Arbuthnot
FTDNA: N114168, BigY3: N114168, BigY2: N114168Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA N114168 | BigY3 N114168 | BigY2 N114168 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3657065-G-C | 3789024-G-C | A+ | ||||||||
4695928-A-G | 4827887-A-G | A* | ||||||||
10064169-T-G | 10226560-T-G | A* | ||||||||
19673336-C-T | 17561456-C-T | P5_Prx | *** | A* | A* | |||||
20506442-G-A | 18344556-G-A | P5_Dst | A* | |||||||
20795181-C-T | 18633295-C-T | P4_Prx | *** | A* | A* | |||||
22265203-T-A | 20103317-T-A | DYZ19 | *** | A* | ||||||
22290039-G-C | 20128153-G-C | DYZ19 | *** | A* | ||||||
20302110-G-GT | 18140224-G-GT | P5_Dst | 10×T | A* | ||||||
15426394-C-T | 13314514-C-T | Z39517 FGC14325 | Y | Y | + | + | + | |||
18390331-A-G | 16278451-A-G | FGC14327 | P6_Gap | + | + | + | ||||
21909443-G-T | 19747557-G-T | FGC14329 | Y | Y | + | + | + | |||
13455693-C-G | 11300017-C-G | BY85443 | + | |||||||
14168951-C-A | 12048245-C-A | FGC14323 | Y | Y | + | + | + | |||
4207742-C-G | 4339701-C-G | FT110027 | + | |||||||
15388244-T-G | 13276364-T-G | FGC14324 | Y | Y | + | + | + | |||
5380840-T-C | 5512799-T-C | FT110459 | + | |||||||
17737996-G-A | 15626116-G-A | FT60208 | Y | Y | + | ** | ||||
8302867-G-A | 8434826-G-A | FGC14321 | Y | Y | + | + | + | |||
22255465-T-C | 20093579-T-C | DYZ19 | *** | * | ||||||
18639018-AGTGT-A,AGT | 16527138-AGTGT-A,AGT | 26×GT | * | |||||||
9865159-C-A | 10027550-C-A | ** | ||||||||
9824990-C-A | 9987381-C-A | ** | ||||||||
9799363-C-A | 9961754-C-A | ** | ||||||||
10020274-C-A | 10182665-C-A | ** | ||||||||
21315101-G-A | 19153215-G-A | ** | ||||||||
9899549-A-C | 10061940-A-C | ** | ||||||||
9506961-A-C | 9669352-A-C | ** | ||||||||
10050281-A-C | 10212672-A-C | ** | ||||||||
10070930-C-A | 10233321-C-A | ** | ||||||||
10645939-T-C | ** | |||||||||
10659355-T-C | ** | |||||||||
10660093-A-G | ** | |||||||||
6784579-T-C | 6916538-T-C | ** | ||||||||
9417012-C-A | 9579403-C-A | ** | ||||||||
9498665-C-A | 9661056-C-A | ** | ||||||||
8856853-C-A | 8988812-C-A | ** | ||||||||
21435115-G-A | 19273229-G-A | 14×A | ** | |||||||
8501528-CTTCCTCT-C | 8633487-CTTCCTCT-C | ** | ||||||||
8720298-T-A | 8852257-T-A | ** | ||||||||
21325802-C-A | 19163916-C-A | ** | ||||||||
8811287-G-T | 8943246-G-T | ** | ||||||||
8815805-T-A | 8947764-T-A | ** | ||||||||
8848207-G-A | 8980166-G-A | ** | ||||||||
8856958-G-C | 8988917-G-C | ** | ||||||||
21162844-G-A | 19000958-G-A | ** | ||||||||
8907706-T-G | 9039665-T-G | ** | ||||||||
8913433-C-A | 9045392-C-A | ** | ||||||||
9123250-T-C | ** | |||||||||
9040744-C-A | 9203135-C-A | ** | ||||||||
9047669-G-T | 9210060-G-T | ** | ||||||||
9048006-C-A | 9210397-C-A | ** | ||||||||
9063440-G-T | 9225831-G-T | ** | ||||||||
21246476-C-A | 19084590-C-A | ** | ||||||||
10690228-C-A | ** | |||||||||
10667151-A-C | ** | |||||||||
10914218-A-T | ** | |||||||||
10863073-T-A | ** | |||||||||
10863086-CAT-C | ** | |||||||||
10863090-CCAT-C | ** | |||||||||
10863113-A-C | ** | |||||||||
10874182-G-T | ** | |||||||||
20815484-CAC-A | 18653598-CAC-A | P4_Gap | ** | |||||||
10895060-C-A | ** | |||||||||
10906064-T-G | ** | |||||||||
10914237-C-G | ** | |||||||||
10863045-C-A | ** | |||||||||
10914244-C-T | ** | |||||||||
10914248-G-A | ** | |||||||||
10914259-T-A | ** | |||||||||
10914265-C-G | ** | |||||||||
10914272-T-C | ** | |||||||||
10932265-A-T | FT437066 | ** | ||||||||
10932268-G-C | ** | |||||||||
10932273-G-C | ** | |||||||||
10863064-T-C | ** | |||||||||
10863040-T-C | ** | |||||||||
10668500-C-T | ** | |||||||||
20829807-T-C | 18667921-T-C | P4_Gap | ** | |||||||
10671526-A-C | ** | |||||||||
10673283-TC-T | ** | |||||||||
8172781-A-G | 8304740-A-G | ** | ||||||||
10747125-C-A | FT219923 | ** | ||||||||
10752198-C-A | ** | |||||||||
10753228-T-C | ** | |||||||||
10757213-C-CCCCTCCATTT | ** | |||||||||
10763082-A-AT | ** | |||||||||
10772325-C-A | ** | |||||||||
10863037-C-CA | ** | |||||||||
10788465-C-A | ** | |||||||||
10801632-C-T | ** | |||||||||
10822201-C-A | ** | |||||||||
10838905-C-A | ** | |||||||||
10840057-C-T | ** | |||||||||
10847387-T-C | ** | |||||||||
10850353-A-T | ** | |||||||||
10863011-C-CGAGTT | ** | |||||||||
10863034-A-C | ** | |||||||||
8214040-C-G | 8345999-C-G | ** | ||||||||
7629896-C-A | 7761855-C-A | ** | ||||||||
8170425-A-T | 8302384-A-T | ** | ||||||||
5293877-A-G | 5425836-A-G | ** | ||||||||
4918223-T-C | 5050182-T-C | ** | ||||||||
21738766-T-C | 19576880-T-C | ** | ||||||||
4981981-C-A | 5113940-C-A | ** | ||||||||
5004324-G-A | 5136283-G-A | ** | ||||||||
5126278-C-A | 5258237-C-A | ** | ||||||||
5190069-C-A | 5322028-C-A | ** | ||||||||
5211999-C-A | 5343958-C-A | ** | ||||||||
5448787-C-A | 5580746-C-A | ** | ||||||||
4902350-C-A | 5034309-C-A | ** | ||||||||
5558551-T-C | 5690510-T-C | ** | ||||||||
5565995-T-G | 5697954-T-G | ** | ||||||||
5606899-C-A | 5738858-C-A | ** | ||||||||
5710583-T-C | 5842542-T-C | ** | ||||||||
5775518-C-A | 5907477-C-A | ** | ||||||||
21738765-A-G | 19576879-A-G | ** | ||||||||
5976405-C-A | 6108364-C-A | ** | ||||||||
4902436-C-A | 5034395-C-A | ** | ||||||||
4888598-T-C | 5020557-T-C | ** | ||||||||
6009327-C-A | 6141286-C-A | ** | ||||||||
4160984-A-G | 4292943-A-G | ** | ||||||||
3756258-G-T | 3888217-G-T | ** | ||||||||
3836957-C-A | 3968916-C-A | ** | ||||||||
3853292-G-A | 3985251-G-A | ** | ||||||||
3868456-G-T | 4000415-G-T | ** | ||||||||
4070233-A-G | 4202192-A-G | ** | ||||||||
4136565-T-G | 4268524-T-G | ** | ||||||||
4136571-T-G | 4268530-T-G | ** | ||||||||
4374401-T-C | 4506360-T-C | ** | ||||||||
4678843-C-A | 4810802-C-A | ** | ||||||||
4451456-C-A | 4583415-C-A | ** | ||||||||
4462597-G-T | 4594556-G-T | ** | ||||||||
4462606-G-T | 4594565-G-T | ** | ||||||||
4490401-T-G | 4622360-T-G | ** | ||||||||
4490411-G-T | 4622370-G-T | ** | ||||||||
4528001-A-G | 4659960-A-G | ** | ||||||||
4540718-T-C | 4672677-T-C | ** | ||||||||
4604336-T-C | 4736295-T-C | ** | ||||||||
5980450-G-T | 6112409-G-T | ** | ||||||||
21526879-T-A | 19364993-T-A | ** | ||||||||
8124907-G-A | 8256866-G-A | ** | ||||||||
10932299-T-A | ** | |||||||||
7270403-G-A | 7402362-G-A | ** | ||||||||
7305653-C-A | 7437612-C-A | ** | ||||||||
7341574-G-T | 7473533-G-T | ** | ||||||||
7349103-T-A | 7481062-T-A | ** | ||||||||
7377530-C-A | 7509489-C-A | ** | ||||||||
7418410-C-A | 7550369-C-A | ** | ||||||||
7423249-C-A | 7555208-C-A | ** | ||||||||
7670768-A-C | 7802727-A-C | ** | ||||||||
7229089-C-T | 7361048-C-T | ** | ||||||||
7757124-C-A | 7889083-C-A | ** | ||||||||
7996835-C-T | 8128794-C-T | ** | ||||||||
8008868-C-A | 8140827-C-A | ** | ||||||||
8045366-G-C | 8177325-G-C | ** | ||||||||
8067411-G-A | 8199370-G-A | ** | ||||||||
21435158-C-A | 19273272-C-A | ** | ||||||||
21435151-G-A | 19273265-G-A | ** | ||||||||
7258590-T-A | 7390549-T-A | ** | ||||||||
7202081-C-A | 7334040-C-A | ** | ||||||||
21459737-G-A | 19297851-G-A | ** | ||||||||
6828814-C-A | 6960773-C-A | ** | ||||||||
6459757-T-G | 6591716-T-G | ** | ||||||||
6461847-A-C | 6593806-A-C | ** | ||||||||
6462071-G-T | 6594030-G-T | FT66928 | ** | |||||||
6486267-G-T | 6618226-G-T | ** | ||||||||
6694913-G-A | 6826872-G-A | ** | ||||||||
21455943-A-T | 19294057-A-T | ** | ||||||||
6822064-G-T | 6954023-G-T | ** | ||||||||
21455409-TC-T | 19293523-TC-T | ** | ||||||||
21435163-G-A | 19273277-G-A | ** | ||||||||
6996695-AC-A | 7128654-AC-A | ** | ||||||||
7098621-T-C | 7230580-T-C | FT67062 | ** | |||||||
7107051-A-T | 7239010-A-T | ** | ||||||||
7107059-ATG-A | 7239018-ATG-A | ** | ||||||||
7107074-G-C | 7239033-G-C | ** | ||||||||
7107079-C-G | 7239038-C-G | ** | ||||||||
7134800-A-G | 7266759-A-G | ** | ||||||||
7140803-C-A | 7272762-C-A | ** | ||||||||
10932290-A-T | ** | |||||||||
11029931-C-A | ** | |||||||||
10945080-C-T | ** | |||||||||
17284589-G-T | 15172709-G-T | ** | ||||||||
16874799-T-C | 14762919-T-C | ** | ||||||||
16952914-C-T | 14841034-C-T | ** | ||||||||
16989248-A-T | 14877368-A-T | ** | ||||||||
17006285-G-A | 14894405-G-A | ** | ||||||||
17006329-C-A | 14894449-C-A | ** | ||||||||
17215378-G-T | 15103498-G-T | ** | ||||||||
17257268-A-G | 15145388-A-G | ** | ||||||||
17370877-A-C | 15258997-A-C | ** | ||||||||
16707591-C-A | 14595711-C-A | ** | ||||||||
17406954-A-T | 15295074-A-T | ** | ||||||||
17492247-A-T | 15380367-A-T | ** | ||||||||
17492272-G-T | 15380392-G-T | ** | ||||||||
17500822-G-T | 15388942-G-T | ** | ||||||||
17535280-T-C | 15423400-T-C | ** | ||||||||
17535360-G-T | 15423480-G-T | ** | ||||||||
17546052-C-A | 15434172-C-A | ** | ||||||||
20213233-G-T | 18051347-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
16676734-T-G | 14564854-T-G | ** | ||||||||
17548233-T-C | 15436353-T-C | ** | ||||||||
16092982-T-C | 13981102-T-C | ** | ||||||||
15927081-T-C | 13815201-T-C | ** | ||||||||
15941473-C-A | 13829593-C-A | ** | ||||||||
15995454-C-A | 13883574-C-A | ** | ||||||||
16017587-G-T | 13905707-G-T | ** | ||||||||
16018994-A-T | 13907114-A-T | ** | ||||||||
16051005-T-A | 13939125-T-A | ** | ||||||||
16092575-T-A | 13980695-T-A | ** | ||||||||
16181302-TG-T | 14069422-TG-T | ** | ||||||||
16676628-C-T | 14564748-C-T | ** | ||||||||
20384604-C-T | 18222718-C-T | P5_Dst | ** | |||||||
16341035-T-A | 14229155-T-A | ** | ||||||||
16341088-C-A | 14229208-C-A | ** | ||||||||
16394333-T-G | 14282453-T-G | ** | ||||||||
16421871-G-A | 14309991-G-A | ** | ||||||||
16530964-G-A | 14419084-G-A | ** | ||||||||
16636006-C-T | 14524126-C-T | ** | ||||||||
17547707-G-T | 15435827-G-T | ** | ||||||||
17629468-C-A | 15517588-C-A | ** | ||||||||
20384620-T-TA | 18222734-T-TA | P5_Dst | ** | |||||||
19071028-C-A | 16959148-C-A | ** | ||||||||
18756396-G-A | 16644516-G-A | ** | ||||||||
18877335-T-C | 16765455-T-C | ** | ||||||||
18877426-A-G | 16765546-A-G | ** | ||||||||
19539692-C-A | 17427812-C-A | ** | ||||||||
19044520-C-A | 16932640-C-A | ** | ||||||||
19044596-C-A | 16932716-C-A | ** | ||||||||
19529164-A-G | 17417284-A-G | ** | ||||||||
19097109-C-A | 16985229-C-A | ** | ||||||||
18711484-T-A | 16599604-T-A | FT301946 | ** | |||||||
19129158-C-A | 17017278-C-A | ** | ||||||||
19202926-CTCA-T | 17091046-CTCA-T | ** | ||||||||
19235583-C-A | 17123703-C-A | ** | ||||||||
19415514-C-A | 17303634-C-A | ** | ||||||||
19436810-G-GAAAA | 17324930-G-GAAAA | ** | ||||||||
19444274-C-A | 17332394-C-A | ** | ||||||||
19528480-G-A | 17416600-G-A | ** | ||||||||
18742338-G-T | 16630458-G-T | ** | ||||||||
18707732-T-C | 16595852-T-C | ** | ||||||||
17685743-C-A | 15573863-C-A | ** | ||||||||
20104136-T-G | 17992256-T-G | P5_Dst | ** | |||||||
17779540-C-A | 15667660-C-A | ** | ||||||||
17794236-C-T | 15682356-C-T | BY25137 | ** | |||||||
17794256-C-T | 15682376-C-T | ** | ||||||||
17864187-C-A | 15752307-C-A | ** | ||||||||
17898132-A-G | 15786252-A-G | FT297475 | ** | |||||||
17963866-C-A | 15851986-C-A | ** | ||||||||
18053454-C-G | 15941574-C-G | ** | ||||||||
18088582-C-A | 15976702-C-A | ** | ||||||||
18621843-T-C | 16509963-T-C | ** | ||||||||
18089215-T-A | 15977335-T-A | ** | ||||||||
18159187-A-C | 16047307-A-C | ** | ||||||||
18173223-C-A | 16061343-C-A | ** | ||||||||
18173233-C-A | 16061353-C-A | ** | ||||||||
18336369-C-A | 16224489-C-A | P6_Prx | ** | |||||||
18423915-T-A | 16312035-T-A | P6_Gap | ** | |||||||
18491442-T-G | 16379562-T-G | P6_Dst | ** | |||||||
18501923-G-T | 16390043-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
15921924-G-T | 13810044-G-T | ** | ||||||||
15839671-A-G | 13727791-A-G | ** | ||||||||
10967498-C-A | ** | |||||||||
13885462-G-T | 11764756-G-T | ** | ||||||||
11649168-T-A | ** | |||||||||
11662613-G-A | ** | |||||||||
11677110-T-A | ** | |||||||||
13856346-T-TATAAC | 11735640-T-TATAAC | ** | ||||||||
13878541-T-A | 11757835-T-A | ** | ||||||||
13884072-T-C | 11763366-T-C | ** | ||||||||
13884097-C-A | 11763391-C-A | ** | ||||||||
13922447-C-A | 11801741-C-A | ** | ||||||||
13610604-G-T | 11454928-G-T | ** | ||||||||
13928674-A-G | 11807968-A-G | ** | ||||||||
13929225-C-A | 11808519-C-A | ** | ||||||||
13972444-G-T | 11851738-G-T | ** | ||||||||
13975798-G-C | 11855092-G-C | ** | ||||||||
14035233-G-T | 11914527-G-T | ** | ||||||||
14123946-C-A | 12003240-C-A | ** | ||||||||
14129674-G-A | 12008968-G-A | ** | ||||||||
13637508-C-A | 11481832-C-A | ** | ||||||||
13498233-C-A | 11342557-C-A | ** | ||||||||
14195151-G-T | 12074445-G-T | ** | ||||||||
11015924-A-G | ** | |||||||||
10971772-C-A | ** | |||||||||
10973883-C-A | ** | |||||||||
10980418-C-A | ** | |||||||||
10984342-T-A | ** | |||||||||
10984862-T-C | ** | |||||||||
10987908-C-CCACA | ** | |||||||||
10987912-T-TG | ** | |||||||||
3696627-A-T | 3828586-A-T | ** | ||||||||
13460966-A-C | 11305290-A-C | ** | ||||||||
11033339-A-T | ** | |||||||||
11035114-G-T | ** | |||||||||
11037858-C-T | ** | |||||||||
13213539-C-A | 11057863-C-A | ** | ||||||||
20384656-C-A | 18222770-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
13213914-G-T | 11058238-G-T | ** | ||||||||
13242842-G-T | 11087166-G-T | ** | ||||||||
13252566-A-C | 11096890-A-C | ** | ||||||||
14146766-T-A | 12026060-T-A | ** | ||||||||
14204520-C-A | 12083814-C-A | ** | ||||||||
15775271-G-C | 13663391-G-C | ** | ||||||||
15773581-A-C | 13661701-A-C | ** | ||||||||
15619156-A-T | 13507276-A-T | ** | ||||||||
15730655-C-A | 13618775-C-A | ** | ||||||||
15733787-T-A | 13621907-T-A | ** | ||||||||
15745757-T-C | 13633877-T-C | ** | ||||||||
15773554-T-C | 13661674-T-C | ** | ||||||||
15773562-C-T | 13661682-C-T | ** | ||||||||
15773578-T-A | 13661698-T-A | ** | ||||||||
15773591-G-C | 13661711-G-C | ** | ||||||||
15333641-A-T | 13221759-A-T | ** | ||||||||
15773597-G-A | 13661717-G-A | ** | ||||||||
15773607-C-CTTTA | 13661727-C-CTTTA | ** | ||||||||
15773618-T-C | 13661738-T-C | ** | ||||||||
15775244-C-T | 13663364-C-T | ** | ||||||||
15775245-A-G | 13663365-A-G | ** | ||||||||
15775257-G-T | 13663377-G-T | ** | ||||||||
15775268-C-T | 13663388-C-T | ** | ||||||||
15406958-A-G | 13295078-A-G | ** | ||||||||
15321313-T-C | 13209431-T-C | ** | ||||||||
14230153-C-T | 12109447-C-T | ** | ||||||||
14582345-C-A | 12470545-C-A | ** | ||||||||
14267076-A-G | 12146370-A-G | ** | ||||||||
14270550-T-C | 12149844-T-C | ** | ||||||||
14386723-A-T | 12266019-A-T | ** | ||||||||
14444963-C-G | 12324236-C-G | ** | ||||||||
14449974-T-G | 12329247-T-G | ** | ||||||||
14506965-C-G | 12395170-C-G | ** | ||||||||
14539379-C-A | 12427580-C-A | ** | ||||||||
14694973-C-T | 12583039-C-T | ** | ||||||||
15232228-AC-A | 13120314-AC-A | ** | ||||||||
14764838-C-A | 12652907-C-A | ** | ||||||||
14815442-G-A | 12703513-G-A | ** | ||||||||
14835327-ATTT-A | 12723394-ATTT-A | 14×T | ** | |||||||
14888014-C-A | 12776080-C-A | ** | ||||||||
15114696-C-A | 13002783-C-A | ** | ||||||||
15168331-C-A | 13056417-C-A | ** | ||||||||
15178636-G-C | 13066722-G-C | ** | ||||||||
15209349-C-A | 13097435-C-A | ** | ||||||||
3727226-G-T | 3859185-G-T | ** | ||||||||
2948077-A-T | 3080036-A-T | ** | ||||||||
3467144-A-G | 3599103-A-G | ** | ||||||||
28483547-C-A | 26337400-C-A | ** | ||||||||
10974168-C-A | ** | |||||||||
8230323-C-A | 8362282-C-A | ** | ||||||||
13252582-A-C | 11096906-A-C | ** | ||||||||
9601588-T-TA | 9763979-T-TA | IR3_Prx | ** | |||||||
11006841-C-A | ** | |||||||||
13394839-C-T | 11239163-C-T | 13×G | ** | |||||||
2814909-T-G | 2946868-T-G | ** | ||||||||
23111578-TA-T | 20949692-TA-T | ** | ||||||||
23086025-A-G | 20924139-A-G | ** | ||||||||
21945286-C-T | 19783400-C-T | ** | ||||||||
21945313-A-C | 19783427-A-C | ** | ||||||||
3876017-C-A | 4007976-C-A | ** | ||||||||
23898947-T-TA | 21737061-T-TA | ** | ||||||||
15556923-C-A | 13445043-C-A | ** | ||||||||
28612195-C-A | 26466048-C-A | ** | ||||||||
8761992-C-A | 8893951-C-A | ** | ||||||||
10932284-C-T | ** | |||||||||
17301237-T-C | 15189357-T-C | ** | ||||||||
14743886-C-A | 12631955-C-A | ** | ||||||||
18174762-C-A | 16062882-C-A | ** | ||||||||
10831666-G-T | ** | |||||||||
23337159-A-G | 21175273-A-G | ** | ||||||||
13252580-T-G | 11096904-T-G | ** | ||||||||
17928002-C-A | 15816122-C-A | ** | ||||||||
23259237-C-G | 21097351-C-G | ** | ||||||||
7318659-C-A | 7450618-C-A | ** | ||||||||
23111746-A-G | 20949860-A-G | ** | ||||||||
16886952-C-A | 14775072-C-A | ** | ||||||||
13218926-C-A | 11063250-C-A | ** | ||||||||
11669271-G-T | ** | |||||||||
18201038-C-A | 16089158-C-A | ** | ||||||||
18738223-C-A | 16626343-C-A | ** | ||||||||
21132636-C-A | 18970750-C-A | FT35116 | ** | |||||||
17692114-C-A | 15580234-C-A | ** | ||||||||
23085918-C-A | 20924032-C-A | ** | ||||||||
11014724-A-G | ** | |||||||||
10773635-C-A | ** | |||||||||
8691929-C-A | 8823888-C-A | FT327631 | ** | |||||||
10890080-C-A | FT435679 | ** | ||||||||
23047567-C-A | 20885681-C-A | ** | ||||||||
15683781-C-A | 13571901-C-A | ** | ||||||||
18035899-C-A | 15924019-C-A | ** | ||||||||
5172124-C-A | 5304083-C-A | ** | ||||||||
18848441-G-T | 16736561-G-T | ** | ||||||||
9899544-G-A | 10061935-G-A | ** | ||||||||
10914210-A-C | ** | |||||||||
4537856-A-G | 4669815-A-G | ** | ||||||||
3427053-G-T | 3559012-G-T | ** | ||||||||
6461518-C-A | 6593477-C-A | ** | ||||||||
14220922-G-A | 12100216-G-A | ** | ||||||||
20025441-C-G | 17913561-C-G | P5_Prx | ** | |||||||
22629869-C-A | 20467983-C-A | ** | ||||||||
17770402-C-A | 15658522-C-A | ** | ||||||||
21316874-C-A | 19154988-C-A | ** | ||||||||
20979249-A-ACG | 18817363-A-ACG | P4_Dst | ** | |||||||
2814894-C-A | 2946853-C-A | ** | ||||||||
8119385-C-A | 8251344-C-A | ** | ||||||||
8172776-C-A | 8304735-C-A | ** | ||||||||
11000161-C-T | ** | |||||||||
15749294-C-A | 13637414-C-A | ** | ||||||||
7253974-C-A | 7385933-C-A | ** | ||||||||
16019134-G-T | 13907254-G-T | ** | ||||||||
10830929-C-A | ** | |||||||||
22995450-C-A | 20833564-C-A | ** | ||||||||
18687531-G-T | 16575651-G-T | ** | ||||||||
23055332-T-G | 20893446-T-G | ** | ||||||||
23223298-C-T | 21061412-C-T | ** | ||||||||
28517377-C-A | 26371230-C-A | ** | ||||||||
11033288-C-A | ** | |||||||||
23065701-C-A | 20903815-C-A | ** | ||||||||
21748285-C-A | 19586399-C-A | ** | ||||||||
3116231-C-A | 3248190-C-A | ** | ||||||||
9732930-A-T | 9895321-A-T | IR3_Prx | ** | |||||||
12370737-TTTTG-T | ** | |||||||||
5263565-C-A | 5395524-C-A | ** | ||||||||
22613849-C-T | 20451963-C-T | ** | ||||||||
28731323-G-T | 26585176-G-T | ** | ||||||||
28773113-C-A | 26626966-C-A | ** | ||||||||
13742875-A-AGAATG | 11587199-A-AGAATG | 6×GAATG | ** | |||||||
28760178-C-A | 26614031-C-A | ** | ||||||||
3756137-AAG-A | 3888096-AAG-A | ** | ||||||||
5354713-C-CAT | 5486672-C-CAT | 16×AT | ** | |||||||
8901990-TC-T | 9033949-TC-T | ** | ||||||||
20025418-T-C | 17913538-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
56718316-G-C | ** | |||||||||
28728401-C-A | 26582254-C-A | ** | ||||||||
28642804-T-A | 26496657-T-A | ** | ||||||||
58858932-C-T | 56731939-G-A | S3129 | ** | |||||||
4968794-T-G | 5100753-T-G | L815 | ** | |||||||
28632846-G-C | 26486699-G-C | FT108532 | ** | |||||||
13981852-T-C | 11861146-T-C | BY49172 | ** | |||||||
14592787-C-A | 12480987-C-A | FT372083 | ** | |||||||
56718176-G-C | ** | |||||||||
56750046-TA-T | ** | |||||||||
14295275-C-A | 12174569-C-A | ** | ||||||||
22425515-C-G | 20263629-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
26329242-G-A | 24183095-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
25988680-A-G | 23842533-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
22288137-T-C | 20126251-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
20025473-CT-C | 17913593-CT-C | P5_Prx | ** | |||||||
20025451-C-G | 17913571-C-G | P5_Prx | ** | |||||||
14132600-C-T | 12011894-C-T | ** | ||||||||
10654557-T-C | ** | |||||||||
13353746-ATG-A | 11198070-ATG-A | ** | ||||||||
56750062-A-G | ** | |||||||||
13353757-T-C | 11198081-T-C | ** | ||||||||
13455623-C-G | 11299947-C-G | ** | ||||||||
56846246-T-A | ** | |||||||||
56844136-C-A | ** | |||||||||
56835802-CCTTCG-C | ** | |||||||||
28692484-A-G | 26546337-A-G | CTS12754 | ** | |||||||
56750067-A-G | ** | |||||||||
28631447-C-A | 26485300-C-A | ** | ||||||||
7243145-C-A | 7375104-C-A | ** | ||||||||
21383352-C-A | 19221466-C-A | ** | ||||||||
15424336-T-G | 13312456-T-G | ** | ||||||||
10980005-C-A | ** | |||||||||
56750054-T-A | ** | |||||||||
19109973-C-A | 16998093-C-A | ** | ||||||||
13258459-C-A | 11102783-C-A | ** | ||||||||
21836713-C-A | 19674827-C-A | ** | ||||||||
14554491-C-A | 12442692-C-A | ** | ||||||||
17284575-G-T | 15172695-G-T | ** | ||||||||
10921115-C-T | ** | |||||||||
6882518-T-C | 7014477-T-C | ** | ||||||||
24247415-AC-A | 22101268-AC-A | P3_b1 | ** | |||||||
22203760-C-A | 20041874-C-A | ** | ||||||||
15769111-C-A | 13657231-C-A | ** | ||||||||
17158995-GA-G | 15047115-GA-G | ** | ||||||||
18901112-C-A | 16789232-C-A | ** | ||||||||
5576831-C-A | 5708790-C-A | ** | ||||||||
23476162-TA-T | 21314276-TA-T | ** | ||||||||
25995070-G-T | 23848923-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
28622285-A-C | 26476138-A-C | ** | ||||||||
25732854-C-A | 23586707-C-A | P1_b3 | ** | |||||||
28575146-C-A | 26428999-C-A | ** | ||||||||
28511716-A-G | 26365569-A-G | ** | ||||||||
26366462-G-T | 24220315-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26206101-G-T | 24059954-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26133214-C-T | 23987067-C-T | P1_Y1 | ** | |||||||
25887385-A-C | 23741238-A-C | P1_Y1 | ** | |||||||
25733069-C-A | 23586922-C-A | P1_b3 | ** | |||||||
24875542-G-T | 22729395-G-T | g1 | ** | |||||||
6784572-G-A | 6916531-G-A | ** | ||||||||
24509422-T-A | 22363275-T-A | ** | ||||||||
24466342-T-G | 22320195-T-G | ** | ||||||||
23831293-C-G | 21669407-C-G | ** | ||||||||
23810644-C-A | 21648758-C-A | ** | ||||||||
23625484-G-T | 21463598-G-T | ** | ||||||||
23609233-T-C | 21447347-T-C | ** | ||||||||
22330271-C-T | 20168385-C-T | BY217480 | DYZ19 | ** | ||||||
10631412-C-A | ** | |||||||||
4064041-C-A | 4196000-C-A | ** | ||||||||
21154554-C-A | 18992668-C-A | ** | ||||||||
11016467-C-A | ** | |||||||||
4981926-C-A | 5113885-C-A | ** | ||||||||
20104132-G-T | 17992252-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
10787617-C-CATTCA | ** | |||||||||
22013211-C-A | 19851325-C-A | ** | ||||||||
23997634-C-A | 21851487-C-A | ** | ||||||||
13582728-C-A | 11427052-C-A | ** | ||||||||
2701211-T-C | 2833170-T-C | ** | ||||||||
21902119-A-G | 19740233-A-G | ** | ||||||||
6596183-C-A | 6728142-C-A | ** | ||||||||
7250439-C-A | 7382398-C-A | ** | ||||||||
8290758-C-A | 8422717-C-A | ** | ||||||||
56848617-C-A | ** | |||||||||
7270415-C-T | 7402374-C-T | ** | ||||||||
10825284-C-G | ** | |||||||||
28535606-C-A | 26389459-C-A | ** | ||||||||
14186987-C-A | 12066281-C-A | ** | ||||||||
6029016-A-G | 6160975-A-G | ** | ||||||||
21828539-C-A | 19666653-C-A | ** | ||||||||
10863067-C-A | ** | |||||||||
56750059-T-A | ** | |||||||||
10789112-C-A | ** | |||||||||
5449497-G-T | 5581456-G-T | ** | ||||||||
2975515-C-A | 3107474-C-A | ** | ||||||||
7248527-C-A | 7380486-C-A | ** | ||||||||
22587976-G-A | 20426090-G-A | ** | ||||||||
23005405-C-A | 20843519-C-A | ** | ||||||||
22787366-C-A | 20625480-C-A | ** | ||||||||
22076968-C-A | 19915082-C-A | ** | ||||||||
21945292-T-C | 19783406-T-C | ** | ||||||||
13466090-A-C | 11310414-A-C | ** | ||||||||
6490676-C-A | 6622635-C-A | ** | ||||||||
19438309-CG-C | 17326429-CG-C | ** | ||||||||
16783372-C-A | 14671492-C-A | ** | ||||||||
10863032-A-C | ** | |||||||||
23625510-C-T | 21463624-C-T | ** | ||||||||
14427219-C-A | 12306494-C-A | FTA36242 | ** | |||||||
4918875-G-T | 5050834-G-T | ** | ||||||||
22018227-C-A | 19856341-C-A | ** | ||||||||
19510160-T-C | 17398280-T-C | ** | ||||||||
2852764-G-A | 2984723-G-A | ** | ||||||||
2852768-C-G | 2984727-C-G | FT108582 | ** | |||||||
2852776-TA-T | 2984735-TA-T | ** | ||||||||
2852819-A-C | 2984778-A-C | ** | ||||||||
2866371-CG-C | 2998330-CG-C | ** | ||||||||
2906762-G-A | 3038721-G-A | ** | ||||||||
2970732-T-G | 3102691-T-G | ** | ||||||||
2852761-T-G | 2984720-T-G | ** | ||||||||
3032526-C-T | 3164485-C-T | ** | ||||||||
3127378-G-T | 3259337-G-T | ** | ||||||||
3175145-G-T | 3307104-G-T | ** | ||||||||
3175256-G-T | 3307215-G-T | ** | ||||||||
3285216-G-T | 3417175-G-T | ** | ||||||||
3328155-C-A | 3460114-C-A | ** | ||||||||
3367254-C-A | 3499213-C-A | ** | ||||||||
2852762-C-G | 2984721-C-G | ** | ||||||||
2852734-C-T | 2984693-C-T | ** | ||||||||
28627296-C-A | 26481149-C-A | ** | ||||||||
14390015-C-A | 12269311-C-A | ** | ||||||||
3366575-C-A | 3498534-C-A | ** | ||||||||
21115660-C-A | 18953774-C-A | ** | ||||||||
6277752-C-CACT | 6409711-C-CACT | IR3_Dst | ** | |||||||
4374304-C-A | 4506263-C-A | ** | ||||||||
10667159-G-C | ** | |||||||||
10849472-C-A | ** | |||||||||
17346151-T-C | 15234271-T-C | ** | ||||||||
10667242-C-A | FT428687 | ** | ||||||||
2814906-A-G | 2946865-A-G | ** | ||||||||
2683998-G-A | 2815957-G-A | ** | ||||||||
2697466-G-A | 2829425-G-A | ** | ||||||||
2708135-C-A | 2840094-C-A | ** | ||||||||
2767941-G-A | 2899900-G-A | ** | ||||||||
2786002-A-T | 2917961-A-T | ** | ||||||||
2786006-T-G | 2917965-T-G | ** | ||||||||
2788457-G-T | 2920416-G-T | ** | ||||||||
10874944-C-A | ** | |||||||||
22173555-C-A | 20011669-C-A | ** | ||||||||
22079953-T-C | 19918067-T-C | ** | ||||||||
22587970-T-A | 20426084-T-A | ** | ||||||||
13973061-C-A | 11852355-C-A | ** | ||||||||
16428070-C-A | 14316190-C-A | ** | ||||||||
22587975-T-G | 20426089-T-G | ** | ||||||||
7391883-C-A | 7523842-C-A | ** | ||||||||
7107081-A-C | 7239040-A-C | ** | ||||||||
10772622-G-T | ** | |||||||||
5829352-C-A | 5961311-C-A | ** | ||||||||
21457393-G-T | 19295507-G-T | ** | ||||||||
10669328-C-A | ** | |||||||||
18346517-G-A | 16234637-G-A | P6_Prx | ** | |||||||
22448729-T-C | 20286843-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
15775232-T-C | 13663352-T-C | ** | ||||||||
16040948-C-A | 13929068-C-A | ** | ||||||||
22734376-C-A | 20572490-C-A | ** | ||||||||
18636677-C-A | 16524797-C-A | ** | ||||||||
10663831-C-A | ** | |||||||||
10888800-C-A | ** | |||||||||
15137910-C-A | 13025997-C-A | ** | ||||||||
14727350-A-G | 12615418-A-G | ** | ||||||||
3178849-C-A | 3310808-C-A | ** | ||||||||
21473777-C-A | 19311891-C-A | ** | ||||||||
15773606-C-T | 13661726-C-T | ** | ||||||||
10805485-G-T | ** | |||||||||
6826796-A-G | 6958755-A-G | FT259537 | ** | |||||||
13878581-T-A | 11757875-T-A | ** | ||||||||
14960293-G-C | 12848368-G-C | ** | ||||||||
10958665-C-A | ** | |||||||||
4389494-C-A | 4521453-C-A | ** | ||||||||
10787394-C-T | ** | |||||||||
9491972-C-CT | 9654363-C-CT | 8×T | ** | |||||||
18631004-C-A | 16519124-C-A | ** | ||||||||
14884698-GAAAAAAAA-G | 12772764-GAAAAAAAA-G | 26×A | ** | |||||||
10628824-T-C | ** | |||||||||
10628853-T-C | ** | |||||||||
10628858-T-TTCCCC | ** | |||||||||
10628868-T-C | ** | |||||||||
10628877-A-C | ** | |||||||||
20486773-A-AG | 18324887-A-AG | P5_Dst | ** | |||||||
16083582-C-T | 13971702-C-T | ** | ||||||||
22128678-C-A | 19966792-C-A | ** | ||||||||
19479508-C-A | 17367628-C-A | ** | ||||||||
56848712-T-A | ** | |||||||||
6792576-C-A | 6924535-C-A | ** | ||||||||
10914252-C-A | ** | |||||||||
28483541-C-A | 26337394-C-A | ** | ||||||||
18951264-C-A | 16839384-C-A | ** | ||||||||
13433611-C-A | 11277935-C-A | ** | ||||||||
22165079-C-A | 20003193-C-A | ** | ||||||||
22155428-G-A | 19993542-G-A | ** | ||||||||
14427122-G-A | 12306397-G-A | ** | ||||||||
10958827-A-ACACAT | ** | |||||||||
2852758-C-A | 2984717-C-A | ** | ||||||||
21945314-T-A | 19783428-T-A | ** | ||||||||
22155381-C-A | 19993495-C-A | ** | ||||||||
5867542-C-A | 5999501-C-A | ** | ||||||||
5249727-C-A | 5381686-C-A | ** | ||||||||
17379914-C-A | 15268034-C-A | ** | ||||||||
15210983-G-A | 13099069-G-A | ** | ||||||||
10863022-C-A | ** | |||||||||
10848562-C-A | ** | |||||||||
10958670-C-A | ** | |||||||||
7028699-C-A | 7160658-C-A | ** | ||||||||
15761214-C-A | 13649334-C-A | ** | ||||||||
22203773-T-A | 20041887-T-A | ** | ||||||||
22314929-C-A | 20153043-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22253207-G-T | 20091321-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
14845343-G-T | 12733409-G-T | ** | ||||||||
8172786-A-C | 8304745-A-C | ** | ||||||||
7646617-G-T | 7778576-G-T | ** | ||||||||
2843931-G-T | 2975890-G-T | ** | ||||||||
22901935-C-A | 20740049-C-A | ** | ||||||||
22252462-G-A | 20090576-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
22425351-G-C | 20263465-G-C | DYZ19 | ** | |||||||
20815832-C-A | 18653946-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
16424624-G-T | 14312744-G-T | ** | ||||||||
22962031-TTTTTG-G,T | 20800145-TTTTTG-G,T | *** | ||||||||
27713539-G-T | 25567392-G-T | P1_Y2 | *** | |||||||
28428920-AAG-A | 26282773-AAG-A | P1_gr2 | *** | |||||||
13455785-AGTCCAT-A,ATTCCAT | 11300109-AGTCCAT-A,ATTCCAT | *** | ||||||||
28766455-G-A | 26620308-G-A | *** | ||||||||
9309746-T-C | 9472137-T-C | *** | ||||||||
6624551-T-C | 6756510-T-C | *** | ||||||||
15332293-A-T | 13220411-A-T | *** | ||||||||
28664981-G-T | 26518834-G-T | *** | ||||||||
16627747-T-C | 14515867-T-C | *** | ||||||||
17006261-CTTT-C,CTTTT | 14894381-CTTT-C,CTTTT | 17×T | *** | |||||||
23463328-C-A | 21301442-C-A | *** | ||||||||
56828937-TCCATTCCATTCCAT-T,TCCATTCC | *** | |||||||||
28551566-G-T | 26405419-G-T | *** | ||||||||
23741955-G-T | 21580069-G-T | FTB69913 | *** | |||||||
28551652-C-A | 26405505-C-A | *** | ||||||||
13812083-A-G | 11691377-A-G | *** | ||||||||
19476799-C-A | 17364919-C-A | *** | ||||||||
13831930-A-T | 11711224-A-T | *** | ||||||||
13686815-A-G | 11531139-A-G | *** | ||||||||
13832905-G-T | 11712199-G-T | *** | ||||||||
13664359-GAATGTAATCA-G | 11508683-GAATGTAATCA-G | *** | ||||||||
13818648-T-C | 11697942-T-C | *** | ||||||||
13813941-C-T | 11693235-C-T | FT328456 | *** | |||||||
13824021-A-G | 11703315-A-G | FT422595 | *** | |||||||
13451183-C-T | 11295507-C-T | *** | ||||||||
28801768-C-A | 26655621-C-A | *** | ||||||||
58973970-CCAGTG-C | 56827823-CCAGTG-C | *** | ||||||||
13831925-C-T | 11711219-C-T | *** | ||||||||
13700109-C-T | 11544433-C-T | *** | ||||||||
13817341-C-T | 11696635-C-T | FT186074 | *** | |||||||
58977211-T-A | 56831064-T-A | *** | ||||||||
28801766-A-G | 26655619-A-G | *** | ||||||||
13853062-GGAGTC-G | 11732356-GGAGTC-G | *** | ||||||||
6403635-C-CATATATGTTATATTTGTTGGTGAT | 6535594-C-CATATATGTTATATTTGTTGGTGAT | *** | ||||||||
9318323-G-A | 9480714-G-A | *** | ||||||||
13138826-C-T | 10628312-C-T | *** | ||||||||
13456578-G-A | 11300902-G-A | *** | ||||||||
13801561-G-GTGGAATGGAATCGAA | 11680855-G-GTGGAATGGAATCGAA | *** | ||||||||
13818655-G-C | 11697949-G-C | *** | ||||||||
13823996-G-A | 11703290-G-A | *** | ||||||||
13838369-A-G | 11717663-A-G | *** | ||||||||
13856281-T-G | 11735575-T-G | *** | ||||||||
13868854-C-T | 11748148-C-T | *** | ||||||||
13676799-A-T | 11521123-A-T | *** | ||||||||
13861683-C-G | 11740977-C-G | *** | ||||||||
22365041-C-T | 20203155-C-T | DYZ19 | *** | |||||||
9985752-CA-T | 10148143-CA-T | *** | ||||||||
27637200-A-T | 25491053-A-T | Z16272 | A18826 | P1_Y2 | *** | |||||
28800316-C-G | 26654169-C-G | *** | ||||||||
13138113-C-T | 10627599-C-T | *** | ||||||||
13455170-T-C | 11299494-T-C | *** | ||||||||
13832889-A-T | 11712183-A-T | *** | ||||||||
13854169-G-A | 11733463-G-A | *** | ||||||||
13854173-T-G | 11733467-T-G | *** | ||||||||
13138153-C-T | 10627639-C-T | *** | ||||||||
13456571-A-C | 11300895-A-C | *** | ||||||||
13669482-A-G | 11513806-A-G | *** | ||||||||
13823292-A-G | 11702586-A-G | *** | ||||||||
13860015-G-C | 11739309-G-C | *** | ||||||||
13823159-A-G | 11702453-A-G | *** | ||||||||
13860017-C-G | 11739311-C-G | *** | ||||||||
13860020-G-GACACA | 11739314-G-GACACA | *** | ||||||||
13458412-ATTCCC-A | 11302736-ATTCCC-A | *** | ||||||||
13824917-T-C | 11704211-T-C | *** | ||||||||
13837539-G-A | 11716833-G-A | *** | ||||||||
58979670-G-C | 56833523-G-C | *** | ||||||||
13858419-C-G | 11737713-C-G | *** | ||||||||
13679959-A-T | 11524283-A-T | *** | ||||||||
13810732-C-T | 11690026-C-T | *** | ||||||||
13859792-T-A,C | 11739086-T-A,C | *** | ||||||||
13681115-A-G | 11525439-A-G | *** | ||||||||
13832647-C-G | 11711941-C-G | *** | ||||||||
22249237-T-C | 20087351-T-C | DYZ19 | *** | |||||||
22453305-C-T | 20291419-C-T | DYZ19 | *** | |||||||
19054294-C-A | 16942414-C-A | FTA9137 | *** | |||||||
8119444-C-A | 8251403-C-A | *** | ||||||||
13466065-T-A | 11310389-T-A | *** | ||||||||
18819700-C-A | 16707820-C-A | *** | ||||||||
17885036-C-A | 15773156-C-A | *** | ||||||||
4925960-T-C | 5057919-T-C | *** | ||||||||
5869694-C-A | 6001653-C-A | *** | ||||||||
6427073-C-A | 6559032-C-A | *** | ||||||||
6427419-T-C | 6559378-T-C | *** | ||||||||
13835394-C-G | 11714688-C-G | *** | ||||||||
6978246-T-C | 7110205-T-C | *** | ||||||||
7166634-ATATATA-A,ATATATATATAT | 7298593-ATATATA-A,ATATATATATAT | *** | ||||||||
8104776-C-A | 8236735-C-A | *** | ||||||||
8351814-C-A | 8483773-C-A | *** | ||||||||
16550957-C-A | 14439077-C-A | *** | ||||||||
8791036-C-A | 8922995-C-A | *** | ||||||||
10033473-C-A | 10195864-C-A | *** | ||||||||
10667004-C-GTGTTA | *** | |||||||||
10667046-T-A | *** | |||||||||
10764532-T-C | *** | |||||||||
10875751-C-CTTTCA | *** | |||||||||
13213746-G-A | 11058070-G-A | *** | ||||||||
15911417-C-A | 13799537-C-A | *** | ||||||||
16245943-G-A | 14134063-G-A | *** | ||||||||
16719779-T-C | 14607899-T-C | *** | ||||||||
18059998-C-A | 15948118-C-A | *** | ||||||||
18916530-GAAA-G | 16804650-GAAA-G | 12×A | *** | |||||||
9462189-G-T | 9624580-G-T | *** | ||||||||
8172843-A-T | 8304802-A-T | *** | ||||||||
24172352-CTT-C | 22026205-CTT-C | P3_b1 | 16×T | *** | ||||||
7166660-A-T | 7298619-A-T | *** | ||||||||
26658219-T-C | 24512072-T-C | P1_g2 | *** | |||||||
28785854-G-A | 26639707-G-A | *** | ||||||||
13686897-C-CGAATG,G | 11531221-C-CGAATG,G | *** | ||||||||
4853215-GTA-G | 4985174-GTA-G | *** | ||||||||
14949304-C-A | 12837378-C-A | *** | ||||||||
10987513-C-A | *** | |||||||||
5644667-C-A | 5776626-C-A | *** | ||||||||
9047943-C-A | 9210334-C-A | *** | ||||||||
10660944-C-A | *** | |||||||||
10662487-C-A | *** | |||||||||
7935852-T-C | 8067811-T-C | *** | ||||||||
10796647-C-CGGAAG | *** | |||||||||
13468566-C-G | 11312890-C-G | *** | ||||||||
10057140-C-A | 10219531-C-A | *** | ||||||||
10938669-C-A | *** | |||||||||
28510499-C-A | 26364352-C-A | *** | ||||||||
14240585-C-A | 12119879-C-A | *** | ||||||||
7705624-C-A | 7837583-C-A | *** | ||||||||
11663265-A-T | *** | |||||||||
6664349-T-G | 6796308-T-G | *** | ||||||||
7282557-C-A | 7414516-C-A | *** | ||||||||
23054292-C-A | 20892406-C-A | *** | ||||||||
13482060-T-A | 11326384-T-A | *** | ||||||||
13466029-G-A | 11310353-G-A | *** | ||||||||
10796682-C-CCCTGCACTCGCGTTG | *** | |||||||||
10847023-C-A | *** | |||||||||
56861812-CAAAAA-C,CAAAA | 26×A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: N114168 | 10709131 | 7749761 | 7829284 |
Kit: N114168 | 9696724 | 7906559 | 7798456 |
Kit: N114168 | 14992587 | 9377119 | 8321391 |
Used in age calculations | 14992587 | 9377119 | 8321391 |
Counts of SNPs | 6 | 6 |
Big Tree Main Page