Lawton
FTDNA: 274113, BigY2: 27413Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 274113 | BigY2 27413 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
19909884-A-G | 17798004-A-G | P5_Prx | *** | A* | ||||||
7071549-T-C | 7203508-T-C | BY63189 | Y | Y | + | + | ||||
8534240-T-C | 8666199-T-C | BY73764 | Y | Y | + | + | ||||
9406769-G-A | 9569160-G-A | BY79271 | Y | Y | + | + | ||||
14218230-C-T | 12097524-C-T | BY93995 | Y | Y | + | + | ||||
14813318-G-C | 12701389-G-C | BY97737 | Y | Y | + | + | ||||
19079985-T-C | 16968105-T-C | BY126100 | Y | Y | + | + | ||||
19164330-A-T | 17052450-A-T | BY126871 | Y | + | + | |||||
23075192-G-A | 20913306-G-A | BY142823 | Y | Y | + | + | ||||
13469506-A-G | 11313830-A-G | ** | ||||||||
14858924-A-C | 12746990-A-C | ** | ||||||||
19537954-C-A | 17426074-C-A | ** | ||||||||
5221058-C-T | 5353017-C-T | ** | ||||||||
6419046-A-ATG | 6551005-A-ATG | 18×TG | ** | |||||||
17081268-A-T | 14969388-A-T | 9×AT | ** | |||||||
17081288-AAT-A | 14969408-AAT-A | 11×AT | ** | |||||||
17385413-T-A | 15273533-T-A | ** | ||||||||
22215217-C-CTT | 20053331-C-CTT | 17×T | ** | |||||||
13215433-G-A | 11059757-G-A | ** | ||||||||
21054409-C-A | 18892523-C-A | ** | ||||||||
8987706-A-G | 9150097-A-G | M10738 | ** | |||||||
13989061-G-A | 11868355-G-A | ** | ||||||||
3461791-C-A | 3593750-C-A | ** | ||||||||
27499305-T-C | 25353158-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
13971609-G-A | 11850903-G-A | ** | ||||||||
19187600-C-T | 17075720-C-T | ** | ||||||||
21248567-G-A | 19086681-G-A | ** | ** | |||||||
23415308-GTATGTATA-G | 21253422-GTATGTATA-G | ** | ||||||||
28742512-A-ATT | 26596365-A-ATT | 14×T | ** | |||||||
14648743-C-T | 12536808-C-T | S7128 | ** | |||||||
10684247-T-A | ** | |||||||||
10684258-C-T | ** | |||||||||
10684266-C-A | ** | |||||||||
10684282-T-G | ** | |||||||||
10684286-T-C | ** | |||||||||
13705506-G-T | 11549830-G-T | ** | ||||||||
21858259-T-TAA | 19696373-T-TAA | 14×A | ** | |||||||
22011308-T-C | 19849422-T-C | ** | ||||||||
16118600-T-G | 14006720-T-G | P8_Prx | ** | |||||||
17200099-C-T | 15088219-C-T | ** | ||||||||
17200118-A-T | 15088238-A-T | ** | ||||||||
10937434-C-G | ** | |||||||||
16656658-CTTT-C | 14544778-CTTT-C | 14×T | ** | |||||||
3252964-C-A | 3384923-C-A | ** | ||||||||
13962070-TG-T | 11841364-TG-T | ** | ||||||||
13962075-C-A | 11841369-C-A | ** | ||||||||
23633393-G-T | 21471507-G-T | ** | ||||||||
11020879-T-C | ** | |||||||||
10677248-A-G | ** | |||||||||
10763057-A-C | ** | |||||||||
10763065-C-G | ** | |||||||||
10767471-C-A | ** | |||||||||
13512918-T-G | 11357242-T-G | ** | ||||||||
10838355-T-A | ** | |||||||||
5191256-G-T | 5323215-G-T | ** | ||||||||
11025553-C-A | ** | |||||||||
11025559-C-A | ** | |||||||||
15397251-G-T | 13285371-G-T | FT368961 | ** | |||||||
26204665-A-C | 24058518-A-C | P1_Y1 | ** | |||||||
19300729-C-A | 17188849-C-A | ** | ||||||||
11020807-T-C | ** | |||||||||
11020809-C-A | ** | |||||||||
11020852-TGCCAC-T | ** | |||||||||
11020871-A-T | ** | |||||||||
6040608-CA-C | 6172567-CA-C | 10×A | ** | |||||||
10780587-A-C | ** | |||||||||
10995800-A-T | ** | |||||||||
4002431-C-A | 4134390-C-A | ** | ||||||||
9125447-CTTTTTT-C | ** | |||||||||
13229703-C-A | 11074027-C-A | ** | ||||||||
23434314-C-A | 21272428-C-A | ** | ||||||||
6239-T-C | ** | |||||||||
21836574-C-G | 19674688-C-G | FT406247 | ** | |||||||
10944211-C-A | ** | |||||||||
10802392-A-G | ** | |||||||||
19187607-C-T | 17075727-C-T | ** | ||||||||
19187619-C-T | 17075739-C-T | ** | ||||||||
19187624-G-A | 17075744-G-A | ** | ||||||||
10895765-C-A | ** | |||||||||
13485667-C-A | 11329991-C-A | ** | ||||||||
10780588-G-A | ** | |||||||||
10830675-T-TC | ** | |||||||||
10830684-C-A | ** | |||||||||
10830686-A-T | ** | |||||||||
10830719-A-C | ** | |||||||||
10830720-CTTTCT-C | ** | |||||||||
10830730-T-A | ** | |||||||||
10830734-C-A | ** | |||||||||
10830738-C-T | ** | |||||||||
10830745-T-C | ** | |||||||||
10830746-G-A | ** | |||||||||
10684259-T-G | ** | |||||||||
10684196-T-C | ** | |||||||||
23007080-T-A | 20845194-T-A | ** | ||||||||
10907666-C-G | ** | |||||||||
20434788-T-G | 18272902-T-G | P5_Dst | ** | |||||||
9507982-CTTTTT-C | 9670373-CTTTTT-C | 34×T | ** | |||||||
19146602-C-G | 17034722-C-G | ** | ||||||||
23570112-C-A | 21408226-C-A | ** | ||||||||
22011484-C-A | 19849598-C-A | ** | ||||||||
28518822-G-T | 26372675-G-T | ** | ||||||||
10971172-TTCCAC-T | ** | |||||||||
10766152-C-T | ** | |||||||||
13252851-C-A | 11097175-C-A | ** | ||||||||
2974374-C-A | 3106333-C-A | ** | ||||||||
10780529-C-A | ** | |||||||||
10654755-A-C | ** | |||||||||
22011638-C-A | 19849752-C-A | ** | ||||||||
10011087-G-T | 10173478-G-T | ** | ||||||||
14490912-C-A | 12370181-C-A | Y66803 | ** | |||||||
10930064-C-T | ** | |||||||||
10930106-C-A | ** | |||||||||
13938423-C-A | 11817717-C-A | ** | ||||||||
7100987-G-T | 7232946-G-T | ** | ||||||||
4271273-C-A | 4403232-C-A | ** | ||||||||
9962391-C-A | 10124782-C-A | ** | ||||||||
22439789-G-C | 20277903-G-C | DYZ19 | ** | |||||||
10780505-C-T | FT132254 | ** | ||||||||
10780520-T-A | ** | |||||||||
10780533-C-G | ** | |||||||||
10780551-C-G | ** | |||||||||
16039053-C-A | 13927173-C-A | ** | ||||||||
13971609-G-GAGGAAA | 11850903-G-GAGGAAA | ** | ||||||||
18855623-A-T | 16743743-A-T | ** | ||||||||
11653023-C-A | ** | |||||||||
13217364-T-C | 11061688-T-C | ** | ||||||||
3229176-A-G | 3361135-A-G | ** | ||||||||
11024774-G-A | ** | |||||||||
10838331-T-C | ** | |||||||||
10838333-C-G | ** | |||||||||
7334019-C-A | 7465978-C-A | ** | ||||||||
10918309-G-T | ** | |||||||||
16271827-G-A | 14159947-G-A | FT32532 | ** | |||||||
8734349-C-A | 8866308-C-A | ** | ||||||||
11024780-C-G | ** | |||||||||
6465537-CTT-C | 6597496-CTT-C | 11×T | ** | |||||||
23035980-G-GA | 20874094-G-GA | 9×A | ** | |||||||
14786535-G-A | 12674605-G-A | ** | ||||||||
24518265-CA-C | 22372118-CA-C | ** | ||||||||
5937208-A-ATC | 6069167-A-ATC | 17×TC | ** | |||||||
19059744-ATTC-A | 16947864-ATTC-A | ** | ||||||||
7154881-C-A | 7286840-C-A | ** | ||||||||
10988169-C-A | ** | |||||||||
9962084-C-A | 10124475-C-A | ** | ||||||||
27902197-CTTTTT-C | 25756050-CTTTTT-C | P1_Y2 | 34×T | ** | ||||||
3889608-C-A | 4021567-C-A | ** | ||||||||
10980072-C-T | ** | |||||||||
13909304-CAAAA-C | 11788598-CAAAA-C | 18×A | ** | |||||||
5449992-G-T | 5581951-G-T | ** | ||||||||
26355477-C-A | 24209330-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
56847288-C-A | ** | |||||||||
7095128-T-G | 7227087-T-G | ** | ||||||||
5212742-C-A | 5344701-C-A | ** | ||||||||
11020885-C-T | ** | |||||||||
22253232-G-A | 20091346-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
11034117-C-G | ** | |||||||||
10802400-C-A | ** | |||||||||
23819050-C-A | 21657164-C-A | ** | ||||||||
10821877-C-T | ** | |||||||||
10821899-C-CGCTAA | ** | |||||||||
7861209-C-A | 7993168-C-A | ** | ||||||||
56843738-G-T | ** | |||||||||
10925611-T-C | ** | |||||||||
28716265-C-A | 26570118-C-A | ** | ||||||||
7335713-CAAAA-C | 7467672-CAAAA-C | 15×A | ** | |||||||
21677088-C-A | 19515202-C-A | ** | ||||||||
28610260-C-A | 26464113-C-A | ** | ||||||||
10773650-C-A | ** | |||||||||
22340038-A-T | 20178152-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
19252926-G-T | 17141046-G-T | ** | ||||||||
22991217-C-A | 20829331-C-A | FT264859 | ** | |||||||
22489654-C-G | 20327768-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
4133334-C-A | 4265293-C-A | ** | ||||||||
10883916-C-A | FT435462 | ** | ||||||||
22483900-C-A | 20322014-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
19071152-C-A | 16959272-C-A | ** | ||||||||
10676932-G-T | ** | |||||||||
13963332-A-G | 11842626-A-G | ** | ||||||||
14803090-T-C | 12691161-T-C | ** | ||||||||
7428333-T-C | 7560292-T-C | ** | ||||||||
17056753-G-A | 14944873-G-A | ** | ||||||||
18443627-G-T | 16331747-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
13642281-C-A | 11486605-C-A | ** | ||||||||
9123256-G-T | ** | |||||||||
15193490-G-A | 13081576-G-A | ** | ||||||||
14531070-C-A | 12419271-C-A | ** | ||||||||
22011296-T-C | 19849410-T-C | Y12179 | ** | |||||||
23439038-C-T | 21277152-C-T | ** | ||||||||
28780223-A-G | 26634076-A-G | ** | ||||||||
13196514-C-A | 11040838-C-A | ** | ||||||||
11000329-G-T | ** | |||||||||
8481397-A-G | 8613356-A-G | ** | ||||||||
20409511-G-T | 18247625-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
10998408-T-C | ** | |||||||||
13442087-C-A | 11286411-C-A | ** | ||||||||
10765016-TATTCC-T | ** | |||||||||
11001153-C-A | ** | |||||||||
6277750-C-G | 6409709-C-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6355676-G-T | 6487635-G-T | ** | ||||||||
10683692-C-T | ** | |||||||||
2649679-T-A | 2781638-T-A | ** | ||||||||
2708558-C-G | 2840517-C-G | ** | ||||||||
2745791-G-C | 2877750-G-C | ** | ||||||||
2773180-T-A | 2905139-T-A | ** | ||||||||
2795607-C-G | 2927566-C-G | ** | ||||||||
2860074-A-G | 2992033-A-G | ** | ||||||||
2917309-A-G | 3049268-A-G | ** | ||||||||
3007322-A-G | 3139281-A-G | ** | ||||||||
3015590-A-G | 3147549-A-G | ** | ||||||||
3048231-T-A | 3180190-T-A | ** | ||||||||
3094413-C-A | 3226372-C-A | ** | ||||||||
3116488-T-A | 3248447-T-A | ** | ||||||||
3147315-C-G | 3279274-C-G | ** | ||||||||
3165175-G-T | 3297134-G-T | Y81836 | ** | |||||||
3229163-A-G | 3361122-A-G | ** | ||||||||
3287565-CT-C | 3419524-CT-C | ** | ||||||||
3596513-T-G | 3728472-T-G | ** | ||||||||
3627899-G-A | 3759858-G-A | ** | ||||||||
3759514-G-A | 3891473-G-A | ** | ||||||||
3759528-A-G | 3891487-A-G | ** | ||||||||
3790405-C-A | 3922364-C-A | ** | ||||||||
3815146-G-T | 3947105-G-T | ** | ||||||||
3818136-T-C | 3950095-T-C | ** | ||||||||
3851553-T-A | 3983512-T-A | ** | ||||||||
3880849-C-A | 4012808-C-A | ** | ||||||||
3950775-A-G | 4082734-A-G | ** | ||||||||
3950778-A-G | 4082737-A-G | ** | ||||||||
3965115-T-A | 4097074-T-A | ** | ||||||||
4015200-C-A | 4147159-C-A | ** | ||||||||
4048961-C-A | 4180920-C-A | ** | ||||||||
4051267-G-T | 4183226-G-T | ** | ||||||||
4059867-C-A | 4191826-C-A | ** | ||||||||
4133415-T-C | 4265374-T-C | ** | ||||||||
4136361-A-G | 4268320-A-G | ** | ||||||||
4164878-G-T | 4296837-G-T | ** | ||||||||
4353936-T-A | 4485895-T-A | ** | ||||||||
4366499-C-A | 4498458-C-A | ** | ||||||||
4388632-C-T | 4520591-C-T | ** | ||||||||
4444976-G-T | 4576935-G-T | ** | ||||||||
4523698-C-A | 4655657-C-A | ** | ||||||||
4523808-C-G | 4655767-C-G | ** | ||||||||
4533293-T-A | 4665252-T-A | ** | ||||||||
4540703-C-A | 4672662-C-A | ** | ||||||||
4558081-A-G | 4690040-A-G | ** | ||||||||
4561974-G-T | 4693933-G-T | ** | ||||||||
4580422-G-A | 4712381-G-A | ** | ||||||||
4670666-T-C | 4802625-T-C | ** | ||||||||
4670789-G-A | 4802748-G-A | ** | ||||||||
4672277-C-A | 4804236-C-A | ** | ||||||||
4688865-A-T | 4820824-A-T | ** | ||||||||
4733291-C-A | 4865250-C-A | ** | ||||||||
4756026-C-A | 4887985-C-A | ** | ||||||||
4901474-A-G | 5033433-A-G | ** | ||||||||
4918913-C-T | 5050872-C-T | ** | ||||||||
4926277-T-C | 5058236-T-C | ** | ||||||||
4968154-C-A | 5100113-C-A | ** | ||||||||
4968412-T-G | 5100371-T-G | ** | ||||||||
5113765-A-G | 5245724-A-G | ** | ||||||||
5126426-G-T | 5258385-G-T | ** | ||||||||
5171560-A-G | 5303519-A-G | ** | ||||||||
5309581-G-A | 5441540-G-A | ** | ||||||||
5407822-C-A | 5539781-C-A | ** | ||||||||
5419680-T-C | 5551639-T-C | ** | ||||||||
5443270-A-G | 5575229-A-G | ** | ||||||||
5526109-C-A | 5658068-C-A | ** | ||||||||
5537394-C-A | 5669353-C-A | ** | ||||||||
5678561-C-A | 5810520-C-A | ** | ||||||||
5687492-C-A | 5819451-C-A | ** | ||||||||
5688404-A-G | 5820363-A-G | ** | ||||||||
5698687-T-C | 5830646-T-C | ** | ||||||||
5809131-T-A | 5941090-T-A | ** | ||||||||
5817836-G-C | 5949795-G-C | ** | ||||||||
5873563-G-T | 6005522-G-T | ** | ||||||||
5873590-A-G | 6005549-A-G | ** | ||||||||
5882544-G-T | 6014503-G-T | ** | ||||||||
5882689-T-C | 6014648-T-C | ** | ||||||||
5887640-G-A | 6019599-G-A | ** | ||||||||
5910180-C-A | 6042139-C-A | ** | ||||||||
5968315-C-A | 6100274-C-A | ** | ||||||||
6003156-G-T | 6135115-G-T | ** | ||||||||
6039825-A-G | 6171784-A-G | ** | ||||||||
6072590-C-A | 6204549-C-A | ** | ||||||||
6072630-T-C | 6204589-T-C | ** | ||||||||
6091287-C-T | 6223246-C-T | ** | ||||||||
6096286-G-A | 6228245-G-A | ** | ||||||||
6224874-C-A | 6356833-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6330132-A-G | 6462091-A-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6368023-C-A | 6499982-C-A | ** | ||||||||
6405972-C-A | 6537931-C-A | ** | ||||||||
6441135-C-A | 6573094-C-A | ** | ||||||||
6461646-A-G | 6593605-A-G | ** | ||||||||
6490608-A-T | 6622567-A-T | ** | ||||||||
6516841-C-A | 6648800-C-A | ** | ||||||||
6540940-C-A | 6672899-C-A | ** | ||||||||
6614790-G-T | 6746749-G-T | ** | ||||||||
6666256-C-G | 6798215-C-G | ** | ||||||||
6671697-C-A | 6803656-C-A | ** | ||||||||
6874686-A-T | 7006645-A-T | ** | ||||||||
6891987-G-A | 7023946-G-A | ** | ||||||||
7013515-T-G | 7145474-T-G | ** | ||||||||
7013524-A-G | 7145483-A-G | ** | ||||||||
7030928-T-G | 7162887-T-G | ** | ||||||||
7042663-C-A | 7174622-C-A | ** | ||||||||
7109503-C-A | 7241462-C-A | ** | ||||||||
7110642-C-A | 7242601-C-A | ** | ||||||||
7138397-C-A | 7270356-C-A | ** | ||||||||
7186313-T-C | 7318272-T-C | ** | ||||||||
7186475-A-C | 7318434-A-C | ** | ||||||||
7197427-C-G | 7329386-C-G | ** | ||||||||
7235372-A-T | 7367331-A-T | ** | ||||||||
7252390-AAC-A | 7384349-AAC-A | ** | ||||||||
7254974-C-A | 7386933-C-A | ** | ||||||||
7258881-A-G | 7390840-A-G | ** | ||||||||
7277490-C-A | 7409449-C-A | ** | ||||||||
7360546-C-G | 7492505-C-G | ** | ||||||||
7381298-G-C | 7513257-G-C | ** | ||||||||
7381354-T-A | 7513313-T-A | ** | ||||||||
7420700-T-G | 7552659-T-G | ** | ||||||||
7579068-C-A | 7711027-C-A | ** | ||||||||
7753519-G-A | 7885478-G-A | FGC56171 | ** | |||||||
7755118-C-A | 7887077-C-A | ** | ||||||||
7864250-C-T | 7996209-C-T | ** | ||||||||
7873868-A-AT | 8005827-A-AT | ** | ||||||||
7897079-T-G | 8029038-T-G | ** | ||||||||
7991024-C-A | 8122983-C-A | ** | ||||||||
8052380-T-A | 8184339-T-A | ** | ||||||||
8058341-C-A | 8190300-C-A | ** | ||||||||
8074204-G-A | 8206163-G-A | ** | ||||||||
8481330-A-G | 8613289-A-G | ** | ||||||||
8481386-T-G | 8613345-T-G | ** | ||||||||
8481957-C-A | 8613916-C-A | FT303909 | ** | |||||||
8712214-G-C | 8844173-G-C | FTA22115 | ** | |||||||
9116869-G-T | 9279260-G-T | ** | ||||||||
9499221-C-G | 9661612-C-G | ** | ||||||||
9664404-C-A | 9826795-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9934939-A-G | 10097330-A-G | ** | ||||||||
9938875-C-A | 10101266-C-A | ** | ||||||||
9953050-C-G | 10115441-C-G | ** | ||||||||
9987678-T-C | 10150069-T-C | ** | ||||||||
10018065-T-C | 10180456-T-C | ** | ||||||||
10022959-C-A | 10185350-C-A | ** | ||||||||
10094307-C-A | 10256698-C-A | ** | ||||||||
10651685-C-G | ** | |||||||||
10654231-C-T | ** | |||||||||
10664284-C-A | ** | |||||||||
10664597-T-A | ** | |||||||||
10673139-C-T | ** | |||||||||
10683429-C-A | ** | |||||||||
10683711-G-A | ** | |||||||||
10757130-C-T | ** | |||||||||
10757312-T-G | ** | |||||||||
10763087-A-ACTCAT | ** | |||||||||
10765596-C-T | FT91653 | ** | ||||||||
10766162-T-C | ** | |||||||||
10766166-T-G | ** | |||||||||
10766181-T-A | ** | |||||||||
10766185-C-A | ** | |||||||||
10773633-T-C | ** | |||||||||
10785835-C-A | ** | |||||||||
10789739-T-G | ** | |||||||||
10801554-C-A | ** | |||||||||
10825093-T-A | ** | |||||||||
10827604-C-A | ** | |||||||||
10835619-G-T | ** | |||||||||
10838346-A-T | ** | |||||||||
10861557-C-A | FT434453 | ** | ||||||||
10867172-C-A | ** | |||||||||
10867327-C-A | ** | |||||||||
10868812-C-G | ** | |||||||||
10878073-T-A | ** | |||||||||
10883821-A-C | ** | |||||||||
10883851-A-C | ** | |||||||||
10889393-C-T | ** | |||||||||
10902276-C-G | ** | |||||||||
10912012-A-G | ** | |||||||||
10912013-C-G | ** | |||||||||
10917669-G-T | ** | |||||||||
10924231-T-A | ** | |||||||||
10926240-C-G | ** | |||||||||
10926439-T-A | ** | |||||||||
10932515-C-CTTTG | ** | |||||||||
10940170-T-C | ** | |||||||||
10943242-C-A | ** | |||||||||
10956593-C-CTT | ** | |||||||||
10956594-CAT-C | ** | |||||||||
10967753-C-A | ** | |||||||||
10977865-C-A | ** | |||||||||
10987519-C-T | ** | |||||||||
10992254-T-C | ** | |||||||||
10998421-C-A | ** | |||||||||
10998423-T-C | ** | |||||||||
11000101-C-A | ** | |||||||||
11001301-C-A | ** | |||||||||
11022533-C-A | ** | |||||||||
11034191-T-G | ** | |||||||||
13196802-A-G | 11041126-A-G | ** | ||||||||
13199037-C-A | 11043361-C-A | ** | ||||||||
13226236-T-C | 11070560-T-C | FT441289 | ** | |||||||
13252868-C-A | 11097192-C-A | ** | ||||||||
13289365-C-A | 11133689-C-A | ** | ||||||||
13296039-A-G | 11140363-A-G | ** | ||||||||
13320641-C-A | 11164965-C-A | ** | ||||||||
13322515-A-G | 11166839-A-G | ** | ||||||||
13358997-G-A | 11203321-G-A | ** | ||||||||
13421706-C-A | 11266030-C-A | ** | ||||||||
13442457-T-C | 11286781-T-C | ** | ||||||||
13469557-C-T | 11313881-C-T | ** | ||||||||
13486651-G-T | 11330975-G-T | ** | ||||||||
13496820-T-C | 11341144-T-C | ** | ||||||||
13516728-C-A | 11361052-C-A | ** | ||||||||
13528902-A-G | 11373226-A-G | ** | ||||||||
13544865-C-A | 11389189-C-A | ** | ||||||||
13605803-T-C | 11450127-T-C | ** | ||||||||
13617557-C-T | 11461881-C-T | ** | ||||||||
13633840-A-G | 11478164-A-G | FT220044 | ** | |||||||
11648662-G-T | FT450077 | ** | ||||||||
11648663-G-CTGATGCATC | ** | |||||||||
11648665-A-C | ** | |||||||||
11652968-A-T | ** | |||||||||
11652969-G-A | ** | |||||||||
11652974-G-A | ** | |||||||||
11652994-G-T | ** | |||||||||
11653007-A-C | ** | |||||||||
11653009-C-G | ** | |||||||||
11659093-A-T | ** | |||||||||
11659438-C-A | ** | |||||||||
11670840-A-G | ** | |||||||||
11671085-T-A | ** | |||||||||
13888797-A-G | 11768091-A-G | ** | ||||||||
13925149-A-G | 11804443-A-G | ** | ||||||||
13938395-C-A | 11817689-C-A | ** | ||||||||
13939831-A-C | 11819125-A-C | ** | ||||||||
13993601-C-T | 11872895-C-T | ** | ||||||||
14032430-C-A | 11911724-C-A | ** | ||||||||
14059401-T-G | 11938695-T-G | ** | ||||||||
14107014-G-C | 11986308-G-C | ** | ||||||||
14107083-A-G | 11986377-A-G | ** | ||||||||
14159735-T-G | 12039029-T-G | ** | ||||||||
14159774-C-T | 12039068-C-T | FT253494 | ** | |||||||
14225308-A-G | 12104602-A-G | ** | ||||||||
14247382-A-G | 12126676-A-G | ** | ||||||||
14253128-A-G | 12132422-A-G | ** | ||||||||
14295272-T-C | 12174566-T-C | ** | ||||||||
14295401-C-T | 12174695-C-T | ** | ||||||||
14352324-C-A | 12231619-C-A | ** | ||||||||
14371338-G-A | 12250634-G-A | ** | ||||||||
14422607-T-A | 12301882-T-A | ** | ||||||||
14427178-A-T | 12306453-A-T | ** | ||||||||
14431262-T-C | 12310535-T-C | ** | ||||||||
14463551-G-A | 12342824-G-A | ** | ||||||||
14546781-A-G | 12434982-A-G | ** | ||||||||
14584781-C-A | 12472981-C-A | ** | ||||||||
14586151-G-T | 12474351-G-T | ** | ||||||||
14620601-C-A | 12508799-C-A | ** | ||||||||
14725235-C-A | 12613303-C-A | ** | ||||||||
14786530-T-C | 12674600-T-C | ** | ||||||||
14858874-A-C | 12746940-A-C | ** | ||||||||
14908475-C-A | 12796542-C-A | ** | ||||||||
14933545-C-A | 12821610-C-A | ** | ||||||||
14988834-G-A | 12876900-G-A | FT81936 | ** | |||||||
15012733-C-A | 12900821-C-A | ** | ||||||||
15045554-C-A | 12933644-C-A | ** | ||||||||
15060719-C-T | 12948811-C-T | ** | ||||||||
15098167-T-C | 12986255-T-C | ** | ||||||||
15109626-C-A | 12997713-C-A | ** | ||||||||
15193486-G-T | 13081572-G-T | ** | ||||||||
15193489-T-C | 13081575-T-C | ** | ||||||||
15193512-C-T | 13081598-C-T | ** | ||||||||
15218610-G-C | 13106696-G-C | ** | ||||||||
15278947-C-T | 13167046-C-T | ** | ||||||||
15284373-G-T | 13172472-G-T | ** | ||||||||
15332374-A-G | 13220492-A-G | ** | ||||||||
15557999-A-G | 13446119-A-G | ** | ||||||||
15643028-T-A | 13531148-T-A | ** | ||||||||
15653424-A-T | 13541544-A-T | ** | ||||||||
15686724-TG-T | 13574844-TG-T | ** | ||||||||
15687814-A-T | 13575934-A-T | ** | ||||||||
15699116-A-G | 13587236-A-G | ** | ||||||||
15769422-T-G | 13657542-T-G | ** | ||||||||
15823910-C-T | 13712030-C-T | ** | ||||||||
15842951-A-C | 13731071-A-C | ** | ||||||||
15842977-T-C | 13731097-T-C | ** | ||||||||
15842989-A-C | 13731109-A-C | ** | ||||||||
15843003-A-C | 13731123-A-C | ** | ||||||||
15919682-G-C | 13807802-G-C | ** | ||||||||
16021526-G-C | 13909646-G-C | ** | ||||||||
16046955-T-G | 13935075-T-G | ** | ||||||||
16055991-C-A | 13944111-C-A | ** | ||||||||
16091110-C-A | 13979230-C-A | ** | ||||||||
16148184-T-C | 14036304-T-C | P8_Dst | ** | |||||||
16240974-A-C | 14129094-A-C | ** | ||||||||
16241039-C-T | 14129159-C-T | ** | ||||||||
16241060-G-C | 14129180-G-C | ** | ||||||||
16244844-C-T | 14132964-C-T | ** | ||||||||
16270612-C-A | 14158732-C-A | ** | ||||||||
16271828-G-GC | 14159948-G-GC | ** | ||||||||
16395099-C-A | 14283219-C-A | ** | ||||||||
16424653-G-A | 14312773-G-A | ** | ||||||||
16428105-CT-C | 14316225-CT-C | ** | ||||||||
16429069-G-T | 14317189-G-T | ** | ||||||||
16430135-CA-C | 14318255-CA-C | ** | ||||||||
16465013-T-C | 14353133-T-C | ** | ||||||||
16466904-G-A | 14355024-G-A | ** | ||||||||
16467528-C-A | 14355648-C-A | A15579 | ** | |||||||
16540319-C-T | 14428439-C-T | ** | ||||||||
16551110-C-A | 14439230-C-A | ** | ||||||||
16662620-G-C | 14550740-G-C | ** | ||||||||
16704835-G-A | 14592955-G-A | ** | ||||||||
16707901-T-A | 14596021-T-A | ** | ||||||||
16904658-TG-T | 14792778-TG-T | ** | ||||||||
16972385-G-C | 14860505-G-C | ** | ||||||||
16989271-C-A | 14877391-C-A | ** | ||||||||
17036790-T-G | 14924910-T-G | ** | ||||||||
17038979-A-G | 14927099-A-G | Z36126 | ** | |||||||
17066152-A-C | 14954272-A-C | ** | ||||||||
17159419-C-A | 15047539-C-A | ** | ||||||||
17200108-C-T | 15088228-C-T | ** | ||||||||
17200113-C-T | 15088233-C-T | ** | ||||||||
17244399-G-T | 15132519-G-T | ** | ||||||||
17372383-C-A | 15260503-C-A | ** | ||||||||
17440674-C-A | 15328794-C-A | FT50766 | ** | |||||||
17466641-G-T | 15354761-G-T | ** | ||||||||
17481464-C-A | 15369584-C-A | ** | ||||||||
17481470-A-T | 15369590-A-T | ** | ||||||||
17492071-T-C | 15380191-T-C | ** | ||||||||
17502538-C-A | 15390658-C-A | ** | ||||||||
17535308-C-A | 15423428-C-A | ** | ||||||||
17600648-T-C | 15488768-T-C | ** | ||||||||
17605312-G-A | 15493432-G-A | ** | ||||||||
17605390-C-A | 15493510-C-A | ** | ||||||||
17616850-C-A | 15504970-C-A | ** | ||||||||
18042845-C-A | 15930965-C-A | ** | ||||||||
18158552-C-T | 16046672-C-T | ** | ||||||||
18185292-G-A | 16073412-G-A | ** | ||||||||
18398007-AT-A | 16286127-AT-A | P6_Gap | ** | |||||||
18749256-A-G | 16637376-A-G | BY207868 | ** | |||||||
18750104-A-G | 16638224-A-G | ** | ||||||||
18848668-G-T | 16736788-G-T | ** | ||||||||
18874060-G-C | 16762180-G-C | ** | ||||||||
18926881-A-T | 16815001-A-T | ** | ||||||||
19055667-A-T | 16943787-A-T | ** | ||||||||
19075160-C-T | 16963280-C-T | ** | ||||||||
19075323-C-T | 16963443-C-T | ** | ||||||||
19081413-C-A | 16969533-C-A | ** | ||||||||
19121823-T-C | 17009943-T-C | ** | ||||||||
19137708-T-C | 17025828-T-C | ** | ||||||||
19187588-G-A | 17075708-G-A | ** | ||||||||
19187603-C-T | 17075723-C-T | ** | ||||||||
19187612-G-A | 17075732-G-A | ** | ||||||||
19187644-A-G | 17075764-A-G | ** | ||||||||
19244634-C-A | 17132754-C-A | ** | ||||||||
19394149-G-A | 17282269-G-A | ** | ||||||||
19509926-T-C | 17398046-T-C | ** | ||||||||
19754861-C-T | 17642981-C-T | P5_Prx | ** | |||||||
19873471-G-A | 17761591-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
19950182-A-ATGCTGTGTG | 17838302-A-ATGCTGTGTG | P5_Prx | 18×TG | ** | ||||||
20004085-T-A | 17892205-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
20252944-T-C | 18091058-T-C | P5_Dst | ** | |||||||
20432886-A-G | 18271000-A-G | P5_Dst | ** | |||||||
21072645-A-C | 18910759-A-C | ** | ||||||||
21141224-T-C | 18979338-T-C | ** | ||||||||
21146236-T-C | 18984350-T-C | ** | ||||||||
21152299-C-A | 18990413-C-A | ** | ||||||||
21155098-T-G | 18993212-T-G | FT149814 | ** | |||||||
21221065-C-T | 19059179-C-T | ** | ||||||||
21240551-C-A | 19078665-C-A | FT385740 | ** | |||||||
21353070-C-G | 19191184-C-G | ** | ||||||||
21379806-G-C | 19217920-G-C | ** | ||||||||
21409805-G-C | 19247919-G-C | ** | ||||||||
21417073-G-C | 19255187-G-C | ** | ||||||||
21462553-T-A | 19300667-T-A | ** | ||||||||
21534972-T-C | 19373086-T-C | ** | ||||||||
21671986-C-A | 19510100-C-A | ** | ||||||||
21672017-T-C | 19510131-T-C | ** | ||||||||
21672069-T-C | 19510183-T-C | ** | ||||||||
21738623-A-G | 19576737-A-G | ** | ||||||||
21738708-G-T | 19576822-G-T | ** | ||||||||
21738710-T-G | 19576824-T-G | ** | ||||||||
21771632-C-A | 19609746-C-A | ** | ||||||||
21828547-T-C | 19666661-T-C | ** | ||||||||
21836512-G-A | 19674626-G-A | ** | ||||||||
21836627-G-A | 19674741-G-A | FTB12880 | ** | |||||||
21966376-G-T | 19804490-G-T | ** | ||||||||
22011297-G-A | 19849411-G-A | ** | ||||||||
22011301-G-A | 19849415-G-A | ** | ||||||||
22011310-G-A | 19849424-G-A | ** | ||||||||
22011321-G-A | 19849435-G-A | ** | ||||||||
22124213-C-A | 19962327-C-A | ** | ||||||||
22130024-G-A | 19968138-G-A | ** | ||||||||
22209609-A-T | 20047723-A-T | ** | ||||||||
22211439-TA-T | 20049553-TA-T | ** | ||||||||
22287118-T-G | 20125232-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
22517825-T-C | 20355939-T-C | ** | ||||||||
22520561-G-A | 20358675-G-A | ** | ||||||||
22520568-C-A | 20358682-C-A | ** | ||||||||
22965085-C-A | 20803199-C-A | ** | ||||||||
22965467-T-A | 20803581-T-A | ** | ||||||||
22986679-T-C | 20824793-T-C | ** | ||||||||
22995280-G-A | 20833394-G-A | ** | ||||||||
23098038-TG-T | 20936152-TG-T | ** | ||||||||
23103100-A-G | 20941214-A-G | ** | ||||||||
23350625-A-AC | 21188739-A-AC | ** | ||||||||
23421015-A-C | 21259129-A-C | ** | ||||||||
23439028-C-G | 21277142-C-G | ** | ||||||||
23439050-G-T | 21277164-G-T | ** | ||||||||
23447605-A-T | 21285719-A-T | ** | ||||||||
23459899-A-T | 21298013-A-T | ** | ||||||||
23570098-T-C | 21408212-T-C | ** | ||||||||
23570115-C-T | 21408229-C-T | ** | ||||||||
23570127-A-C | 21408241-A-C | ** | ||||||||
23570128-T-C | 21408242-T-C | ** | ||||||||
23570149-A-G | 21408263-A-G | ** | ||||||||
23570152-G-T | 21408266-G-T | ** | ||||||||
23570172-CT-C | 21408286-CT-C | ** | ||||||||
23570177-T-C | 21408291-T-C | ** | ||||||||
23570183-G-A | 21408297-G-A | ** | ||||||||
23886833-TG-T | 21724947-TG-T | ** | ||||||||
24405168-C-A | 22259021-C-A | ** | ||||||||
25029894-C-A | 22883747-C-A | g1 | ** | |||||||
26328711-G-A | 24182564-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26354611-G-A | 24208464-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27603682-G-T | 25457535-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27958456-A-G | 25812309-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
28008273-A-C | 25862126-A-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28008311-T-C | 25862164-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28008347-A-C | 25862200-A-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28097006-T-TG | 25950859-T-TG | P1_Y2 | ** | |||||||
28401927-T-G | 26255780-T-G | P1_gr2 | ** | |||||||
28481170-C-A | 26335023-C-A | ** | ||||||||
28499370-G-A | 26353223-G-A | ** | ||||||||
28510040-C-A | 26363893-C-A | ** | ||||||||
28518922-T-G | 26372775-T-G | ** | ||||||||
28520523-T-G | 26374376-T-G | ** | ||||||||
28520582-A-G | 26374435-A-G | ** | ||||||||
28521867-C-A | 26375720-C-A | ** | ||||||||
28537103-T-A | 26390956-T-A | ** | ||||||||
28546518-G-T | 26400371-G-T | ** | ||||||||
28547349-C-T | 26401202-C-T | ** | ||||||||
28560164-C-A | 26414017-C-A | ** | ||||||||
28591304-CT-C | 26445157-CT-C | ** | ||||||||
28591831-C-T | 26445684-C-T | ** | ||||||||
28631652-C-A | 26485505-C-A | ** | ||||||||
28654123-A-C | 26507976-A-C | ** | ||||||||
28654251-A-T | 26508104-A-T | ** | ||||||||
28654266-G-T | 26508119-G-T | ** | ||||||||
28679680-A-G | 26533533-A-G | ** | ||||||||
28697781-A-G | 26551634-A-G | ** | ||||||||
28697837-C-A | 26551690-C-A | ** | ||||||||
28721763-G-T | 26575616-G-T | ** | ||||||||
28722570-C-A | 26576423-C-A | ** | ||||||||
28725942-A-C | 26579795-A-C | F26788 | ** | |||||||
28728446-C-A | 26582299-C-A | ** | ||||||||
28731046-C-T | 26584899-C-T | ** | ||||||||
28779751-C-A | 26633604-C-A | ** | ||||||||
28798214-T-A | 26652067-T-A | ** | ||||||||
56822112-G-T | ** | |||||||||
56825729-G-A | ** | |||||||||
56835384-T-C | ** | |||||||||
56836631-C-A | ** | |||||||||
58992799-A-G | 56846652-A-G | ** | ||||||||
56880331-A-T | ** | |||||||||
25705290-A-ACT | 23559143-A-ACT | P1_b3 | 18×CT | *** | ||||||
58975582-C-T | 56829435-C-T | *** | ||||||||
24278183-C-CAAGAAAGAAAGA | 22132036-C-CAAGAAAGAAAGA | P3_b1 | 22×AAGA | *** | ||||||
58976635-C-T | 56830488-C-T | *** | ||||||||
14213636-GAGGA-G | 12092930-GAGGA-G | 7×AGGA | *** | |||||||
24470052-T-G | 22323905-T-G | *** | ||||||||
58976664-T-C | 56830517-T-C | *** | ||||||||
23808115-T-C | 21646229-T-C | *** | ||||||||
18699739-CCT-C | 16587859-CCT-C | 8×CT | *** | |||||||
13466157-C-A | 11310481-C-A | *** | ||||||||
18039415-A-T | 15927535-A-T | *** | ||||||||
58976645-A-G | 56830498-A-G | *** | ||||||||
2665267-CTT-C | 2797226-CTT-C | 12×T | *** | |||||||
22285254-G-A | 20123368-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
25279176-A-T | 23133029-A-T | P2_r1 | *** | |||||||
58976458-G-GCCATTCCATTCCACT | 56830311-G-GCCATTCCATTCCACT | *** | ||||||||
15490662-A-AT | 13378782-A-AT | 10×T | *** | |||||||
24421126-G-C | 22274979-G-C | *** | ||||||||
7217162-CTTT-C | 7349121-CTTT-C | 14×T | *** | |||||||
10764569-C-CCGTAT | *** | |||||||||
10878320-A-G | *** | |||||||||
10878321-C-T | *** | |||||||||
15557124-AATATATATAT-A | 13445244-AATATATATAT-A | 19×AT | *** | |||||||
10799466-CGA-G | *** | |||||||||
2777828-TAA-T,TA | 2909787-TAA-T,TA | 15×A | *** | |||||||
10763081-C-T | *** | |||||||||
56832509-CTCCAC-C,CTCCAA | *** | |||||||||
10764551-A-G | *** | |||||||||
13471978-G-C | 11316302-G-C | *** | ||||||||
3790866-G-A | 3922825-G-A | *** | ||||||||
10821757-C-A | *** | |||||||||
10796683-A-G,T | *** | |||||||||
10994643-C-A | *** | |||||||||
10973659-T-C | *** | |||||||||
16090225-C-A | 13978345-C-A | *** | ||||||||
8216406-CTTTT-C,CT | 8348365-CTTTT-C,CT | 16×T | *** | |||||||
10799508-A-C,G | *** | |||||||||
15612233-C-CAT | 13500353-C-CAT | *** | ||||||||
10673828-C-A | *** | |||||||||
4063965-C-A | 4195924-C-A | *** | ||||||||
13227903-G-A | 11072227-G-A | *** | ||||||||
10883574-A-T | *** | |||||||||
2960075-A-T | 3092034-A-T | *** | ||||||||
5742802-C-A | 5874761-C-A | *** | ||||||||
6712476-G-T | 6844435-G-T | *** | ||||||||
7142197-C-A | 7274156-C-A | *** | ||||||||
8725374-C-A | 8857333-C-A | *** | ||||||||
9354128-T-C | 9516519-T-C | *** | ||||||||
9678327-T-C | 9840718-T-C | IR3_Prx | *** | |||||||
10944584-C-A | *** | |||||||||
11013734-A-C | *** | |||||||||
13236580-T-C | 11080904-T-C | *** | ||||||||
13858541-A-C | 11737835-A-C | *** | ||||||||
13858545-G-C | 11737839-G-C | *** | ||||||||
13858557-A-ATCTTC | 11737851-A-ATCTTC | *** | ||||||||
15179151-T-C | 13067237-T-C | *** | ||||||||
13208774-GAAGA-G | *** | |||||||||
15430612-T-C | 13318732-T-C | *** | ||||||||
16430404-A-T | 14318524-A-T | *** | ||||||||
16779280-C-T | 14667400-C-T | *** | ||||||||
21200848-G-A | 19038962-G-A | *** | ||||||||
21584215-C-T | 19422329-C-T | *** | ||||||||
22625051-CT-C | 20463165-CT-C | *** | ||||||||
22849491-CTTTT-C,CTTTTT | 20687605-CTTTT-C,CTTTTT | 20×T | *** | |||||||
24001384-C-A | 21855237-C-A | *** | ||||||||
26206233-C-T | 24060086-C-T | P1_Y1 | *** | |||||||
27862574-G-A | 25716427-G-A | P1_Y2 | *** | |||||||
56830525-TATTCCATTGCATTCTGCTGA-T,TATTCCATTGCATTCCATTGC | *** | |||||||||
56830607-C-T | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
---|---|---|---|
Manual | 16354918-T-A | 14243038-T-A | Nigel McCarthy: Low number of reads but all positive. |