Biggins
FTDNA: 127469, BigY2: 127469, BigY3: 127469MDKA Birth: Ireland
Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 127469 | BigY2 127469 | BigY3 127469 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3062015-T-A | 3193974-T-A | A* | |||||||||
59026124-C-T | 56879977-C-T | A* | |||||||||
19963834-A-G | 17851954-A-G | P5_Prx | A* | ||||||||
18755369-T-C | 16643489-T-C | Y | Y | A* | |||||||
28816537-T-A | 26670390-T-A | A* | A* | ||||||||
17705431-C-T | 15593551-C-T | BY116798 | Y | Y | + | + | + | ||||
4487392-A-C | 4619351-A-C | FT74878 | + | ||||||||
6601002-A-G | 6732961-A-G | FT75611 | + | ||||||||
21600724-G-A | 19438838-G-A | FT77206 | Y | + | |||||||
18968285-G-A | 16856405-G-A | PF953 | ** | ||||||||
58976969-C-A | 56830822-C-A | ** | |||||||||
13194672-C-A | 11038996-C-A | ** | |||||||||
13394061-A-G | 11238385-A-G | PR4983 | ** | ||||||||
2854773-C-T | 2986732-C-T | ** | |||||||||
13860968-C-A | 11740262-C-A | Z5389 | DYZ17 | ** | |||||||
14965273-G-A | 12853348-G-A | Z12884 | ** | ||||||||
17170411-C-T | 15058531-C-T | M11413 | ** | ||||||||
17277418-C-A | 15165538-C-A | Y6057 | 4×ATAA | ** | |||||||
18195202-G-T | 16083322-G-T | ** | |||||||||
16295711-C-A | 14183831-C-A | ** | |||||||||
20326069-G-T | 18164183-G-T | P5_Dst | ** | ||||||||
14727348-A-G | 12615416-A-G | ** | |||||||||
26100553-A-G | 23954406-A-G | P1_Y1 | ** | ||||||||
17569255-C-G | 15457375-C-G | ** | |||||||||
15963987-A-G | 13852107-A-G | ** | |||||||||
16689880-T-C | 14578000-T-C | ** | |||||||||
15749239-C-A | 13637359-C-A | ** | |||||||||
11031407-T-A | ** | ||||||||||
8124937-C-A | 8256896-C-A | A3721 | ** | ||||||||
16471695-C-A | 14359815-C-A | ** | |||||||||
6267671-T-A | 6399630-T-A | IR3_Dst | ** | ||||||||
13461175-C-T | 11305499-C-T | ** | |||||||||
10892121-T-C | ** | ||||||||||
17301237-TC-T | 15189357-TC-T | ** | |||||||||
16410214-C-A | 14298334-C-A | ** | |||||||||
17492345-C-A | 15380465-C-A | ** | |||||||||
11031415-C-A | ** | ||||||||||
5449957-G-T | 5581916-G-T | ** | |||||||||
13927506-C-A | 11806800-C-A | ** | |||||||||
16056965-C-A | 13945085-C-A | ** | |||||||||
22760842-C-A | 20598956-C-A | ** | |||||||||
25524728-A-G | 23378581-A-G | P1_gr1 | ** | ||||||||
6694342-C-A | 6826301-C-A | ** | |||||||||
14981757-T-G | 12869833-T-G | ** | |||||||||
17201758-A-T | 15089878-A-T | ** | |||||||||
6267696-T-A | 6399655-T-A | IR3_Dst | 19×A | ** | |||||||
15866156-G-A | 13754276-G-A | ** | |||||||||
10686706-C-CACTAA | ** | ||||||||||
10686731-C-A | ** | ||||||||||
22080464-C-A | 19918578-C-A | ** | |||||||||
13445376-AAG-A | 11289700-AAG-A | ** | |||||||||
10858430-T-C | ** | ||||||||||
7224282-C-A | 7356241-C-A | ** | |||||||||
10887981-C-T | ** | ||||||||||
17569124-C-A | 15457244-C-A | ** | |||||||||
7572861-C-A | 7704820-C-A | ** | |||||||||
14195309-C-A | 12074603-C-A | ** | |||||||||
10892118-A-T | ** | ||||||||||
10817378-C-A | ** | ||||||||||
10984007-T-G | ** | ||||||||||
21281590-C-A | 19119704-C-A | ** | |||||||||
14933566-CTTTTT-C | 12821631-CTTTTT-C | 16×T | ** | ||||||||
13461167-G-T | 11305491-G-T | ** | |||||||||
2790428-C-A | 2922387-C-A | ** | |||||||||
10663769-T-C | ** | ||||||||||
14440835-C-A | 12320108-C-A | ** | |||||||||
14644943-CTT-C | 12533012-CTT-C | 12×T | ** | ||||||||
28791310-A-C | 26645163-A-C | ** | |||||||||
10973991-C-A | ** | ||||||||||
10973992-C-A | ** | ||||||||||
8389596-A-T | 8521555-A-T | ** | |||||||||
14926461-TCA-T | 12814526-TCA-T | ** | |||||||||
10682690-CTTCCA-C | ** | ||||||||||
14253233-C-G | 12132527-C-G | ** | |||||||||
15065913-C-A | 12954005-C-A | ** | |||||||||
10971938-A-T | ** | ||||||||||
23801732-T-C | 21639846-T-C | ** | |||||||||
13255461-A-C | 11099785-A-C | ** | |||||||||
10887962-C-A | ** | ||||||||||
10888003-A-AC | ** | ||||||||||
10888005-C-CCACT | ** | ||||||||||
10888023-A-T | ** | ||||||||||
10935535-T-A | ** | ||||||||||
10935542-C-CACTCT | ** | ||||||||||
10935549-C-CTCCCA | ** | ||||||||||
10935589-T-A | ** | ||||||||||
20865511-C-A | 18703625-C-A | P4_Dst | ** | ||||||||
24634110-G-C | 22487963-G-C | P3_t2 | ** | ||||||||
4105499-C-A | 4237458-C-A | ** | |||||||||
7135205-C-A | 7267164-C-A | ** | |||||||||
28791300-G-C | 26645153-G-C | ** | |||||||||
21175731-C-A | 19013845-C-A | FTB38025 | ** | ||||||||
21482782-GA-G | 19320896-GA-G | ** | |||||||||
5894966-A-G | 6026925-A-G | ** | |||||||||
14644927-C-A | 12532996-C-A | ** | |||||||||
14981768-G-A | 12869844-G-A | ** | |||||||||
15777052-C-A | 13665172-C-A | FT10130 | ** | ||||||||
6770884-A-G | 6902843-A-G | ** | |||||||||
13898748-C-T | 11778042-C-T | ** | |||||||||
6368196-C-A | 6500155-C-A | ** | |||||||||
10686611-C-G | ** | ||||||||||
10686613-C-G | ** | ||||||||||
10688017-T-C | ** | ||||||||||
9063663-C-A | 9226054-C-A | ** | |||||||||
7717787-TCTTC-T | 7849746-TCTTC-T | 5×CTTC | ** | ||||||||
6801105-C-A | 6933064-C-A | ** | |||||||||
16213536-C-A | 14101656-C-A | ** | |||||||||
10824183-A-C | ** | ||||||||||
8749159-C-A | 8881118-C-A | ** | |||||||||
4101107-C-A | 4233066-C-A | ** | |||||||||
24884192-A-G | 22738045-A-G | g1 | ** | ||||||||
16505953-A-T | 14394073-A-T | ** | |||||||||
28633188-A-C | 26487041-A-C | ** | |||||||||
8389731-T-G | 8521690-T-G | ** | |||||||||
2701070-C-A | 2833029-C-A | ** | |||||||||
2718903-G-TTT | 2850862-G-TTT | ** | |||||||||
2813664-G-T | 2945623-G-T | ** | |||||||||
2824548-C-A | 2956507-C-A | ** | |||||||||
2853508-C-A | 2985467-C-A | ** | |||||||||
2928244-T-C | 3060203-T-C | ** | |||||||||
2959942-C-A | 3091901-C-A | ** | |||||||||
3385723-A-C | 3517682-A-C | ** | |||||||||
3594161-C-A | 3726120-C-A | ** | |||||||||
3627728-A-G | 3759687-A-G | ** | |||||||||
3889712-C-A | 4021671-C-A | ** | |||||||||
4071370-C-A | 4203329-C-A | ** | |||||||||
4094371-C-A | 4226330-C-A | ** | |||||||||
4230087-C-A | 4362046-C-A | ** | |||||||||
4302086-C-A | 4434045-C-A | ** | |||||||||
4357364-C-A | 4489323-C-A | ** | |||||||||
4443098-T-A | 4575057-T-A | ** | |||||||||
4561135-T-C | 4693094-T-C | ** | |||||||||
4616593-C-A | 4748552-C-A | ** | |||||||||
4778597-A-C | 4910556-A-C | ** | |||||||||
4778647-A-G | 4910606-A-G | FTB55532 | ** | ||||||||
4939814-C-A | 5071773-C-A | ** | |||||||||
5235437-G-T | 5367396-G-T | ** | |||||||||
5275608-G-T | 5407567-G-T | ** | |||||||||
5292837-C-A | 5424796-C-A | ** | |||||||||
5309607-T-A | 5441566-T-A | ** | |||||||||
5364921-G-T | 5496880-G-T | ** | |||||||||
5624351-C-A | 5756310-C-A | ** | |||||||||
5678977-C-A | 5810936-C-A | ** | |||||||||
5709990-G-A | 5841949-G-A | ** | |||||||||
5851220-C-T | 5983179-C-T | ** | |||||||||
5869503-C-G | 6001462-C-G | ** | |||||||||
5884573-A-G | 6016532-A-G | ** | |||||||||
6354008-G-A | 6485967-G-A | ** | |||||||||
6688652-C-A | 6820611-C-A | ** | |||||||||
6693065-G-T | 6825024-G-T | ** | |||||||||
6752685-C-T | 6884644-C-T | FGC59027 | ** | ||||||||
6769873-C-T | 6901832-C-T | ** | |||||||||
6770842-T-C | 6902801-T-C | ** | |||||||||
6770859-T-C | 6902818-T-C | ** | |||||||||
6770860-G-A | 6902819-G-A | ** | |||||||||
6770861-A-G | 6902820-A-G | ** | |||||||||
6770879-C-T | 6902838-C-T | ** | |||||||||
6770881-T-C | 6902840-T-C | ** | |||||||||
6770882-G-A | 6902841-G-A | ** | |||||||||
6774094-A-T | 6906053-A-T | ** | |||||||||
6809341-C-T | 6941300-C-T | ** | |||||||||
6862188-C-A | 6994147-C-A | ** | |||||||||
6881535-C-A | 7013494-C-A | ** | |||||||||
6916019-C-T | 7047978-C-T | ** | |||||||||
6934745-C-G | 7066704-C-G | ** | |||||||||
6983700-G-T | 7115659-G-T | ** | |||||||||
7012279-C-A | 7144238-C-A | ** | |||||||||
7013622-T-C | 7145581-T-C | ** | |||||||||
7088089-C-A | 7220048-C-A | ** | |||||||||
7106304-C-A | 7238263-C-A | ** | |||||||||
7112517-C-A | 7244476-C-A | ** | |||||||||
7115480-C-T | 7247439-C-T | ** | |||||||||
7134288-C-A | 7266247-C-A | ** | |||||||||
7185443-C-A | 7317402-C-A | ** | |||||||||
7207450-C-A | 7339409-C-A | ** | |||||||||
7229140-C-T | 7361099-C-T | ** | |||||||||
7237111-A-G | 7369070-A-G | ** | |||||||||
7269804-A-T | 7401763-A-T | ** | |||||||||
7285253-C-A | 7417212-C-A | ** | |||||||||
7311951-C-A | 7443910-C-A | ** | |||||||||
7314350-C-A | 7446309-C-A | ** | |||||||||
7323095-C-A | 7455054-C-A | ** | |||||||||
7333849-G-T | 7465808-G-T | ** | |||||||||
7333975-A-T | 7465934-A-T | ** | |||||||||
7378525-C-A | 7510484-C-A | ** | |||||||||
7385387-C-A | 7517346-C-A | ** | |||||||||
7396448-C-A | 7528407-C-A | ** | |||||||||
7524665-C-A | 7656624-C-A | ** | |||||||||
7534690-A-G | 7666649-A-G | ** | |||||||||
7536466-A-T | 7668425-A-T | ** | |||||||||
7572843-C-A | 7704802-C-A | ** | |||||||||
7629853-C-A | 7761812-C-A | ** | |||||||||
7656929-A-G | 7788888-A-G | ** | |||||||||
7996303-A-G | 8128262-A-G | ** | |||||||||
8072384-G-A | 8204343-G-A | ** | |||||||||
8119237-C-A | 8251196-C-A | ** | |||||||||
8173783-C-A | 8305742-C-A | ** | |||||||||
8218078-TCTCC-T | 8350037-TCTCC-T | ** | |||||||||
8253709-A-T | 8385668-A-T | BY71174 | ** | ||||||||
8253726-T-C | 8385685-T-C | ** | |||||||||
8253733-G-A | 8385692-G-A | ** | |||||||||
8279658-A-G | 8411617-A-G | ** | |||||||||
8296754-G-A | 8428713-G-A | ** | |||||||||
8353339-T-G | 8485298-T-G | ** | |||||||||
8389675-A-C | 8521634-A-C | ** | |||||||||
8389740-T-TA | 8521699-T-TA | ** | |||||||||
8389751-A-AT | 8521710-A-AT | ** | |||||||||
8525294-C-A | 8657253-C-A | ** | |||||||||
8556331-G-TTT | 8688290-G-TTT | ** | |||||||||
8695848-C-A | 8827807-C-A | ** | |||||||||
8697396-T-A | 8829355-T-A | ** | |||||||||
8728138-C-A | 8860097-C-A | ** | |||||||||
8734235-AAC-A | 8866194-AAC-A | ** | |||||||||
8736414-A-G | 8868373-A-G | ** | |||||||||
9074075-C-A | 9236466-C-A | ** | |||||||||
9116674-G-T | 9279065-G-T | ** | |||||||||
9183591-T-C | 9345982-T-C | ** | |||||||||
9420222-C-A | 9582613-C-A | ** | |||||||||
9971454-C-A | 10133845-C-A | ** | |||||||||
9997325-T-C | 10159716-T-C | ** | |||||||||
10020175-A-T | 10182566-A-T | ** | |||||||||
10040829-C-T | 10203220-C-T | ** | |||||||||
10046233-T-C | 10208624-T-C | ** | |||||||||
10661728-C-A | FT428488 | ** | |||||||||
10668411-C-CTTCAA | ** | ||||||||||
10668685-C-A | ** | ||||||||||
10684256-C-A | ** | ||||||||||
10688029-C-A | ** | ||||||||||
10748975-T-A | ** | ||||||||||
10749011-C-A | FT429504 | ** | |||||||||
10757245-A-C | ** | ||||||||||
10764817-C-A | ** | ||||||||||
10770492-C-A | ** | ||||||||||
10789321-A-G | ** | ||||||||||
10789339-C-CTGTT | ** | ||||||||||
10789340-C-CAGGTTA | ** | ||||||||||
10796565-G-C | ** | ||||||||||
10796901-C-A | ** | ||||||||||
10827158-C-A | ** | ||||||||||
10828819-T-G | ** | ||||||||||
10886945-C-T | ** | ||||||||||
10892113-C-T | FT268326 | ** | |||||||||
10892136-A-C | ** | ||||||||||
10892137-AACCCG-A | ** | ||||||||||
10903011-A-G | ** | ||||||||||
10954602-A-T | ** | ||||||||||
10959651-A-C | ** | ||||||||||
10971870-A-T | ** | ||||||||||
10971948-AC-A | ** | ||||||||||
10971979-C-G | ** | ||||||||||
10981407-C-A | ** | ||||||||||
10981450-C-A | ** | ||||||||||
10987912-T-A | ** | ||||||||||
10987912-T-TCACCG | ** | ||||||||||
10988623-T-C | ** | ||||||||||
11000512-C-A | ** | ||||||||||
11030109-CTTTCC-A | ** | ||||||||||
11034908-A-C | ** | ||||||||||
13228083-C-A | 11072407-C-A | ** | |||||||||
13255963-C-T | 11100287-C-T | ** | |||||||||
13273066-C-T | 11117390-C-T | ** | |||||||||
13320087-C-A | 11164411-C-A | ** | |||||||||
13355476-C-A | 11199800-C-A | ** | |||||||||
13457698-CTCCAT-C | 11302022-CTCCAT-C | ** | |||||||||
13620303-A-T | 11464627-A-T | ** | |||||||||
13637359-C-A | 11481683-C-A | FT446864 | ** | ||||||||
11649552-C-A | DYZ17 | ** | |||||||||
11651096-G-T | DYZ17 | ** | |||||||||
11655412-T-G | DYZ17 | ** | |||||||||
11666526-C-A | DYZ17 | ** | |||||||||
11674720-C-A | DYZ17 | ** | |||||||||
13811022-AGGAATGGATTC-A | 11690316-AGGAATGGATTC-A | DYZ17 | ** | ||||||||
13825032-T-C | 11704326-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
13898745-A-G | 11778039-A-G | ** | |||||||||
13939822-C-A | 11819116-C-A | ** | |||||||||
13962088-G-A | 11841382-G-A | ** | |||||||||
14008838-T-A | 11888132-T-A | ** | |||||||||
14067322-C-A | 11946616-C-A | FT411905 | ** | ||||||||
14080295-T-C | 11959589-T-C | ** | |||||||||
14184615-C-A | 12063909-C-A | ** | |||||||||
14195295-C-T | 12074589-C-T | ** | |||||||||
14227745-A-C | 12107039-A-C | ** | |||||||||
14245221-A-G | 12124515-A-G | ** | |||||||||
14273639-C-A | 12152933-C-A | ** | |||||||||
14284965-C-A | 12164259-C-A | ** | |||||||||
14311695-C-A | 12190989-C-A | ** | |||||||||
14328087-C-A | 12207381-C-A | ** | |||||||||
14513295-T-G | 12401500-T-G | ** | |||||||||
14526037-G-C | 12414238-G-C | ** | |||||||||
14660469-A-G | 12548534-A-G | ** | |||||||||
14700237-C-A | 12588303-C-A | ** | |||||||||
14724932-G-T | 12613000-G-T | ** | |||||||||
14762342-G-A | 12650411-G-A | ** | |||||||||
14815943-T-C | 12704014-T-C | ** | |||||||||
14854338-C-A | 12742404-C-A | ** | |||||||||
14926453-A-G | 12814518-A-G | ** | |||||||||
14933634-T-G | 12821699-T-G | ** | |||||||||
14981766-G-A | 12869842-G-A | ** | |||||||||
14981777-C-T | 12869853-C-T | ** | |||||||||
14981778-T-A | 12869854-T-A | ** | |||||||||
15038237-G-T | 12926327-G-T | ** | |||||||||
15145088-C-A | 13033175-C-A | ** | |||||||||
15157857-T-A | 13045944-T-A | ** | |||||||||
15189730-C-G | 13077816-C-G | ** | |||||||||
15198659-C-A | 13086745-C-A | ** | |||||||||
15220925-C-A | 13109011-C-A | ** | |||||||||
15221797-C-A | 13109883-C-A | ** | |||||||||
15320523-GA-G | 13208629-GA-G | ** | |||||||||
15333469-T-A | 13221587-T-A | ** | |||||||||
15358575-A-C | 13246694-A-C | ** | |||||||||
15396770-C-A | 13284890-C-A | ** | |||||||||
15406822-C-A | 13294942-C-A | ** | |||||||||
15410526-C-A | 13298646-C-A | ** | |||||||||
15455013-A-G | 13343133-A-G | BY161954 | ** | ||||||||
15495455-C-A | 13383575-C-A | ** | |||||||||
15515219-A-G | 13403339-A-G | ** | |||||||||
15527815-T-G | 13415935-T-G | ** | |||||||||
15533737-C-A | 13421857-C-A | ** | |||||||||
15679932-C-A | 13568052-C-A | ** | |||||||||
15748153-C-T | 13636273-C-T | ** | |||||||||
15778622-G-T | 13666742-G-T | ** | |||||||||
15915147-C-A | 13803267-C-A | ** | |||||||||
16024305-C-A | 13912425-C-A | 10×A | ** | ||||||||
16046296-C-G | 13934416-C-G | ** | |||||||||
16050020-C-A | 13938140-C-A | ** | |||||||||
16060365-A-C | 13948485-A-C | ** | |||||||||
16063077-C-A | 13951197-C-A | ** | |||||||||
16063172-T-A | 13951292-T-A | ** | |||||||||
16075395-C-A | 13963515-C-A | ** | |||||||||
16101999-T-A | 13990119-T-A | P8_Prx | ** | ||||||||
16102038-G-C | 13990158-G-C | P8_Prx | ** | ||||||||
16221104-C-A | 14109224-C-A | ** | |||||||||
16275395-C-A | 14163515-C-A | ** | |||||||||
16319552-C-A | 14207672-C-A | ** | |||||||||
16416737-A-T | 14304857-A-T | ** | |||||||||
16427597-C-A | 14315717-C-A | ** | |||||||||
16484377-ATAATGGC-A | 14372497-ATAATGGC-A | ** | |||||||||
16505949-C-T | 14394069-C-T | ** | |||||||||
16666115-C-A | 14554235-C-A | ** | |||||||||
16707249-G-T | 14595369-G-T | ** | |||||||||
16745320-G-T | 14633440-G-T | ** | |||||||||
16760048-G-A | 14648168-G-A | ** | |||||||||
16786166-T-C | 14674286-T-C | ** | |||||||||
16830961-C-A | 14719081-C-A | ** | |||||||||
16833297-G-T | 14721417-G-T | ** | |||||||||
16889723-A-T | 14777843-A-T | ** | |||||||||
16938540-C-A | 14826660-C-A | ** | |||||||||
17027691-T-A | 14915811-T-A | ** | |||||||||
17039176-C-A | 14927296-C-A | ** | |||||||||
17064808-T-C | 14952928-T-C | ** | |||||||||
17143943-C-T | 15032063-C-T | ** | |||||||||
17143954-G-T | 15032074-G-T | ** | |||||||||
17143964-A-T | 15032084-A-T | ** | |||||||||
17143969-C-T | 15032089-C-T | ** | |||||||||
17143977-C-T | 15032097-C-T | ** | |||||||||
17143987-C-T | 15032107-C-T | ** | |||||||||
17144010-G-T | 15032130-G-T | ** | |||||||||
17158516-C-T | 15046636-C-T | ** | |||||||||
17170390-A-C | 15058510-A-C | ** | |||||||||
17170422-G-C | 15058542-G-C | ** | |||||||||
17196309-T-A | 15084429-T-A | ** | |||||||||
17196523-A-G | 15084643-A-G | ** | |||||||||
17224388-T-A | 15112508-T-A | ** | |||||||||
17245504-C-A | 15133624-C-A | ** | |||||||||
17245509-C-A | 15133629-C-A | ** | |||||||||
17245511-G-A | 15133631-G-A | ** | |||||||||
17245514-C-A | 15133634-C-A | ** | |||||||||
17245517-G-A | 15133637-G-A | ** | |||||||||
17297442-C-A | 15185562-C-A | ** | |||||||||
17310888-G-T | 15199008-G-T | ** | |||||||||
17310897-A-T | 15199017-A-T | ** | |||||||||
17370838-C-A | 15258958-C-A | ** | |||||||||
17379978-C-T | 15268098-C-T | ** | |||||||||
17569205-A-G | 15457325-A-G | ** | |||||||||
17707373-T-G | 15595493-T-G | ** | |||||||||
17812075-A-C | 15700195-A-C | ** | |||||||||
17897958-C-G | 15786078-C-G | ** | |||||||||
18020788-C-A | 15908908-C-A | ** | |||||||||
18088391-C-A | 15976511-C-A | ** | |||||||||
18154626-C-A | 16042746-C-A | ** | |||||||||
18183637-G-T | 16071757-G-T | ** | |||||||||
18247380-C-A | 16135500-C-A | ** | |||||||||
18284708-C-A | 16172828-C-A | P6_Prx | ** | ||||||||
18411299-G-T | 16299419-G-T | P6_Gap | ** | ||||||||
18429196-C-CAGA | 16317316-C-CAGA | P6_Dst | 17×A | ** | |||||||
18520515-G-T | 16408635-G-T | P6_Dst | ** | ||||||||
18528820-G-T | 16416940-G-T | P6_Dst | ** | ||||||||
18578092-C-A | 16466212-C-A | ** | |||||||||
18619012-A-C | 16507132-A-C | ** | |||||||||
18728652-G-A | 16616772-G-A | ** | |||||||||
18733485-C-A | 16621605-C-A | ** | |||||||||
18753055-C-A | 16641175-C-A | ** | |||||||||
18756085-C-A | 16644205-C-A | ** | |||||||||
18791312-C-A | 16679432-C-A | ** | |||||||||
18812221-C-A | 16700341-C-A | ** | |||||||||
18902033-G-T | 16790153-G-T | ** | |||||||||
18949739-C-A | 16837859-C-A | ** | |||||||||
18965951-G-A | 16854071-G-A | ** | |||||||||
18985070-C-A | 16873190-C-A | ** | |||||||||
19129083-C-A | 17017203-C-A | ** | |||||||||
19235628-C-G | 17123748-C-G | ** | |||||||||
19244651-T-G | 17132771-T-G | ** | |||||||||
19318261-C-T | 17206381-C-T | ** | |||||||||
19412573-T-C | 17300693-T-C | ** | |||||||||
19505173-T-C | 17393293-T-C | ** | |||||||||
19732399-A-C | 17620519-A-C | P5_Prx | ** | ||||||||
20028114-G-A | 17916234-G-A | P5_Prx | ** | ||||||||
20330548-A-C | 18168662-A-C | P5_Dst | ** | ||||||||
20366767-G-T | 18204881-G-T | P5_Dst | ** | ||||||||
20809851-G-A | 18647965-G-A | P4_Gap | ** | ||||||||
21116969-G-C | 18955083-G-C | ** | |||||||||
21175712-T-G | 19013826-T-G | ** | |||||||||
21195827-T-C | 19033941-T-C | ** | |||||||||
21207539-G-A | 19045653-G-A | ** | |||||||||
21244951-A-T | 19083065-A-T | ** | |||||||||
21267592-T-A | 19105706-T-A | ** | |||||||||
21323167-C-A | 19161281-C-A | ** | |||||||||
21566012-A-G | 19404126-A-G | ** | |||||||||
21583998-C-A | 19422112-C-A | ** | |||||||||
21677854-C-A | 19515968-C-A | ** | |||||||||
21827879-A-G | 19665993-A-G | ** | |||||||||
21883589-C-A | 19721703-C-A | ** | |||||||||
21902257-A-C | 19740371-A-C | ** | |||||||||
21984116-G-C | 19822230-G-C | ** | |||||||||
21984264-C-A | 19822378-C-A | ** | |||||||||
21991341-G-T | 19829455-G-T | ** | |||||||||
21991358-G-T | 19829472-G-T | ** | |||||||||
22055523-T-TG | 19893637-T-TG | ** | |||||||||
22079969-A-T | 19918083-A-T | ** | |||||||||
22092679-C-A | 19930793-C-A | ** | |||||||||
22189068-C-A | 20027182-C-A | ** | |||||||||
22195138-G-T | 20033252-G-T | ** | |||||||||
22212078-T-C | 20050192-T-C | ** | |||||||||
22249907-C-T | 20088021-C-T | DYZ19 | ** | ||||||||
22281815-T-C | 20119929-T-C | DYZ19 | ** | ||||||||
22309853-C-G | 20147967-C-G | DYZ19 | ** | ||||||||
22562936-T-C | 20401050-T-C | ** | |||||||||
22613789-T-G | 20451903-T-G | ** | |||||||||
22613807-G-T | 20451921-G-T | ** | |||||||||
22808823-C-A | 20646937-C-A | ** | |||||||||
22838670-GAA-G | 20676784-GAA-G | 11×A | ** | ||||||||
22901926-C-T | 20740040-C-T | ** | |||||||||
22916925-C-A | 20755039-C-A | ** | |||||||||
23047790-C-A | 20885904-C-A | ** | |||||||||
23098741-C-A | 20936855-C-A | ** | |||||||||
23127585-A-T | 20965699-A-T | ** | |||||||||
23128488-G-A | 20966602-G-A | ** | |||||||||
23188284-T-A | 21026398-T-A | ** | |||||||||
23342092-A-T | 21180206-A-T | ** | |||||||||
23373150-TA-T | 21211264-TA-T | ** | |||||||||
23459582-C-A | 21297696-C-A | ** | |||||||||
23493480-A-G | 21331594-A-G | ** | |||||||||
23875670-C-T | 21713784-C-T | ** | |||||||||
21751508-G-T | ** | ||||||||||
24130336-T-A | 21984189-T-A | P3_b1 | ** | ||||||||
24403155-C-A | 22257008-C-A | ** | |||||||||
24421907-C-A | 22275760-C-A | ** | |||||||||
24470776-T-G | 22324629-T-G | ** | |||||||||
24751205-C-G | 22605058-C-G | P3_b2 | ** | ||||||||
26098002-A-AC | 23951855-A-AC | P1_Y1 | ** | ||||||||
26152106-C-A | 24005959-C-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
26153999-C-A | 24007852-C-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
26154001-G-A | 24007854-G-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
26834502-G-T | 24688355-G-T | P1_g2 | ** | ||||||||
27525271-GA-G | 25379124-GA-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
27647741-G-T | 25501594-G-T | P1_Y2 | ** | ||||||||
27861804-C-A | 25715657-C-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
28480901-C-A | 26334754-C-A | ** | |||||||||
28514763-C-T | 26368616-C-T | ** | |||||||||
28541429-C-A | 26395282-C-A | ** | |||||||||
28547365-TA-T | 26401218-TA-T | ** | |||||||||
28550612-G-T | 26404465-G-T | ** | |||||||||
28581846-C-A | 26435699-C-A | ** | |||||||||
28605437-C-A | 26459290-C-A | ** | |||||||||
28700606-G-A | 26554459-G-A | ** | |||||||||
28763153-C-A | 26617006-C-A | ** | |||||||||
28782075-C-A | 26635928-C-A | ** | |||||||||
28800843-T-C | 26654696-T-C | ** | |||||||||
56728187-C-G | ** | ||||||||||
56827367-G-T | ** | ||||||||||
56850335-C-G | ** | ||||||||||
56850528-T-A | ** | ||||||||||
56850659-A-AT | ** | ||||||||||
56850731-G-A | ** | ||||||||||
56850773-A-G | ** | ||||||||||
27540968-C-A | 25394821-C-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
12807338-CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-C | 43×T | ** | |||||||||
19762966-T-G | 17651086-T-G | P5_Prx | ** | ||||||||
19762998-T-G | 17651118-T-G | P5_Prx | ** | ||||||||
20757324-C-A | 18595438-C-A | P4_Prx | ** | ||||||||
23897335-A-T | 21735449-A-T | ** | |||||||||
13455114-T-C | 11299438-T-C | BY85416 | *** | ||||||||
13843488-C-T | 11722782-C-T | BY47123 | DYZ17 | *** | |||||||
16107432-C-T | 13995552-C-T | P8_Prx | *** | ||||||||
6861229-C-T | 6993188-C-T | *** | |||||||||
13451866-C-CCCATTCCATT | 11296190-C-CCCATTCCATT | *** | |||||||||
26153566-CT-C | 24007419-CT-C | P1_Y1 | 10×T | *** | |||||||
28808033-C-G | 26661886-C-G | *** | |||||||||
13453618-A-AATTCCATTCCATTCC | 11297942-A-AATTCCATTCCATTCC | 12×ATTCC | *** | ||||||||
13801037-T-A | 11680331-T-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13868389-T-C | 11747683-T-C | DYZ17 | 4×GGAAC | *** | |||||||
18378957-GAC-T | 16267077-GAC-T | P6_Prx | *** | ||||||||
13452391-C-A | 11296715-C-A | *** | |||||||||
13826116-GGAAAC-G | 11705410-GGAAAC-G | DYZ17 | *** | ||||||||
2783733-AC-A | 2915692-AC-A | *** | |||||||||
6867679-TG-T | 6999638-TG-T | *** | |||||||||
7461754-G-T | 7593713-G-T | IR1_L | 23×T | *** | |||||||
10019057-GGAAGGGGGTAT-G,GGGAGGTGGTGT | 10181448-GGAAGGGGGTAT-G,GGGAGGTGGTGT | *** | |||||||||
13446511-T-C,TTCCA | 11290835-T-C,TTCCA | *** | |||||||||
13452973-G-A | 11297297-G-A | *** | |||||||||
13454842-T-C,TATTCC | 11299166-T-C,TATTCC | 7×ATTCC | *** | ||||||||
13458511-C-T | 11302835-C-T | *** | |||||||||
13459486-G-C | 11303810-G-C | *** | |||||||||
13658847-G-A | 11503171-G-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13664703-G-C | 11509027-G-C | DYZ17 | *** | ||||||||
13678424-C-G | 11522748-C-G | BY88112 | DYZ17 | *** | |||||||
13678433-T-G | 11522757-T-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13678436-T-A | 11522760-T-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13684847-C-CAATGG | 11529171-C-CAATGG | DYZ17 | *** | ||||||||
13686973-T-G | 11531297-T-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13692879-T-TGAATG | 11537203-T-TGAATG | DYZ17 | 4×GAATG | *** | |||||||
13696380-AATGGAATCCATTGGAATGG-A | 11540704-AATGGAATCCATTGGAATGG-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13700138-A-G | 11544462-A-G | FT244580 | DYZ17 | *** | |||||||
13728561-CATGGA-C | 11572885-CATGGA-C | DYZ17 | 5×ATGGA | *** | |||||||
13740768-A-G | 11585092-A-G | DYZ17 | 4×AATGG | *** | |||||||
13748492-G-C | 11592816-G-C | DYZ17 | *** | ||||||||
13805369-G-A | 11684663-G-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13810872-TAGATTGGAAA-T | 11690166-TAGATTGGAAA-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13825224-A-C | 11704518-A-C | DYZ17 | *** | ||||||||
13825241-T-A | 11704535-T-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13825250-A-G | 11704544-A-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13855524-T-C | 11734818-T-C | DYZ17 | *** | ||||||||
13860202-A-ATGGAC | 11739496-A-ATGGAC | DYZ17 | *** | ||||||||
13860204-T-C | 11739498-T-C | BY49167 | DYZ17 | *** | |||||||
13860215-G-T | 11739509-G-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13867480-T-C | 11746774-T-C | BY31722 | DYZ17 | *** | |||||||
14637667-T-A | 12525736-T-A | FT335687 | *** | ||||||||
15799138-T-TC | 13687258-T-TC | *** | |||||||||
15928370-G-T | 13816490-G-T | *** | |||||||||
18355098-AT-A | 16243218-AT-A | P6_Prx | 10×T | *** | |||||||
19668782-TAAA-T | 17556902-TAAA-T | P5_Prx | 33×A | *** | |||||||
19948179-C-CTCCT | 17836299-C-CTCCT | P5_Prx | *** | ||||||||
22256593-C-A | 20094707-C-A | BY46599 | DYZ19 | *** | |||||||
22360029-A-C | 20198143-A-C | DYZ19 | *** | ||||||||
22425209-C-T | 20263323-C-T | DYZ19 | *** | ||||||||
22446613-G-A | 20284727-G-A | DYZ19 | *** | ||||||||
22447462-A-T | 20285576-A-T | DYZ19 | *** | ||||||||
22473642-G-C | 20311756-G-C | BY21255 | DYZ19 | *** | |||||||
24107681-AG-A | 21961534-AG-A | P3_b1 | *** | ||||||||
24911013-A-T | 22764866-A-T | g1 | *** | ||||||||
25524691-TTC-T | 23378544-TTC-T | P1_gr1 | *** | ||||||||
25899791-CAA-C | 23753644-CAA-C | P1_Y1 | 15×A | *** | |||||||
28253523-ACCAATGAAGC-A | 26107376-ACCAATGAAGC-A | P1_b4 | *** | ||||||||
58975654-G-GTCCAT,T | 56829507-G-GTCCAT,T | 4×TCCAT | *** | ||||||||
13452853-T-TCATTCCATTC | 11297177-T-TCATTCCATTC | *** | |||||||||
13488383-A-C | 11332707-A-C | *** | |||||||||
18953065-G-T | 16841185-G-T | *** | |||||||||
58981812-C-A,T | 56835665-C-A,T | *** | |||||||||
15049918-CAAA-C | 12938009-CAAA-C | 18×A | *** | ||||||||
4179006-C-T | 4310965-C-T | *** | |||||||||
14392777-G-T | 12272073-G-T | *** | |||||||||
23827542-CA-C,CAA | 21665656-CA-C,CAA | 17×A | *** | ||||||||
56835613-C-G,T | *** | ||||||||||
14008778-GAAAAAA-G | 11888072-GAAAAAA-G | 25×A | *** | ||||||||
15866197-T-A | 13754317-T-A | *** | |||||||||
14272704-C-T | 12151998-C-T | *** | |||||||||
23522511-A-G | 21360625-A-G | *** | |||||||||
56847373-G-A | *** | ||||||||||
10812351-CT-C | *** | ||||||||||
22914658-C-A | 20752772-C-A | *** | |||||||||
21411717-GCA-G | 19249831-GCA-G | *** | |||||||||
8890985-T-A | 9022944-T-A | *** | |||||||||
9356920-C-A | 9519311-C-A | *** | |||||||||
2784669-T-C | 2916628-T-C | *** | |||||||||
2825206-GTT-G | 2957165-GTT-G | 12×T | *** | ||||||||
3131628-C-A | 3263587-C-A | *** | |||||||||
3641241-C-A | 3773200-C-A | *** | |||||||||
3834720-T-C | 3966679-T-C | *** | |||||||||
3865630-C-A | 3997589-C-A | *** | |||||||||
4769316-TA-T | 4901275-TA-T | *** | |||||||||
4862680-C-A | 4994639-C-A | *** | |||||||||
5864619-C-A | 5996578-C-A | FT28532 | *** | ||||||||
7088376-C-A | 7220335-C-A | *** | |||||||||
7816249-C-A | 7948208-C-A | *** | |||||||||
7995966-G-T | 8127925-G-T | *** | |||||||||
8022673-C-A | 8154632-C-A | *** | |||||||||
8130764-C-A | 8262723-C-A | *** | |||||||||
8172696-T-C | 8304655-T-C | *** | |||||||||
8350794-C-A | 8482753-C-A | *** | |||||||||
8766221-C-T | 8898180-C-T | *** | |||||||||
9500210-T-G | 9662601-T-G | *** | |||||||||
9522471-C-A | 9684862-C-A | *** | |||||||||
9798264-C-A | 9960655-C-A | *** | |||||||||
9865010-T-C | 10027401-T-C | *** | |||||||||
10678237-C-A | *** | ||||||||||
10694029-C-A | *** | ||||||||||
10965131-C-A | *** | ||||||||||
13317701-CT-C | 11162025-CT-C | *** | |||||||||
11655849-C-A | BY65035 | DYZ17 | *** | ||||||||
13811058-G-A | 11690352-G-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13811059-GT-G | 11690353-GT-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13811063-T-TG | 11690357-T-TG | DYZ17 | *** | ||||||||
13855453-A-G | 11734747-A-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13859004-C-A | 11738298-C-A | DYZ17 | *** | ||||||||
14272686-C-CTT | 12151980-C-CTT | 15×T | *** | ||||||||
14440157-T-C | 12319430-T-C | *** | |||||||||
14587765-C-A | 12475965-C-A | *** | |||||||||
14753276-T-C | 12641345-T-C | *** | |||||||||
14866170-C-A | 12754240-C-A | *** | |||||||||
15068980-C-A | 12957071-C-A | *** | |||||||||
15380258-G-T | 13268378-G-T | *** | |||||||||
15477175-C-A | 13365295-C-A | *** | |||||||||
15584435-C-A | 13472555-C-A | *** | |||||||||
16041474-C-A | 13929594-C-A | *** | |||||||||
16247256-A-G | 14135376-A-G | *** | |||||||||
16620421-C-A | 14508541-C-A | *** | |||||||||
17637802-G-T | 15525922-G-T | *** | |||||||||
17943268-C-T | 15831388-C-T | *** | |||||||||
18722890-C-A | 16611010-C-A | *** | |||||||||
18722896-A-G | 16611016-A-G | *** | |||||||||
18811001-C-A | 16699121-C-A | *** | |||||||||
21596487-C-A | 19434601-C-A | *** | |||||||||
21699967-C-A | 19538081-C-A | *** | |||||||||
22089812-A-G | 19927926-A-G | *** | |||||||||
22803917-C-A | 20642031-C-A | *** | |||||||||
23044445-C-A | 20882559-C-A | *** | |||||||||
23061315-C-A | 20899429-C-A | *** | |||||||||
23186215-C-A | 21024329-C-A | *** | |||||||||
23433522-C-A | 21271636-C-A | *** | |||||||||
23775461-G-T | 21613575-G-T | *** | |||||||||
28734842-C-A | 26588695-C-A | *** | |||||||||
56830429-T-C | *** | ||||||||||
56835658-A-C,T | *** | ||||||||||
9915785-A-T | 10078176-A-T | *** | |||||||||
13449764-TATTCCATTCT-T,TATTCCATTCC | 11294088-TATTCCATTCT-T,TATTCCATTCC | *** | |||||||||
17057120-A-C | 14945240-A-C | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
---|---|---|---|
Manual | 14054252-G-T | 11933546-G-T | 4T |