Maxwell
FTDNA: 3204, BigY2: 3204, BigY3: 3204MDKA Birth: Scotland
Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 3204 | BigY2 3204 | BigY3 3204 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
13695105-C-T | 11539429-C-T | DYZ17 | A* | ||||||||
28817749-A-C | 26671602-A-C | A* | |||||||||
20903283-C-T | 18741397-C-T | P4_Dst | A* | ||||||||
18762655-T-G | 16650775-T-G | A1286 | Y | Y | + | + | ** | ||||
22458102-T-A | 20296216-T-A | A1288 | DYZ19 | + | + | ||||||
13194379-C-G | 11038703-C-G | FT440455 | ** | + | |||||||
3428998-T-C | 3560957-T-C | FT81189 | + | ||||||||
7043418-G-A | 7175377-G-A | FT81731 | Y | + | |||||||
4037680-G-C | 4169639-G-C | * | |||||||||
4769547-C-A | 4901506-C-A | PR4356 | ** | ** | |||||||
22365426-T-G | 20203540-T-G | DYZ19 | ** | ||||||||
22365430-G-A | 20203544-G-A | DYZ19 | ** | ||||||||
22365438-C-G | 20203552-C-G | DYZ19 | ** | ||||||||
22783042-T-C | 20621156-T-C | ** | |||||||||
20001361-A-AT | 17889481-A-AT | P5_Prx | 8×T | ** | |||||||
7131386-ACCCC-A | 7263345-ACCCC-A | 14×C | ** | ||||||||
19235208-C-A | 17123328-C-A | ** | |||||||||
13372061-C-A | 11216385-C-A | ** | |||||||||
23187756-C-A | 21025870-C-A | ** | |||||||||
10753260-C-A | ** | ||||||||||
10954748-C-A | ** | ||||||||||
16441135-C-A | 14329255-C-A | ** | |||||||||
26228720-A-G | 24082573-A-G | P1_Y1 | ** | ||||||||
15532430-C-A | 13420550-C-A | ** | |||||||||
17360445-C-A | 15248565-C-A | ** | |||||||||
8748403-C-A | 8880362-C-A | ** | |||||||||
10868473-G-T | ** | ||||||||||
21673279-C-A | 19511393-C-A | ** | |||||||||
13522862-G-A | 11367186-G-A | ** | |||||||||
14468392-C-A | 12347661-C-A | ** | |||||||||
7418543-C-A | 7550502-C-A | ** | |||||||||
11038154-C-A | ** | ||||||||||
16029025-C-A | 13917145-C-A | ** | |||||||||
15221207-C-A | 13109293-C-A | ** | |||||||||
10979597-T-A | ** | ||||||||||
10057369-C-A | 10219760-C-A | ** | |||||||||
15178427-C-A | 13066513-C-A | ** | |||||||||
10753211-A-T | ** | ||||||||||
17692114-C-A | 15580234-C-A | ** | |||||||||
5359136-G-T | 5491095-G-T | ** | |||||||||
16779156-C-A | 14667276-C-A | ** | |||||||||
3148097-C-A | 3280056-C-A | ** | |||||||||
14543993-C-A | 12432194-C-A | ** | |||||||||
17713952-C-A | 15602072-C-A | ** | |||||||||
18736542-C-A | 16624662-C-A | ** | |||||||||
7579639-T-C | 7711598-T-C | FT121376 | ** | ||||||||
5420567-C-A | 5552526-C-A | FT59875 | ** | ||||||||
28772890-C-A | 26626743-C-A | ** | |||||||||
14090315-C-A | 11969609-C-A | ** | |||||||||
21752719-G-T | ** | ||||||||||
22564895-C-A | 20403009-C-A | ** | |||||||||
10673581-C-A | ** | ||||||||||
14554456-C-A | 12442657-C-A | ** | |||||||||
14408620-C-A | 12287918-C-A | ** | |||||||||
15258512-C-A | 13146596-C-A | ** | |||||||||
16474704-C-A | 14362824-C-A | ** | |||||||||
13212817-C-A | 11057141-C-A | ** | |||||||||
10662078-G-T | ** | ||||||||||
13803337-C-A | 11682631-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
10882059-C-G | ** | ||||||||||
10666758-C-A | ** | ||||||||||
28529837-C-A | 26383690-C-A | ** | |||||||||
16666079-ATTTTTTTT-A | 14554199-ATTTTTTTT-A | 25×T | ** | ||||||||
6132097-C-A | 6264056-C-A | ** | |||||||||
15792724-C-A | 13680844-C-A | FT377791 | ** | ||||||||
9442190-C-A | 9604581-C-A | ** | |||||||||
14371308-C-A | 12250604-C-A | ** | |||||||||
28779601-C-A | 26633454-C-A | ** | |||||||||
23801649-C-A | 21639763-C-A | ** | |||||||||
16980089-C-A | 14868209-C-A | ** | |||||||||
14234689-C-A | 12113983-C-A | ** | |||||||||
18329044-T-C | 16217164-T-C | P6_Prx | ** | ||||||||
18391805-C-A | 16279925-C-A | P6_Gap | ** | ||||||||
15321357-AT-A | 13209475-AT-A | ** | |||||||||
18189471-C-A | 16077591-C-A | ** | |||||||||
10809506-G-T | ** | ||||||||||
14768009-C-A | 12656078-C-A | ** | |||||||||
10869964-T-C | FT434851 | ** | |||||||||
18717722-C-A | 16605842-C-A | ** | |||||||||
10866036-C-A | ** | ||||||||||
7354699-C-A | 7486658-C-A | ** | |||||||||
14315526-C-A | 12194820-C-A | ** | |||||||||
14645025-C-A | 12533094-C-A | ** | |||||||||
13588520-C-A | 11432844-C-A | ** | |||||||||
7169789-C-A | 7301748-C-A | BY169216 | ** | ||||||||
24729781-C-A | 22583634-C-A | P3_b2 | ** | ||||||||
22793970-C-A | 20632084-C-A | ** | |||||||||
10661949-C-A | ** | ||||||||||
7235932-C-A | 7367891-C-A | ** | |||||||||
23435884-C-A | 21273998-C-A | ** | |||||||||
6478617-C-A | 6610576-C-A | ** | |||||||||
24875301-C-A | 22729154-C-A | g1 | ** | ||||||||
21299383-C-T | 19137497-C-T | ** | |||||||||
9936221-C-A | 10098612-C-A | ** | |||||||||
14757443-C-A | 12645512-C-A | ** | |||||||||
13298539-C-A | 11142863-C-A | ** | |||||||||
18796501-A-G | 16684621-A-G | ** | |||||||||
14267040-C-A | 12146334-C-A | ** | |||||||||
28534454-C-A | 26388307-C-A | ** | |||||||||
3111614-C-A | 3243573-C-A | ** | |||||||||
15743884-C-A | 13632004-C-A | ** | |||||||||
7311210-C-A | 7443169-C-A | ** | |||||||||
14554431-C-A | 12442632-C-A | ** | |||||||||
28480178-C-A | 26334031-C-A | ** | |||||||||
14263329-C-A | 12142623-C-A | ** | |||||||||
14800023-C-A | 12688094-C-A | ** | |||||||||
17103845-G-T | 14991965-G-T | ** | |||||||||
13332419-C-A | 11176743-C-A | ** | |||||||||
22075726-C-A | 19913840-C-A | ** | |||||||||
16295038-C-A | 14183158-C-A | ** | |||||||||
15210753-C-A | 13098839-C-A | ** | |||||||||
16462825-G-T | 14350945-G-T | ** | |||||||||
13255514-C-A | 11099838-C-A | ** | |||||||||
28700916-C-A | 26554769-C-A | ** | |||||||||
10033300-C-A | 10195691-C-A | ** | |||||||||
10009481-C-A | 10171872-C-A | ** | |||||||||
10991475-C-A | ** | ||||||||||
7106424-G-A | 7238383-G-A | ** | |||||||||
5911837-C-A | 6043796-C-A | ** | |||||||||
10673411-C-A | ** | ||||||||||
18088971-C-A | 15977091-C-A | ** | |||||||||
17580830-C-A | 15468950-C-A | ** | |||||||||
10869962-C-T | ** | ||||||||||
3726389-C-A | 3858348-C-A | ** | |||||||||
13627193-C-A | 11471517-C-A | ** | |||||||||
17211018-C-A | 15099138-C-A | ** | |||||||||
9094375-A-G | 9256766-A-G | FT248669 | ** | ||||||||
16526547-C-A | 14414667-C-A | ** | |||||||||
26098128-T-C | 23951981-T-C | P1_Y1 | ** | ||||||||
7009272-C-A | 7141231-C-A | ** | |||||||||
21489165-C-A | 19327279-C-A | ** | |||||||||
13496299-G-T | 11340623-G-T | ** | |||||||||
6621458-C-A | 6753417-C-A | ** | |||||||||
13606325-T-G | 11450649-T-G | ** | |||||||||
10866038-A-T | ** | ||||||||||
22330237-G-T | 20168351-G-T | DYZ19 | ** | ||||||||
15785917-T-C | 13674037-T-C | ** | |||||||||
9025090-C-A | 9187481-C-A | ** | |||||||||
5800482-T-C | 5932441-T-C | ** | |||||||||
16172126-G-T | 14060246-G-T | ** | |||||||||
5828944-A-G | 5960903-A-G | ** | |||||||||
15743949-C-A | 13632069-C-A | ** | |||||||||
24459304-G-T | 22313157-G-T | ** | |||||||||
10971516-C-A | ** | ||||||||||
11643828-CA-C | DYZ17 | ** | |||||||||
8036081-C-A | 8168040-C-A | ** | |||||||||
13998229-C-A | 11877523-C-A | ** | |||||||||
16876990-C-A | 14765110-C-A | ** | |||||||||
4213046-C-A | 4345005-C-A | ** | |||||||||
11038237-C-A | ** | ||||||||||
20755645-C-A | 18593759-C-A | P4_Prx | ** | ||||||||
6126234-C-A | 6258193-C-A | ** | |||||||||
10671374-C-A | ** | ||||||||||
22584278-C-A | 20422392-C-A | ** | |||||||||
2767961-G-T | 2899920-G-T | ** | |||||||||
19933393-T-C | 17821513-T-C | P5_Prx | ** | ||||||||
2695477-G-C | 2827436-G-C | ** | |||||||||
2753830-C-A | 2885789-C-A | ** | |||||||||
2803963-G-T | 2935922-G-T | ** | |||||||||
2906611-A-G | 3038570-A-G | ** | |||||||||
2908911-G-T | 3040870-G-T | ** | |||||||||
2987805-A-G | 3119764-A-G | ** | |||||||||
2987839-T-A | 3119798-T-A | ** | |||||||||
3111593-T-C | 3243552-T-C | ** | |||||||||
3111597-CT-C | 3243556-CT-C | ** | |||||||||
3131729-T-G | 3263688-T-G | ** | |||||||||
3152182-A-G | 3284141-A-G | ** | |||||||||
3158853-C-A | 3290812-C-A | ** | |||||||||
3260334-AGTTG-A | 3392293-AGTTG-A | ** | |||||||||
3346324-A-C | 3478283-A-C | ** | |||||||||
3366633-G-T | 3498592-G-T | ** | |||||||||
3405510-A-G | 3537469-A-G | ** | |||||||||
3492609-G-C | 3624568-G-C | ** | |||||||||
3501153-G-T | 3633112-G-T | ** | |||||||||
3622415-C-T | 3754374-C-T | ** | |||||||||
3627924-T-C | 3759883-T-C | ** | |||||||||
3650846-G-T | 3782805-G-T | ** | |||||||||
3721332-C-T | 3853291-C-T | ** | |||||||||
3804391-G-T | 3936350-G-T | ** | |||||||||
3815249-T-A | 3947208-T-A | ** | |||||||||
3966989-C-T | 4098948-C-T | ** | |||||||||
3986391-C-A | 4118350-C-A | ** | |||||||||
4056640-G-T | 4188599-G-T | ** | |||||||||
4100875-T-C | 4232834-T-C | ** | |||||||||
4138954-C-A | 4270913-C-A | ** | |||||||||
4212740-G-T | 4344699-G-T | ** | |||||||||
4218292-G-T | 4350251-G-T | ** | |||||||||
4225983-T-G | 4357942-T-G | ** | |||||||||
4254809-C-A | 4386768-C-A | ** | |||||||||
4255007-A-C | 4386966-A-C | ** | |||||||||
4270708-G-T | 4402667-G-T | ** | |||||||||
4288019-C-T | 4419978-C-T | ** | |||||||||
4305299-C-A | 4437258-C-A | ** | |||||||||
4317234-G-T | 4449193-G-T | ** | |||||||||
4377878-C-A | 4509837-C-A | ** | |||||||||
4392711-C-A | 4524670-C-A | ** | |||||||||
4406850-G-A | 4538809-G-A | ** | |||||||||
4449070-C-A | 4581029-C-A | ** | |||||||||
4453612-G-GCT | 4585571-G-GCT | ** | |||||||||
4521456-T-A | 4653415-T-A | ** | |||||||||
4523711-G-T | 4655670-G-T | ** | |||||||||
4523742-A-G | 4655701-A-G | ** | |||||||||
4525898-T-G | 4657857-T-G | ** | |||||||||
4545578-C-A | 4677537-C-A | ** | |||||||||
4555538-C-A | 4687497-C-A | ** | |||||||||
4607437-C-T | 4739396-C-T | ** | |||||||||
4696878-G-T | 4828837-G-T | ** | |||||||||
4701206-C-A | 4833165-C-A | ** | |||||||||
4807009-G-T | 4938968-G-T | ** | |||||||||
4861879-A-G | 4993838-A-G | ** | |||||||||
5078430-A-G | 5210389-A-G | ** | |||||||||
5092200-G-T | 5224159-G-T | ** | |||||||||
5195211-G-T | 5327170-G-T | ** | |||||||||
5210792-C-A | 5342751-C-A | ** | |||||||||
5239572-A-G | 5371531-A-G | ** | |||||||||
5440039-C-A | 5571998-C-A | ** | |||||||||
5560848-T-C | 5692807-T-C | ** | |||||||||
5585475-G-A | 5717434-G-A | ** | |||||||||
5609801-C-A | 5741760-C-A | ** | |||||||||
5676618-G-C | 5808577-G-C | ** | |||||||||
6096960-T-C | 6228919-T-C | ** | |||||||||
6110989-C-A | 6242948-C-A | ** | |||||||||
6110997-C-A | 6242956-C-A | ** | |||||||||
6111018-C-A | 6242977-C-A | ** | |||||||||
6144610-C-A | 6276569-C-A | IR3_Dst | ** | ||||||||
6205730-C-A | 6337689-C-A | IR3_Dst | ** | ||||||||
6250189-T-TC | 6382148-T-TC | IR3_Dst | ** | ||||||||
6353678-G-T | 6485637-G-T | ** | |||||||||
6384740-A-G | 6516699-A-G | ** | |||||||||
6457817-T-G | 6589776-T-G | ** | |||||||||
6459414-A-G | 6591373-A-G | ** | |||||||||
6477257-A-T | 6609216-A-T | ** | |||||||||
6520376-T-C | 6652335-T-C | ** | |||||||||
6598853-T-G | 6730812-T-G | ** | |||||||||
6621518-C-A | 6753477-C-A | ** | |||||||||
6655008-C-A | 6786967-C-A | ** | |||||||||
6730207-A-T | 6862166-A-T | ** | |||||||||
6751201-G-A | 6883160-G-A | ** | |||||||||
6762845-ATCCAGC-A | 6894804-ATCCAGC-A | ** | |||||||||
6930890-C-T | 7062849-C-T | ** | |||||||||
6956566-A-T | 7088525-A-T | ** | |||||||||
6959907-G-T | 7091866-G-T | ** | |||||||||
6975250-G-A | 7107209-G-A | ** | |||||||||
6983979-G-A | 7115938-G-A | ** | |||||||||
7001127-T-G | 7133086-T-G | ** | |||||||||
7011634-C-A | 7143593-C-A | ** | |||||||||
7028491-C-A | 7160450-C-A | ** | |||||||||
7062107-C-A | 7194066-C-A | ** | |||||||||
7076227-C-T | 7208186-C-T | ** | |||||||||
7102469-C-T | 7234428-C-T | ** | |||||||||
7142516-A-G | 7274475-A-G | ** | |||||||||
7142658-C-A | 7274617-C-A | ** | |||||||||
7159335-C-A | 7291294-C-A | ** | |||||||||
7218297-G-T | 7350256-G-T | ** | |||||||||
7222967-C-A | 7354926-C-A | ** | |||||||||
7253718-G-C | 7385677-G-C | ** | |||||||||
7253742-C-T | 7385701-C-T | ** | |||||||||
7253743-C-T | 7385702-C-T | ** | |||||||||
7253753-T-C | 7385712-T-C | ** | |||||||||
7255833-T-C | 7387792-T-C | ** | |||||||||
7282544-A-G | 7414503-A-G | ** | |||||||||
7286799-C-A | 7418758-C-A | ** | |||||||||
7299104-A-C | 7431063-A-C | ** | |||||||||
7321806-T-A | 7453765-T-A | ** | |||||||||
7417153-C-A | 7549112-C-A | ** | |||||||||
7444340-C-A | 7576299-C-A | ** | |||||||||
7664104-T-C | 7796063-T-C | ** | |||||||||
7664126-A-C | 7796085-A-C | ** | |||||||||
7670277-C-A | 7802236-C-A | ** | |||||||||
7721333-C-A | 7853292-C-A | ** | |||||||||
7755403-C-A | 7887362-C-A | ** | |||||||||
7992321-G-T | 8124280-G-T | ** | |||||||||
8008830-T-G | 8140789-T-G | ** | |||||||||
8080120-T-A | 8212079-T-A | ** | |||||||||
8085705-G-T | 8217664-G-T | ** | |||||||||
8207353-C-A | 8339312-C-A | ** | |||||||||
8214879-TTTC-T | 8346838-TTTC-T | ** | |||||||||
8216479-A-G | 8348438-A-G | ** | |||||||||
8235722-G-T | 8367681-G-T | ** | |||||||||
8369759-C-A | 8501718-C-A | ** | |||||||||
8456705-C-A | 8588664-C-A | ** | |||||||||
8681448-C-A | 8813407-C-A | ** | |||||||||
8681476-C-A | 8813435-C-A | ** | |||||||||
8699870-G-A | 8831829-G-A | ** | |||||||||
8712006-A-T | 8843965-A-T | ** | |||||||||
8715155-C-A | 8847114-C-A | ** | |||||||||
8776754-G-A | 8908713-G-A | ** | |||||||||
8831288-C-A | 8963247-C-A | ** | |||||||||
8865732-C-A | 8997691-C-A | ** | |||||||||
8865976-T-G | 8997935-T-G | ** | |||||||||
9076001-C-A | 9238392-C-A | ** | |||||||||
9423009-C-A | 9585400-C-A | ** | |||||||||
9865322-C-A | 10027713-C-A | ** | |||||||||
9892606-C-A | 10054997-C-A | ** | |||||||||
9928044-G-C | 10090435-G-C | ** | |||||||||
9932671-A-G | 10095062-A-G | ** | |||||||||
9937110-G-A | 10099501-G-A | ** | |||||||||
9953316-C-A | 10115707-C-A | ** | |||||||||
9996486-C-A | 10158877-C-A | ** | |||||||||
10026119-G-A | 10188510-G-A | ** | |||||||||
10032276-G-A | 10194667-G-A | ** | |||||||||
10034410-G-T | 10196801-G-T | ** | |||||||||
10034834-T-C | 10197225-T-C | ** | |||||||||
10046121-A-C | 10208512-A-C | ** | |||||||||
10046150-T-C | 10208541-T-C | ** | |||||||||
10632529-C-A | ** | ||||||||||
10651934-C-T | ** | ||||||||||
10665132-T-C | ** | ||||||||||
10753222-T-A | ** | ||||||||||
10753226-A-ATTCGT | ** | ||||||||||
10753232-T-TTAC | ** | ||||||||||
10753257-T-C | FT56509 | ** | |||||||||
10753262-T-A | ** | ||||||||||
10758103-T-C | ** | ||||||||||
10769610-C-A | ** | ||||||||||
10773129-TTTCAC-T | ** | ||||||||||
10773143-A-G | ** | ||||||||||
10773164-C-G | ** | ||||||||||
10792428-A-ACACCTT | ** | ||||||||||
10792429-T-TGCAC | ** | ||||||||||
10792477-T-C | ** | ||||||||||
10828705-C-G | ** | ||||||||||
10837539-C-A | ** | ||||||||||
10866012-C-T | ** | ||||||||||
10866043-A-G | ** | ||||||||||
10866063-A-ATTCTG | ** | ||||||||||
10869972-C-G | ** | ||||||||||
10869980-T-G | ** | ||||||||||
10887282-C-A | ** | ||||||||||
10900615-C-A | ** | ||||||||||
10926708-C-CGGATG | ** | ||||||||||
10938206-C-A | ** | ||||||||||
10940372-A-ACTACT | ** | ||||||||||
10945610-T-C | ** | ||||||||||
10952383-C-A | ** | ||||||||||
10988594-TCATTC-T | ** | ||||||||||
11015550-A-G | ** | ||||||||||
11031133-G-A | ** | ||||||||||
13248809-C-A | 11093133-C-A | ** | |||||||||
13298547-C-G | 11142871-C-G | ** | |||||||||
13305727-G-T | 11150051-G-T | ** | |||||||||
13468660-G-C | 11312984-G-C | ** | |||||||||
13554879-C-A | 11399203-C-A | ** | |||||||||
13623444-G-T | 11467768-G-T | ** | |||||||||
13626790-T-G | 11471114-T-G | ** | |||||||||
13642836-G-C | 11487160-G-C | ** | |||||||||
13642840-T-G | 11487164-T-G | ** | |||||||||
13642849-G-T | 11487173-G-T | ** | |||||||||
11648610-A-G | DYZ17 | ** | |||||||||
11672234-A-G | DYZ17 | ** | |||||||||
13803931-G-C | 11683225-G-C | DYZ17 | ** | ||||||||
13846639-G-C | 11725933-G-C | DYZ17 | ** | ||||||||
13860530-G-A | 11739824-G-A | FT126578 | DYZ17 | ** | |||||||
13885511-G-T | 11764805-G-T | ** | |||||||||
13885874-TTTG-T | 11765168-TTTG-T | ** | |||||||||
13889286-TC-T | 11768580-TC-T | ** | |||||||||
13900255-A-C | 11779549-A-C | ** | |||||||||
13935041-G-A | 11814335-G-A | ** | |||||||||
13937425-T-G | 11816719-T-G | ** | |||||||||
14006766-A-C | 11886060-A-C | ** | |||||||||
14036073-T-A | 11915367-T-A | ** | |||||||||
14067353-G-T | 11946647-G-T | ** | |||||||||
14109545-C-A | 11988839-C-A | ** | |||||||||
14123176-C-T | 12002470-C-T | ** | |||||||||
14153079-T-C | 12032373-T-C | ** | |||||||||
14168185-A-G | 12047479-A-G | ** | |||||||||
14196359-T-G | 12075653-T-G | ** | |||||||||
14227610-T-C | 12106904-T-C | ** | |||||||||
14270099-G-T | 12149393-G-T | ** | |||||||||
14270465-A-C | 12149759-A-C | ** | |||||||||
14272978-T-C | 12152272-T-C | FT83608 | ** | ||||||||
14279928-T-G | 12159222-T-G | ** | |||||||||
14285005-C-A | 12164299-C-A | ** | |||||||||
14300625-G-A | 12179919-G-A | ** | |||||||||
14356951-G-A | 12236246-G-A | ** | |||||||||
14373765-C-A | 12253061-C-A | ** | |||||||||
14376622-C-A | 12255918-C-A | ** | |||||||||
14397447-G-T | 12276743-G-T | ** | |||||||||
14431565-C-A | 12310838-C-A | ** | |||||||||
14449767-TC-T | 12329040-TC-T | ** | |||||||||
14464310-C-G | 12343583-C-G | ** | |||||||||
14467763-C-A | 12347032-C-A | ** | |||||||||
14484439-G-T | 12363708-G-T | ** | |||||||||
14524098-G-T | 12412299-G-T | ** | |||||||||
14539295-C-A | 12427496-C-A | ** | |||||||||
14581169-G-T | 12469369-G-T | ** | |||||||||
14581176-C-G | 12469376-C-G | ** | |||||||||
14600049-C-A | 12488249-C-A | ** | |||||||||
14610678-C-A | 12498880-C-A | ** | |||||||||
14622157-G-C | 12510355-G-C | ** | |||||||||
14658332-C-A | 12546397-C-A | ** | |||||||||
14667972-G-T | 12556038-G-T | ** | |||||||||
14691754-G-A | 12579820-G-A | ** | |||||||||
14757793-T-C | 12645862-T-C | ** | |||||||||
15038342-C-A | 12926432-C-A | ** | |||||||||
15049817-C-A | 12937908-C-A | ** | |||||||||
15066373-C-A | 12954464-C-A | FT416911 | ** | ||||||||
15102119-G-T | 12990207-G-T | ** | |||||||||
15109829-G-T | 12997916-G-T | ** | |||||||||
15151397-G-A | 13039484-G-A | ** | |||||||||
15185230-T-C | 13073316-T-C | ** | |||||||||
15197502-A-G | 13085588-A-G | ** | |||||||||
15464374-A-C | 13352494-A-C | ** | |||||||||
15468569-G-T | 13356689-G-T | ** | |||||||||
15500710-G-T | 13388830-G-T | ** | |||||||||
15628635-G-T | 13516755-G-T | ** | |||||||||
15646402-T-C | 13534522-T-C | ** | |||||||||
15657169-C-T | 13545289-C-T | ** | |||||||||
15712390-C-A | 13600510-C-A | ** | |||||||||
15742071-A-C | 13630191-A-C | ** | |||||||||
15743134-T-C | 13631254-T-C | ** | |||||||||
15743982-A-T | 13632102-A-T | ** | |||||||||
15770525-T-A | 13658645-T-A | ** | |||||||||
15798374-G-A | 13686494-G-A | ** | |||||||||
15804090-A-T | 13692210-A-T | ** | |||||||||
15804134-A-C | 13692254-A-C | ** | |||||||||
15841823-T-A | 13729943-T-A | ** | |||||||||
15894669-C-T | 13782789-C-T | ** | |||||||||
15894705-A-G | 13782825-A-G | ** | |||||||||
16038844-T-C | 13926964-T-C | ** | |||||||||
16042747-C-G | 13930867-C-G | ** | |||||||||
16062341-C-A | 13950461-C-A | ** | |||||||||
16070176-G-T | 13958296-G-T | ** | |||||||||
16084415-C-A | 13972535-C-A | ** | |||||||||
16469882-G-T | 14358002-G-T | FT353848 | ** | ||||||||
16487250-G-T | 14375370-G-T | ** | |||||||||
16491824-C-A | 14379944-C-A | ** | |||||||||
16524950-C-A | 14413070-C-A | ** | |||||||||
16530928-A-C | 14419048-A-C | ** | |||||||||
16654733-C-A | 14542853-C-A | ** | |||||||||
16666218-C-A | 14554338-C-A | ** | |||||||||
16696233-C-A | 14584353-C-A | ** | |||||||||
16702238-T-C | 14590358-T-C | ** | |||||||||
16711381-T-G | 14599501-T-G | ** | |||||||||
16761409-T-C | 14649529-T-C | ** | |||||||||
16896649-T-C | 14784769-T-C | ** | |||||||||
16987337-T-C | 14875457-T-C | ** | |||||||||
17093849-C-A | 14981969-C-A | 9×A | ** | ||||||||
17169881-C-A | 15058001-C-A | ** | |||||||||
17181468-C-A | 15069588-C-A | ** | |||||||||
17195054-C-A | 15083174-C-A | ** | |||||||||
17196328-C-T | 15084448-C-T | ** | |||||||||
17218230-C-A | 15106350-C-A | ** | |||||||||
17226478-G-T | 15114598-G-T | ** | |||||||||
17315318-C-A | 15203438-C-A | FT187671 | ** | ||||||||
17317455-C-A | 15205575-C-A | ** | |||||||||
17318411-C-A | 15206531-C-A | ** | |||||||||
17326764-G-C | 15214884-G-C | ** | |||||||||
17378054-A-G | 15266174-A-G | ** | |||||||||
17503618-G-A | 15391738-G-A | ** | |||||||||
17628854-T-C | 15516974-T-C | ** | |||||||||
17646773-G-C | 15534893-G-C | ** | |||||||||
17673246-A-T | 15561366-A-T | ** | |||||||||
17741494-C-A | 15629614-C-A | ** | |||||||||
17752107-G-A | 15640227-G-A | ** | |||||||||
17826344-A-G | 15714464-A-G | ** | |||||||||
17831286-C-A | 15719406-C-A | ** | |||||||||
17832508-T-C | 15720628-T-C | ** | |||||||||
17842395-A-G | 15730515-A-G | ** | |||||||||
17859739-C-A | 15747859-C-A | ** | |||||||||
17902006-G-T | 15790126-G-T | ** | |||||||||
17915094-A-G | 15803214-A-G | ** | |||||||||
18039394-TTTGC-T | 15927514-TTTGC-T | ** | |||||||||
18094326-C-A | 15982446-C-A | ** | |||||||||
18102085-GA-G | 15990205-GA-G | ** | |||||||||
18143838-A-G | 16031958-A-G | ** | |||||||||
18154287-A-C | 16042407-A-C | ** | |||||||||
18190692-C-G | 16078812-C-G | ** | |||||||||
18190730-T-G | 16078850-T-G | ** | |||||||||
18263633-C-A | 16151753-C-A | ** | |||||||||
18279984-T-C | 16168104-T-C | P6_Prx | ** | ||||||||
18280009-C-A | 16168129-C-A | P6_Prx | ** | ||||||||
18317691-C-A | 16205811-C-A | P6_Prx | ** | ||||||||
18389231-A-T | 16277351-A-T | P6_Gap | ** | ||||||||
18434506-C-A | 16322626-C-A | P6_Dst | ** | ||||||||
18528992-A-T | 16417112-A-T | P6_Dst | ** | ||||||||
18529003-T-A | 16417123-T-A | P6_Dst | ** | ||||||||
18605185-C-A | 16493305-C-A | ** | |||||||||
18625455-G-T | 16513575-G-T | ** | |||||||||
18625949-A-C | 16514069-A-C | ** | |||||||||
18631915-C-A | 16520035-C-A | ** | |||||||||
18682526-G-T | 16570646-G-T | ** | |||||||||
18687502-G-C | 16575622-G-C | ** | |||||||||
18735192-C-A | 16623312-C-A | ** | |||||||||
18742238-C-A | 16630358-C-A | ** | |||||||||
18745848-C-A | 16633968-C-A | ** | |||||||||
18753331-C-A | 16641451-C-A | ** | |||||||||
18796631-G-T | 16684751-G-T | ** | |||||||||
18929836-C-A | 16817956-C-A | ** | |||||||||
18948310-T-G | 16836430-T-G | ** | |||||||||
18951485-A-G | 16839605-A-G | ** | |||||||||
19056295-C-A | 16944415-C-A | ** | |||||||||
19075315-T-G | 16963435-T-G | ** | |||||||||
19075324-A-G | 16963444-A-G | ** | |||||||||
19098135-A-G | 16986255-A-G | ** | |||||||||
19251517-C-T | 17139637-C-T | ** | |||||||||
19252354-C-G | 17140474-C-G | ** | |||||||||
19290912-C-A | 17179032-C-A | ** | |||||||||
19298828-A-G | 17186948-A-G | ** | |||||||||
19302581-G-T | 17190701-G-T | ** | |||||||||
19319834-GTATATATATATA-G | 17207954-GTATATATATATA-G | 23×TA | ** | ||||||||
19379609-A-G | 17267729-A-G | ** | |||||||||
19424016-C-A | 17312136-C-A | ** | |||||||||
19429392-A-T | 17317512-A-T | ** | |||||||||
19461148-C-A | 17349268-C-A | ** | |||||||||
19490981-G-T | 17379101-G-T | ** | |||||||||
19510357-T-G | 17398477-T-G | ** | |||||||||
19675506-T-A | 17563626-T-A | P5_Prx | ** | ||||||||
19716318-A-AAAT | 17604438-A-AAAT | P5_Prx | ** | ||||||||
19934667-T-TC | 17822787-T-TC | P5_Prx | ** | ||||||||
19937969-G-T | 17826089-G-T | P5_Prx | ** | ||||||||
20084416-C-CTTTA | 17972536-C-CTTTA | P5_Dst | ** | ||||||||
20350324-T-A | 18188438-T-A | P5_Dst | ** | ||||||||
20636186-C-A | 18474300-C-A | P4_Prx | ** | ||||||||
20707736-C-A | 18545850-C-A | P4_Prx | ** | ||||||||
20802970-TA-T | 18641084-TA-T | P4_Gap | ** | ||||||||
20832455-T-A | 18670569-T-A | P4_Gap | ** | ||||||||
20838945-G-C | 18677059-G-C | P4_Gap | ** | ||||||||
21054372-T-C | 18892486-T-C | ** | |||||||||
21072237-C-A | 18910351-C-A | ** | |||||||||
21084591-C-A | 18922705-C-A | ** | |||||||||
21118502-G-C | 18956616-G-C | ** | |||||||||
21248720-G-C | 19086834-G-C | ** | |||||||||
21299373-C-A | 19137487-C-A | ** | |||||||||
21526977-C-A | 19365091-C-A | ** | |||||||||
21563053-T-C | 19401167-T-C | ** | |||||||||
21624866-G-T | 19462980-G-T | ** | |||||||||
21713401-G-C | 19551515-G-C | ** | |||||||||
21775298-C-T | 19613412-C-T | ** | |||||||||
21818857-A-C | 19656971-A-C | ** | |||||||||
21875851-C-A | 19713965-C-A | ** | |||||||||
21921892-C-A | 19760006-C-A | ** | |||||||||
21947117-C-T | 19785231-C-T | ** | |||||||||
21950040-C-A | 19788154-C-A | ** | |||||||||
21953572-G-A | 19791686-G-A | ** | |||||||||
22078239-A-G | 19916353-A-G | ** | |||||||||
22170385-G-T | 20008499-G-T | ** | |||||||||
22170421-A-T | 20008535-A-T | ** | |||||||||
22204850-C-A | 20042964-C-A | ** | |||||||||
22205587-C-A | 20043701-C-A | ** | |||||||||
22268078-C-A | 20106192-C-A | DYZ19 | ** | ||||||||
22330226-C-T | 20168340-C-T | DYZ19 | ** | ||||||||
22330238-T-A | 20168352-T-A | DYZ19 | ** | ||||||||
22527177-C-A | 20365291-C-A | ** | |||||||||
22544238-T-C | 20382352-T-C | ** | |||||||||
22584304-C-A | 20422418-C-A | ** | |||||||||
22655222-A-T | 20493336-A-T | ** | |||||||||
22720538-C-A | 20558652-C-A | ** | |||||||||
22833815-C-A | 20671929-C-A | ** | |||||||||
22837140-G-T | 20675254-G-T | ** | |||||||||
22849673-G-T | 20687787-G-T | ** | |||||||||
22875335-A-C | 20713449-A-C | ** | |||||||||
22884946-T-C | 20723060-T-C | ** | |||||||||
22936390-C-A | 20774504-C-A | ** | |||||||||
22991234-G-T | 20829348-G-T | ** | |||||||||
23004874-A-T | 20842988-A-T | ** | |||||||||
23145920-A-T | 20984034-A-T | ** | |||||||||
23259269-C-A | 21097383-C-A | ** | |||||||||
23345948-C-A | 21184062-C-A | ** | |||||||||
23373078-C-G | 21211192-C-G | ** | |||||||||
23373544-A-C | 21211658-A-C | ** | |||||||||
23391580-C-A | 21229694-C-A | ** | |||||||||
23425552-C-A | 21263666-C-A | ** | |||||||||
23742046-C-G | 21580160-C-G | ** | |||||||||
23777764-A-T | 21615878-A-T | ** | |||||||||
23808624-C-A | 21646738-C-A | ** | |||||||||
23817898-C-CA | 21656012-C-CA | ** | |||||||||
23955036-C-A | 21808889-C-A | ** | |||||||||
24475133-T-C | 22328986-T-C | FT378651 | ** | ||||||||
24666440-G-T | 22520293-G-T | P3_b2 | ** | ||||||||
26495362-C-A | 24349215-C-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
27240149-G-T | 25094002-G-T | P1_g3 | ** | ||||||||
27576071-C-A | 25429924-C-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
27576309-G-A | 25430162-G-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
27794677-CAT-C | 25648530-CAT-C | P1_Y2 | 12×AT | ** | |||||||
27889327-AC-A | 25743180-AC-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
27952077-GTATGTCTGTGTGTGTA-G | 25805930-GTATGTCTGTGTGTGTA-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
28462087-A-G | 26315940-A-G | ** | |||||||||
28468764-A-G | 26322617-A-G | ** | |||||||||
28468805-A-G | 26322658-A-G | ** | |||||||||
28478748-T-C | 26332601-T-C | ** | |||||||||
28492089-C-A | 26345942-C-A | ** | |||||||||
28496979-C-G | 26350832-C-G | ** | |||||||||
28609104-C-A | 26462957-C-A | ** | |||||||||
28626075-A-T | 26479928-A-T | ** | |||||||||
28633820-C-A | 26487673-C-A | ** | |||||||||
28649373-A-G | 26503226-A-G | ** | |||||||||
28661501-AT-A | 26515354-AT-A | ** | |||||||||
28754223-C-A | 26608076-C-A | ** | |||||||||
28801488-C-A | 26655341-C-A | ** | |||||||||
28801510-A-G | 26655363-A-G | ** | |||||||||
56834649-A-G | ** | ||||||||||
56842385-A-G | ** | ||||||||||
56849423-G-T | ** | ||||||||||
56849545-A-T | ** | ||||||||||
16293816-T-C | 14181936-T-C | ** | |||||||||
27447480-GTAT-G | 25301333-GTAT-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
27447487-T-C | 25301340-T-C | P1_Y2 | ** | ||||||||
28082037-T-TAAG | 25935890-T-TAAG | P1_Y2 | ** | ||||||||
58973996-GATTCC-C,CATTCT | 56827849-GATTCC-C,CATTCT | 5×ATTCC | *** | ||||||||
13865775-G-T | 11745069-G-T | DYZ17 | *** | ||||||||
58830512-C-T | 56760359-G-A | *** | |||||||||
13458128-TTCCGG-T | 11302452-TTCCGG-T | *** | |||||||||
13823293-A-G | 11702587-A-G | DYZ17 | *** | ||||||||
58979290-C-T | 56833143-C-T | *** | |||||||||
13699244-C-T | 11543568-C-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13699246-AT-A | 11543570-AT-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13818056-T-G | 11697350-T-G | DYZ17 | *** | ||||||||
58974143-T-C | 56827996-T-C | *** | |||||||||
9068855-G-C | 9231246-G-C | *** | |||||||||
9068856-C-T | 9231247-C-T | *** | |||||||||
9068859-G-A | 9231250-G-A | *** | |||||||||
9068868-G-A | 9231259-G-A | *** | |||||||||
13465288-C-T | 11309612-C-T | *** | |||||||||
13680899-TGGAATCGAAA-GGGAATGGAGT,T | 11525223-TGGAATCGAAA-GGGAATGGAGT,T | DYZ17 | *** | ||||||||
13735596-G-A | 11579920-G-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13735599-T-G | 11579923-T-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13823209-A-G | 11702503-A-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13869549-T-C,G | 11748843-T-C,G | DYZ17 | *** | ||||||||
13869638-A-T | 11748932-A-T | DYZ17 | *** | ||||||||
16108635-A-C | 13996755-A-C | P8_Prx | *** | ||||||||
16961287-C-A | 14849407-C-A | *** | *** | ||||||||
22365302-T-C | 20203416-T-C | DYZ19 | *** | ||||||||
22502881-T-C | 20340995-T-C | DYZ19 | *** | ||||||||
28799735-GTGGAGTGGAC-G,GTGGAGTGAAC | 26653588-GTGGAGTGGAC-G,GTGGAGTGAAC | *** | |||||||||
58908844-C-T | 56682027-G-A | *** | |||||||||
58908847-T-A | 56682024-A-T | *** | |||||||||
58974850-C-T | 56828703-C-T | *** | |||||||||
58974853-T-G | 56828706-T-G | *** | |||||||||
58974896-C-G | 56828749-C-G | *** | |||||||||
13883707-C-A | 11763001-C-A | *** | |||||||||
17941628-C-A | 15829748-C-A | *** | |||||||||
13843713-A-AGGAATGGAATGGAAT,T | 11723007-A-AGGAATGGAATGGAAT,T | DYZ17 | 10×GGAAT | *** | |||||||
13451184-ACTCC-A,ACTCCTTTCCATTCTATTCCACTCCATTCCACTCCA | 11295508-ACTCC-A,ACTCCTTTCCATTCTATTCCACTCCATTCCACTCCA | *** | |||||||||
13861442-A-G,T | 11740736-A-G,T | DYZ17 | *** | ||||||||
13867911-C-CA,G | 11747205-C-CA,G | DYZ17 | *** | ||||||||
8550844-TAA-T,TAAA | 8682803-TAA-T,TAAA | 17×A | *** | ||||||||
11019060-A-T | *** | ||||||||||
10792673-C-A | *** | ||||||||||
10789862-C-A | *** | ||||||||||
21196453-C-A | 19034567-C-A | *** | |||||||||
14320651-CTT-C,CT | 12199945-CTT-C,CT | 12×T | *** | ||||||||
6944970-A-G | 7076929-A-G | FT71808 | *** | ||||||||
10691411-C-A | *** | ||||||||||
13461841-C-T | 11306165-C-T | *** | |||||||||
8525485-C-A | 8657444-C-A | *** | |||||||||
3345861-C-A | 3477820-C-A | *** | |||||||||
16057836-C-A | 13945956-C-A | *** | |||||||||
16836776-C-A | 14724896-C-A | Y13006 | Y14990 | *** | |||||||
10809628-C-A | *** | ||||||||||
11656620-A-G | DYZ17 | *** | |||||||||
18204180-C-A | 16092300-C-A | *** | |||||||||
13811013-G-A | 11690307-G-A | DYZ17 | *** | ||||||||
2803382-C-A | 2935341-C-A | *** | |||||||||
7013279-C-A | 7145238-C-A | *** | |||||||||
7374809-C-A | 7506768-C-A | *** | |||||||||
7591332-T-C | 7723291-T-C | *** | |||||||||
7957009-C-A | 8088968-C-A | *** | |||||||||
8243951-G-A | 8375910-G-A | *** | |||||||||
8383882-C-A | 8515841-C-A | *** | |||||||||
8431724-C-G | 8563683-C-G | *** | |||||||||
8853037-C-A | 8984996-C-A | *** | |||||||||
9645653-CTTTTTTTT-C | 9808044-CTTTTTTTT-C | IR3_Prx | 20×T | *** | |||||||
10938539-C-A | *** | ||||||||||
13299163-C-A | 11143487-C-A | *** | |||||||||
13488796-G-C | 11333120-G-C | *** | |||||||||
13488801-A-G | 11333125-A-G | *** | |||||||||
13488820-C-T | 11333144-C-T | *** | |||||||||
13596588-C-A | 11440912-C-A | *** | |||||||||
13801181-A-T | 11680475-A-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13856767-G-T | 11736061-G-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13857244-A-G | 11736538-A-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13936129-C-CAGAAAGAA | 11815423-C-CAGAAAGAA | 6×AGAA | *** | ||||||||
14460129-C-A | 12339402-C-A | *** | |||||||||
14488506-T-C | 12367775-T-C | *** | |||||||||
14949170-G-A | 12837244-G-A | *** | |||||||||
15131228-C-A | 13019315-C-A | *** | |||||||||
15320710-G-T | 13208828-G-T | *** | |||||||||
15739462-C-A | 13627582-C-A | *** | |||||||||
16057842-GT-G | 13945962-GT-G | *** | |||||||||
17974160-C-A | 15862280-C-A | *** | |||||||||
18421723-G-T | 16309843-G-T | P6_Gap | *** | ||||||||
18859778-C-A | 16747898-C-A | *** | |||||||||
19226049-C-A | 17114169-C-A | *** | |||||||||
21151647-G-T | 18989761-G-T | *** | |||||||||
21979751-C-A | 19817865-C-A | *** | |||||||||
22011778-T-G | 19849892-T-G | *** | |||||||||
22147314-AAAACAAAC-A | 19985428-AAAACAAAC-A | 5×AAAC | *** | ||||||||
22935266-C-A | 20773380-C-A | *** | |||||||||
22950888-C-A | 20789002-C-A | *** | |||||||||
23098815-TCAA-T,TAAA | 20936929-TCAA-T,TAAA | *** | |||||||||
24109051-C-A | 21962904-C-A | P3_b1 | *** | ||||||||
28777095-A-G | 26630948-A-G | *** | |||||||||
15413217-TA-T | 13301337-TA-T | 9×A | *** | ||||||||
2979554-G-T | 3111513-G-T | *** | |||||||||
6692829-CA-C,CAA | 6824788-CA-C,CAA | 14×A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
---|---|---|---|
Manual | 21100421-C-T | 18938535-C-T | 9T |