Canady
FTDNA: N16254, BigY2: N16254, BigY3: N16254Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA N16254 | BigY2 N16254 | BigY3 N16254 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
20562663-A-G | 18400777-A-G | P5_Dst | A* | ||||||||
20869214-G-T | 18707328-G-T | P4_Dst | A* | ||||||||
3955890-T-A | 4087849-T-A | FT81281 | + | ||||||||
4301119-T-C | 4433078-T-C | FT81347 | + | ||||||||
5634350-G-A | 5766309-G-A | FT81574 | + | ||||||||
14124119-C-T | 12003413-C-T | FT81877 | Y | Y | + | ||||||
21477220-C-CTTA | 19315334-C-CTTA | 8×TTCTTA | * | ||||||||
16757087-C-T | 14645207-C-T | CTS6238 | ** | ||||||||
5824668-C-A | 5956627-C-A | Z2059 | ** | ||||||||
22369119-G-T | 20207233-G-T | DYZ19 | ** | ||||||||
13885894-A-G | 11765188-A-G | ** | |||||||||
21726157-C-T | 19564271-C-T | BY59683 | BY135019 | ** | |||||||
14656154-C-CAA | 12544219-C-CAA | 24×A | ** | ||||||||
14658043-G-T | 12546108-G-T | ** | |||||||||
15818488-G-A | 13706608-G-A | A1290 | Y11025 PH1831 | ** | |||||||
2763689-T-C | 2895648-T-C | 12795839-A-G | Y8710 Z19815 | ** | |||||||
7028302-G-A | 7160261-G-A | ** | |||||||||
10046088-TAC-T | 10208479-TAC-T | ** | |||||||||
23392984-C-A | 21231098-C-A | ** | |||||||||
23598024-C-A | 21436138-C-A | FT315029 | ** | ||||||||
21261823-C-T | 19099937-C-T | ** | |||||||||
18078072-C-A | 15966192-C-A | BY119777 | ** | ||||||||
22301139-A-C | 20139253-A-C | DYZ19 | ** | ||||||||
6753433-A-G | 6885392-A-G | FGC17551 | M7585 ZS7266 | ** | |||||||
26133799-T-C | 23987652-T-C | P1_Y1 | ** | ||||||||
10661660-A-T | ** | ||||||||||
21261826-TAAAA-T | 19099940-TAAAA-T | 26×A | ** | ||||||||
20666087-T-TG | 18504201-T-TG | P4_Prx | ** | ||||||||
7617708-C-A | 7749667-C-A | ** | |||||||||
2740538-G-T | 2872497-G-T | ** | |||||||||
10776510-T-A | ** | ||||||||||
15769522-C-A | 13657642-C-A | ** | |||||||||
6293385-T-G | 6425344-T-G | IR3_Dst | ** | ||||||||
18772456-C-A | 16660576-C-A | ** | |||||||||
10661654-C-T | ** | ||||||||||
8498355-G-A | 8630314-G-A | ** | |||||||||
17811111-C-A | 15699231-C-A | ** | |||||||||
14282535-C-A | 12161829-C-A | ** | |||||||||
21904585-C-A | 19742699-C-A | ** | |||||||||
5021965-C-A | 5153924-C-A | ** | |||||||||
10654088-C-A | ** | ||||||||||
21532559-C-A | 19370673-C-A | ** | |||||||||
2722005-G-C | 2853964-G-C | ** | |||||||||
8181461-C-T | 8313420-C-T | ** | |||||||||
22173949-C-A | 20012063-C-A | ** | |||||||||
16905849-T-G | 14793969-T-G | ** | |||||||||
8181447-G-A | 8313406-G-A | ** | |||||||||
21827606-CAAAAAA-C | 19665720-CAAAAAA-C | 21×A | ** | ||||||||
23232232-C-A | 21070346-C-A | ** | |||||||||
10859415-A-C | ** | ||||||||||
10662372-T-A | ** | ||||||||||
15843169-A-G | 13731289-A-G | ** | |||||||||
15843178-G-A | 13731298-G-A | ** | |||||||||
15843181-T-C | 13731301-T-C | ** | |||||||||
26415674-CT-C | 24269527-CT-C | P1_Y1 | ** | ||||||||
17030974-G-A | 14919094-G-A | ** | |||||||||
19345342-C-A | 17233462-C-A | ** | |||||||||
11658817-C-A | DYZ17 | ** | |||||||||
22849516-C-A | 20687630-C-A | ** | |||||||||
10926530-C-T | ** | ||||||||||
16757089-G-T | 14645209-G-T | ** | |||||||||
10792741-T-G | ** | ||||||||||
10792761-T-A | ** | ||||||||||
10792769-A-G | ** | ||||||||||
13642945-C-A | 11487269-C-A | ** | |||||||||
20865354-C-CCGCA | 18703468-C-CCGCA | P4_Dst | 18×CA | ** | |||||||
21326555-G-A | 19164669-G-A | ** | |||||||||
21697091-C-T | 19535205-C-T | ** | |||||||||
14900760-G-T | 12788827-G-T | ** | |||||||||
17361057-TCA-T | 15249177-TCA-T | ** | |||||||||
10885001-C-A | ** | ||||||||||
5220942-C-A | 5352901-C-A | ** | |||||||||
6793531-C-A | 6925490-C-A | ** | |||||||||
6365086-C-A | 6497045-C-A | Y38227 | ** | ||||||||
2740558-G-T | 2872517-G-T | ** | |||||||||
10866222-C-A | ** | ||||||||||
16666321-C-A | 14554441-C-A | BY109318 | ** | ||||||||
10962614-A-T | ** | ||||||||||
25376566-A-T | 23230419-A-T | P2_r2 | ** | ||||||||
11031447-T-G | ** | ||||||||||
10809329-ATTC-A | ** | ||||||||||
15669946-T-G | 13558066-T-G | ** | |||||||||
17330306-A-T | 15218426-A-T | ** | |||||||||
13487836-A-G | 11332160-A-G | ** | |||||||||
18222770-C-A | 16110890-C-A | ** | |||||||||
10662366-T-C | ** | ||||||||||
10662378-C-T | ** | ||||||||||
10662405-C-A | ** | ||||||||||
4425548-C-A | 4557507-C-A | ** | |||||||||
7475620-A-G | 7607579-A-G | IR1_L | ** | ||||||||
10672081-G-T | ** | ||||||||||
10967560-T-C | ** | ||||||||||
10967562-C-G | ** | ||||||||||
24469713-T-C | 22323566-T-C | ** | |||||||||
18769361-C-A | 16657481-C-A | ** | |||||||||
8270784-C-A | 8402743-C-A | ** | |||||||||
19275207-T-TAC | 17163327-T-TAC | ** | |||||||||
13218432-C-A | 11062756-C-A | ** | |||||||||
21235204-A-G | 19073318-A-G | ** | |||||||||
14900687-T-C | 12788754-T-C | ** | |||||||||
7086882-C-A | 7218841-C-A | ** | |||||||||
14184620-T-C | 12063914-T-C | ** | |||||||||
22147420-C-A | 19985534-C-A | ** | |||||||||
7386043-C-A | 7518002-C-A | ** | |||||||||
17592374-C-T | 15480494-C-T | ** | |||||||||
19861278-A-AG | 17749398-A-AG | P5_Prx | ** | ||||||||
2696379-A-G | 2828338-A-G | ** | |||||||||
3016508-C-A | 3148467-C-A | ** | |||||||||
6739948-T-C | 6871907-T-C | ** | |||||||||
6739955-G-A | 6871914-G-A | ** | |||||||||
20332029-G-A | 18170143-G-A | P5_Dst | ** | ||||||||
22613296-C-A | 20451410-C-A | ** | |||||||||
23188877-C-A | 21026991-C-A | ** | |||||||||
19721224-T-C | 17609344-T-C | P5_Prx | ** | ||||||||
13212367-C-A | 11056691-C-A | ** | |||||||||
14604709-C-A | 12492911-C-A | ** | |||||||||
13226629-C-A | 11070953-C-A | ** | |||||||||
21091049-A-C | 18929163-A-C | ** | |||||||||
13471998-C-T | 11316322-C-T | ** | |||||||||
8981598-C-A | 9143989-C-A | ** | |||||||||
9639135-C-T | 9801526-C-T | IR3_Prx | ** | ||||||||
10883921-C-T | ** | ||||||||||
10845690-C-G | ** | ||||||||||
10745775-C-A | FT429361 | ** | |||||||||
7705585-C-A | 7837544-C-A | ** | |||||||||
18953067-G-A | 16841187-G-A | ** | |||||||||
15438920-A-T | 13327040-A-T | ** | |||||||||
21911957-C-A | 19750071-C-A | ** | |||||||||
8293971-T-A | 8425930-T-A | ** | |||||||||
15865916-C-A | 13754036-C-A | ** | |||||||||
17028969-C-A | 14917089-C-A | ** | |||||||||
7922711-C-A | 8054670-C-A | ** | |||||||||
10669473-C-G | ** | ||||||||||
2689646-C-T | 2821605-C-T | ** | |||||||||
2689652-T-C | 2821611-T-C | ** | |||||||||
2689662-T-C | 2821621-T-C | ** | |||||||||
2689663-A-C | 2821622-A-C | ** | |||||||||
2689664-G-A | 2821623-G-A | ** | |||||||||
2721997-C-T | 2853956-C-T | ** | |||||||||
2721998-C-T | 2853957-C-T | ** | |||||||||
2722011-T-C | 2853970-T-C | ** | |||||||||
2752409-C-A | 2884368-C-A | ** | |||||||||
2813583-C-A | 2945542-C-A | ** | |||||||||
2820088-T-A | 2952047-T-A | ** | |||||||||
2833193-T-C | 2965152-T-C | ** | |||||||||
2841243-C-A | 2973202-C-A | ** | |||||||||
2907183-A-G | 3039142-A-G | ** | |||||||||
3011732-A-G | 3143691-A-G | ** | |||||||||
3011737-A-G | 3143696-A-G | ** | |||||||||
3074668-C-A | 3206627-C-A | ** | |||||||||
3251443-C-A | 3383402-C-A | ** | |||||||||
3546437-C-A | 3678396-C-A | ** | |||||||||
3606892-C-A | 3738851-C-A | ** | |||||||||
3712277-G-A | 3844236-G-A | ** | |||||||||
3712278-C-T | 3844237-C-T | ** | |||||||||
3712297-T-C | 3844256-T-C | ** | |||||||||
4160049-A-G | 4292008-A-G | ** | |||||||||
4357784-AT-A | 4489743-AT-A | ** | |||||||||
4461090-C-A | 4593049-C-A | ** | |||||||||
4470176-T-C | 4602135-T-C | ** | |||||||||
4585655-C-A | 4717614-C-A | ** | |||||||||
4687627-A-G | 4819586-A-G | ** | |||||||||
4687639-T-C | 4819598-T-C | ** | |||||||||
4703491-C-A | 4835450-C-A | ** | |||||||||
4740566-G-A | 4872525-G-A | 9×A | ** | ||||||||
4740576-T-A | 4872535-T-A | ** | |||||||||
4740581-G-A | 4872540-G-A | ** | |||||||||
4740588-T-C | 4872547-T-C | BY58288 | ** | ||||||||
5021957-C-A | 5153916-C-A | ** | |||||||||
5303380-A-G | 5435339-A-G | ** | |||||||||
5309150-G-T | 5441109-G-T | ** | |||||||||
5426329-T-A | 5558288-T-A | ** | |||||||||
5782081-G-A | 5914040-G-A | ** | |||||||||
5785701-CAAAA-C | 5917660-CAAAA-C | 14×A | ** | ||||||||
5851859-T-C | 5983818-T-C | ** | |||||||||
5874137-C-A | 6006096-C-A | ** | |||||||||
5888026-C-A | 6019985-C-A | ** | |||||||||
5911815-A-G | 6043774-A-G | ** | |||||||||
5935748-A-G | 6067707-A-G | ** | |||||||||
6130579-T-A | 6262538-T-A | ** | |||||||||
6131059-C-T | 6263018-C-T | ** | |||||||||
6142894-A-C | 6274853-A-C | IR3_Dst | ** | ||||||||
6242140-T-G | 6374099-T-G | IR3_Dst | ** | ||||||||
6293360-TTTG-T | 6425319-TTTG-T | IR3_Dst | ** | ||||||||
6390897-C-A | 6522856-C-A | ** | |||||||||
6400984-G-T | 6532943-G-T | ** | |||||||||
6479040-C-A | 6610999-C-A | ** | |||||||||
6516240-C-A | 6648199-C-A | ** | |||||||||
6736312-G-A | 6868271-G-A | ** | |||||||||
6764674-C-A | 6896633-C-A | ** | |||||||||
6831516-C-A | 6963475-C-A | ** | |||||||||
6915855-C-A | 7047814-C-A | ** | |||||||||
6922332-C-A | 7054291-C-A | ** | |||||||||
6930920-C-A | 7062879-C-A | ** | |||||||||
6947343-C-A | 7079302-C-A | ** | |||||||||
6975909-C-G | 7107868-C-G | ** | |||||||||
6979751-C-A | 7111710-C-A | ** | |||||||||
6992713-C-A | 7124672-C-A | ** | |||||||||
7021926-C-G | 7153885-C-G | ** | |||||||||
7021936-T-C | 7153895-T-C | ** | |||||||||
7021951-T-C | 7153910-T-C | ** | |||||||||
7021952-G-T | 7153911-G-T | ** | |||||||||
7021955-T-C | 7153914-T-C | ** | |||||||||
7021956-G-A | 7153915-G-A | ** | |||||||||
7021960-T-C | 7153919-T-C | ** | |||||||||
7021962-A-G | 7153921-A-G | ** | |||||||||
7021963-A-C | 7153922-A-C | FGC64355 | ** | ||||||||
7046634-C-T | 7178593-C-T | ** | |||||||||
7048346-T-C | 7180305-T-C | ** | |||||||||
7053050-C-A | 7185009-C-A | ** | |||||||||
7073137-A-G | 7205096-A-G | ** | |||||||||
7073150-C-A | 7205109-C-A | ** | |||||||||
7190000-A-C | 7321959-A-C | ** | |||||||||
7287487-C-A | 7419446-C-A | ** | |||||||||
7304514-G-A | 7436473-G-A | ** | |||||||||
7305117-T-G | 7437076-T-G | ** | |||||||||
7305122-T-G | 7437081-T-G | ** | |||||||||
7305134-A-G | 7437093-A-G | ** | |||||||||
7311663-C-A | 7443622-C-A | ** | |||||||||
7312087-C-A | 7444046-C-A | ** | |||||||||
7315711-C-A | 7447670-C-A | ** | |||||||||
7322035-C-A | 7453994-C-A | ** | |||||||||
7382533-C-A | 7514492-C-A | ** | |||||||||
7468153-A-G | 7600112-A-G | IR1_L | ** | ||||||||
7506826-C-T | 7638785-C-T | IR1_L | ** | ||||||||
7527605-C-T | 7659564-C-T | ** | |||||||||
7593608-C-A | 7725567-C-A | ** | |||||||||
7637791-C-A | 7769750-C-A | ** | |||||||||
7664051-CT-C | 7796010-CT-C | ** | |||||||||
7705529-A-T | 7837488-A-T | ** | |||||||||
7724699-A-T | 7856658-A-T | ** | |||||||||
7767599-A-T | 7899558-A-T | ** | |||||||||
7825009-T-C | 7956968-T-C | ** | |||||||||
7852450-C-A | 7984409-C-A | ** | |||||||||
7858350-T-A | 7990309-T-A | ** | |||||||||
7904851-C-A | 8036810-C-A | BY178191 | ** | ||||||||
7938164-A-G | 8070123-A-G | ** | |||||||||
7938201-C-A | 8070160-C-A | ** | |||||||||
7997924-T-C | 8129883-T-C | ** | |||||||||
8090720-CATGCTCATGGA-C | 8222679-CATGCTCATGGA-C | ** | |||||||||
8172104-C-A | 8304063-C-A | ** | |||||||||
8172545-T-C | 8304504-T-C | ** | |||||||||
8217735-C-A | 8349694-C-A | ** | |||||||||
8273706-C-A | 8405665-C-A | ** | |||||||||
8293958-T-A | 8425917-T-A | ** | |||||||||
8293964-T-A | 8425923-T-A | ** | |||||||||
8326515-C-A | 8458474-C-A | ** | |||||||||
8350892-T-C | 8482851-T-C | ** | |||||||||
8379730-C-A | 8511689-C-A | ** | |||||||||
8431704-C-A | 8563663-C-A | ** | |||||||||
8433943-T-C | 8565902-T-C | ** | |||||||||
8589700-C-A | 8721659-C-A | ** | |||||||||
8592856-C-A | 8724815-C-A | ** | |||||||||
8631406-TTTTG-T | 8763365-TTTTG-T | ** | |||||||||
8690242-C-A | 8822201-C-A | ** | |||||||||
8711699-C-A | 8843658-C-A | ** | |||||||||
8718889-C-A | 8850848-C-A | ** | |||||||||
8860250-C-A | 8992209-C-A | ** | |||||||||
9124988-G-T | ** | ||||||||||
9126656-G-T | ** | ||||||||||
8977120-G-T | 9139511-G-T | ** | |||||||||
9090726-C-A | 9253117-C-A | ** | |||||||||
9174898-C-A | 9337289-C-A | ** | |||||||||
9319254-C-T | 9481645-C-T | ** | |||||||||
9401819-C-G | 9564210-C-G | ** | |||||||||
9401832-T-C | 9564223-T-C | ** | |||||||||
9401840-G-C | 9564231-G-C | ** | |||||||||
9401842-T-C | 9564233-T-C | FT228747 | ** | ||||||||
9401843-G-A | 9564234-G-A | ** | |||||||||
9418899-C-A | 9581290-C-A | ** | |||||||||
9708083-C-A | 9870474-C-A | IR3_Prx | ** | ||||||||
9770631-C-A | 9933022-C-A | ** | |||||||||
9774891-A-AT | 9937282-A-AT | ** | |||||||||
9774902-T-A | 9937293-T-A | ** | |||||||||
9774905-G-A | 9937296-G-A | ** | |||||||||
9774909-C-G | 9937300-C-G | ** | |||||||||
9774915-A-G | 9937306-A-G | ** | |||||||||
9774923-G-C | 9937314-G-C | ** | |||||||||
9774931-C-G | 9937322-C-G | ** | |||||||||
9830990-T-C | 9993381-T-C | ** | |||||||||
9836893-T-G | 9999284-T-G | ** | |||||||||
9836898-T-G | 9999289-T-G | ** | |||||||||
9836903-T-G | 9999294-T-G | ** | |||||||||
9890947-G-A | 10053338-G-A | ** | |||||||||
9900354-T-C | 10062745-T-C | ** | |||||||||
9973878-T-A | 10136269-T-A | ** | |||||||||
9979334-G-T | 10141725-G-T | ** | |||||||||
10009520-C-A | 10171911-C-A | FT376176 | ** | ||||||||
10029296-T-C | 10191687-T-C | ** | |||||||||
10059780-T-C | 10222171-T-C | ** | |||||||||
10658593-C-T | ** | ||||||||||
10659615-C-A | ** | ||||||||||
10673945-C-A | ** | ||||||||||
10745721-T-A | ** | ||||||||||
10745729-C-T | ** | ||||||||||
10745735-G-A | ** | ||||||||||
10745769-C-T | ** | ||||||||||
10780993-C-A | ** | ||||||||||
10794268-C-A | ** | ||||||||||
10801662-C-CAATGCACTCGCGTGG | ** | ||||||||||
10801703-A-ATTCTG | ** | ||||||||||
10801738-A-G | ** | ||||||||||
10803090-C-A | ** | ||||||||||
10821729-C-T | ** | ||||||||||
10821991-C-A | ** | ||||||||||
10824250-T-G | ** | ||||||||||
10852739-C-A | ** | ||||||||||
10859405-A-T | ** | ||||||||||
10859409-T-C | ** | ||||||||||
10869961-C-T | ** | ||||||||||
10878290-A-T | ** | ||||||||||
10883862-C-A | ** | ||||||||||
10883869-T-C | ** | ||||||||||
10883894-TC-T | ** | ||||||||||
10883910-T-G | ** | ||||||||||
10893724-A-C | ** | ||||||||||
10959372-T-C | ** | ||||||||||
10979549-A-G | ** | ||||||||||
11031479-A-T | ** | ||||||||||
13194913-G-T | 11039237-G-T | ** | |||||||||
13212381-C-A | 11056705-C-A | ** | |||||||||
13212410-C-A | 11056734-C-A | ** | |||||||||
13212528-G-T | 11056852-G-T | ** | |||||||||
13255622-C-A | 11099946-C-A | ** | |||||||||
13267795-G-T | 11112119-G-T | ** | |||||||||
13479685-G-T | 11324009-G-T | ** | |||||||||
13484964-A-G | 11329288-A-G | ** | |||||||||
13542878-T-C | 11387202-T-C | ** | |||||||||
13542879-G-A | 11387203-G-A | ** | |||||||||
13671343-C-A | 11515667-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11653406-G-T | DYZ17 | ** | |||||||||
13817987-G-T | 11697281-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
13837409-C-A | 11716703-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
13874559-C-A | 11753853-C-A | ** | |||||||||
13969930-G-T | 11849224-G-T | ** | |||||||||
14005873-T-C | 11885167-T-C | ** | |||||||||
14005874-G-A | 11885168-G-A | ** | |||||||||
14018088-G-T | 11897382-G-T | ** | |||||||||
14048528-A-G | 11927822-A-G | ** | |||||||||
14060287-A-G | 11939581-A-G | ** | |||||||||
14092137-C-A | 11971431-C-A | ** | |||||||||
14107850-A-C | 11987144-A-C | ** | |||||||||
14184629-G-A | 12063923-G-A | ** | |||||||||
14213269-C-A | 12092563-C-A | ** | |||||||||
14222793-G-A | 12102087-G-A | ** | |||||||||
14281802-C-A | 12161096-C-A | ** | |||||||||
14288417-C-A | 12167711-C-A | ** | |||||||||
14296231-C-A | 12175525-C-A | ** | |||||||||
14369723-C-A | 12249019-C-A | FT290194 | ** | ||||||||
14387817-C-A | 12267113-C-A | ** | |||||||||
14392733-TTC-T | 12272029-TTC-T | ** | |||||||||
14444890-C-A | 12324163-C-A | ** | |||||||||
14458004-C-A | 12337277-C-A | ** | |||||||||
14522418-C-A | 12410619-C-A | ** | |||||||||
14547159-C-A | 12435360-C-A | ** | |||||||||
14550564-A-G | 12438765-A-G | ** | |||||||||
14563609-C-A | 12451809-C-A | ** | |||||||||
14565821-C-T | 12454021-C-T | FT346371 | ** | ||||||||
14579553-C-T | 12467753-C-T | ** | |||||||||
14586618-C-T | 12474818-C-T | ** | |||||||||
14618437-A-G | 12506635-A-G | ** | |||||||||
14688855-T-C | 12576921-T-C | ** | |||||||||
14784724-G-TT | 12672794-G-TT | ** | |||||||||
14785172-T-C | 12673242-T-C | ** | |||||||||
14798826-C-A | 12686897-C-A | ** | |||||||||
14802598-A-G | 12690669-A-G | ** | |||||||||
14810799-C-A | 12698870-C-A | ** | |||||||||
14816942-T-C | 12705013-T-C | ** | |||||||||
14872410-T-A | 12760480-T-A | ** | |||||||||
14900757-G-A | 12788824-G-A | ** | |||||||||
14900769-C-T | 12788836-C-T | ** | |||||||||
14933942-GT-G | 12822007-GT-G | ** | |||||||||
14981850-C-A | 12869918-C-A | ** | |||||||||
15047612-C-A | 12935703-C-A | ** | |||||||||
15047978-G-T | 12936069-G-T | ** | |||||||||
15051321-A-G | 12939412-A-G | ** | |||||||||
15091590-C-A | 12979679-C-A | ** | |||||||||
15107114-T-A | 12995201-T-A | ** | |||||||||
15205992-A-C | 13094078-A-C | ** | |||||||||
15206002-G-A | 13094088-G-A | FT13139 | ** | ||||||||
15208789-C-T | 13096875-C-T | ** | |||||||||
15208839-C-T | 13096925-C-T | ** | |||||||||
15259342-C-A | 13147426-C-A | ** | |||||||||
15259359-C-A | 13147443-C-A | ** | |||||||||
15270940-T-A | 13159029-T-A | ** | |||||||||
15270941-T-C | 13159030-T-C | ** | |||||||||
15310956-C-T | 13199061-C-T | ** | |||||||||
15403311-C-A | 13291431-C-A | ** | |||||||||
15438888-T-G | 13327008-T-G | ** | |||||||||
15447231-A-G | 13335351-A-G | ** | |||||||||
15496827-T-C | 13384947-T-C | ** | |||||||||
15529952-A-C | 13418072-A-C | ** | |||||||||
15576208-C-A | 13464328-C-A | ** | |||||||||
15581277-C-A | 13469397-C-A | ** | |||||||||
15587714-C-A | 13475834-C-A | ** | |||||||||
15611979-C-G | 13500099-C-G | ** | |||||||||
15621287-A-G | 13509407-A-G | ** | |||||||||
15622189-C-A | 13510309-C-A | ** | |||||||||
15658176-A-G | 13546296-A-G | ** | |||||||||
15669947-G-A | 13558067-G-A | ** | |||||||||
15741709-T-A | 13629829-T-A | ** | |||||||||
15780292-A-G | 13668412-A-G | ** | |||||||||
15811402-T-C | 13699522-T-C | ** | |||||||||
15811435-A-G | 13699555-A-G | ** | |||||||||
15811443-A-AC | 13699563-A-AC | ** | |||||||||
15818471-G-A | 13706591-G-A | ** | |||||||||
15818494-C-CA | 13706614-C-CA | ** | |||||||||
15818572-G-A | 13706692-G-A | ** | |||||||||
15843182-G-A | 13731302-G-A | ** | |||||||||
15896092-C-A | 13784212-C-A | ** | |||||||||
15909541-C-G | 13797661-C-G | ** | |||||||||
15909547-T-G | 13797667-T-G | ** | |||||||||
15909550-T-C | 13797670-T-C | ** | |||||||||
15909551-G-A | 13797671-G-A | ** | |||||||||
15936291-C-A | 13824411-C-A | ** | |||||||||
15941684-G-A | 13829804-G-A | ** | |||||||||
15968168-C-A | 13856288-C-A | ** | |||||||||
15982077-C-A | 13870197-C-A | ** | |||||||||
16005923-A-C | 13894043-A-C | ** | |||||||||
16019530-C-A | 13907650-C-A | ** | |||||||||
16076539-C-A | 13964659-C-A | ** | |||||||||
16076944-C-A | 13965064-C-A | ** | |||||||||
16078351-C-A | 13966471-C-A | ** | |||||||||
16253936-T-C | 14142056-T-C | ** | |||||||||
16253936-TG-T | 14142056-TG-T | ** | |||||||||
16253968-C-T | 14142088-C-T | ** | |||||||||
16253969-A-G | 14142089-A-G | ** | |||||||||
16341276-C-T | 14229396-C-T | ** | |||||||||
16519311-C-A | 14407431-C-A | ** | |||||||||
16568797-A-G | 14456917-A-G | ** | |||||||||
16568806-C-T | 14456926-C-T | ** | |||||||||
16568807-A-G | 14456927-A-G | ** | |||||||||
16614666-C-A | 14502786-C-A | ** | |||||||||
16681501-T-C | 14569621-T-C | ** | |||||||||
16696828-TA-T | 14584948-TA-T | ** | |||||||||
16704412-G-T | 14592532-G-T | ** | |||||||||
16757085-C-T | 14645205-C-T | ** | |||||||||
16811155-C-A | 14699275-C-A | ** | |||||||||
16826972-G-C | 14715092-G-C | ** | |||||||||
16842211-C-A | 14730331-C-A | ** | |||||||||
16848651-C-A | 14736771-C-A | ** | |||||||||
16859697-C-A | 14747817-C-A | ** | |||||||||
16875084-C-A | 14763204-C-A | ** | |||||||||
16892120-C-A | 14780240-C-A | ** | |||||||||
16905857-C-G | 14793977-C-G | ** | |||||||||
16905867-TC-T | 14793987-TC-T | ** | |||||||||
16940905-A-G | 14829025-A-G | ** | |||||||||
17030991-GC-T | 14919111-GC-T | ** | |||||||||
17045030-G-C | 14933150-G-C | ** | |||||||||
17070795-C-A | 14958915-C-A | ** | |||||||||
17151912-TGGC-T | 15040032-TGGC-T | ** | |||||||||
17194313-C-G | 15082433-C-G | ** | |||||||||
17283211-T-A | 15171331-T-A | ** | |||||||||
17284738-C-T | 15172858-C-T | ** | |||||||||
17440407-C-A | 15328527-C-A | ** | |||||||||
17515564-C-G | 15403684-C-G | ** | |||||||||
17537143-C-A | 15425263-C-A | ** | |||||||||
17549162-C-A | 15437282-C-A | ** | |||||||||
17598068-C-A | 15486188-C-A | ** | |||||||||
17661251-A-G | 15549371-A-G | ** | |||||||||
17675407-C-A | 15563527-C-A | ** | |||||||||
17702676-G-T | 15590796-G-T | ** | |||||||||
17729422-C-A | 15617542-C-A | ** | |||||||||
17793280-C-A | 15681400-C-A | ** | |||||||||
17830447-T-C | 15718567-T-C | ** | |||||||||
17867335-C-A | 15755455-C-A | ** | |||||||||
17872029-A-T | 15760149-A-T | ** | |||||||||
17876634-A-G | 15764754-A-G | ** | |||||||||
17923861-T-A | 15811981-T-A | ** | |||||||||
17946657-C-G | 15834777-C-G | ** | |||||||||
18012886-T-TC | 15901006-T-TC | P7_Dst | ** | ||||||||
18062203-T-C | 15950323-T-C | ** | |||||||||
18080608-A-T | 15968728-A-T | ** | |||||||||
18088200-C-A | 15976320-C-A | ** | |||||||||
18124739-C-A | 16012859-C-A | FT372454 | ** | ||||||||
18179520-C-A | 16067640-C-A | ** | |||||||||
18244005-C-A | 16132125-C-A | ** | |||||||||
18254734-C-A | 16142854-C-A | ** | |||||||||
18266887-C-A | 16155007-C-A | ** | |||||||||
18283841-G-T | 16171961-G-T | P6_Prx | ** | ||||||||
18283876-A-C | 16171996-A-C | P6_Prx | ** | ||||||||
18403446-C-A | 16291566-C-A | P6_Gap | ** | ||||||||
18427628-C-A | 16315748-C-A | P6_Gap | ** | ||||||||
18440935-AAC-A | 16329055-AAC-A | P6_Dst | ** | ||||||||
18491604-C-A | 16379724-C-A | P6_Dst | ** | ||||||||
18584135-C-T | 16472255-C-T | ** | |||||||||
18585726-C-A | 16473846-C-A | ** | |||||||||
18592119-G-T | 16480239-G-T | ** | |||||||||
18597619-C-A | 16485739-C-A | ** | |||||||||
18631111-C-G | 16519231-C-G | ** | |||||||||
18660038-G-T | 16548158-G-T | ** | |||||||||
18663358-C-A | 16551478-C-A | ** | |||||||||
18821377-T-A | 16709497-T-A | ** | |||||||||
18901897-C-T | 16790017-C-T | Y74237 | ** | ||||||||
18928500-G-C | 16816620-G-C | ** | |||||||||
19003612-T-C | 16891732-T-C | ** | |||||||||
19009158-C-A | 16897278-C-A | ** | |||||||||
19121377-C-T | 17009497-C-T | ** | |||||||||
19159837-C-A | 17047957-C-A | ** | |||||||||
19187412-TTGCAC-T | 17075532-TTGCAC-T | ** | |||||||||
19206917-C-A | 17095037-C-A | ** | |||||||||
19342058-C-A | 17230178-C-A | ** | |||||||||
19472486-A-T | 17360606-A-T | ** | |||||||||
19504238-G-T | 17392358-G-T | ** | |||||||||
19548414-C-A | 17436534-C-A | ** | |||||||||
19721217-G-A | 17609337-G-A | P5_Prx | ** | ||||||||
19721225-G-A | 17609345-G-A | P5_Prx | ** | ||||||||
19721333-C-A | 17609453-C-A | P5_Prx | ** | ||||||||
19861236-A-G | 17749356-A-G | P5_Prx | ** | ||||||||
19861249-T-C | 17749369-T-C | P5_Prx | ** | ||||||||
20001306-T-A | 17889426-T-A | P5_Prx | ** | ||||||||
20063938-A-C | 17952058-A-C | P5_Gap | ** | ||||||||
20489332-AC-A | 18327446-AC-A | P5_Dst | ** | ||||||||
20801600-T-C | 18639714-T-C | P4_Prx | ** | ||||||||
20815376-C-A | 18653490-C-A | P4_Gap | ** | ||||||||
20816920-G-C | 18655034-G-C | P4_Gap | ** | ||||||||
20816923-T-C | 18655037-T-C | P4_Gap | ** | ||||||||
21091053-T-C | 18929167-T-C | ** | |||||||||
21092398-C-T | 18930512-C-T | ** | |||||||||
21100609-A-G | 18938723-A-G | ** | |||||||||
21103216-C-A | 18941330-C-A | ** | |||||||||
21105502-A-G | 18943616-A-G | ** | |||||||||
21128867-C-A | 18966981-C-A | ** | |||||||||
21138763-G-A | 18976877-G-A | ** | |||||||||
21164480-C-A | 19002594-C-A | ** | |||||||||
21169002-A-T | 19007116-A-T | ** | |||||||||
21182369-C-A | 19020483-C-A | ** | |||||||||
21219009-C-A | 19057123-C-A | ** | |||||||||
21220259-TGA-T | 19058373-TGA-T | ** | |||||||||
21220268-G-A | 19058382-G-A | ** | |||||||||
21220274-C-T | 19058388-C-T | ** | |||||||||
21235214-T-A | 19073328-T-A | ** | |||||||||
21235219-T-G | 19073333-T-G | ** | |||||||||
21244214-C-G | 19082328-C-G | ** | |||||||||
21257363-C-A | 19095477-C-A | ** | |||||||||
21326560-A-AT | 19164674-A-AT | ** | |||||||||
21360245-C-A | 19198359-C-A | ** | |||||||||
21486978-C-A | 19325092-C-A | ** | |||||||||
21661629-C-A | 19499743-C-A | ** | |||||||||
21707716-G-A | 19545830-G-A | ** | |||||||||
21726125-T-C | 19564239-T-C | ** | |||||||||
21726154-T-C | 19564268-T-C | ** | |||||||||
21726156-C-A | 19564270-C-A | ** | |||||||||
21761145-C-A | 19599259-C-A | ** | |||||||||
21779582-C-A | 19617696-C-A | ** | |||||||||
21816369-C-A | 19654483-C-A | ** | |||||||||
21891025-T-C | 19729139-T-C | ** | |||||||||
21934577-A-G | 19772691-A-G | ** | |||||||||
21975421-C-T | 19813535-C-T | ** | |||||||||
21993857-G-T | 19831971-G-T | ** | |||||||||
22018193-A-T | 19856307-A-T | ** | |||||||||
22018457-T-C | 19856571-T-C | ** | |||||||||
22018459-T-G | 19856573-T-G | ** | |||||||||
22018461-G-A | 19856575-G-A | ** | |||||||||
22018474-C-T | 19856588-C-T | ** | |||||||||
22023412-G-T | 19861526-G-T | ** | |||||||||
22040747-A-G | 19878861-A-G | ** | |||||||||
22071514-C-A | 19909628-C-A | ** | |||||||||
22127134-C-A | 19965248-C-A | ** | |||||||||
22176923-C-A | 20015037-C-A | ** | |||||||||
22176937-C-A | 20015051-C-A | ** | |||||||||
22590705-C-A | 20428819-C-A | ** | |||||||||
22698948-G-A | 20537062-G-A | ** | |||||||||
22698952-T-A | 20537066-T-A | ** | |||||||||
22752537-T-A | 20590651-T-A | ** | |||||||||
22876036-A-G | 20714150-A-G | ** | |||||||||
22893509-A-G | 20731623-A-G | ** | |||||||||
22893510-T-C | 20731624-T-C | ** | |||||||||
22893521-C-A | 20731635-C-A | ** | |||||||||
22896169-C-A | 20734283-C-A | ** | |||||||||
22899975-C-A | 20738089-C-A | ** | |||||||||
22912831-C-A | 20750945-C-A | ** | |||||||||
23019949-C-A | 20858063-C-A | ** | |||||||||
23042910-C-A | 20881024-C-A | ** | |||||||||
23054353-T-A | 20892467-T-A | ** | |||||||||
23069714-CA-C | 20907828-CA-C | 8×A | ** | ||||||||
23128163-A-T | 20966277-A-T | ** | |||||||||
23205522-C-A | 21043636-C-A | ** | |||||||||
23236687-C-T | 21074801-C-T | ** | |||||||||
23267086-C-A | 21105200-C-A | ** | |||||||||
23293653-C-A | 21131767-C-A | ** | |||||||||
23386855-C-A | 21224969-C-A | ** | |||||||||
23391555-G-T | 21229669-G-T | ** | |||||||||
23828779-A-G | 21666893-A-G | ** | |||||||||
24003017-T-C | 21856870-T-C | ** | |||||||||
24223355-A-T | 22077208-A-T | P3_b1 | ** | ||||||||
24450397-C-A | 22304250-C-A | ** | |||||||||
24513740-C-A | 22367593-C-A | ** | |||||||||
24523967-G-A | 22377820-G-A | ** | |||||||||
24872849-C-A | 22726702-C-A | IR1_R | ** | ||||||||
24876226-C-A | 22730079-C-A | g1 | ** | ||||||||
24881783-G-A | 22735636-G-A | g1 | ** | ||||||||
25720432-G-T | 23574285-G-T | P1_b3 | ** | ||||||||
25930605-C-A | 23784458-C-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
25943125-T-A | 23796978-T-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
26247560-T-G | 24101413-T-G | P1_Y1 | ** | ||||||||
27641696-C-A | 25495549-C-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
27863553-G-T | 25717406-G-T | P1_Y2 | ** | ||||||||
28006629-G-T | 25860482-G-T | P1_Y2 | ** | ||||||||
28006670-G-T | 25860523-G-T | P1_Y2 | ** | ||||||||
28024705-A-AC | 25878558-A-AC | P1_Y2 | ** | ||||||||
28090328-A-G | 25944181-A-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
28483862-A-G | 26337715-A-G | ** | |||||||||
28601149-G-A | 26455002-G-A | ** | |||||||||
28601165-A-G | 26455018-A-G | ** | |||||||||
28608318-C-A | 26462171-C-A | ** | |||||||||
28618128-C-A | 26471981-C-A | ** | |||||||||
28626100-C-A | 26479953-C-A | ** | |||||||||
28658964-C-A | 26512817-C-A | ** | |||||||||
28701713-C-A | 26555566-C-A | ** | |||||||||
28724393-G-A | 26578246-G-A | ** | |||||||||
28754843-C-A | 26608696-C-A | ** | |||||||||
28755634-A-T | 26609487-A-T | ** | |||||||||
28765527-C-T | 26619380-C-T | ** | |||||||||
28765528-A-G | 26619381-A-G | ** | |||||||||
28773093-C-A | 26626946-C-A | ** | |||||||||
28814124-T-C | 26667977-T-C | ** | |||||||||
56826560-T-C | ** | ||||||||||
56830434-T-C | ** | ||||||||||
56831016-C-CCACTT | ** | ||||||||||
56835840-G-T | ** | ||||||||||
56858238-A-G | ** | ||||||||||
56858249-G-C | ** | ||||||||||
56858257-G-T | ** | ||||||||||
29509-T-G | ** | ||||||||||
26102218-C-A | 23956071-C-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
6182776-C-T | 6314735-C-T | IR3_Dst | ** | ||||||||
19673432-A-C | 17561552-A-C | P5_Prx | ** | ||||||||
23226080-G-A | 21064194-G-A | ** | |||||||||
25089806-C-T | 22943659-C-T | g1 | ** | ||||||||
25938880-G-T | 23792733-G-T | P1_Y1 | ** | ||||||||
27339815-T-G | 25193668-T-G | P1_g3 | ** | ||||||||
28081897-C-T | 25935750-C-T | P1_Y2 | ** | ||||||||
13140113-T-C | 10629599-T-C | *** | |||||||||
13272115-CAAAAAAAT-C | 11116439-CAAAAAAAT-C | *** | |||||||||
13272126-AT-A | 11116450-AT-A | *** | |||||||||
13452851-T-G | 11297175-T-G | *** | |||||||||
13542958-AAC-A | 11387282-AAC-A | *** | |||||||||
13542963-A-T | 11387287-A-T | *** | |||||||||
13693855-G-T | 11538179-G-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13708507-A-C | 11552831-A-C | DYZ17 | *** | ||||||||
13709538-C-G,T | 11553862-C-G,T | DYZ17 | *** | ||||||||
13866042-A-T | 11745336-A-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13869490-T-A,G | 11748784-T-A,G | DYZ17 | *** | ||||||||
28817594-C-G | 26671447-C-G | *** | |||||||||
13683005-C-G | 11527329-C-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13821246-C-G | 11700540-C-G | DYZ17 | *** | ||||||||
20757358-TTACA-T | 18595472-TTACA-T | P4_Prx | *** | ||||||||
13869489-A-C,G | 11748783-A-C,G | DYZ17 | *** | ||||||||
13802957-G-C | 11682251-G-C | DYZ17 | *** | ||||||||
22216810-A-T | 20054924-A-T | DYZ19 | *** | ||||||||
22216817-T-C | 20054931-T-C | DYZ19 | *** | ||||||||
58974727-A-T | 56828580-A-T | *** | |||||||||
13828114-A-T | 11707408-A-T | DYZ17 | *** | ||||||||
7485256-C-CT | 7617215-C-CT | IR1_L | 23×T | *** | |||||||
25964918-TG-T | 23818771-TG-T | P1_Y1 | *** | ||||||||
13821231-C-G | 11700525-C-G | DYZ17 | *** | ||||||||
58977211-T-C | 56831064-T-C | *** | |||||||||
13818006-T-G | 11697300-T-G | DYZ17 | *** | ||||||||
9986372-A-G | 10148763-A-G | YSC0000092 | *** | ||||||||
13823254-G-A,GATGGA | 11702548-G-A,GATGGA | DYZ17 | *** | ||||||||
13866777-G-T | 11746071-G-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13453078-C-G | 11297402-C-G | *** | |||||||||
13458412-ATTCCC-A | 11302736-ATTCCC-A | *** | |||||||||
13458422-A-C | 11302746-A-C | BY39638 | *** | ||||||||
26463097-C-T | 24316950-C-T | P1_Y1 | 36×T | *** | |||||||
28818578-T-A | 26672431-T-A | *** | |||||||||
13823194-A-G | 11702488-A-G | DYZ17 | *** | *** | |||||||
24950426-GAA-G | 22804279-GAA-G | g1 | 15×A | *** | |||||||
10026087-T-C | 10188478-T-C | BY83140 | *** | ||||||||
13453718-T-C | 11298042-T-C | *** | |||||||||
13480156-C-G | 11324480-C-G | *** | |||||||||
13727732-G-GT | 11572056-G-GT | DYZ17 | *** | ||||||||
13821226-A-G | 11700520-A-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13821227-T-A | 11700521-T-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13853622-T-G | 11732916-T-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13453607-C-G | 11297931-C-G | *** | |||||||||
22235842-T-A | 20073956-T-A | DYZ19 | *** | ||||||||
13737177-TCGAAC-T | 11581501-TCGAAC-T | DYZ17 | *** | ||||||||
6133969-A-C | 6265928-A-C | *** | |||||||||
7387396-A-T | 7519355-A-T | 22×T | *** | ||||||||
13458796-C-T | 11303120-C-T | *** | |||||||||
23097835-C-A | 20935949-C-A | *** | |||||||||
20650557-TA-T | 18488671-TA-T | P4_Prx | *** | ||||||||
13869394-G-C | 11748688-G-C | DYZ17 | *** | ||||||||
19682353-GAAA-G | 17570473-GAAA-G | P5_Prx | *** | ||||||||
19682358-AG-A | 17570478-AG-A | P5_Prx | *** | ||||||||
24300838-TG-T | 22154691-TG-T | P3_t1 | *** | ||||||||
13723953-AAATGG-A | 11568277-AAATGG-A | DYZ17 | 4×AATGG | *** | |||||||
16242628-A-AT | 14130748-A-AT | *** | |||||||||
16242632-T-TCTA | 14130752-T-TCTA | 10×TCTA | *** | ||||||||
17992531-TAA-T | 15880651-TAA-T | P7_Prx | 20×A | *** | |||||||
13433617-ATT-A | 11277941-ATT-A | 8×T | *** | ||||||||
17794157-CTTT-C | 15682277-CTTT-C | *** | |||||||||
17794161-TC-T | 15682281-TC-T | *** | |||||||||
28802663-T-C | 26656516-T-C | *** | |||||||||
13701323-G-A | 11545647-G-A | DYZ17 | *** | ||||||||
7387394-C-T | 7519353-C-T | *** | |||||||||
13433620-T-A | 11277944-T-A | *** | |||||||||
13455999-C-T | 11300323-C-T | FT443826 | *** | ||||||||
13691776-A-T | 11536100-A-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13694105-T-G | 11538429-T-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13701316-A-T | 11545640-A-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13734509-A-C | 11578833-A-C | DYZ17 | *** | ||||||||
13734511-A-C | 11578835-A-C | DYZ17 | 4×AATGG | *** | |||||||
13809659-C-G | 11688953-C-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13810866-ATGGAATAGAT-A | 11690160-ATGGAATAGAT-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13853596-T-A | 11732890-T-A | DYZ17 | *** | ||||||||
13856275-A-T | 11735569-A-T | DYZ17 | *** | ||||||||
13856277-GGAATA-G | 11735571-GGAATA-G | DYZ17 | *** | ||||||||
17662161-GGATAGGTAGATA-G | 15550281-GGATAGGTAGATA-G | *** | |||||||||
20019185-CTTT-C | 17907305-CTTT-C | P5_Prx | 20×T | *** | |||||||
21651831-A-AT | 19489945-A-AT | 11×AT | *** | ||||||||
24686451-TG-T | 22540304-TG-T | P3_b2 | *** | ||||||||
26089061-C-CAA | 23942914-C-CAA | P1_Y1 | 20×A | *** | |||||||
26953141-TA-T | 24806994-TA-T | P1_r3 | 24×A | *** | |||||||
58980737-TTGCATTCCAC-T | 56834590-TTGCATTCCAC-T | *** | |||||||||
14325557-C-A | 12204851-C-A | *** | |||||||||
17653704-TTTG-T | 15541824-TTTG-T | 8×TTG | *** | ||||||||
22483528-C-A | 20321642-C-A | DYZ19 | *** | ||||||||
23260557-C-CT | 21098671-C-CT | 9×T | *** | ||||||||
13453618-A-AATTCCATTCCATTCC,C | 11297942-A-AATTCCATTCCATTCC,C | 12×ATTCC | *** | ||||||||
13483298-C-T | 11327622-C-T | *** | |||||||||
4064008-C-A | 4195967-C-A | *** | |||||||||
6352178-G-GA | 6484137-G-GA | 10×A | *** | ||||||||
13489621-C-A,T | 11333945-C-A,T | *** | |||||||||
13818192-TGAATG-G,T | 11697486-TGAATG-G,T | DYZ17 | 10×GAATG | *** | |||||||
58981827-A-ATCCAT | 56835680-A-ATCCAT | *** | |||||||||
21929509-G-A | 19767623-G-A | Y77416 | *** | ||||||||
5829956-C-A | 5961915-C-A | *** | |||||||||
21211686-C-A | 19049800-C-A | *** | |||||||||
14036916-C-A | 11916210-C-A | *** | |||||||||
13660465-C-A | 11504789-C-A | DYZ17 | *** | ||||||||
10958311-C-A | *** | ||||||||||
10958320-A-C | *** | ||||||||||
56828929-C-CATGCTATTAG | *** | ||||||||||
10821882-C-CACTAA | *** | ||||||||||
11643688-G-A | DYZ17 | *** | |||||||||
15449892-CTT-C,CT | 13338012-CTT-C,CT | 21×T | *** | ||||||||
11014509-T-G | *** | ||||||||||
22490485-C-A | 20328599-C-A | DYZ19 | *** | ||||||||
14659444-CAA-C | 12547509-CAA-C | 13×A | *** | ||||||||
13489681-C-G | 11334005-C-G | *** | |||||||||
15616870-G-T | 13504990-G-T | *** | |||||||||
16863543-ATTTT-A | 14751663-ATTTT-A | 14×T | *** | ||||||||
17362675-C-A | 15250795-C-A | *** | |||||||||
11014458-A-G | *** | ||||||||||
10693233-C-T | *** | ||||||||||
22536231-C-A | 20374345-C-A | *** | |||||||||
19333258-A-G | 17221378-A-G | *** | |||||||||
13842641-A-C | 11721935-A-C | DYZ17 | *** | ||||||||
24485725-A-T | 22339578-A-T | *** | |||||||||
10790213-T-G | *** | ||||||||||
8144989-G-T | 8276948-G-T | *** | |||||||||
10968468-C-A | *** | ||||||||||
14385238-C-A | 12264534-C-A | *** | |||||||||
3164481-C-A | 3296440-C-A | *** | |||||||||
18085121-C-A | 15973241-C-A | *** | |||||||||
23097812-C-A | 20935926-C-A | *** | |||||||||
13224231-C-A | 11068555-C-A | *** | |||||||||
13578034-C-A | 11422358-C-A | 14×A | *** | ||||||||
10973651-C-G | *** | ||||||||||
17196870-C-A | 15084990-C-A | *** | |||||||||
21517951-C-A | 19356065-C-A | *** | |||||||||
14762542-C-A | 12650611-C-A | *** | |||||||||
15718486-C-A | 13606606-C-A | *** | |||||||||
8865949-G-T | 8997908-G-T | *** | |||||||||
2717424-G-T | 2849383-G-T | *** | |||||||||
2746104-G-A | 2878063-G-A | *** | |||||||||
2748371-C-A | 2880330-C-A | *** | |||||||||
2819981-A-T | 2951940-A-T | FT129510 | *** | ||||||||
2860015-T-C | 2991974-T-C | *** | |||||||||
3467361-C-A | 3599320-C-A | *** | |||||||||
3627546-G-A | 3759505-G-A | *** | |||||||||
3712329-T-C | 3844288-T-C | *** | |||||||||
3712342-G-A | 3844301-G-A | *** | |||||||||
3720908-C-A | 3852867-C-A | *** | |||||||||
4069707-C-A | 4201666-C-A | *** | |||||||||
4417019-C-A | 4548978-C-A | *** | |||||||||
4969587-C-A | 5101546-C-A | *** | |||||||||
5426390-CTTTTTT-C,CTTT | 5558349-CTTTTTT-C,CTTT | 17×T | *** | ||||||||
5675032-G-T | 5806991-G-T | *** | |||||||||
6147678-C-A | 6279637-C-A | IR3_Dst | *** | ||||||||
6355531-G-T | 6487490-G-T | *** | |||||||||
6356831-G-T | 6488790-G-T | *** | |||||||||
6362448-G-T | 6494407-G-T | *** | |||||||||
6385765-G-T | 6517724-G-T | *** | |||||||||
6662427-C-A | 6794386-C-A | *** | |||||||||
6664154-G-T | 6796113-G-T | *** | |||||||||
6785245-C-A | 6917204-C-A | *** | |||||||||
6916853-C-A | 7048812-C-A | *** | |||||||||
7091901-T-C | 7223860-T-C | *** | |||||||||
7144042-C-T | 7276001-C-T | *** | |||||||||
7187584-CTT-C,CT | 7319543-CTT-C,CT | 15×T | *** | ||||||||
7305832-G-A | 7437791-G-A | *** | |||||||||
7422100-C-A | 7554059-C-A | *** | |||||||||
7643864-C-A | 7775823-C-A | *** | |||||||||
7662799-C-A | 7794758-C-A | *** | |||||||||
7663158-C-A | 7795117-C-A | *** | |||||||||
7670221-T-C | 7802180-T-C | *** | |||||||||
7670224-T-C | 7802183-T-C | *** | |||||||||
7702471-G-A | 7834430-G-A | *** | |||||||||
7702760-C-A | 7834719-C-A | *** | |||||||||
7760013-G-T | 7891972-G-T | *** | |||||||||
7775146-A-G | 7907105-A-G | *** | |||||||||
7956982-C-A | 8088941-C-A | *** | |||||||||
8013230-T-C | 8145189-T-C | *** | |||||||||
8138275-A-G | 8270234-A-G | *** | |||||||||
8385384-C-A | 8517343-C-A | *** | |||||||||
8397105-G-T | 8529064-G-T | *** | |||||||||
8529662-C-A | 8661621-C-A | *** | |||||||||
8549032-GTTTT-G,GTTT | 8680991-GTTTT-G,GTTT | 23×T | *** | ||||||||
8638739-G-A | 8770698-G-A | *** | |||||||||
8779813-A-G | 8911772-A-G | *** | |||||||||
8792791-C-A | 8924750-C-A | *** | |||||||||
8821832-C-A | 8953791-C-A | *** | |||||||||
8892915-C-A | 9024874-C-A | *** | |||||||||
8897161-C-A | 9029120-C-A | *** | |||||||||
9022134-C-A | 9184525-C-A | BY77435 | *** | ||||||||
9025620-T-C | 9188011-T-C | *** | |||||||||
9140301-C-A | 9302692-C-A | *** | |||||||||
9190275-T-A | 9352666-T-A | *** | |||||||||
9479554-A-T | 9641945-A-T | *** | |||||||||
9500264-T-C | 9662655-T-C | *** | |||||||||
9517338-C-A | 9679729-C-A | *** | |||||||||
9647669-C-A | 9810060-C-A | IR3_Prx | *** | ||||||||
9787241-C-A | 9949632-C-A | *** | |||||||||
9859806-C-A | 10022197-C-A | *** | |||||||||
9865537-C-A | 10027928-C-A | *** | |||||||||
9897874-C-A | 10060265-C-A | *** | |||||||||
9945863-GAAAA-G,GAAAAA | 10108254-GAAAA-G,GAAAAA | 16×A | *** | ||||||||
9972337-A-G | 10134728-A-G | *** | |||||||||
9989943-A-G | 10152334-A-G | *** | |||||||||
10034853-C-T | 10197244-C-T | *** | |||||||||
10625555-C-A | *** | ||||||||||
10748295-T-A | *** | ||||||||||
10825284-C-CGGG | *** | ||||||||||
10825285-C-CTA | *** | ||||||||||
10825510-C-T | *** | ||||||||||
10992836-C-T | *** | ||||||||||
10999952-T-G | *** | ||||||||||
13456496-C-A | 11300820-C-A | *** | |||||||||
13507166-C-A | 11351490-C-A | *** | |||||||||
11643723-T-CAAACA,CAACTC | DYZ17 | *** | |||||||||
13830615-G-T | 11709909-G-T | DYZ17 | *** | ||||||||
14007891-C-A | 11887185-C-A | *** | |||||||||
14104826-C-A | 11984120-C-A | *** | |||||||||
14115503-C-A | 11994797-C-A | *** | |||||||||
14143815-T-A | 12023109-T-A | *** | |||||||||
14151895-A-T | 12031189-A-T | *** | |||||||||
14206268-C-A | 12085562-C-A | *** | |||||||||
14208130-C-A | 12087424-C-A | *** | |||||||||
14220538-C-A | 12099832-C-A | *** | |||||||||
14288344-C-A | 12167638-C-A | *** | |||||||||
14323849-G-GA | 12203143-G-GA | 8×A | *** | ||||||||
14392176-A-AG | 12271472-A-AG | *** | |||||||||
14392224-C-A | 12271520-C-A | *** | |||||||||
14398518-C-A | 12277814-C-A | *** | |||||||||
14479420-A-G | 12358689-A-G | *** | |||||||||
14550296-A-G | 12438497-A-G | *** | |||||||||
14595537-C-A | 12483737-C-A | *** | |||||||||
14602228-T-A | 12490430-T-A | *** | |||||||||
14744075-C-A | 12632144-C-A | *** | |||||||||
14782114-C-A | 12670184-C-A | *** | |||||||||
14808421-C-A | 12696492-C-A | *** | |||||||||
14885631-G-A | 12773697-G-A | *** | |||||||||
14970822-A-G | 12858897-A-G | *** | |||||||||
14980831-CT-C,CTT | 12868907-CT-C,CTT | 15×T | *** | ||||||||
15076074-C-A | 12964164-C-A | *** | |||||||||
15183069-C-A | 13071155-C-A | *** | |||||||||
15250850-T-A | 13138936-T-A | *** | |||||||||
15321521-C-A | 13209639-C-A | *** | |||||||||
15355382-A-G | 13243501-A-G | *** | |||||||||
15365459-A-G | 13253579-A-G | *** | |||||||||
15411659-C-A | 13299779-C-A | *** | |||||||||
15475505-G-A | 13363625-G-A | *** | |||||||||
15509134-CCAGTAAA-C | 13397254-CCAGTAAA-C | *** | |||||||||
15572573-C-A | 13460693-C-A | *** | |||||||||
15616885-G-T | 13505005-G-T | *** | |||||||||
15649033-C-A | 13537153-C-A | *** | |||||||||
15681177-C-A | 13569297-C-A | *** | |||||||||
15731773-C-A | 13619893-C-A | *** | |||||||||
15733094-C-A | 13621214-C-A | *** | |||||||||
15876675-C-A | 13764795-C-A | *** | |||||||||
15975250-GT-G | 13863370-GT-G | *** | |||||||||
15998263-C-A | 13886383-C-A | Y69234 | *** | ||||||||
16033257-C-A | 13921377-C-A | *** | |||||||||
16247208-C-A | 14135328-C-A | *** | |||||||||
16247264-C-A | 14135384-C-A | *** | |||||||||
16327598-C-A | 14215718-C-A | *** | |||||||||
16330494-C-A | 14218614-C-A | *** | |||||||||
16340823-C-A | 14228943-C-A | *** | |||||||||
16402523-T-C | 14290643-T-C | *** | |||||||||
16413327-C-A | 14301447-C-A | *** | |||||||||
16524468-C-A | 14412588-C-A | *** | |||||||||
16562261-TTTTAGC-T | 14450381-TTTTAGC-T | *** | |||||||||
16651433-CTTTTT-C,CTTTT | 14539553-CTTTTT-C,CTTTT | 16×T | *** | ||||||||
16915421-C-A | 14803541-C-A | *** | |||||||||
17021933-C-A | 14910053-C-A | *** | |||||||||
17044711-T-C | 14932831-T-C | *** | |||||||||
17137222-C-A | 15025342-C-A | *** | |||||||||
17232989-C-A | 15121109-C-A | *** | |||||||||
17444215-C-A | 15332335-C-A | *** | |||||||||
17537206-C-A | 15425326-C-A | *** | |||||||||
17609834-C-A | 15497954-C-A | *** | |||||||||
17694609-GA-G,GAA | 15582729-GA-G,GAA | 14×A | *** | ||||||||
17869039-T-C | 15757159-T-C | *** | |||||||||
17874650-T-C | 15762770-T-C | *** | |||||||||
17887553-ATT-A,AT | 15775673-ATT-A,AT | 10×T | *** | ||||||||
17918216-G-T | 15806336-G-T | *** | |||||||||
17949244-A-G | 15837364-A-G | *** | |||||||||
17995687-C-A | 15883807-C-A | P7_Gap | *** | ||||||||
18040127-C-A | 15928247-C-A | *** | |||||||||
18060848-C-A | 15948968-C-A | *** | |||||||||
18195356-T-C | 16083476-T-C | *** | |||||||||
18195357-A-G | 16083477-A-G | *** | |||||||||
18204155-C-T | 16092275-C-T | *** | |||||||||
18269639-C-A | 16157759-C-A | *** | |||||||||
18616584-C-A | 16504704-C-A | *** | |||||||||
18666125-C-A | 16554245-C-A | *** | |||||||||
18668102-C-A | 16556222-C-A | *** | |||||||||
18940520-C-A | 16828640-C-A | *** | |||||||||
18942199-C-A | 16830319-C-A | *** | |||||||||
18961871-G-A | 16849991-G-A | *** | |||||||||
18982342-C-A | 16870462-C-A | *** | |||||||||
19022112-C-A | 16910232-C-A | *** | |||||||||
19239135-G-T | 17127255-G-T | *** | |||||||||
19283141-C-A | 17171261-C-A | *** | |||||||||
19308764-C-A | 17196884-C-A | *** | |||||||||
19334688-C-A | 17222808-C-A | *** | |||||||||
19467147-C-A | 17355267-C-A | *** | |||||||||
19512584-T-C | 17400704-T-C | *** | |||||||||
19522800-C-A | 17410920-C-A | *** | |||||||||
19535866-C-A | 17423986-C-A | *** | |||||||||
19709515-G-T | 17597635-G-T | P5_Prx | *** | ||||||||
20829668-C-G | 18667782-C-G | P4_Gap | *** | ||||||||
21079492-T-C | 18917606-T-C | *** | |||||||||
21111160-C-A | 18949274-C-A | *** | |||||||||
21167488-T-C | 19005602-T-C | *** | |||||||||
21167489-G-A | 19005603-G-A | *** | |||||||||
21167492-G-A | 19005606-G-A | *** | |||||||||
21228580-C-A | 19066694-C-A | *** | |||||||||
21441103-A-G | 19279217-A-G | *** | |||||||||
21467438-C-A | 19305552-C-A | *** | |||||||||
21549404-C-A | 19387518-C-A | *** | |||||||||
21717847-G-T | 19555961-G-T | *** | |||||||||
21785740-A-G | 19623854-A-G | *** | |||||||||
21856335-C-A | 19694449-C-A | *** | |||||||||
22035659-A-C | 19873773-A-C | *** | |||||||||
22036374-C-A | 19874488-C-A | *** | |||||||||
22040730-T-C | 19878844-T-C | *** | |||||||||
22060845-C-A | 19898959-C-A | *** | |||||||||
22069818-T-C | 19907932-T-C | *** | |||||||||
22085525-A-G | 19923639-A-G | *** | |||||||||
22117835-C-A | 19955949-C-A | *** | |||||||||
22123927-T-C | 19962041-T-C | *** | |||||||||
22127834-A-G | 19965948-A-G | *** | |||||||||
22528575-C-A | 20366689-C-A | *** | |||||||||
22576422-C-A | 20414536-C-A | *** | |||||||||
22616130-C-A | 20454244-C-A | *** | |||||||||
22654674-C-A | 20492788-C-A | *** | |||||||||
22791785-C-A | 20629899-C-A | *** | |||||||||
22993621-T-A | 20831735-T-A | *** | |||||||||
23044779-G-A | 20882893-G-A | *** | |||||||||
23056913-C-A | 20895027-C-A | *** | |||||||||
23076182-AT-A | 20914296-AT-A | *** | |||||||||
23157397-C-A | 20995511-C-A | *** | |||||||||
23186498-C-A | 21024612-C-A | *** | |||||||||
23186508-C-A | 21024622-C-A | *** | |||||||||
23205224-C-A | 21043338-C-A | *** | |||||||||
23267297-T-C | 21105411-T-C | *** | |||||||||
23280313-C-A | 21118427-C-A | *** | |||||||||
23457691-C-A | 21295805-C-A | *** | |||||||||
23504917-T-C | 21343031-T-C | *** | |||||||||
23532822-T-C | 21370936-T-C | *** | |||||||||
23597059-C-A | 21435173-C-A | *** | |||||||||
23642392-T-C | 21480506-T-C | *** | |||||||||
23771519-C-A | 21609633-C-A | *** | |||||||||
23776571-T-C | 21614685-T-C | *** | |||||||||
23807400-G-A | 21645514-G-A | *** | |||||||||
24357425-C-A | 22211278-C-A | *** | |||||||||
24433888-C-A | 22287741-C-A | *** | |||||||||
24500261-A-C | 22354114-A-C | *** | |||||||||
56825948-TG-T,TA | *** | ||||||||||
56858269-T-C | *** | ||||||||||
14457387-CAAAA-C | 12336660-CAAAA-C | 18×A | *** | ||||||||
3186741-CAA-C | 3318700-CAA-C | 15×A | *** | ||||||||
17584310-T-G | 15472430-T-G | *** | |||||||||
21416907-G-T | 19255021-G-T | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
---|---|---|---|
Manual | 4687827-A-G | 4819786-A-G | 14 reads, all G. |
Manual | 17546935-C-G | 15435055-C-G | 11 reads, all G. |
Manual | 7323076-T-C | 7455035-T-C | 3 reads, all C. |
Manual | 7368747-C-T | 7500706-C-T | 13 reads total, 12 are T, one is C. |
Manual | 22323215-T-A | 20161329-T-A | 9 reads, all A. |
Manual | 24897683-A-G | 22751536-A-G | 31A, 1C, 27G |
Manual | 8736111-G-T | 8868070-G-T | 2 reads, both T. |
Manual | 18130421-C-T | 16018541-C-T | 6 reads, all T. |
Manual | 18382652-T-A | 16270772-T-A | 3 reads, all A. |
Manual | 16443269-C-A | 14331389-C-A | 12 reads, all A. |