McFarland
FTDNA: 149904, BigY3: 149904, BigY2: 149904MDKA Birth: Scotland
Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 149904 | BigY3 149904 | BigY2 149904 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
20891740-C-G | 18729854-C-G | P4_Dst | A+ | |||||||
6292696-G-A | 6424655-G-A | IR3_Dst | *** | A* | A* | |||||
20752435-G-C | 18590549-G-C | P4_Prx | *** | A* | A* | |||||
22508526-C-T | 20346640-C-T | DYZ19 | A* | |||||||
8509534-C-T | 8641493-C-T | BY73526 | Y | Y | + | + | + | |||
16320101-A-C | 14208221-A-C | ** | ||||||||
19409374-T-A | 17297494-T-A | ** | ||||||||
24386648-C-A | 22240501-C-A | PF1291 | ** | ** | ||||||
18627616-G-T | 16515736-G-T | FT297731 | ** | |||||||
58985443-C-T | 56839296-C-T | ** | ||||||||
14295414-C-A | 12174708-C-A | ** | ||||||||
8389600-G-A | 8521559-G-A | ** | ||||||||
7433956-C-A | 7565915-C-A | ** | ||||||||
58985444-T-G | 56839297-T-G | ** | ||||||||
9927308-C-A | 10089699-C-A | ** | ||||||||
24112775-C-A | 21966628-C-A | P3_b1 | ** | |||||||
6995127-CAAA-C | 7127086-CAAA-C | 13×A | ** | |||||||
19544394-C-A | 17432514-C-A | ** | ||||||||
28620684-A-G | 26474537-A-G | ** | ||||||||
6125761-C-A | 6257720-C-A | ** | ||||||||
21382098-C-A | 19220212-C-A | ** | ||||||||
10860018-C-T | ** | |||||||||
9117205-C-A | 9279596-C-A | ** | ||||||||
9887091-A-C | 10049482-A-C | ** | ||||||||
8678101-C-A | 8810060-C-A | ** | ||||||||
14846801-C-A | 12734867-C-A | ** | ||||||||
9381898-C-A | 9544289-C-A | ** | ||||||||
10888645-C-A | ** | |||||||||
15786062-C-A | 13674182-C-A | ** | ||||||||
28724269-C-T | 26578122-C-T | ** | ||||||||
14390040-C-A | 12269336-C-A | ** | ||||||||
4655286-G-T | 4787245-G-T | ** | ||||||||
17104170-C-A | 14992290-C-A | ** | ||||||||
24252247-A-C | 22106100-A-C | P3_b1 | ** | |||||||
27998485-CAAAAAAA-C | 25852338-CAAAAAAA-C | P1_Y2 | 30×A | ** | ||||||
9942960-C-A | 10105351-C-A | ** | ||||||||
10914734-G-T | ** | |||||||||
6992595-C-A | 7124554-C-A | ** | ||||||||
9116866-G-T | 9279257-G-T | ** | ||||||||
10841897-A-T | ** | |||||||||
10977075-C-T | ** | |||||||||
14357819-C-A | 12237114-C-A | ** | ||||||||
28707360-C-A | 26561213-C-A | ** | ||||||||
16462517-C-A | 14350637-C-A | ** | ||||||||
10937389-C-A | ** | |||||||||
10864357-A-T | ** | |||||||||
10864363-C-T | ** | |||||||||
10864384-T-C | ** | |||||||||
10864385-T-A | ** | |||||||||
10864391-C-A | ** | |||||||||
10864396-C-T | ** | |||||||||
10785819-T-A | ** | |||||||||
23460435-C-A | 21298549-C-A | ** | ||||||||
10860008-C-CTGCAT | ** | |||||||||
23203802-C-A | 21041916-C-A | ** | ||||||||
16605065-C-A | 14493185-C-A | ** | ||||||||
13976696-A-G | 11855990-A-G | ** | ||||||||
22218858-A-G | 20056972-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
9735649-C-T | 9898040-C-T | IR3_Prx | ** | |||||||
10796791-C-T | ** | |||||||||
22868930-C-A | 20707044-C-A | ** | ||||||||
2833253-C-A | 2965212-C-A | ** | ||||||||
14029363-C-A | 11908657-C-A | ** | ||||||||
4101073-C-A | 4233032-C-A | ** | ||||||||
15688267-C-A | 13576387-C-A | ** | ||||||||
13217087-C-A | 11061411-C-A | ** | ||||||||
4898484-C-A | 5030443-C-A | ** | ||||||||
9805058-C-A | 9967449-C-A | ** | ||||||||
5022007-GAAAAA-G | 5153966-GAAAAA-G | 16×A | ** | |||||||
10763349-C-T | ** | |||||||||
28532612-C-A | 26386465-C-A | ** | ||||||||
9918861-T-A | 10081252-T-A | FT333231 | ** | |||||||
21435439-G-A | 19273553-G-A | ** | ||||||||
10050203-G-T | 10212594-G-T | ** | ||||||||
5874363-C-A | 6006322-C-A | ** | ||||||||
4443007-G-C | 4574966-G-C | ** | ||||||||
14846809-G-T | 12734875-G-T | ** | ||||||||
11024643-C-A | ** | |||||||||
10973843-C-A | ** | |||||||||
6510516-C-A | 6642475-C-A | ** | ||||||||
7182192-G-T | 7314151-G-T | ** | ||||||||
9936439-C-A | 10098830-C-A | ** | ||||||||
16016425-A-G | 13904545-A-G | ** | ||||||||
10958555-C-A | ** | |||||||||
4873709-C-A | 5005668-C-A | ** | ||||||||
18368639-TG-T | 16256759-TG-T | P6_Prx | ** | |||||||
8385255-C-A | 8517214-C-A | ** | ||||||||
13902831-C-A | 11782125-C-A | ** | ||||||||
11037098-C-T | ** | |||||||||
11037119-A-ATTCCT | ** | |||||||||
10766339-T-A | ** | |||||||||
17014694-G-T | 14902814-G-T | ** | ||||||||
18422772-C-A | 16310892-C-A | P6_Gap | ** | |||||||
10763331-CTT-C | ** | |||||||||
10796451-C-T | ** | |||||||||
9986205-C-A | 10148596-C-A | ** | ||||||||
14483202-C-A | 12362471-C-A | ** | ||||||||
21888434-C-A | 19726548-C-A | ** | ||||||||
14875621-G-T | 12763691-G-T | ** | ||||||||
10693254-C-A | ** | |||||||||
28798698-G-T | 26652551-G-T | ** | ||||||||
4604200-C-G | 4736159-C-G | ** | ||||||||
3846607-C-A | 3978566-C-A | ** | ||||||||
14711817-A-C | 12599884-A-C | ** | ||||||||
2665625-A-G | 2797584-A-G | ** | ||||||||
2745044-C-A | 2877003-C-A | ** | ||||||||
2785253-T-G | 2917212-T-G | ** | ||||||||
2852603-T-G | 2984562-T-G | ** | ||||||||
2860253-T-A | 2992212-T-A | ** | ||||||||
2892588-C-A | 3024547-C-A | ** | ||||||||
2942033-T-C | 3073992-T-C | ** | ||||||||
2970758-T-G | 3102717-T-G | ** | ||||||||
3019614-C-A | 3151573-C-A | ** | ||||||||
3042415-GT-G | 3174374-GT-G | ** | ||||||||
3054850-C-A | 3186809-C-A | ** | ||||||||
3061323-C-A | 3193282-C-A | ** | ||||||||
3089964-G-T | 3221923-G-T | ** | ||||||||
3093117-T-G | 3225076-T-G | ** | ||||||||
3262853-G-T | 3394812-G-T | ** | ||||||||
3262954-C-A | 3394913-C-A | ** | ||||||||
3275661-G-T | 3407620-G-T | ** | ||||||||
3279025-T-G | 3410984-T-G | ** | ||||||||
3284151-A-G | 3416110-A-G | ** | ||||||||
3286617-C-T | 3418576-C-T | ** | ||||||||
3328117-A-C | 3460076-A-C | ** | ||||||||
3328137-A-C | 3460096-A-C | ** | ||||||||
3348120-C-G | 3480079-C-G | ** | ||||||||
3348177-A-C | 3480136-A-C | ** | ||||||||
3374276-C-A | 3506235-C-A | ** | ||||||||
3415191-C-T | 3547150-C-T | ** | ||||||||
3445284-G-T | 3577243-G-T | ** | ||||||||
3445380-G-T | 3577339-G-T | ** | ||||||||
3491967-T-G | 3623926-T-G | ** | ||||||||
3565690-T-G | 3697649-T-G | ** | ||||||||
3601758-G-A | 3733717-G-A | ** | ||||||||
3602783-A-G | 3734742-A-G | ** | ||||||||
3621026-G-T | 3752985-G-T | ** | ||||||||
3626282-C-T | 3758241-C-T | ** | ||||||||
3669581-G-T | 3801540-G-T | ** | ||||||||
3673012-G-A | 3804971-G-A | ** | ||||||||
3688365-C-A | 3820324-C-A | ** | ||||||||
3732735-G-A | 3864694-G-A | ** | ||||||||
3804394-G-T | 3936353-G-T | ** | ||||||||
3815145-G-T | 3947104-G-T | ** | ||||||||
3847394-G-C | 3979353-G-C | ** | ||||||||
3879351-A-G | 4011310-A-G | ** | ||||||||
3953061-C-A | 4085020-C-A | ** | ||||||||
3966853-T-G | 4098812-T-G | ** | ||||||||
3966910-G-T | 4098869-G-T | ** | ||||||||
3978210-C-A | 4110169-C-A | ** | ||||||||
3986085-G-T | 4118044-G-T | ** | ||||||||
3986090-G-T | 4118049-G-T | ** | ||||||||
3997789-C-A | 4129748-C-A | ** | ||||||||
4070764-C-A | 4202723-C-A | ** | ||||||||
4101085-C-A | 4233044-C-A | ** | ||||||||
4107799-T-G | 4239758-T-G | ** | ||||||||
4113008-T-G | 4244967-T-G | ** | ||||||||
4127537-T-G | 4259496-T-G | ** | ||||||||
4136978-C-A | 4268937-C-A | ** | ||||||||
4172554-C-A | 4304513-C-A | ** | ||||||||
4245131-C-A | 4377090-C-A | ** | ||||||||
4270846-G-T | 4402805-G-T | ** | ||||||||
4272615-G-C | 4404574-G-C | ** | ||||||||
4298351-A-G | 4430310-A-G | ** | ||||||||
4370961-G-T | 4502920-G-T | ** | ||||||||
4425990-C-A | 4557949-C-A | ** | ||||||||
4426621-C-A | 4558580-C-A | ** | ||||||||
4433453-C-A | 4565412-C-A | ** | ||||||||
4473498-A-T | 4605457-A-T | ** | ||||||||
4504627-T-G | 4636586-T-G | ** | ||||||||
4553904-A-G | 4685863-A-G | ** | ||||||||
4560716-G-C | 4692675-G-C | ** | ||||||||
4580661-G-T | 4712620-G-T | ** | ||||||||
4604984-T-C | 4736943-T-C | ** | ||||||||
4626809-C-A | 4758768-C-A | ** | ||||||||
4630777-T-G | 4762736-T-G | ** | ||||||||
4630806-T-G | 4762765-T-G | ** | ||||||||
4632508-G-T | 4764467-G-T | ** | ||||||||
4687954-A-C | 4819913-A-C | ** | ||||||||
4715137-C-A | 4847096-C-A | ** | ||||||||
4731033-C-A | 4862992-C-A | ** | ||||||||
4755773-T-G | 4887732-T-G | ** | ||||||||
4755817-G-T | 4887776-G-T | ** | ||||||||
4757741-T-A | 4889700-T-A | ** | ||||||||
4778528-G-T | 4910487-G-T | ** | ||||||||
4778538-G-T | 4910497-G-T | ** | ||||||||
4888164-C-A | 5020123-C-A | ** | ||||||||
4898037-T-G | 5029996-T-G | ** | ||||||||
4908704-C-A | 5040663-C-A | ** | ||||||||
4996060-A-C | 5128019-A-C | ** | ||||||||
4996187-C-T | 5128146-C-T | ** | ||||||||
5061022-T-A | 5192981-T-A | ** | ||||||||
5116105-G-T | 5248064-G-T | ** | ||||||||
5127174-G-T | 5259133-G-T | ** | ||||||||
5127181-C-A | 5259140-C-A | ** | ||||||||
5172760-A-G | 5304719-A-G | ** | ||||||||
5184121-G-T | 5316080-G-T | ** | ||||||||
5184156-G-T | 5316115-G-T | ** | ||||||||
5184231-G-T | 5316190-G-T | ** | ||||||||
5184236-G-T | 5316195-G-T | ** | ||||||||
5184259-A-C | 5316218-A-C | ** | ||||||||
5189269-G-T | 5321228-G-T | ** | ||||||||
5200304-T-G | 5332263-T-G | ** | ||||||||
5200765-G-C | 5332724-G-C | ** | ||||||||
5212656-A-C | 5344615-A-C | ** | ||||||||
5218041-G-T | 5350000-G-T | ** | ||||||||
5230921-T-G | 5362880-T-G | ** | ||||||||
5289034-G-T | 5420993-G-T | ** | ||||||||
5293871-C-A | 5425830-C-A | ** | ||||||||
5335969-T-C | 5467928-T-C | ** | ||||||||
5335971-C-A | 5467930-C-A | ** | ||||||||
5358575-G-C | 5490534-G-C | ** | ||||||||
5358852-G-T | 5490811-G-T | ** | ||||||||
5358880-G-T | 5490839-G-T | ** | ||||||||
5402347-G-T | 5534306-G-T | ** | ||||||||
5414533-C-G | 5546492-C-G | ** | ||||||||
5414594-T-G | 5546553-T-G | ** | ||||||||
5419860-C-A | 5551819-C-A | ** | ||||||||
5419911-G-C | 5551870-G-C | ** | ||||||||
5419928-T-G | 5551887-T-G | ** | ||||||||
5420576-G-T | 5552535-G-T | ** | ||||||||
5421176-A-C | 5553135-A-C | ** | ||||||||
5426240-T-A | 5558199-T-A | ** | ||||||||
5447177-C-A | 5579136-C-A | ** | ||||||||
5492718-G-T | 5624677-G-T | ** | ||||||||
5533845-T-C | 5665804-T-C | ** | ||||||||
5565101-C-A | 5697060-C-A | ** | ||||||||
5644600-G-C | 5776559-G-C | ** | ||||||||
5644604-G-T | 5776563-G-T | ** | ||||||||
5645100-C-A | 5777059-C-A | ** | ||||||||
5650751-C-A | 5782710-C-A | ** | ||||||||
5650812-C-A | 5782771-C-A | ** | ||||||||
5659323-T-G | 5791282-T-G | ** | ||||||||
5669964-A-C | 5801923-A-C | ** | ||||||||
5675556-T-C | 5807515-T-C | ** | ||||||||
5684047-C-G | 5816006-C-G | ** | ||||||||
5684120-C-A | 5816079-C-A | ** | ||||||||
5720738-A-G | 5852697-A-G | ** | ||||||||
5728429-C-A | 5860388-C-A | ** | ||||||||
5742772-C-A | 5874731-C-A | ** | ||||||||
5755099-C-T | 5887058-C-T | ** | ||||||||
5796726-A-T | 5928685-A-T | ** | ||||||||
5817784-G-C | 5949743-G-C | ** | ||||||||
5824786-A-C | 5956745-A-C | ** | ||||||||
5829286-A-C | 5961245-A-C | ** | ||||||||
5829615-T-G | 5961574-T-G | ** | ||||||||
5829644-T-G | 5961603-T-G | ** | ||||||||
5845826-G-T | 5977785-G-T | ** | ||||||||
5846419-C-A | 5978378-C-A | ** | ||||||||
5846433-C-A | 5978392-C-A | ** | ||||||||
5852579-C-A | 5984538-C-A | ** | ||||||||
5853742-C-A | 5985701-C-A | ** | ||||||||
5853856-G-T | 5985815-G-T | ** | ||||||||
5857959-C-A | 5989918-C-A | ** | ||||||||
5865675-C-A | 5997634-C-A | ** | ||||||||
5965515-G-T | 6097474-G-T | ** | ||||||||
5965568-T-G | 6097527-T-G | ** | ||||||||
5965575-G-T | 6097534-G-T | ** | ||||||||
5989512-G-T | 6121471-G-T | ** | ||||||||
6001663-G-C | 6133622-G-C | ** | ||||||||
6010280-G-T | 6142239-G-T | ** | ||||||||
6024750-G-T | 6156709-G-T | ** | ||||||||
6040256-C-T | 6172215-C-T | ** | ||||||||
6092249-G-T | 6224208-G-T | ** | ||||||||
6125990-G-T | 6257949-G-T | ** | ||||||||
6166943-G-T | 6298902-G-T | IR3_Dst | ** | |||||||
6190342-C-A | 6322301-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6223526-T-G | 6355485-T-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6245735-C-A | 6377694-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6280465-A-C | 6412424-A-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6394183-C-A | 6526142-C-A | ** | ||||||||
6516232-C-A | 6648191-C-A | ** | ||||||||
6520214-C-A | 6652173-C-A | ** | ||||||||
6619640-T-G | 6751599-T-G | ** | ||||||||
6646781-C-A | 6778740-C-A | ** | ||||||||
6648518-C-A | 6780477-C-A | ** | ||||||||
6697153-C-A | 6829112-C-A | ** | ||||||||
6730471-C-A | 6862430-C-A | ** | ||||||||
6751476-G-T | 6883435-G-T | ** | ||||||||
6832184-C-A | 6964143-C-A | ** | ||||||||
6881230-T-C | 7013189-T-C | ** | ||||||||
6926252-A-C | 7058211-A-C | ** | ||||||||
6978314-C-A | 7110273-C-A | ** | ||||||||
6998363-G-T | 7130322-G-T | ** | ||||||||
6998424-G-T | 7130383-G-T | ** | ||||||||
7050193-C-A | 7182152-C-A | ** | ||||||||
7091119-T-G | 7223078-T-G | ** | ||||||||
7095181-G-T | 7227140-G-T | ** | ||||||||
7138355-G-T | 7270314-G-T | ** | ||||||||
7138363-T-G | 7270322-T-G | ** | ||||||||
7138364-G-T | 7270323-G-T | ** | ||||||||
7140627-C-A | 7272586-C-A | ** | ||||||||
7140743-AG-A | 7272702-AG-A | ** | ||||||||
7140920-T-G | 7272879-T-G | ** | ||||||||
7140921-T-A | 7272880-T-A | ** | ||||||||
7140932-A-C | 7272891-A-C | ** | ||||||||
7148440-C-T | 7280399-C-T | ** | ||||||||
7217452-A-C | 7349411-A-C | ** | ||||||||
7225557-C-A | 7357516-C-A | ** | ||||||||
7303928-G-A | 7435887-G-A | BY161167 | ** | |||||||
7320416-C-A | 7452375-C-A | ** | ||||||||
7322777-C-A | 7454736-C-A | ** | ||||||||
7337840-C-A | 7469799-C-A | ** | ||||||||
7338656-G-T | 7470615-G-T | ** | ||||||||
7338866-A-T | 7470825-A-T | ** | ||||||||
7360668-C-T | 7492627-C-T | ** | ||||||||
7422227-A-C | 7554186-A-C | ** | ||||||||
7422251-A-C | 7554210-A-C | ** | ||||||||
7580032-G-A | 7711991-G-A | ** | ||||||||
7621351-A-C | 7753310-A-C | ** | ||||||||
7643099-A-G | 7775058-A-G | ** | ||||||||
7695704-G-T | 7827663-G-T | ** | ||||||||
7717612-T-C | 7849571-T-C | ** | ||||||||
7717959-T-G | 7849918-T-G | ** | ||||||||
7759180-G-T | 7891139-G-T | ** | ||||||||
7829660-A-T | 7961619-A-T | ** | ||||||||
7860146-G-C | 7992105-G-C | ** | ||||||||
7862085-G-T | 7994044-G-T | ** | ||||||||
7886191-G-T | 8018150-G-T | ** | ||||||||
7939371-G-T | 8071330-G-T | ** | ||||||||
7996076-A-C | 8128035-A-C | ** | ||||||||
8058630-G-T | 8190589-G-T | ** | ||||||||
8333575-C-A | 8465534-C-A | ** | ||||||||
8344031-T-G | 8475990-T-G | ** | ||||||||
8344514-C-A | 8476473-C-A | ** | ||||||||
8385583-G-A | 8517542-G-A | ** | ||||||||
8389608-G-A | 8521567-G-A | ** | ||||||||
8661058-G-T | 8793017-G-T | ** | ||||||||
8661826-G-T | 8793785-G-T | ** | ||||||||
8668330-A-G | 8800289-A-G | ** | ||||||||
8673314-G-T | 8805273-G-T | ** | ||||||||
8678281-A-C | 8810240-A-C | ** | ||||||||
8733147-C-A | 8865106-C-A | ** | ||||||||
8735584-C-A | 8867543-C-A | ** | ||||||||
8811271-C-A | 8943230-C-A | ** | ||||||||
8811439-C-A | 8943398-C-A | ** | ||||||||
8987294-A-C | 9149685-A-C | ** | ||||||||
9015360-C-A | 9177751-C-A | ** | ||||||||
9076725-G-T | 9239116-G-T | ** | ||||||||
9402656-C-A | 9565047-C-A | ** | ||||||||
9410098-G-T | 9572489-G-T | ** | ||||||||
9465214-G-C | 9627605-G-C | ** | ||||||||
9499232-T-A | 9661623-T-A | ** | ||||||||
9645677-T-C | 9808068-T-C | IR3_Prx | ** | |||||||
9700867-C-A | 9863258-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9700906-T-C | 9863297-T-C | IR3_Prx | ** | |||||||
9721875-G-T | 9884266-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9799512-C-A | 9961903-C-A | ** | ||||||||
9874972-C-A | 10037363-C-A | ** | ||||||||
9915430-C-A | 10077821-C-A | FT45537 | ** | |||||||
9915477-C-A | 10077868-C-A | ** | ||||||||
9927306-C-A | 10089697-C-A | ** | ||||||||
9941036-G-T | 10103427-G-T | ** | ||||||||
9941068-G-T | 10103459-G-T | ** | ||||||||
9957497-T-C | 10119888-T-C | ** | ||||||||
9963410-T-C | 10125801-T-C | ** | ||||||||
9964388-C-G | 10126779-C-G | ** | ||||||||
9996503-G-T | 10158894-G-T | ** | ||||||||
10009497-C-A | 10171888-C-A | ** | ||||||||
10011892-G-C | 10174283-G-C | ** | ||||||||
10034195-T-C | 10196586-T-C | ** | ||||||||
10647941-C-A | ** | |||||||||
10652449-T-C | ** | |||||||||
10652451-T-C | ** | |||||||||
10654612-T-G | ** | |||||||||
10657168-T-G | ** | |||||||||
10660755-C-A | ** | |||||||||
10660769-C-G | ** | |||||||||
10665475-C-A | ** | |||||||||
10671412-T-G | ** | |||||||||
10671456-G-C | ** | |||||||||
10672685-T-G | ** | |||||||||
10672918-C-A | ** | |||||||||
10678460-G-T | ** | |||||||||
10678506-G-T | ** | |||||||||
10744518-C-A | ** | |||||||||
10756172-C-T | ** | |||||||||
10757176-T-C | ** | |||||||||
10757191-T-C | ** | |||||||||
10757216-C-T | ** | |||||||||
10757218-C-G | ** | |||||||||
10765083-T-G | ** | |||||||||
10773320-C-A | ** | |||||||||
10777586-T-C | ** | |||||||||
10782998-C-G | ** | |||||||||
10785056-G-T | ** | |||||||||
10785772-A-ACTCCC | ** | |||||||||
10785788-C-G | ** | |||||||||
10785804-T-A | ** | |||||||||
10785823-C-T | ** | |||||||||
10785825-C-G | ** | |||||||||
10787384-C-A | ** | |||||||||
10796445-C-G | ** | |||||||||
10796453-C-T | ** | |||||||||
10796477-A-T | ** | |||||||||
10798837-C-A | ** | |||||||||
10812175-C-A | ** | |||||||||
10825077-T-A | ** | |||||||||
10826925-A-G | ** | |||||||||
10832675-C-T | ** | |||||||||
10835791-C-A | ** | |||||||||
10840904-C-A | ** | |||||||||
10841383-C-A | ** | |||||||||
10841811-T-C | ** | |||||||||
10841818-T-A | ** | |||||||||
10841841-C-G | ** | |||||||||
10841853-A-T | ** | |||||||||
10841868-T-A | ** | |||||||||
10841870-A-C | ** | |||||||||
10841887-G-C | ** | |||||||||
10841893-C-T | ** | |||||||||
10841910-T-A | ** | |||||||||
10846359-T-G | ** | |||||||||
10850717-C-A | ** | |||||||||
10857845-C-A | ** | |||||||||
10864345-A-G | ** | |||||||||
10864360-T-A | ** | |||||||||
10864370-T-A | ** | |||||||||
10869343-T-C | ** | |||||||||
10892670-G-T | ** | |||||||||
10893747-C-G | ** | |||||||||
10896347-C-A | ** | |||||||||
10903506-G-T | ** | |||||||||
10903841-A-C | ** | |||||||||
10905918-G-T | ** | |||||||||
10906825-C-A | ** | |||||||||
10914709-T-G | ** | |||||||||
10915856-G-T | ** | |||||||||
10916103-C-T | ** | |||||||||
10935834-C-A | ** | |||||||||
10941557-C-A | ** | |||||||||
10949920-C-A | ** | |||||||||
10955745-C-A | ** | |||||||||
10958216-T-G | ** | |||||||||
10959273-C-A | ** | |||||||||
10974784-A-T | ** | |||||||||
10977096-T-G | ** | |||||||||
10977128-G-A | ** | |||||||||
10986559-A-G | ** | |||||||||
10988133-C-A | ** | |||||||||
10988156-C-A | ** | |||||||||
10988175-A-C | ** | |||||||||
10991216-A-T | ** | |||||||||
10992418-T-G | ** | |||||||||
10992962-ACCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATT-A | ** | |||||||||
10994482-C-A | ** | |||||||||
10994564-C-A | ** | |||||||||
10994579-C-A | ** | |||||||||
10994603-C-A | ** | |||||||||
10997036-A-G | ** | |||||||||
10997453-G-T | ** | |||||||||
10997874-C-A | ** | |||||||||
10999122-C-G | ** | |||||||||
10999484-C-A | ** | |||||||||
11024334-T-G | ** | |||||||||
11024476-C-G | ** | |||||||||
11034171-T-C | ** | |||||||||
13217866-G-T | 11062190-G-T | ** | ||||||||
13226300-C-A | 11070624-C-A | ** | ||||||||
13226479-G-C | 11070803-G-C | ** | ||||||||
13231728-C-A | 11076052-C-A | ** | ||||||||
13231782-C-A | 11076106-C-A | ** | ||||||||
13310780-C-A | 11155104-C-A | ** | ||||||||
13324652-C-A | 11168976-C-A | ** | ||||||||
13328811-G-T | 11173135-G-T | ** | ||||||||
13361543-C-A | 11205867-C-A | FT399469 | ** | |||||||
13368112-G-T | 11212436-G-T | ** | ||||||||
13384524-G-T | 11228848-G-T | ** | ||||||||
13384526-T-G | 11228850-T-G | ** | ||||||||
13433232-T-G | 11277556-T-G | ** | ||||||||
13484696-T-TACATCA | 11329020-T-TACATCA | ** | ||||||||
13484706-A-G | 11329030-A-G | ** | ||||||||
13484707-A-G | 11329031-A-G | ** | ||||||||
13494093-C-A | 11338417-C-A | ** | ||||||||
13544989-G-T | 11389313-G-T | ** | ||||||||
13558290-A-C | 11402614-A-C | ** | ||||||||
13575534-G-T | 11419858-G-T | ** | ||||||||
13585474-C-A | 11429798-C-A | ** | ||||||||
13595685-C-A | 11440009-C-A | ** | ||||||||
13603300-C-A | 11447624-C-A | ** | ||||||||
13610929-C-A | 11455253-C-A | ** | ||||||||
13633111-C-A | 11477435-C-A | ** | ||||||||
13639064-G-T | 11483388-G-T | ** | ||||||||
13643957-T-C | 11488281-T-C | ** | ||||||||
11645003-G-T | FT449808 | DYZ17 | ** | |||||||
11645013-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11645088-G-T | FT449816 | DYZ17 | ** | |||||||
11655594-A-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11657008-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
11659177-G-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11671636-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
13854517-A-C | 11733811-A-C | DYZ17 | ** | |||||||
13857092-G-C | 11736386-G-C | DYZ17 | ** | |||||||
13882988-G-C | 11762282-G-C | ** | ||||||||
13884403-G-A | 11763697-G-A | ** | ||||||||
13902882-C-A | 11782176-C-A | ** | ||||||||
13919851-C-A | 11799145-C-A | ** | ||||||||
13920933-G-T | 11800227-G-T | ** | ||||||||
13920977-G-T | 11800271-G-T | ** | ||||||||
13962624-G-T | 11841918-G-T | ** | ||||||||
13967022-A-G | 11846316-A-G | ** | ||||||||
13996007-G-T | 11875301-G-T | ** | ||||||||
13996010-G-T | 11875304-G-T | ** | ||||||||
14012849-G-T | 11892143-G-T | ** | ||||||||
14109428-C-A | 11988722-C-A | ** | ||||||||
14109450-C-T | 11988744-C-T | ** | ||||||||
14114845-G-T | 11994139-G-T | ** | ||||||||
14131373-T-G | 12010667-T-G | ** | ||||||||
14166133-G-T | 12045427-G-T | ** | ||||||||
14166186-G-T | 12045480-G-T | ** | ||||||||
14176424-G-T | 12055718-G-T | ** | ||||||||
14218556-C-A | 12097850-C-A | ** | ||||||||
14224371-C-G | 12103665-C-G | ** | ||||||||
14230312-A-G | 12109606-A-G | ** | ||||||||
14284771-C-A | 12164065-C-A | ** | ||||||||
14300166-C-A | 12179460-C-A | ** | ||||||||
14307880-C-A | 12187174-C-A | ** | ||||||||
14328286-G-T | 12207580-G-T | ** | ||||||||
14351321-T-G | 12230616-T-G | ** | ||||||||
14366388-T-A | 12245683-T-A | ** | ||||||||
14373677-T-G | 12252973-T-G | ** | ||||||||
14384749-G-T | 12264045-G-T | ** | ||||||||
14409052-C-A | 12288349-C-A | ** | ||||||||
14428147-A-C | 12307422-A-C | ** | ||||||||
14441923-A-C | 12321196-A-C | ** | ||||||||
14474909-G-T | 12354178-G-T | ** | ||||||||
14485283-G-A | 12364552-G-A | ** | ||||||||
14490316-C-A | 12369585-C-A | ** | ||||||||
14501809-C-A | 12390014-C-A | ** | ||||||||
14514770-C-A | 12402975-C-A | ** | ||||||||
14514860-C-A | 12403065-C-A | ** | ||||||||
14518929-G-C | 12407130-G-C | ** | ||||||||
14519450-C-T | 12407651-C-T | ** | ||||||||
14519581-A-T | 12407782-A-T | ** | ||||||||
14552644-A-C | 12440845-A-C | ** | ||||||||
14564536-C-A | 12452736-C-A | ** | ||||||||
14564549-C-A | 12452749-C-A | ** | ||||||||
14566553-A-T | 12454753-A-T | ** | ||||||||
14605703-C-A | 12493905-C-A | ** | ||||||||
14649564-C-A | 12537629-C-A | ** | ||||||||
14656147-C-A | 12544212-C-A | ** | ||||||||
14667874-A-C | 12555940-A-C | ** | ||||||||
14667935-T-C | 12556001-T-C | ** | ||||||||
14669172-C-A | 12557238-C-A | ** | ||||||||
14671009-T-G | 12559075-T-G | ** | ||||||||
14671017-G-A | 12559083-G-A | ** | ||||||||
14693713-T-C | 12581779-T-C | ** | ||||||||
14696043-G-T | 12584109-G-T | ** | ||||||||
14711829-A-C | 12599896-A-C | ** | ||||||||
14711852-C-A | 12599919-C-A | ** | ||||||||
14717791-C-T | 12605859-C-T | ** | ||||||||
14717858-T-C | 12605926-T-C | ** | ||||||||
14721558-C-T | 12609626-C-T | ** | ||||||||
14721782-C-A | 12609850-C-A | ** | ||||||||
14736146-C-A | 12624214-C-A | ** | ||||||||
14886357-C-A | 12774423-C-A | ** | ||||||||
14926269-C-A | 12814334-C-A | ** | ||||||||
14926282-T-C | 12814347-T-C | ** | ||||||||
14960511-T-C | 12848586-T-C | ** | ||||||||
15044490-G-C | 12932580-G-C | ** | ||||||||
15083691-C-A | 12971781-C-A | ** | ||||||||
15177757-G-T | 13065843-G-T | ** | ||||||||
15209261-G-A | 13097347-G-A | ** | ||||||||
15232100-C-G | 13120186-C-G | ** | ||||||||
15232339-G-T | 13120425-G-T | ** | ||||||||
15333586-G-C | 13221704-G-C | ** | ||||||||
15400302-C-A | 13288422-C-A | FT23566 | ** | |||||||
15558113-G-T | 13446233-G-T | ** | ||||||||
15576754-C-A | 13464874-C-A | ** | ||||||||
15605641-G-A | 13493761-G-A | ** | ||||||||
15730471-A-C | 13618591-A-C | ** | ||||||||
15734260-A-G | 13622380-A-G | ** | ||||||||
15742383-G-T | 13630503-G-T | FTB77985 | ** | |||||||
15743009-A-C | 13631129-A-C | ** | ||||||||
15743019-C-A | 13631139-C-A | ** | ||||||||
15756389-T-G | 13644509-T-G | ** | ||||||||
15776778-C-A | 13664898-C-A | ** | ||||||||
15776898-G-T | 13665018-G-T | ** | ||||||||
15776905-C-G | 13665025-C-G | ** | ||||||||
15823572-C-A | 13711692-C-A | ** | ||||||||
15842984-T-G | 13731104-T-G | ** | ||||||||
15844633-C-A | 13732753-C-A | ** | ||||||||
15844758-AT-A | 13732878-AT-A | ** | ||||||||
15882688-C-G | 13770808-C-G | ** | ||||||||
15921221-G-T | 13809341-G-T | ** | ||||||||
15921964-G-T | 13810084-G-T | ** | ||||||||
15921992-T-G | 13810112-T-G | ** | ||||||||
15931736-G-A | 13819856-G-A | ** | ||||||||
15937123-C-A | 13825243-C-A | ** | ||||||||
15940162-C-A | 13828282-C-A | ** | ||||||||
15946750-T-G | 13834870-T-G | ** | ||||||||
16005487-G-T | 13893607-G-T | ** | ||||||||
16018970-C-A | 13907090-C-A | ** | ||||||||
16027645-G-T | 13915765-G-T | ** | ||||||||
16028563-C-A | 13916683-C-A | ** | ||||||||
16029589-A-T | 13917709-A-T | ** | ||||||||
16044803-C-A | 13932923-C-A | ** | ||||||||
16047109-T-G | 13935229-T-G | ** | ||||||||
16052184-C-A | 13940304-C-A | ** | ||||||||
16056081-G-A | 13944201-G-A | ** | ||||||||
16057342-C-A | 13945462-C-A | ** | ||||||||
16070005-G-T | 13958125-G-T | ** | ||||||||
16070898-C-A | 13959018-C-A | ** | ||||||||
16180386-C-A | 14068506-C-A | ** | ||||||||
16232510-C-A | 14120630-C-A | ** | ||||||||
16266068-C-A | 14154188-C-A | ** | ||||||||
16399863-T-C | 14287983-T-C | ** | ||||||||
16410625-C-A | 14298745-C-A | ** | ||||||||
16422049-G-T | 14310169-G-T | ** | ||||||||
16422899-G-T | 14311019-G-T | ** | ||||||||
16422939-G-T | 14311059-G-T | ** | ||||||||
16422940-G-T | 14311060-G-T | ** | ||||||||
16501887-C-A | 14390007-C-A | ** | ||||||||
16501926-C-A | 14390046-C-A | ** | ||||||||
16501932-C-A | 14390052-C-A | ** | ||||||||
16501956-C-A | 14390076-C-A | ** | ||||||||
16540347-G-T | 14428467-G-T | ** | ||||||||
16559920-C-A | 14448040-C-A | ** | ||||||||
16575056-C-T | 14463176-C-T | ** | ||||||||
16575075-G-T | 14463195-G-T | ** | ||||||||
16623884-G-C | 14512004-G-C | ** | ||||||||
16673184-C-T | 14561304-C-T | ** | ||||||||
16688260-C-A | 14576380-C-A | ** | ||||||||
16712962-G-T | 14601082-G-T | ** | ||||||||
16777740-T-C | 14665860-T-C | ** | ||||||||
16777758-A-C | 14665878-A-C | ** | ||||||||
16827450-T-G | 14715570-T-G | ** | ||||||||
16896350-C-CT | 14784470-C-CT | ** | ||||||||
16974399-G-A | 14862519-G-A | ** | ||||||||
17002640-T-G | 14890760-T-G | ** | ||||||||
17023443-G-T | 14911563-G-T | ** | ||||||||
17064861-C-A | 14952981-C-A | ** | ||||||||
17095333-T-A | 14983453-T-A | ** | ||||||||
17158505-A-T | 15046625-A-T | ** | ||||||||
17158508-T-G | 15046628-T-G | ** | ||||||||
17175484-C-G | 15063604-C-G | ** | ||||||||
17269321-T-G | 15157441-T-G | ** | ||||||||
17338519-G-T | 15226639-G-T | ** | ||||||||
17355519-A-C | 15243639-A-C | ** | ||||||||
17355531-A-C | 15243651-A-C | ** | ||||||||
17366861-C-A | 15254981-C-A | ** | ||||||||
17370829-T-C | 15258949-T-C | ** | ||||||||
17374457-C-A | 15262577-C-A | ** | ||||||||
17377544-C-T | 15265664-C-T | ** | ||||||||
17464899-G-T | 15353019-G-T | ** | ||||||||
17466592-C-A | 15354712-C-A | ** | ||||||||
17475145-C-T | 15363265-C-T | ** | ||||||||
17537878-A-C | 15425998-A-C | ** | ||||||||
17549503-G-C | 15437623-G-C | ** | ||||||||
17549521-T-G | 15437641-T-G | ** | ||||||||
17589049-A-T | 15477169-A-T | ** | ||||||||
17601171-G-T | 15489291-G-T | ** | ||||||||
17702530-G-T | 15590650-G-T | ** | ||||||||
17718342-T-A | 15606462-T-A | ** | ||||||||
17756743-C-A | 15644863-C-A | ** | ||||||||
17787684-G-A | 15675804-G-A | ** | ||||||||
17854367-C-A | 15742487-C-A | ** | ||||||||
17884492-C-G | 15772612-C-G | ** | ||||||||
17929689-C-A | 15817809-C-A | ** | ||||||||
17955949-C-A | 15844069-C-A | ** | ||||||||
18080465-G-T | 15968585-G-T | ** | ||||||||
18094247-T-G | 15982367-T-G | ** | ||||||||
18159401-A-C | 16047521-A-C | ** | ||||||||
18184636-G-T | 16072756-G-T | FTA53706 | ** | |||||||
18191457-C-A | 16079577-C-A | ** | ||||||||
18288533-T-C | 16176653-T-C | P6_Prx | ** | |||||||
18407455-C-T | 16295575-C-T | P6_Gap | ** | |||||||
18440415-C-A | 16328535-C-A | P6_Dst | ** | |||||||
18440419-C-CCA | 16328539-C-CCA | P6_Dst | ** | |||||||
18504910-T-C | 16393030-T-C | P6_Dst | ** | |||||||
18518211-G-T | 16406331-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
18518216-G-T | 16406336-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
18647552-C-A | 16535672-C-A | ** | ||||||||
18807835-C-A | 16695955-C-A | ** | ||||||||
18890476-A-AT | 16778596-A-AT | ** | ||||||||
18932157-A-C | 16820277-A-C | ** | ||||||||
18948150-G-T | 16836270-G-T | ** | ||||||||
18987170-A-C | 16875290-A-C | ** | ||||||||
19053379-T-C | 16941499-T-C | ** | ||||||||
19059964-C-A | 16948084-C-A | ** | ||||||||
19075238-G-A | 16963358-G-A | ** | ||||||||
19075247-G-T | 16963367-G-T | ** | ||||||||
19075305-G-C | 16963425-G-C | ** | ||||||||
19086144-T-G | 16974264-T-G | ** | ||||||||
19086150-C-T | 16974270-C-T | ** | ||||||||
19249534-C-A | 17137654-C-A | ** | ||||||||
19299543-C-A | 17187663-C-A | ** | ||||||||
19304299-G-T | 17192419-G-T | ** | ||||||||
19356274-T-G | 17244394-T-G | ** | ||||||||
19385169-T-C | 17273289-T-C | ** | ||||||||
19524566-A-G | 17412686-A-G | ** | ||||||||
19524591-A-G | 17412711-A-G | ** | ||||||||
19524675-A-G | 17412795-A-G | ** | ||||||||
19558296-C-A | 17446416-C-A | ** | ||||||||
19559138-C-A | 17447258-C-A | ** | ||||||||
19562514-T-G | 17450634-T-G | ** | ||||||||
19576292-G-A | 17464412-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
19609520-A-C | 17497640-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
19625509-T-C | 17513629-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
19677937-G-T | 17566057-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19677952-G-T | 17566072-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19815527-A-C | 17703647-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
19815544-A-AC | 17703664-A-AC | P5_Prx | ** | |||||||
19887274-A-ATT | 17775394-A-ATT | P5_Prx | ** | |||||||
20336809-C-A | 18174923-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
20748636-A-C | 18586750-A-C | P4_Prx | ** | |||||||
20995563-T-TTTCC | 18833677-T-TTTCC | P4_Dst | ** | |||||||
21006548-T-C | 18844662-T-C | P4_Dst | ** | |||||||
21125247-G-T | 18963361-G-T | ** | ||||||||
21149243-A-G | 18987357-A-G | ** | ||||||||
21153288-G-T | 18991402-G-T | ** | ||||||||
21182496-G-T | 19020610-G-T | ** | ||||||||
21201714-C-A | 19039828-C-A | ** | ||||||||
21211210-A-G | 19049324-A-G | ** | ||||||||
21234899-C-A | 19073013-C-A | ** | ||||||||
21274770-G-T | 19112884-G-T | ** | ||||||||
21297889-A-C | 19136003-A-C | ** | ||||||||
21323093-G-T | 19161207-G-T | ** | ||||||||
21363020-G-C | 19201134-G-C | ** | ||||||||
21386319-C-A | 19224433-C-A | ** | ||||||||
21392447-C-CT | 19230561-C-CT | ** | ||||||||
21408388-A-C | 19246502-A-C | ** | ||||||||
21435431-C-T | 19273545-C-T | ** | ||||||||
21446246-G-A | 19284360-G-A | ** | ||||||||
21472291-C-A | 19310405-C-A | ** | ||||||||
21482762-CTTTTTTTTT-C | 19320876-CTTTTTTTTT-C | 19×T | ** | |||||||
21500444-C-A | 19338558-C-A | ** | ||||||||
21633359-C-A | 19471473-C-A | ** | ||||||||
21658592-C-A | 19496706-C-A | ** | ||||||||
21665694-C-G | 19503808-C-G | ** | ||||||||
21682255-C-A | 19520369-C-A | ** | ||||||||
21694884-A-C | 19532998-A-C | ** | ||||||||
21850363-T-A | 19688477-T-A | ** | ||||||||
21939518-C-A | 19777632-C-A | ** | ||||||||
21939695-C-A | 19777809-C-A | ** | ||||||||
21939707-A-C | 19777821-A-C | ** | ||||||||
21969318-T-G | 19807432-T-G | ** | ||||||||
21993851-C-T | 19831965-C-T | ** | ||||||||
22027809-C-T | 19865923-C-T | ** | ||||||||
22060419-C-A | 19898533-C-A | ** | ||||||||
22079474-C-A | 19917588-C-A | ** | ||||||||
22080578-C-A | 19918692-C-A | ** | ||||||||
22134605-T-C | 19972719-T-C | ** | ||||||||
22177463-C-A | 20015577-C-A | ** | ||||||||
22359733-A-C | 20197847-A-C | DYZ19 | ** | |||||||
22366286-T-C | 20204400-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22520679-C-A | 20358793-C-A | ** | ||||||||
22787230-A-G | 20625344-A-G | ** | ||||||||
22827362-A-T | 20665476-A-T | ** | ||||||||
22853592-C-A | 20691706-C-A | ** | ||||||||
22954758-A-C | 20792872-A-C | ** | ||||||||
22963472-A-C | 20801586-A-C | ** | ||||||||
22963533-A-C | 20801647-A-C | ** | ||||||||
22993370-A-C | 20831484-A-C | ** | ||||||||
22994930-C-A | 20833044-C-A | ** | ||||||||
23004883-G-T | 20842997-G-T | ** | ||||||||
23013799-C-A | 20851913-C-A | ** | ||||||||
23058546-A-C | 20896660-A-C | ** | ||||||||
23096554-C-A | 20934668-C-A | ** | ||||||||
23126672-C-A | 20964786-C-A | ** | ||||||||
23142391-A-G | 20980505-A-G | ** | ||||||||
23145974-AT-A | 20984088-AT-A | ** | ||||||||
23199739-C-A | 21037853-C-A | ** | ||||||||
23285130-C-T | 21123244-C-T | ** | ||||||||
23321851-T-C | 21159965-T-C | ** | ||||||||
23355269-C-A | 21193383-C-A | ** | ||||||||
23358644-G-T | 21196758-G-T | ** | ||||||||
23364023-G-T | 21202137-G-T | ** | ||||||||
23372133-C-G | 21210247-C-G | ** | ||||||||
23723646-C-A | 21561760-C-A | ** | ||||||||
23773529-G-T | 21611643-G-T | ** | ||||||||
23818526-G-T | 21656640-G-T | ** | ||||||||
23825173-G-T | 21663287-G-T | ** | ||||||||
23848561-T-C | 21686675-T-C | ** | ||||||||
23885176-G-T | 21723290-G-T | ** | ||||||||
23952733-C-T | 21806586-C-T | ** | ||||||||
24290764-C-A | 22144617-C-A | P3_t1 | ** | |||||||
24290782-C-A | 22144635-C-A | P3_t1 | ** | |||||||
24290811-A-C | 22144664-A-C | P3_t1 | ** | |||||||
24359616-G-T | 22213469-G-T | ** | ||||||||
24363766-G-C | 22217619-G-C | ** | ||||||||
24406594-A-G | 22260447-A-G | ** | ||||||||
24475261-G-T | 22329114-G-T | ** | ||||||||
24491652-T-G | 22345505-T-G | ** | ||||||||
24883606-G-T | 22737459-G-T | g1 | ** | |||||||
24885617-G-A | 22739470-G-A | g1 | ** | |||||||
25302723-C-A | 23156576-C-A | P2_r1 | ** | |||||||
25508335-A-AG | 23362188-A-AG | P1_gr1 | ** | |||||||
25525172-C-A | 23379025-C-A | P1_gr1 | ** | |||||||
25888593-C-A | 23742446-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
25888601-C-A | 23742454-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
25966246-T-TA | 23820099-T-TA | P1_Y1 | ** | |||||||
26355499-C-A | 24209352-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26400428-A-C | 24254281-A-C | P1_Y1 | ** | |||||||
27972546-G-T | 25826399-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27972553-G-T | 25826406-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27972562-G-T | 25826415-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27972584-G-T | 25826437-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
28076644-C-A | 25930497-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28477970-G-T | 26331823-G-T | ** | ||||||||
28480418-C-T | 26334271-C-T | ** | ||||||||
28496428-G-T | 26350281-G-T | ** | ||||||||
28499469-G-T | 26353322-G-T | ** | ||||||||
28504193-T-C | 26358046-T-C | ** | ||||||||
28504195-C-A | 26358048-C-A | ** | ||||||||
28506198-C-A | 26360051-C-A | ** | ||||||||
28511011-A-C | 26364864-A-C | ** | ||||||||
28518845-T-G | 26372698-T-G | ** | ||||||||
28535671-T-G | 26389524-T-G | ** | ||||||||
28536077-C-A | 26389930-C-A | ** | ||||||||
28536106-C-T | 26389959-C-T | ** | ||||||||
28551696-C-T | 26405549-C-T | ** | ||||||||
28551704-C-A | 26405557-C-A | ** | ||||||||
28574484-G-A | 26428337-G-A | ** | ||||||||
28611690-G-GT | 26465543-G-GT | 8×T | ** | |||||||
28613008-C-A | 26466861-C-A | ** | ||||||||
28632958-C-A | 26486811-C-A | ** | ||||||||
28654009-T-C | 26507862-T-C | ** | ||||||||
28656909-G-T | 26510762-G-T | ** | ||||||||
28659876-G-T | 26513729-G-T | ** | ||||||||
28659924-T-G | 26513777-T-G | ** | ||||||||
28687360-A-C | 26541213-A-C | ** | ||||||||
28689137-T-A | 26542990-T-A | ** | ||||||||
28724255-C-G | 26578108-C-G | ** | ||||||||
28724275-C-T | 26578128-C-T | ** | ||||||||
28724289-G-T | 26578142-G-T | ** | ||||||||
28724335-C-T | 26578188-C-T | ** | ||||||||
28724338-G-A | 26578191-G-A | ** | ||||||||
28743226-C-A | 26597079-C-A | ** | ||||||||
28762619-G-T | 26616472-G-T | ** | ||||||||
56822501-T-A | ** | |||||||||
56824570-C-A | ** | |||||||||
56830187-C-A | ** | |||||||||
56835891-T-A | ** | |||||||||
56839696-T-G | ** | |||||||||
56846255-A-C | ** | |||||||||
56848519-G-A | ** | |||||||||
56885869-C-T | ** | |||||||||
4665-G-A | ** | |||||||||
31656-G-T | ** | |||||||||
5075345-T-A | 5207304-T-A | ** | ||||||||
13476600-G-C | 11320924-G-C | ** | ||||||||
18707725-G-T | 16595845-G-T | ** | ||||||||
19512198-A-G | 17400318-A-G | ** | ||||||||
19746219-T-C | 17634339-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
25602241-A-AT | 23456094-A-AT | P1_gr1 | ** | |||||||
27007731-T-C | 24861584-T-C | P1_r4 | ** | |||||||
28324741-C-T | 26178594-C-T | P1_b4 | ** | |||||||
56854868-A-T | ** | |||||||||
13451980-CACCACTCCACTGCTCTCCAA-C,CCACTCCAC | 11296304-CACCACTCCACTGCTCTCCAA-C,CCACTCCAC | *** | ||||||||
13435159-A-T | 11279483-A-T | *** | ||||||||
13435166-T-C | 11279490-T-C | *** | ||||||||
13480896-G-A | 11325220-G-A | *** | ||||||||
13457695-C-A | 11302019-C-A | *** | ||||||||
10785243-C-T | *** | |||||||||
10748277-C-T | *** | |||||||||
22869608-C-A | 20707722-C-A | *** | ||||||||
15029495-CTT-C,CT | 12917583-CTT-C,CT | 16×T | *** | |||||||
10924386-CCACTTTAT-C | *** | |||||||||
4918496-C-T | 5050455-C-T | *** | ||||||||
6664109-T-C | 6796068-T-C | *** | ||||||||
7359791-A-AATAT | 7491750-A-AATAT | 12×AT | *** | |||||||
8094693-G-C | 8226652-G-C | *** | ||||||||
8094700-C-T | 8226659-C-T | BY192492 | *** | |||||||
8094701-G-A | 8226660-G-A | FTB170 | *** | |||||||
8281779-CAAAA-C,CA | 8413738-CAAAA-C,CA | 15×A | *** | |||||||
9873917-C-A | 10036308-C-A | *** | ||||||||
10663611-G-A | *** | |||||||||
10747024-A-G | *** | |||||||||
10785249-A-T | *** | |||||||||
10785251-T-A | *** | |||||||||
13475275-C-A | 11319599-C-A | *** | ||||||||
13478146-C-A | 11322470-C-A | *** | ||||||||
13585292-C-A | 11429616-C-A | *** | ||||||||
14194991-T-G | 12074285-T-G | *** | ||||||||
14273112-C-T | 12152406-C-T | *** | ||||||||
14340793-C-A | 12220088-C-A | *** | ||||||||
17500808-G-T | 15388928-G-T | *** | ||||||||
19204330-T-C | 17092450-T-C | *** | ||||||||
19422858-C-A | 17310978-C-A | *** | ||||||||
21238805-C-A | 19076919-C-A | *** | ||||||||
21263685-C-A | 19101799-C-A | *** | ||||||||
21320051-TG-T | 19158165-TG-T | *** | ||||||||
22505882-T-G | 20343996-T-G | DYZ19 | *** | |||||||
22855071-G-T | 20693185-G-T | *** | ||||||||
22961918-C-A | 20800032-C-A | *** | ||||||||
24070778-TAC-T,TACAC | 21924631-TAC-T,TACAC | P3_b1 | 9×AC | *** | ||||||
26593176-C-A | 24447029-C-A | P1_g2 | *** | |||||||
28778850-TTC-T | 26632703-TTC-T | *** | ||||||||
15919459-G-GT | 13807579-G-GT | 9×T | *** | |||||||
6605511-TTATA-T,TTA | 6737470-TTATA-T,TTA | 14×TA | *** | |||||||
5387228-G-C | 5519187-G-C | *** | ||||||||
6494902-T-G | 6626861-T-G | *** | ||||||||
16170549-C-T | 14058669-C-T | *** | ||||||||
16402013-G-T | 14290133-G-T | *** | ||||||||
21755795-CT-C,CTTT | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.