MacFarlane
BigY3: 230321, FTDNA: 230321, BigY2: 230321MDKA Birth: Scotland
Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | BigY3 230321 | FTDNA 230321 | BigY2 230321 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
22312751-G-A | 20150865-G-A | DYZ19 | A* | *** | ||||||
16290387-T-G | 14178507-T-G | Y | Y | A* | ||||||
14124870-C-A | 12004164-C-A | Y | Y | * | *** | |||||
13140295-T-G | 10629781-T-G | ** | ||||||||
2836569-C-T | 2968528-C-T | CTS242 L1249 M5379 PF1451 | ** | |||||||
7233156-A-G | 7365115-A-G | CTS1141 | ** | ** | ||||||
10008797-G-T | 10171188-G-T | ** | ** | |||||||
16282204-T-C | 14170324-T-C | CTS5449 AM00253 AMM208 | ** | ** | ||||||
18125132-C-A | 16013252-C-A | PF4225 | ** | ** | ||||||
28708402-G-T | 26562255-G-T | ** | ||||||||
28812737-G-A | 26666590-G-A | ** | *** | ** | ||||||
13477422-C-A | 11321746-C-A | ** | ||||||||
9221712-T-C | 9384103-T-C | ** | ||||||||
17408290-T-C | 15296410-T-C | ** | ||||||||
9444123-C-A | 9606514-C-A | Z22169 | ** | |||||||
9891742-T-C | 10054133-T-C | Z11977 | ** | |||||||
14884583-C-T | 12772649-C-T | ** | ||||||||
17387317-TAA-T | 15275437-TAA-T | ** | ||||||||
17477886-A-G | 15366006-A-G | ** | ||||||||
17552175-C-A | 15440295-C-A | ** | ||||||||
17764698-C-A | 15652818-C-A | Y906 | ** | |||||||
18643406-C-T | 16531526-C-T | FT283200 | ** | |||||||
9830994-C-CA | 9993385-C-CA | ** | ||||||||
28480128-C-A | 26333981-C-A | ** | ||||||||
21984150-C-T | 19822264-C-T | ** | ||||||||
13962072-AG-A | 11841366-AG-A | ** | ||||||||
14934351-T-G | 12822416-T-G | ** | ||||||||
3957629-T-TA | 4089588-T-TA | 7×AAATA | ** | |||||||
10808578-T-C | ** | |||||||||
13857715-C-A | 11737009-C-A | DYZ17 | ** | |||||||
21283343-C-A | 19121457-C-A | ** | ||||||||
10841963-C-A | FT433656 | ** | ||||||||
10987850-A-C | ** | |||||||||
7562143-C-A | 7694102-C-A | ** | ||||||||
2651898-TTTTTG-T | 2783857-TTTTTG-T | ** | ||||||||
2683891-T-C | 2815850-T-C | ** | ||||||||
2690273-G-T | 2822232-G-T | ** | ||||||||
2708000-G-T | 2839959-G-T | ** | ||||||||
2757588-C-A | 2889547-C-A | ** | ||||||||
2803683-T-C | 2935642-T-C | ** | ||||||||
2835785-C-T | 2967744-C-T | ** | ||||||||
2835798-G-A | 2967757-G-A | ** | ||||||||
2835802-C-T | 2967761-C-T | ** | ||||||||
2835803-A-G | 2967762-A-G | ** | ||||||||
2835806-T-A | 2967765-T-A | ** | ||||||||
2835813-T-C | 2967772-T-C | ** | ||||||||
2842924-C-A | 2974883-C-A | ** | ||||||||
2845813-C-A | 2977772-C-A | ** | ||||||||
2847883-C-A | 2979842-C-A | ** | ||||||||
2877260-C-A | 3009219-C-A | ** | ||||||||
2877865-C-A | 3009824-C-A | ** | ||||||||
2909065-T-A | 3041024-T-A | ** | ||||||||
2970877-C-A | 3102836-C-A | ** | ||||||||
3389046-TACTAAAA-T | 3521005-TACTAAAA-T | ** | ||||||||
3389074-A-G | 3521033-A-G | ** | ||||||||
3488669-A-G | 3620628-A-G | ** | ||||||||
3661333-G-T | 3793292-G-T | FGC29855 | ** | |||||||
3716237-T-C | 3848196-T-C | ** | ||||||||
3957610-T-G | 4089569-T-G | ** | ||||||||
3957616-T-TC | 4089575-T-TC | 12×A | ** | |||||||
3991694-A-G | 4123653-A-G | ** | ||||||||
4049834-C-A | 4181793-C-A | ** | ||||||||
4144046-G-A | 4276005-G-A | FTA55344 | ** | |||||||
4197003-A-G | 4328962-A-G | ** | ||||||||
4323611-G-T | 4455570-G-T | ** | ||||||||
4343168-G-T | 4475127-G-T | ** | ||||||||
4360643-G-T | 4492602-G-T | ** | ||||||||
4374723-T-A | 4506682-T-A | ** | ||||||||
4423439-C-A | 4555398-C-A | ** | ||||||||
4429334-G-A | 4561293-G-A | ** | ||||||||
4468368-G-C | 4600327-G-C | ** | ||||||||
4968436-T-G | 5100395-T-G | ** | ||||||||
5186772-G-A | 5318731-G-A | ** | ||||||||
5194434-G-T | 5326393-G-T | ** | ||||||||
5194445-G-T | 5326404-G-T | ** | ||||||||
5639368-TTAAAAATAA-T | 5771327-TTAAAAATAA-T | ** | ||||||||
5851451-C-G | 5983410-C-G | ** | ||||||||
6057738-A-G | 6189697-A-G | ** | ||||||||
6063502-C-G | 6195461-C-G | ** | ||||||||
6065090-C-A | 6197049-C-A | ** | ||||||||
6121202-C-A | 6253161-C-A | ** | ||||||||
6125017-T-A | 6256976-T-A | ** | ||||||||
6245038-TA-T | 6376997-TA-T | IR3_Dst | ** | |||||||
6403694-G-T | 6535653-G-T | ** | ||||||||
6427671-C-A | 6559630-C-A | ** | ||||||||
6461457-C-A | 6593416-C-A | ** | ||||||||
6534012-G-T | 6665971-G-T | ** | ||||||||
6539534-C-A | 6671493-C-A | ** | ||||||||
6543362-A-T | 6675321-A-T | ** | ||||||||
6671075-TA-T | 6803034-TA-T | ** | ||||||||
6752645-C-A | 6884604-C-A | ** | ||||||||
6775294-C-A | 6907253-C-A | ** | ||||||||
6782703-C-A | 6914662-C-A | ** | ||||||||
6785222-T-G | 6917181-T-G | ** | ||||||||
6788934-C-A | 6920893-C-A | ** | ||||||||
6880015-C-G | 7011974-C-G | ** | ||||||||
6897455-A-G | 7029414-A-G | ** | ||||||||
6933402-G-A | 7065361-G-A | BY62337 | ** | |||||||
6944072-C-T | 7076031-C-T | ** | ||||||||
6944073-A-G | 7076032-A-G | ** | ||||||||
6944081-C-T | 7076040-C-T | ** | ||||||||
6944082-A-G | 7076041-A-G | ** | ||||||||
6944083-C-T | 7076042-C-T | ** | ||||||||
6987320-T-C | 7119279-T-C | ** | ||||||||
6992358-G-A | 7124317-G-A | ** | ||||||||
6997905-A-T | 7129864-A-T | ** | ||||||||
6997908-A-G | 7129867-A-G | ** | ||||||||
6997915-T-A | 7129874-T-A | ** | ||||||||
6997937-A-C | 7129896-A-C | ** | ||||||||
6997941-A-C | 7129900-A-C | ** | ||||||||
7035376-C-A | 7167335-C-A | ** | ||||||||
7079213-C-A | 7211172-C-A | ** | ||||||||
7096668-G-T | 7228627-G-T | ** | ||||||||
7111454-G-A | 7243413-G-A | ** | ||||||||
7172815-C-A | 7304774-C-A | ** | ||||||||
7193739-C-A | 7325698-C-A | ** | ||||||||
7195219-C-A | 7327178-C-A | ** | ||||||||
7199541-G-T | 7331500-G-T | ** | ||||||||
7212719-A-T | 7344678-A-T | ** | ||||||||
7233158-G-T | 7365117-G-T | ** | ||||||||
7253741-C-A | 7385700-C-A | ** | ||||||||
7366019-C-A | 7497978-C-A | ** | ||||||||
7387848-A-G | 7519807-A-G | ** | ||||||||
7428461-C-A | 7560420-C-A | ** | ||||||||
7434999-C-A | 7566958-C-A | ** | ||||||||
7470077-C-A | 7602036-C-A | IR1_L | ** | |||||||
7518959-C-A | 7650918-C-A | ** | ||||||||
7538733-TA-T | 7670692-TA-T | ** | ||||||||
7580729-C-A | 7712688-C-A | ** | ||||||||
7580780-A-C | 7712739-A-C | ** | ||||||||
7614074-G-T | 7746033-G-T | ** | ||||||||
7677480-C-A | 7809439-C-A | ** | ||||||||
7679726-C-A | 7811685-C-A | ** | ||||||||
7681180-C-A | 7813139-C-A | ** | ||||||||
7689539-C-A | 7821498-C-A | ** | ||||||||
7701505-C-A | 7833464-C-A | ** | ||||||||
7702379-C-A | 7834338-C-A | ** | ||||||||
7703666-C-A | 7835625-C-A | ** | ||||||||
7722991-C-A | 7854950-C-A | ** | ||||||||
7735064-C-A | 7867023-C-A | ** | ||||||||
7771817-C-A | 7903776-C-A | ** | ||||||||
7772781-G-A | 7904740-G-A | FTB15814 | ** | |||||||
7772783-G-A | 7904742-G-A | ** | ||||||||
7777162-C-A | 7909121-C-A | ** | ||||||||
7801140-C-A | 7933099-C-A | ** | ||||||||
7817518-C-A | 7949477-C-A | ** | ||||||||
7994016-C-A | 8125975-C-A | ** | ||||||||
8016097-G-T | 8148056-G-T | ** | ||||||||
8108914-C-A | 8240873-C-A | ** | ||||||||
8138200-A-G | 8270159-A-G | ** | ||||||||
8138206-A-C | 8270165-A-C | ** | ||||||||
8138207-T-C | 8270166-T-C | ** | ||||||||
8138208-T-A | 8270167-T-A | ** | ||||||||
8143492-C-A | 8275451-C-A | ** | ||||||||
8164942-T-G | 8296901-T-G | ** | ||||||||
8198635-G-T | 8330594-G-T | ** | ||||||||
8216599-G-A | 8348558-G-A | ** | ||||||||
8341822-CCCAGA-C | 8473781-CCCAGA-C | ** | ||||||||
8347959-G-T | 8479918-G-T | ** | ||||||||
8392019-C-A | 8523978-C-A | ** | ||||||||
8605343-C-A | 8737302-C-A | ** | ||||||||
8661246-T-C | 8793205-T-C | ** | ||||||||
8666266-G-T | 8798225-G-T | ** | ||||||||
8704299-G-T | 8836258-G-T | ** | ||||||||
8778941-T-C | 8910900-T-C | ** | ||||||||
8778942-G-A | 8910901-G-A | ** | ||||||||
8778944-C-T | 8910903-C-T | ** | ||||||||
8778948-C-A | 8910907-C-A | ** | ||||||||
8778958-CAA-C | 8910917-CAA-C | ** | ||||||||
8788812-TT-C | 8920771-TT-C | ** | ||||||||
8788824-C-T | 8920783-C-T | ** | ||||||||
8788830-T-C | 8920789-T-C | ** | ||||||||
8822415-C-A | 8954374-C-A | ** | ||||||||
8824151-C-A | 8956110-C-A | ** | ||||||||
8843680-A-T | 8975639-A-T | ** | ||||||||
8855130-T-C | 8987089-T-C | ** | ||||||||
8896865-G-T | 9028824-G-T | ** | ||||||||
9125528-G-C | ** | |||||||||
8988019-C-T | 9150410-C-T | ** | ||||||||
9020593-C-A | 9182984-C-A | ** | ||||||||
9093447-C-A | 9255838-C-A | ** | ||||||||
9157966-C-A | 9320357-C-A | ** | ||||||||
9216473-A-T | 9378864-A-T | ** | ||||||||
9221705-A-G | 9384096-A-G | ** | ||||||||
9456678-G-A | 9619069-G-A | ** | ||||||||
9459808-A-C | 9622199-A-C | ** | ||||||||
9524182-A-G | 9686573-A-G | ** | ||||||||
9577147-C-A | 9739538-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9807152-C-A | 9969543-C-A | ** | ||||||||
9855857-A-G | 10018248-A-G | ** | ||||||||
9865146-A-T | 10027537-A-T | ** | ||||||||
9891728-A-G | 10054119-A-G | ** | ||||||||
9891734-T-C | 10054125-T-C | ** | ||||||||
9891766-T-C | 10054157-T-C | ** | ||||||||
9891774-A-T | 10054165-A-T | ** | ||||||||
9960825-C-A | 10123216-C-A | ** | ||||||||
9964077-C-A | 10126468-C-A | ** | ||||||||
9992788-C-A | 10155179-C-A | ** | ||||||||
10016552-C-A | 10178943-C-A | ** | ||||||||
10033008-C-A | 10195399-C-A | ** | ||||||||
10631965-C-A | ** | |||||||||
10683038-C-A | ** | |||||||||
10744377-C-T | ** | |||||||||
10744408-CCCTTA-C | ** | |||||||||
10744438-G-A | ** | |||||||||
10763130-C-G | ** | |||||||||
10766519-C-T | ** | |||||||||
10787295-C-A | ** | |||||||||
10789968-A-ACTCGGGGTGT | ** | |||||||||
10801523-A-C | ** | |||||||||
10829043-C-A | ** | |||||||||
10832269-T-A | ** | |||||||||
10876796-G-T | ** | |||||||||
10889755-C-A | ** | |||||||||
10900833-C-CCA | ** | |||||||||
10906584-G-T | ** | |||||||||
10987785-A-T | ** | |||||||||
10987806-C-A | ** | |||||||||
10987821-T-A | ** | |||||||||
10987825-A-ACTCTG | ** | |||||||||
11004431-A-ATTGCT | ** | |||||||||
11004441-A-ATTAAGGATGT | ** | |||||||||
13212854-TA-T | 11057178-TA-T | ** | ||||||||
13212883-A-T | 11057207-A-T | ** | ||||||||
13231603-GA-G | 11075927-GA-G | ** | ||||||||
13330237-C-G | 11174561-C-G | ** | ||||||||
13382439-A-T | 11226763-A-T | ** | ||||||||
13453286-T-C | 11297610-T-C | ** | ||||||||
13454379-G-A | 11298703-G-A | ** | ||||||||
13460039-C-A | 11304363-C-A | ** | ||||||||
13460591-C-A | 11304915-C-A | ** | ||||||||
13463772-G-T | 11308096-G-T | ** | ||||||||
13463776-G-GA | 11308100-G-GA | ** | ||||||||
13472342-C-A | 11316666-C-A | ** | ||||||||
13480201-C-A | 11324525-C-A | ** | ||||||||
13494185-C-A | 11338509-C-A | ** | ||||||||
13523017-T-G | 11367341-T-G | ** | ||||||||
13545566-C-A | 11389890-C-A | ** | ||||||||
13572703-C-A | 11417027-C-A | ** | ||||||||
13584643-C-A | 11428967-C-A | ** | ||||||||
13651846-T-C | 11496170-T-C | DYZ17 | ** | |||||||
13665573-G-A | 11509897-G-A | FT447662 | DYZ17 | ** | ||||||
13695497-GTCTCC-G | 11539821-GTCTCC-G | DYZ17 | ** | |||||||
13695519-G-A | 11539843-G-A | DYZ17 | ** | |||||||
13695531-C-A | 11539855-C-A | DYZ17 | ** | |||||||
11648702-A-G | FT450082 | DYZ17 | ** | |||||||
11656217-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11657088-GAAACA-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11657101-TG-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11657321-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
11671320-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
11675260-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
13803349-A-G | 11682643-A-G | DYZ17 | ** | |||||||
13853732-T-G | 11733026-T-G | DYZ17 | ** | |||||||
13857706-G-C | 11737000-G-C | DYZ17 | ** | |||||||
13857711-G-C | 11737005-G-C | DYZ17 | ** | |||||||
13857712-A-C | 11737006-A-C | DYZ17 | ** | |||||||
13858302-C-T | 11737596-C-T | FT50025 | DYZ17 | ** | ||||||
13858304-CG-C | 11737598-CG-C | DYZ17 | ** | |||||||
13891454-C-A | 11770748-C-A | ** | ||||||||
13894030-A-G | 11773324-A-G | ** | ||||||||
13895327-C-A | 11774621-C-A | ** | ||||||||
13900071-G-A | 11779365-G-A | BY91888 | ** | |||||||
13919279-C-A | 11798573-C-A | ** | ||||||||
13945212-T-A | 11824506-T-A | ** | ||||||||
13945219-A-C | 11824513-A-C | ** | ||||||||
13976342-A-G | 11855636-A-G | ** | ||||||||
13976554-CA-C | 11855848-CA-C | 9×A | ** | |||||||
14049030-C-T | 11928324-C-T | ** | ||||||||
14054933-C-T | 11934227-C-T | ** | ||||||||
14054940-G-A | 11934234-G-A | ** | ||||||||
14054944-C-T | 11934238-C-T | ** | ||||||||
14093508-A-G | 11972802-A-G | ** | ||||||||
14104311-C-A | 11983605-C-A | ** | ||||||||
14104314-G-C | 11983608-G-C | ** | ||||||||
14108203-C-A | 11987497-C-A | ** | ||||||||
14124206-T-A | 12003500-T-A | ** | ||||||||
14124224-G-C | 12003518-G-C | ** | ||||||||
14124245-C-G | 12003539-C-G | ** | ||||||||
14143343-T-G | 12022637-T-G | ** | ||||||||
14211948-C-A | 12091242-C-A | ** | ||||||||
14224523-C-A | 12103817-C-A | ** | ||||||||
14230705-T-C | 12109999-T-C | ** | ||||||||
14261487-T-C | 12140781-T-C | ** | ||||||||
14316174-C-A | 12195468-C-A | ** | ||||||||
14339918-C-A | 12219213-C-A | ** | ||||||||
14351338-G-A | 12230633-G-A | ** | ||||||||
14351539-C-A | 12230834-C-A | ** | ||||||||
14376557-C-A | 12255853-C-A | ** | ||||||||
14377088-C-A | 12256384-C-A | ** | ||||||||
14396217-G-A | 12275513-G-A | ** | ||||||||
14405809-G-T | 12285106-G-T | ** | ||||||||
14408615-T-C | 12287913-T-C | ** | ||||||||
14414751-C-A | 12294048-C-A | ** | ||||||||
14420070-C-A | 12299345-C-A | ** | ||||||||
14420771-C-A | 12300046-C-A | ** | ||||||||
14425972-C-G | 12305247-C-G | ** | ||||||||
14443194-A-T | 12322467-A-T | ** | ||||||||
14487580-G-T | 12366849-G-T | ** | ||||||||
14499038-G-T | 12387243-G-T | ** | ||||||||
14540785-A-G | 12428986-A-G | ** | ||||||||
14547488-A-C | 12435689-A-C | ** | ||||||||
14556589-C-A | 12444790-C-A | ** | ||||||||
14654129-C-G | 12542194-C-G | ** | ||||||||
14696332-C-A | 12584398-C-A | ** | ||||||||
14710433-G-A | 12598500-G-A | ** | ||||||||
14710453-C-A | 12598520-C-A | ** | ||||||||
14721535-T-G | 12609603-T-G | ** | ||||||||
14734961-G-A | 12623029-G-A | ** | ||||||||
14734965-G-A | 12623033-G-A | ** | ||||||||
14747499-G-A | 12635568-G-A | ** | ||||||||
14784797-C-A | 12672867-C-A | ** | ||||||||
14799738-G-T | 12687809-G-T | ** | ||||||||
14857801-CT-C | 12745867-CT-C | ** | ||||||||
14879129-C-A | 12767199-C-A | ** | ||||||||
14882296-C-T | 12770364-C-T | Y92434 | ** | |||||||
14884572-G-A | 12772638-G-A | ** | ||||||||
14884573-C-T | 12772639-C-T | ** | ||||||||
14884579-A-G | 12772645-A-G | ** | ||||||||
14884580-T-C | 12772646-T-C | ** | ||||||||
14900817-C-T | 12788884-C-T | ** | ||||||||
14984445-C-A | 12872513-C-A | ** | ||||||||
15011136-C-A | 12899221-C-A | ** | ||||||||
15027478-C-A | 12915566-C-A | ** | ||||||||
15080067-T-A | 12968157-T-A | ** | ||||||||
15114825-C-A | 13002912-C-A | ** | ||||||||
15115191-T-C | 13003278-T-C | ** | ||||||||
15143719-A-G | 13031806-A-G | ** | ||||||||
15203617-C-A | 13091703-C-A | ** | ||||||||
15208051-C-A | 13096137-C-A | ** | ||||||||
15211009-T-C | 13099095-T-C | ** | ||||||||
15236183-G-A | 13124269-G-A | ** | ||||||||
15236217-C-T | 13124303-C-T | ** | ||||||||
15260210-G-T | 13148294-G-T | ** | ||||||||
15271417-A-C | 13159506-A-C | ** | ||||||||
15271418-G-T | 13159507-G-T | ** | ||||||||
15271422-C-G | 13159511-C-G | ** | ||||||||
15271436-CT-C | 13159525-CT-C | ** | ||||||||
15271440-T-TG | 13159529-T-TG | ** | ||||||||
15324480-A-G | 13212598-A-G | ** | ||||||||
15353785-C-A | 13241904-C-A | ** | ||||||||
15353900-C-T | 13242019-C-T | ** | ||||||||
15353910-T-C | 13242029-T-C | BY7167 | ** | |||||||
15357920-T-A | 13246039-T-A | ** | ||||||||
15357928-C-T | 13246047-C-T | ** | ||||||||
15366446-TC-T | 13254566-TC-T | ** | ||||||||
15464343-C-A | 13352463-C-A | ** | ||||||||
15489475-T-C | 13377595-T-C | ** | ||||||||
15497416-C-A | 13385536-C-A | ** | ||||||||
15612420-A-G | 13500540-A-G | ** | ||||||||
15652460-C-A | 13540580-C-A | ** | ||||||||
15655064-C-A | 13543184-C-A | ** | ||||||||
15657159-C-A | 13545279-C-A | ** | ||||||||
15657251-C-A | 13545371-C-A | ** | ||||||||
15669659-C-A | 13557779-C-A | ** | ||||||||
15677435-G-T | 13565555-G-T | FT346698 | ** | |||||||
15710384-C-A | 13598504-C-A | ** | ||||||||
15746712-GA-G | 13634832-GA-G | ** | ||||||||
15771244-C-A | 13659364-C-A | Y21983 | ** | |||||||
15833902-G-A | 13722022-G-A | ** | ||||||||
15912084-T-G | 13800204-T-G | ** | ||||||||
15918390-T-C | 13806510-T-C | ** | ||||||||
15918403-G-C | 13806523-G-C | ** | ||||||||
15918408-G-T | 13806528-G-T | ** | ||||||||
15931280-C-A | 13819400-C-A | ** | ||||||||
15947733-C-A | 13835853-C-A | ** | ||||||||
15976177-A-T | 13864297-A-T | ** | ||||||||
16022529-T-A | 13910649-T-A | ** | ||||||||
16032908-T-G | 13921028-T-G | ** | ||||||||
16040914-C-A | 13929034-C-A | ** | ||||||||
16047798-C-A | 13935918-C-A | ** | ||||||||
16084073-G-T | 13972193-G-T | ** | ||||||||
16160886-C-G | 14049006-C-G | P8_Dst | ** | |||||||
16282161-A-C | 14170281-A-C | ** | ||||||||
16282165-G-C | 14170285-G-C | ** | ||||||||
16282165-GGGTGGGT-G | 14170285-GGGTGGGT-G | ** | ||||||||
16317256-C-T | 14205376-C-T | ** | ||||||||
16317257-C-A | 14205377-C-A | ** | ||||||||
16317264-C-T | 14205384-C-T | FT369055 | ** | |||||||
16317274-T-C | 14205394-T-C | ** | ||||||||
16317277-T-C | 14205397-T-C | ** | ||||||||
16317278-G-A | 14205398-G-A | FT382961 | ** | |||||||
16317283-A-G | 14205403-A-G | ** | ||||||||
16326329-C-A | 14214449-C-A | ** | ||||||||
16376540-C-A | 14264660-C-A | ** | ||||||||
16418136-A-T | 14306256-A-T | ** | ||||||||
16419095-C-A | 14307215-C-A | ** | ||||||||
16420968-C-A | 14309088-C-A | ** | ||||||||
16437534-A-G | 14325654-A-G | ** | ||||||||
16437549-T-A | 14325669-T-A | ** | ||||||||
16440926-C-A | 14329046-C-A | ** | ||||||||
16464365-A-G | 14352485-A-G | ** | ||||||||
16476375-C-G | 14364495-C-G | ** | ||||||||
16489525-T-C | 14377645-T-C | ** | ||||||||
16493328-A-T | 14381448-A-T | ** | ||||||||
16544584-AGGAG-A | 14432704-AGGAG-A | 4×GGAG | ** | |||||||
16553827-C-A | 14441947-C-A | ** | ||||||||
16562769-A-G | 14450889-A-G | ** | ||||||||
16571719-T-C | 14459839-T-C | ** | ||||||||
16581801-C-A | 14469921-C-A | ** | ||||||||
16616054-T-A | 14504174-T-A | ** | ||||||||
16642110-G-T | 14530230-G-T | ** | ||||||||
16777557-C-A | 14665677-C-A | ** | ||||||||
16786765-C-A | 14674885-C-A | ** | ||||||||
16808056-A-G | 14696176-A-G | ** | ||||||||
16822332-C-G | 14710452-C-G | ** | ||||||||
16822334-G-T | 14710454-G-T | ** | ||||||||
16822337-A-G | 14710457-A-G | ** | ||||||||
16825090-C-T | 14713210-C-T | ** | ||||||||
16862206-C-A | 14750326-C-A | ** | ||||||||
16889851-G-A | 14777971-G-A | ** | ||||||||
16890778-C-A | 14778898-C-A | ** | ||||||||
16897531-C-A | 14785651-C-A | ** | ||||||||
17014209-C-A | 14902329-C-A | ** | ||||||||
17019834-C-A | 14907954-C-A | ** | ||||||||
17089178-C-G | 14977298-C-G | ** | ||||||||
17092125-G-A | 14980245-G-A | ** | ||||||||
17104283-A-T | 14992403-A-T | ** | ||||||||
17120051-C-A | 15008171-C-A | ** | ||||||||
17196444-A-G | 15084564-A-G | ** | ||||||||
17211061-C-A | 15099181-C-A | ** | ||||||||
17212440-C-A | 15100560-C-A | ** | ||||||||
17315286-A-G | 15203406-A-G | ** | ||||||||
17337068-A-C | 15225188-A-C | ** | ||||||||
17347593-T-G | 15235713-T-G | ** | ||||||||
17408281-C-G | 15296401-C-G | ** | ||||||||
17408284-A-G | 15296404-A-G | ** | ||||||||
17408300-A-G | 15296420-A-G | ** | ||||||||
17411782-C-A | 15299902-C-A | ** | ||||||||
17498461-C-A | 15386581-C-A | ** | ||||||||
17504800-C-A | 15392920-C-A | ** | ||||||||
17513185-C-A | 15401305-C-A | ** | ||||||||
17558690-C-A | 15446810-C-A | ** | ||||||||
17580675-C-A | 15468795-C-A | ** | ||||||||
17588526-G-A | 15476646-G-A | ** | ||||||||
17632610-C-T | 15520730-C-T | ** | ||||||||
17658022-C-A | 15546142-C-A | ** | ||||||||
17676239-C-A | 15564359-C-A | ** | ||||||||
17676991-C-A | 15565111-C-A | ** | ||||||||
17714660-C-A | 15602780-C-A | ** | ||||||||
17716780-G-T | 15604900-G-T | ** | ||||||||
17737618-CAAAA-C | 15625738-CAAAA-C | 14×A | ** | |||||||
17773983-G-T | 15662103-G-T | ** | ||||||||
17885239-C-A | 15773359-C-A | ** | ||||||||
17909473-C-T | 15797593-C-T | ** | ||||||||
17932717-G-T | 15820837-G-T | ** | ||||||||
17964730-C-A | 15852850-C-A | ** | ||||||||
18020895-C-A | 15909015-C-A | ** | ||||||||
18030290-A-C | 15918410-A-C | ** | ||||||||
18053366-C-A | 15941486-C-A | ** | ||||||||
18071390-T-C | 15959510-T-C | ** | ||||||||
18074450-C-A | 15962570-C-A | ** | ||||||||
18077973-C-A | 15966093-C-A | ** | ||||||||
18088581-C-A | 15976701-C-A | ** | ||||||||
18386638-A-G | 16274758-A-G | P6_Gap | ** | |||||||
18388418-C-A | 16276538-C-A | P6_Gap | ** | |||||||
18426013-G-GA | 16314133-G-GA | P6_Gap | ** | |||||||
18544796-T-A | 16432916-T-A | ** | ||||||||
18544803-A-C | 16432923-A-C | ** | ||||||||
18544810-T-G | 16432930-T-G | ** | ||||||||
18544811-G-T | 16432931-G-T | ** | ||||||||
18572810-C-A | 16460930-C-A | ** | ||||||||
18643409-AC-A | 16531529-AC-A | ** | ||||||||
18717673-A-T | 16605793-A-T | ** | ||||||||
18884160-C-A | 16772280-C-A | ** | ||||||||
18889163-C-A | 16777283-C-A | ** | ||||||||
18927935-G-A | 16816055-G-A | ** | ||||||||
18950529-C-A | 16838649-C-A | ** | ||||||||
18952089-C-A | 16840209-C-A | ** | ||||||||
18993276-T-A | 16881396-T-A | ** | ||||||||
18993279-G-T | 16881399-G-T | ** | ||||||||
18993281-C-T | 16881401-C-T | ** | ||||||||
18993286-A-G | 16881406-A-G | ** | ||||||||
18993287-C-G | 16881407-C-G | ** | ||||||||
18993294-T-G | 16881414-T-G | ** | ||||||||
18993299-C-T | 16881419-C-T | ** | ||||||||
18993303-C-A | 16881423-C-A | ** | ||||||||
18993321-C-G | 16881441-C-G | ** | ||||||||
18993324-C-A | 16881444-C-A | ** | ||||||||
19008698-C-A | 16896818-C-A | ** | ||||||||
19040207-C-A | 16928327-C-A | ** | ||||||||
19110023-C-A | 16998143-C-A | ** | ||||||||
19161088-C-A | 17049208-C-A | ** | ||||||||
19178740-C-A | 17066860-C-A | ** | ||||||||
19213454-T-C | 17101574-T-C | ** | ||||||||
19243330-C-A | 17131450-C-A | ** | ||||||||
19284115-C-A | 17172235-C-A | ** | ||||||||
19412990-C-A | 17301110-C-A | ** | ||||||||
19436174-C-A | 17324294-C-A | ** | ||||||||
19439625-G-A | 17327745-G-A | ** | ||||||||
19439630-AT-A | 17327750-AT-A | ** | ||||||||
19444084-C-A | 17332204-C-A | ** | ||||||||
19464069-G-T | 17352189-G-T | Y104838 | ** | |||||||
19496355-A-G | 17384475-A-G | ** | ||||||||
19496362-A-T | 17384482-A-T | ** | ||||||||
19496362-A-AG | 17384482-A-AG | ** | ||||||||
19496368-A-G | 17384488-A-G | ** | ||||||||
19508183-T-C | 17396303-T-C | ** | ||||||||
19508288-C-T | 17396408-C-T | ** | ||||||||
19509702-C-A | 17397822-C-A | ** | ||||||||
19518014-G-T | 17406134-G-T | ** | ||||||||
19522756-C-A | 17410876-C-A | ** | ||||||||
19547453-C-CAA | 17435573-C-CAA | 24×A | ** | |||||||
19552273-C-A | 17440393-C-A | ** | ||||||||
19562978-C-A | 17451098-C-A | ** | ||||||||
19564619-C-A | 17452739-C-A | ** | ||||||||
19678419-C-A | 17566539-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19755027-TC-T | 17643147-TC-T | P5_Prx | ** | |||||||
19827417-G-T | 17715537-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19992518-C-A | 17880638-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
20560575-G-T | 18398689-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20614723-TA-T | 18452837-TA-T | P4_Prx | ** | |||||||
20815853-T-C | 18653967-T-C | P4_Gap | ** | |||||||
20908155-T-C | 18746269-T-C | P4_Dst | ** | |||||||
21113054-A-G | 18951168-A-G | ** | ||||||||
21113060-C-T | 18951174-C-T | ** | ||||||||
21113061-A-G | 18951175-A-G | ** | ||||||||
21136321-C-A | 18974435-C-A | ** | ||||||||
21138533-G-C | 18976647-G-C | FT402285 | ** | |||||||
21155722-A-G | 18993836-A-G | ** | ||||||||
21155734-A-G | 18993848-A-G | ** | ||||||||
21155736-T-C | 18993850-T-C | ** | ||||||||
21155737-G-A | 18993851-G-A | ** | ||||||||
21155747-G-C | 18993861-G-C | ** | ||||||||
21155749-G-A | 18993863-G-A | ** | ||||||||
21155753-G-C | 18993867-G-C | ** | ||||||||
21155760-G-A | 18993874-G-A | ** | ||||||||
21163483-A-G | 19001597-A-G | ** | ||||||||
21200657-C-A | 19038771-C-A | ** | ||||||||
21209906-A-G | 19048020-A-G | ** | ||||||||
21211983-G-T | 19050097-G-T | ** | ||||||||
21233205-A-C | 19071319-A-C | BY7115 | ** | |||||||
21237755-C-A | 19075869-C-A | ** | ||||||||
21282001-T-C | 19120115-T-C | ** | ||||||||
21317738-A-G | 19155852-A-G | ** | ||||||||
21326541-T-A | 19164655-T-A | ** | ||||||||
21326543-TC-T | 19164657-TC-T | ** | ||||||||
21345060-C-A | 19183174-C-A | ** | ||||||||
21409442-A-T | 19247556-A-T | ** | ||||||||
21451414-G-A | 19289528-G-A | ** | ||||||||
21650962-C-A | 19489076-C-A | ** | ||||||||
21682178-A-G | 19520292-A-G | ** | ||||||||
21795516-T-C | 19633630-T-C | ** | ||||||||
21814824-C-A | 19652938-C-A | ** | ||||||||
21917053-C-A | 19755167-C-A | ** | ||||||||
21932593-C-A | 19770707-C-A | ** | ||||||||
21932701-T-TC | 19770815-T-TC | ** | ||||||||
21932717-C-G | 19770831-C-G | ** | ||||||||
21932720-T-G | 19770834-T-G | ** | ||||||||
21939602-C-A | 19777716-C-A | ** | ||||||||
21947187-C-A | 19785301-C-A | ** | ||||||||
21984157-G-AA | 19822271-G-AA | ** | ||||||||
21984160-C-A | 19822274-C-A | ** | ||||||||
22002012-C-T | 19840126-C-T | ** | ||||||||
22002027-T-A | 19840141-T-A | ** | ||||||||
22032768-C-A | 19870882-C-A | ** | ||||||||
22080446-C-A | 19918560-C-A | ** | ||||||||
22139423-C-A | 19977537-C-A | ** | ||||||||
22166149-C-A | 20004263-C-A | ** | ||||||||
22199291-T-A | 20037405-T-A | ** | ||||||||
22210849-T-C | 20048963-T-C | ** | ||||||||
22211279-A-G | 20049393-A-G | ** | ||||||||
22252457-T-A | 20090571-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
22252476-A-T | 20090590-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
22256244-AAGGTGGTATGTCCAG-A | 20094358-AAGGTGGTATGTCCAG-A | DYZ19 | ** | |||||||
22289342-C-T | 20127456-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
22289353-G-C | 20127467-G-C | DYZ19 | ** | |||||||
22330265-A-G | 20168379-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
22483492-G-A | 20321606-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
22522380-C-A | 20360494-C-A | ** | ||||||||
22565006-C-A | 20403120-C-A | ** | ||||||||
22580131-A-G | 20418245-A-G | ** | ||||||||
22587900-C-G | 20426014-C-G | ** | ||||||||
22587902-T-C | 20426016-T-C | ** | ||||||||
22587903-G-A | 20426017-G-A | ** | ||||||||
22665765-G-T | 20503879-G-T | ** | ||||||||
22696396-G-T | 20534510-G-T | ** | ||||||||
22712892-C-A | 20551006-C-A | ** | ||||||||
22720544-A-G | 20558658-A-G | ** | ||||||||
22767308-T-C | 20605422-T-C | ** | ||||||||
22793190-C-A | 20631304-C-A | ** | ||||||||
22864529-A-T | 20702643-A-T | ** | ||||||||
22864533-T-C | 20702647-T-C | ** | ||||||||
22864535-A-G | 20702649-A-G | ** | ||||||||
22864542-A-G | 20702656-A-G | ** | ||||||||
22904265-C-A | 20742379-C-A | ** | ||||||||
22950724-CCTCTG-C | 20788838-CCTCTG-C | ** | ||||||||
22972785-C-A | 20810899-C-A | ** | ||||||||
23080887-C-A | 20919001-C-A | ** | ||||||||
23086716-T-A | 20924830-T-A | ** | ||||||||
23086722-C-G | 20924836-C-G | ** | ||||||||
23086727-C-A | 20924841-C-A | ** | ||||||||
23086744-C-G | 20924858-C-G | ** | ||||||||
23086745-T-C | 20924859-T-C | ** | ||||||||
23086746-G-A | 20924860-G-A | ** | ||||||||
23086752-T-C | 20924866-T-C | ** | ||||||||
23086759-C-T | 20924873-C-T | ** | ||||||||
23086760-T-C | 20924874-T-C | ** | ||||||||
23086761-G-A | 20924875-G-A | ** | ||||||||
23095023-G-T | 20933137-G-T | ** | ||||||||
23097787-T-A | 20935901-T-A | ** | ||||||||
23097792-A-C | 20935906-A-C | ** | ||||||||
23097796-A-G | 20935910-A-G | FT292428 | ** | |||||||
23225236-C-A | 21063350-C-A | ** | ||||||||
23236690-T-G | 21074804-T-G | ** | ||||||||
23248331-C-A | 21086445-C-A | ** | ||||||||
23249308-C-A | 21087422-C-A | ** | ||||||||
23284167-C-A | 21122281-C-A | ** | ||||||||
23343637-T-C | 21181751-T-C | ** | ||||||||
23343753-G-A | 21181867-G-A | ** | ||||||||
23410865-C-A | 21248979-C-A | ** | ||||||||
23442831-A-G | 21280945-A-G | ** | ||||||||
23448916-C-A | 21287030-C-A | ** | ||||||||
23465956-G-T | 21304070-G-T | ** | ||||||||
23475365-T-G | 21313479-T-G | ** | ||||||||
23475372-C-T | 21313486-C-T | ** | ||||||||
23475381-G-A | 21313495-G-A | ** | ||||||||
23475391-G-A | 21313505-G-A | ** | ||||||||
23555013-C-T | 21393127-C-T | ** | ||||||||
23569003-C-A | 21407117-C-A | ** | ||||||||
23609085-C-A | 21447199-C-A | ** | ||||||||
23609590-C-A | 21447704-C-A | ** | ||||||||
23620798-C-A | 21458912-C-A | ** | ||||||||
23627941-G-A | 21466055-G-A | ** | ||||||||
23745316-G-C | 21583430-G-C | ** | ||||||||
23770068-A-G | 21608182-A-G | ** | ||||||||
23837128-C-A | 21675242-C-A | ** | ||||||||
23875780-C-A | 21713894-C-A | ** | ||||||||
23898736-T-TG | 21736850-T-TG | ** | ||||||||
23954941-C-T | 21808794-C-T | ** | ||||||||
23961105-G-T | 21814958-G-T | ** | ||||||||
23994580-TTCTGTCA-T | 21848433-TTCTGTCA-T | ** | ||||||||
24001479-C-A | 21855332-C-A | ** | ||||||||
24381353-C-A | 22235206-C-A | ** | ||||||||
24406576-G-A | 22260429-G-A | ** | ||||||||
24443514-G-T | 22297367-G-T | ** | ||||||||
24511206-T-C | 22365059-T-C | ** | ||||||||
24871293-C-A | 22725146-C-A | IR1_R | ** | |||||||
24876796-G-T | 22730649-G-T | g1 | ** | |||||||
24886662-C-A | 22740515-C-A | BY226303 | g1 | ** | ||||||
25804972-G-A | 23658825-G-A | P1_b3 | ** | |||||||
25985389-T-TC | 23839242-T-TC | P1_Y1 | ** | |||||||
26454953-C-A | 24308806-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27636378-G-T | 25490231-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27838450-T-A | 25692303-T-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28081871-T-C | 25935724-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28081885-C-CCAT | 25935738-C-CCAT | P1_Y2 | ** | |||||||
28111760-G-T | 25965613-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
28461419-C-T | 26315272-C-T | ** | ||||||||
28514896-C-A | 26368749-C-A | ** | ||||||||
28548059-T-G | 26401912-T-G | ** | ||||||||
28567553-C-A | 26421406-C-A | ** | ||||||||
28673568-T-C | 26527421-T-C | ** | ||||||||
28745163-C-A | 26599016-C-A | ** | ||||||||
28755167-G-A | 26609020-G-A | ** | ||||||||
56827174-T-C | ** | |||||||||
56833754-T-G | ** | |||||||||
56837414-T-C | ** | |||||||||
14788-T-A | ** | |||||||||
18951639-T-C | 16839759-T-C | ** | ||||||||
8154017-A-G | 8285976-A-G | ** | ||||||||
5354957-A-AT | 5486916-A-AT | 9×T | ** | |||||||
10982155-T-G | ** | |||||||||
14048905-T-C | 11928199-T-C | ** | ||||||||
2900075-T-C | 3032034-T-C | ** | ||||||||
2941971-G-A | 3073930-G-A | ** | ||||||||
3137555-C-A | 3269514-C-A | ** | ||||||||
6046157-G-A | 6178116-G-A | ** | ||||||||
7020818-A-C | 7152777-A-C | ** | ||||||||
7020823-T-C | 7152782-T-C | ** | ||||||||
7020836-T-G | 7152795-T-G | ** | ||||||||
7316712-T-C | 7448671-T-C | ** | ||||||||
8062820-C-T | 8194779-C-T | FTA9929 | ** | |||||||
9623617-C-T | 9786008-C-T | IR3_Prx | ** | |||||||
10001809-CA-C | 10164200-CA-C | ** | ||||||||
13611206-A-G | 11455530-A-G | ** | ||||||||
14278502-A-G | 12157796-A-G | ** | ||||||||
14740067-T-C | 12628135-T-C | ** | ||||||||
14845403-T-C | 12733469-T-C | ** | ||||||||
15628794-T-A | 13516914-T-A | ** | ||||||||
16022759-A-C | 13910879-A-C | ** | ||||||||
16081168-A-G | 13969288-A-G | ** | ||||||||
16826871-A-G | 14714991-A-G | ** | ||||||||
17269606-T-C | 15157726-T-C | ** | ||||||||
18690156-A-G | 16578276-A-G | ** | ||||||||
18951621-C-A | 16839741-C-A | ** | ||||||||
18951649-C-T | 16839769-C-T | ** | ||||||||
18951655-A-G | 16839775-A-G | ** | ||||||||
19178493-G-T | 17066613-G-T | ** | ||||||||
19721818-T-G | 17609938-T-G | P5_Prx | ** | |||||||
20233046-C-A | 18071160-C-A | P5_Dst | 10×A | ** | ||||||
21942348-A-G | 19780462-A-G | ** | ||||||||
22435694-G-T | 20273808-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
24605211-G-GT | 22459064-G-GT | P3_t2 | ** | |||||||
25369759-C-T | 23223612-C-T | P2_r2 | ** | |||||||
25533342-AT-A | 23387195-AT-A | P1_gr1 | ** | |||||||
13489629-C-T | 11333953-C-T | *** | ||||||||
13852017-G-C | 11731311-G-C | DYZ17 | *** | |||||||
13705060-T-C | 11549384-T-C | DYZ17 | *** | |||||||
10020511-C-A | 10182902-C-A | 10×AAAAG | *** | |||||||
58974138-G-T | 56827991-G-T | *** | ||||||||
18354164-T-A | 16242284-T-A | P6_Prx | 13×AGAA | *** | ||||||
58975654-G-GTCCATTCCAT | 56829507-G-GTCCATTCCAT | 4×TCCAT | *** | |||||||
58975682-C-G | 56829535-C-G | *** | ||||||||
58975684-T-A | 56829537-T-A | *** | ||||||||
13838531-A-C | 11717825-A-C | DYZ17 | *** | |||||||
13864450-G-A | 11743744-G-A | FT234019 | DYZ17 | *** | ||||||
23347909-CT-C | 21186023-CT-C | 10×T | *** | |||||||
13325637-G-T | 11169961-G-T | *** | ||||||||
13325663-ATT-A | 11169987-ATT-A | *** | ||||||||
13447666-C-T | 11291990-C-T | *** | ||||||||
13453840-C-CTCCATTCCATTCCAT,T | 11298164-C-CTCCATTCCATTCCAT,T | 10×TCCAT | *** | |||||||
13459577-T-G | 11303901-T-G | *** | ||||||||
13467811-TG-T | 11312135-TG-T | *** | ||||||||
13479314-T-A | 11323638-T-A | *** | ||||||||
13715384-A-G | 11559708-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
13745426-G-A | 11589750-G-A | DYZ17 | *** | |||||||
13805376-G-A | 11684670-G-A | DYZ17 | *** | |||||||
13810901-A-G | 11690195-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
13832608-T-G | 11711902-T-G | DYZ17 | *** | |||||||
13839745-G-T | 11719039-G-T | DYZ17 | *** | |||||||
15799251-T-C | 13687371-T-C | *** | ||||||||
28587458-G-A | 26441311-G-A | *** | ||||||||
28587474-G-T | 26441327-G-T | *** | ||||||||
28587490-A-T | 26441343-A-T | *** | ||||||||
28587510-G-T | 26441363-G-T | *** | ||||||||
58974110-C-T | 56827963-C-T | *** | ||||||||
58974142-A-T | 56827995-A-T | *** | ||||||||
58974161-G-T | 56828014-G-T | *** | ||||||||
58974176-C-G | 56828029-C-G | *** | ||||||||
13815030-C-A | 11694324-C-A | FT242500 | DYZ17 | *** | ||||||
13839835-CGGGTG-C,G | 11719129-CGGGTG-C,G | DYZ17 | *** | |||||||
13477450-C-T | 11321774-C-T | *** | ||||||||
13489724-C-A | 11334048-C-A | *** | ||||||||
7359768-AATAT-A | 7491727-AATAT-A | 10×AT | *** | |||||||
17872639-CTTTT-C | 15760759-CTTTT-C | 17×T | *** | |||||||
7914499-C-A | 8046458-C-A | *** | ||||||||
13450314-CATTTA-C | 11294638-CATTTA-C | *** | ||||||||
8160162-C-A | 8292121-C-A | *** | ||||||||
13140223-TTGAAC-C,T | 10629709-TTGAAC-C,T | *** | ||||||||
27232111-TTTTC-CTTTC,T | 25085964-TTTTC-CTTTC,T | P1_g3 | 18×TTTC | *** | ||||||
16357374-G-A | 14245494-G-A | A11632 | BY43434 | *** | ||||||
13477464-A-G | 11321788-A-G | *** | ||||||||
13477467-T-C | 11321791-T-C | *** | ||||||||
13477480-T-C | 11321804-T-C | *** | ||||||||
2768130-G-A | 2900089-G-A | *** | ||||||||
2863154-G-A | 2995113-G-A | SK1055 | *** | |||||||
4062811-C-A | 4194770-C-A | *** | ||||||||
5412318-CA-C | 5544277-CA-C | *** | ||||||||
6000853-G-T | 6132812-G-T | *** | ||||||||
6631867-G-T | 6763826-G-T | *** | ||||||||
6658741-C-A | 6790700-C-A | *** | ||||||||
6778403-C-A | 6910362-C-A | *** | ||||||||
6817013-GA-G | 6948972-GA-G | 8×A | *** | |||||||
6866385-C-A | 6998344-C-A | *** | ||||||||
6947344-A-G | 7079303-A-G | *** | ||||||||
6990852-C-A | 7122811-C-A | *** | ||||||||
6994465-C-A | 7126424-C-A | *** | ||||||||
7031948-C-T | 7163907-C-T | *** | ||||||||
7031976-C-A | 7163935-C-A | *** | ||||||||
7250384-G-A | 7382343-G-A | *** | ||||||||
7262803-C-A | 7394762-C-A | *** | ||||||||
7341921-C-A | 7473880-C-A | *** | ||||||||
7410754-C-A | 7542713-C-A | *** | ||||||||
7431564-C-A | 7563523-C-A | *** | ||||||||
7435846-T-C | 7567805-T-C | Y84148 | *** | |||||||
7445329-C-A | 7577288-C-A | FT150763 | *** | |||||||
7557987-C-A | 7689946-C-A | *** | ||||||||
7625047-A-G | 7757006-A-G | *** | ||||||||
7626380-C-A | 7758339-C-A | *** | ||||||||
7719050-C-A | 7851009-C-A | *** | ||||||||
7749567-C-A | 7881526-C-A | *** | ||||||||
7787181-C-T | 7919140-C-T | *** | ||||||||
7854505-C-A | 7986464-C-A | *** | ||||||||
7869717-C-A | 8001676-C-A | *** | ||||||||
7891301-C-T | 8023260-C-T | *** | ||||||||
7898880-C-A | 8030839-C-A | *** | ||||||||
7945533-C-A | 8077492-C-A | *** | ||||||||
8120893-TGCAAA-T | 8252852-TGCAAA-T | *** | ||||||||
8142925-TG-T | 8274884-TG-T | *** | ||||||||
8144909-C-A | 8276868-C-A | *** | ||||||||
8308629-CA-C | 8440588-CA-C | *** | ||||||||
8397473-C-A | 8529432-C-A | *** | ||||||||
8412890-C-A | 8544849-C-A | *** | ||||||||
8431799-C-A | 8563758-C-A | *** | ||||||||
8439835-C-A | 8571794-C-A | *** | ||||||||
8506324-C-A | 8638283-C-A | *** | ||||||||
8541694-C-A | 8673653-C-A | *** | ||||||||
8587735-AC-A | 8719694-AC-A | *** | ||||||||
8615912-C-A | 8747871-C-A | *** | ||||||||
8626201-C-A | 8758160-C-A | *** | ||||||||
8853330-A-G | 8985289-A-G | *** | ||||||||
9427321-TG-T | 9589712-TG-T | *** | ||||||||
9461111-G-T | 9623502-G-T | *** | ||||||||
9774932-C-A | 9937323-C-A | *** | ||||||||
9798300-C-A | 9960691-C-A | *** | ||||||||
9813349-C-A | 9975740-C-A | *** | ||||||||
9845621-C-A | 10008012-C-A | *** | ||||||||
9858292-C-A | 10020683-C-A | *** | ||||||||
9874835-G-T | 10037226-G-T | *** | ||||||||
10025740-C-A | 10188131-C-A | *** | ||||||||
10035355-C-A | 10197746-C-A | *** | ||||||||
10662088-C-A | *** | |||||||||
10670941-C-A | *** | |||||||||
10761275-A-G | *** | |||||||||
10796150-T-A | *** | |||||||||
10845705-C-CATTT | *** | |||||||||
11031585-C-T | *** | |||||||||
13209193-C-A | 11053517-C-A | *** | ||||||||
13220141-G-A | 11064465-G-A | *** | ||||||||
13280496-C-A | 11124820-C-A | *** | ||||||||
13456987-C-A | 11301311-C-A | *** | ||||||||
13457467-C-A | 11301791-C-A | *** | ||||||||
13459951-C-T | 11304275-C-T | *** | ||||||||
13462445-T-C | 11306769-T-C | *** | ||||||||
13471747-A-T | 11316071-A-T | *** | ||||||||
13477472-G-A | 11321796-G-A | *** | ||||||||
13477487-G-A | 11321811-G-A | *** | ||||||||
13642570-T-C | 11486894-T-C | *** | ||||||||
13660465-C-A | 11504789-C-A | DYZ17 | *** | |||||||
11643777-T-A,C | DYZ17 | *** | ||||||||
13811282-T-A | 11690576-T-A | DYZ17 | *** | |||||||
13812146-T-C | 11691440-T-C | DYZ17 | *** | |||||||
13839695-G-A | 11718989-G-A | DYZ17 | *** | |||||||
14148627-T-C | 12027921-T-C | *** | ||||||||
14150653-C-T | 12029947-C-T | *** | ||||||||
14168708-C-A | 12048002-C-A | *** | ||||||||
14264292-C-A | 12143586-C-A | *** | ||||||||
14392318-C-A | 12271614-C-A | *** | ||||||||
14412786-CA-C | 12292083-CA-C | 8×A | *** | |||||||
14415737-T-A | 12295034-T-A | *** | ||||||||
14442550-C-A | 12321823-C-A | *** | ||||||||
14479486-C-A | 12358755-C-A | *** | ||||||||
14480775-C-A | 12360044-C-A | *** | ||||||||
14494937-C-A | 12383134-C-A | *** | ||||||||
14523617-C-A | 12411818-C-A | *** | ||||||||
14527912-A-G | 12416113-A-G | *** | ||||||||
14597234-G-T | 12485434-G-T | *** | ||||||||
14600824-C-T | 12489026-C-T | FT384737 | *** | |||||||
14623721-C-A | 12511919-C-A | *** | ||||||||
14842556-C-A | 12730622-C-A | *** | ||||||||
14844629-C-A | 12732695-C-A | *** | ||||||||
14854159-G-A | 12742225-G-A | *** | ||||||||
14857448-C-A | 12745514-C-A | *** | ||||||||
14984796-C-A | 12872864-C-A | *** | ||||||||
15060987-TG-T | 12949079-TG-T | *** | ||||||||
15194494-GGATTTGAAT-G | 13082580-GGATTTGAAT-G | *** | ||||||||
15257804-A-G | 13145888-A-G | *** | ||||||||
15346671-T-C | 13234790-T-C | *** | ||||||||
15349914-C-A | 13238033-C-A | *** | ||||||||
15355907-C-A | 13244026-C-A | *** | ||||||||
15451141-T-C | 13339261-T-C | *** | ||||||||
15452914-CA-C | 13341034-CA-C | *** | ||||||||
15455235-C-A | 13343355-C-A | *** | ||||||||
15466277-CA-C | 13354397-CA-C | 9×A | *** | |||||||
15535369-G-A | 13423489-G-A | *** | ||||||||
15722733-C-A | 13610853-C-A | *** | ||||||||
15941243-C-A | 13829363-C-A | *** | ||||||||
15952450-C-A | 13840570-C-A | *** | ||||||||
16042438-T-C | 13930558-T-C | *** | ||||||||
16049170-C-A | 13937290-C-A | *** | ||||||||
16213775-C-A | 14101895-C-A | *** | ||||||||
16290351-T-A | 14178471-T-A | *** | ||||||||
16350068-G-T | 14238188-G-T | *** | ||||||||
16581878-CATATTATAT-C | 14469998-CATATTATAT-C | *** | ||||||||
16598983-AC-A,AA | 14487103-AC-A,AA | *** | ||||||||
16635374-C-A | 14523494-C-A | *** | ||||||||
16717463-C-A | 14605583-C-A | *** | ||||||||
16777496-G-A | 14665616-G-A | *** | ||||||||
16792870-A-G | 14680990-A-G | *** | ||||||||
17057434-C-A | 14945554-C-A | *** | ||||||||
17079242-C-A | 14967362-C-A | *** | ||||||||
17189750-C-A | 15077870-C-A | *** | ||||||||
17192946-AATAT-A | 15081066-AATAT-A | *** | ||||||||
17199393-A-G | 15087513-A-G | *** | ||||||||
17315830-C-A | 15203950-C-A | *** | ||||||||
17418011-TG-T | 15306131-TG-T | *** | ||||||||
17419439-ATTTTTTTT-A | 15307559-ATTTTTTTT-A | 25×T | *** | |||||||
17534495-CT-C | 15422615-CT-C | *** | ||||||||
17632126-GT-G | 15520246-GT-G | *** | ||||||||
17676973-C-A | 15565093-C-A | *** | ||||||||
17801431-A-G | 15689551-A-G | *** | ||||||||
17922391-G-T | 15810511-G-T | *** | ||||||||
17945323-C-A | 15833443-C-A | *** | ||||||||
17960966-CTTT-C,CTT | 15849086-CTTT-C,CTT | 18×T | *** | |||||||
18005184-A-G | 15893304-A-G | P7_Gap | *** | |||||||
18039395-TTGC-T | 15927515-TTGC-T | *** | ||||||||
18385679-C-A | 16273799-C-A | P6_Gap | *** | |||||||
18414353-C-A | 16302473-C-A | P6_Gap | *** | |||||||
18634465-A-T | 16522585-A-T | *** | ||||||||
18673581-C-A | 16561701-C-A | *** | ||||||||
18718689-TTGTATCTATCTATCTATCTATC-T | 16606809-TTGTATCTATCTATCTATCTATC-T | *** | ||||||||
18738361-C-A | 16626481-C-A | *** | ||||||||
18809639-G-A | 16697759-G-A | *** | ||||||||
18887975-G-A | 16776095-G-A | *** | ||||||||
18933536-T-C | 16821656-T-C | *** | ||||||||
18952976-G-A | 16841096-G-A | *** | ||||||||
19134140-C-A | 17022260-C-A | *** | ||||||||
19189983-A-G | 17078103-A-G | *** | ||||||||
19215754-C-A | 17103874-C-A | *** | ||||||||
19290962-C-A | 17179082-C-A | *** | ||||||||
19419884-C-T | 17308004-C-T | *** | ||||||||
19476787-C-A | 17364907-C-A | *** | ||||||||
19754996-C-T | 17643116-C-T | P5_Prx | *** | |||||||
19754999-C-T | 17643119-C-T | P5_Prx | 7×TCTT | *** | ||||||
20808294-C-A | 18646408-C-A | P4_Gap | *** | |||||||
21073471-C-A | 18911585-C-A | *** | ||||||||
21211159-T-C | 19049273-T-C | *** | ||||||||
21253824-G-T | 19091938-G-T | *** | ||||||||
21299481-C-T | 19137595-C-T | *** | ||||||||
21362742-T-C | 19200856-T-C | *** | ||||||||
21384541-C-A | 19222655-C-A | *** | ||||||||
21395333-C-A | 19233447-C-A | *** | ||||||||
21642962-C-A | 19481076-C-A | *** | ||||||||
21658704-C-A | 19496818-C-A | *** | ||||||||
21700078-C-A | 19538192-C-A | *** | ||||||||
22096345-C-A | 19934459-C-A | *** | ||||||||
22105247-C-A | 19943361-C-A | *** | ||||||||
22124691-C-T | 19962805-C-T | *** | ||||||||
22166816-C-A | 20004930-C-A | *** | ||||||||
22273500-C-A | 20111614-C-A | FT454645 | DYZ19 | *** | ||||||
22447027-C-A | 20285141-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
22628316-C-A | 20466430-C-A | *** | ||||||||
22631456-C-A | 20469570-C-A | *** | ||||||||
22935456-A-G | 20773570-A-G | *** | ||||||||
22953308-G-A | 20791422-G-A | *** | ||||||||
23058415-T-C | 20896529-T-C | *** | ||||||||
23314104-C-A | 21152218-C-A | *** | ||||||||
23411193-C-A | 21249307-C-A | *** | ||||||||
23654586-C-A | 21492700-C-A | *** | ||||||||
23766687-C-A | 21604801-C-A | *** | ||||||||
23772680-C-A | 21610794-C-A | *** | ||||||||
23977183-C-T | 21831036-C-T | *** | ||||||||
23993962-G-T | 21847815-G-T | *** | ||||||||
24483831-TTA-T | 22337684-TTA-T | *** | ||||||||
24504478-C-A | 22358331-C-A | *** | ||||||||
28679385-C-A | 26533238-C-A | *** | ||||||||
56832542-C-G | *** | |||||||||
56833241-C-A | *** | |||||||||
56858153-TA-T,TAA | 9×A | *** | ||||||||
22784825-T-TA | 20622939-T-TA | 9×A | *** | |||||||
19261128-CTTTTT-C | 17149248-CTTTTT-C | 21×T | *** | |||||||
13236194-A-G | 11080518-A-G | *** | ||||||||
21902215-A-G | 19740329-A-G | *** | ||||||||
10909700-C-A | *** | |||||||||
10772527-ACAC-A | *** | |||||||||
10772540-C-A | *** | |||||||||
10772541-C-T | *** | |||||||||
10909707-CT-C | *** | |||||||||
28812767-A-G | 26666620-A-G | *** | ||||||||
10772517-ATTCCATT-A | *** | |||||||||
2746792-G-A | 2878751-G-A | FT135244 | *** | |||||||
2810366-ATTTTTTT-A,AT | 2942325-ATTTTTTT-A,AT | 23×T | *** | |||||||
2898271-T-C | 3030230-T-C | *** | ||||||||
3206198-A-G | 3338157-A-G | *** | ||||||||
3451484-C-T | 3583443-C-T | *** | ||||||||
4216437-G-T | 4348396-G-T | *** | ||||||||
4275437-C-CAA | 4407396-C-CAA | 19×A | *** | |||||||
4715613-A-G | 4847572-A-G | *** | ||||||||
5190004-GA-G,GAAA | 5321963-GA-G,GAAA | 16×A | *** | |||||||
5570209-AT-A,ATT | 5702168-AT-A,ATT | 14×T | *** | |||||||
5574096-TG-T | 5706055-TG-T | *** | ||||||||
7310571-CTTT-C,CTT | 7442530-CTTT-C,CTT | 21×T | *** | |||||||
7630177-G-A | 7762136-G-A | *** | ||||||||
8816508-C-A | 8948467-C-A | *** | ||||||||
9810837-A-G | 9973228-A-G | *** | ||||||||
9830216-T-C | 9992607-T-C | *** | ||||||||
13236195-C-T | 11080519-C-T | *** | ||||||||
13236198-G-T | 11080522-G-T | *** | ||||||||
13236199-C-T | 11080523-C-T | *** | ||||||||
14763550-G-C | 12651619-G-C | *** | ||||||||
14960735-G-T | 12848810-G-T | *** | ||||||||
15626303-A-G | 13514423-A-G | *** | ||||||||
15628654-C-T | 13516774-C-T | *** | ||||||||
16045161-C-G | 13933281-C-G | *** | ||||||||
17862792-T-A | 15750912-T-A | *** | ||||||||
21362741-A-G | 19200855-A-G | *** | ||||||||
21891124-GAAATA-G | 19729238-GAAATA-G | *** | ||||||||
22263357-G-A | 20101471-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
22623021-T-C | 20461135-T-C | *** | ||||||||
22623030-C-T | 20461144-C-T | *** | ||||||||
22699044-C-T | 20537158-C-T | *** | ||||||||
22837291-A-G | 20675405-A-G | *** | ||||||||
23778131-A-T | 21616245-A-T | *** | ||||||||
23962030-T-A | 21815883-T-A | *** | ||||||||
28534760-T-G | 26388613-T-G | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.