGA-G | 2942349-GAGA-G | ** | |||||||
2810399-C-G | 2942358-C-G | ** | |||||||
2842469-G-A | 2974428-G-A | FT165324 | ** | ||||||
2842469-G-GC | 2974428-G-GC | ** | |||||||
2852869-C-A | 2984828-C-A | ** | |||||||
2865866-C-A | 2997825-C-A | ** | |||||||
2902215-G-C | 3034174-G-C | ** | |||||||
3012737-TAC-T | 3144696-TAC-T | ** | |||||||
3123041-C-A | 3255000-C-A | ** | |||||||
3218049-A-G | 3350008-A-G | ** | |||||||
3218068-T-C | 3350027-T-C | ** | |||||||
3272011-C-G | 3403970-C-G | ** | |||||||
3274201-C-A | 3406160-C-A | ** | |||||||
3291815-G-T | 3423774-G-T | ** | |||||||
3334612-G-T | 3466571-G-T | ** | |||||||
3343721-C-A | 3475680-C-A | ** | |||||||
3463375-G-T | 3595334-G-T | ** | |||||||
3659188-G-T | 3791147-G-T | ** | |||||||
3688651-A-C | 3820610-A-C | ** | |||||||
3726322-C-T | 3858281-C-T | ** | |||||||
3815324-A-G | 3947283-A-G | ** | |||||||
3834878-T-G | 3966837-T-G | ** | |||||||
3834921-TC-T | 3966880-TC-T | ** | |||||||
3990639-C-G | 4122598-C-G | FT319159 | ** | ||||||
3991785-A-T | 4123744-A-T | ** | |||||||
3991863-T-A | 4123822-T-A | ** | |||||||
4012698-C-A | 4144657-C-A | ** | |||||||
4069549-T-G | 4201508-T-G | ** | |||||||
4142420-T-A | 4274379-T-A | ** | |||||||
4262333-A-G | 4394292-A-G | ** | |||||||
4372422-C-A | 4504381-C-A | ** | |||||||
4408728-A-G | 4540687-A-G | ** | |||||||
4581719-G-T | 4713678-G-T | ** | |||||||
4652716-G-T | 4784675-G-T | ** | |||||||
4780423-C-A | 4912382-C-A | ** | |||||||
5107468-G-A | 5239427-G-A | ** | |||||||
5204580-G-A | 5336539-G-A | ** | |||||||
5242428-C-A | 5374387-C-A | ** | |||||||
5313665-G-C | 5445624-G-C | ** | |||||||
5409846-A-G | 5541805-A-G | ** | |||||||
5650663-T-A | 5782622-T-A | ** | |||||||
5800203-A-T | 5932162-A-T | ** | |||||||
5818014-C-A | 5949973-C-A | ** | |||||||
6228201-A-ATG | 6360160-A-ATG | IR3_Dst | ** | ||||||
6231174-G-C | 6363133-G-C | IR3_Dst | ** | ||||||
6295927-C-A | 6427886-C-A | IR3_Dst | ** | ||||||
6330105-T-A | 6462064-T-A | IR3_Dst | ** | ||||||
6330116-A-AT | 6462075-A-AT | IR3_Dst | ** | ||||||
6389887-C-A | 6521846-C-A | ** | |||||||
6457916-A-G | 6589875-A-G | ** | |||||||
6461074-A-G | 6593033-A-G | ** | |||||||
6644967-T-A | 6776926-T-A | ** | |||||||
6693014-T-C | 6824973-T-C | ** | |||||||
6748090-T-C | 6880049-T-C | ** | |||||||
6769793-C-G | 6901752-C-G | ** | |||||||
6769797-A-C | 6901756-A-C | ** | |||||||
6775875-C-T | 6907834-C-T | ** | |||||||
6776493-T-A | 6908452-T-A | ** | |||||||
6799095-G-T | 6931054-G-T | ** | |||||||
6805445-C-A | 6937404-C-A | ** | |||||||
6805455-T-G | 6937414-T-G | ** | |||||||
6835592-A-C | 6967551-A-C | ** | |||||||
6862176-A-G | 6994135-A-G | ** | |||||||
6869568-G-A | 7001527-G-A | ** | |||||||
6869590-G-A | 7001549-G-A | ** | |||||||
6915819-GAGA-G | 7047778-GAGA-G | ** | |||||||
6925703-C-A | 7057662-C-A | ** | |||||||
6976612-C-A | 7108571-C-A | ** | |||||||
6979798-G-A | 7111757-G-A | ** | |||||||
6988463-G-A | 7120422-G-A | ** | |||||||
6996559-G-T | 7128518-G-T | ** | |||||||
7028773-C-A | 7160732-C-A | ** | |||||||
7029995-A-G | 7161954-A-G | ** | |||||||
7050365-T-A | 7182324-T-A | ** | |||||||
7101070-G-T | 7233029-G-T | ** | |||||||
7103494-C-A | 7235453-C-A | ** | |||||||
7111011-A-G | 7242970-A-G | ** | |||||||
7126561-A-C | 7258520-A-C | ** | |||||||
7126562-C-T | 7258521-C-T | ** | |||||||
7146168-G-A | 7278127-G-A | ** | |||||||
7172443-G-A | 7304402-G-A | ** | |||||||
7183169-C-A | 7315128-C-A | ** | |||||||
7187770-G-T | 7319729-G-T | ** | |||||||
7207385-TAA-T | 7339344-TAA-T | ** | |||||||
7211287-C-A | 7343246-C-A | ** | |||||||
7256138-A-T | 7388097-A-T | ** | |||||||
7257935-A-G | 7389894-A-G | ** | |||||||
7270312-C-G | 7402271-C-G | ** | |||||||
7282547-T-C | 7414506-T-C | ** | |||||||
7286744-T-C | 7418703-T-C | ** | |||||||
7294374-C-A | 7426333-C-A | ** | |||||||
7298330-G-T | 7430289-G-T | ** | |||||||
7299834-G-T | 7431793-G-T | ** | |||||||
7336871-C-A | 7468830-C-A | ** | |||||||
7436055-C-T | 7568014-C-T | ** | |||||||
7437598-A-G | 7569557-A-G | ** | |||||||
7437606-G-A | 7569565-G-A | ** | |||||||
7468089-A-T | 7600048-A-T | IR1_L | ** | ||||||
7468090-C-A | 7600049-C-A | IR1_L | ** | ||||||
7534508-G-A | 7666467-G-A | ** | |||||||
7536453-G-T | 7668412-G-T | ** | |||||||
7543809-A-T | 7675768-A-T | ** | |||||||
7579924-G-A | 7711883-G-A | ** | |||||||
7580085-G-C | 7712044-G-C | ** | |||||||
7580092-T-C | 7712051-T-C | ** | |||||||
7582044-T-C | 7714003-T-C | ** | |||||||
7635995-G-A | 7767954-G-A | ** | |||||||
7649300-T-A | 7781259-T-A | ** | |||||||
7663574-C-A | 7795533-C-A | ** | |||||||
7670706-C-A | 7802665-C-A | ** | |||||||
7820944-C-A | 7952903-C-A | ** | |||||||
7822025-C-A | 7953984-C-A | ** | |||||||
7824677-C-G | 7956636-C-G | ** | |||||||
7867074-A-C | 7999033-A-C | ** | |||||||
7868072-CA-C | 8000031-CA-C | ** | |||||||
7869266-C-A | 8001225-C-A | ** | |||||||
8074891-G-T | 8206850-G-T | ** | |||||||
8125032-G-GAAAC | 8256991-G-GAAAC | ** | |||||||
8213615-G-A | 8345574-G-A | ** | |||||||
8232021-C-A | 8363980-C-A | ** | |||||||
8238191-G-T | 8370150-G-T | ** | |||||||
8563740-A-G | 8695699-A-G | ** | |||||||
8563744-GC-G | 8695703-GC-G | ** | |||||||
8689335-C-A | 8821294-C-A | ** | |||||||
8705966-A-T | 8837925-A-T | ** | |||||||
8746475-T-C | 8878434-T-C | ** | |||||||
8806910-C-A | 8938869-C-A | ** | |||||||
8832169-C-A | 8964128-C-A | ** | |||||||
9075274-C-A | 9237665-C-A | ** | |||||||
9184216-C-A | 9346607-C-A | ** | |||||||
9446068-G-T | 9608459-G-T | ** | |||||||
9457125-C-A | 9619516-C-A | ** | |||||||
9516787-A-C | 9679178-A-C | ** | |||||||
9517400-T-C | 9679791-T-C | ** | |||||||
9624866-A-T | 9787257-A-T | IR3_Prx | ** | ||||||
9742608-C-A | 9904999-C-A | IR3_Prx | ** | ||||||
9742609-A-T | 9905000-A-T | IR3_Prx | ** | ||||||
9822854-T-C | 9985245-T-C | ** | |||||||
9847442-G-T | 10009833-G-T | ** | |||||||
9877122-T-G | 10039513-T-G | ** | |||||||
9891179-C-A | 10053570-C-A | ** | |||||||
10022975-C-A | 10185366-C-A | ** | |||||||
10651596-T-C | ** | ||||||||
10655885-A-G | ** | ||||||||
10661408-C-A | ** | ||||||||
10661413-T-G | ** | ||||||||
10665822-G-T | ** | ||||||||
10666936-C-CTCCAT | ** | ||||||||
10677167-C-CACACT | ** | ||||||||
10679232-C-T | ** | ||||||||
10683048-CATTCG-C | ** | ||||||||
10684099-C-A | ** | ||||||||
10687105-T-A | ** | ||||||||
10754856-C-A | ** | ||||||||
10755447-C-A | ** | ||||||||
10766720-T-A | ** | ||||||||
10768092-A-ACTCCG | ** | ||||||||
10773379-T-C | ** | ||||||||
10774759-C-A | ** | ||||||||
10777244-T-C | ** | ||||||||
10778216-G-T | ** | ||||||||
10778234-TC-T | ** | ||||||||
10778238-C-G | ** | ||||||||
10778238-C-CTA | ** | ||||||||
10778240-CA-C | ** | ||||||||
10778297-C-T | ** | ||||||||
10778326-C-A | ** | ||||||||
10781633-C-T | ** | ||||||||
10783938-G-A | ** | ||||||||
10800828-T-G | ** | ||||||||
10804732-CA-C | ** | ||||||||
10804737-A-AT | ** | ||||||||
10804751-T-A | ** | ||||||||
10804752-C-T | ** | ||||||||
10804785-C-CATTGT | ** | ||||||||
10804796-A-ACTGAAC | ** | ||||||||
10804797-T-TCCAC | ** | ||||||||
10822041-G-C | ** | ||||||||
10822056-G-C | ** | ||||||||
10826857-A-C | ** | ||||||||
10835648-A-T | ** | ||||||||
10835651-C-A | ** | ||||||||
10835661-C-A | ** | ||||||||
10840581-G-T | ** | ||||||||
10848412-C-A | ** | ||||||||
10869360-C-A | ** | ||||||||
10870283-G-T | ** | ||||||||
10873669-A-T | ** | ||||||||
10881643-T-C | ** | ||||||||
10888061-T-C | ** | ||||||||
10888447-A-G | ** | ||||||||
10890343-C-A | ** | ||||||||
10890412-A-C | ** | ||||||||
10898958-T-C | ** | ||||||||
10919649-G-T | ** | ||||||||
10921176-C-T | ** | ||||||||
10922109-A-G | ** | ||||||||
10930333-C-A | ** | ||||||||
10931150-C-A | ** | ||||||||
10932511-A-C | ** | ||||||||
10940912-A-G | ** | ||||||||
10941205-C-G | ** | ||||||||
10941760-T-G | ** | ||||||||
10945590-G-T | ** | ||||||||
10947889-T-A | ** | ||||||||
10955438-C-A | ** | ||||||||
10959705-T-C | ** | ||||||||
10981740-C-T | ** | ||||||||
10982425-C-A | ** | ||||||||
11014049-G-A | ** | ||||||||
11017441-T-A | ** | ||||||||
11020739-C-T | ** | ||||||||
11027207-A-G | ** | ||||||||
11028097-G-CCATAT | ** | ||||||||
11028199-C-T | ** | ||||||||
11037960-C-T | ** | ||||||||
11037964-A-T | ** | ||||||||
13212849-C-A | 11057173-C-A | ** | |||||||
13236252-G-A | 11080576-G-A | ** | |||||||
13236256-T-C | 11080580-T-C | ** | |||||||
13236268-CAAA-C | 11080592-CAAA-C | 8×A | ** | ||||||
13313977-C-A | 11158301-C-A | ** | |||||||
13463892-A-T | 11308216-A-T | ** | |||||||
13484541-G-T | 11328865-G-T | ** | |||||||
13491112-T-G | 11335436-T-G | ** | |||||||
13491136-G-A | 11335460-G-A | ** | |||||||
13493385-A-G | 11337709-A-G | ** | |||||||
13602703-ACCATGCTTC-A | 11447027-ACCATGCTTC-A | ** | |||||||
13617936-C-A | 11462260-C-A | FT70169 | ** | ||||||
13643921-C-A | 11488245-C-A | ** | |||||||
11659394-C-A | DYZ17 | ** | |||||||
11671518-A-C | DYZ17 | ** | |||||||
13840609-T-A | 11719903-T-A | DYZ17 | ** | ||||||
13881229-C-A | 11760523-C-A | ** | |||||||
13900220-C-A | 11779514-C-A | ** | |||||||
13909295-A-C | 11788589-A-C | ** | |||||||
13909379-G-T | 11788673-G-T | ** | |||||||
13919560-T-C | 11798854-T-C | ** | |||||||
13941501-A-C | 11820795-A-C | ** | |||||||
13952651-T-C | 11831945-T-C | ** | |||||||
14000529-C-A | 11879823-C-A | ** | |||||||
14066908-T-C | 11946202-T-C | ** | |||||||
14069050-C-T | 11948344-C-T | ** | |||||||
14136247-G-C | 12015541-G-C | ** | |||||||
14171840-T-C | 12051134-T-C | ** | |||||||
14200452-C-A | 12079746-C-A | ** | |||||||
14214315-T-C | 12093609-T-C | ** | |||||||
14216485-A-G | 12095779-A-G | ** | |||||||
14222784-A-T | 12102078-A-T | ** | |||||||
14238495-A-G | 12117789-A-G | ** | |||||||
14245230-A-T | 12124524-A-T | ** | |||||||
14246784-G-T | 12126078-G-T | ** | |||||||
14250139-G-T | 12129433-G-T | ** | |||||||
14251742-A-G | 12131036-A-G | ** | |||||||
14272888-T-A | 12152182-T-A | ** | |||||||
14283389-A-T | 12162683-A-T | ** | |||||||
14286206-C-A | 12165500-C-A | ** | |||||||
14295296-T-A | 12174590-T-A | ** | |||||||
14299786-C-G | 12179080-C-G | ** | |||||||
14322828-C-A | 12202122-C-A | ** | |||||||
14328067-C-T | 12207361-C-T | ** | |||||||
14353792-C-T | 12233087-C-T | ** | |||||||
14357700-TG-T | 12236995-TG-T | ** | |||||||
14379109-A-G | 12258405-A-G | ** | |||||||
14379367-C-T | 12258663-C-T | ** | |||||||
14383518-A-G | 12262814-A-G | ** | |||||||
14389870-A-G | 12269166-A-G | ** | |||||||
14400224-T-C | 12279521-T-C | ** | |||||||
14402084-C-A | 12281381-C-A | ** | |||||||
14449602-A-G | 12328875-A-G | ** | |||||||
14449609-C-A | 12328882-C-A | ** | |||||||
14449624-T-C | 12328897-T-C | ** | |||||||
14450529-G-C | 12329802-G-C | ** | |||||||
14452198-G-T | 12331471-G-T | ** | |||||||
14457249-G-C | 12336522-G-C | ** | |||||||
14465469-C-A | 12344742-C-A | ** | |||||||
14465522-A-G | 12344795-A-G | ** | |||||||
14465534-A-G | 12344807-A-G | ** | |||||||
14465538-C-T | 12344811-C-T | ** | |||||||
14465539-A-G | 12344812-A-G | ** | |||||||
14471966-A-T | 12351235-A-T | ** | |||||||
14527028-G-A | 12415229-G-A | ** | |||||||
14538649-G-C | 12426850-G-C | ** | |||||||
14544101-C-A | 12432302-C-A | ** | |||||||
14566686-C-T | 12454886-C-T | ** | |||||||
14566687-A-G | 12454887-A-G | ** | |||||||
14609610-G-T | 12497812-G-T | ** | |||||||
14611766-C-A | 12499972-C-A | ** | |||||||
14623482-T-G | 12511680-T-G | ** | |||||||
14645058-T-G | 12533127-T-G | ** | |||||||
14743990-C-A | 12632059-C-A | ** | |||||||
14745118-C-A | 12633187-C-A | ** | |||||||
14753800-C-A | 12641869-C-A | ** | |||||||
14769340-C-A | 12657409-C-A | ** | |||||||
14771703-A-T | 12659772-A-T | ** | |||||||
14785741-C-A | 12673811-C-A | ** | |||||||
14789405-G-T | 12677476-G-T | ** | |||||||
14789506-G-A | 12677577-G-A | ** | |||||||
14825977-C-A | 12714044-C-A | ** | |||||||
14831787-T-A | 12719854-T-A | ** | |||||||
14849033-C-T | 12737099-C-T | ** | |||||||
14849034-A-G | 12737100-A-G | ** | |||||||
14885561-C-A | 12773627-C-A | ** | |||||||
14909686-T-C | 12797753-T-C | ** | |||||||
14926504-T-C | 12814569-T-C | ** | |||||||
15049467-T-G | 12937558-T-G | ** | |||||||
15092295-C-A | 12980384-C-A | ** | |||||||
15161318-G-A | 13049404-G-A | Z27081 | ** | ||||||
15169228-T-A | 13057314-T-A | ** | |||||||
15169401-G-T | 13057487-G-T | ** | |||||||
15170990-A-C | 13059076-A-C | ** | |||||||
15172074-C-T | 13060160-C-T | ** | |||||||
15172080-T-C | 13060166-T-C | ** | |||||||
15201722-A-G | 13089808-A-G | ** | |||||||
15203236-C-A | 13091322-C-A | ** | |||||||
15206009-C-T | 13094095-C-T | ** | |||||||
15209527-A-G | 13097613-A-G | ** | |||||||
15218517-C-A | 13106603-C-A | ** | |||||||
15259168-C-T | 13147252-C-T | ** | |||||||
15305788-C-T | 13193887-C-T | ** | |||||||
15320781-G-T | 13208899-G-T | ** | |||||||
15342076-C-G | 13230195-C-G | ** | |||||||
15367070-A-G | 13255190-A-G | ** | |||||||
15401415-C-A | 13289535-C-A | ** | |||||||
15405360-A-G | 13293480-A-G | ** | |||||||
15410612-C-T | 13298732-C-T | F19771 | ** | ||||||
15468184-T-G | 13356304-T-G | ** | |||||||
15546073-T-C | 13434193-T-C | ** | |||||||
15655644-C-A | 13543764-C-A | ** | |||||||
15657992-A-G | 13546112-A-G | ** | |||||||
15743586-A-T | 13631706-A-T | ** | |||||||
15871754-C-T | 13759874-C-T | ** | |||||||
15957739-A-T | 13845859-A-T | ** | |||||||
15976499-TTATTTAATATTTCCA-T | 13864619-TTATTTAATATTTCCA-T | ** | |||||||
15987279-C-T | 13875399-C-T | ** | |||||||
15991803-T-G | 13879923-T-G | ** | |||||||
16017819-C-A | 13905939-C-A | ** | |||||||
16176562-C-A | 14064682-C-A | ** | |||||||
16223544-C-A | 14111664-C-A | ** | |||||||
16244363-C-A | 14132483-C-A | ** | |||||||
16279011-T-A | 14167131-T-A | ** | |||||||
16279029-G-A | 14167149-G-A | ** | |||||||
16340173-A-G | 14228293-A-G | ** | |||||||
16422797-C-A | 14310917-C-A | ** | |||||||
16441084-A-C | 14329204-A-C | ** | |||||||
16467550-A-C | 14355670-A-C | ** | |||||||
16467560-G-C | 14355680-G-C | ** | |||||||
16503693-T-A | 14391813-T-A | ** | |||||||
16528918-A-T | 14417038-A-T | ** | |||||||
16603858-C-T | 14491978-C-T | ** | |||||||
16629272-G-A | 14517392-G-A | ** | |||||||
16667848-C-A | 14555968-C-A | ** | |||||||
16668191-C-A | 14556311-C-A | ** | |||||||
16700179-A-G | 14588299-A-G | ** | |||||||
16701604-A-T | 14589724-A-T | ** | |||||||
16705430-A-C | 14593550-A-C | ** | |||||||
16707453-G-T | 14595573-G-T | ** | |||||||
16729957-C-A | 14618077-C-A | ** | |||||||
16781334-C-A | 14669454-C-A | ** | |||||||
16827379-T-C | 14715499-T-C | ** | |||||||
16867519-C-A | 14755639-C-A | ** | |||||||
16868502-C-A | 14756622-C-A | ** | |||||||
16868547-C-A | 14756667-C-A | ** | |||||||
16919998-T-C | 14808118-T-C | ** | |||||||
16931135-G-T | 14819255-G-T | ** | |||||||
16936095-CA-C | 14824215-CA-C | ** | |||||||
16943506-C-A | 14831626-C-A | FTB41551 | ** | ||||||
16962783-C-A | 14850903-C-A | ** | |||||||
17013310-G-A | 14901430-G-A | ** | |||||||
17046769-C-A | 14934889-C-A | ** | |||||||
17057450-T-A | 14945570-T-A | ** | |||||||
17097561-G-T | 14985681-G-T | ** | |||||||
17129953-A-G | 15018073-A-G | ** | |||||||
17187506-C-A | 15075626-C-A | ** | |||||||
17233393-C-A | 15121513-C-A | ** | |||||||
17263295-C-A | 15151415-C-A | ** | |||||||
17280014-T-C | 15168134-T-C | ** | |||||||
17302151-G-A | 15190271-G-A | ** | |||||||
17342821-C-A | 15230941-C-A | ** | |||||||
17377174-A-C | 15265294-A-C | ** | |||||||
17380100-C-T | 15268220-C-T | ** | |||||||
17412265-C-A | 15300385-C-A | ** | |||||||
17465831-C-A | 15353951-C-A | ** | |||||||
17465868-C-A | 15353988-C-A | ** | |||||||
17491082-A-G | 15379202-A-G | ** | |||||||
17497809-C-A | 15385929-C-A | ** | |||||||
17527205-C-A | 15415325-C-A | FT353002 | ** | ||||||
17580880-C-T | 15469000-C-T | ** | |||||||
17580895-C-T | 15469015-C-T | ** | |||||||
17598046-C-A | 15486166-C-A | ** | |||||||
17634484-C-A | 15522604-C-A | ** | |||||||
17675560-A-G | 15563680-A-G | ** | |||||||
17715038-T-G | 15603158-T-G | ** | |||||||
17737368-C-A | 15625488-C-A | FTB22055 | ** | ||||||
17749321-T-A | 15637441-T-A | ** | |||||||
17859669-A-G | 15747789-A-G | ** | |||||||
17913612-C-G | 15801732-C-G | ** | |||||||
17915069-C-A | 15803189-C-A | ** | |||||||
17942236-G-T | 15830356-G-T | ** | |||||||
17946653-T-A | 15834773-T-A | ** | |||||||
17946654-TTAC-T | 15834774-TTAC-T | ** | |||||||
17997176-C-A | 15885296-C-A | P7_Gap | ** | ||||||
18108588-G-C | 15996708-G-C | ** | |||||||
18147651-C-A | 16035771-C-A | ** | |||||||
18147655-A-G | 16035775-A-G | FT181381 | ** | ||||||
18249848-C-T | 16137968-C-T | ** | |||||||
18261589-A-G | 16149709-A-G | ** | |||||||
18280240-T-A | 16168360-T-A | BY121370 | P6_Prx | ** | |||||
18343775-A-C | 16231895-A-C | P6_Prx | ** | ||||||
18382608-C-A | 16270728-C-A | P6_Gap | ** | ||||||
18567831-A-G | 16455951-A-G | ** | |||||||
18589723-G-A | 16477843-G-A | ** | |||||||
18589807-C-A | 16477927-C-A | ** | |||||||
18668055-G-T | 16556175-G-T | ** | |||||||
18668060-C-A | 16556180-C-A | ** | |||||||
18682487-C-A | 16570607-C-A | ** | |||||||
18688237-C-T | 16576357-C-T | ** | |||||||
18704332-C-A | 16592452-C-A | ** | |||||||
18718786-C-A | 16606906-C-A | ** | |||||||
18792881-C-A | 16681001-C-A | ** | |||||||
18800911-T-C | 16689031-T-C | ** | |||||||
18814752-C-A | 16702872-C-A | ** | |||||||
18857688-A-G | 16745808-A-G | ** | |||||||
18904355-C-A | 16792475-C-A | ** | |||||||
18986022-T-C | 16874142-T-C | ** | |||||||
18996466-A-T | 16884586-A-T | ** | |||||||
19041292-A-T | 16929412-A-T | ** | |||||||
19041321-C-G | 16929441-C-G | ** | |||||||
19061364-C-A | 16949484-C-A | ** | |||||||
19223386-A-T | 17111506-A-T | ** | |||||||
19231313-TTGTTTC-T | 17119433-TTGTTTC-T | ** | |||||||
19298716-C-A | 17186836-C-A | ** | |||||||
19299793-A-T | 17187913-A-T | ** | |||||||
19362620-C-A | 17250740-C-A | FGC5466 | ** | ||||||
19376256-G-T | 17264376-G-T | ** | |||||||
19391272-T-G | 17279392-T-G | ** | |||||||
19403882-T-A | 17292002-T-A | ** | |||||||
19403885-A-G | 17292005-A-G | ** | |||||||
19403897-C-G | 17292017-C-G | ** | |||||||
19403898-A-C | 17292018-A-C | ** | |||||||
19412374-G-T | 17300494-G-T | ** | |||||||
19412853-G-T | 17300973-G-T | ** | |||||||
19423149-C-A | 17311269-C-A | FTB34073 | ** | ||||||
19427296-G-T | 17315416-G-T | ** | |||||||
19464169-A-T | 17352289-A-T | ** | |||||||
19476766-G-A | 17364886-G-A | ** | |||||||
19504198-C-T | 17392318-C-T | ** | |||||||
19522587-C-A | 17410707-C-A | ** | |||||||
19527893-T-G | 17416013-T-G | ** | |||||||
19564584-CAGAGGTCA-C | 17452704-CAGAGGTCA-C | ** | |||||||
19706122-C-G | 17594242-C-G | P5_Prx | 9×CAT | ** | |||||
19706122-C-CCGT | 17594242-C-CCGT | P5_Prx | 9×CAT | ** | |||||
20001319-C-T | 17889439-C-T | P5_Prx | ** | ||||||
20101794-TG-T | 17989914-TG-T | P5_Dst | ** | ||||||
20132267-A-G | 18020387-A-G | P5_Dst | ** | ||||||
20230257-C-A | 18068371-C-A | P5_Dst | ** | ||||||
20815956-T-C | 18654070-T-C | P4_Gap | ** | ||||||
20840349-T-A | 18678463-T-A | P4_Gap | ** | ||||||
21068199-T-G | 18906313-T-G | ** | |||||||
21092301-C-G | 18930415-C-G | ** | |||||||
21149574-T-C | 18987688-T-C | ** | |||||||
21153274-C-G | 18991388-C-G | ** | |||||||
21177098-TA-T | 19015212-TA-T | ** | |||||||
21220276-C-G | 19058390-C-G | ** | |||||||
21315326-C-T | 19153440-C-T | ** | |||||||
21332749-C-A | 19170863-C-A | ** | |||||||
21373690-A-G | 19211804-A-G | ** | |||||||
21388807-T-G | 19226921-T-G | ** | |||||||
21389791-C-A | 19227905-C-A | ** | |||||||
21405895-C-T | 19244009-C-T | ** | |||||||
21456713-C-T | 19294827-C-T | ** | |||||||
21522081-C-A | 19360195-C-A | ** | |||||||
21554392-T-G | 19392506-T-G | ** | |||||||
21556477-C-A | 19394591-C-A | ** | |||||||
21639032-T-A | 19477146-T-A | ** | |||||||
21732663-C-T | 19570777-C-T | 14×T | ** | ||||||
21737903-G-C | 19576017-G-C | ** | |||||||
21875794-A-T | 19713908-A-T | ** | |||||||
21904583-C-A | 19742697-C-A | ** | |||||||
21975319-C-A | 19813433-C-A | ** | |||||||
21987415-C-A | 19825529-C-A | ** | |||||||
21990482-C-A | 19828596-C-A | ** | |||||||
21996386-T-C | 19834500-T-C | ** | |||||||
22028824-C-G | 19866938-C-G | ** | |||||||
22047928-C-A | 19886042-C-A | ** | |||||||
22079432-C-A | 19917546-C-A | ** | |||||||
22124515-C-G | 19962629-C-G | ** | |||||||
22215329-C-A | 20053443-C-A | ** | |||||||
22258180-A-T | 20096294-A-T | DYZ19 | ** | ||||||
22522761-G-T | 20360875-G-T | ** | |||||||
22527256-C-T | 20365370-C-T | FT270713 | ** | ||||||
22598293-T-A | 20436407-T-A | ** | |||||||
22611455-T-G | 20449569-T-G | ** | |||||||
22727308-T-C | 20565422-T-C | ** | |||||||
22729346-C-A | 20567460-C-A | ** | |||||||
22756053-A-T | 20594167-A-T | ** | |||||||
22756055-G-T | 20594169-G-T | ** | |||||||
22756068-T-C | 20594182-T-C | ** | |||||||
22774620-C-A | 20612734-C-A | ** | |||||||
22774900-A-G | 20613014-A-G | ** | |||||||
22819293-T-C | 20657407-T-C | ** | |||||||
22833876-AT-A | 20671990-AT-A | ** | |||||||
22864895-A-T | 20703009-A-T | ** | |||||||
22864914-A-G | 20703028-A-G | FT361381 | ** | ||||||
22869785-A-G | 20707899-A-G | ** | |||||||
22914547-C-A | 20752661-C-A | ** | |||||||
22951476-C-A | 20789590-C-A | ** | |||||||
22965160-T-A | 20803274-T-A | ** | |||||||
23037230-C-T | 20875344-C-T | ** | |||||||
23047708-C-A | 20885822-C-A | ** | |||||||
23052627-C-T | 20890741-C-T | ** | |||||||
23134194-A-T | 20972308-A-T | ** | |||||||
23202974-G-C | 21041088-G-C | ** | |||||||
23202978-C-A | 21041092-C-A | ** | |||||||
23208128-C-A | 21046242-C-A | ** | |||||||
23259285-A-T | 21097399-A-T | ** | |||||||
23285106-A-T | 21123220-A-T | ** | |||||||
23293623-T-A | 21131737-T-A | ** | |||||||
23370732-C-A | 21208846-C-A | ** | |||||||
23398198-A-T | 21236312-A-T | ** | |||||||
23411933-T-A | 21250047-T-A | ** | |||||||
23436019-T-C | 21274133-T-C | ** | |||||||
23459657-T-A | 21297771-T-A | ** | |||||||
23464608-C-A | 21302722-C-A | ** | |||||||
23522574-G-T | 21360688-G-T | ** | |||||||
23741919-G-T | 21580033-G-T | ** | |||||||
23779964-C-A | 21618078-C-A | ** | |||||||
23869855-G-C | 21707969-G-C | ** | |||||||
23869886-T-G | 21708000-T-G | ** | |||||||
23983654-G-T | 21837507-G-T | ** | |||||||
24003098-ACTG-A | 21856951-ACTG-A | ** | |||||||
24381299-G-A | 22235152-G-A | ** | |||||||
24422014-AAATCT-A | 22275867-AAATCT-A | ** | |||||||
24458779-G-C | 22312632-G-C | ** | |||||||
24474950-C-A | 22328803-C-A | ** | |||||||
24503072-C-A | 22356925-C-A | ** | |||||||
24577879-A-AT | 22431732-A-AT | P3_t2 | ** | ||||||
24869445-A-T | 22723298-A-T | IR1_R | ** | ||||||
24883634-T-A | 22737487-T-A | g1 | ** | ||||||
24883653-A-C | 22737506-A-C | g1 | ** | ||||||
25872062-A-C | 23725915-A-C | P1_Y1 | ** | ||||||
25937866-G-C | 23791719-G-C | P1_Y1 | ** | ||||||
25955615-C-A | 23809468-C-A | P1_Y1 | ** | ||||||
25996010-A-C | 23849863-A-C | P1_Y1 | ** | ||||||
26055613-T-C | 23909466-T-C | P1_Y1 | ** | ||||||
26344189-T-G | 24198042-T-G | P1_Y1 | ** | ||||||
26478117-A-AAAGAAAGT | 24331970-A-AAAGAAAGT | P1_Y1 | ** | ||||||
28429661-C-A | 26283514-C-A | P1_gr2 | ** | ||||||
28503136-G-T | 26356989-G-T | ** | |||||||
28529877-A-C | 26383730-A-C | ** | |||||||
28589114-A-G | 26442967-A-G | ** | |||||||
28650131-T-C | 26503984-T-C | ** | |||||||
28657736-A-G | 26511589-A-G | ** | |||||||
28719790-C-T | 26573643-C-T | ** | |||||||
28760271-C-G | 26614124-C-G | ** | |||||||
28773686-C-A | 26627539-C-A | ** | |||||||
28775860-G-T | 26629713-G-T | ** | |||||||
28779227-T-C | 26633080-T-C | ** | |||||||
28779584-A-G | 26633437-A-G | ** | |||||||
28798207-A-G | 26652060-A-G | ** | |||||||
56834943-A-G | ** | ||||||||
56839003-A-G | ** | ||||||||
56840375-G-T | ** | ||||||||
56844737-T-G | ** | ||||||||
58981847-A-T | 56835700-A-T | *** | |||||||
21182165-G-GA | 19020279-G-GA | 10×A | *** | ||||||
13848249-C-A | 11727543-C-A | FT328716 | DYZ17 | *** | |||||
18947916-C-A | 16836036-C-A | *** | |||||||
10016259-G-GA | 10178650-G-GA | *** | |||||||
9983834-A-T | 10146225-A-T | *** | |||||||
13433489-A-C,T | 11277813-A-C,T | *** | |||||||
14143824-C-A | 12023118-C-A | Z42332 Y24129 | *** | ||||||
9983838-A-G | 10146229-A-G | *** | |||||||
9995006-G-C | 10157397-G-C | *** | |||||||
13820769-A-G,T | 11700063-A-G,T | DYZ17 | *** | ||||||
18957220-C-A | 16845340-C-A | PR2944 | *** | ||||||
25092899-T-C | 22946752-T-C | g1 | *** | ||||||
17950870-AT-A | 15838990-AT-A | *** | |||||||
11672680-C-A | DYZ17 | *** | |||||||
10687013-G-T | *** | ||||||||
19283747-C-A | 17171867-C-A | *** | |||||||
7363613-C-A | 7495572-C-A | *** | |||||||
21856017-C-A | 19694131-C-A | *** | |||||||
20065109-C-A | 17953229-C-A | P5_Gap | *** | ||||||
23997570-C-A | 21851423-C-A | *** | |||||||
2979318-A-T | 3111277-A-T | *** | |||||||
13474050-C-T | 11318374-C-T | *** | |||||||
15078102-CTT-C,CT | 12966192-CTT-C,CT | 14×T | *** | ||||||
19104617-G-T | 16992737-G-T | *** | |||||||
15059692-C-A | 12947784-C-A | *** | |||||||
7360380-C-A | 7492339-C-A | *** | |||||||
9944155-G-T | 10106546-G-T | *** | |||||||
7134873-T-G | 7266832-T-G | *** | |||||||
17760347-CTTT-C,CT | 15648467-CTTT-C,CT | 14×T | *** | ||||||
56839239-G-T | *** | ||||||||
22037415-TA-T,TAA | 19875529-TA-T,TAA | 10×A | *** | ||||||
21754285-G-T | *** | ||||||||
18685369-C-A | 16573489-C-A | *** | |||||||
10801732-C-CTCTCG | *** | ||||||||
6345941-C-A | 6477900-C-A | *** | |||||||
17664881-C-A | 15553001-C-A | *** | |||||||
8217735-C-A | 8349694-C-A | *** | |||||||
10876813-G-T | *** | ||||||||
10995525-T-C | *** | ||||||||
23505549-C-A | 21343663-C-A | *** | |||||||
16180147-C-A | 14068267-C-A | *** | |||||||
19565634-TAAA-T | 17453754-TAAA-T | 14×A | *** | ||||||
16912636-C-A | 14800756-C-A | *** | |||||||
27823801-C-A | 25677654-C-A | P1_Y2 | *** | ||||||
2690875-C-A | 2822834-C-A | *** | |||||||
2695607-T-C | 2827566-T-C | *** | |||||||
2842330-T-C | 2974289-T-C | *** | |||||||
2855305-CTTT-C,CTT | 2987264-CTTT-C,CTT | 16×T | *** | ||||||
2901921-C-A | 3033880-C-A | *** | |||||||
4201234-T-C | 4333193-T-C | *** | |||||||
5911595-C-A | 6043554-C-A | *** | |||||||
5924254-C-A | 6056213-C-A | *** | |||||||
6345906-C-A | 6477865-C-A | *** | |||||||
6359626-T-G | 6491585-T-G | *** | |||||||
6674489-A-G | 6806448-A-G | *** | |||||||
6880259-A-T | 7012218-A-T | *** | |||||||
6972704-C-A | 7104663-C-A | *** | |||||||
7101660-C-A | 7233619-C-A | *** | |||||||
7104230-C-A | 7236189-C-A | *** | |||||||
7295727-C-A | 7427686-C-A | *** | |||||||
7609323-A-G | 7741282-A-G | *** | |||||||
7854597-G-T | 7986556-G-T | *** | |||||||
8019103-C-A | 8151062-C-A | *** | |||||||
8104751-A-G | 8236710-A-G | *** | |||||||
8158059-A-T | 8290018-A-T | *** | |||||||
8162573-C-A | 8294532-C-A | *** | |||||||
8349324-A-G | 8481283-A-G | *** | |||||||
8536175-G-T | 8668134-G-T | *** | |||||||
8730859-G-A | 8862818-G-A | BY75509 | *** | ||||||
8993894-G-T | 9156285-G-T | *** | |||||||
9380852-C-A | 9543243-C-A | *** | |||||||
9465937-G-T | 9628328-G-T | *** | |||||||
9856077-A-G | 10018468-A-G | *** | |||||||
9874941-C-A | 10037332-C-A | *** | |||||||
10020379-C-A | 10182770-C-A | *** | |||||||
10029933-C-T | 10192324-C-T | *** | |||||||
10825289-C-CCATTA | *** | ||||||||
10888571-C-A | *** | ||||||||
10943067-C-A | *** | ||||||||
11004509-G-T | *** | ||||||||
11026025-C-CTGAAT | *** | ||||||||
11026029-A-C | *** | ||||||||
13480884-G-A | 11325208-G-A | *** | |||||||
11648864-C-A | DYZ17 | *** | |||||||
11656643-GA-G | DYZ17 | *** | |||||||
13833380-T-C | 11712674-T-C | DYZ17 | *** | ||||||
14377005-C-A | 12256301-C-A | *** | |||||||
14392086-C-A | 12271382-C-A | *** | |||||||
14451088-C-A | 12330361-C-A | *** | |||||||
14548622-G-A | 12436823-G-A | *** | |||||||
14622714-C-A | 12510912-C-A | *** | |||||||
14745983-C-A | 12634052-C-A | *** | |||||||
14750064-C-A | 12638133-C-A | *** | |||||||
14766403-A-T | 12654472-A-T | *** | |||||||
14787043-A-G | 12675113-A-G | *** | |||||||
14799712-C-A | 12687783-C-A | *** | |||||||
14843996-C-A | 12732062-C-A | *** | |||||||
14939659-C-A | 12827733-C-A | *** | |||||||
15113996-T-C | 13002083-T-C | FT116977 | *** | ||||||
15114038-C-A | 13002125-C-A | *** | |||||||
15160765-A-G | 13048851-A-G | *** | |||||||
15160768-C-A | 13048854-C-A | *** | |||||||
15182914-C-G | 13071000-C-G | *** | |||||||
15182952-C-T | 13071038-C-T | *** | |||||||
15321482-C-A | 13209600-C-A | *** | |||||||
15404567-C-A | 13292687-C-A | *** | |||||||
15411416-A-C | 13299536-A-C | *** | |||||||
15411732-T-C | 13299852-T-C | *** | |||||||
15483894-C-A | 13372014-C-A | *** | |||||||
15572123-C-A | 13460243-C-A | *** | |||||||
15747111-A-G | 13635231-A-G | *** | |||||||
15980745-T-G | 13868865-T-G | *** | |||||||
16054361-C-A | 13942481-C-A | *** | |||||||
16085864-T-A | 13973984-T-A | *** | |||||||
16177416-C-A | 14065536-C-A | *** | |||||||
16279915-C-A | 14168035-C-A | *** | |||||||
16541252-G-A | 14429372-G-A | *** | |||||||
16716895-A-G | 14605015-A-G | 9×T | *** | ||||||
16740234-C-A | 14628354-C-A | *** | |||||||
16888251-AT-A | 14776371-AT-A | *** | |||||||
17285370-G-A | 15173490-G-A | *** | |||||||
17729899-C-A | 15618019-C-A | *** | |||||||
17811179-A-G | 15699299-A-G | *** | |||||||
17811953-C-A | 15700073-C-A | *** | |||||||
17869493-C-A | 15757613-C-A | *** | |||||||
17911161-C-A | 15799281-C-A | *** | |||||||
17911955-A-G | 15800075-A-G | *** | |||||||
18213499-C-A | 16101619-C-A | MF4824 | *** | ||||||
18263217-G-T | 16151337-G-T | *** | |||||||
18693625-T-C | 16581745-T-C | *** | |||||||
19228948-T-A | 17117068-T-A | *** | |||||||
19390893-C-A | 17279013-C-A | *** | |||||||
19509321-C-T | 17397441-C-T | *** | |||||||
19562715-C-A | 17450835-C-A | *** | |||||||
21138824-C-A | 18976938-C-A | *** | |||||||
21187170-C-A | 19025284-C-A | *** | |||||||
21284307-C-A | 19122421-C-A | *** | |||||||
21386211-C-A | 19224325-C-A | *** | |||||||
21445383-C-A | 19283497-C-A | *** | |||||||
21531608-C-A | 19369722-C-A | *** | |||||||
21603379-C-A | 19441493-C-A | *** | |||||||
21627280-C-A | 19465394-C-A | *** | |||||||
21627290-C-A | 19465404-C-A | *** | |||||||
21822535-C-A | 19660649-C-A | *** | |||||||
21880831-C-T | 19718945-C-T | *** | |||||||
21909518-C-T | 19747632-C-T | *** | |||||||
21916148-A-T | 19754262-A-T | *** | |||||||
21960400-T-A | 19798514-T-A | *** | |||||||
21974967-C-A | 19813081-C-A | *** | |||||||
21996338-G-T | 19834452-G-T | *** | |||||||
22527293-C-A | 20365407-C-A | *** | |||||||
22578532-C-A | 20416646-C-A | *** | |||||||
22843917-T-C | 20682031-T-C | *** | |||||||
22867928-A-C | 20706042-A-C | *** | |||||||
22868233-C-A | 20706347-C-A | *** | |||||||
22895787-AT-A | 20733901-AT-A | 10×T | *** | ||||||
23125888-G-A | 20964002-G-A | *** | |||||||
23125889-A-G | 20964003-A-G | *** | |||||||
23125892-C-T | 20964006-C-T | *** | |||||||
23274155-A-T | 21112269-A-T | *** | |||||||
23359026-C-A | 21197140-C-A | *** | |||||||
23429705-A-G | 21267819-A-G | *** | |||||||
23449826-C-A | 21287940-C-A | *** | |||||||
23493385-C-A | 21331499-C-A | *** | |||||||
23886982-C-A | 21725096-C-A | *** | |||||||
23954352-C-A | 21808205-C-A | *** | |||||||
23991951-C-A | 21845804-C-A | *** | |||||||
27883499-C-A | 25737352-C-A | P1_Y2 | *** | ||||||
28589650-G-A | 26443503-G-A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.