Graham
BigY3: B122909, FTDNA: B122909, BigY2: B122909, YFull-BigY: YF07351Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | BigY3 B122909 | FTDNA B122909 | BigY2 B122909 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
56834166-G-A | A* | |||||||||
7371009-C-T | 7502968-C-T | FT104475 | Y | + | ||||||
22287598-G-T | 20125712-G-T | Y38730 | FT454986 | DYZ19 | ** | |||||
5472027-C-A | 5603986-C-A | ** | ||||||||
19146569-C-T | 17034689-C-T | 28×T | ** | |||||||
16944551-C-A | 14832671-C-A | ** | ||||||||
22040982-C-A | 19879096-C-A | ** | ||||||||
22855459-G-T | 20693573-G-T | Z21645 | ** | |||||||
58876790-C-A | 56714081-G-T | ** | ||||||||
23048332-C-A | 20886446-C-A | ** | ||||||||
13538231-C-T | 11382555-C-T | ** | ||||||||
16952945-C-A | 14841065-C-A | ** | ||||||||
24585689-G-GAAA | 22439542-G-GAAA | P3_t2 | 10×A | ** | ||||||
23066845-C-A | 20904959-C-A | ** | ||||||||
15841876-A-G | 13729996-A-G | ** | ||||||||
6293372-TG-T | 6425331-TG-T | IR3_Dst | ** | |||||||
21863900-T-A | 19702014-T-A | ** | ||||||||
7085260-C-A | 7217219-C-A | ** | ||||||||
19071570-C-A | 16959690-C-A | ** | ||||||||
23277317-C-A | 21115431-C-A | ** | ||||||||
7861560-C-A | 7993519-C-A | ** | ||||||||
10935579-C-CTGCCA | ** | |||||||||
4537856-A-T | 4669815-A-T | ** | ||||||||
28500162-C-A | 26354015-C-A | ** | ||||||||
5710442-C-A | 5842401-C-A | ** | ||||||||
13922562-C-A | 11801856-C-A | ** | ||||||||
13937073-C-A | 11816367-C-A | ** | ||||||||
10787295-C-A | ** | |||||||||
5865466-C-A | 5997425-C-A | ** | ||||||||
7021863-C-A | 7153822-C-A | ** | ||||||||
5235351-C-A | 5367310-C-A | ** | ||||||||
14911037-C-A | 12799104-C-A | ** | ||||||||
10666989-C-A | ** | |||||||||
7362572-C-A | 7494531-C-A | ** | ||||||||
10992995-A-T | ** | |||||||||
15402365-C-A | 13290485-C-A | ** | ||||||||
17440723-C-A | 15328843-C-A | ** | ||||||||
24406667-C-A | 22260520-C-A | ** | ||||||||
10987385-A-T | ** | |||||||||
10987392-T-A | ** | |||||||||
10987393-C-G | ** | |||||||||
2746016-C-A | 2877975-C-A | ** | ||||||||
10987471-T-C | ** | |||||||||
10678063-A-T | ** | |||||||||
9927355-C-A | 10089746-C-A | ** | ||||||||
4537872-C-A | 4669831-C-A | ** | ||||||||
4537882-A-T | 4669841-A-T | ** | ||||||||
15424272-C-CAA | 13312392-C-CAA | 11×A | ** | |||||||
19075362-C-A | 16963482-C-A | ** | ||||||||
6771516-C-A | 6903475-C-A | ** | ||||||||
16179724-C-A | 14067844-C-A | ** | ||||||||
10764544-CAT-C | ** | |||||||||
13195781-C-A | 11040105-C-A | ** | ||||||||
10984200-C-A | ** | |||||||||
13471947-C-G | 11316271-C-G | ** | ||||||||
13471950-G-GC | 11316274-G-GC | ** | ||||||||
13471953-T-TC | 11316277-T-TC | ** | ||||||||
13471955-CCA-C | 11316279-CCA-C | ** | ||||||||
18035921-C-T | 15924041-C-T | ** | ||||||||
17381352-C-A | 15269472-C-A | ** | ||||||||
13469581-C-A | 11313905-C-A | ** | ||||||||
10982843-T-C | ** | |||||||||
10987377-A-G | ** | |||||||||
7281008-G-C | 7412967-G-C | ** | ||||||||
6948348-C-A | 7080307-C-A | ** | ||||||||
15712328-C-A | 13600448-C-A | ** | ||||||||
17362824-C-A | 15250944-C-A | ** | ||||||||
3800001-C-A | 3931960-C-A | ** | ||||||||
22204401-G-T | 20042515-G-T | ** | ||||||||
21267892-C-A | 19106006-C-A | ** | ||||||||
10678072-C-A | ** | |||||||||
7201601-C-A | 7333560-C-A | ** | ||||||||
10887393-C-A | ** | |||||||||
10796691-C-G | ** | |||||||||
4510000-C-A | 4641959-C-A | ** | ||||||||
23128607-C-A | 20966721-C-A | ** | ||||||||
24310308-T-TGA | 22164161-T-TGA | P3_t1 | ** | |||||||
4354074-C-A | 4486033-C-A | ** | ||||||||
8153581-T-C | 8285540-T-C | ** | ||||||||
23512375-C-A | 21350489-C-A | ** | ||||||||
10850954-C-A | ** | |||||||||
10789345-C-T | ** | |||||||||
18611646-TA-T | 16499766-TA-T | 9×A | ** | |||||||
14328399-C-A | 12207693-C-A | ** | ||||||||
3889495-C-A | 4021454-C-A | ** | ||||||||
5761607-C-A | 5893566-C-A | ** | ||||||||
15969862-C-A | 13857982-C-A | ** | ||||||||
11007435-C-A | ** | |||||||||
7167132-C-A | 7299091-C-A | ** | ||||||||
14506842-C-A | 12395047-C-A | ** | ||||||||
10993064-C-G | ** | |||||||||
5860862-C-A | 5992821-C-A | ** | ||||||||
7437403-C-A | 7569362-C-A | ** | ||||||||
2814972-A-G | 2946931-A-G | ** | ||||||||
2856709-G-T | 2988668-G-T | ** | ||||||||
2859083-C-A | 2991042-C-A | ** | ||||||||
3051294-C-A | 3183253-C-A | ** | ||||||||
3243973-G-T | 3375932-G-T | ** | ||||||||
3275716-C-T | 3407675-C-T | ** | ||||||||
3329428-A-C | 3461387-A-C | ** | ||||||||
3337289-C-A | 3469248-C-A | ** | ||||||||
3345542-C-A | 3477501-C-A | ** | ||||||||
3473587-A-G | 3605546-A-G | ** | ||||||||
3606399-A-G | 3738358-A-G | ** | ||||||||
3732011-C-A | 3863970-C-A | ** | ||||||||
3758703-C-A | 3890662-C-A | ** | ||||||||
3769623-C-A | 3901582-C-A | ** | ||||||||
3815089-G-T | 3947048-G-T | ** | ||||||||
3826420-G-T | 3958379-G-T | ** | ||||||||
3849398-C-A | 3981357-C-A | ** | ||||||||
3900770-A-G | 4032729-A-G | ** | ||||||||
3950816-T-A | 4082775-T-A | ** | ||||||||
3984025-G-T | 4115984-G-T | ** | ||||||||
3985693-G-T | 4117652-G-T | ** | ||||||||
4007719-T-C | 4139678-T-C | ** | ||||||||
4035922-A-C | 4167881-A-C | ** | ||||||||
4080867-G-A | 4212826-G-A | ** | ||||||||
4100799-C-A | 4232758-C-A | ** | ||||||||
4114922-C-A | 4246881-C-A | ** | ||||||||
4215710-T-C | 4347669-T-C | FT113470 | ** | |||||||
4223488-C-A | 4355447-C-A | ** | ||||||||
4423543-G-T | 4555502-G-T | ** | ||||||||
4498908-G-T | 4630867-G-T | A12549 | ** | |||||||
4509424-C-T | 4641383-C-T | ** | ||||||||
4512877-T-A | 4644836-T-A | ** | ||||||||
4521891-C-A | 4653850-C-A | ** | ||||||||
4557636-TTTACCAG-T | 4689595-TTTACCAG-T | ** | ||||||||
4567098-C-A | 4699057-C-A | ** | ||||||||
4626125-C-A | 4758084-C-A | ** | ||||||||
4788955-C-A | 4920914-C-A | ** | ||||||||
4871291-C-A | 5003250-C-A | ** | ||||||||
4932772-C-A | 5064731-C-A | ** | ||||||||
5022431-C-A | 5154390-C-A | ** | ||||||||
5110829-C-A | 5242788-C-A | ** | ||||||||
5171581-C-A | 5303540-C-A | ** | ||||||||
5204380-C-T | 5336339-C-T | ** | ||||||||
5231249-C-A | 5363208-C-A | ** | ||||||||
5274158-C-A | 5406117-C-A | ** | ||||||||
5275622-G-T | 5407581-G-T | ** | ||||||||
5420513-C-A | 5552472-C-A | ** | ||||||||
5501013-C-A | 5632972-C-A | ** | ||||||||
5713123-T-C | 5845082-T-C | ** | ||||||||
5715178-C-A | 5847137-C-A | ** | ||||||||
5741873-G-T | 5873832-G-T | ** | ||||||||
5755888-G-T | 5887847-G-T | ** | ||||||||
5761036-A-G | 5892995-A-G | ** | ||||||||
5796680-C-A | 5928639-C-A | ** | ||||||||
6038940-C-A | 6170899-C-A | ** | ||||||||
6096067-C-A | 6228026-C-A | ** | ||||||||
6153222-C-A | 6285181-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6240907-A-ATG | 6372866-A-ATG | IR3_Dst | 12×T | ** | ||||||
6356202-C-A | 6488161-C-A | ** | ||||||||
6414398-C-A | 6546357-C-A | ** | ||||||||
6515953-C-A | 6647912-C-A | ** | ||||||||
6519409-C-A | 6651368-C-A | ** | ||||||||
6615342-G-T | 6747301-G-T | ** | ||||||||
6626824-C-A | 6758783-C-A | ** | ||||||||
6651514-G-A | 6783473-G-A | ** | ||||||||
6776396-C-A | 6908355-C-A | ** | ||||||||
6795312-C-A | 6927271-C-A | ** | ||||||||
6977528-C-A | 7109487-C-A | ** | ||||||||
7084487-C-A | 7216446-C-A | ** | ||||||||
7091185-C-A | 7223144-C-A | ** | ||||||||
7093310-C-A | 7225269-C-A | ** | ||||||||
7128281-C-A | 7260240-C-A | ** | ||||||||
7138980-G-C | 7270939-G-C | ** | ||||||||
7143425-C-A | 7275384-C-A | ** | ||||||||
7160542-C-A | 7292501-C-A | ** | ||||||||
7201537-G-C | 7333496-G-C | ** | ||||||||
7225601-C-A | 7357560-C-A | ** | ||||||||
7258988-C-A | 7390947-C-A | ** | ||||||||
7286908-C-A | 7418867-C-A | ** | ||||||||
7333101-C-A | 7465060-C-A | ** | ||||||||
7337430-C-A | 7469389-C-A | ** | ||||||||
7340383-G-T | 7472342-G-T | ** | ||||||||
7340393-G-T | 7472352-G-T | ** | ||||||||
7425190-C-A | 7557149-C-A | ** | ||||||||
7646572-C-A | 7778531-C-A | ** | ||||||||
7664376-C-A | 7796335-C-A | ** | ||||||||
7885443-C-A | 8017402-C-A | ** | ||||||||
7898779-C-A | 8030738-C-A | ** | ||||||||
7918349-AG-A | 8050308-AG-A | ** | ||||||||
8052462-C-A | 8184421-C-A | BY530 | ** | |||||||
8078543-G-T | 8210502-G-T | ** | ||||||||
8079312-C-A | 8211271-C-A | A12548 | ** | |||||||
8235658-G-T | 8367617-G-T | ** | ||||||||
8343020-C-A | 8474979-C-A | ** | ||||||||
8385323-C-A | 8517282-C-A | ** | ||||||||
8408419-C-A | 8540378-C-A | ** | ||||||||
8799610-C-A | 8931569-C-A | ** | ||||||||
8980043-G-T | 9142434-G-T | ** | ||||||||
9015436-C-A | 9177827-C-A | ** | ||||||||
9223107-C-A | 9385498-C-A | ** | ||||||||
9428281-G-T | 9590672-G-T | ** | ||||||||
9499190-C-A | 9661581-C-A | ** | ||||||||
9799280-C-A | 9961671-C-A | ** | ||||||||
9826172-C-A | 9988563-C-A | ** | ||||||||
9945003-G-A | 10107394-G-A | ** | ||||||||
9947665-T-C | 10110056-T-C | ** | ||||||||
9953247-C-A | 10115638-C-A | ** | ||||||||
10015020-G-A | 10177411-G-A | ** | ||||||||
10628013-C-A | ** | |||||||||
10667000-ATTC-A | ** | |||||||||
10668931-C-A | ** | |||||||||
10671882-C-A | ** | |||||||||
10678073-T-G | ** | |||||||||
10678078-A-G | ** | |||||||||
10678099-C-T | ** | |||||||||
10678101-C-T | ** | |||||||||
10754625-C-A | ** | |||||||||
10758904-C-A | ** | |||||||||
10764552-C-CTT | ** | |||||||||
10766250-C-A | ** | |||||||||
10785214-A-C | ** | |||||||||
10785966-T-C | ** | |||||||||
10789336-A-G | ** | |||||||||
10789764-C-A | ** | |||||||||
10792385-C-A | ** | |||||||||
10792939-G-T | ** | |||||||||
10793062-T-C | ** | |||||||||
10796684-T-TTGCAACCGAGTTGAA | ** | |||||||||
10804469-C-A | ** | |||||||||
10835591-C-A | ** | |||||||||
10848836-C-A | ** | |||||||||
10894783-C-A | ** | |||||||||
10914603-G-C | ** | |||||||||
10927327-C-A | ** | |||||||||
10934276-C-T | ** | |||||||||
10946797-C-A | ** | |||||||||
10959209-TCCACTGC-T | ** | |||||||||
10963000-C-G | ** | |||||||||
10964731-C-A | ** | |||||||||
10973920-C-T | ** | |||||||||
10982882-A-T | ** | |||||||||
10984134-T-C | ** | |||||||||
10987403-C-CCATTA | ** | |||||||||
10992980-A-AT | ** | |||||||||
10992985-A-C | ** | |||||||||
10993042-T-G | ** | |||||||||
10998966-C-A | ** | |||||||||
10999014-C-A | ** | |||||||||
11007607-C-A | ** | |||||||||
13209621-C-A | 11053945-C-A | ** | ||||||||
13223801-G-A | 11068125-G-A | ** | ||||||||
13258340-C-A | 11102664-C-A | FT441977 | ** | |||||||
13394891-T-C | 11239215-T-C | ** | ||||||||
13469393-C-A | 11313717-C-A | ** | ||||||||
13480618-G-T | 11324942-G-T | ** | ||||||||
13538224-T-TC | 11382548-T-TC | ** | ||||||||
13538238-TCAC-T | 11382562-TCAC-T | ** | ||||||||
13538243-C-T | 11382567-C-T | ** | ||||||||
13553372-C-A | 11397696-C-A | ** | ||||||||
13596353-G-T | 11440677-G-T | ** | ||||||||
13602563-C-A | 11446887-C-A | ** | ||||||||
13700575-T-C | 11544899-T-C | ** | ||||||||
11649613-G-T | ** | |||||||||
11655422-G-T | ** | |||||||||
11655567-C-A | ** | |||||||||
11659036-G-T | ** | |||||||||
13859254-G-T | 11738548-G-T | ** | ||||||||
13860647-C-A | 11739941-C-A | ** | ||||||||
13888506-G-T | 11767800-G-T | ** | ||||||||
13892855-T-G | 11772149-T-G | ** | ||||||||
13894314-C-A | 11773608-C-A | ** | ||||||||
13910758-G-T | 11790052-G-T | ** | ||||||||
13970424-A-T | 11849718-A-T | ** | ||||||||
14073150-C-A | 11952444-C-A | ** | ||||||||
14077905-C-A | 11957199-C-A | ** | ||||||||
14132463-C-A | 12011757-C-A | ** | ||||||||
14153102-C-A | 12032396-C-A | ** | ||||||||
14167698-C-G | 12046992-C-G | ** | ||||||||
14183169-C-A | 12062463-C-A | ** | ||||||||
14214899-C-A | 12094193-C-A | ** | ||||||||
14285952-C-A | 12165246-C-A | ** | ||||||||
14347913-C-A | 12227208-C-A | 8×T | ** | |||||||
14361748-C-A | 12241043-C-A | ** | ||||||||
14366633-C-A | 12245928-C-A | ** | ||||||||
14402512-C-A | 12281809-C-A | ** | ||||||||
14450526-C-A | 12329799-C-A | ** | ||||||||
14458364-C-A | 12337637-C-A | ** | ||||||||
14468227-G-T | 12347496-G-T | ** | ||||||||
14492683-G-T | 12380880-G-T | ** | ||||||||
14500220-C-A | 12388425-C-A | ** | ||||||||
14501919-C-CA | 12390124-C-CA | ** | ||||||||
14531282-G-A | 12419483-G-A | ** | ||||||||
14539495-C-A | 12427696-C-A | ** | ||||||||
14544244-G-T | 12432445-G-T | ** | ||||||||
14560537-C-A | 12448738-C-A | ** | ||||||||
14571175-G-A | 12459375-G-A | ** | ||||||||
14599045-G-T | 12487245-G-T | ** | ||||||||
14675843-G-T | 12563909-G-T | ** | ||||||||
14714823-G-T | 12602890-G-T | ** | ||||||||
14719981-G-T | 12608049-G-T | ** | ||||||||
14720397-C-A | 12608465-C-A | ** | ||||||||
14785596-C-A | 12673666-C-A | ** | ||||||||
14908327-C-A | 12796394-C-A | ** | ||||||||
15126204-A-G | 13014291-A-G | ** | ||||||||
15172690-C-A | 13060776-C-A | ** | ||||||||
15221303-C-A | 13109389-C-A | ** | ||||||||
15410632-TCAAAAAA-T | 13298752-TCAAAAAA-T | ** | ||||||||
15495334-C-A | 13383454-C-A | ** | ||||||||
15533039-C-A | 13421159-C-A | ** | ||||||||
15541669-C-A | 13429789-C-A | FT251782 | ** | |||||||
15556891-C-A | 13445011-C-A | ** | ||||||||
15644931-G-T | 13533051-G-T | ** | ||||||||
15655041-C-A | 13543161-C-A | ** | ||||||||
15699716-C-A | 13587836-C-A | ** | ||||||||
15769480-C-A | 13657600-C-A | ** | ||||||||
15775494-T-C | 13663614-T-C | ** | ||||||||
15841846-T-C | 13729966-T-C | ** | ||||||||
15841864-G-A | 13729984-G-A | ** | ||||||||
15842766-C-A | 13730886-C-A | ** | ||||||||
15871671-C-A | 13759791-C-A | ** | ||||||||
15946598-C-A | 13834718-C-A | ** | ||||||||
15985734-C-A | 13873854-C-A | ** | ||||||||
16000829-T-C | 13888949-T-C | ** | ||||||||
16015907-C-A | 13904027-C-A | ** | ||||||||
16044455-C-A | 13932575-C-A | ** | ||||||||
16084305-C-A | 13972425-C-A | ** | ||||||||
16274121-C-A | 14162241-C-A | ** | ||||||||
16344645-C-A | 14232765-C-A | ** | ||||||||
16507104-C-A | 14395224-C-A | ** | ||||||||
16701517-T-C | 14589637-T-C | ** | ||||||||
16823890-C-A | 14712010-C-A | ** | ||||||||
17175402-G-T | 15063522-G-T | ** | ||||||||
17217326-C-A | 15105446-C-A | ** | ||||||||
17277229-C-T | 15165349-C-T | ** | ||||||||
17313486-C-A | 15201606-C-A | ** | ||||||||
17355585-G-T | 15243705-G-T | ** | ||||||||
17371235-C-A | 15259355-C-A | ** | ||||||||
17379515-G-T | 15267635-G-T | ** | ||||||||
17480191-C-A | 15368311-C-A | ** | ||||||||
17481205-C-A | 15369325-C-A | ** | ||||||||
17489791-C-A | 15377911-C-A | ** | ||||||||
17504750-C-A | 15392870-C-A | ** | ||||||||
17504818-G-A | 15392938-G-A | ** | ||||||||
17547578-G-A | 15435698-G-A | ** | ||||||||
17568480-C-T | 15456600-C-T | ** | ||||||||
17597888-C-A | 15486008-C-A | ** | ||||||||
17648353-C-A | 15536473-C-A | ** | ||||||||
17676395-C-A | 15564515-C-A | ** | ||||||||
17707221-C-CA | 15595341-C-CA | ** | ||||||||
17730547-A-C | 15618667-A-C | ** | ||||||||
17832482-A-C | 15720602-A-C | ** | ||||||||
18050420-C-A | 15938540-C-A | ** | ||||||||
18101984-T-A | 15990104-T-A | ** | ||||||||
18165572-C-A | 16053692-C-A | ** | ||||||||
18165594-C-A | 16053714-C-A | ** | ||||||||
18472709-G-T | 16360829-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
18796211-C-A | 16684331-C-A | ** | ||||||||
18847500-C-A | 16735620-C-A | ** | ||||||||
18948065-G-T | 16836185-G-T | ** | ||||||||
18964119-C-A | 16852239-C-A | ** | ||||||||
18969715-G-A | 16857835-G-A | ** | ||||||||
18976266-T-C | 16864386-T-C | ** | ||||||||
19014445-C-T | 16902565-C-T | ** | ||||||||
19053298-C-T | 16941418-C-T | ** | ||||||||
19075265-C-A | 16963385-C-A | ** | ||||||||
19075617-C-A | 16963737-C-A | ** | ||||||||
19126427-C-A | 17014547-C-A | ** | ||||||||
19168561-C-A | 17056681-C-A | ** | ||||||||
19206586-C-A | 17094706-C-A | ** | ||||||||
19216308-C-A | 17104428-C-A | ** | ||||||||
19246620-C-A | 17134740-C-A | ** | ||||||||
19299156-T-C | 17187276-T-C | ** | ||||||||
19353448-T-C | 17241568-T-C | ** | ||||||||
19407607-T-C | 17295727-T-C | ** | ||||||||
19415553-C-A | 17303673-C-A | ** | ||||||||
19437939-G-T | 17326059-G-T | ** | ||||||||
19496264-C-A | 17384384-C-A | ** | ||||||||
19537919-G-GA | 17426039-G-GA | ** | ||||||||
19537954-CA-C | 17426074-CA-C | ** | ||||||||
20229557-TACAC-T | 18067671-TACAC-T | P5_Dst | 18×AC | ** | ||||||
20229600-G-A | 18067714-G-A | P5_Dst | ** | |||||||
20229603-A-C | 18067717-A-C | P5_Dst | ** | |||||||
20426076-AAAAAG-A | 18264190-AAAAAG-A | P5_Dst | ** | |||||||
20654983-TA-T | 18493097-TA-T | P4_Prx | ** | |||||||
20773381-T-C | 18611495-T-C | P4_Prx | ** | |||||||
20825612-C-A | 18663726-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
21092260-C-A | 18930374-C-A | ** | ||||||||
21096358-C-A | 18934472-C-A | ** | ||||||||
21133480-C-T | 18971594-C-T | ** | ||||||||
21267934-C-A | 19106048-C-A | ** | ||||||||
21328680-C-A | 19166794-C-A | ** | ||||||||
21408453-ACACAG-A | 19246567-ACACAG-A | ** | ||||||||
21417156-G-A | 19255270-G-A | ** | ||||||||
21495545-C-A | 19333659-C-A | ** | ||||||||
21588045-G-T | 19426159-G-T | ** | ||||||||
21949015-C-T | 19787129-C-T | ** | ||||||||
21963806-A-G | 19801920-A-G | ** | ||||||||
22055384-C-T | 19893498-C-T | ** | ||||||||
22077337-C-T | 19915451-C-T | ** | ||||||||
22166608-C-A | 20004722-C-A | ** | ||||||||
22205555-C-A | 20043669-C-A | ** | ||||||||
22211484-C-A | 20049598-C-A | ** | ||||||||
22303548-C-A | 20141662-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22419772-C-G | 20257886-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
22530180-G-T | 20368294-G-T | ** | ||||||||
22625032-C-A | 20463146-C-A | ** | ||||||||
22765661-C-A | 20603775-C-A | ** | ||||||||
22808989-C-A | 20647103-C-A | ** | ||||||||
22868997-C-A | 20707111-C-A | ** | ||||||||
22877440-C-A | 20715554-C-A | ** | ||||||||
22914540-C-A | 20752654-C-A | ** | ||||||||
22972723-C-T | 20810837-C-T | ** | ||||||||
22988832-C-A | 20826946-C-A | ** | ||||||||
23143914-T-C | 20982028-T-C | ** | ||||||||
23185266-G-T | 21023380-G-T | ** | ||||||||
23339756-G-T | 21177870-G-T | A12550 | ** | |||||||
23441465-C-A | 21279579-C-A | ** | ||||||||
23455053-ATTT-A | 21293167-ATTT-A | 14×T | ** | |||||||
23579353-G-T | 21417467-G-T | ** | ||||||||
23789548-C-A | 21627662-C-A | ** | ||||||||
23997601-G-T | 21851454-G-T | ** | ||||||||
24016986-C-CTCT | 21870839-C-CTCT | 15×T | ** | |||||||
24245491-G-A | 22099344-G-A | P3_b1 | ** | |||||||
24310306-C-T | 22164159-C-T | P3_t1 | 8×AT | ** | ||||||
24404369-C-A | 22258222-C-A | ** | ||||||||
25727839-C-A | 23581692-C-A | P1_b3 | ** | |||||||
25983814-A-G | 23837667-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26292535-C-A | 24146388-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26345790-C-A | 24199643-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26377870-A-G | 24231723-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26440654-G-T | 24294507-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
27507475-A-G | 25361328-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
27523264-C-A | 25377117-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27633656-G-T | 25487509-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27701879-C-A | 25555732-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27808525-G-T | 25662378-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27883194-C-A | 25737047-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28402155-C-A | 26256008-C-A | P1_gr2 | ** | |||||||
28464184-C-A | 26318037-C-A | ** | ||||||||
28468746-C-A | 26322599-C-A | ** | ||||||||
28521904-C-A | 26375757-C-A | ** | ||||||||
28534584-C-A | 26388437-C-A | ** | ||||||||
28558631-C-A | 26412484-C-A | ** | ||||||||
28581651-A-G | 26435504-A-G | ** | ||||||||
28582048-T-C | 26435901-T-C | ** | ||||||||
28607715-C-A | 26461568-C-A | ** | ||||||||
28660522-C-T | 26514375-C-T | ** | ||||||||
28716345-C-A | 26570198-C-A | ** | ||||||||
28727633-C-A | 26581486-C-A | ** | ||||||||
28732846-G-T | 26586699-G-T | ** | ||||||||
28761382-C-CA | 26615235-C-CA | 31×A | ** | |||||||
28772012-C-A | 26625865-C-A | ** | ||||||||
56824753-G-T | ** | |||||||||
56832978-C-A | ** | |||||||||
56836581-C-A | ** | |||||||||
56839727-C-T | ** | |||||||||
56839906-C-A | ** | |||||||||
56848562-G-T | ** | |||||||||
56850353-A-C | ** | |||||||||
56870816-C-A | ** | |||||||||
28602147-C-CA | 26456000-C-CA | 13×A | ** | |||||||
27216705-G-A | 25070558-G-A | P1_g3 | ** | |||||||
13453170-A-ATTGAG | 11297494-A-ATTGAG | ** | ||||||||
27525243-CTTTT-C | 25379096-CTTTT-C | P1_Y2 | 27×T | ** | ||||||
6314947-T-G | 6446906-T-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6747432-G-T | 6879391-G-T | ** | ||||||||
9361106-A-G | 9523497-A-G | ** | ||||||||
13480304-A-T | 11324628-A-T | ** | ||||||||
19505378-A-AAT | 17393498-A-AAT | ** | ||||||||
19839943-T-C | 17728063-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
19932198-T-A | 17820318-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
22085078-T-C | 19923192-T-C | ** | ||||||||
22287601-T-C | 20125715-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22287605-G-A | 20125719-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
22508041-A-G | 20346155-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
26374557-G-T | 24228410-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
28619201-GGT-G | 26473054-GGT-G | ** | ||||||||
56714055-T-G | ** | |||||||||
56714094-A-ATCTT | ** | |||||||||
56864590-C-T | ** | |||||||||
22304514-A-T | 20142628-A-T | DYZ19 | *** | |||||||
10036805-C-T | 10199196-C-T | *** | ||||||||
18125767-A-G | 16013887-A-G | BY17384 | *** | |||||||
23300266-GA-G | 21138380-GA-G | 10×A | *** | |||||||
22902108-C-A | 20740222-C-A | 17×A | *** | |||||||
19522542-C-A | 17410662-C-A | *** | ||||||||
22304558-C-T | 20142672-C-T | DYZ19 | *** | |||||||
25207926-T-C | 23061779-T-C | BY16762 | P2_r1 | *** | ||||||
25776140-T-C | 23629993-T-C | P1_b3 | *** | |||||||
15358761-GAA-G | 13246880-GAAA-G | 26×A | *** | |||||||
21238028-C-A | 19076142-C-A | *** | ||||||||
8913448-G-T | 9045407-G-T | *** | ||||||||
14109332-A-T | 11988626-A-T | *** | ||||||||
22929693-GAA-G | 20767807-GAA-G | 14×A | *** | |||||||
9959845-AAAT-A | 10122236-AAAT-A | 6×AAT | *** | |||||||
56833457-C-A | *** | |||||||||
10926621-C-T | *** | |||||||||
5785700-AC-A | 5917659-AC-A | *** | ||||||||
11014481-C-T | *** | |||||||||
7896717-C-A | 8028676-C-A | *** | ||||||||
11643677-C-A,T | *** | |||||||||
6697258-C-A | 6829217-C-A | *** | ||||||||
7197570-ATT-A,AT | 7329529-ATT-A,AT | 19×T | *** | |||||||
10032101-C-A | 10194492-C-A | *** | ||||||||
10671004-TC-T | *** | |||||||||
10677425-C-A | *** | |||||||||
10747000-T-TGG | *** | |||||||||
10747001-TCC-T | *** | |||||||||
10766442-C-A | *** | |||||||||
10789337-T-TTCCGTTCTGC | *** | |||||||||
10789409-C-G | *** | |||||||||
10789412-T-TTCCCC | *** | |||||||||
10789431-C-T | *** | |||||||||
10926613-GGTA-G,GGCA | *** | |||||||||
10926701-TC-T | *** | |||||||||
10967333-G-T | *** | |||||||||
13477776-C-A | 11322100-C-A | *** | ||||||||
13478624-T-C | 11322948-T-C | *** | ||||||||
11659281-G-A | *** | |||||||||
13857596-G-T | 11736890-G-T | *** | ||||||||
14072977-G-A | 11952271-G-A | *** | ||||||||
14610548-C-A | 12498750-C-A | *** | ||||||||
15474833-G-A | 13362953-G-A | *** | ||||||||
15745567-G-T | 13633687-G-T | *** | ||||||||
15863238-C-A | 13751358-C-A | *** | ||||||||
16351983-G-T | 14240103-G-T | FGC52745 | *** | |||||||
17527396-G-GTA | 15415516-G-GTA | *** | ||||||||
17576268-C-A | 15464388-C-A | *** | ||||||||
19035837-A-AC | 16923957-A-AC | *** | ||||||||
21238043-C-A | 19076157-C-A | *** | ||||||||
23187686-C-A | 21025800-C-A | *** | ||||||||
28497323-C-A | 26351176-C-A | *** | ||||||||
56827251-C-A | *** | |||||||||
56830812-C-A | *** | |||||||||
56839591-C-A | *** | |||||||||
21766728-G-GA | 19604842-G-GA | 9×A | *** | |||||||
8056252-A-G | 8188211-A-G | *** | ||||||||
5209997-CAAA-C | 5341956-CAAA-C | 16×A | *** | |||||||
4735176-G-C | 4867135-G-C | *** | ||||||||
8218069-C-T | 8350028-C-T | *** | ||||||||
10785135-T-C | *** | |||||||||
16973778-A-G | 14861898-A-G | *** | ||||||||
22639670-T-C | 20477784-T-C | *** | ||||||||
24550170-A-G | 22404023-A-G | P3_t2 | *** | |||||||
27263088-G-T | 25116941-G-T | P1_g3 | *** | |||||||
56848095-T-C | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.