Leahy
BigY3: 207157, FTDNA: 207157, BigY2: 207157MDKA Birth: Ireland > County Tipperary 1813
Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | BigY3 207157 | FTDNA 207157 | BigY2 207157 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
28031431-G-A | 25885284-G-A | P1_Y2 | A+ | |||||||
6928381-C-CT | 7060340-C-CT | 10×T | A* | |||||||
13449475-C-A | 11293799-C-A | A* | ||||||||
56833784-T-A | A* | |||||||||
13449830-T-C | 11294154-T-C | A* | ||||||||
18532626-C-T | 16420746-C-T | P6_Dst | A* | |||||||
20736147-C-T | 18574261-C-T | P4_Prx | A* | |||||||
20851599-G-A | 18689713-G-A | P4_Dst | A* | |||||||
21551637-ATATG-A | 19389751-ATATG-A | + | ||||||||
23197251-CT-C | 21035365-CT-C | b38:8850740-C-A | 9×T | * | ||||||
4618773-C-A | 4750732-C-A | * | ||||||||
14256513-T-C | 12135807-T-C | CTS2308 | ** | |||||||
4223743-G-T | 4355702-G-T | PR271 | ** | |||||||
22749410-A-G | 20587524-A-G | PR3772 Y19614 FT74233 | ** | |||||||
7359788-T-A | 7491747-T-A | ** | ||||||||
58848126-T-A | 56742745-A-T | ** | ||||||||
14051930-C-A | 11931224-C-A | ** | ||||||||
4937675-C-T | 5069634-C-T | ** | ||||||||
5426407-TGA-T | 5558366-TGA-T | ** | ||||||||
6593634-G-A | 6725593-G-A | Y804 | ** | |||||||
23425358-C-A | 21263472-C-A | M4415 | ** | |||||||
13927885-C-A | 11807179-C-A | FT91170 | ** | |||||||
19058046-C-A | 16946166-C-A | ** | ||||||||
19014142-G-T | 16902262-G-T | FGC19159 | ** | |||||||
20994238-TA-T | 18832352-TA-T | P4_Dst | 6×AAGA | ** | ||||||
18255888-T-A | 16144008-T-A | 22×A | ** | |||||||
58848124-A-C | 56742747-T-G | ** | ||||||||
20815408-CATATATAT-C | 18653522-CATATATAT-C | P4_Gap | 22×AT | ** | ||||||
17597715-C-A | 15485835-C-A | ** | ||||||||
13936213-A-G | 11815507-A-G | ** | ||||||||
14283414-C-A | 12162708-C-A | ** | ||||||||
10754788-T-G | ** | |||||||||
10754794-C-T | ** | |||||||||
10754799-C-G | ** | |||||||||
10754809-A-T | ** | |||||||||
10754814-G-C | ** | |||||||||
10987854-C-T | ** | |||||||||
18423874-CAA-C | 16311994-CAA-C | P6_Gap | 12×A | ** | ||||||
23415343-T-TA | 21253457-T-TA | ** | ||||||||
2649800-CTCA-C | 2781759-CTCA-C | ** | ||||||||
18263476-C-A | 16151596-C-A | ** | ||||||||
10939629-C-A | ** | |||||||||
25990685-A-G | 23844538-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
13487109-G-A | 11331433-G-A | ** | ||||||||
25995072-A-T | 23848925-A-T | P1_Y1 | ** | |||||||
10952475-C-A | ** | |||||||||
18723066-C-A | 16611186-C-A | ** | ||||||||
18226116-C-A | 16114236-C-A | ** | ||||||||
7414276-T-A | 7546235-T-A | ** | ||||||||
10669417-T-TC | ** | |||||||||
28778969-A-T | 26632822-A-T | ** | ||||||||
13578388-C-A | 11422712-C-A | ** | ||||||||
2810390-GA-T | 2942349-GA-T | ** | ||||||||
26100563-G-T | 23954416-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
5426406-T-G | 5558365-T-G | ** | ||||||||
10795847-A-T | ** | |||||||||
10795855-C-CCATTGCACTA | ** | |||||||||
4049605-CTT-C | 4181564-CTT-C | 11×T | ** | |||||||
10973958-C-A | ** | |||||||||
15198632-C-A | 13086718-C-A | ** | ||||||||
20022444-T-TA | 17910564-T-TA | P5_Prx | ** | |||||||
20022453-T-TG | 17910573-T-TG | P5_Prx | ** | |||||||
23261475-A-G | 21099589-A-G | ** | ||||||||
15619532-G-GA | 13507652-G-GA | 9×A | ** | |||||||
20019186-T-TG | 17907306-T-TG | P5_Prx | ** | |||||||
14453731-G-A | 12333004-G-A | ** | ||||||||
14453734-G-A | 12333007-G-A | ** | ||||||||
14453737-G-A | 12333010-G-A | ** | ||||||||
10939591-C-T | ** | |||||||||
28618264-C-A | 26472117-C-A | ** | ||||||||
56848727-C-A | ** | |||||||||
10935574-C-A | ** | |||||||||
21482782-G-TT | 19320896-G-TT | ** | ||||||||
7099298-C-A | 7231257-C-A | ** | ||||||||
10956578-C-G | ** | |||||||||
10754744-G-GCATTTTACTC | ** | |||||||||
5969768-C-A | 6101727-C-A | ** | ||||||||
19125172-C-A | 17013292-C-A | ** | ||||||||
19732412-C-CACA | 17620532-C-CACA | P5_Prx | ** | |||||||
19720766-A-G | 17608886-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
21945386-C-A | 19783500-C-A | ** | ||||||||
7377514-C-A | 7509473-C-A | ** | ||||||||
14490358-C-A | 12369627-C-A | ** | ||||||||
23831415-C-G | 21669529-C-G | ** | ||||||||
4081622-C-A | 4213581-C-A | ** | ||||||||
17915885-C-A | 15804005-C-A | ** | ||||||||
21263475-C-A | 19101589-C-A | ** | ||||||||
28759728-C-A | 26613581-C-A | ** | ||||||||
18752087-C-A | 16640207-C-A | ** | ||||||||
28500789-G-T | 26354642-G-T | ** | ||||||||
10800313-T-A | ** | |||||||||
10653921-C-A | ** | |||||||||
11004420-C-G | ** | |||||||||
2708665-C-G | 2840624-C-G | ** | ||||||||
2758842-C-A | 2890801-C-A | 19×A | ** | |||||||
2795120-C-A | 2927079-C-A | ** | ||||||||
2833199-A-T | 2965158-A-T | ** | ||||||||
2833205-A-T | 2965164-A-T | ** | ||||||||
2854819-C-A | 2986778-C-A | ** | ||||||||
2996822-A-T | 3128781-A-T | ** | ||||||||
3051829-C-A | 3183788-C-A | ** | ||||||||
3092620-A-G | 3224579-A-G | ** | ||||||||
3275398-C-T | 3407357-C-T | ** | ||||||||
3330417-C-A | 3462376-C-A | ** | ||||||||
3854106-C-A | 3986065-C-A | ** | ||||||||
4063174-C-A | 4195133-C-A | ** | ||||||||
4229298-G-T | 4361257-G-T | ** | ||||||||
4240706-C-A | 4372665-C-A | ** | ||||||||
4371981-G-A | 4503940-G-A | ** | ||||||||
4499621-C-A | 4631580-C-A | ** | ||||||||
4580323-AT-A | 4712282-AT-A | ** | ||||||||
4616848-C-A | 4748807-C-A | ** | ||||||||
4697808-A-G | 4829767-A-G | ** | ||||||||
4888679-T-C | 5020638-T-C | ** | ||||||||
4982223-C-A | 5114182-C-A | ** | ||||||||
5022035-C-A | 5153994-C-A | ** | ||||||||
5242430-C-A | 5374389-C-A | ** | ||||||||
5336939-A-G | 5468898-A-G | ** | ||||||||
5502820-A-G | 5634779-A-G | ** | ||||||||
5817644-C-A | 5949603-C-A | ** | ||||||||
5824215-G-T | 5956174-G-T | ** | ||||||||
5833763-C-A | 5965722-C-A | ** | ||||||||
5933498-C-A | 6065457-C-A | ** | ||||||||
6147463-T-A | 6279422-T-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6191299-C-A | 6323258-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6510103-A-T | 6642062-A-T | ** | ||||||||
6510585-C-A | 6642544-C-A | ** | ||||||||
6510587-T-A | 6642546-T-A | ** | ||||||||
6510588-G-T | 6642547-G-T | ** | ||||||||
6541278-C-A | 6673237-C-A | ** | ||||||||
6700773-C-T | 6832732-C-T | ** | ||||||||
6700774-A-G | 6832733-A-G | ** | ||||||||
6700776-T-C | 6832735-T-C | ** | ||||||||
6709395-G-T | 6841354-G-T | ** | ||||||||
6732524-C-A | 6864483-C-A | ** | ||||||||
6771575-C-T | 6903534-C-T | ** | ||||||||
6771583-C-T | 6903542-C-T | ** | ||||||||
6780814-T-A | 6912773-T-A | ** | ||||||||
6827851-C-A | 6959810-C-A | ** | ||||||||
6828457-A-G | 6960416-A-G | ** | ||||||||
6953405-T-G | 7085364-T-G | ** | ||||||||
7098860-C-T | 7230819-C-T | ** | ||||||||
7099189-C-A | 7231148-C-A | ** | ||||||||
7104913-T-C | 7236872-T-C | ** | ||||||||
7135499-C-A | 7267458-C-A | ** | ||||||||
7172593-C-A | 7304552-C-A | ** | ||||||||
7174310-C-A | 7306269-C-A | ** | ||||||||
7196476-T-C | 7328435-T-C | ** | ||||||||
7199374-A-T | 7331333-A-T | ** | ||||||||
7209967-T-A | 7341926-T-A | ** | ||||||||
7256301-G-A | 7388260-G-A | FTB32633 | ** | |||||||
7258673-T-C | 7390632-T-C | ** | ||||||||
7259051-T-C | 7391010-T-C | ** | ||||||||
7340397-G-T | 7472356-G-T | ** | ||||||||
7379658-T-A | 7511617-T-A | ** | ||||||||
7390071-A-T | 7522030-A-T | ** | ||||||||
7396390-C-A | 7528349-C-A | ** | ||||||||
7425206-C-A | 7557165-C-A | ** | ||||||||
7436081-A-T | 7568040-A-T | ** | ||||||||
7603272-T-C | 7735231-T-C | ** | ||||||||
7664673-C-A | 7796632-C-A | ** | ||||||||
7702363-C-A | 7834322-C-A | ** | ||||||||
7918486-T-C | 8050445-T-C | ** | ||||||||
7990569-A-T | 8122528-A-T | ** | ||||||||
8022727-GCT-C | 8154686-GCT-C | ** | ||||||||
8170395-G-A | 8302354-G-A | Y63218 | ** | |||||||
8170404-C-T | 8302363-C-T | ** | ||||||||
8170425-AAG-A | 8302384-AAG-A | ** | ||||||||
8171813-T-C | 8303772-T-C | ** | ||||||||
8172776-C-A | 8304735-C-A | ** | ||||||||
8389595-G-TTT | 8521554-G-TTT | ** | ||||||||
8513566-C-A | 8645525-C-A | ** | ||||||||
8710023-C-A | 8841982-C-A | ** | ||||||||
8736522-G-T | 8868481-G-T | ** | ||||||||
8913292-T-A | 9045251-T-A | ** | ||||||||
9015896-G-T | 9178287-G-T | ** | ||||||||
9047483-C-A | 9209874-C-A | ** | ||||||||
9094501-A-G | 9256892-A-G | ** | ||||||||
9385081-C-A | 9547472-C-A | ** | ||||||||
9403221-C-A | 9565612-C-A | ** | ||||||||
9442124-A-G | 9604515-A-G | ** | ||||||||
9636619-T-TGC | 9799010-T-TGC | IR3_Prx | ** | |||||||
9735563-C-A | 9897954-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9735639-G-TT | 9898030-G-TT | IR3_Prx | ** | |||||||
9768467-G-T | 9930858-G-T | ** | ||||||||
9877212-A-C | 10039603-A-C | ** | ||||||||
9930645-A-T | 10093036-A-T | ** | ||||||||
9930682-G-T | 10093073-G-T | ** | ||||||||
9934618-C-T | 10097009-C-T | ** | ||||||||
9968355-G-A | 10130746-G-A | ** | ||||||||
9985963-T-C | 10148354-T-C | ** | ||||||||
9993529-G-A | 10155920-G-A | ** | ||||||||
10653994-C-A | ** | |||||||||
10654638-C-A | ** | |||||||||
10657053-T-G | ** | |||||||||
10657140-C-G | ** | |||||||||
10657148-T-G | ** | |||||||||
10658609-A-C | ** | |||||||||
10658614-A-C | ** | |||||||||
10658629-A-C | ** | |||||||||
10669374-C-T | ** | |||||||||
10683329-T-C | ** | |||||||||
10686475-TC-T | ** | |||||||||
10693911-T-C | ** | |||||||||
10754655-C-T | ** | |||||||||
10763299-T-C | ** | |||||||||
10763335-CCA-C | ** | |||||||||
10767611-C-A | ** | |||||||||
10768554-C-G | ** | |||||||||
10768566-C-A | ** | |||||||||
10768577-TG-T | ** | |||||||||
10768609-G-T | ** | |||||||||
10780125-C-A | ** | |||||||||
10791217-A-G | ** | |||||||||
10791230-C-G | ** | |||||||||
10809348-C-A | ** | |||||||||
10861098-C-A | ** | |||||||||
10870036-C-A | ** | |||||||||
10879907-A-C | ** | |||||||||
10879923-T-C | ** | |||||||||
10879935-C-G | ** | |||||||||
10885139-C-A | ** | |||||||||
10892676-G-A | ** | |||||||||
10900714-C-A | ** | |||||||||
10930595-C-A | ** | |||||||||
10935556-C-CTACTCCACTA | ** | |||||||||
10935582-C-A | ** | |||||||||
10939586-C-G | ** | |||||||||
10939611-C-T | ** | |||||||||
10939612-C-CA | ** | |||||||||
10939617-C-ACTTA | ** | |||||||||
10939636-C-T | ** | |||||||||
10956598-C-CCGGAT | ** | |||||||||
10956609-C-CACTGA | ** | |||||||||
10973959-ACTC-A | ** | |||||||||
10973964-AC-A | ** | |||||||||
10974024-T-A | ** | |||||||||
10998206-C-A | ** | |||||||||
11004366-A-G | ** | |||||||||
11004396-A-T | ** | |||||||||
11004397-T-TTACACTGCAC | ** | |||||||||
11004411-A-AATTCT | ** | |||||||||
11004425-C-CACTAA | ** | |||||||||
11004435-C-A | ** | |||||||||
11004439-C-CCGCT | ** | |||||||||
11004441-A-AG | ** | |||||||||
11013599-A-C | ** | |||||||||
13208103-C-A | 11052427-C-A | ** | ||||||||
13209381-C-A | 11053705-C-A | ** | ||||||||
13234281-A-T | 11078605-A-T | ** | ||||||||
13234340-G-T | 11078664-G-T | ** | ||||||||
13310711-C-A | 11155035-C-A | FT197485 | ** | |||||||
13469430-A-T | 11313754-A-T | ** | ||||||||
13469450-G-A | 11313774-G-A | ** | ||||||||
13469461-T-A | 11313785-T-A | ** | ||||||||
13473989-C-A | 11318313-C-A | ** | ||||||||
13487112-T-A | 11331436-T-A | ** | ||||||||
13567775-C-A | 11412099-C-A | ** | ||||||||
13582860-T-A | 11427184-T-A | ** | ||||||||
13633871-CT-C | 11478195-CT-C | ** | ||||||||
13719284-C-T | 11563608-C-T | DYZ17 | ** | |||||||
11658789-C-T | DYZ17 | ** | ||||||||
13850138-A-G | 11729432-A-G | DYZ17 | ** | |||||||
13881131-C-A | 11760425-C-A | ** | ||||||||
13919662-T-C | 11798956-T-C | ** | ||||||||
13919665-T-C | 11798959-T-C | ** | ||||||||
13938028-A-G | 11817322-A-G | ** | ||||||||
13942521-C-G | 11821815-C-G | ** | ||||||||
13946774-C-A | 11826068-C-A | ** | ||||||||
13961794-T-A | 11841088-T-A | ** | ||||||||
13973212-C-G | 11852506-C-G | ** | ||||||||
13973215-C-T | 11852509-C-T | ** | ||||||||
13973223-A-G | 11852517-A-G | ** | ||||||||
14000528-C-A | 11879822-C-A | ** | ||||||||
14032663-G-T | 11911957-G-T | ** | ||||||||
14041601-G-A | 11920895-G-A | ** | ||||||||
14085944-A-C | 11965238-A-C | ** | ||||||||
14142078-T-C | 12021372-T-C | ** | ||||||||
14152269-C-G | 12031563-C-G | ** | ||||||||
14225866-C-T | 12105160-C-T | ** | ||||||||
14241814-G-T | 12121108-G-T | ** | ||||||||
14272456-T-C | 12151750-T-C | ** | ||||||||
14286107-C-A | 12165401-C-A | FTB80889 | ** | |||||||
14296287-A-G | 12175581-A-G | ** | ||||||||
14339871-C-A | 12219166-C-A | ** | ||||||||
14354375-C-A | 12233670-C-A | ** | ||||||||
14364102-T-G | 12243397-T-G | ** | ||||||||
14367908-C-T | 12247204-C-T | ** | ||||||||
14373792-C-G | 12253088-C-G | ** | ||||||||
14373796-T-C | 12253092-T-C | ** | ||||||||
14402477-A-G | 12281774-A-G | ** | ||||||||
14425725-A-G | 12305000-A-G | ** | ||||||||
14458532-TG-T | 12337805-TG-T | ** | ||||||||
14490954-C-A | 12370223-C-A | ** | ||||||||
14548209-C-A | 12436410-C-A | ** | ||||||||
14550322-C-A | 12438523-C-A | ** | ||||||||
14552655-G-T | 12440856-G-T | ** | ||||||||
14555164-G-A | 12443365-G-A | ** | ||||||||
14564132-A-T | 12452332-A-T | ** | ||||||||
14582281-A-C | 12470481-A-C | ** | ||||||||
14689238-C-G | 12577304-C-G | FTB22734 | ** | |||||||
14694796-G-T | 12582862-G-T | ** | ||||||||
14716539-C-A | 12604607-C-A | ** | ||||||||
14771733-G-A | 12659802-G-A | ** | ||||||||
14786535-G-A | 12674605-G-A | ** | ||||||||
14786542-T-TA | 12674612-T-TA | ** | ||||||||
14786547-T-G | 12674617-T-G | ** | ||||||||
15111500-C-A | 12999587-C-A | ** | ||||||||
15167959-C-A | 13056045-C-A | ** | ||||||||
15173447-T-C | 13061533-T-C | ** | ||||||||
15288196-A-G | 13176295-A-G | ** | ||||||||
15353881-G-A | 13242000-G-A | ** | ||||||||
15391291-A-G | 13279411-A-G | ** | ||||||||
15401958-A-T | 13290078-A-T | ** | ||||||||
15462665-T-C | 13350785-T-C | ** | ||||||||
15503447-T-C | 13391567-T-C | ** | ||||||||
15536303-A-G | 13424423-A-G | ** | ||||||||
15619544-T-A | 13507664-T-A | ** | ||||||||
15619550-T-A | 13507670-T-A | ** | ||||||||
15619562-A-G | 13507682-A-G | ** | ||||||||
15748602-C-A | 13636722-C-A | ** | ||||||||
15769497-C-A | 13657617-C-A | ** | ||||||||
15776034-G-T | 13664154-G-T | Y68871 | ** | |||||||
15863244-C-A | 13751364-C-A | ** | ||||||||
15921267-T-A | 13809387-T-A | ** | ||||||||
15928570-G-C | 13816690-G-C | ** | ||||||||
15962839-G-T | 13850959-G-T | ** | ||||||||
15995561-C-A | 13883681-C-A | 7460739-G-T | AMM262 Z2932 | ** | ||||||
15997403-CT-C | 13885523-CT-C | ** | ||||||||
16018938-C-A | 13907058-C-A | ** | ||||||||
16041763-C-A | 13929883-C-A | ** | ||||||||
16050489-C-A | 13938609-C-A | ** | ||||||||
16091267-C-A | 13979387-C-A | ** | ||||||||
16184416-C-A | 14072536-C-A | ** | ||||||||
16259132-G-A | 14147252-G-A | ** | ||||||||
16316916-C-A | 14205036-C-A | ** | ||||||||
16475275-T-C | 14363395-T-C | ** | ||||||||
16498129-T-A | 14386249-T-A | ** | ||||||||
16506040-C-A | 14394160-C-A | ** | ||||||||
16575221-C-A | 14463341-C-A | ** | ||||||||
16679397-C-A | 14567517-C-A | ** | ||||||||
16679421-TTA-T | 14567541-TTA-T | ** | ||||||||
16701544-A-G | 14589664-A-G | ** | ||||||||
16708407-G-T | 14596527-G-T | ** | ||||||||
16710306-A-G | 14598426-A-G | ** | ||||||||
16723296-A-T | 14611416-A-T | ** | ||||||||
16723297-G-T | 14611417-G-T | ** | ||||||||
16786196-C-A | 14674316-C-A | ** | ||||||||
16932793-C-A | 14820913-C-A | ** | ||||||||
17048125-C-A | 14936245-C-A | ** | ||||||||
17118384-G-T | 15006504-G-T | ** | ||||||||
17127357-A-G | 15015477-A-G | ** | ||||||||
17128501-CA-C | 15016621-CA-C | ** | ||||||||
17128526-T-C | 15016646-T-C | ** | ||||||||
17139671-C-A | 15027791-C-A | ** | ||||||||
17158616-C-A | 15046736-C-A | ** | ||||||||
17187547-C-A | 15075667-C-A | ** | ||||||||
17187562-G-A | 15075682-G-A | ** | ||||||||
17251018-C-A | 15139138-C-A | ** | ||||||||
17370780-C-A | 15258900-C-A | ** | ||||||||
17478861-C-A | 15366981-C-A | ** | ||||||||
17527384-A-T | 15415504-A-T | ** | ||||||||
17539396-T-A | 15427516-T-A | ** | ||||||||
17561353-C-A | 15449473-C-A | ** | ||||||||
17572044-C-A | 15460164-C-A | ** | ||||||||
17584157-G-C | 15472277-G-C | ** | ||||||||
17584189-A-G | 15472309-A-G | ** | ||||||||
17601264-C-A | 15489384-C-A | ** | ||||||||
17634568-A-G | 15522688-A-G | ** | ||||||||
17645593-C-A | 15533713-C-A | ** | ||||||||
17717280-G-C | 15605400-G-C | ** | ||||||||
17718433-A-ATT | 15606553-A-ATT | ** | ||||||||
17737929-G-T | 15626049-G-T | ** | ||||||||
17752081-C-A | 15640201-C-A | ** | ||||||||
17929623-A-C | 15817743-A-C | ** | ||||||||
17933977-C-A | 15822097-C-A | ** | ||||||||
17946944-GA-T | 15835064-GA-T | ** | ||||||||
17997600-G-A | 15885720-G-A | P7_Gap | ** | |||||||
18059829-T-A | 15947949-T-A | ** | ||||||||
18088399-C-A | 15976519-C-A | ** | ||||||||
18100845-T-C | 15988965-T-C | ** | ||||||||
18174846-C-A | 16062966-C-A | ** | ||||||||
18187599-C-A | 16075719-C-A | ** | ||||||||
18189595-C-A | 16077715-C-A | ** | ||||||||
18243856-A-G | 16131976-A-G | ** | ||||||||
18297648-C-A | 16185768-C-A | P6_Prx | ** | |||||||
18645943-G-T | 16534063-G-T | ** | ||||||||
18688521-C-CAA | 16576641-C-CAA | ** | ||||||||
18753110-G-T | 16641230-G-T | ** | ||||||||
18826644-C-A | 16714764-C-A | ** | ||||||||
18869834-A-G | 16757954-A-G | ** | ||||||||
18949834-C-A | 16837954-C-A | ** | ||||||||
18965946-A-G | 16854066-A-G | ** | ||||||||
18966143-C-A | 16854263-C-A | ** | ||||||||
18968716-C-T | 16856836-C-T | ** | ||||||||
18972147-G-A | 16860267-G-A | ZS10056 | ** | |||||||
18976681-C-A | 16864801-C-A | ** | ||||||||
19040724-C-A | 16928844-C-A | PR2953 | ** | |||||||
19087976-C-A | 16976096-C-A | ** | ||||||||
19138725-G-A | 17026845-G-A | ** | ||||||||
19206620-T-C | 17094740-T-C | ** | ||||||||
19235807-C-A | 17123927-C-A | ** | ||||||||
19241506-C-A | 17129626-C-A | ** | ||||||||
19312343-T-C | 17200463-T-C | ** | ||||||||
19330101-G-T | 17218221-G-T | ** | ||||||||
19410188-C-A | 17298308-C-A | ** | ||||||||
19520811-C-A | 17408931-C-A | ** | ||||||||
19531321-G-T | 17419441-G-T | ** | ||||||||
19547759-G-A | 17435879-G-A | ** | ||||||||
19563192-T-G | 17451312-T-G | FT25059 | ** | |||||||
19563280-T-A | 17451400-T-A | ** | ||||||||
19663429-A-G | 17551549-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
19844961-C-A | 17733081-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19992317-T-C | 17880437-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
20497379-T-TTTCG | 18335493-T-TTTCG | P5_Dst | ** | |||||||
20501867-G-GA | 18339981-G-GA | P5_Dst | ** | |||||||
20825659-C-A | 18663773-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
20865597-G-T | 18703711-G-T | P4_Dst | ** | |||||||
21070029-A-G | 18908143-A-G | ** | ||||||||
21081977-C-A | 18920091-C-A | ** | ||||||||
21082140-C-A | 18920254-C-A | ** | ||||||||
21122759-A-G | 18960873-A-G | ** | ||||||||
21238219-C-CA | 19076333-C-CA | ** | ||||||||
21267613-C-A | 19105727-C-A | ** | ||||||||
21299419-C-A | 19137533-C-A | ** | ||||||||
21308876-C-A | 19146990-C-A | ** | ||||||||
21317746-C-A | 19155860-C-A | ** | ||||||||
21334069-T-A | 19172183-T-A | ** | ||||||||
21387223-T-G | 19225337-T-G | ** | ||||||||
21392753-A-T | 19230867-A-T | ** | ||||||||
21447882-A-G | 19285996-A-G | ** | ||||||||
21700383-A-T | 19538497-A-T | ** | ||||||||
21815296-C-A | 19653410-C-A | ** | ||||||||
21852546-C-A | 19690660-C-A | ** | ||||||||
21939511-T-C | 19777625-T-C | ** | ||||||||
21947186-T-A | 19785300-T-A | ** | ||||||||
22037578-A-G | 19875692-A-G | ** | ||||||||
22078089-C-A | 19916203-C-A | ** | ||||||||
22191774-T-C | 20029888-T-C | ** | ||||||||
22204157-C-A | 20042271-C-A | BY138444 | ** | |||||||
22241459-A-G | 20079573-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
22241463-T-G | 20079577-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
22300809-T-G | 20138923-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
22309974-G-A | 20148088-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
22527152-A-G | 20365266-A-G | ** | ||||||||
22587844-C-T | 20425958-C-T | ** | ||||||||
22587858-A-G | 20425972-A-G | ** | ||||||||
22587859-G-C | 20425973-G-C | ** | ||||||||
22739642-C-A | 20577756-C-A | ** | ||||||||
22809032-G-T | 20647146-G-T | ** | ||||||||
22875922-C-A | 20714036-C-A | ** | ||||||||
22914479-C-A | 20752593-C-A | ** | ||||||||
22965384-A-C | 20803498-A-C | ** | ||||||||
22965401-A-T | 20803515-A-T | ** | ||||||||
22974115-G-T | 20812229-G-T | ** | ||||||||
23005369-G-A | 20843483-G-A | ** | ||||||||
23066102-A-G | 20904216-A-G | ** | ||||||||
23120071-T-C | 20958185-T-C | ** | ||||||||
23142477-C-A | 20980591-C-A | ** | ||||||||
23186202-C-A | 21024316-C-A | ** | ||||||||
23261490-T-G | 21099604-T-G | ** | ||||||||
23310553-A-T | 21148667-A-T | ** | ||||||||
23442698-A-G | 21280812-A-G | ** | ||||||||
23603079-G-A | 21441193-G-A | ** | ||||||||
23603152-T-A | 21441266-T-A | ** | ||||||||
23623186-G-T | 21461300-G-T | ** | ||||||||
23808758-G-T | 21646872-G-T | ** | ||||||||
23831392-C-A | 21669506-C-A | ** | ||||||||
23831416-C-A | 21669530-C-A | ** | ||||||||
23831443-A-G | 21669557-A-G | F26436 | ** | |||||||
21751657-T-G | ** | |||||||||
23954221-C-G | 21808074-C-G | ** | ||||||||
24127621-TA-T | 21981474-TA-T | P3_b1 | 9×A | ** | ||||||
24244511-A-G | 22098364-A-G | P3_b1 | ** | |||||||
24363959-G-T | 22217812-G-T | ** | ||||||||
24416924-C-G | 22270777-C-G | ** | ||||||||
24416947-A-G | 22270800-A-G | ** | ||||||||
24518494-G-C | 22372347-G-C | ** | ||||||||
24518495-T-G | 22372348-T-G | ** | ||||||||
24518508-C-A | 22372361-C-A | ** | ||||||||
25246373-T-C | 23100226-T-C | P2_r1 | ** | |||||||
25883631-T-C | 23737484-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26047577-A-T | 23901430-A-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26078792-G-C | 23932645-G-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26117878-A-C | 23971731-A-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26122102-G-T | 23975955-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26170507-GA-G | 24024360-GA-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26325909-C-A | 24179762-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26454936-A-C | 24308789-A-C | P1_Y1 | ** | |||||||
27596084-C-A | 25449937-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27856422-T-C | 25710275-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
27864385-T-TC | 25718238-T-TC | P1_Y2 | ** | |||||||
28019222-C-A | 25873075-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28468882-C-A | 26322735-C-A | ** | ||||||||
28478402-C-A | 26332255-C-A | ** | ||||||||
28531985-C-A | 26385838-C-A | ** | ||||||||
28532760-C-A | 26386613-C-A | ** | ||||||||
28544506-C-A | 26398359-C-A | ** | ||||||||
28621945-G-T | 26475798-G-T | ** | ||||||||
28653945-C-A | 26507798-C-A | ** | ||||||||
28722601-T-C | 26576454-T-C | ** | ||||||||
28724845-C-G | 26578698-C-G | ** | ||||||||
28767168-G-A | 26621021-G-A | ** | ||||||||
28780946-T-C | 26634799-T-C | ** | ||||||||
28798948-T-G | 26652801-T-G | ** | ||||||||
56842261-G-T | ** | |||||||||
56846419-G-A | ** | |||||||||
56848684-G-T | ** | |||||||||
56848699-G-A | ** | |||||||||
56848706-G-A | ** | |||||||||
56848711-A-T | ** | |||||||||
56848715-C-A | ** | |||||||||
56848716-T-C | ** | |||||||||
56848734-G-C | ** | |||||||||
7038-A-T | ** | |||||||||
56707277-T-A | ** | |||||||||
7280952-CTTTTTT-C | 7412911-CTTTTTT-C | 26×T | ** | |||||||
26228738-C-A | 24082591-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
19737755-T-A | 17625875-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
3204223-G-T | 3336182-G-T | ** | ||||||||
8062888-T-C | 8194847-T-C | ** | ||||||||
13706298-A-T | 11550622-A-T | DYZ17 | ** | |||||||
15141372-C-T | 13029459-C-T | ** | ||||||||
16118955-A-G | 14007075-A-G | P8_Prx | ** | |||||||
16214833-C-T | 14102953-C-T | ** | ||||||||
18465594-C-T | 16353714-C-T | P6_Dst | ** | |||||||
19700240-TC-T | 17588360-TC-T | P5_Prx | ** | |||||||
19737715-C-G | 17625835-C-G | P5_Prx | ** | |||||||
19737743-A-C | 17625863-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
19737744-T-A | 17625864-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19737761-T-C | 17625881-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
19737762-G-C | 17625882-G-C | P5_Prx | ** | |||||||
19811404-T-A | 17699524-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19895380-A-G | 17783500-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
20216066-TA-T | 18054180-TA-T | P5_Dst | ** | |||||||
22983891-A-G | 20822005-A-G | ** | ||||||||
24245102-G-T | 22098955-G-T | P3_b1 | ** | |||||||
25918736-AT-A | 23772589-AT-A | P1_Y1 | 9×T | ** | ||||||
26073063-T-TGC | 23926916-T-TGC | P1_Y1 | ** | |||||||
56742774-A-G | ** | |||||||||
13838787-C-G | 11718081-C-G | DYZ17 | *** | |||||||
13695656-G-C | 11539980-G-C | DYZ17 | *** | |||||||
13466795-G-T | 11311119-G-T | *** | ||||||||
13853758-G-T | 11733052-G-T | DYZ17 | *** | |||||||
13869234-A-C,T | 11748528-A-C,T | DYZ17 | *** | |||||||
20019795-C-A | 17907915-C-A | P5_Prx | *** | |||||||
25200867-G-GAC | 23054720-G-GAC | g1 | *** | |||||||
26153979-G-A | 24007832-G-A | P1_Y1 | *** | |||||||
4123990-C-A | 4255949-C-A | *** | ||||||||
22479605-C-A | 20317719-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
9722500-GAA-G | 9884891-GAA-G | IR3_Prx | 18×A | *** | ||||||
6634259-G-GTT | 6766218-G-GTT | 15×T | *** | |||||||
2840091-T-C | 2972050-T-C | *** | ||||||||
13489399-G-A | 11333723-G-A | *** | ||||||||
13489416-G-C | 11333740-G-C | *** | ||||||||
56837439-G-T | *** | |||||||||
56833292-A-G | *** | |||||||||
16908449-T-A | 14796569-T-A | *** | ||||||||
6120234-CAT-C,CATAT | 6252193-CAT-C,CATAT | 14×AT | *** | |||||||
22164547-CAAAAAA-C | 20002661-CAAAAAA-C | 19×A | *** | |||||||
16679404-ATTTTT-A | 14567524-ATTTTT-A | 18×T | *** | |||||||
16640336-C-A | 14528456-C-A | *** | ||||||||
3131062-C-A | 3263021-C-A | *** | ||||||||
24430245-C-A | 22284098-C-A | *** | ||||||||
3051728-A-G | 3183687-A-G | *** | ||||||||
5586506-G-A | 5718465-G-A | *** | ||||||||
5708606-C-A | 5840565-C-A | *** | ||||||||
7184802-C-A | 7316761-C-A | *** | ||||||||
7188551-A-G | 7320510-A-G | *** | ||||||||
7240123-C-A | 7372082-C-A | *** | ||||||||
7781686-G-A | 7913645-G-A | *** | ||||||||
8085246-C-A | 8217205-C-A | *** | ||||||||
8104917-G-T | 8236876-G-T | *** | ||||||||
8341844-C-A | 8473803-C-A | *** | ||||||||
8351796-C-A | 8483755-C-A | *** | ||||||||
8462062-TGC-T | 8594021-TGC-T | *** | ||||||||
10673943-CACCC-C,CACACGGTTT | *** | |||||||||
10691179-C-A | *** | |||||||||
10776358-A-AT | *** | |||||||||
10874490-C-A | *** | |||||||||
11009320-C-A | *** | |||||||||
13467819-T-A | 11312143-T-A | *** | ||||||||
13487894-C-A | 11332218-C-A | *** | ||||||||
13489491-G-A,T | 11333815-G-A,T | *** | ||||||||
11643165-A-G | DYZ17 | *** | ||||||||
14071463-A-T | 11950757-A-T | *** | ||||||||
14316186-CTTT-C,CTT | 12195480-CTTT-C,CTT | 14×T | *** | |||||||
14522145-C-A | 12410346-C-A | *** | ||||||||
12786501-CTT-C,CTTT | 16×T | *** | ||||||||
15489526-A-G | 13377646-A-G | *** | ||||||||
15586327-C-A | 13474447-C-A | *** | ||||||||
16170307-T-C | 14058427-T-C | *** | ||||||||
17019603-C-A | 14907723-C-A | *** | ||||||||
17141708-T-C | 15029828-T-C | *** | ||||||||
17500703-G-A | 15388823-G-A | *** | ||||||||
17794085-C-A | 15682205-C-A | *** | ||||||||
17904081-C-CTT | 15792201-C-CTT | 12×T | *** | |||||||
18019854-TG-T | 15907974-TG-T | *** | ||||||||
18890578-A-G | 16778698-A-G | *** | ||||||||
19048902-C-A | 16937022-C-A | *** | ||||||||
19048911-C-A | 16937031-C-A | *** | ||||||||
19048913-G-A | 16937033-G-A | *** | ||||||||
19050368-A-T | 16938488-A-T | *** | ||||||||
19107521-C-A | 16995641-C-A | *** | ||||||||
19244504-C-A | 17132624-C-A | *** | ||||||||
19547798-C-A | 17435918-C-A | *** | ||||||||
22068363-C-A | 19906477-C-A | *** | ||||||||
22307300-T-C | 20145414-T-C | DYZ19 | *** | |||||||
23272284-G-T | 21110398-G-T | *** | ||||||||
23697494-C-A | 21535608-C-A | *** | ||||||||
23827529-C-A | 21665643-C-A | *** | ||||||||
24378380-C-A | 22232233-C-A | *** | ||||||||
56836671-C-A | *** | |||||||||
56837427-T-C | *** | |||||||||
56837432-T-A | *** | |||||||||
56846402-C-T | *** | |||||||||
56846404-G-A | *** | |||||||||
56846407-G-C | *** | |||||||||
3800092-AACAC-A,AAC | 3932051-AACAC-A,AAC | 17×AC | *** | |||||||
8568465-G-GTT | 8700424-G-GTT | 22×T | *** | |||||||
24423236-G-T | 22277089-G-T | *** | ||||||||
56830557-TTC-T | *** | |||||||||
28370013-TATAG-T,TAG | 26223866-TATAG-T,TAG | P1_gr2 | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.