Laugesgard
FTDNA: 254745, BigY2: 254745MDKA Birth:

Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 254745 | BigY2 254745 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
26067757-G-T | 23921610-G-T | P1_Y1 | *** | A* | ||||||
13687822-G-A | 11532146-G-A | A* | ||||||||
25575423-G-A | 23429276-G-A | P1_gr1 | A* | |||||||
6189807-G-C | 6321766-G-C | BY59436 | IR3_Dst | *** | + | |||||
14266867-C-A | 12146161-C-A | Y66319 | Y | Y | + | + | ||||
15750139-T-C | 13638259-T-C | Y68812 | Y | Y | + | + | ||||
17695046-A-G | 15583166-A-G | Y72174 | Y | Y | + | + | ||||
18167202-A-T | 16055322-A-T | Y73201 | Y | Y | + | + | ||||
22288322-A-T | 20126436-A-T | DYZ19 | *** | * | ||||||
22309893-C-A | 20148007-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
6001604-C-A | 6133563-C-A | ** | ||||||||
17713849-TC-T | 15601969-TC-T | ** | ||||||||
18189585-C-A | 16077705-C-A | FT330782 | ** | |||||||
22232834-G-T | 20070948-G-T | ZS3104 | DYZ19 | ** | ||||||
15109457-A-T | 12997544-A-T | 14×T | ** | |||||||
10057389-C-T | 10219780-C-T | ** | ||||||||
26272543-C-A | 24126396-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
13313810-C-A | 11158134-C-A | ** | ||||||||
27904477-T-TC | 25758330-T-TC | P1_Y2 | ** | |||||||
3732638-C-A | 3864597-C-A | ** | ||||||||
22997668-C-A | 20835782-C-A | ** | ||||||||
13860946-C-A | 11740240-C-A | ** | ||||||||
14449875-C-A | 12329148-C-A | ** | ||||||||
10764700-G-A | FT383787 | ** | ||||||||
10764710-T-C | ** | |||||||||
21391650-C-A | 19229764-C-A | 14×T | ** | |||||||
23997460-C-A | 21851313-C-A | FT244429 | ** | |||||||
16466651-G-T | 14354771-G-T | ** | ||||||||
5249141-T-G | 5381100-T-G | ** | ||||||||
6978258-C-A | 7110217-C-A | ** | ||||||||
11037378-C-A | ** | |||||||||
22259177-C-A | 20097291-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
14038254-C-A | 11917548-C-A | ** | ||||||||
10666965-G-T | ** | |||||||||
11653065-N-A | ** | |||||||||
11653066-N-T | ** | |||||||||
11653067-N-A | ** | |||||||||
11653068-N-G | ** | |||||||||
11653069-N-C | ** | |||||||||
11653070-N-A | ** | |||||||||
11653071-N-A | ** | |||||||||
11653072-N-G | ** | |||||||||
11653073-N-G | ** | |||||||||
11653074-N-T | ** | |||||||||
11653075-N-A | ** | |||||||||
11653077-N-T | ** | |||||||||
11653078-N-T | ** | |||||||||
11653079-N-G | ** | |||||||||
11653080-N-T | ** | |||||||||
11653081-N-T | ** | |||||||||
11653082-N-T | ** | |||||||||
11653083-N-C | ** | |||||||||
11653085-N-A | ** | |||||||||
11653086-N-G | ** | |||||||||
11653087-N-T | ** | |||||||||
11653088-N-G | ** | |||||||||
11653089-N-C | ** | |||||||||
11653090-N-C | ** | |||||||||
11653091-N-T | ** | |||||||||
11653092-N-T | ** | |||||||||
11653093-N-G | ** | |||||||||
11653094-N-G | ** | |||||||||
11653095-N-A | ** | |||||||||
11653096-N-A | ** | |||||||||
11653097-N-T | ** | |||||||||
11653098-N-C | ** | |||||||||
11653099-N-A | ** | |||||||||
11653100-N-A | ** | |||||||||
11653101-N-A | ** | |||||||||
11653102-N-TGCTATGTAATCAATTAGAAAGGAAAGGAATGCAATTGAGTGGA | ** | |||||||||
10972096-C-A | ** | |||||||||
10773211-C-A | ** | |||||||||
10884644-C-A | ** | |||||||||
22309910-C-T | 20148024-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
4925220-C-A | 5057179-C-A | ** | ||||||||
9590560-T-TC | 9752951-T-TC | IR3_Prx | ** | |||||||
13218720-C-A | 11063044-C-A | ** | ||||||||
13958525-T-C | 11837819-T-C | ** | ||||||||
14270677-C-A | 12149971-C-A | ** | ||||||||
22809954-C-A | 20648068-C-A | Z30694 | ** | |||||||
10987583-G-C | ** | |||||||||
10671299-C-A | ** | |||||||||
28483730-C-A | 26337583-C-A | ** | ||||||||
10868747-C-A | ** | |||||||||
11649737-G-T | ** | |||||||||
4302114-C-A | 4434073-C-A | ** | ||||||||
13234468-T-C | 11078792-T-C | ** | ||||||||
10655314-G-T | ** | |||||||||
13460311-C-A | 11304635-C-A | ** | ||||||||
17770402-C-A | 15658522-C-A | ** | ||||||||
17492210-C-A | 15380330-C-A | ** | ||||||||
17153490-C-A | 15041610-C-A | ** | ||||||||
13952562-C-A | 11831856-C-A | ** | ||||||||
10970889-C-A | ** | |||||||||
17798909-C-A | 15687029-C-A | ** | ||||||||
11653076-N-A | ** | |||||||||
14372107-C-G | 12251403-C-G | ** | ||||||||
15495134-C-A | 13383254-C-A | ** | ||||||||
10998651-C-A | ** | |||||||||
7164135-A-T | 7296094-A-T | ** | ||||||||
5708483-C-A | 5840442-C-A | FT263448 | ** | |||||||
10690870-C-T | ** | |||||||||
8295435-C-A | 8427394-C-A | ** | ||||||||
6646110-C-A | 6778069-C-A | ** | ||||||||
16092672-C-A | 13980792-C-A | ** | ||||||||
3815337-G-T | 3947296-G-T | ** | ||||||||
28017188-A-AG | 25871041-A-AG | P1_Y2 | ** | |||||||
10094206-C-A | 10256597-C-A | ** | ||||||||
14301921-C-T | 12181215-C-T | FT362958 | ** | |||||||
15865918-C-A | 13754038-C-A | ** | ||||||||
4213293-C-A | 4345252-C-A | ** | ||||||||
4408323-C-A | 4540282-C-A | ** | ||||||||
4143686-C-A | 4275645-C-A | ** | ||||||||
9967200-C-A | 10129591-C-A | ** | ||||||||
15495116-A-G | 13383236-A-G | ** | ||||||||
21467938-C-A | 19306052-C-A | ** | ||||||||
10815287-A-G | ** | |||||||||
16062140-C-A | 13950260-C-A | ** | ||||||||
21268022-C-A | 19106136-C-A | FT56363 | ** | |||||||
6756867-C-A | 6888826-C-A | ** | ||||||||
3832282-G-A | 3964241-G-A | ** | ||||||||
10817682-G-T | ** | |||||||||
17426834-C-A | 15314954-C-A | ** | ||||||||
28730119-C-A | 26583972-C-A | FT112419 | ** | |||||||
10884671-C-A | ** | |||||||||
9958015-C-A | 10120406-C-A | ** | ||||||||
17492173-C-A | 15380293-C-A | ** | ||||||||
21115623-C-A | 18953737-C-A | ** | ||||||||
14074038-C-A | 11953332-C-A | ** | ||||||||
16028291-C-A | 13916411-C-A | ** | ||||||||
8673244-C-A | 8805203-C-A | ** | ||||||||
19464885-C-A | 17353005-C-A | ** | ||||||||
22775024-C-A | 20613138-C-A | ** | ||||||||
11029845-C-A | ** | |||||||||
9076059-C-A | 9238450-C-A | ** | ||||||||
10777076-C-T | ** | |||||||||
15495138-A-C | 13383258-A-C | ** | ||||||||
24336794-T-TC | 22190647-T-TC | P3_t1 | ** | |||||||
4471309-C-A | 4603268-C-A | ** | ||||||||
2790596-C-A | 2922555-C-A | ** | ||||||||
10888473-C-G | ** | |||||||||
15684456-C-A | 13572576-C-A | ** | ||||||||
16429822-G-T | 14317942-G-T | ** | ||||||||
13527743-C-A | 11372067-C-A | ** | ||||||||
28719239-C-A | 26573092-C-A | FT148154 | ** | |||||||
28679554-C-A | 26533407-C-A | ** | ||||||||
17029028-C-A | 14917148-C-A | ** | ||||||||
5336899-G-T | 5468858-G-T | ** | ||||||||
10815291-C-T | ** | |||||||||
28597305-C-A | 26451158-C-A | ** | ||||||||
21241892-C-A | 19080006-C-A | ** | ||||||||
13930064-C-A | 11809358-C-A | ** | ||||||||
19072024-C-A | 16960144-C-A | ** | ||||||||
3804762-T-TA | 3936721-T-TA | ** | ||||||||
20700739-T-A | 18538853-T-A | P4_Prx | ** | |||||||
28700621-C-A | 26554474-C-A | ** | ||||||||
10847042-C-A | ** | |||||||||
10843808-C-A | ** | |||||||||
9414551-C-A | 9576942-C-A | ** | ||||||||
2745845-T-C | 2877804-T-C | ** | ||||||||
2788998-T-C | 2920957-T-C | ** | ||||||||
3013089-C-A | 3145048-C-A | FT81111 | ** | |||||||
3049116-C-T | 3181075-C-T | ** | ||||||||
3077033-G-T | 3208992-G-T | ** | ||||||||
3086568-C-A | 3218527-C-A | ** | ||||||||
3106168-C-A | 3238127-C-A | ** | ||||||||
3106852-G-T | 3238811-G-T | ** | ||||||||
3131711-G-A | 3263670-G-A | ** | ||||||||
3155841-T-C | 3287800-T-C | ** | ||||||||
3272006-A-T | 3403965-A-T | ** | ||||||||
3272261-C-A | 3404220-C-A | ** | ||||||||
3285515-A-G | 3417474-A-G | ** | ||||||||
3341462-G-A | 3473421-G-A | ** | ||||||||
3347711-C-A | 3479670-C-A | ** | ||||||||
3439727-T-A | 3571686-T-A | ** | ||||||||
3439777-T-C | 3571736-T-C | ** | ||||||||
3439842-G-A | 3571801-G-A | ** | ||||||||
3482455-G-A | 3614414-G-A | ** | ||||||||
3491930-G-T | 3623889-G-T | ** | ||||||||
3559118-A-T | 3691077-A-T | ** | ||||||||
3559638-T-C | 3691597-T-C | ** | ||||||||
3559835-C-A | 3691794-C-A | ** | ||||||||
3633524-A-T | 3765483-A-T | ** | ||||||||
3830775-T-G | 3962734-T-G | ** | ||||||||
3832318-G-A | 3964277-G-A | ** | ||||||||
3834439-C-G | 3966398-C-G | ** | ||||||||
3834446-A-G | 3966405-A-G | ** | ||||||||
3834471-G-C | 3966430-G-C | ** | ||||||||
3850274-A-C | 3982233-A-C | ** | ||||||||
3860572-C-A | 3992531-C-A | ** | ||||||||
3882347-G-T | 4014306-G-T | ** | ||||||||
3960092-A-C | 4092051-A-C | ** | ||||||||
3979906-G-T | 4111865-G-T | ** | ||||||||
3990314-C-A | 4122273-C-A | ** | ||||||||
4003126-C-A | 4135085-C-A | ** | ||||||||
4098543-C-T | 4230502-C-T | ** | ||||||||
4116907-G-T | 4248866-G-T | ** | ||||||||
4118665-G-A | 4250624-G-A | FT211344 | ** | |||||||
4155351-C-A | 4287310-C-A | ** | ||||||||
4170602-G-T | 4302561-G-T | ** | ||||||||
4194142-C-A | 4326101-C-A | ** | ||||||||
4241245-G-A | 4373204-G-A | ** | ||||||||
4272536-G-T | 4404495-G-T | ** | ||||||||
4331261-T-C | 4463220-T-C | ** | ||||||||
4438690-A-C | 4570649-A-C | ** | ||||||||
4528053-T-A | 4660012-T-A | ** | ||||||||
4598765-C-T | 4730724-C-T | ** | ||||||||
4647803-C-A | 4779762-C-A | ** | ||||||||
4703040-A-G | 4834999-A-G | ** | ||||||||
4752730-C-A | 4884689-C-A | ** | ||||||||
4756758-A-T | 4888717-A-T | ** | ||||||||
4925087-T-G | 5057046-T-G | ** | ||||||||
4958512-G-T | 5090471-G-T | ** | ||||||||
5120170-T-C | 5252129-T-C | ** | ||||||||
5126966-C-A | 5258925-C-A | ** | ||||||||
5165819-C-A | 5297778-C-A | ** | ||||||||
5172334-C-A | 5304293-C-A | ** | ||||||||
5249786-A-C | 5381745-A-C | ** | ||||||||
5274213-A-G | 5406172-A-G | ** | ||||||||
5358956-T-C | 5490915-T-C | ** | ||||||||
5421197-A-C | 5553156-A-C | ** | ||||||||
5423044-C-A | 5555003-C-A | ** | ||||||||
5449365-T-A | 5581324-T-A | ** | ||||||||
5528257-T-G | 5660216-T-G | ** | ||||||||
5557334-A-T | 5689293-A-T | ** | ||||||||
5559918-C-A | 5691877-C-A | ** | ||||||||
5577733-C-A | 5709692-C-A | ** | ||||||||
5583834-G-T | 5715793-G-T | ** | ||||||||
5653474-C-A | 5785433-C-A | ** | ||||||||
5691175-C-A | 5823134-C-A | ** | ||||||||
5715903-G-T | 5847862-G-T | ** | ||||||||
5720986-A-C | 5852945-A-C | ** | ||||||||
5754914-A-T | 5886873-A-T | ** | ||||||||
5785136-G-A | 5917095-G-A | ** | ||||||||
5858211-T-C | 5990170-T-C | ** | ||||||||
5867404-C-A | 5999363-C-A | ** | ||||||||
5876222-G-T | 6008181-G-T | ** | ||||||||
5883930-G-T | 6015889-G-T | ** | ||||||||
5957339-T-C | 6089298-T-C | ** | ||||||||
6024471-C-A | 6156430-C-A | ** | ||||||||
6148757-A-G | 6280716-A-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6369471-T-A | 6501430-T-A | ** | ||||||||
6369549-G-T | 6501508-G-T | ** | ||||||||
6452792-C-A | 6584751-C-A | ** | ||||||||
6474851-A-C | 6606810-A-C | ** | ||||||||
6511946-C-A | 6643905-C-A | ** | ||||||||
6690450-C-A | 6822409-C-A | ** | ||||||||
6770897-C-A | 6902856-C-A | ** | ||||||||
7003813-C-A | 7135772-C-A | ** | ||||||||
7039170-C-A | 7171129-C-A | ** | ||||||||
7058278-C-T | 7190237-C-T | ** | ||||||||
7142238-G-C | 7274197-G-C | ** | ||||||||
7159180-T-C | 7291139-T-C | ** | ||||||||
7174497-C-T | 7306456-C-T | ** | ||||||||
7201363-G-T | 7333322-G-T | ** | ||||||||
7238294-T-C | 7370253-T-C | ** | ||||||||
7255015-A-G | 7386974-A-G | ** | ||||||||
7314645-C-A | 7446604-C-A | ** | ||||||||
7348585-G-T | 7480544-G-T | ** | ||||||||
7414052-A-G | 7546011-A-G | ** | ||||||||
7451323-TG-T | 7583282-TG-T | IR1_L | ** | |||||||
7537703-C-A | 7669662-C-A | ** | ||||||||
7918127-G-T | 8050086-G-T | ** | ||||||||
7996217-C-A | 8128176-C-A | ** | ||||||||
8371661-C-A | 8503620-C-A | ** | ||||||||
8661198-C-A | 8793157-C-A | ** | ||||||||
8723918-A-G | 8855877-A-G | ** | ||||||||
8731132-C-A | 8863091-C-A | ** | ||||||||
8741524-A-G | 8873483-A-G | ** | ||||||||
8814740-C-A | 8946699-C-A | ** | ||||||||
9015615-A-G | 9178006-A-G | ** | ||||||||
9147013-G-T | 9309404-G-T | ** | ||||||||
9306673-G-A | 9469064-G-A | ** | ||||||||
9373578-A-T | 9535969-A-T | ** | ||||||||
9492192-T-C | 9654583-T-C | ** | ||||||||
9493478-C-A | 9655869-C-A | ** | ||||||||
9826025-C-A | 9988416-C-A | ** | ||||||||
9957658-C-A | 10120049-C-A | ** | ||||||||
9965354-G-T | 10127745-G-T | ** | ||||||||
9965417-G-C | 10127808-G-C | ** | ||||||||
9993358-G-A | 10155749-G-A | ** | ||||||||
10037814-A-G | 10200205-A-G | ** | ||||||||
10041133-CT-C | 10203524-CT-C | ** | ||||||||
10057390-A-G | 10219781-A-G | ** | ||||||||
10057405-C-T | 10219796-C-T | ** | ||||||||
10057408-G-A | 10219799-G-A | ** | ||||||||
10082483-G-T | 10244874-G-T | ** | ||||||||
10622961-T-C | ** | |||||||||
10632731-C-A | ** | |||||||||
10651907-T-A | ** | |||||||||
10657064-G-T | ** | |||||||||
10660094-A-G | ** | |||||||||
10663062-T-C | ** | |||||||||
10663383-T-G | ** | |||||||||
10682834-C-T | ** | |||||||||
10687147-C-A | ** | |||||||||
10693481-C-G | ** | |||||||||
10745279-T-C | ** | |||||||||
10757670-G-A | FT91634 | ** | ||||||||
10764679-C-T | ** | |||||||||
10769745-C-T | ** | |||||||||
10772640-C-A | ** | |||||||||
10775894-C-A | ** | |||||||||
10775920-C-A | ** | |||||||||
10776290-A-T | ** | |||||||||
10790496-C-A | ** | |||||||||
10796143-G-GTTCCA | ** | |||||||||
10796187-C-T | ** | |||||||||
10796191-C-T | ** | |||||||||
10815243-T-A | ** | |||||||||
10815247-G-A | ** | |||||||||
10815250-A-C | ** | |||||||||
10815254-C-T | FT432417 | ** | ||||||||
10815298-T-C | ** | |||||||||
10815299-T-A | ** | |||||||||
10815305-C-T | ** | |||||||||
10838229-G-T | ** | |||||||||
10845876-C-A | ** | |||||||||
10851295-C-A | ** | |||||||||
10859665-C-G | ** | |||||||||
10876101-C-A | ** | |||||||||
10895519-C-A | ** | |||||||||
10898954-C-A | ** | |||||||||
10899381-C-T | ** | |||||||||
10899424-C-A | ** | |||||||||
10899464-C-G | ** | |||||||||
10900669-C-A | ** | |||||||||
10921805-T-C | ** | |||||||||
10938803-G-A | ** | |||||||||
10943805-C-A | ** | |||||||||
10981789-C-A | ** | |||||||||
10983436-C-A | ** | |||||||||
10986064-C-T | ** | |||||||||
10990254-C-T | ** | |||||||||
10997768-C-T | ** | |||||||||
11004809-C-A | ** | |||||||||
11008978-C-A | ** | |||||||||
11012239-C-A | ** | |||||||||
11013664-C-A | ** | |||||||||
11025791-C-A | ** | |||||||||
11029173-C-A | ** | |||||||||
11032160-T-A | ** | |||||||||
11032228-C-G | ** | |||||||||
11035206-C-G | ** | |||||||||
13206447-C-A | 11050771-C-A | ** | ||||||||
13256120-G-T | 11100444-G-T | ** | ||||||||
13284538-G-T | 11128862-G-T | ** | ||||||||
13354781-C-A | 11199105-C-A | ** | ||||||||
13354877-C-A | 11199201-C-A | ** | ||||||||
13542264-T-A | 11386588-T-A | ** | ||||||||
13591460-G-A | 11435784-G-A | ** | ||||||||
13592227-C-T | 11436551-C-T | ** | ||||||||
13606537-A-C | 11450861-A-C | ** | ||||||||
13606762-C-G | 11451086-C-G | ** | ||||||||
13614404-G-T | 11458728-G-T | ** | ||||||||
13709497-A-G | 11553821-A-G | ** | ||||||||
11647381-G-A | FT424348 | ** | ||||||||
11647413-A-G | ** | |||||||||
11649922-G-C | ** | |||||||||
11653084-N-A | ** | |||||||||
11658722-G-T | FT229985 | ** | ||||||||
11671705-G-T | ** | |||||||||
13801001-A-G | 11680295-A-G | ** | ||||||||
13872805-A-G | 11752099-A-G | ** | ||||||||
13935992-C-A | 11815286-C-A | ** | ||||||||
13943234-C-A | 11822528-C-A | ** | ||||||||
13956864-C-T | 11836158-C-T | ** | ||||||||
13999399-T-C | 11878693-T-C | ** | ||||||||
13999449-T-C | 11878743-T-C | FT29631 | ** | |||||||
14046612-A-C | 11925906-A-C | ** | ||||||||
14051730-C-A | 11931024-C-A | ** | ||||||||
14107585-C-A | 11986879-C-A | ** | ||||||||
14246722-A-T | 12126016-A-T | ** | ||||||||
14302975-T-C | 12182269-T-C | ** | ||||||||
14307813-C-A | 12187107-C-A | ** | ||||||||
14371991-C-G | 12251287-C-G | ** | ||||||||
14371997-A-G | 12251293-A-G | ** | ||||||||
14371999-T-A | 12251295-T-A | ** | ||||||||
14372087-C-G | 12251383-C-G | ** | ||||||||
14422610-T-C | 12301885-T-C | ** | ||||||||
14539609-G-A | 12427810-G-A | ** | ||||||||
14569361-C-A | 12457561-C-A | ** | ||||||||
14660367-C-T | 12548432-C-T | ** | ||||||||
14715405-C-T | 12603472-C-T | ** | ||||||||
14741388-T-C | 12629456-T-C | ** | ||||||||
14802913-C-A | 12690984-C-A | ** | ||||||||
14959645-A-G | 12847720-A-G | ** | ||||||||
14989010-C-A | 12877076-C-A | ** | ||||||||
15168106-T-G | 13056192-T-G | ** | ||||||||
15334561-A-G | 13222679-A-G | ** | ||||||||
15396968-C-A | 13285088-C-A | ** | ||||||||
15401213-C-G | 13289333-C-G | ** | ||||||||
15475221-A-C | 13363341-A-C | ** | ||||||||
15495118-T-C | 13383238-T-C | ** | ||||||||
15495131-G-T | 13383251-G-T | ** | ||||||||
15495146-G-A | 13383266-G-A | ** | ||||||||
15530178-C-A | 13418298-C-A | ** | ||||||||
15642936-G-T | 13531056-G-T | ** | ||||||||
15698815-T-C | 13586935-T-C | ** | ||||||||
15760366-T-C | 13648486-T-C | ** | ||||||||
15916389-T-C | 13804509-T-C | ** | ||||||||
15988011-C-A | 13876131-C-A | ** | ||||||||
15995526-C-A | 13883646-C-A | ** | ||||||||
16040950-C-A | 13929070-C-A | ** | ||||||||
16384726-GT-G | 14272846-GT-G | ** | ||||||||
16503729-A-T | 14391849-A-T | ** | ||||||||
16506127-G-T | 14394247-G-T | ** | ||||||||
16562822-G-T | 14450942-G-T | ** | ||||||||
16590711-C-A | 14478831-C-A | ** | ||||||||
16590877-A-G | 14478997-A-G | ** | ||||||||
16620283-C-A | 14508403-C-A | ** | ||||||||
16621534-T-C | 14509654-T-C | ** | ||||||||
16622676-A-T | 14510796-A-T | ** | ||||||||
16652743-G-T | 14540863-G-T | ** | ||||||||
16702791-G-A | 14590911-G-A | ** | ||||||||
16885122-T-C | 14773242-T-C | ** | ||||||||
16926244-C-A | 14814364-C-A | ** | ||||||||
17535609-C-A | 15423729-C-A | ** | ||||||||
17549621-C-A | 15437741-C-A | ** | ||||||||
17597885-G-T | 15486005-G-T | ** | ||||||||
17605446-A-T | 15493566-A-T | ** | ||||||||
17757600-G-C | 15645720-G-C | ** | ||||||||
17779431-C-A | 15667551-C-A | ** | ||||||||
18053602-T-A | 15941722-T-A | ** | ||||||||
18086140-T-A | 15974260-T-A | ** | ||||||||
18187561-C-T | 16075681-C-T | ** | ||||||||
18270498-G-A | 16158618-G-A | ** | ||||||||
18343604-T-TC | 16231724-T-TC | P6_Prx | ** | |||||||
18401103-G-T | 16289223-G-T | P6_Gap | ** | |||||||
18554307-A-G | 16442427-A-G | ** | ||||||||
18580220-C-A | 16468340-C-A | ** | ||||||||
18660044-A-G | 16548164-A-G | ** | ||||||||
18847694-T-A | 16735814-T-A | ** | ||||||||
18864459-A-G | 16752579-A-G | ** | ||||||||
19065999-A-G | 16954119-A-G | ** | ||||||||
19246803-T-C | 17134923-T-C | ** | ||||||||
19352079-G-T | 17240199-G-T | ** | ||||||||
19463789-G-A | 17351909-G-A | ** | ||||||||
19668758-G-T | 17556878-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19668786-A-AT | 17556906-A-AT | P5_Prx | ** | |||||||
19689568-T-C | 17577688-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
20084412-C-CTTTA | 17972532-C-CTTTA | P5_Dst | ** | |||||||
20641609-G-GAGAA | 18479723-G-GAGAA | P4_Prx | ** | |||||||
20693260-T-C | 18531374-T-C | P4_Prx | ** | |||||||
21153679-G-T | 18991793-G-T | ** | ||||||||
21153689-T-C | 18991803-T-C | ** | ||||||||
21321670-G-T | 19159784-G-T | ** | ||||||||
21361959-C-A | 19200073-C-A | ** | ||||||||
21362846-T-C | 19200960-T-C | ** | ||||||||
21503186-T-A | 19341300-T-A | ** | ||||||||
21535076-AT-A | 19373190-AT-A | ** | ||||||||
21582742-C-A | 19420856-C-A | ** | ||||||||
21596949-C-A | 19435063-C-A | ** | ||||||||
21597208-G-T | 19435322-G-T | ** | ||||||||
21597486-C-A | 19435600-C-A | ** | ||||||||
21672063-G-T | 19510177-G-T | ** | ||||||||
21681655-A-G | 19519769-A-G | ** | ||||||||
21697310-C-A | 19535424-C-A | ** | ||||||||
21807094-C-A | 19645208-C-A | ** | ||||||||
22048845-C-A | 19886959-C-A | ** | ||||||||
22058992-C-A | 19897106-C-A | ** | ||||||||
22078171-C-A | 19916285-C-A | ** | ||||||||
22090043-A-T | 19928157-A-T | ** | ||||||||
22091035-C-A | 19929149-C-A | ** | ||||||||
22167239-A-AT | 20005353-A-AT | ** | ||||||||
22172419-G-T | 20010533-G-T | ** | ||||||||
22232835-G-C | 20070949-G-C | DYZ19 | ** | |||||||
22232856-T-G | 20070970-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
22232875-A-T | 20070989-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
22309879-C-G | 20147993-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
22309884-T-A | 20147998-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
22309895-T-A | 20148009-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
22309902-T-C | 20148016-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22517325-A-C | 20355439-A-C | ** | ||||||||
22535590-T-C | 20373704-T-C | ** | ||||||||
22535598-T-C | 20373712-T-C | ** | ||||||||
22535625-A-T | 20373739-A-T | ** | ||||||||
22535652-A-G | 20373766-A-G | ** | ||||||||
22535655-C-G | 20373769-C-G | ** | ||||||||
22535659-G-A | 20373773-G-A | ** | ||||||||
22535720-T-C | 20373834-T-C | ** | ||||||||
22546332-T-A | 20384446-T-A | ** | ||||||||
22780354-T-C | 20618468-T-C | ** | ||||||||
22800973-C-G | 20639087-C-G | ** | ||||||||
22800975-T-C | 20639089-T-C | ** | ||||||||
22800977-G-C | 20639091-G-C | ** | ||||||||
22801489-T-G | 20639603-T-G | ** | ||||||||
22989937-C-A | 20828051-C-A | ** | ||||||||
23036117-C-A | 20874231-C-A | ** | ||||||||
23038035-A-G | 20876149-A-G | ** | ||||||||
23052496-A-G | 20890610-A-G | ** | ||||||||
23083244-G-C | 20921358-G-C | ** | ||||||||
23083256-A-G | 20921370-A-G | ** | ||||||||
23231526-C-A | 21069640-C-A | ** | ||||||||
23345740-G-T | 21183854-G-T | ** | ||||||||
24405043-G-A | 22258896-G-A | FT70430 | ** | |||||||
24415798-A-G | 22269651-A-G | ** | ||||||||
24513468-C-A | 22367321-C-A | ** | ||||||||
24673080-G-T | 22526933-G-T | P3_b2 | ** | |||||||
24729800-C-A | 22583653-C-A | P3_b2 | ** | |||||||
25592786-G-T | 23446639-G-T | P1_gr1 | ** | |||||||
25892410-A-AG | 23746263-A-AG | P1_Y1 | ** | |||||||
26018321-T-C | 23872174-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26018401-G-C | 23872254-G-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26018753-G-T | 23872606-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26146688-C-A | 24000541-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27971686-T-C | 25825539-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28505188-T-C | 26359041-T-C | ** | ||||||||
28505243-A-C | 26359096-A-C | ** | ||||||||
28505322-G-C | 26359175-G-C | ** | ||||||||
28506385-C-A | 26360238-C-A | ** | ||||||||
28518821-T-G | 26372674-T-G | ** | ||||||||
28533187-T-A | 26387040-T-A | ** | ||||||||
28542109-G-T | 26395962-G-T | ** | ||||||||
28597507-G-T | 26451360-G-T | ** | ||||||||
28601803-T-C | 26455656-T-C | ** | ||||||||
28679058-C-G | 26532911-C-G | ** | ||||||||
28684216-C-T | 26538069-C-T | ** | ||||||||
28728469-T-C | 26582322-T-C | ** | ||||||||
28730115-T-A | 26583968-T-A | ** | ||||||||
28743185-C-A | 26597038-C-A | ** | ||||||||
28781439-G-C | 26635292-G-C | ** | ||||||||
28798365-T-C | 26652218-T-C | ** | ||||||||
56860455-G-A | ** | |||||||||
56867909-C-A | ** | |||||||||
56873015-C-A | ** | |||||||||
56873359-T-A | ** | |||||||||
56873365-A-T | ** | |||||||||
56873399-A-T | ** | |||||||||
13848355-T-A | 11727649-T-A | *** | ||||||||
13848362-A-G | 11727656-A-G | *** | ||||||||
13848351-G-C | 11727645-G-C | *** | ||||||||
13801007-T-A | 11680301-T-A | *** | ||||||||
15864268-C-A | 13752388-C-A | *** | *** | |||||||
13471951-T-C | 11316275-T-C | *** | ||||||||
24046405-C-T | 21900258-C-T | PR4019 | *** | |||||||
22286529-G-T | 20124643-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
22251588-A-T | 20089702-A-T | DYZ19 | *** | |||||||
22283563-C-T | 20121677-C-T | DYZ19 | *** | |||||||
22306476-A-T | 20144590-A-T | DYZ19 | *** | |||||||
23714513-T-C | 21552627-T-C | *** | ||||||||
24046402-T-A | 21900255-T-A | PR4018 | *** | |||||||
25259137-C-T | 23112990-C-T | P2_r1 | *** | |||||||
56826478-ATTTCC-A | *** | |||||||||
8344064-G-T | 8476023-G-T | *** | ||||||||
17480254-C-A | 15368374-C-A | *** | ||||||||
10932849-C-A | *** | |||||||||
2844149-GTTT-G | 2976108-GTTT-G | 16×T | *** | |||||||
7197570-ATTTT-A | 7329529-ATTTT-A | 19×T | *** | |||||||
5869491-C-A | 6001450-C-A | *** | ||||||||
13461092-C-T | 11305416-C-T | *** | ||||||||
11018027-C-A | *** | |||||||||
9374710-C-A | 9537101-C-A | *** | ||||||||
23126979-C-A | 20965093-C-A | *** | ||||||||
10655143-C-T | *** | |||||||||
10797990-CACTCCATACC-C,CTCTTCATTCG | *** | |||||||||
5231056-C-A | 5363015-C-A | *** | ||||||||
13478288-C-A | 11322612-C-A | *** | ||||||||
10992248-A-C,T | *** | |||||||||
10788321-G-T | *** | |||||||||
18703944-GA-G | 16592064-GA-G | *** | ||||||||
10669329-G-T | *** | |||||||||
10967687-C-A | *** | |||||||||
9945863-GAAA-G,GAAAA | 10108254-GAAA-G,GAAAA | 16×A | *** | |||||||
11003765-CTCCAC-C,CTCCAA | *** | |||||||||
6663267-GACATGAACT-G | 6795226-GACATGAACT-G | *** | ||||||||
6663280-C-CA | 6795239-C-CA | *** | ||||||||
9055485-G-A | *** | |||||||||
10668355-C-CACTCA,CACTCC | *** | |||||||||
10693898-C-A | *** | |||||||||
10792147-G-T | *** | |||||||||
10801219-C-A | *** | |||||||||
10869892-C-A | *** | |||||||||
10885350-C-A | *** | |||||||||
10894499-TCCCCTCTACT-T,TCCCCTCTACA | *** | |||||||||
10976716-C-A | *** | |||||||||
10976734-T-C | *** | |||||||||
10993716-T-A | *** | |||||||||
10999087-C-A | *** | |||||||||
11653713-A-T | *** | |||||||||
13828444-A-T | 11707738-A-T | *** | ||||||||
13938882-CAAA-C,CAA | 11818176-CAAA-C,CAA | 13×A | *** | |||||||
15653762-AT-A | 13541882-AT-A | *** | ||||||||
15931514-C-A | 13819634-C-A | *** | ||||||||
16544627-GGGAA-G | 14432747-GGGAA-G | *** | ||||||||
22210646-C-T | 20048760-C-T | *** | ||||||||
22300823-T-A | 20138937-T-A | DYZ19 | *** | |||||||
24109049-C-A | 21962902-C-A | P3_b1 | *** | |||||||
28462005-G-A | 26315858-G-A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
---|---|---|---|
Manual | 23316016-C-CTTTA | 21154130-C-CTTTA | 1 read, it has the insertion. |
Manual | 24898772-A-G | 22752625-A-G | 51A 16G |