McFarlin
BigY3: N76446, FTDNA: N76446, BigY2: N76446MDKA Birth: Northern Ireland
Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | BigY3 N76446 | FTDNA N76446 | BigY2 N76446 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
11028195-C-T | A* | |||||||||
11028203-T-A | A* | |||||||||
16824966-C-T | 14713086-C-T | FT86988 | Y | Y | + | ** | ||||
15129623-C-A | 13017710-C-A | Y | Y | * | *** | |||||
19036743-TA-T | 16924863-TA-T | ** | ||||||||
9694782-TA-T | 9857173-TA-T | IR3_Prx | ** | |||||||
13212349-G-C | 11056673-G-C | ** | ** | |||||||
13312987-T-G | 11157311-T-G | ** | ||||||||
18908185-C-A | 16796305-C-A | CTS9463 | ** | ** | ||||||
8428944-CAAAAAAA-C | 8560903-CAAAAAAA-C | 25×A | ** | |||||||
17211670-C-A | 15099790-C-A | ** | ||||||||
14024939-AAC-A | 11904233-AAC-A | ** | ||||||||
21940420-C-A | 19778534-C-A | ** | ||||||||
3755415-TC-T | 3887374-TC-T | ** | ||||||||
26295230-T-A | 24149083-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27943970-CCA-C | 25797823-CCA-C | P1_Y2 | 14×CA | ** | ||||||
17031292-AG-A | 14919412-AG-A | ** | ||||||||
21846895-A-C | 19685009-A-C | ** | ||||||||
16228139-T-G | 14116259-T-G | ** | ||||||||
17842213-C-A | 15730333-C-A | Y100365 | ** | |||||||
15205918-C-A | 13094004-C-A | ** | ||||||||
27916371-C-A | 25770224-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
14151554-C-A | 12030848-C-A | ** | ||||||||
9886572-C-A | 10048963-C-A | ** | ||||||||
8981583-C-A | 9143974-C-A | ** | ||||||||
14203347-C-T | 12082641-C-T | ** | ||||||||
27733737-A-G | 25587590-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
6953264-C-A | 7085223-C-A | ** | ||||||||
10880263-G-A | ** | |||||||||
10800584-G-T | ** | |||||||||
10669550-A-T | ** | |||||||||
23569036-G-A | 21407150-G-A | ** | ||||||||
14203348-A-G | 12082642-A-G | ** | ||||||||
14451655-C-A | 12330928-C-A | ** | ||||||||
8281661-C-A | 8413620-C-A | ** | ||||||||
23569007-C-A | 21407121-C-A | ** | ||||||||
24871228-G-T | 22725081-G-T | IR1_R | ** | |||||||
8799524-C-A | 8931483-C-A | ** | ||||||||
5586564-C-A | 5718523-C-A | ** | ||||||||
4919331-G-T | 5051290-G-T | ** | ||||||||
10744464-C-T | ** | |||||||||
23262524-C-A | 21100638-C-A | ** | ||||||||
14910909-C-A | 12798976-C-A | ** | ||||||||
15764278-C-A | 13652398-C-A | ** | ||||||||
28547295-C-A | 26401148-C-A | ** | ||||||||
7358206-C-A | 7490165-C-A | ** | ||||||||
22124111-C-A | 19962225-C-A | ** | ||||||||
7717445-C-A | 7849404-C-A | ** | ||||||||
4557572-C-A | 4689531-C-A | ** | ||||||||
21834087-CAT-C | 19672201-CAT-C | ** | ||||||||
14009535-C-A | 11888829-C-A | ** | ||||||||
10776057-T-TTGCTC | ** | |||||||||
5219480-C-A | 5351439-C-A | ** | ||||||||
16412283-C-A | 14300403-C-A | ** | ||||||||
14343928-C-A | 12223223-C-A | FT55885 | ** | |||||||
16848123-C-A | 14736243-C-A | ** | ||||||||
10755012-C-A | ** | |||||||||
5011551-C-A | 5143510-C-A | ** | ||||||||
18740805-C-A | 16628925-C-A | ** | ||||||||
13402704-C-A | 11247028-C-A | ** | ||||||||
19351447-C-A | 17239567-C-A | ** | ||||||||
13294157-C-A | 11138481-C-A | ** | ||||||||
17210885-C-A | 15099005-C-A | ** | ||||||||
14764948-C-A | 12653017-C-A | ** | ||||||||
8342907-C-A | 8474866-C-A | ** | ||||||||
28532007-C-A | 26385860-C-A | ** | ||||||||
17346424-A-T | 15234544-A-T | ** | ||||||||
2686973-T-C | 2818932-T-C | ** | ||||||||
2784281-C-T | 2916240-C-T | ** | ||||||||
2790408-A-G | 2922367-A-G | ** | ||||||||
2811413-C-T | 2943372-C-T | ** | ||||||||
2817690-A-T | 2949649-A-T | ** | ||||||||
2824509-T-G | 2956468-T-G | ** | ||||||||
2854889-G-A | 2986848-G-A | ** | ||||||||
2865054-C-A | 2997013-C-A | ** | ||||||||
2876898-TAGCTCTGTGTGAGGCTG-T | 3008857-TAGCTCTGTGTGAGGCTG-T | ** | ||||||||
2881398-C-T | 3013357-C-T | ** | ||||||||
3122583-C-A | 3254542-C-A | ** | ||||||||
3123127-C-A | 3255086-C-A | ** | ||||||||
3164573-C-T | 3296532-C-T | ** | ||||||||
3164606-C-A | 3296565-C-A | ** | ||||||||
3267435-T-G | 3399394-T-G | ** | ||||||||
3286610-C-A | 3418569-C-A | ** | ||||||||
3327945-C-A | 3459904-C-A | ** | ||||||||
3329222-A-C | 3461181-A-C | ** | ||||||||
3329225-C-A | 3461184-C-A | ** | ||||||||
3424099-C-A | 3556058-C-A | ** | ||||||||
3579461-G-T | 3711420-G-T | ** | ||||||||
3591749-C-A | 3723708-C-A | ** | ||||||||
3804520-C-A | 3936479-C-A | ** | ||||||||
3852307-G-C | 3984266-G-C | ** | ||||||||
3987847-A-C | 4119806-A-C | ** | ||||||||
4006678-T-C | 4138637-T-C | ** | ||||||||
4103765-G-C | 4235724-G-C | ** | ||||||||
4109009-CACCAGTTTGTATATTT-C | 4240968-CACCAGTTTGTATATTT-C | ** | ||||||||
4112790-C-A | 4244749-C-A | ** | ||||||||
4112801-G-A | 4244760-G-A | ** | ||||||||
4136594-T-G | 4268553-T-G | ** | ||||||||
4215739-C-A | 4347698-C-A | ** | ||||||||
4254718-T-C | 4386677-T-C | ** | ||||||||
4326502-C-A | 4458461-C-A | ** | ||||||||
4374296-T-G | 4506255-T-G | ** | ||||||||
4388475-A-C | 4520434-A-C | ** | ||||||||
4449153-C-A | 4581112-C-A | ** | ||||||||
4464281-A-T | 4596240-A-T | ** | ||||||||
4467091-C-A | 4599050-C-A | ** | ||||||||
4493004-C-A | 4624963-C-A | ** | ||||||||
4527934-A-C | 4659893-A-C | ** | ||||||||
4862877-T-G | 4994836-T-G | ** | ||||||||
4887848-G-T | 5019807-G-T | ** | ||||||||
4900937-G-T | 5032896-G-T | ** | ||||||||
4968711-C-A | 5100670-C-A | ** | ||||||||
5084220-G-T | 5216179-G-T | ** | ||||||||
5141793-AAAGG-A | 5273752-AAAGG-A | ** | ||||||||
5180531-T-G | 5312490-T-G | ** | ||||||||
5221010-T-C | 5352969-T-C | ** | ||||||||
5384735-C-A | 5516694-C-A | ** | ||||||||
5393425-C-A | 5525384-C-A | ** | ||||||||
5577217-TCGTTTCC-T | 5709176-TCGTTTCC-T | ** | ||||||||
5642431-G-GAA | 5774390-G-GAA | 10×A | ** | |||||||
5644615-G-A | 5776574-G-A | ** | ||||||||
5687670-G-T | 5819629-G-T | ** | ||||||||
5762503-A-G | 5894462-A-G | ** | ||||||||
5782466-A-C | 5914425-A-C | ** | ||||||||
5830211-C-A | 5962170-C-A | ** | ||||||||
5846332-G-T | 5978291-G-T | ** | ||||||||
5898902-C-A | 6030861-C-A | ** | ||||||||
5936817-T-C | 6068776-T-C | ** | ||||||||
6001383-A-T | 6133342-A-T | ** | ||||||||
6021460-C-A | 6153419-C-A | ** | ||||||||
6028975-T-C | 6160934-T-C | ** | ||||||||
6040189-C-A | 6172148-C-A | ** | ||||||||
6144917-C-G | 6276876-C-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6252030-C-A | 6383989-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6329186-T-A | 6461145-T-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6350667-C-A | 6482626-C-A | ** | ||||||||
6368239-A-G | 6500198-A-G | ** | ||||||||
6435113-C-A | 6567072-C-A | ** | ||||||||
6490767-C-A | 6622726-C-A | ** | ||||||||
6516789-C-A | 6648748-C-A | ** | ||||||||
6535524-C-A | 6667483-C-A | ** | ||||||||
6621387-C-A | 6753346-C-A | ** | ||||||||
6633141-G-C | 6765100-G-C | ** | ||||||||
6637178-C-A | 6769137-C-A | ** | ||||||||
6644980-C-A | 6776939-C-A | ** | ||||||||
6667491-T-G | 6799450-T-G | ** | ||||||||
6690128-C-A | 6822087-C-A | ** | ||||||||
6748144-G-T | 6880103-G-T | ** | ||||||||
6751262-T-TA | 6883221-T-TA | 8×A | ** | |||||||
6762762-C-A | 6894721-C-A | ** | ||||||||
6770809-G-A | 6902768-G-A | ** | ||||||||
6792403-G-A | 6924362-G-A | ** | ||||||||
6814484-G-T | 6946443-G-T | ** | ||||||||
6818901-T-C | 6950860-T-C | ** | ||||||||
6862216-C-A | 6994175-C-A | ** | ||||||||
6915399-C-A | 7047358-C-A | ** | ||||||||
6934073-C-A | 7066032-C-A | ** | ||||||||
6936184-A-C | 7068143-A-C | ** | ||||||||
6955823-C-A | 7087782-C-A | ** | ||||||||
6957027-C-A | 7088986-C-A | ** | ||||||||
6997881-A-C | 7129840-A-C | ** | ||||||||
6997886-C-A | 7129845-C-A | ** | ||||||||
7008278-A-G | 7140237-A-G | ** | ||||||||
7053698-C-A | 7185657-C-A | ** | ||||||||
7074501-G-T | 7206460-G-T | ** | ||||||||
7100954-CTTTTTTTT-C | 7232913-CTTTTTTTT-C | 32×T | ** | |||||||
7104061-C-A | 7236020-C-A | ** | ||||||||
7138104-T-A | 7270063-T-A | ** | ||||||||
7143564-C-A | 7275523-C-A | ** | ||||||||
7158909-A-C | 7290868-A-C | ** | ||||||||
7158925-C-T | 7290884-C-T | ** | ||||||||
7167719-A-C | 7299678-A-C | ** | ||||||||
7174284-G-A | 7306243-G-A | ** | ||||||||
7184984-T-C | 7316943-T-C | ** | ||||||||
7231644-G-T | 7363603-G-T | ** | ||||||||
7255982-G-T | 7387941-G-T | ** | ||||||||
7290535-C-A | 7422494-C-A | ** | ||||||||
7310004-C-A | 7441963-C-A | ** | ||||||||
7317605-C-A | 7449564-C-A | ** | ||||||||
7362109-A-G | 7494068-A-G | ** | ||||||||
7420529-A-C | 7552488-A-C | ** | ||||||||
7429933-C-A | 7561892-C-A | ** | ||||||||
7442454-C-A | 7574413-C-A | ** | ||||||||
7548234-G-A | 7680193-G-A | ** | ||||||||
7558051-G-T | 7690010-G-T | ** | ||||||||
7613812-C-G | 7745771-C-G | ** | ||||||||
7617778-C-A | 7749737-C-A | ** | ||||||||
7633806-C-A | 7765765-C-A | ** | ||||||||
7650647-A-C | 7782606-A-C | ** | ||||||||
7670359-C-A | 7802318-C-A | ** | ||||||||
7670735-G-T | 7802694-G-T | ** | ||||||||
7689934-C-A | 7821893-C-A | ** | ||||||||
7699309-T-C | 7831268-T-C | ** | ||||||||
7749429-C-T | 7881388-C-T | ** | ||||||||
7761233-C-A | 7893192-C-A | ** | ||||||||
7874161-C-A | 8006120-C-A | ** | ||||||||
7898784-C-G | 8030743-C-G | ** | ||||||||
7958354-C-A | 8090313-C-A | ** | ||||||||
7990859-C-A | 8122818-C-A | ** | ||||||||
7992367-T-G | 8124326-T-G | ** | ||||||||
8047093-C-A | 8179052-C-A | ** | ||||||||
8049497-C-A | 8181456-C-A | ** | ||||||||
8173772-G-C | 8305731-G-C | ** | ||||||||
8329888-G-A | 8461847-G-A | ** | ||||||||
8482022-A-T | 8613981-A-T | ** | ||||||||
8501442-C-A | 8633401-C-A | ** | ||||||||
8624503-A-G | 8756462-A-G | ** | ||||||||
8698089-C-A | 8830048-C-A | ** | ||||||||
8704322-C-A | 8836281-C-A | ** | ||||||||
8718330-G-C | 8850289-G-C | ** | ||||||||
8735772-A-G | 8867731-A-G | ** | ||||||||
8746543-C-A | 8878502-C-A | ** | ||||||||
8774534-G-A | 8906493-G-A | ** | ||||||||
9123212-G-T | ** | |||||||||
9014392-T-C | 9176783-T-C | ** | ||||||||
9040694-C-A | 9203085-C-A | ** | ||||||||
9338460-C-A | 9500851-C-A | ** | ||||||||
9457312-T-G | 9619703-T-G | ** | ||||||||
9487671-G-T | 9650062-G-T | ** | ||||||||
9647566-T-C | 9809957-T-C | IR3_Prx | ** | |||||||
9647570-C-T | 9809961-C-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9678170-G-T | 9840561-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9702772-G-T | 9865163-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9742453-C-A | 9904844-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9830698-C-A | 9993089-C-A | ** | ||||||||
9865210-T-G | 10027601-T-G | ** | ||||||||
9926662-C-A | 10089053-C-A | ** | ||||||||
9934043-G-T | 10096434-G-T | ** | ||||||||
9973336-A-C | 10135727-A-C | ** | ||||||||
10003714-C-A | 10166105-C-A | ** | ||||||||
10005953-T-C | 10168344-T-C | ** | ||||||||
10033710-G-T | 10196101-G-T | ** | ||||||||
10627532-C-T | ** | |||||||||
10630689-C-T | ** | |||||||||
10652532-G-T | ** | |||||||||
10687738-TC-T | ** | |||||||||
10693175-A-T | ** | |||||||||
10747993-T-G | ** | |||||||||
10748283-A-G | ** | |||||||||
10754085-T-C | ** | |||||||||
10765811-T-TGCAAC | ** | |||||||||
10765816-C-A | ** | |||||||||
10780119-T-C | ** | |||||||||
10788274-C-A | ** | |||||||||
10801782-A-G | ** | |||||||||
10802441-C-A | ** | |||||||||
10845028-C-T | ** | |||||||||
10915511-C-A | ** | |||||||||
10985634-A-T | ** | |||||||||
10985641-T-C | ** | |||||||||
10985648-G-C | ** | |||||||||
10985655-A-T | ** | |||||||||
10985657-T-G | ** | |||||||||
10985660-T-A | ** | |||||||||
10999344-C-A | ** | |||||||||
11022029-T-A | ** | |||||||||
11033181-T-C | ** | |||||||||
13195928-T-C | 11040252-T-C | ** | ||||||||
13217414-T-G | 11061738-T-G | ** | ||||||||
13249234-A-C | 11093558-A-C | ** | ||||||||
13298214-G-T | 11142538-G-T | ** | ||||||||
13298669-G-T | 11142993-G-T | ** | ||||||||
13324543-C-A | 11168867-C-A | ** | ||||||||
13325968-C-A | 11170292-C-A | ** | ||||||||
13456932-C-A | 11301256-C-A | ** | ||||||||
13460070-C-A | 11304394-C-A | ** | ||||||||
13471242-C-A | 11315566-C-A | ** | ||||||||
13471957-ACCCG-A | 11316281-ACCCG-A | ** | ||||||||
13477629-C-A | 11321953-C-A | ** | ||||||||
13477730-C-A | 11322054-C-A | ** | ||||||||
13494189-AAACACT-A | 11338513-AAACACT-A | ** | ||||||||
13505183-C-A | 11349507-C-A | ** | ||||||||
13509299-G-T | 11353623-G-T | ** | ||||||||
13542778-C-A | 11387102-C-A | ** | ||||||||
13563125-C-T | 11407449-C-T | ** | ||||||||
13605207-T-G | 11449531-T-G | ** | ||||||||
13614165-A-C | 11458489-A-C | ** | ||||||||
13621609-A-C | 11465933-A-C | ** | ||||||||
11666037-T-A | FT255243 | DYZ17 | ** | |||||||
11666040-C-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11666045-A-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11666052-T-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11666054-T-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11676555-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
13829135-G-A | 11708429-G-A | DYZ17 | ** | |||||||
13847553-G-T | 11726847-G-T | DYZ17 | ** | |||||||
13857834-T-G | 11737128-T-G | DYZ17 | ** | |||||||
13862583-TAG-T | 11741877-TAG-T | DYZ17 | ** | |||||||
13891495-T-C | 11770789-T-C | ** | ||||||||
13927466-C-A | 11806760-C-A | ** | ||||||||
13934393-G-A | 11813687-G-A | ** | ||||||||
13986851-A-G | 11866145-A-G | ** | ||||||||
14006830-C-A | 11886124-C-A | ** | ||||||||
14043956-A-G | 11923250-A-G | ** | ||||||||
14073168-G-A | 11952462-G-A | ** | ||||||||
14091414-G-A | 11970708-G-A | ** | ||||||||
14092595-C-A | 11971889-C-A | ** | ||||||||
14102573-C-A | 11981867-C-A | ** | ||||||||
14109030-C-A | 11988324-C-A | ** | ||||||||
14135309-G-T | 12014603-G-T | ** | ||||||||
14161852-A-G | 12041146-A-G | ** | ||||||||
14187979-C-T | 12067273-C-T | ** | ||||||||
14190185-C-A | 12069479-C-A | ** | ||||||||
14203324-A-G | 12082618-A-G | ** | ||||||||
14203336-CAGG-C | 12082630-CAGG-C | ** | ||||||||
14203356-A-G | 12082650-A-G | ** | ||||||||
14203361-G-A | 12082655-G-A | FTB80833 | ** | |||||||
14203362-A-C | 12082656-A-C | ** | ||||||||
14225870-C-G | 12105164-C-G | ** | ||||||||
14230346-TG-T | 12109640-TG-T | ** | ||||||||
14256095-G-T | 12135389-G-T | ** | ||||||||
14266930-C-A | 12146224-C-A | ** | ||||||||
14273002-G-T | 12152296-G-T | ** | ||||||||
14282589-G-T | 12161883-G-T | ** | ||||||||
14304068-C-A | 12183362-C-A | ** | ||||||||
14342015-A-G | 12221310-A-G | ** | ||||||||
14368030-G-T | 12247326-G-T | ** | ||||||||
14368569-G-T | 12247865-G-T | ** | ||||||||
14393843-AGATACAAG-A | 12273139-AGATACAAG-A | ** | ||||||||
14402577-G-T | 12281874-G-T | ** | ||||||||
14428100-C-A | 12307375-C-A | ** | ||||||||
14443138-C-A | 12322411-C-A | ** | ||||||||
14461040-C-A | 12340313-C-A | ** | ||||||||
14461484-C-A | 12340757-C-A | ** | ||||||||
14462382-C-A | 12341655-C-A | ** | ||||||||
14466908-A-G | 12346181-A-G | ** | ||||||||
14467336-C-A | 12346605-C-A | ** | ||||||||
14468432-C-T | 12347701-C-T | ** | ||||||||
14470593-T-A | 12349862-T-A | ** | ||||||||
14472058-G-T | 12351327-G-T | ** | ||||||||
14499419-A-C | 12387624-A-C | ** | ||||||||
14499437-AG-A | 12387642-AG-A | ** | ||||||||
14517575-C-A | 12405776-C-A | ** | ||||||||
14521838-C-A | 12410039-C-A | ** | ||||||||
14571049-C-T | 12459249-C-T | ** | ||||||||
14572524-T-C | 12460724-T-C | ** | ||||||||
14572932-C-A | 12461132-C-A | ** | ||||||||
14579610-C-A | 12467810-C-A | ** | ||||||||
14598461-C-A | 12486661-C-A | ** | ||||||||
14611429-C-G | 12499635-C-G | ** | ||||||||
14621472-C-T | 12509670-C-T | ** | ||||||||
14635795-T-A | 12523864-T-A | ** | ||||||||
14654249-C-G | 12542314-C-G | ** | ||||||||
14700653-C-A | 12588719-C-A | Y67110 | ** | |||||||
14701262-A-T | 12589328-A-T | ** | ||||||||
14719657-T-C | 12607725-T-C | ** | ||||||||
14724398-C-A | 12612466-C-A | ** | ||||||||
14755479-C-T | 12643548-C-T | ** | ||||||||
14769298-C-A | 12657367-C-A | ** | ||||||||
14879167-C-A | 12767237-C-A | ** | ||||||||
14886282-C-A | 12774348-C-A | ** | ||||||||
14893106-C-A | 12781172-C-A | ** | ||||||||
14953533-C-A | 12841607-C-A | ** | ||||||||
14994423-G-T | 12882508-G-T | ** | ||||||||
14995623-C-A | 12883708-C-A | Y92736 | ** | |||||||
15035696-C-A | 12923784-C-A | ** | ||||||||
15036258-G-A | 12924346-G-A | ** | ||||||||
15091795-T-A | 12979884-T-A | ** | ||||||||
15106537-C-A | 12994625-C-A | ** | ||||||||
15109300-T-G | 12997387-T-G | ** | ||||||||
15117826-C-A | 13005913-C-A | ** | ||||||||
15172770-G-T | 13060856-G-T | ** | ||||||||
15177426-C-A | 13065512-C-A | ** | ||||||||
15182915-A-T | 13071001-A-T | ** | ||||||||
15193681-C-A | 13081767-C-A | ** | ||||||||
15201748-C-G | 13089834-C-G | ** | ||||||||
15221720-T-C | 13109806-T-C | ** | ||||||||
15250682-T-C | 13138768-T-C | ** | ||||||||
15260066-C-A | 13148150-C-A | ** | ||||||||
15347193-A-G | 13235312-A-G | ** | ||||||||
15386598-G-T | 13274718-G-T | ** | ||||||||
15392074-G-T | 13280194-G-T | ** | ||||||||
15395096-C-A | 13283216-C-A | ** | ||||||||
15433558-C-A | 13321678-C-A | ** | ||||||||
15438896-A-T | 13327016-A-T | ** | ||||||||
15446880-C-G | 13335000-C-G | ** | ||||||||
15457937-G-T | 13346057-G-T | ** | ||||||||
15457947-G-T | 13346067-G-T | ** | ||||||||
15532327-C-T | 13420447-C-T | ** | ||||||||
15581063-T-C | 13469183-T-C | ** | ||||||||
15601176-C-A | 13489296-C-A | ** | ||||||||
15620401-G-T | 13508521-G-T | ** | ||||||||
15642876-C-T | 13530996-C-T | ** | ||||||||
15648053-C-A | 13536173-C-A | ** | ||||||||
15653208-C-A | 13541328-C-A | ** | ||||||||
15662229-C-A | 13550349-C-A | ** | ||||||||
15689566-A-C | 13577686-A-C | ** | ||||||||
15717692-C-A | 13605812-C-A | ** | ||||||||
15739765-C-A | 13627885-C-A | ** | ||||||||
15756225-C-A | 13644345-C-A | ** | ||||||||
15761508-C-A | 13649628-C-A | ** | ||||||||
15764159-T-G | 13652279-T-G | ** | ||||||||
15857330-T-C | 13745450-T-C | ** | ||||||||
15906400-C-A | 13794520-C-A | ** | ||||||||
15946745-C-G | 13834865-C-G | ** | ||||||||
15957002-G-C | 13845122-G-C | ** | ||||||||
16034211-C-A | 13922331-C-A | ** | ||||||||
16043335-C-G | 13931455-C-G | ** | ||||||||
16071943-T-G | 13960063-T-G | ** | ||||||||
16170015-C-A | 14058135-C-A | P8_Dst | ** | |||||||
16197356-G-T | 14085476-G-T | ** | ||||||||
16223632-C-A | 14111752-C-A | ** | ||||||||
16242970-C-A | 14131090-C-A | ** | ||||||||
16245907-G-T | 14134027-G-T | ** | ||||||||
16257884-CATTACAGG-C | 14146004-CATTACAGG-C | ** | ||||||||
16269356-C-A | 14157476-C-A | ** | ||||||||
16284032-C-A | 14172152-C-A | ** | ||||||||
16293698-C-A | 14181818-C-A | ** | ||||||||
16308256-A-G | 14196376-A-G | ** | ||||||||
16379055-C-A | 14267175-C-A | ** | ||||||||
16395344-G-T | 14283464-G-T | ** | ||||||||
16413709-ATC-A | 14301829-ATC-A | ** | ||||||||
16425054-G-T | 14313174-G-T | ** | ||||||||
16428491-C-A | 14316611-C-A | ** | ||||||||
16462907-TA-T | 14351027-TA-T | ** | ||||||||
16520894-G-T | 14409014-G-T | ** | ||||||||
16544593-G-T | 14432713-G-T | ** | ||||||||
16603341-G-T | 14491461-G-T | Y96816 | ** | |||||||
16623663-G-T | 14511783-G-T | ** | ||||||||
16645466-A-G | 14533586-A-G | ** | ||||||||
16645469-CT-C | 14533589-CT-C | 8×T | ** | |||||||
16648226-A-G | 14536346-A-G | ** | ||||||||
16712906-C-A | 14601026-C-A | ** | ||||||||
16729440-G-T | 14617560-G-T | ** | ||||||||
16746348-T-G | 14634468-T-G | ** | ||||||||
16765034-C-A | 14653154-C-A | ** | ||||||||
16799402-GCA-G | 14687522-GCA-G | ** | ||||||||
16874355-G-T | 14762475-G-T | ** | ||||||||
16922196-C-T | 14810316-C-T | ** | ||||||||
16968114-C-A | 14856234-C-A | ** | ||||||||
17004617-T-A | 14892737-T-A | ** | ||||||||
17014536-C-A | 14902656-C-A | ** | ||||||||
17039164-C-A | 14927284-C-A | ** | ||||||||
17225833-C-A | 15113953-C-A | ** | ||||||||
17242177-C-A | 15130297-C-A | ** | ||||||||
17244228-C-A | 15132348-C-A | ** | ||||||||
17374934-A-G | 15263054-A-G | ** | ||||||||
17375052-C-A | 15263172-C-A | ** | ||||||||
17375588-C-T | 15263708-C-T | ** | ||||||||
17385291-G-T | 15273411-G-T | ** | ||||||||
17505751-A-G | 15393871-A-G | ** | ||||||||
17632087-G-C | 15520207-G-C | ** | ||||||||
17632103-A-C | 15520223-A-C | ** | ||||||||
17674661-C-A | 15562781-C-A | ** | ||||||||
17705561-TG-T | 15593681-TG-T | ** | ||||||||
17752181-TG-T | 15640301-TG-T | ** | ||||||||
17763925-G-T | 15652045-G-T | ** | ||||||||
17770119-A-T | 15658239-A-T | ** | ||||||||
17773550-C-A | 15661670-C-A | ** | ||||||||
17887653-G-T | 15775773-G-T | ** | ||||||||
17905117-C-A | 15793237-C-A | ** | ||||||||
17913608-T-C | 15801728-T-C | ** | ||||||||
17918588-C-A | 15806708-C-A | ** | ||||||||
17927498-C-A | 15815618-C-A | ** | ||||||||
17944262-G-A | 15832382-G-A | ** | ||||||||
18060874-C-A | 15948994-C-A | ** | ||||||||
18080575-C-A | 15968695-C-A | ** | ||||||||
18097926-C-A | 15986046-C-A | ** | ||||||||
18115869-T-C | 16003989-T-C | ** | ||||||||
18121791-A-T | 16009911-A-T | ** | ||||||||
18136019-C-A | 16024139-C-A | Y101423 | ** | |||||||
18136034-C-A | 16024154-C-A | ** | ||||||||
18191174-C-A | 16079294-C-A | ** | ||||||||
18247395-C-A | 16135515-C-A | ** | ||||||||
18262503-A-G | 16150623-A-G | ** | ||||||||
18270209-G-C | 16158329-G-C | ** | ||||||||
18471995-A-C | 16360115-A-C | P6_Dst | ** | |||||||
18512537-C-T | 16400657-C-T | P6_Dst | ** | |||||||
18577081-C-A | 16465201-C-A | ** | ||||||||
18577137-A-T | 16465257-A-T | ** | ||||||||
18653606-G-A | 16541726-G-A | ** | ||||||||
18692679-C-A | 16580799-C-A | ** | ||||||||
18697966-G-A | 16586086-G-A | ** | ||||||||
18709205-G-T | 16597325-G-T | ** | ||||||||
18712882-G-C | 16601002-G-C | ** | ||||||||
18712885-G-T | 16601005-G-T | ** | ||||||||
18712888-G-A | 16601008-G-A | ** | ||||||||
18725094-A-G | 16613214-A-G | ** | ||||||||
18739672-A-G | 16627792-A-G | ** | ||||||||
18751573-G-C | 16639693-G-C | ** | ||||||||
18752166-C-A | 16640286-C-A | ** | ||||||||
18772949-T-C | 16661069-T-C | ** | ||||||||
18830047-C-A | 16718167-C-A | ** | ||||||||
18846202-C-A | 16734322-C-A | ** | ||||||||
18854992-C-A | 16743112-C-A | ** | ||||||||
18901581-C-A | 16789701-C-A | ** | ||||||||
18915259-A-G | 16803379-A-G | ** | ||||||||
18929803-G-A | 16817923-G-A | ** | ||||||||
18945358-G-C | 16833478-G-C | ** | ||||||||
18951185-T-C | 16839305-T-C | ** | ||||||||
18956321-T-C | 16844441-T-C | FT88126 | ** | |||||||
18965066-C-A | 16853186-C-A | ** | ||||||||
19056376-C-A | 16944496-C-A | ** | ||||||||
19081068-C-A | 16969188-C-A | ** | ||||||||
19102810-A-G | 16990930-A-G | ** | ||||||||
19129299-C-A | 17017419-C-A | ** | ||||||||
19143125-A-T | 17031245-A-T | 17×T | ** | |||||||
19143187-T-C | 17031307-T-C | ** | ||||||||
19155364-G-T | 17043484-G-T | ** | ||||||||
19201412-A-C | 17089532-A-C | ** | ||||||||
19201417-G-C | 17089537-G-C | ** | ||||||||
19248077-C-A | 17136197-C-A | ** | ||||||||
19253638-G-T | 17141758-G-T | ** | ||||||||
19255521-C-A | 17143641-C-A | ** | ||||||||
19266595-A-C | 17154715-A-C | ** | ||||||||
19266784-C-A | 17154904-C-A | ** | ||||||||
19311030-T-G | 17199150-T-G | ** | ||||||||
19312410-C-A | 17200530-C-A | ** | ||||||||
19313670-A-G | 17201790-A-G | ** | ||||||||
19313676-T-G | 17201796-T-G | ** | ||||||||
19365504-C-A | 17253624-C-A | ** | ||||||||
19370386-C-A | 17258506-C-A | ** | ||||||||
19435860-C-A | 17323980-C-A | ** | ||||||||
19449317-C-A | 17337437-C-A | ** | ||||||||
19459230-C-A | 17347350-C-A | FT207753 | ** | |||||||
19575989-C-A | 17464109-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19643393-T-G | 17531513-T-G | P5_Prx | ** | |||||||
19720902-C-A | 17609022-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19818813-A-AG | 17706933-A-AG | P5_Prx | ** | |||||||
19948187-T-TTTCTTTCA | 17836307-T-TTTCTTTCA | P5_Prx | ** | |||||||
19997498-G-T | 17885618-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
20045358-A-C | 17933478-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
20231512-A-AAAGAAAG | 18069626-A-AAAGAAAG | P5_Dst | ** | |||||||
20334844-G-T | 18172958-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20621331-A-AG | 18459445-A-AG | P4_Prx | ** | |||||||
20655126-C-A | 18493240-C-A | P4_Prx | ** | |||||||
20830363-A-T | 18668477-A-T | P4_Gap | ** | |||||||
20958252-GT-G | 18796366-GT-G | P4_Dst | ** | |||||||
20972669-T-TC | 18810783-T-TC | P4_Dst | ** | |||||||
21086996-C-A | 18925110-C-A | ** | ||||||||
21092269-G-A | 18930383-G-A | ** | ||||||||
21106725-C-A | 18944839-C-A | ** | ||||||||
21111598-G-C | 18949712-G-C | ** | ||||||||
21111606-C-A | 18949720-C-A | FT170502 | ** | |||||||
21130273-A-T | 18968387-A-T | ** | ||||||||
21132111-T-G | 18970225-T-G | ** | ||||||||
21135149-T-G | 18973263-T-G | ** | ||||||||
21140996-G-C | 18979110-G-C | ** | ||||||||
21164650-A-C | 19002764-A-C | ** | ||||||||
21176959-C-A | 19015073-C-A | ** | ||||||||
21206848-C-T | 19044962-C-T | ** | ||||||||
21207080-A-G | 19045194-A-G | ** | ||||||||
21237820-G-T | 19075934-G-T | ** | ||||||||
21297989-C-G | 19136103-C-G | ** | ||||||||
21397543-A-G | 19235657-A-G | ** | ||||||||
21528407-G-T | 19366521-G-T | ** | ||||||||
21545316-G-A | 19383430-G-A | FGC28595 | ** | |||||||
21579526-C-A | 19417640-C-A | ** | ||||||||
21580590-C-A | 19418704-C-A | ** | ||||||||
21589681-C-A | 19427795-C-A | ** | ||||||||
21624416-TC-T | 19462530-TC-T | ** | ||||||||
21813920-A-T | 19652034-A-T | ** | ||||||||
21815139-G-C | 19653253-G-C | ** | ||||||||
21822058-C-A | 19660172-C-A | ** | ||||||||
21822077-C-A | 19660191-C-A | ** | ||||||||
21847523-GTATT-G | 19685637-GTATT-G | ** | ||||||||
21935159-C-A | 19773273-C-A | ** | ||||||||
21972639-C-A | 19810753-C-A | ** | ||||||||
22010268-C-A | 19848382-C-A | ** | ||||||||
22018060-C-T | 19856174-C-T | Y108146 | ** | |||||||
22020622-C-A | 19858736-C-A | ** | ||||||||
22122069-C-A | 19960183-C-A | ** | ||||||||
22127926-C-A | 19966040-C-A | ** | ||||||||
22189096-G-T | 20027210-G-T | ** | ||||||||
22345997-CA-T | 20184111-CA-T | DYZ19 | ** | |||||||
22517865-A-G | 20355979-A-G | ** | ||||||||
22517976-C-A | 20356090-C-A | ** | ||||||||
22565019-C-A | 20403133-C-A | ** | ||||||||
22612953-C-G | 20451067-C-G | ** | ||||||||
22722433-C-T | 20560547-C-T | ** | ||||||||
22734317-A-C | 20572431-A-C | ** | ||||||||
22793966-C-G | 20632080-C-G | ** | ||||||||
22811636-A-C | 20649750-A-C | ** | ||||||||
22812081-C-A | 20650195-C-A | ** | ||||||||
22830222-C-A | 20668336-C-A | ** | ||||||||
22899954-G-T | 20738068-G-T | ** | ||||||||
22919409-C-A | 20757523-C-A | ** | ||||||||
22948195-C-A | 20786309-C-A | ** | ||||||||
23007077-G-T | 20845191-G-T | ** | ||||||||
23097812-C-A | 20935926-C-A | ** | ||||||||
23098143-C-A | 20936257-C-A | ** | ||||||||
23155526-C-A | 20993640-C-A | ** | ||||||||
23155529-C-A | 20993643-C-A | ** | ||||||||
23199329-C-A | 21037443-C-A | ** | ||||||||
23208108-G-C | 21046222-G-C | ** | ||||||||
23226664-AAGAAATGTT-A | 21064778-AAGAAATGTT-A | ** | ||||||||
23276451-A-C | 21114565-A-C | ** | ||||||||
23311329-A-C | 21149443-A-C | ** | ||||||||
23315938-A-C | 21154052-A-C | ** | ||||||||
23345511-AG-A | 21183625-AG-A | ** | ||||||||
23373622-G-T | 21211736-G-T | ** | ||||||||
23545800-G-T | 21383914-G-T | ** | ||||||||
23572553-T-A | 21410667-T-A | ** | ||||||||
23573317-A-T | 21411431-A-T | ** | ||||||||
23623274-A-G | 21461388-A-G | ** | ||||||||
24399636-T-C | 22253489-T-C | ** | ||||||||
24406623-C-A | 22260476-C-A | ** | ||||||||
24491754-C-A | 22345607-C-A | ** | ||||||||
24626441-A-ATTT | 22480294-A-ATTT | P3_t2 | 10×T | ** | ||||||
26386329-A-G | 24240182-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26422447-G-T | 24276300-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26463003-T-C | 24316856-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26730194-GAAAAAGA-G | 24584047-GAAAAAGA-G | P1_g2 | ** | |||||||
27021872-T-G | 24875725-T-G | P1_r4 | ** | |||||||
27232229-G-T | 25086082-G-T | P1_g3 | ** | |||||||
27762782-C-CCA | 25616635-C-CCA | P1_Y2 | ** | |||||||
27915185-A-AG | 25769038-A-AG | P1_Y2 | ** | |||||||
27943989-C-A | 25797842-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28478410-C-A | 26332263-C-A | ** | ||||||||
28483870-C-A | 26337723-C-A | ** | ||||||||
28492041-C-A | 26345894-C-A | ** | ||||||||
28496416-T-G | 26350269-T-G | ** | ||||||||
28533866-T-G | 26387719-T-G | ** | ||||||||
28591081-C-A | 26444934-C-A | ** | ||||||||
28591814-T-A | 26445667-T-A | ** | ||||||||
28602115-T-A | 26455968-T-A | ** | ||||||||
28633691-C-A | 26487544-C-A | ** | ||||||||
28635635-C-A | 26489488-C-A | ** | ||||||||
28711438-C-A | 26565291-C-A | ** | ||||||||
28722500-T-C | 26576353-T-C | ** | ||||||||
28741358-C-A | 26595211-C-A | ** | ||||||||
28756185-C-A | 26610038-C-A | ** | ||||||||
28764476-G-T | 26618329-G-T | ** | ||||||||
28777955-C-A | 26631808-C-A | ** | ||||||||
28808625-G-C | 26662478-G-C | ** | ||||||||
56822984-A-G | ** | |||||||||
56830009-T-C | ** | |||||||||
56833547-C-A | ** | |||||||||
27291-G-A | ** | |||||||||
9574853-C-CAT | 9737244-C-CAT | IR3_Prx | 12×A | ** | ||||||
13971303-A-G | 11850597-A-G | ** | ||||||||
15676897-G-T | 13565017-G-T | ** | ||||||||
17269347-G-C | 15157467-G-C | ** | ||||||||
18312188-A-AT | 16200308-A-AT | P6_Prx | ** | |||||||
20620990-C-A | 18459104-C-A | P4_Prx | ** | |||||||
28565874-C-T | 26419727-C-T | ** | ||||||||
58866112-G-C | 56724759-C-G | *** | ||||||||
13701342-T-C | 11545666-T-C | DYZ17 | *** | |||||||
13489638-A-C | 11333962-A-C | *** | ||||||||
18378959-CTT-C | 16267079-CTT-C | P6_Prx | 28×T | *** | ||||||
13455536-C-CTCCAG | 11299860-C-CTCCAG | *** | ||||||||
58973947-A-T | 56827800-A-T | *** | ||||||||
13455626-C-T | 11299950-C-T | *** | ||||||||
13458477-A-G | 11302801-A-G | *** | ||||||||
13701316-A-T | 11545640-A-T | DYZ17 | *** | |||||||
9977669-T-C | 10140060-T-C | *** | ||||||||
9985581-G-T | 10147972-G-T | *** | ||||||||
9991585-G-A | 10153976-G-A | *** | ||||||||
13453100-ACTCTC-A,ATTCCA | 11297424-ACTCTC-A,ATTCCA | *** | ||||||||
13454168-T-C | 11298492-T-C | *** | ||||||||
13701336-ATGAAC-A,ATGAAG | 11545660-ATGAAC-A,ATGAAG | DYZ17 | *** | |||||||
13720952-C-G | 11565276-C-G | DYZ17 | *** | |||||||
13805364-C-A,G | 11684658-C-A,G | DYZ17 | *** | |||||||
13823275-A-G | 11702569-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
13839751-G-A | 11719045-G-A | DYZ17 | *** | |||||||
13839860-G-T | 11719154-G-T | DYZ17 | *** | |||||||
13848989-C-A | 11728283-C-A | DYZ17 | *** | |||||||
13848991-C-G | 11728285-C-G | DYZ17 | *** | |||||||
13857563-A-G | 11736857-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
13865934-G-C | 11745228-G-C | DYZ17 | *** | |||||||
18354236-GGAAA-G,GG | 16242356-GGAAA-G,GG | P6_Prx | 13×GAAA | *** | ||||||
22299810-A-G | 20137924-A-G | DYZ19 | *** | |||||||
25314410-G-A | 23168263-G-A | P2_r1 | *** | |||||||
13848940-AGGAAC-A | 11728234-AGGAAC-A | DYZ17 | *** | |||||||
28623880-C-A | 26477733-C-A | BY69463 | B123 | *** | ||||||
7386623-T-C | 7518582-T-C | *** | ||||||||
8476198-TTG-T | 8608157-TTG-T | *** | ||||||||
58973996-GATTCC-A,C | 56827849-GATTCC-A,C | 5×ATTCC | *** | |||||||
9211352-AACACACACACACAC-A,AA | 9373743-AACACACACACACAC-A,AA | 22×AC | *** | |||||||
10648785-C-A | *** | |||||||||
19345331-C-A | 17233451-C-A | *** | ||||||||
10748018-T-C | *** | |||||||||
10980769-C-A | *** | |||||||||
56834545-T-A | *** | |||||||||
13489122-GGATGAGCTCCTG-G,GGATGAGCTACTA | 11333446-GGATGAGCTCCTG-G,GGATGAGCTACTA | *** | ||||||||
27216712-C-A | 25070565-C-A | P1_g3 | *** | |||||||
18263589-C-A | 16151709-C-A | *** | ||||||||
15406651-C-A | 13294771-C-A | *** | ||||||||
16342334-G-A | 14230454-G-A | *** | ||||||||
4172196-C-A | 4304155-C-A | FT32035 | *** | |||||||
10889297-C-CCGTT | *** | |||||||||
10889308-C-CATTAGTGTTT | *** | |||||||||
2842480-C-A | 2974439-C-A | *** | ||||||||
4604862-C-A | 4736821-C-A | *** | ||||||||
4936878-C-A | 5068837-C-A | *** | ||||||||
6205489-T-C | 6337448-T-C | IR3_Dst | *** | |||||||
6509553-C-A | 6641512-C-A | *** | ||||||||
6512372-C-A | 6644331-C-A | *** | ||||||||
6795117-T-C | 6927076-T-C | *** | ||||||||
7051550-C-A | 7183509-C-A | *** | ||||||||
7096937-A-G | 7228896-A-G | *** | ||||||||
7144819-TG-T | 7276778-TG-T | *** | ||||||||
7145086-C-A | 7277045-C-A | *** | ||||||||
7221180-C-A | 7353139-C-A | *** | ||||||||
7255111-G-A | 7387070-G-A | *** | ||||||||
7353272-C-A | 7485231-C-A | *** | ||||||||
7527566-C-A | 7659525-C-A | *** | ||||||||
7626355-T-A | 7758314-T-A | *** | ||||||||
7703234-C-A | 7835193-C-A | *** | ||||||||
7771858-A-G | 7903817-A-G | *** | ||||||||
7901046-C-A | 8033005-C-A | *** | ||||||||
7997116-C-A | 8129075-C-A | *** | ||||||||
8048680-C-A | 8180639-C-A | *** | ||||||||
8154223-C-A | 8286182-C-A | *** | ||||||||
8230814-C-A | 8362773-C-A | *** | ||||||||
8246972-CT-C | 8378931-CT-C | 9×T | *** | |||||||
8395936-C-A | 8527895-C-A | *** | ||||||||
8421581-C-A | 8553540-C-A | *** | ||||||||
8550267-C-A | 8682226-C-A | *** | ||||||||
8698580-C-T | 8830539-C-T | *** | ||||||||
8835878-C-A | 8967837-C-A | *** | ||||||||
8888157-C-A | 9020116-C-A | *** | ||||||||
9485806-C-A | 9648197-C-A | *** | ||||||||
9640946-C-A | 9803337-C-A | IR3_Prx | *** | |||||||
9647346-C-T | 9809737-C-T | IR3_Prx | *** | |||||||
9693125-G-T | 9855516-G-T | IR3_Prx | *** | |||||||
9994344-C-A | 10156735-C-A | *** | ||||||||
10671094-C-G | *** | |||||||||
10748065-C-A | *** | |||||||||
10801732-CTTTTC-C,TTTTTG | *** | |||||||||
10889750-AATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCC-A,AATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCC | *** | |||||||||
13452013-C-A | 11296337-C-A | *** | ||||||||
13453289-C-CA | 11297613-C-CA | *** | ||||||||
13457490-GCCAATT-G | 11301814-GCCAATT-G | *** | ||||||||
13457861-C-A | 11302185-C-A | *** | ||||||||
13462748-T-C | 11307072-T-C | *** | ||||||||
13578084-C-A | 11422408-C-A | *** | ||||||||
13660841-G-T | 11505165-G-T | DYZ17 | *** | |||||||
13842628-G-GAATGC | 11721922-G-GAATGC | DYZ17 | *** | |||||||
13847214-GAATGGAATGGAATGGACTCAAATGG-G,GAATGGAATGGAATGGACTCA | 11726508-GAATGGAATGGAATGGACTCAAATGG-G,GAATGGAATGGAATGGACTCA | DYZ17 | *** | |||||||
13988708-C-A | 11868002-C-A | *** | ||||||||
14193432-C-A | 12072726-C-A | FT419478 | *** | |||||||
14238983-C-A | 12118277-C-A | *** | ||||||||
14585906-G-T | 12474106-G-T | *** | ||||||||
14654670-C-A | 12542735-C-A | *** | ||||||||
14805453-T-C | 12693524-T-C | *** | ||||||||
14932129-C-A | 12820194-C-A | *** | ||||||||
15129710-G-T | 13017797-G-T | *** | ||||||||
15278676-C-A | 13166765-C-A | *** | ||||||||
15455201-C-A | 13343321-C-A | *** | ||||||||
15744332-C-A | 13632452-C-A | *** | ||||||||
15906581-C-A | 13794701-C-A | *** | ||||||||
16045000-C-A | 13933120-C-A | *** | ||||||||
16065105-A-G | 13953225-A-G | *** | ||||||||
16260354-C-A | 14148474-C-A | *** | ||||||||
16324220-C-A | 14212340-C-A | *** | ||||||||
16345082-C-A | 14233202-C-A | Y96036 | *** | |||||||
16484087-CA-C | 14372207-CA-C | *** | ||||||||
16530833-C-A | 14418953-C-A | *** | ||||||||
17284744-C-A | 15172864-C-A | *** | ||||||||
17445593-C-A | 15333713-C-A | *** | ||||||||
17515235-C-A | 15403355-C-A | *** | ||||||||
17962864-C-A | 15850984-C-A | *** | ||||||||
18395244-C-A | 16283364-C-A | P6_Gap | *** | |||||||
18729006-G-T | 16617126-G-T | *** | ||||||||
19039798-C-A | 16927918-C-A | *** | ||||||||
19047349-G-T | 16935469-G-T | *** | ||||||||
19232442-C-A | 17120562-C-A | *** | ||||||||
19324039-GC-G | 17212159-GC-G | *** | ||||||||
19461753-G-T | 17349873-G-T | *** | ||||||||
19534042-A-G | 17422162-A-G | *** | ||||||||
21225154-G-A | 19063268-G-A | *** | ||||||||
21547955-C-A | 19386069-C-A | *** | ||||||||
21563640-G-A | 19401754-G-A | *** | ||||||||
21717716-C-A | 19555830-C-A | *** | ||||||||
21809477-C-A | 19647591-C-A | *** | ||||||||
21816483-C-A | 19654597-C-A | *** | ||||||||
21979319-C-A | 19817433-C-A | *** | ||||||||
22176643-C-A | 20014757-C-A | *** | ||||||||
22529507-G-T | 20367621-G-T | *** | ||||||||
22969964-C-A | 20808078-C-A | *** | ||||||||
23203731-G-T | 21041845-G-T | *** | ||||||||
23246921-C-A | 21085035-C-A | *** | ||||||||
23627397-C-A | 21465511-C-A | *** | ||||||||
23779191-C-A | 21617305-C-A | *** | ||||||||
23801966-C-G | 21640080-C-G | *** | ||||||||
23807339-G-T | 21645453-G-T | *** | ||||||||
23990612-T-C | 21844465-T-C | *** | ||||||||
24003746-G-T | 21857599-G-T | *** | ||||||||
24402874-C-A | 22256727-C-A | *** | ||||||||
28631759-C-A | 26485612-C-A | *** | ||||||||
56832750-A-G | *** | |||||||||
56834560-C-A,T | *** | |||||||||
56834568-C-CAAGCA | *** | |||||||||
9524096-TAC-T | 9686487-TAC-T | *** | ||||||||
13469978-C-A | 11314302-C-A | *** | ||||||||
4600930-C-A | 4732889-C-A | *** | ||||||||
3076069-CTTTTT-C,CTTT | 3208028-CTTTTT-C,CTTT | 25×T | *** | |||||||
3403375-G-A | 3535334-G-A | *** | ||||||||
5042212-T-C | 5174171-T-C | *** | ||||||||
5042212-TAT-T,TAC | 5174171-TAT-T,TAC | *** | ||||||||
5194770-A-G | 5326729-A-G | *** | ||||||||
7115595-G-A | 7247554-G-A | *** | ||||||||
7128140-G-A | 7260099-G-A | *** | ||||||||
9411052-G-C | 9573443-G-C | *** | ||||||||
10080226-G-A | 10242617-G-A | *** | ||||||||
13469436-C-G,T | 11313760-C-G,T | *** | ||||||||
14012911-A-T | 11892205-A-T | *** | ||||||||
14087721-T-A | 11967015-T-A | *** | ||||||||
14179416-A-G | 12058710-A-G | *** | ||||||||
22639366-G-A | 20477480-G-A | *** | ||||||||
56848954-T-C | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.