Callaghan
FTDNA: B59960, BigY2: B59960, FGC: KA2ZZTree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA B59960 | BigY2 B59960 | FGC KA2ZZ |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
13449858-A-G | 11294182-A-G | A* | ||||||||
6334539-T-A | 6466498-T-A | IR3_Dst | *** | A* | ||||||
20776675-A-G | 18614789-A-G | P4_Prx | *** | A* | ||||||
15992284-A-G | 13880404-A-G | FGC67685 | Y | Y | + | + | + | |||
22460726-G-C | 20298840-G-C | FGC67687 | DYZ19 | + | + | * | ||||
22179331-A-G | 20017445-A-G | FGC67686 | Y | Y | + | + | + | |||
18551133-A-AT | 16439253-A-AT | 9×T | + | + | ** | |||||
13848848-C-T | 11728142-C-T | FGC67683 | + | + | + | |||||
8697192-G-A | 8829151-G-A | FGC67682 | Y | Y | + | + | + | |||
15963498-G-T | 13851618-G-T | FGC67684 | Y | ** | * | |||||
7289475-C-T | 7421434-C-T | FGC67681 | Y | Y | ** | * | ||||
6830088-G-A | 6962047-G-A | ** | ||||||||
6786701-C-A | 6918660-C-A | Y60964 | ** | |||||||
6918525-G-C | 7050484-G-C | ** | ||||||||
6984027-C-A | 7115986-C-A | ** | ||||||||
6798818-C-A | 6930777-C-A | ** | ||||||||
6790235-A-G | 6922194-A-G | ** | ||||||||
16545412-AC-A | 14433532-AC-A | ** | ||||||||
6608234-T-G | 6740193-T-G | ** | ||||||||
6699019-TA-C | 6830978-TA-C | ** | ||||||||
6654991-T-A | 6786950-T-A | ** | ||||||||
6608329-C-T | 6740288-C-T | ** | ||||||||
6608316-A-C | 6740275-A-C | ** | ||||||||
6582804-A-T | 6714763-A-T | ** | ||||||||
6580116-T-G | 6712075-T-G | ** | ||||||||
6576534-T-C | 6708493-T-C | ** | ||||||||
6992631-C-A | 7124590-C-A | ** | ||||||||
7183803-A-C | 7315762-A-C | ** | ||||||||
7048593-A-T | 7180552-A-T | ** | ||||||||
7313468-T-G | 7445427-T-G | ** | ||||||||
7475306-C-T | 7607265-C-T | IR1_L | ** | |||||||
7475298-C-A | 7607257-C-A | IR1_L | ** | |||||||
7450256-G-T | 7582215-G-T | IR1_L | ** | |||||||
7362491-A-G | 7494450-A-G | ** | ||||||||
7362425-C-A | 7494384-C-A | ** | ||||||||
7320261-C-G | 7452220-C-G | ** | ||||||||
7313412-G-A | 7445371-G-A | ** | ||||||||
7127399-T-C | 7259358-T-C | ** | ||||||||
7312627-A-T | 7444586-A-T | ** | ||||||||
7235869-G-A | 7367828-G-A | ** | ||||||||
6470776-G-A | 6602735-G-A | ** | ||||||||
7169853-A-T | 7301812-A-T | ** | ||||||||
7160946-T-A | 7292905-T-A | ** | ||||||||
7132018-A-G | 7263977-A-G | ** | ||||||||
6492022-G-A | 6623981-G-A | ** | ||||||||
6366486-A-C | 6498445-A-C | ** | ||||||||
6454744-C-A | 6586703-C-A | ** | ||||||||
5663436-C-A | 5795395-C-A | ** | ||||||||
5817905-A-C | 5949864-A-C | ** | ||||||||
5792966-A-T | 5924925-A-T | ** | ||||||||
5787339-A-T | 5919298-A-T | ** | ||||||||
5753141-T-A | 5885100-T-A | ** | ||||||||
5728237-C-A | 5860196-C-A | ** | ||||||||
5698641-T-G | 5830600-T-G | ** | ||||||||
5645972-G-A | 5777931-G-A | ** | ||||||||
5817951-C-G | 5949910-C-G | ** | ||||||||
5606149-A-G | 5738108-A-G | ** | ||||||||
5603753-A-T | 5735712-A-T | ** | ||||||||
5593083-A-G | 5725042-A-G | ** | ||||||||
5587263-C-A | 5719222-C-A | ** | ||||||||
5585102-C-A | 5717061-C-A | ** | ||||||||
5534746-T-C | 5666705-T-C | ** | ||||||||
5817928-A-G | 5949887-A-G | ** | ||||||||
5849310-C-A | 5981269-C-A | ** | ||||||||
6414311-A-T | 6546270-A-T | ** | ||||||||
6357975-C-G | 6489934-C-G | ** | ||||||||
6405212-T-C | 6537171-T-C | ** | ||||||||
6392536-T-A | 6524495-T-A | ** | ||||||||
7590737-A-C | 7722696-A-C | ** | ||||||||
6366431-G-A | 6498390-G-A | ** | ||||||||
6358402-A-C | 6490361-A-C | ** | ||||||||
6358396-G-T | 6490355-G-T | ** | ||||||||
6310766-C-T | 6442725-C-T | IR3_Dst | ** | |||||||
5859168-C-A | 5991127-C-A | ** | ||||||||
6267665-T-C | 6399624-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6028140-T-G | 6160099-T-G | ** | ||||||||
5996982-A-C | 6128941-A-C | ** | ||||||||
5981232-A-C | 6113191-A-C | ** | ||||||||
5965450-G-A | 6097409-G-A | ** | ||||||||
5867350-TC-T | 5999309-TC-T | ** | ||||||||
5867265-C-A | 5999224-C-A | ** | ||||||||
7579623-A-G | 7711582-A-G | ** | ||||||||
7645408-T-A | 7777367-T-A | ** | ||||||||
7629954-C-T | 7761913-C-T | ** | ||||||||
10756044-C-A | ** | |||||||||
10768318-C-T | ** | |||||||||
10762411-A-C | ** | |||||||||
10761828-T-C | ** | |||||||||
10761824-C-G | ** | |||||||||
10756221-C-T | ** | |||||||||
10756163-A-T | ** | |||||||||
10756056-G-A | ** | |||||||||
10755980-T-A | ** | |||||||||
10771069-C-A | ** | |||||||||
10749032-A-G | ** | |||||||||
10693523-T-G | ** | |||||||||
10687153-A-C | ** | |||||||||
10686177-C-A | ** | |||||||||
10678451-C-A | ** | |||||||||
10668269-C-A | ** | |||||||||
10657163-T-C | ** | |||||||||
10768376-C-A | ** | |||||||||
10796539-T-C | ** | |||||||||
10656094-C-G | ** | |||||||||
10826945-A-G | ** | |||||||||
10843734-G-T | ** | |||||||||
10843726-A-AACTACATTCCT | ** | |||||||||
10843686-C-A | ** | |||||||||
10843363-A-C | ** | |||||||||
10843355-T-C | ** | |||||||||
10832633-T-G | ** | |||||||||
10831281-C-G | ** | |||||||||
10820117-C-A | ** | |||||||||
10801220-A-T | ** | |||||||||
10820044-C-A | ** | |||||||||
10815187-G-T | ** | |||||||||
10814632-C-A | ** | |||||||||
10809206-T-G | ** | |||||||||
10806953-A-C | ** | |||||||||
10806935-C-T | ** | |||||||||
10801940-C-A | ** | |||||||||
10801818-A-T | ** | |||||||||
10656170-T-G | ** | |||||||||
10656093-A-G | ** | |||||||||
5471943-AG-A | 5603902-AG-A | ** | ||||||||
7969529-C-T | 8101488-C-T | ** | ||||||||
8661314-C-T | 8793273-C-T | ** | ||||||||
8525177-T-A | 8657136-T-A | ** | ||||||||
8481103-AT-A | 8613062-AT-A | ** | ||||||||
8481077-TA-T | 8613036-TA-T | ** | ||||||||
8481074-A-AT | 8613033-A-AT | ** | ||||||||
8314144-A-G | 8446103-A-G | ** | ||||||||
8154168-G-T | 8286127-G-T | ** | ||||||||
7969189-T-A | 8101148-T-A | ** | ||||||||
8739220-A-G | 8871179-A-G | ** | ||||||||
7923772-A-C | 8055731-A-C | ** | ||||||||
7923738-T-C | 8055697-T-C | ** | ||||||||
7873950-A-T | 8005909-A-T | ** | ||||||||
7869121-A-T | 8001080-A-T | ** | ||||||||
7861243-A-T | 7993202-A-T | ** | ||||||||
7829040-G-T | 7960999-G-T | ** | ||||||||
7656740-T-G | 7788699-T-G | ** | ||||||||
8739131-C-G | 8871090-C-G | ** | ||||||||
8824079-C-A | 8956038-C-A | ** | ||||||||
10656063-C-A | ** | |||||||||
9832626-C-T | 9995017-C-T | ** | ||||||||
10653669-C-A | ** | |||||||||
10651652-A-AC | ** | |||||||||
10625708-C-A | ** | |||||||||
10057020-A-C | 10219411-A-C | ** | ||||||||
9942344-A-T | 10104735-A-T | ** | ||||||||
9928315-T-C | 10090706-T-C | FT165025 | ** | |||||||
9887915-T-A | 10050306-T-A | ** | ||||||||
9639052-G-T | 9801443-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9113745-A-C | ** | |||||||||
9566728-A-G | 9729119-A-G | IR3_Prx | ** | |||||||
9514413-G-C | 9676804-G-C | ** | ||||||||
9509716-C-A | 9672107-C-A | FT233986 | ** | |||||||
9472275-C-A | 9634666-C-A | ** | ||||||||
9436953-C-A | 9599344-C-A | ** | ||||||||
9211372-C-T | 9373763-C-T | ** | ||||||||
9211362-C-G | 9373753-C-G | ** | ||||||||
8983721-G-C | 9146112-G-C | ** | ||||||||
5524330-T-G | 5656289-T-G | ** | ||||||||
5471929-AAAGAAAGAAAG-A | 5603888-AAAGAAAGAAAG-A | ** | ||||||||
10843750-C-G | ** | |||||||||
23848280-G-T | 21686394-G-T | ** | ||||||||
24013904-C-A | 21867757-C-A | ** | ||||||||
18201127-G-A | 16089247-G-A | ** | ||||||||
13578392-C-A | 11422716-C-A | ** | ||||||||
9183743-C-A | 9346134-C-A | ** | ||||||||
11018268-C-A | ** | |||||||||
4416892-T-G | 4548851-T-G | ** | ||||||||
28611452-C-A | 26465305-C-A | ** | ||||||||
5727899-C-A | 5859858-C-A | ** | ||||||||
18966217-C-A | 16854337-C-A | ** | ||||||||
4230247-C-A | 4362206-C-A | ** | ||||||||
16421585-C-A | 14309705-C-A | ** | ||||||||
4521605-T-C | 4653564-T-C | ** | ||||||||
10804749-T-A | ** | |||||||||
15406933-C-A | 13295053-C-A | ** | ||||||||
21133482-G-C | 18971596-G-C | ** | ||||||||
10980574-G-A | ** | |||||||||
10889187-A-C | ** | |||||||||
15179003-T-A | 13067089-T-A | ** | ||||||||
18890451-TCAA-T | 16778571-TCAA-T | 5×CAA | ** | |||||||
2860491-G-T | 2992450-G-T | ** | ||||||||
3109320-A-G | 3241279-A-G | ** | ||||||||
3093191-T-A | 3225150-T-A | ** | ||||||||
3091735-C-A | 3223694-C-A | ** | ||||||||
3032476-T-C | 3164435-T-C | ** | ||||||||
2973059-G-T | 3105018-G-T | ** | ||||||||
2948819-T-A | 3080778-T-A | ** | ||||||||
2948800-A-T | 3080759-A-T | ** | ||||||||
2839979-C-A | 2971938-C-A | ** | ||||||||
10889190-A-C | ** | |||||||||
2773899-A-C | 2905858-A-C | ** | ||||||||
2699426-G-C | 2831385-G-C | ** | ||||||||
18480352-A-C | 16368472-A-C | P6_Dst | ** | |||||||
23825090-GA-G | 21663204-GA-G | ** | ||||||||
18201146-A-G | 16089266-A-G | ** | ||||||||
27423950-T-A | 25277803-T-A | P1_g3 | ** | |||||||
10814590-C-A | ** | |||||||||
25246609-A-T | 23100462-A-T | P2_r1 | ** | |||||||
23099854-C-A | 20937968-C-A | ** | ||||||||
28633565-C-A | 26487418-C-A | ** | ||||||||
3267347-G-A | 3399306-G-A | ** | ||||||||
24013901-C-T | 21867754-C-T | ** | ||||||||
10865853-C-A | ** | |||||||||
13846728-T-A | 11726022-T-A | ** | ||||||||
4081612-A-G | 4213571-A-G | ** | ||||||||
4416886-T-G | 4548845-T-G | ** | ||||||||
6267716-G-A | 6399675-G-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6150064-C-T | 6282023-C-T | IR3_Dst | ** | |||||||
4521611-C-A | 4653570-C-A | ** | ||||||||
17030605-G-TT | 14918725-G-TT | ** | ||||||||
6770773-G-T | 6902732-G-T | ** | ||||||||
3804725-T-C | 3936684-T-C | ** | ||||||||
13255798-A-C | 11100122-A-C | ** | ||||||||
10862989-C-T | ** | |||||||||
15557051-AG-A | 13445171-AG-A | ** | ||||||||
9968320-G-A | 10130711-G-A | ** | ||||||||
15882060-G-A | 13770180-G-A | ** | ||||||||
17876450-T-G | 15764570-T-G | ** | ||||||||
6267674-T-C | 6399633-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
7269641-A-G | 7401600-A-G | ** | ||||||||
2948150-C-A | 3080109-C-A | ** | ||||||||
13642633-C-A | 11486957-C-A | ** | ||||||||
10992260-C-G | ** | |||||||||
10812492-C-A | ** | |||||||||
28730088-C-A | 26583941-C-A | ** | ||||||||
6816748-A-C | 6948707-A-C | ** | ||||||||
10889215-A-T | ** | |||||||||
14639045-A-G | 12527114-A-G | ** | ||||||||
21328846-A-T | 19166960-A-T | ** | ||||||||
15128121-C-CTT | 13016208-C-CTT | 18×T | ** | |||||||
20637669-C-T | 18475783-C-T | P4_Prx | ** | |||||||
11029376-G-C | ** | |||||||||
7269652-C-T | 7401611-C-T | ** | ||||||||
10969488-C-T | ** | |||||||||
4871743-C-A | 5003702-C-A | ** | ||||||||
19592223-C-A | 17480343-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
3536395-G-T | 3668354-G-T | ** | ||||||||
15406937-C-T | 13295057-C-T | ** | ||||||||
19304703-C-A | 17192823-C-A | ** | ||||||||
3241744-C-A | 3373703-C-A | ** | ||||||||
3271675-C-T | 3403634-C-T | ** | ||||||||
5471793-C-A | 5603752-C-A | ** | ||||||||
4882645-G-C | 5014604-G-C | ** | ||||||||
5025579-G-C | 5157538-G-C | ** | ||||||||
5025531-T-G | 5157490-T-G | ** | ||||||||
5025473-C-A | 5157432-C-A | ** | ||||||||
4968902-T-G | 5100861-T-G | ** | ||||||||
4940720-G-A | 5072679-G-A | ** | ||||||||
4929156-C-A | 5061115-C-A | ** | ||||||||
4902253-C-G | 5034212-C-G | ** | ||||||||
4882530-G-A | 5014489-G-A | ** | ||||||||
5056547-G-T | 5188506-G-T | ** | ||||||||
4862866-T-C | 4994825-T-C | ** | ||||||||
4804245-T-A | 4936204-T-A | ** | ||||||||
4760676-G-T | 4892635-G-T | ** | ||||||||
4679014-G-A | 4810973-G-A | ** | ||||||||
4638795-C-T | 4770754-C-T | ** | ||||||||
4625737-A-T | 4757696-A-T | ** | ||||||||
4523831-A-C | 4655790-A-C | ** | ||||||||
5035826-G-T | 5167785-G-T | ** | ||||||||
5069761-G-T | 5201720-G-T | ** | ||||||||
4368794-G-T | 4500753-G-T | ** | ||||||||
5238387-A-T | 5370346-A-T | ** | ||||||||
5420588-T-G | 5552547-T-G | ** | ||||||||
5420481-T-C | 5552440-T-C | ** | ||||||||
5376434-A-C | 5508393-A-C | ** | ||||||||
5367154-C-A | 5499113-C-A | ** | ||||||||
5367069-G-A | 5499028-G-A | FT49265 | ** | |||||||
5238663-A-C | 5370622-A-C | ** | ||||||||
5238455-A-G | 5370414-A-G | ** | ||||||||
5221041-G-T | 5353000-G-T | ** | ||||||||
5169863-T-A | 5301822-T-A | ** | ||||||||
5221029-C-T | 5352988-C-T | ** | ||||||||
5205369-C-A | 5337328-C-A | ** | ||||||||
5200168-C-A | 5332127-C-A | ** | ||||||||
5187024-A-C | 5318983-A-C | ** | ||||||||
5187002-T-A | 5318961-T-A | ** | ||||||||
5186971-T-C | 5318930-T-C | ** | ||||||||
5186969-G-A | 5318928-G-A | ** | ||||||||
5186966-T-A | 5318925-T-A | ** | ||||||||
4423637-C-A | 4555596-C-A | ** | ||||||||
4357695-T-C | 4489654-T-C | ** | ||||||||
3271681-G-T | 3403640-G-T | ** | ||||||||
3550774-G-T | 3682733-G-T | ** | ||||||||
3784682-T-A | 3916641-T-A | ** | ||||||||
3697220-G-T | 3829179-G-T | ** | ||||||||
3697095-T-C | 3829054-T-C | ** | ||||||||
3667165-C-G | 3799124-C-G | ** | ||||||||
3642700-C-A | 3774659-C-A | ** | ||||||||
3555737-C-A | 3687696-C-A | ** | ||||||||
3550815-G-T | 3682774-G-T | ** | ||||||||
3534923-A-C | 3666882-A-C | ** | ||||||||
3828969-G-C | 3960928-G-C | ** | ||||||||
3492838-G-T | 3624797-G-T | ** | ||||||||
3492781-A-T | 3624740-A-T | ** | ||||||||
3463881-T-G | 3595840-T-G | ** | ||||||||
3463879-T-G | 3595838-T-G | ** | ||||||||
3368353-A-T | 3500312-A-T | ** | ||||||||
3366272-G-C | 3498231-G-C | ** | ||||||||
3287247-C-A | 3419206-C-A | ** | ||||||||
3285170-G-T | 3417129-G-T | ** | ||||||||
3820831-C-G | 3952790-C-G | ** | ||||||||
3835091-A-C | 3967050-A-C | ** | ||||||||
4351536-T-G | 4483495-T-G | ** | ||||||||
4114877-G-C | 4246836-G-C | ** | ||||||||
4302989-T-C | 4434948-T-C | ** | ||||||||
4302979-T-C | 4434938-T-C | ** | ||||||||
4270719-C-A | 4402678-C-A | ** | ||||||||
4225939-A-G | 4357898-A-G | ** | ||||||||
4133950-T-C | 4265909-T-C | ** | ||||||||
4124113-A-G | 4256072-A-G | ** | ||||||||
4120594-C-CA | 4252553-C-CA | ** | ||||||||
4109524-G-T | 4241483-G-T | ** | ||||||||
3848301-C-T | 3980260-C-T | ** | ||||||||
4091814-C-T | 4223773-C-T | ** | ||||||||
4081706-C-A | 4213665-C-A | ** | ||||||||
4072679-T-A | 4204638-T-A | ** | ||||||||
4063237-G-T | 4195196-G-T | ** | ||||||||
4062268-C-A | 4194227-C-A | ** | ||||||||
3966802-A-G | 4098761-A-G | ** | ||||||||
3875977-C-T | 4007936-C-T | ** | ||||||||
3848589-T-A | 3980548-T-A | ** | ||||||||
10843736-A-T | ** | |||||||||
10862969-CTGATT-C | ** | |||||||||
10851193-C-T | ** | |||||||||
19518723-T-G | 17406843-T-G | ** | ||||||||
19705301-T-TA | 17593421-T-TA | P5_Prx | ** | |||||||
19705244-C-A | 17593364-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19644653-A-G | 17532773-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
19592338-T-TA | 17480458-T-TA | P5_Prx | ** | |||||||
19592242-T-A | 17480362-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19592203-T-G | 17480323-T-G | P5_Prx | ** | |||||||
19532796-C-A | 17420916-C-A | ** | ||||||||
19486905-T-C | 17375025-T-C | ** | ||||||||
19899589-G-T | 17787709-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19464528-T-G | 17352648-T-G | ** | ||||||||
19245678-C-T | 17133798-C-T | ** | ||||||||
19146601-G-C | 17034721-G-C | ** | ||||||||
19137582-C-T | 17025702-C-T | ** | ||||||||
19127687-CA-C | 17015807-CA-C | ** | ||||||||
19107445-TA-T | 16995565-TA-T | ** | ||||||||
18791529-A-T | 16679649-A-T | ** | ||||||||
19899581-G-A | 17787701-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
19899626-A-AAGGC | 17787746-A-AAGGC | P5_Prx | ** | |||||||
18791340-T-A | 16679460-T-A | ** | ||||||||
20637673-T-A | 18475787-T-A | P4_Prx | ** | |||||||
21353276-C-G | 19191390-C-G | ** | ||||||||
21353274-G-A | 19191388-G-A | ** | ||||||||
21328837-TC-T | 19166951-TC-T | ** | ||||||||
21241756-TA-T | 19079870-TA-T | ** | ||||||||
20888629-G-A | 18726743-G-A | P4_Dst | ** | |||||||
20854469-T-TG | 18692583-T-TG | P4_Dst | ** | |||||||
20707615-A-G | 18545729-A-G | P4_Prx | ** | |||||||
20569557-G-T | 18407671-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
19948109-T-A | 17836229-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
20493594-T-A | 18331708-T-A | P5_Dst | ** | |||||||
20493554-A-C | 18331668-A-C | P5_Dst | ** | |||||||
20354926-T-G | 18193040-T-G | P5_Dst | ** | |||||||
19948131-C-CT | 17836251-C-CT | P5_Prx | ** | |||||||
19948127-C-CAT | 17836247-C-CAT | P5_Prx | ** | |||||||
19948117-T-TC | 17836237-T-TC | P5_Prx | ** | |||||||
19948113-T-C | 17836233-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
18791431-T-C | 16679551-T-C | ** | ||||||||
18753060-G-C | 16641180-G-C | ** | ||||||||
21503288-T-C | 19341402-T-C | ** | ||||||||
16709782-T-G | 14597902-T-G | ** | ||||||||
17125910-G-T | 15014030-G-T | ** | ||||||||
17052984-C-A | 14941104-C-A | ** | ||||||||
17020553-T-A | 14908673-T-A | ** | ||||||||
17020552-A-C | 14908672-A-C | ** | ||||||||
16989100-A-C | 14877220-A-C | ** | ||||||||
16941986-C-A | 14830106-C-A | ** | ||||||||
16709783-G-T | 14597903-G-T | ** | ||||||||
16709778-C-A | 14597898-C-A | ** | ||||||||
17244335-A-G | 15132455-A-G | ** | ||||||||
16707101-C-A | 14595221-C-A | ** | ||||||||
16417281-T-C | 14305401-T-C | ** | ||||||||
16410241-C-A | 14298361-C-A | ** | ||||||||
16354921-A-G | 14243041-A-G | ** | ||||||||
16320428-A-T | 14208548-A-T | ** | ||||||||
16320387-T-G | 14208507-T-G | ** | ||||||||
16220903-C-T | 14109023-C-T | ** | ||||||||
17153332-T-A | 15041452-T-A | ** | ||||||||
17246494-T-C | 15134614-T-C | ** | ||||||||
18753052-A-C | 16641172-A-C | ** | ||||||||
18185022-C-G | 16073142-C-G | ** | ||||||||
18753011-C-T | 16641131-C-T | ** | ||||||||
18624486-A-T | 16512606-A-T | ** | ||||||||
18565059-CTCA-C | 16453179-CTCA-C | ** | ||||||||
18518159-G-T | 16406279-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
18465446-A-G | 16353566-A-G | P6_Dst | ** | |||||||
18201107-C-A | 16089227-C-A | ** | ||||||||
18196394-G-T | 16084514-G-T | ** | ||||||||
18094167-A-G | 15982287-A-G | ** | ||||||||
17317780-G-A | 15205900-G-A | ** | ||||||||
18094042-A-G | 15982162-A-G | ** | ||||||||
17883950-A-C | 15772070-A-C | ** | ||||||||
17576227-T-G | 15464347-T-G | ** | ||||||||
17503974-G-T | 15392094-G-T | ** | ||||||||
17426599-T-C | 15314719-T-C | ** | ||||||||
17402472-TA-T | 15290592-TA-T | ** | ||||||||
17382319-A-T | 15270439-A-T | ** | ||||||||
21367737-A-T | 19205851-A-T | ** | ||||||||
21583839-C-T | 19421953-C-T | ** | ||||||||
16147498-G-A | 14035618-G-A | P8_Dst | ** | |||||||
26477985-C-A | 24331838-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
28361372-T-A | 26215225-T-A | P1_gr2 | ** | |||||||
28064066-A-G | 25917919-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
27873594-G-T | 25727447-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27633620-G-A | 25487473-G-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27552538-C-A | 25406391-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27423964-C-A | 25277817-C-A | P1_g3 | ** | |||||||
27232159-C-A | 25086012-C-A | P1_g3 | ** | |||||||
26139997-T-G | 23993850-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
28429404-C-G | 26283257-C-G | P1_gr2 | ** | |||||||
26098016-A-AAAAAG | 23951869-A-AAAAAG | P1_Y1 | ** | |||||||
26041918-A-T | 23895771-A-T | P1_Y1 | ** | |||||||
25995443-A-AAT | 23849296-A-AAT | P1_Y1 | ** | |||||||
25934585-T-C | 23788438-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
24751259-A-G | 22605112-A-G | P3_b2 | ** | |||||||
24525867-A-AG | 22379720-A-AG | P3_t2 | ** | |||||||
24512272-A-G | 22366125-A-G | BY204642 | ** | |||||||
28361445-T-TA | 26215298-T-TA | P1_gr2 | ** | |||||||
28480193-A-T | 26334046-A-T | ** | ||||||||
24406509-A-T | 22260362-A-T | ** | ||||||||
28706304-G-A | 26560157-G-A | ** | ||||||||
56881340-A-T | ** | |||||||||
56848355-A-T | ** | |||||||||
56848333-G-C | ** | |||||||||
56845900-C-A | ** | |||||||||
56839066-C-A | ** | |||||||||
28758167-C-T | 26612020-C-T | ** | ||||||||
28707815-G-T | 26561668-G-T | FT353961 | ** | |||||||
28660669-T-A | 26514522-T-A | ** | ||||||||
28486145-G-A | 26339998-G-A | ** | ||||||||
28645099-A-T | 26498952-A-T | ** | ||||||||
28611460-C-A | 26465313-C-A | ** | ||||||||
28611450-A-T | 26465303-A-T | ** | ||||||||
28581112-A-G | 26434965-A-G | ** | ||||||||
28545334-T-G | 26399187-T-G | ** | ||||||||
28521663-C-A | 26375516-C-A | ** | ||||||||
28513798-C-A | 26367651-C-A | ** | ||||||||
24458769-A-AG | 22312622-A-AG | ** | ||||||||
24402388-T-A | 22256241-T-A | ** | ||||||||
21584621-T-G | 19422735-T-G | ** | ||||||||
21963817-C-T | 19801931-C-T | ** | ||||||||
22713120-G-T | 20551234-G-T | ** | ||||||||
22611307-A-G | 20449421-A-G | ** | ||||||||
22210513-T-C | 20048627-T-C | ** | ||||||||
22171511-C-T | 20009625-C-T | ** | ||||||||
22146489-C-T | 19984603-C-T | ** | ||||||||
22080673-G-T | 19918787-G-T | ** | ||||||||
21969526-T-A | 19807640-T-A | ** | ||||||||
21954473-C-T | 19792587-C-T | ** | ||||||||
22713955-G-T | 20552069-G-T | ** | ||||||||
21919340-C-A | 19757454-C-A | ** | ||||||||
21891125-A-C | 19729239-A-C | ** | ||||||||
21886329-A-T | 19724443-A-T | ** | ||||||||
21852517-T-A | 19690631-T-A | ** | ||||||||
21698424-C-A | 19536538-C-A | ** | ||||||||
21698420-C-A | 19536534-C-A | ** | ||||||||
21602805-G-T | 19440919-G-T | ** | ||||||||
22713813-C-A | 20551927-C-A | ** | ||||||||
22775048-G-A | 20613162-G-A | ** | ||||||||
24013909-C-T | 21867762-C-T | ** | ||||||||
23106000-C-T | 20944114-C-T | 12×T | ** | |||||||
24013891-G-A | 21867744-G-A | ** | ||||||||
23475510-C-T | 21313624-C-T | ** | ||||||||
23360815-C-A | 21198929-C-A | ** | ||||||||
23345681-T-C | 21183795-T-C | ** | ||||||||
23288650-T-C | 21126764-T-C | ** | ||||||||
23287238-T-C | 21125352-T-C | ** | ||||||||
23260866-C-T | 21098980-C-T | ** | ||||||||
23098016-T-G | 20936130-T-G | ** | ||||||||
22854918-A-T | 20693032-A-T | ** | ||||||||
23050440-A-T | 20888554-A-T | ** | ||||||||
23014775-C-A | 20852889-C-A | ** | ||||||||
23009327-C-A | 20847441-C-A | ** | ||||||||
22991130-A-G | 20829244-A-G | ** | ||||||||
22991126-A-G | 20829240-A-G | ** | ||||||||
22991125-C-T | 20829239-C-T | ** | ||||||||
22914654-A-C | 20752768-A-C | ** | ||||||||
16179720-T-C | 14067840-T-C | ** | ||||||||
16147493-AG-A | 14035613-AG-A | P8_Dst | ** | |||||||
10851195-T-C | ** | |||||||||
11009758-C-A | ** | |||||||||
11025926-TC-T | ** | |||||||||
11022445-C-A | ** | |||||||||
11018917-C-A | ** | |||||||||
11017259-A-T | ** | |||||||||
11017253-T-G | ** | |||||||||
11015785-C-A | ** | |||||||||
11013952-C-A | ** | |||||||||
11000942-C-A | ** | |||||||||
11029288-T-G | ** | |||||||||
10998518-G-A | FT92202 | ** | ||||||||
10996398-G-T | ** | |||||||||
10992272-A-T | ** | |||||||||
10991368-C-A | ** | |||||||||
10986766-A-C | ** | |||||||||
10983609-T-A | ** | |||||||||
10980226-A-C | ** | |||||||||
11027996-A-C | ** | |||||||||
11029332-A-T | FT191031 | ** | ||||||||
10974728-C-A | ** | |||||||||
13466390-T-G | 11310714-T-G | ** | ||||||||
13643501-G-T | 11487825-G-T | ** | ||||||||
13593598-C-G | 11437922-C-G | ** | ||||||||
13543723-A-C | 11388047-A-C | ** | ||||||||
13490501-A-C | 11334825-A-C | ** | ||||||||
13490482-T-G | 11334806-T-G | ** | ||||||||
13490429-T-G | 11334753-T-G | ** | ||||||||
13474080-G-A | 11318404-G-A | ** | ||||||||
13267405-C-A | 11111729-C-A | ** | ||||||||
11029336-C-T | ** | |||||||||
13255806-C-G | 11100130-C-G | ** | ||||||||
13199204-G-A | 11043528-G-A | ** | ||||||||
13199203-T-A | 11043527-T-A | ** | ||||||||
11034097-C-A | ** | |||||||||
11034085-T-A | ** | |||||||||
11034049-A-T | ** | |||||||||
11030304-C-G | ** | |||||||||
10976116-C-A | ** | |||||||||
10970664-C-A | ** | |||||||||
11646046-T-A | ** | |||||||||
10866178-A-T | ** | |||||||||
10889182-A-C | ** | |||||||||
10888865-T-C | ** | |||||||||
10880038-C-CGGATA | ** | |||||||||
10880029-G-A | ** | |||||||||
10871034-C-T | ** | |||||||||
10870915-T-A | ** | |||||||||
10868889-A-G | ** | |||||||||
10865854-A-C | ** | |||||||||
10894149-C-A | ** | |||||||||
10865032-A-C | ** | |||||||||
10862994-C-T | ** | |||||||||
10862984-C-T | ** | |||||||||
10756069-C-T | ** | |||||||||
10862964-C-T | ** | |||||||||
10861895-AATTCC-A | ** | |||||||||
16089-C-A | ** | |||||||||
10889409-A-C | ** | |||||||||
10896402-C-A | ** | |||||||||
10964537-C-T | FGC83132 | ** | ||||||||
10921147-A-T | ** | |||||||||
10964534-T-C | ** | |||||||||
10952507-T-G | ** | |||||||||
10945757-T-C | ** | |||||||||
10940591-T-A | ** | |||||||||
10937228-C-T | ** | |||||||||
10930425-A-C | ** | |||||||||
10921644-T-TCTAATCCATA | ** | |||||||||
10921143-T-TCCAAGTCCCCTCCTACCCAG | ** | |||||||||
10896460-A-T | ** | |||||||||
10913996-T-C | ** | |||||||||
10899317-T-C | ** | |||||||||
10899271-T-A | ** | |||||||||
10898554-A-T | ** | |||||||||
10898337-C-G | ** | |||||||||
10898330-C-CTCCAT | ** | |||||||||
10898319-A-T | ** | |||||||||
13643503-C-T | 11487827-C-T | ** | ||||||||
11646344-A-G | ** | |||||||||
16090345-G-C | 13978465-G-C | ** | ||||||||
14720195-C-T | 12608263-C-T | M7181 | ** | |||||||
15332419-T-A | 13220537-T-A | ** | ||||||||
15323455-A-AAT | 13211573-A-AAT | ** | ||||||||
15320647-G-A | 13208753-G-A | ** | ||||||||
15280659-C-T | 13168758-C-T | ** | ||||||||
15128140-AC-A | 13016227-AC-A | ** | ||||||||
15091772-G-A | 12979861-G-A | ** | ||||||||
14721639-A-T | 12609707-A-T | ** | ||||||||
14661377-T-G | 12549442-T-G | ** | ||||||||
15401158-C-A | 13289278-C-A | ** | ||||||||
14639042-A-C | 12527111-A-C | ** | ||||||||
14598789-T-C | 12486989-T-C | ** | ||||||||
14571247-G-A | 12459447-G-A | ** | ||||||||
14550747-A-G | 12438948-A-G | ** | ||||||||
14539621-C-G | 12427822-C-G | ** | ||||||||
14532140-C-A | 12420341-C-A | ** | ||||||||
14527652-G-C | 12415853-G-C | ** | ||||||||
15397208-C-A | 13285328-C-A | ** | ||||||||
15429709-G-T | 13317829-G-T | ** | ||||||||
14526446-G-A | 12414647-G-A | ** | ||||||||
15971379-C-A | 13859499-C-A | ** | ||||||||
16070666-C-A | 13958786-C-A | ** | ||||||||
16056121-C-A | 13944241-C-A | ** | ||||||||
16017598-G-A | 13905718-G-A | ** | ||||||||
16017564-A-C | 13905684-A-C | ** | ||||||||
16016329-C-A | 13904449-C-A | ** | ||||||||
16006819-C-A | 13894939-C-A | ** | ||||||||
16003023-C-A | 13891143-C-A | ** | ||||||||
15952699-G-T | 13840819-G-T | ** | ||||||||
15435120-A-T | 13323240-A-T | ** | ||||||||
15860174-C-A | 13748294-C-A | ** | ||||||||
15834331-G-C | 13722451-G-C | ** | ||||||||
15775822-A-C | 13663942-A-C | ** | ||||||||
15748041-A-G | 13636161-A-G | ** | ||||||||
15650569-T-C | 13538689-T-C | ** | ||||||||
15475210-CG-C | 13363330-CG-C | ** | ||||||||
15446837-T-A | 13334957-T-A | ** | ||||||||
14527629-A-T | 12415830-A-T | ** | ||||||||
12378249-C-A | ** | |||||||||
11650651-G-A | ** | |||||||||
13903841-A-G | 11783135-A-G | ** | ||||||||
13996362-G-T | 11875656-G-T | ** | ||||||||
13996361-C-G | 11875655-C-G | FT281341 | ** | |||||||
13953535-C-A | 11832829-C-A | ** | ||||||||
13951930-A-G | 11831224-A-G | ** | ||||||||
13950161-G-T | 11829455-G-T | ** | ||||||||
13945333-A-C | 11824627-A-C | ** | ||||||||
13937355-C-A | 11816649-C-A | ** | ||||||||
13809243-G-C | 11688537-G-C | ** | ||||||||
14007677-C-A | 11886971-C-A | ** | ||||||||
11677229-T-A | ** | |||||||||
11676061-C-T | ** | |||||||||
11673322-TA-T | ** | |||||||||
11670987-G-C | ** | |||||||||
11669812-A-G | ** | |||||||||
11669566-A-G | ** | |||||||||
11651426-A-G | ** | |||||||||
14000047-C-A | 11879341-C-A | ** | ||||||||
14055882-C-A | 11935176-C-A | ** | ||||||||
12373955-C-T | ** | |||||||||
14302179-G-C | 12181473-G-C | ** | ||||||||
14483193-T-G | 12362462-T-G | ** | ||||||||
14463324-G-T | 12342597-G-T | ** | ||||||||
14430522-A-G | 12309795-A-G | ** | ||||||||
14361611-T-C | 12240906-T-C | ** | ||||||||
14361610-T-A | 12240905-T-A | ** | ||||||||
14348001-G-A | 12227296-G-A | ** | ||||||||
14339409-T-C | 12218704-T-C | ** | ||||||||
14261573-A-C | 12140867-A-C | ** | ||||||||
14055954-A-C | 11935248-A-C | ** | ||||||||
14261568-G-A | 12140862-G-A | ** | ||||||||
14252156-C-A | 12131450-C-A | FT335400 | ** | |||||||
14212560-T-G | 12091854-T-G | ** | ||||||||
14198465-C-G | 12077759-C-G | ** | ||||||||
14109543-C-G | 11988837-C-G | ** | ||||||||
14056005-A-C | 11935299-A-C | ** | ||||||||
14055993-T-A | 11935287-T-A | ** | ||||||||
19130771-TG-T | 17018891-TG-T | ** | ||||||||
10861115-C-T | ** | |||||||||
27861908-C-A | 25715761-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
17217402-C-A | 15105522-C-A | ** | *** | |||||||
16677122-C-A | 14565242-C-A | ** | ** | |||||||
16692062-A-G | 14580182-A-G | ** | *** | |||||||
16702280-G-C | 14590400-G-C | ** | ** | |||||||
16719789-C-A | 14607909-C-A | ** | ** | |||||||
16783613-C-A | 14671733-C-A | ** | ** | |||||||
17065941-G-T | 14954061-G-T | ** | *** | |||||||
17065986-A-G | 14954106-A-G | ** | ** | |||||||
17087816-C-A | 14975936-C-A | ** | *** | |||||||
17225880-G-A | 15114000-G-A | ** | *** | |||||||
16575084-C-G | 14463204-C-G | ** | *** | |||||||
17433329-C-A | 15321449-C-A | ** | ** | |||||||
17483208-G-T | 15371328-G-T | ** | *** | |||||||
17544034-A-T | 15432154-A-T | ** | *** | |||||||
17561495-C-A | 15449615-C-A | ** | *** | |||||||
17572070-C-A | 15460190-C-A | ** | *** | |||||||
17629016-G-T | 15517136-G-T | ** | *** | |||||||
17855622-G-T | 15743742-G-T | ** | *** | |||||||
17902596-G-T | 15790716-G-T | ** | *** | |||||||
16623918-G-T | 14512038-G-T | ** | *** | |||||||
16539869-G-T | 14427989-G-T | ** | *** | |||||||
18166090-G-C | 16054210-G-C | ** | ** | |||||||
15860258-C-A | 13748378-C-A | ** | *** | |||||||
15324165-C-A | 13212283-C-A | ** | *** | |||||||
15334800-C-A | 13222918-C-A | ** | *** | |||||||
15370690-G-T | 13258810-G-T | ** | ** | |||||||
15432863-A-T | 13320983-A-T | ** | *** | |||||||
15435159-C-A | 13323279-C-A | ** | *** | |||||||
15741552-T-C | 13629672-T-C | ** | *** | |||||||
15758790-C-T | 13646910-C-T | ** | *** | |||||||
15834221-C-G | 13722341-C-G | ** | *** | |||||||
15901424-C-A | 13789544-C-A | ** | *** | |||||||
16515879-C-T | 14403999-C-T | ** | *** | |||||||
15946716-G-A | 13834836-G-A | ** | *** | |||||||
16047067-A-G | 13935187-A-G | ** | *** | |||||||
16090357-G-C | 13978477-G-C | FT63152 | ** | *** | ||||||
16279170-C-A | 14167290-C-A | ** | *** | |||||||
16320148-T-C | 14208268-T-C | ** | ** | |||||||
16394444-A-C | 14282564-A-C | ** | *** | |||||||
16430198-C-A | 14318318-C-A | ** | *** | |||||||
16462495-A-T | 14350615-A-T | ** | *** | |||||||
16466858-C-A | 14354978-C-A | ** | ** | |||||||
18165663-C-A | 16053783-C-A | ** | *** | |||||||
18172967-T-G | 16061087-T-G | ** | *** | |||||||
15157275-T-C | 13045362-T-C | ** | *** | |||||||
22694053-A-G | 20532167-A-G | ** | ** | |||||||
22092735-C-A | 19930849-C-A | ** | *** | |||||||
22146491-A-G | 19984605-A-G | ** | *** | |||||||
22188928-T-C | 20027042-T-C | ** | *** | |||||||
22204941-C-T | 20043055-C-T | ** | *** | |||||||
22551341-G-T | 20389455-G-T | ** | *** | |||||||
22611305-G-T | 20449419-G-T | ** | *** | |||||||
22615234-C-A | 20453348-C-A | ** | *** | |||||||
22615258-T-C | 20453372-T-C | ** | *** | |||||||
22713132-G-A | 20551246-G-A | FT109425 | ** | *** | ||||||
21963772-T-G | 19801886-T-G | ** | *** | |||||||
22775374-A-C | 20613488-A-C | ** | *** | |||||||
22800176-C-A | 20638290-C-A | ** | ** | |||||||
23061226-C-A | 20899340-C-A | ** | *** | |||||||
23096668-A-G | 20934782-A-G | ** | *** | |||||||
23188628-G-A | 21026742-G-A | ** | *** | |||||||
23287343-C-G | 21125457-C-G | ** | *** | |||||||
23340978-A-C | 21179092-A-C | ** | *** | |||||||
23355951-G-T | 21194065-G-T | ** | *** | |||||||
22080587-G-T | 19918701-G-T | ** | *** | |||||||
21770720-C-A | 19608834-C-A | ** | *** | |||||||
18194301-C-T | 16082421-C-T | ** | *** | |||||||
18901051-C-A | 16789171-C-A | ** | *** | |||||||
18226325-G-C | 16114445-G-C | ** | ** | |||||||
18226354-A-G | 16114474-A-G | ** | *** | |||||||
18534191-C-T | 16422311-C-T | P6_Dst | ** | *** | ||||||
18539141-A-G | 16427261-A-G | ** | *** | |||||||
18624480-G-T | 16512600-G-T | ** | *** | |||||||
18627714-C-A | 16515834-C-A | ** | *** | |||||||
18735318-G-A | 16623438-G-A | ** | *** | |||||||
18791460-A-C | 16679580-A-C | ** | *** | |||||||
19042415-C-A | 16930535-C-A | ** | *** | |||||||
21624741-C-A | 19462855-C-A | ** | *** | |||||||
19340415-C-A | 17228535-C-A | ** | *** | |||||||
19464479-G-T | 17352599-G-T | ** | *** | |||||||
20840374-C-A | 18678488-C-A | P4_Gap | ** | *** | ||||||
21163161-C-A | 19001275-C-A | ** | *** | |||||||
21297816-C-A | 19135930-C-A | ** | *** | |||||||
21367631-C-G | 19205745-C-G | ** | *** | |||||||
21367733-A-G | 19205847-A-G | ** | *** | |||||||
21435104-C-A | 19273218-C-A | ** | *** | |||||||
21459863-C-A | 19297977-C-A | ** | *** | |||||||
15276638-C-A | 13164727-C-A | ** | *** | |||||||
15143614-C-A | 13031701-C-A | ** | *** | |||||||
23449176-C-A | 21287290-C-A | ** | *** | |||||||
6445283-G-T | 6577242-G-T | ** | *** | |||||||
4085431-C-A | 4217390-C-A | ** | *** | |||||||
4498641-T-C | 4630600-T-C | ** | *** | |||||||
4756631-C-A | 4888590-C-A | ** | *** | |||||||
4848871-C-T | 4980830-C-T | ** | *** | |||||||
4902255-T-C | 5034214-T-C | ** | *** | |||||||
4933589-G-T | 5065548-G-T | ** | ** | |||||||
5017726-C-A | 5149685-C-A | ** | *** | |||||||
5293847-A-T | 5425806-A-T | ** | *** | |||||||
6502956-C-A | 6634915-C-A | ** | *** | |||||||
3467631-G-T | 3599590-G-T | ** | ** | |||||||
6622185-G-T | 6754144-G-T | ** | ** | |||||||
6654935-C-A | 6786894-C-A | ** | *** | |||||||
6983801-T-G | 7115760-T-G | ** | *** | |||||||
7030559-C-A | 7162518-C-A | ** | *** | |||||||
7033537-T-A | 7165496-T-A | ** | ** | |||||||
7042924-C-A | 7174883-C-A | ** | ** | |||||||
7043170-G-T | 7175129-G-T | ** | *** | |||||||
7094426-T-C | 7226385-T-C | ** | *** | |||||||
3479733-G-A | 3611692-G-A | ** | *** | |||||||
3299010-C-A | 3430969-C-A | ** | *** | |||||||
7132012-T-G | 7263971-T-G | ** | *** | |||||||
23097973-C-A | 20936087-C-A | FT314828 | ** | *** | ||||||
13255809-T-G | 11100133-T-G | FT268496 | 12×G | ** | ||||||
10064091-A-G | 10226482-A-G | ** | ||||||||
6816736-C-T | 6948695-C-T | ** | *** | |||||||
17231485-C-A | 15119605-C-A | ** | *** | |||||||
4267560-TTC-T | 4399519-TTC-T | ** | ** | |||||||
8712851-C-A | 8844810-C-A | Z28064 | ** | *** | ||||||
10064055-G-A | 10226446-G-A | ** | ||||||||
19286341-T-C | 17174461-T-C | Z20466 | ** | |||||||
9952537-C-T | 10114928-C-T | ** | ||||||||
3100095-C-A | 3232054-C-A | ** | *** | |||||||
7507103-G-T | 7639062-G-T | ** | ||||||||
19206740-GTAAAA-G | 17094860-GTAAAA-G | ** | ||||||||
13224607-C-T | 11068931-C-T | FT265136 | ** | *** | ||||||
13576074-C-A | 11420398-C-A | ** | *** | |||||||
6911377-C-A | 7043336-C-A | ** | *** | |||||||
2708488-G-T | 2840447-G-T | ** | *** | |||||||
2791208-A-G | 2923167-A-G | ** | *** | |||||||
2959951-C-A | 3091910-C-A | ** | *** | |||||||
3042265-G-T | 3174224-G-T | ** | *** | |||||||
7110693-C-T | 7242652-C-T | ** | *** | |||||||
7200886-C-A | 7332845-C-A | ** | *** | |||||||
15084122-T-A | 12972212-T-A | ** | ** | |||||||
14212257-G-C | 12091551-G-C | ** | *** | |||||||
13915098-T-C | 11794392-T-C | ** | *** | |||||||
13938094-G-T | 11817388-G-T | ** | *** | |||||||
13952416-C-A | 11831710-C-A | ** | ** | |||||||
13960758-C-A | 11840052-C-A | ** | ** | |||||||
13988962-C-T | 11868256-C-T | ** | ** | |||||||
14067066-A-G | 11946360-A-G | ** | *** | |||||||
14073541-C-A | 11952835-C-A | ** | ** | |||||||
14115012-T-A | 11994306-T-A | ** | *** | |||||||
14367705-C-A | 12247001-C-A | ** | *** | |||||||
13617632-G-T | 11461956-G-T | ** | *** | |||||||
14451327-G-T | 12330600-G-T | ** | ** | |||||||
14472870-C-A | 12352139-C-A | ** | *** | |||||||
14764903-A-T | 12652972-A-T | ** | ||||||||
14519026-A-C | 12407227-A-C | ** | ** | |||||||
14589365-C-T | 12477565-C-T | ** | *** | |||||||
14697084-A-G | 12585150-A-G | ** | *** | |||||||
14784842-A-T | 12672912-A-T | ** | *** | |||||||
14802957-C-A | 12691028-C-A | ** | ** | |||||||
15044323-T-C | 12932413-T-C | ** | *** | |||||||
13871948-A-G | 11751242-A-G | ** | *** | |||||||
13469536-C-T | 11313860-C-T | ** | *** | |||||||
7243217-C-A | 7375176-C-A | ** | *** | |||||||
8481069-A-T | 8613028-A-T | ** | *** | |||||||
7313419-T-A | 7445378-T-A | ** | *** | |||||||
7320320-C-A | 7452279-C-A | ** | *** | |||||||
7349126-C-A | 7481085-C-A | ** | *** | |||||||
7379715-G-T | 7511674-G-T | ** | *** | |||||||
7824889-A-T | 7956848-A-T | ** | *** | |||||||
7969346-G-T | 8101305-G-T | ** | *** | |||||||
7990468-C-G | 8122427-C-G | ** | *** | |||||||
8093364-C-T | 8225323-C-T | ** | *** | |||||||
8481085-A-T | 8613044-A-T | ** | *** | |||||||
13407198-G-A | 11251522-G-A | ** | *** | |||||||
8671489-A-T | 8803448-A-T | ** | *** | |||||||
8786519-C-A | 8918478-C-A | ** | *** | |||||||
9928692-C-A | 10091083-C-A | ** | *** | |||||||
9942960-C-G | 10105351-C-G | ** | *** | |||||||
10057385-C-A | 10219776-C-A | ** | *** | |||||||
13199101-A-G | 11043425-A-G | ** | *** | |||||||
13272256-C-A | 11116580-C-A | ** | *** | |||||||
13318012-C-A | 11162336-C-A | ** | *** | |||||||
13330062-G-A | 11174386-G-A | ** | ** | |||||||
23360898-T-C | 21199012-T-C | ** | ** | |||||||
14483214-A-C | 12362483-A-C | ** | *** | |||||||
26100553-A-T | 23954406-A-T | P1_Y1 | ** | |||||||
10535-C-A | ** | |||||||||
13199199-A-C | 11043523-A-C | ** | ||||||||
16506873-T-TA | 14394993-T-TA | 9×A | ** | |||||||
22956140-T-C | 20794254-T-C | ** | ||||||||
10817633-G-T | ** | |||||||||
28772144-C-A | 26625997-C-A | ** | *** | |||||||
11030771-C-T | ** | |||||||||
10947380-T-C | ** | |||||||||
28758133-T-C | 26611986-T-C | ** | ** | |||||||
10947384-T-A | ** | |||||||||
6765639-G-C | 6897598-G-C | ** | ||||||||
28758057-T-A | 26611910-T-A | ** | *** | |||||||
28660046-A-G | 26513899-A-G | ** | *** | |||||||
28631506-C-A | 26485359-C-A | ** | ** | |||||||
10668575-A-C | ** | |||||||||
3550675-C-A | 3682634-C-A | ** | ||||||||
20637578-G-GATAGAT | 18475692-G-GATAGAT | P4_Prx | 25×AT | ** | ||||||
28574396-T-G | 26428249-T-G | ** | *** | |||||||
28567466-C-A | 26421319-C-A | ** | *** | |||||||
28549768-C-A | 26403621-C-A | ** | *** | |||||||
28534691-A-G | 26388544-A-G | ** | *** | |||||||
11030765-T-G | ** | |||||||||
22193870-GA-G | 20031984-GA-G | ** | *** | |||||||
20242504-G-T | 18080618-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20423060-G-T | 18261174-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
15128152-C-A | 13016239-C-A | ** | ||||||||
11030770-T-C | ** | |||||||||
10992345-C-T | ** | |||||||||
58862761-G-A | 56728110-C-T | ** | *** | |||||||
2718903-GA-G | 2850862-GA-G | ** | ||||||||
4521597-G-A | 4653556-G-A | ** | ||||||||
5358518-T-C | 5490477-T-C | ** | ||||||||
19318177-TC-T | 17206297-TC-T | ** | ||||||||
7201554-T-C | 7333513-T-C | ** | ||||||||
27862631-A-G | 25716484-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
24904700-AG-A | 22758553-AG-A | g1 | ** | |||||||
7895051-TA-T | 8027010-TA-T | ** | ** | |||||||
13962082-C-T | 11841376-C-T | ** | ||||||||
10974039-T-C | ** | |||||||||
4521603-C-A | 4653562-C-A | ** | ||||||||
10889179-C-A | ** | |||||||||
26046021-G-T | 23899874-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
58986750-C-A | 56840603-C-A | ** | *** | |||||||
5966890-GTT-G | 6098849-GTT-G | 14×T | ** | *** | ||||||
9211368-C-G | 9373759-C-G | ** | ||||||||
9920527-G-T | 10082918-G-T | *** | ||||||||
10021449-C-T | 10183840-C-T | *** | ||||||||
10071258-A-G | 10233649-A-G | *** | ||||||||
22431410-T-G | 20269524-T-G | DYZ19 | *** | |||||||
22431366-A-T | 20269480-A-T | DYZ19 | *** | |||||||
19700266-T-A | 17588386-T-A | P5_Prx | *** | |||||||
9920561-A-G | 10082952-A-G | *** | ||||||||
22340054-G-A | 20178168-G-A | JN96 | DYZ19 | *** | ||||||
9920580-T-C | 10082971-T-C | *** | ||||||||
9920519-C-T | 10082910-C-T | *** | ||||||||
28819318-A-T | 26673171-A-T | *** | ||||||||
9924574-G-C | 10086965-G-C | *** | ||||||||
22481833-G-C | 20319947-G-C | DYZ19 | *** | |||||||
13460602-CAA-AAC | 11304926-CAA-AAC | *** | ||||||||
58838656-ATTGCAG-GTTTGAT | 56752209-CTGCAAT-ATCAAAC | *** | ||||||||
13196367-C-G | 11040691-C-G | *** | ||||||||
22340041-G-A | 20178155-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
58873125-T-G | 56717746-A-C | *** | ||||||||
9943775-G-GAAA | 10106166-G-GAAA | *** | ||||||||
58838681-A-G | 56752190-T-C | *** | ||||||||
22234785-TCTG-ACTA | 20072899-TCTG-ACTA | DYZ19 | *** | |||||||
22234795-CAAAT-AAAAC | 20072909-CAAAT-AAAAC | DYZ19 | *** | |||||||
25440081-C-T | 23293934-C-T | P2_r2 | *** | |||||||
9944566-CT-AC | 10106957-CT-AC | *** | ||||||||
25417491-A-T | 23271344-A-T | P2_r2 | *** | |||||||
13729554-C-G | 11573878-C-G | *** | ||||||||
10037604-A-T | 10199995-A-T | *** | ||||||||
9944912-T-A | 10107303-T-A | *** | ||||||||
58863083-A-C | 56727788-T-G | *** | ||||||||
58841046-C-A | 56749825-G-T | *** | ||||||||
10037620-A-G | 10200011-A-G | *** | ||||||||
10037619-C-T | 10200010-C-T | A18565 | *** | |||||||
13718334-T-A | 11562658-T-A | *** | ||||||||
58838647-ATCCT-TTCCG | 56752220-AGGAT-CGGAA | *** | ||||||||
10037590-T-C | 10199981-T-C | *** | ||||||||
9920519-CAAAGAAAG-TAAACAAAT | 10082910-CAAAGAAAG-TAAACAAAT | *** | ||||||||
13196388-C-A | 11040712-C-A | *** | ||||||||
13734783-TTCAAAT-CTGAAAC | 11579107-TTCAAAT-CTGAAAC | *** | ||||||||
6092491-C-A | 6224450-C-A | *** | ||||||||
17678647-TG-T | 15566767-TG-T | *** | ||||||||
3274723-C-A | 3406682-C-A | *** | ||||||||
10776065-CGCTCCACTCA-C,CATTCCATTCA | *** | |||||||||
4282199-C-A | 4414158-C-A | *** | ||||||||
4585877-C-T | 4717836-C-T | *** | ||||||||
14384631-T-A | 12263927-T-A | *** | ||||||||
2730114-G-A | 2862073-G-A | *** | ||||||||
10947623-ATTCTA-A,ATTCT | *** | |||||||||
5579803-C-A | 5711762-C-A | *** | ||||||||
14331182-C-T | 12210476-C-T | *** | ||||||||
5785633-C-A | 5917592-C-A | *** | ||||||||
6232286-C-A | 6364245-C-A | IR3_Dst | *** | |||||||
22342356-A-T | 20180470-A-T | DYZ19 | *** | |||||||
6323398-A-C | 6455357-A-C | IR3_Dst | *** | |||||||
10756129-C-T | *** | |||||||||
18019855-G-T | 15907975-G-T | *** | ||||||||
14077168-C-A | 11956462-C-A | *** | ||||||||
27829232-C-T | 25683085-C-T | P1_Y2 | *** | |||||||
9398059-C-A | 9560450-C-A | *** | ||||||||
7093236-T-G | 7225195-T-G | *** | ||||||||
23471037-T-A | 21309151-T-A | *** | ||||||||
16406873-TG-T | 14294993-TG-T | *** | ||||||||
7167159-T-A | 7299118-T-A | *** | ||||||||
7172242-C-T | 7304201-C-T | ALK120 | *** | |||||||
2758718-C-A | 2890677-C-A | *** | ||||||||
58985904-T-A | 56839757-T-A | *** | ||||||||
58985891-CCTACAT-GCCACAG | 56839744-CCTACAT-GCCACAG | *** | ||||||||
25054364-C-T | 22908217-C-T | g1 | *** | |||||||
9909078-A-G | 10071469-A-G | *** | ||||||||
58891003-T-C | 56699868-A-G | *** | ||||||||
58891035-GCAT-CTAA | 56699833-ATGC-TTAG | 4×CATTC | *** | |||||||
9323493-C-G | 9485884-C-G | *** | ||||||||
13460477-A-T | 11304801-A-T | *** | ||||||||
24654520-A-G | 22508373-A-G | P3_b2 | *** | |||||||
10063382-T-C | 10225773-T-C | *** | ||||||||
13543218-A-G | 11387542-A-G | *** | ||||||||
10063382-TG-CA | 10225773-TG-CA | *** | ||||||||
6319373-G-A | 6451332-G-A | IR3_Dst | *** | |||||||
9324835-C-T | 9487226-C-T | *** | ||||||||
25110099-G-A | 22963952-G-A | g1 | *** | |||||||
13460578-T-A | 11304902-T-A | *** | ||||||||
10063723-A-T | 10226114-A-T | *** | ||||||||
10063734-A-T | 10226125-A-T | *** | ||||||||
10063761-T-G | 10226152-T-G | *** | ||||||||
15733965-T-C | 13622085-T-C | *** | ||||||||
13460687-G-A | 11305011-G-A | *** | ||||||||
22267544-A-G | 20105658-A-G | DYZ19 | *** | |||||||
58989875-C-T | 56843728-C-T | *** | ||||||||
10063778-G-A | 10226169-G-A | *** | ||||||||
13132246-A-G | 10621732-A-G | *** | ||||||||
10063762-G-C | 10226153-G-C | *** | ||||||||
10063776-A-C | 10226167-A-C | *** | ||||||||
10068075-TGTTG-CGTTT | 10230466-TGTTG-CGTTT | *** | ||||||||
24696149-A-G | 22550002-A-G | P3_b2 | *** | |||||||
9920473-GC-TT | 10082864-GC-TT | *** | ||||||||
7113261-G-T | 7245220-G-T | *** | ||||||||
24177697-T-TTG | 22031550-T-TTG | P3_b1 | 17×TG | *** | *** | |||||
13744999-C-T | 11589323-C-T | *** | ||||||||
22431818-G-T | 20269932-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
15047588-C-A | 12935679-C-A | *** | ||||||||
58982012-GTGCCAC-ATGTCAA | 56835865-GTGCCAC-ATGTCAA | *** | ||||||||
10071073-C-A | 10233464-C-A | *** | ||||||||
10064129-T-G | 10226520-T-G | *** | ||||||||
22334409-A-C | 20172523-A-C | DYZ19 | *** | |||||||
13461435-C-G | 11305759-C-G | *** | ||||||||
13744885-C-T | 11589209-C-T | *** | ||||||||
13299976-A-C | 11144300-A-C | *** | ||||||||
9931411-A-G | 10093802-A-G | *** | ||||||||
27527178-C-A | 25381031-C-A | P1_Y2 | *** | |||||||
10048503-A-G | 10210894-A-G | *** | ||||||||
10063473-T-C | 10225864-T-C | *** | ||||||||
10071114-G-A | 10233505-G-A | *** | ||||||||
26880327-A-T | 24734180-A-T | P1_r3 | *** | |||||||
59021583-ATAAT-GTAA | 56875436-ATAAT-GTAA | *** | ||||||||
22502126-T-G | 20340240-T-G | DYZ19 | *** | |||||||
9540282-G-T | 9702673-G-T | IR3_Prx | *** | |||||||
27016219-A-T | 24870072-A-T | P1_r4 | *** | |||||||
13855066-AGAG-GGAA | 11734360-AGAG-GGAA | *** | ||||||||
22364761-CT-TG | 20202875-CT-TG | DYZ19 | *** | |||||||
26880358-A-C | 24734211-A-C | P1_r3 | *** | |||||||
13846940-TAT-GAA | 11726234-TAT-GAA | *** | ||||||||
13326039-G-A | 11170363-G-A | *** | ||||||||
22360196-C-A | 20198310-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
9369169-A-T | 9531560-A-T | *** | ||||||||
13739635-A-T | 11583959-A-T | *** | ||||||||
27320941-A-AT | 25174794-A-AT | P1_g3 | 11×T | *** | ||||||
56851618-T-C | *** | |||||||||
58882865-C-T | 56708006-G-A | *** | ||||||||
28791280-A-G | 26645133-A-G | A4504 | *** | |||||||
56847053-C-T | *** | |||||||||
25628466-G-T | 23482319-G-T | P1_b3 | *** | |||||||
56843522-C-A | *** | |||||||||
13321117-G-A | 11165441-G-A | *** | ||||||||
28791259-C-A | 26645112-C-A | *** | ||||||||
22337965-A-C | 20176079-A-C | DYZ19 | *** | |||||||
58858773-A-T | 56732098-T-A | *** | ||||||||
58883954-A-G | 56706917-T-C | *** | ||||||||
26905497-CAA-C | 24759350-CAA-C | P1_r3 | 19×A | *** | ||||||
22431801-T-A | 20269915-T-A | DYZ19 | *** | |||||||
58858775-T-C | 56732096-A-G | *** | ||||||||
22277772-T-C | 20115886-T-C | ZS4707 | DYZ19 | *** | ||||||
26992936-C-T | 24846789-C-T | P1_r4 | *** | |||||||
24711544-GT-G | 22565397-GT-G | P3_b2 | 11×T | *** | ||||||
28008591-C-CA | 25862444-C-CA | P1_Y2 | 11×A | *** | ||||||
58912635-G-C | 56678236-C-G | *** | ||||||||
22501937-A-C | 20340051-A-C | DYZ19 | *** | |||||||
10685772-C-A | *** | |||||||||
13485890-CCCA-ACC | 11330214-CCCA-ACC | *** | ||||||||
16768530-T-A | 14656650-T-A | *** | ||||||||
13263371-CAGC-TAGG | 11107695-CAGC-TAGG | *** | ||||||||
13320070-A-T | 11164394-A-T | *** | ||||||||
9962556-G-A | 10124947-G-A | *** | ||||||||
25446036-A-T | 23299889-A-T | P2_r2 | *** | |||||||
13481937-C-A | 11326261-C-A | *** | ||||||||
22309924-G-T | 20148038-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
10048523-A-T | 10210914-A-T | *** | ||||||||
13132235-G-A | 10621721-G-A | *** | ||||||||
25466379-T-A | 23320232-T-A | P2_r2 | *** | |||||||
58837619-C-T | 56753252-G-A | *** | ||||||||
58844561-C-A | 56746310-G-T | *** | ||||||||
22504082-CCAGT-GCAGA | 20342196-CCAGT-GCAGA | DYZ19 | *** | |||||||
22421191-G-A | 20259305-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
22234403-G-A | 20072517-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
22277808-A-G | 20115922-A-G | DYZ19 | *** | |||||||
22277811-A-T | 20115925-A-T | DYZ19 | *** | |||||||
22277828-A-C | 20115942-A-C | DYZ19 | *** | |||||||
20892284-C-A | 18730398-C-A | FGC14545 | P4_Dst | 9×A | *** | |||||
25323046-A-G | 23176899-A-G | P2_r1 | *** | |||||||
9577007-C-A | 9739398-C-A | IR3_Prx | *** | |||||||
9944617-CTT-C | 10107008-CTT-C | *** | ||||||||
19546149-G-A | 17434269-G-A | *** | ||||||||
9944637-TG-T | 10107028-TG-T | *** | ||||||||
10071117-G-A | 10233508-G-A | *** | ||||||||
10063420-G-GT | 10225811-G-GT | *** | ||||||||
24595421-C-T | 22449274-C-T | P3_t2 | *** | |||||||
10744349-C-G | *** | |||||||||
22431886-C-A | 20270000-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
14429405-TTATATA-T | 12308680-TTATA-T | 15×TA | *** | |||||||
9218522-TTGTGTG-T,TTG | 9380913-TTGTGTG-T,TTG | 12×TG | *** | |||||||
18855427-T-C | 16743547-T-C | *** | ||||||||
18831702-G-A | 16719822-G-A | *** | ||||||||
10048514-A-G | 10210905-A-G | *** | ||||||||
9540266-A-G | 9702657-A-G | IR3_Prx | *** | |||||||
22972997-T-C | 20811111-T-C | *** | ||||||||
10064115-T-A | 10226506-T-A | *** | ||||||||
6403564-ATAT-GTAC | 6535523-ATAT-GTAC | *** | ||||||||
13846883-CGGAC-TGGAT | 11726177-CGGAC-TGGAT | *** | ||||||||
13859590-GAACAGATTCG-AAACGGACTC | 11738884-GAACAGATTCG-AAACGGACTC | *** | ||||||||
22234267-AAGAAAT-TAGTAAC | 20072381-AAGAAAT-TAGTAAC | DYZ19 | *** | |||||||
27435279-AGT-A | 25289132-AGT-A | P1_g3 | 11×GT | *** | ||||||
9952019-AT-A | 10114410-AT-A | *** | ||||||||
10014886-C-T | 10177277-C-T | *** | ||||||||
10042410-A-T | 10204801-A-T | *** | ||||||||
10063453-C-T | 10225844-C-T | FT258183 | *** | |||||||
10063823-G-A | 10226214-G-A | *** | ||||||||
10064070-G-T | 10226461-G-T | *** | ||||||||
21946458-T-C,G | 19784572-T-C,G | *** | ||||||||
10071193-C-A | 10233584-C-A | *** | ||||||||
22342344-C-A | 20180458-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
10071223-T-C | 10233614-T-C | *** | ||||||||
10071252-G-A | 10233643-G-A | *** | ||||||||
10071278-T-C | 10233669-T-C | *** | ||||||||
10071295-A-C | 10233686-A-C | *** | ||||||||
13711978-C-T | 11556302-C-T | *** | ||||||||
14067620-TAC-T | 11946914-TAC-T | *** | ||||||||
13132206-G-C | 10621692-G-C | *** | ||||||||
13132226-G-C | 10621712-G-C | *** | ||||||||
19187495-C-T | 17075615-C-T | *** | ||||||||
22431808-T-C | 20269922-T-C | DYZ19 | *** | |||||||
9977458-A-T | 10139849-A-T | *** | ||||||||
13684447-T-A | 11528771-T-A | *** | ||||||||
10063424-A-T | 10225815-A-T | *** | ||||||||
7493850-A-T | 7625809-A-T | IR1_L | *** | |||||||
7270341-A-G | 7402300-A-G | *** | ||||||||
26948608-C-A | 24802461-C-A | P1_r3 | *** | |||||||
27186316-C-A | 25040169-C-A | P1_g3 | *** | |||||||
27154710-G-T | 25008563-G-T | P1_g3 | *** | |||||||
4561176-TAACCTCGACCCAAATAATCTATAACA-T | 4693135-TAACCTCGACCCAAATAATCTATAACA-T | *** | ||||||||
27127696-A-T | 24981549-A-T | P1_g3 | *** | |||||||
8398986-TG-T | 8530945-TG-T | *** | ||||||||
27016224-G-T | 24870077-G-T | P1_r4 | *** | |||||||
18443075-A-T | 16331195-A-T | P6_Dst | *** | |||||||
26991237-T-A | 24845090-T-A | P1_r4 | *** | |||||||
26990989-A-G | 24844842-A-G | P1_r4 | *** | |||||||
18565029-T-A | 16453149-T-A | *** | ||||||||
26990974-G-T | 24844827-G-T | P1_r4 | *** | |||||||
26990961-A-C | 24844814-A-C | P1_r4 | *** | |||||||
26906653-T-C | 24760506-T-C | P1_r3 | *** | |||||||
27262724-G-A | 25116577-G-A | P1_g3 | *** | |||||||
26888460-A-T | 24742313-A-T | P1_r3 | *** | |||||||
4919329-G-T | 5051288-G-T | *** | ||||||||
26887082-G-T | 24740935-G-T | P1_r3 | *** | |||||||
26880435-G-C | 24734288-G-C | P1_r3 | *** | |||||||
19594580-A-G | 17482700-A-G | P5_Prx | *** | |||||||
19620655-C-T | 17508775-C-T | P5_Prx | *** | |||||||
19647567-A-T | 17535687-A-T | P5_Prx | *** | |||||||
19700272-T-A | 17588392-T-A | P5_Prx | *** | |||||||
19773539-C-A | 17661659-C-A | P5_Prx | *** | |||||||
19860888-C-A | 17749008-C-A | P5_Prx | *** | |||||||
20142918-T-G | 18031038-T-G | P5_Dst | *** | |||||||
20384647-T-A | 18222761-T-A | P5_Dst | *** | |||||||
8550834-T-G | 8682793-T-G | *** | ||||||||
17994782-G-T | 15882902-G-T | P7_Prx | *** | |||||||
20744673-C-A | 18582787-C-A | P4_Prx | *** | |||||||
28791275-G-C | 26645128-G-C | *** | ||||||||
16136115-G-T | 14024235-G-T | P8_Dst | *** | |||||||
10755388-ACTCATCTCTGTTTCATTCCG-A,ACTCCTCTCTGTTCCATTCCG | *** | |||||||||
16136116-C-A | 14024236-C-A | P8_Dst | *** | |||||||
10744381-G-C,T | *** | |||||||||
58908849-C-A | 56682022-G-T | *** | ||||||||
58908830-C-A | 56682041-G-T | *** | ||||||||
58891015-C-G | 56699856-G-C | *** | ||||||||
58891006-C-T | 56699865-G-A | *** | ||||||||
10677750-AC-A | *** | |||||||||
10676941-C-A | *** | |||||||||
28804054-C-A | 26657907-C-A | *** | ||||||||
28791307-G-A | 26645160-G-A | *** | ||||||||
9978958-C-A | 10141349-C-A | *** | ||||||||
27289694-G-T | 25143547-G-T | P1_g3 | *** | |||||||
28567393-G-T | 26421246-G-T | *** | ||||||||
28556329-G-T | 26410182-G-T | *** | ||||||||
28234302-A-T | 26088155-A-T | P1_b4 | *** | |||||||
28204106-A-T | 26057959-A-T | P1_b4 | *** | |||||||
27994928-A-G | 25848781-A-G | P1_Y2 | *** | |||||||
27916430-T-A | 25770283-T-A | P1_Y2 | *** | |||||||
27916422-C-A | 25770275-C-A | P1_Y2 | *** | |||||||
27841969-C-A | 25695822-C-A | P1_Y2 | *** | |||||||
17591815-A-G | 15479935-A-G | *** | ||||||||
27714511-G-T | 25568364-G-T | P1_Y2 | *** | |||||||
17629764-C-A | 15517884-C-A | *** | ||||||||
27337977-G-A | 25191830-G-A | P1_g3 | *** | |||||||
20732251-C-A | 18570365-C-A | P4_Prx | *** | |||||||
26880374-A-T | 24734227-A-T | P1_r3 | *** | |||||||
58908862-T-C | 56682009-A-G | *** | ||||||||
25296562-A-T | 23150415-A-T | P2_r1 | *** | |||||||
22537329-C-A | 20375443-C-A | *** | ||||||||
25699320-G-T | 23553173-G-T | P1_b3 | *** | |||||||
25677297-C-T | 23531150-C-T | P1_b3 | *** | |||||||
25651206-T-A | 23505059-T-A | P1_b3 | *** | |||||||
25628726-G-T | 23482579-G-T | P1_b3 | *** | |||||||
25626745-G-A | 23480598-G-A | P1_b3 | *** | |||||||
25602263-T-A | 23456116-T-A | P1_gr1 | *** | |||||||
25592624-C-A | 23446477-C-A | P1_gr1 | *** | |||||||
25466404-T-G | 23320257-T-G | P2_r2 | *** | |||||||
25446052-C-T | 23299905-C-T | P2_r2 | *** | |||||||
25380279-T-G | 23234132-T-G | P2_r2 | *** | |||||||
25369409-A-T | 23223262-A-T | P2_r2 | *** | |||||||
25273912-A-T | 23127765-A-T | P2_r1 | *** | |||||||
22488858-T-G | 20326972-T-G | DYZ19 | *** | |||||||
25228196-G-T | 23082049-G-T | P2_r1 | *** | |||||||
25223947-G-A | 23077800-G-A | P2_r1 | *** | |||||||
25223790-A-C | 23077643-A-C | P2_r1 | *** | |||||||
23682279-G-T | 21520393-G-T | *** | ||||||||
23810486-C-A | 21648600-C-A | *** | ||||||||
23831335-T-C | 21669449-T-C | *** | ||||||||
23879996-G-A | 21718110-G-A | *** | ||||||||
24013816-G-A | 21867669-G-A | *** | ||||||||
24013834-T-A | 21867687-T-A | *** | ||||||||
24028294-G-A | 21882147-G-A | *** | ||||||||
24038362-G-A | 21892215-G-A | *** | ||||||||
24353293-T-A | 22207146-T-A | P3_t1 | *** | |||||||
22493065-G-C | 20331179-G-C | DYZ19 | *** | |||||||
22481826-G-C | 20319940-G-C | DYZ19 | *** | |||||||
20931406-C-T | 18769520-C-T | P4_Dst | *** | |||||||
26580614-G-T | 24434467-G-T | P1_g2 | *** | |||||||
20947502-A-C | 18785616-A-C | P4_Dst | *** | |||||||
26880365-G-T | 24734218-G-T | P1_r3 | *** | |||||||
21170314-G-A | 19008428-G-A | *** | ||||||||
26880363-A-C | 24734216-A-C | P1_r3 | *** | |||||||
26880361-A-T | 24734214-A-T | P1_r3 | *** | |||||||
26880343-A-T | 24734196-A-T | P1_r3 | *** | |||||||
7040196-G-T | 7172155-G-T | *** | ||||||||
7040029-G-T | 7171988-G-T | *** | ||||||||
26880267-G-T | 24734120-G-T | P1_r3 | *** | |||||||
26874719-G-A | 24728572-G-A | P1_r3 | *** | |||||||
26874067-C-A | 24727920-C-A | P1_r3 | *** | |||||||
26594387-A-C | 24448240-A-C | P1_g2 | *** | |||||||
26462979-T-C | 24316832-T-C | P1_Y1 | *** | |||||||
22433116-T-A | 20271230-T-A | DYZ19 | *** | |||||||
26308622-C-A | 24162475-C-A | P1_Y1 | *** | |||||||
26219813-T-A | 24073666-T-A | P1_Y1 | *** | |||||||
26105783-C-T | 23959636-C-T | P1_Y1 | *** | |||||||
26032791-C-A | 23886644-C-A | P1_Y1 | *** | |||||||
22235316-C-A | 20073430-C-A | BY213616 | DYZ19 | *** | ||||||
22301151-T-C | 20139265-T-C | DYZ19 | *** | |||||||
22327188-G-T | 20165302-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
22334517-A-C | 20172631-A-C | DYZ19 | *** | |||||||
22334529-C-A | 20172643-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
22421090-G-T | 20259204-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
22421109-G-T | 20259223-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
22421121-G-T | 20259235-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
16104925-C-A | 13993045-C-A | P8_Prx | *** | |||||||
10756078-A-T | *** | |||||||||
4070062-C-A | 4202021-C-A | *** | ||||||||
10043821-T-C | 10206212-T-C | *** | ||||||||
22504487-CGTT-AGTG | 20342601-CGTT-AGTG | DYZ19 | *** | |||||||
9943740-G-C | 10106131-G-C | *** | ||||||||
9944900-G-T | 10107291-G-T | *** | ||||||||
9945452-T-C | 10107843-T-C | *** | ||||||||
9945458-A-G | 10107849-A-G | *** | ||||||||
9945467-C-T | 10107858-C-T | *** | ||||||||
9947666-G-T | 10110057-G-T | *** | ||||||||
10043063-C-T | 10205454-C-T | *** | ||||||||
10043237-T-C | 10205628-T-C | *** | ||||||||
11003677-C-A | *** | |||||||||
10043265-T-C | 10205656-T-C | FT178380 | *** | |||||||
10043794-T-A | 10206185-T-A | *** | ||||||||
10043846-G-A | 10206237-G-A | *** | ||||||||
24013786-CATGG-TATGT | 21867639-CATGG-TATGT | *** | ||||||||
10048504-C-T | 10210895-C-T | *** | ||||||||
10048520-G-A | 10210911-G-A | *** | ||||||||
22324931-TCAT-GCAC | 20163045-TCAT-GCAC | DYZ19 | *** | |||||||
10063458-G-T | 10225849-G-T | *** | ||||||||
10063719-T-C | 10226110-T-C | *** | ||||||||
10063752-G-C | 10226143-G-C | *** | ||||||||
10068058-G-T | 10230449-G-T | *** | ||||||||
10072036-T-C | 10234427-T-C | *** | ||||||||
10072073-T-C | 10234464-T-C | *** | ||||||||
10086268-C-A | 10248659-C-A | *** | ||||||||
10086355-C-T | 10248746-C-T | *** | ||||||||
13114746-T-A | 10604232-T-A | *** | ||||||||
9931448-G-A | 10093839-G-A | *** | ||||||||
9924611-C-A | 10087002-C-A | *** | ||||||||
13132248-G-A | 10621734-G-A | *** | ||||||||
9166864-T-G | 9329255-T-G | *** | ||||||||
15279206-GTTT-G | 13167305-GTTT-G | 13×T | *** | |||||||
58970174-AA-T | 56824027-AA-T | *** | ||||||||
7466561-C-A | 7598520-C-A | IR1_L | *** | |||||||
24587621-C-A | 22441474-C-A | P3_t2 | *** | |||||||
58908842-TCCCAT-CTCCAC | 56682024-ATGGGA-GTGGAG | *** | ||||||||
58883943-TATC-CATT | 56706925-GATA-AATG | *** | ||||||||
58862760-CG-AA | 56728110-CG-TT | *** | ||||||||
27095986-GTA-TTT | 24949839-GTA-TTT | P1_r4 | *** | |||||||
27016157-CC-TT | 24870010-CC-TT | P1_r4 | *** | |||||||
26283209-CAA-C | 24137062-CAA-C | P1_Y1 | 21×A | *** | ||||||
25096454-A-AAAGC | 22950307-A-AAAGC | g1 | *** | |||||||
24325455-A-AT | 22179308-A-AT | P3_t1 | 11×T | *** | ||||||
9209009-G-T | 9371400-G-T | *** | ||||||||
9924584-G-C | 10086975-G-C | *** | ||||||||
9354950-A-G | 9517341-A-G | *** | ||||||||
13487151-C-T | 11331475-C-T | FGC58454 | *** | |||||||
9540270-T-C | 9702661-T-C | IR3_Prx | *** | |||||||
9540292-C-T | 9702683-C-T | IR3_Prx | *** | |||||||
9731848-C-G | 9894239-C-G | IR3_Prx | *** | |||||||
9916163-A-G | 10078554-A-G | *** | ||||||||
9916247-T-A | 10078638-T-A | *** | ||||||||
9916257-T-A | 10078648-T-A | *** | ||||||||
9916297-A-T | 10078688-A-T | *** | ||||||||
9920507-A-C | 10082898-A-C | *** | ||||||||
9920593-T-A | 10082984-T-A | *** | ||||||||
9924567-C-G | 10086958-C-G | *** | ||||||||
13132244-C-T | 10621730-C-T | *** | ||||||||
13132280-T-C | 10621766-T-C | *** | ||||||||
10756103-A-G | *** | |||||||||
9916262-AAA-CAG | 10078653-AAA-CAG | *** | ||||||||
10063453-CGACAG-TGACT | 10225844-CGACAG-TGACT | *** | ||||||||
2845950-T-C | 2977909-T-C | *** | ||||||||
10043209-AA-GG | 10205600-AA-GG | *** | ||||||||
10037786-GGCTC-AGCTT | 10200177-GGCTC-AGCTT | *** | ||||||||
9930096-GG-AA | 10092487-GG-AA | *** | ||||||||
9924554-CAGAG-AAAAT | 10086945-CAGAG-AAAAT | *** | ||||||||
9924546-ACAC-TCAA | 10086937-ACAC-TCAA | *** | ||||||||
14785522-C-T | 12673592-C-T | *** | ||||||||
9920618-CC-GT | 10083009-CC-GT | *** | ||||||||
9920578-ACT-GCC | 10082969-ACT-GCC | *** | ||||||||
9920498-CTGTT-TTGTC | 10082889-CTGTT-TTGTC | *** | ||||||||
9916277-CTTT-C | 10078668-CTTT-C | *** | ||||||||
9916210-C-CTGAGATAGTT | 10078601-C-CTGAGATAGTT | *** | ||||||||
2768043-TACAG-T | 2900002-TACAG-T | *** | ||||||||
9916198-GT-AA | 10078589-GT-AA | *** | ||||||||
9474544-CA-C | 9636935-CA-C | *** | ||||||||
6780897-C-AA | 6912856-C-AA | *** | ||||||||
10780664-C-G | *** | |||||||||
5059692-GACT-CACC | 5191651-GACT-CACC | *** | ||||||||
13705584-TA-AG | 11549908-TA-AG | *** | ||||||||
9923867-AT-GA | 10086258-AT-GA | *** | ||||||||
19693510-AT-A | 17581630-AT-A | P5_Prx | 12×T | *** | ||||||
21464556-G-AA | 19302670-G-AA | *** | ||||||||
16015243-A-G | 13903363-A-G | *** | ||||||||
58912617-C-A | 56678254-G-T | *** | ||||||||
10756119-T-TTTAAC | *** | |||||||||
10068056-AAG-TAT | 10230447-AAG-TAT | *** | ||||||||
10072025-AGGA-GGGC | 10234416-AGGA-GGGC | *** | ||||||||
13454742-C-A | 11299066-C-A | *** | ||||||||
13521512-A-C | 11365836-A-C | *** | ||||||||
21386171-TTA-T | 19224285-TTA-T | *** | ||||||||
19948181-CCTTTCTTT-C | 17836301-CCTTTCTTT-C | P5_Prx | 21×CTTT | *** | ||||||
13395224-C-G | 11239548-C-G | *** | ||||||||
13395236-C-A | 11239560-C-A | *** | ||||||||
18325701-ATTTT-A | 16213821-ATTTT-A | P6_Prx | 27×T | *** | ||||||
13421471-C-G | 11265795-C-G | *** | ||||||||
13421495-C-T | 11265819-C-T | *** | ||||||||
13433800-C-T | 11278124-C-T | *** | ||||||||
13446072-G-A | 11290396-G-A | *** | ||||||||
13460841-A-C | 11305165-A-C | *** | ||||||||
17672318-GAAAAA-G | 15560438-GAAAAA-G | 16×A | *** | |||||||
13510078-T-C | 11354402-T-C | *** | ||||||||
17663107-CAAG-AAAA | 15551227-CAAG-AAAA | *** | ||||||||
10072047-CCC-TCA | 10234438-CCC-TCA | *** | ||||||||
13729758-T-A | 11574082-T-A | *** | ||||||||
13733676-T-G | 11578000-T-G | *** | ||||||||
13733686-T-A | 11578010-T-A | *** | ||||||||
13740321-T-G | 11584645-T-G | *** | ||||||||
13744989-T-C | 11589313-T-C | *** | ||||||||
13745001-G-A | 11589325-G-A | *** | ||||||||
14391874-TAAAAAA-T | 12271170-TAAAAAA-T | 15×A | *** | |||||||
13842646-C-CGGAATGGAAT | 11721940-C-CGGAATGGAAT | 12×GGAAT | *** | |||||||
13809254-GAATAT-AAATGG | 11688548-GAATAT-AAATGG | *** | ||||||||
13737509-GATTG-AATTC | 11581833-GATTG-AATTC | *** | ||||||||
13461249-TATGT-AATGC | 11305573-TATGT-AATGC | *** | ||||||||
13460649-TCC-CCT | 11304973-TCC-CCT | *** | ||||||||
10086271-CCATA-ACATT | 10248662-CCATA-ACATT | *** | ||||||||
26089061-C-A | 23942914-C-A | P1_Y1 | 20×A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: B59960 | 10852525 | 7885405 | 7971731 |
Kit: KA2ZZ* | 16000000 | 10000000 | 8300000 |
Kit: B59960 | 9925671 | 8056715 | 7923662 |
Used in age calculations | 16000000 | 10000000 | 8300000 |
Counts of SNPs | 5 | 4 |
* BED data not available. Using default values.
Big Tree Main Page