McGill
FTDNA: 306812, BigY2: 306812, BigY3: 306812Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 306812 | BigY2 306812 | BigY3 306812 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
13470039-T-A | 11314363-T-A | A* | ||||||||
13695040-T-A | 11539364-T-A | DYZ17 | A* | |||||||
19844872-G-GT | 17732992-G-GT | P5_Prx | A* | |||||||
27550462-C-CT | 25404315-C-CT | P1_Y2 | 13×T | A* | ||||||
15931003-CCTT-C | 13819123-CCTT-C | BY102602 | + | + | + | |||||
13658047-G-C | 11502371-G-C | BY87307 | DYZ17 | + | + | + | ||||
17570382-C-T | 15458502-C-T | BY115798 | Y | Y | + | + | + | |||
22676920-C-T | 20515034-C-T | BY139971 | Y | Y | + | + | + | |||
10777715-A-C | FT91680 | + | ||||||||
3391304-C-T | 3523263-C-T | FT80352 | + | |||||||
4449547-G-T | 4581506-G-T | FT80471 | + | |||||||
5126705-G-A | 5258664-G-A | FT80553 | + | |||||||
5844263-T-A | 5976222-T-A | FT80643 | + | |||||||
6501799-T-A | 6633758-T-A | FT80688 | + | |||||||
14270931-C-T | 12150225-C-T | FT80806 | Y | + | ||||||
18407509-A-C | 16295629-A-C | FT80927 | P6_Gap | + | ||||||
56881983-G-A | + | |||||||||
10668622-G-GTTCCA | * | |||||||||
13482911-A-C | 11327235-A-C | ** | ||||||||
13405144-T-TC | 11249468-T-TC | ** | ||||||||
15400167-C-A | 13288287-C-A | 14×A | ** | |||||||
58969434-C-T | 56823287-C-T | ** | ||||||||
4267560-TTC-T | 4399519-TTC-T | ** | ||||||||
9514823-A-G | 9677214-A-G | FT328081 | ** | |||||||
15186578-T-A | 13074664-T-A | ** | ||||||||
18188288-C-A | 16076408-C-A | M11473 | ** | |||||||
28642853-CAG-C | 26496706-CAG-C | ** | ||||||||
4388461-C-A | 4520420-C-A | ** | ||||||||
23723544-CAT-C | 21561658-CAT-C | 27×AT | ** | |||||||
26228738-C-T | 24082591-C-T | P1_Y1 | ** | |||||||
27733710-T-A | 25587563-T-A | P1_Y2 | ** | |||||||
13405150-TTTTT-AA | 11249474-TTTTT-AA | ** | ||||||||
4439360-G-A | 4571319-G-A | FGC57729 | ** | |||||||
7417581-G-T | 7549540-G-T | ** | ||||||||
58983484-T-A | 56837337-T-A | ** | ||||||||
10951023-T-C | ** | |||||||||
10935449-C-G | ** | |||||||||
7450219-C-A | 7582178-C-A | IR1_L | ** | |||||||
14926458-GTC-G | 12814523-GTC-G | ** | ||||||||
21515860-C-T | 19353974-C-T | ** | ||||||||
14537918-C-A | 12426119-C-A | ** | ||||||||
15435136-C-A | 13323256-C-A | ** | ||||||||
13441576-TATA-T | 11285900-TATA-T | 5×ATA | ** | |||||||
16531070-C-A | 14419190-C-A | ** | ||||||||
13482885-C-T | 11327209-C-T | ** | ||||||||
14649481-C-A | 12537546-C-A | ** | ||||||||
18959203-A-G | 16847323-A-G | ** | ||||||||
10776055-C-CTCTCG | ** | |||||||||
10935489-C-T | ** | |||||||||
8124979-T-A | 8256938-T-A | ** | ||||||||
17602363-C-A | 15490483-C-A | ** | ||||||||
10755269-C-T | ** | |||||||||
11016193-G-A | FGCLR232 | ** | ||||||||
10790970-T-A | ** | |||||||||
10790993-T-CC | ** | |||||||||
10790995-AT-A | ** | |||||||||
10791001-T-C | ** | |||||||||
10791003-C-T | ** | |||||||||
10950524-C-A | ** | |||||||||
7131406-CT-C | 7263365-CT-C | ** | ||||||||
7643196-C-A | 7775155-C-A | ** | ||||||||
7289494-C-A | 7421453-C-A | ** | ||||||||
7256122-C-A | 7388081-C-A | ** | ||||||||
2688767-C-A | 2820726-C-A | ** | ||||||||
2718905-GAC-G | 2850864-GAC-G | ** | ||||||||
2745739-C-A | 2877698-C-A | ** | ||||||||
2752677-G-C | 2884636-G-C | ** | ||||||||
2840021-A-T | 2971980-A-T | ** | ||||||||
2845177-G-A | 2977136-G-A | ** | ||||||||
2855530-C-A | 2987489-C-A | ** | ||||||||
3046523-T-A | 3178482-T-A | ** | ||||||||
3062909-A-T | 3194868-A-T | ** | ||||||||
3165058-G-T | 3297017-G-T | ** | ||||||||
3165129-TA-T | 3297088-TA-T | ** | ||||||||
3285062-G-T | 3417021-G-T | ** | ||||||||
3352098-C-A | 3484057-C-A | ** | ||||||||
3367037-A-T | 3498996-A-T | ** | ||||||||
3367039-A-T | 3498998-A-T | ** | ||||||||
3431587-CCTG-C | 3563546-CCTG-C | ** | ||||||||
3472275-A-C | 3604234-A-C | ** | ||||||||
3545537-T-A | 3677496-T-A | ** | ||||||||
3545539-C-A | 3677498-C-A | ** | ||||||||
3627913-T-C | 3759872-T-C | ** | ||||||||
3641246-C-T | 3773205-C-T | FT307132 | ** | |||||||
3681433-G-A | 3813392-G-A | ** | ||||||||
3705089-C-A | 3837048-C-A | ** | ||||||||
3732187-C-A | 3864146-C-A | ** | ||||||||
3740384-A-T | 3872343-A-T | ** | ||||||||
3790804-GTGTGTGTGTGTGTGTAT-G | 3922763-GTGTGTGTGTGTGTGTAT-G | ** | ||||||||
3802497-A-T | 3934456-A-T | ** | ||||||||
3829007-C-T | 3960966-C-T | FTB51073 | ** | |||||||
3976282-T-G | 4108241-T-G | FT351731 | ** | |||||||
4128916-T-C | 4260875-T-C | ** | ||||||||
4129638-C-T | 4261597-C-T | ** | ||||||||
4137936-C-A | 4269895-C-A | ** | ||||||||
4148098-A-G | 4280057-A-G | ** | ||||||||
4167641-A-T | 4299600-A-T | ** | ||||||||
4167670-A-AG | 4299629-A-AG | ** | ||||||||
4212731-C-A | 4344690-C-A | ** | ||||||||
4223814-C-A | 4355773-C-A | ** | ||||||||
4226252-G-T | 4358211-G-T | ** | ||||||||
4267624-C-A | 4399583-C-A | ** | ||||||||
4340313-C-A | 4472272-C-A | ** | ||||||||
4353821-C-A | 4485780-C-A | ** | ||||||||
4357951-T-C | 4489910-T-C | ** | ||||||||
4387726-A-G | 4519685-A-G | ** | ||||||||
4403875-A-G | 4535834-A-G | ** | ||||||||
4439289-C-A | 4571248-C-A | ** | ||||||||
4442940-C-A | 4574899-C-A | ** | ||||||||
4466957-C-A | 4598916-C-A | ** | ||||||||
4476238-C-A | 4608197-C-A | ** | ||||||||
4561570-A-G | 4693529-A-G | FT113727 | ** | |||||||
4561577-T-A | 4693536-T-A | ** | ||||||||
4599107-A-C | 4731066-A-C | ** | ||||||||
4700329-C-A | 4832288-C-A | ** | ||||||||
4749526-A-T | 4881485-A-T | ** | ||||||||
4777270-G-A | 4909229-G-A | ** | ||||||||
4778585-C-A | 4910544-C-A | ** | ||||||||
4871471-T-A | 5003430-T-A | ** | ||||||||
4871475-T-G | 5003434-T-G | ** | ||||||||
4891255-C-T | 5023214-C-T | ** | ||||||||
4891320-G-A | 5023279-G-A | ** | ||||||||
4898552-C-A | 5030511-C-A | ** | ||||||||
4902103-T-G | 5034062-T-G | ** | ||||||||
4902495-G-T | 5034454-G-T | ** | ||||||||
4950972-C-A | 5082931-C-A | ** | ||||||||
5005743-A-C | 5137702-A-C | ** | ||||||||
5060183-T-A | 5192142-T-A | ** | ||||||||
5148969-G-T | 5280928-G-T | ** | ||||||||
5158381-C-A | 5290340-C-A | ** | ||||||||
5194165-C-T | 5326124-C-T | ** | ||||||||
5199635-C-A | 5331594-C-A | ** | ||||||||
5205117-T-C | 5337076-T-C | ** | ||||||||
5243463-A-C | 5375422-A-C | ** | ||||||||
5263559-C-A | 5395518-C-A | ** | ||||||||
5264482-G-T | 5396441-G-T | ** | ||||||||
5334297-G-A | 5466256-G-A | ** | ||||||||
5393542-A-G | 5525501-A-G | ** | ||||||||
5444818-G-T | 5576777-G-T | ** | ||||||||
5472075-G-T | 5604034-G-T | ** | ||||||||
5473296-C-A | 5605255-C-A | ** | ||||||||
5549069-A-G | 5681028-A-G | ** | ||||||||
5560098-C-A | 5692057-C-A | ** | ||||||||
5633835-G-T | 5765794-G-T | ** | ||||||||
5635379-A-G | 5767338-A-G | ** | ||||||||
5635382-A-G | 5767341-A-G | ** | ||||||||
5651628-G-T | 5783587-G-T | ** | ||||||||
5694323-C-A | 5826282-C-A | ** | ||||||||
5694609-G-T | 5826568-G-T | ** | ||||||||
5755181-C-A | 5887140-C-A | ** | ||||||||
5794502-C-A | 5926461-C-A | ** | ||||||||
5794646-C-T | 5926605-C-T | ** | ||||||||
5813674-T-A | 5945633-T-A | ** | ||||||||
5858436-T-C | 5990395-T-C | ** | ||||||||
5861164-C-A | 5993123-C-A | ** | ||||||||
5865466-C-A | 5997425-C-A | ** | ||||||||
5924777-A-C | 6056736-A-C | ** | ||||||||
5931938-T-TA | 6063897-T-TA | ** | ||||||||
5967587-C-A | 6099546-C-A | ** | ||||||||
5987684-T-C | 6119643-T-C | ** | ||||||||
6073365-T-C | 6205324-T-C | ** | ||||||||
6073373-G-T | 6205332-G-T | ** | ||||||||
6177391-G-T | 6309350-G-T | IR3_Dst | ** | |||||||
6329215-C-A | 6461174-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6359730-C-A | 6491689-C-A | ** | ||||||||
6384606-G-T | 6516565-G-T | ** | ||||||||
6401605-C-A | 6533564-C-A | ** | ||||||||
6478633-G-A | 6610592-G-A | ** | ||||||||
6505652-A-C | 6637611-A-C | ** | ||||||||
6590657-GCATGTTC-G | 6722616-GCATGTTC-G | ** | ||||||||
6637111-G-A | 6769070-G-A | ** | ||||||||
6700751-T-C | 6832710-T-C | ** | ||||||||
6700757-C-T | 6832716-C-T | ** | ||||||||
6700761-G-A | 6832720-G-A | ** | ||||||||
6714716-C-A | 6846675-C-A | ** | ||||||||
6765621-C-T | 6897580-C-T | 13×T | ** | |||||||
6772986-A-G | 6904945-A-G | ** | ||||||||
6775337-T-A | 6907296-T-A | ** | ||||||||
6901215-T-A | 7033174-T-A | ** | ||||||||
6922741-C-A | 7054700-C-A | ** | ||||||||
6978144-T-G | 7110103-T-G | ** | ||||||||
7012748-C-A | 7144707-C-A | ** | ||||||||
7029928-A-T | 7161887-A-T | ** | ||||||||
7048666-C-A | 7180625-C-A | ** | ||||||||
7082709-C-G | 7214668-C-G | ** | ||||||||
7104918-C-A | 7236877-C-A | ** | ||||||||
7110864-C-A | 7242823-C-A | ** | ||||||||
7132903-C-A | 7264862-C-A | ** | ||||||||
7138899-C-A | 7270858-C-A | ** | ||||||||
7155412-C-A | 7287371-C-A | ** | ||||||||
7160925-C-A | 7292884-C-A | ** | ||||||||
7182192-G-C | 7314151-G-C | ** | ||||||||
7182265-G-A | 7314224-G-A | ** | ||||||||
7196254-T-C | 7328213-T-C | ** | ||||||||
7197455-C-A | 7329414-C-A | ** | ||||||||
7204929-C-A | 7336888-C-A | ** | ||||||||
7289502-C-A | 7421461-C-A | ** | ||||||||
7299621-T-A | 7431580-T-A | ** | ||||||||
7303237-C-A | 7435196-C-A | ** | ||||||||
7308338-C-A | 7440297-C-A | ** | ||||||||
7313574-G-T | 7445533-G-T | ** | ||||||||
7333824-C-T | 7465783-C-T | ** | ||||||||
7335636-C-A | 7467595-C-A | ** | ||||||||
7384368-C-A | 7516327-C-A | ** | ||||||||
7436277-A-C | 7568236-A-C | ** | ||||||||
7534582-G-T | 7666541-G-T | ** | ||||||||
7536484-C-A | 7668443-C-A | ** | ||||||||
7629843-A-T | 7761802-A-T | ** | ||||||||
7641021-C-A | 7772980-C-A | ** | ||||||||
7695729-A-G | 7827688-A-G | ** | ||||||||
7755252-T-G | 7887211-T-G | ** | ||||||||
7820954-C-A | 7952913-C-A | ** | ||||||||
7821074-A-T | 7953033-A-T | ** | ||||||||
7821078-A-T | 7953037-A-T | ** | ||||||||
7821079-A-C | 7953038-A-C | ** | ||||||||
7821318-A-T | 7953277-A-T | ** | ||||||||
7866102-C-A | 7998061-C-A | ** | ||||||||
7990188-T-G | 8122147-T-G | ** | ||||||||
7996048-G-T | 8128007-G-T | ** | ||||||||
8058510-C-A | 8190469-C-A | ** | ||||||||
8074225-A-G | 8206184-A-G | ** | ||||||||
8140377-A-G | 8272336-A-G | ** | ||||||||
8290987-C-T | 8422946-C-T | ** | ||||||||
8690395-A-T | 8822354-A-T | ** | ||||||||
8746498-C-A | 8878457-C-A | ** | ||||||||
8807340-C-A | 8939299-C-A | ** | ||||||||
8817114-C-A | 8949073-C-A | ** | ||||||||
9030127-A-T | 9192518-A-T | ** | ||||||||
9077781-T-C | 9240172-T-C | ** | ||||||||
9077785-T-C | 9240176-T-C | ** | ||||||||
9077808-C-T | 9240199-C-T | ** | ||||||||
9183605-C-A | 9345996-C-A | ** | ||||||||
9356603-C-A | 9518994-C-A | ** | ||||||||
9414669-C-A | 9577060-C-A | ** | ||||||||
9423006-A-G | 9585397-A-G | ** | ||||||||
9427658-A-C | 9590049-A-C | ** | ||||||||
9442099-T-A | 9604490-T-A | ** | ||||||||
9444857-A-T | 9607248-A-T | ** | ||||||||
9469801-A-C | 9632192-A-C | ** | ||||||||
9512012-T-G | 9674403-T-G | ** | ||||||||
9559495-T-TGG | 9721886-T-TGG | IR3_Prx | ** | |||||||
9735764-G-T | 9898155-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9826144-C-A | 9988535-C-A | ** | ||||||||
9892506-C-A | 10054897-C-A | ** | ||||||||
9927620-C-A | 10090011-C-A | ** | ||||||||
9928664-G-A | 10091055-G-A | ** | ||||||||
9928670-G-A | 10091061-G-A | ** | ||||||||
9956357-C-A | 10118748-C-A | ** | ||||||||
9993551-C-A | 10155942-C-A | ** | ||||||||
9993557-C-A | 10155948-C-A | ** | ||||||||
10015018-G-C | 10177409-G-C | ** | ||||||||
10037761-T-A | 10200152-T-A | ** | ||||||||
10624453-C-A | ** | |||||||||
10627921-C-A | ** | |||||||||
10653178-A-C | ** | |||||||||
10658493-C-A | ** | |||||||||
10658570-T-G | ** | |||||||||
10659162-C-T | ** | |||||||||
10663219-G-T | ** | |||||||||
10670845-C-A | ** | |||||||||
10677548-A-T | ** | |||||||||
10677548-ATTCAC-A | ** | |||||||||
10678079-C-A | ** | |||||||||
10685711-C-A | ** | |||||||||
10685766-C-T | ** | |||||||||
10685794-T-A | ** | |||||||||
10685801-C-G | ** | |||||||||
10744649-C-A | ** | |||||||||
10746596-T-C | ** | |||||||||
10748322-C-A | ** | |||||||||
10749318-G-T | ** | |||||||||
10750020-C-A | ** | |||||||||
10759194-T-C | ** | |||||||||
10759217-C-G | ** | |||||||||
10759223-T-C | ** | |||||||||
10759239-G-A | ** | |||||||||
10759994-C-CTGTT | ** | |||||||||
10760301-ACTACT-A | ** | |||||||||
10762954-C-T | ** | |||||||||
10762958-T-A | ** | |||||||||
10764178-A-G | ** | |||||||||
10770035-C-T | ** | |||||||||
10773287-C-A | ** | |||||||||
10773481-A-C | ** | |||||||||
10778533-C-A | ** | |||||||||
10778868-G-C | ** | |||||||||
10780518-C-T | ** | |||||||||
10780534-A-T | ** | |||||||||
10780537-CCATTATTTTA-C | ** | |||||||||
10780565-T-A | ** | |||||||||
10781779-A-G | ** | |||||||||
10785665-C-A | ** | |||||||||
10792411-C-CCACCTCACTCCACTG | ** | |||||||||
10792725-CTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCAT-C | ** | |||||||||
10801305-T-C | ** | |||||||||
10822543-T-C | ** | |||||||||
10827056-C-A | ** | |||||||||
10840811-C-A | ** | |||||||||
10843724-T-TCCCCTCCATTC | ** | |||||||||
10862009-C-A | ** | |||||||||
10872797-T-G | ** | |||||||||
10880732-C-A | ** | |||||||||
10886711-C-A | ** | |||||||||
10886940-C-A | ** | |||||||||
10889296-TC-T | ** | |||||||||
10889404-A-G | ** | |||||||||
10896072-C-G | ** | |||||||||
10896092-A-C | ** | |||||||||
10896293-A-G | ** | |||||||||
10900082-T-G | ** | |||||||||
10900208-C-A | ** | |||||||||
10909676-C-T | ** | |||||||||
10918496-C-T | ** | |||||||||
10930487-G-A | ** | |||||||||
10930536-T-C | ** | |||||||||
10943435-C-A | ** | |||||||||
10949756-T-C | ** | |||||||||
10950498-A-T | ** | |||||||||
10950506-C-G | ** | |||||||||
10950529-G-GTCTAC | ** | |||||||||
10950540-T-C | ** | |||||||||
10950559-T-C | ** | |||||||||
10950561-G-C | ** | |||||||||
10950569-C-T | ** | |||||||||
10954310-C-T | ** | |||||||||
10954316-C-T | ** | |||||||||
10954335-C-G | FT438037 | ** | ||||||||
10954343-C-CTCCATACAAT | ** | |||||||||
10961428-C-CCCCGTTCTAT | ** | |||||||||
10961458-T-G | ** | |||||||||
10961459-T-A | ** | |||||||||
10964416-G-T | ** | |||||||||
10974180-C-A | ** | |||||||||
10979408-C-A | ** | |||||||||
10979817-C-A | ** | |||||||||
10981393-C-T | ** | |||||||||
10993083-T-C | ** | |||||||||
10993088-T-C | ** | |||||||||
10997460-T-C | ** | |||||||||
11016162-A-C | ** | |||||||||
11018050-C-A | ** | |||||||||
11024957-G-A | ** | |||||||||
11025677-A-T | ** | |||||||||
11030029-C-A | ** | |||||||||
13198888-T-C | 11043212-T-C | ** | ||||||||
13198929-G-A | 11043253-G-A | ** | ||||||||
13217097-C-A | 11061421-C-A | ** | ||||||||
13222151-A-G | 11066475-A-G | ** | ||||||||
13223714-G-A | 11068038-G-A | ** | ||||||||
13235043-G-T | 11079367-G-T | ** | ||||||||
13258661-C-A | 11102985-C-A | ** | ||||||||
13462210-C-A | 11306534-C-A | ** | ||||||||
13482901-C-G | 11327225-C-G | ** | ||||||||
13482920-C-G | 11327244-C-G | ** | ||||||||
13482922-T-C | 11327246-T-C | ** | ||||||||
13482935-C-T | 11327259-C-T | ** | ||||||||
13482936-A-C | 11327260-A-C | ** | ||||||||
13485573-G-T | 11329897-G-T | ** | ||||||||
13521647-C-A | 11365971-C-A | ** | ||||||||
13695486-G-A | 11539810-G-A | DYZ17 | ** | |||||||
13695501-C-A | 11539825-C-A | DYZ17 | ** | |||||||
11665355-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11666599-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11671970-A-G | DYZ17 | ** | ||||||||
13909770-C-A | 11789064-C-A | ** | ||||||||
13938712-G-T | 11818006-G-T | ** | ||||||||
13961399-T-C | 11840693-T-C | ** | ||||||||
13986181-T-C | 11865475-T-C | ** | ||||||||
14007332-C-A | 11886626-C-A | ** | ||||||||
14031887-G-T | 11911181-G-T | ** | ||||||||
14055401-C-T | 11934695-C-T | ** | ||||||||
14080101-C-T | 11959395-C-T | ** | ||||||||
14080104-C-T | 11959398-C-T | ** | ||||||||
14080342-C-G | 11959636-C-G | ** | ||||||||
14181557-C-T | 12060851-C-T | ** | ||||||||
14187320-T-A | 12066614-T-A | ** | ||||||||
14191368-T-A | 12070662-T-A | ** | ||||||||
14196283-G-T | 12075577-G-T | ** | ||||||||
14272205-T-G | 12151499-T-G | ** | ||||||||
14273435-G-T | 12152729-G-T | ** | ||||||||
14294189-A-C | 12173483-A-C | ** | ||||||||
14351225-C-T | 12230520-C-T | ** | ||||||||
14396611-C-A | 12275907-C-A | ** | ||||||||
14397466-C-A | 12276762-C-A | ** | ||||||||
14423920-A-C | 12303195-A-C | ** | ||||||||
14442968-C-A | 12322241-C-A | ** | ||||||||
14451739-C-A | 12331012-C-A | ** | ||||||||
14463519-C-A | 12342792-C-A | ** | ||||||||
14483754-C-A | 12363023-C-A | ** | ||||||||
14506775-C-A | 12394980-C-A | ** | ||||||||
14528321-C-T | 12416522-C-T | ** | ||||||||
14533511-C-A | 12421712-C-A | ** | ||||||||
14549308-TCA-T | 12437509-TCA-T | ** | ||||||||
14557082-TA-T | 12445283-TA-T | ** | ||||||||
14559108-A-C | 12447309-A-C | ** | ||||||||
14566618-C-A | 12454818-C-A | ** | ||||||||
14593475-G-T | 12481675-G-T | ** | ||||||||
14630285-T-C | 12518354-T-C | ** | ||||||||
14669535-C-A | 12557601-C-A | ** | ||||||||
14689207-C-A | 12577273-C-A | ** | ||||||||
14698342-C-T | 12586408-C-T | ** | ||||||||
14721613-C-A | 12609681-C-A | ** | ||||||||
14724505-G-T | 12612573-G-T | ** | ||||||||
14764913-AAT-A | 12652982-AAT-A | ** | ||||||||
14802751-G-A | 12690822-G-A | ** | ||||||||
14806069-C-A | 12694140-C-A | ** | ||||||||
14846832-C-A | 12734898-C-A | ** | ||||||||
14887910-C-A | 12775976-C-A | ** | ||||||||
14888193-A-G | 12776259-A-G | ** | ||||||||
14933579-T-C | 12821644-T-C | ** | ||||||||
14943494-C-A | 12831568-C-A | ** | ||||||||
14953429-G-C | 12841503-G-C | ** | ||||||||
14953488-C-A | 12841562-C-A | ** | ||||||||
14981757-T-G | 12869833-T-G | ** | ||||||||
15119406-G-A | 13007493-G-A | ** | ||||||||
15173556-C-A | 13061642-C-A | ** | ||||||||
15185467-C-A | 13073553-C-A | ** | ||||||||
15190134-C-A | 13078220-C-A | ** | ||||||||
15210943-T-G | 13099029-T-G | ** | ||||||||
15218649-T-C | 13106735-T-C | ** | ||||||||
15231015-C-T | 13119101-C-T | ** | ||||||||
15286283-A-G | 13174382-A-G | ** | ||||||||
15309691-C-A | 13197795-C-A | ** | ||||||||
15320667-A-G | 13208785-A-G | ** | ||||||||
15381308-C-G | 13269428-C-G | ** | ||||||||
15397928-A-G | 13286048-A-G | ** | ||||||||
15398297-C-A | 13286417-C-A | ** | ||||||||
15399331-G-A | 13287451-G-A | ** | ||||||||
15404222-A-C | 13292342-A-C | ** | ||||||||
15410855-T-C | 13298975-T-C | ** | ||||||||
15412848-A-G | 13300968-A-G | ** | ||||||||
15424723-G-T | 13312843-G-T | ** | ||||||||
15433662-T-G | 13321782-T-G | ** | ||||||||
15433672-A-C | 13321792-A-C | ** | ||||||||
15447016-C-G | 13335136-C-G | ** | ||||||||
15447023-A-C | 13335143-A-C | ** | ||||||||
15450360-C-A | 13338480-C-A | ** | ||||||||
15468279-C-A | 13356399-C-A | ** | ||||||||
15469264-C-A | 13357384-C-A | ** | ||||||||
15542680-T-G | 13430800-T-G | ** | ||||||||
15579631-A-G | 13467751-A-G | ** | ||||||||
15592834-T-C | 13480954-T-C | ** | ||||||||
15636336-G-T | 13524456-G-T | ** | ||||||||
15686922-G-A | 13575042-G-A | ** | ||||||||
15731317-C-A | 13619437-C-A | ** | ||||||||
15758441-C-A | 13646561-C-A | ** | ||||||||
15777068-C-G | 13665188-C-G | ** | ||||||||
15789035-C-A | 13677155-C-A | ** | ||||||||
15815353-A-G | 13703473-A-G | ** | ||||||||
15815391-A-AAC | 13703511-A-AAC | ** | ||||||||
15860165-C-A | 13748285-C-A | ** | ||||||||
15866079-G-A | 13754199-G-A | ** | ||||||||
15866703-C-A | 13754823-C-A | ** | ||||||||
15870329-C-A | 13758449-C-A | ** | ||||||||
15918388-G-T | 13806508-G-T | ** | ||||||||
15941445-C-A | 13829565-C-A | ** | ||||||||
15964639-G-T | 13852759-G-T | ** | ||||||||
15969794-A-C | 13857914-A-C | ** | ||||||||
16041771-C-A | 13929891-C-A | ** | ||||||||
16058810-A-T | 13946930-A-T | ** | ||||||||
16058814-A-T | 13946934-A-T | ** | ||||||||
16058846-T-G | 13946966-T-G | ** | ||||||||
16058902-A-T | 13947022-A-T | ** | ||||||||
16058903-A-G | 13947023-A-G | ** | ||||||||
16092495-C-A | 13980615-C-A | ** | ||||||||
16135095-G-C | 14023215-G-C | BY28786 | P8_Dst | ** | ||||||
16243156-C-A | 14131276-C-A | ** | ||||||||
16270402-C-G | 14158522-C-G | ** | ||||||||
16270428-T-G | 14158548-T-G | ** | ||||||||
16272335-G-T | 14160455-G-T | ** | ||||||||
16336020-C-A | 14224140-C-A | ** | ||||||||
16424291-C-T | 14312411-C-T | FGC22911 | ** | |||||||
16450254-G-A | 14338374-G-A | ** | ||||||||
16475219-C-A | 14363339-C-A | FTB76328 | ** | |||||||
16478240-G-A | 14366360-G-A | ** | ||||||||
16531054-A-C | 14419174-A-C | ** | ||||||||
16590784-G-A | 14478904-G-A | ** | ||||||||
16598678-A-T | 14486798-A-T | ** | ||||||||
16601415-A-T | 14489535-A-T | ** | ||||||||
16601416-A-C | 14489536-A-C | ** | ||||||||
16601417-C-T | 14489537-C-T | A3867 | ** | |||||||
16601437-T-C | 14489557-T-C | ** | ||||||||
16601445-C-CA | 14489565-C-CA | ** | ||||||||
16601490-A-C | 14489610-A-C | ** | ||||||||
16601518-G-A | 14489638-G-A | ** | ||||||||
16620448-C-A | 14508568-C-A | ** | ||||||||
16645565-C-A | 14533685-C-A | ** | ||||||||
16659057-C-A | 14547177-C-A | ** | ||||||||
16760241-T-C | 14648361-T-C | ** | ||||||||
16876948-T-A | 14765068-T-A | ** | ||||||||
16887054-A-G | 14775174-A-G | ** | ||||||||
16968149-T-A | 14856269-T-A | ** | ||||||||
17013149-T-G | 14901269-T-G | ** | ||||||||
17027514-A-G | 14915634-A-G | ** | ||||||||
17090609-T-A | 14978729-T-A | ** | ||||||||
17098848-A-T | 14986968-A-T | ** | ||||||||
17118459-T-C | 15006579-T-C | ** | ||||||||
17122243-C-A | 15010363-C-A | ** | ||||||||
17135936-C-A | 15024056-C-A | ** | ||||||||
17175647-A-G | 15063767-A-G | ** | ||||||||
17187426-C-A | 15075546-C-A | ** | ||||||||
17211466-C-A | 15099586-C-A | ** | ||||||||
17300691-G-A | 15188811-G-A | ** | ||||||||
17300712-C-G | 15188832-C-G | ** | ||||||||
17300738-T-A | 15188858-T-A | ** | ||||||||
17327252-C-A | 15215372-C-A | ** | ||||||||
17360445-C-A | 15248565-C-A | ** | ||||||||
17386701-G-T | 15274821-G-T | ** | ||||||||
17387306-A-G | 15275426-A-G | ** | ||||||||
17397271-G-A | 15285391-G-A | ** | ||||||||
17406962-C-A | 15295082-C-A | ** | ||||||||
17492120-C-A | 15380240-C-A | ** | ||||||||
17515408-A-C | 15403528-A-C | ** | ||||||||
17518539-G-C | 15406659-G-C | ** | ||||||||
17527275-G-C | 15415395-G-C | ** | ||||||||
17600920-C-A | 15489040-C-A | ** | ||||||||
17600972-T-C | 15489092-T-C | ** | ||||||||
17633005-C-A | 15521125-C-A | ** | ||||||||
17654005-G-T | 15542125-G-T | ** | ||||||||
17707375-TCAAA-T | 15595495-TCAAA-T | ** | ||||||||
17713874-G-A | 15601994-G-A | ** | ||||||||
17713875-AC-A | 15601995-AC-A | ** | ||||||||
17730399-C-A | 15618519-C-A | ** | ||||||||
17741412-C-T | 15629532-C-T | ** | ||||||||
17770670-C-A | 15658790-C-A | ** | ||||||||
17792266-C-A | 15680386-C-A | ** | ||||||||
17848907-C-T | 15737027-C-T | ** | ||||||||
17889815-C-A | 15777935-C-A | ** | ||||||||
17929486-G-T | 15817606-G-T | ** | ||||||||
17940762-T-C | 15828882-T-C | ** | ||||||||
17950867-T-A | 15838987-T-A | ** | ||||||||
17994874-C-T | 15882994-C-T | P7_Prx | 39×A | ** | ||||||
18050357-C-A | 15938477-C-A | ** | ||||||||
18090208-C-A | 15978328-C-A | ** | ||||||||
18100823-C-A | 15988943-C-A | ** | ||||||||
18127916-G-A | 16016036-G-A | ** | ||||||||
18127942-T-G | 16016062-T-G | ** | ||||||||
18154528-G-A | 16042648-G-A | ** | ||||||||
18256227-T-C | 16144347-T-C | ** | ||||||||
18274961-T-C | 16163081-T-C | P6_Prx | ** | |||||||
18290859-C-A | 16178979-C-A | P6_Prx | ** | |||||||
18316529-CA-C | 16204649-CA-C | P6_Prx | 27×A | ** | ||||||
18628047-C-A | 16516167-C-A | ** | ||||||||
18630715-C-A | 16518835-C-A | ** | ||||||||
18630723-C-A | 16518843-C-A | ** | ||||||||
18672578-C-A | 16560698-C-A | ** | ||||||||
18687528-A-T | 16575648-A-T | ** | ||||||||
18794955-C-A | 16683075-C-A | ** | ||||||||
18929905-C-A | 16818025-C-A | ** | ||||||||
18959210-GTC-G | 16847330-GTC-G | ** | ||||||||
18959287-G-A | 16847407-G-A | ** | ||||||||
18983960-C-G | 16872080-C-G | ** | ||||||||
18984058-G-C | 16872178-G-C | ** | ||||||||
19014013-C-T | 16902133-C-T | ** | ||||||||
19042603-G-A | 16930723-G-A | ** | ||||||||
19042615-T-C | 16930735-T-C | ** | ||||||||
19052079-C-A | 16940199-C-A | ** | ||||||||
19109890-A-T | 16998010-A-T | ** | ||||||||
19123143-C-A | 17011263-C-A | ** | ||||||||
19129143-C-T | 17017263-C-T | ** | ||||||||
19135209-G-A | 17023329-G-A | ** | ||||||||
19198084-A-T | 17086204-A-T | ** | ||||||||
19272107-C-A | 17160227-C-A | ** | ||||||||
19303041-A-C | 17191161-A-C | ** | ||||||||
19358165-C-T | 17246285-C-T | ** | ||||||||
19376270-A-T | 17264390-A-T | ** | ||||||||
19403958-C-A | 17292078-C-A | ** | ||||||||
19411704-C-A | 17299824-C-A | ** | ||||||||
19412826-C-A | 17300946-C-A | ** | ||||||||
19417287-C-A | 17305407-C-A | ** | ||||||||
19448295-A-G | 17336415-A-G | ** | ||||||||
19505327-C-A | 17393447-C-A | ** | ||||||||
19544528-C-A | 17432648-C-A | ** | ||||||||
19563040-T-C | 17451160-T-C | ** | ||||||||
19575982-A-T | 17464102-A-T | P5_Prx | ** | |||||||
19904275-A-G | 17792395-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
19966704-A-C | 17854824-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
19966731-A-C | 17854851-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
19992538-A-G | 17880658-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
20554558-G-T | 18392672-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20603923-T-G | 18442037-T-G | P5_Dst | ** | |||||||
20611301-G-T | 18449415-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20685123-C-A | 18523237-C-A | P4_Prx | ** | |||||||
20760070-T-C | 18598184-T-C | P4_Prx | ** | |||||||
20958994-C-T | 18797108-C-T | P4_Dst | ** | |||||||
21031551-C-A | 18869665-C-A | P4_Dst | ** | |||||||
21124471-A-G | 18962585-A-G | ** | ||||||||
21127623-C-A | 18965737-C-A | ** | ||||||||
21139429-C-A | 18977543-C-A | ** | ||||||||
21148545-C-A | 18986659-C-A | ** | ||||||||
21152473-C-A | 18990587-C-A | ** | ||||||||
21200651-C-T | 19038765-C-T | ** | ||||||||
21235090-T-C | 19073204-T-C | ** | ||||||||
21243579-G-T | 19081693-G-T | ** | ||||||||
21282632-A-T | 19120746-A-T | ** | ||||||||
21353147-C-A | 19191261-C-A | ** | ||||||||
21367664-G-T | 19205778-G-T | ** | ||||||||
21426964-C-A | 19265078-C-A | ** | ||||||||
21459920-C-A | 19298034-C-A | ** | ||||||||
21515849-C-A | 19353963-C-A | ** | ||||||||
21596908-G-A | 19435022-G-A | ** | ||||||||
21603957-A-C | 19442071-A-C | ** | ||||||||
21863142-C-A | 19701256-C-A | ** | ||||||||
21885785-T-A | 19723899-T-A | ** | ||||||||
21959276-A-T | 19797390-A-T | ** | ||||||||
21979849-T-A | 19817963-T-A | ** | ||||||||
21983988-G-C | 19822102-G-C | ** | ||||||||
21984004-G-C | 19822118-G-C | ** | ||||||||
22146333-G-A | 19984447-G-A | ** | ||||||||
22189184-C-A | 20027298-C-A | ** | ||||||||
22190659-T-C | 20028773-T-C | ** | ||||||||
22505920-C-A | 20344034-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22691236-G-T | 20529350-G-T | ** | ||||||||
22730305-C-A | 20568419-C-A | ** | ||||||||
22768130-C-A | 20606244-C-A | ** | ||||||||
22783124-A-G | 20621238-A-G | ** | ||||||||
22797576-C-A | 20635690-C-A | ** | ||||||||
22841912-C-G | 20680026-C-G | ** | ||||||||
22846049-C-G | 20684163-C-G | ** | ||||||||
22869061-T-A | 20707175-T-A | ** | ||||||||
22877894-C-A | 20716008-C-A | ** | ||||||||
22877895-C-A | 20716009-C-A | ** | ||||||||
22956111-T-C | 20794225-T-C | ** | ||||||||
23007746-G-T | 20845860-G-T | ** | ||||||||
23007769-T-C | 20845883-T-C | ** | ||||||||
23009958-G-A | 20848072-G-A | ** | ||||||||
23098753-C-A | 20936867-C-A | FT383616 | ** | |||||||
23098754-T-G | 20936868-T-G | ** | ||||||||
23098763-A-G | 20936877-A-G | ** | ||||||||
23098773-C-T | 20936887-C-T | FT350881 | ** | |||||||
23128058-C-A | 20966172-C-A | ** | ||||||||
23137244-T-C | 20975358-T-C | ** | ||||||||
23137314-C-A | 20975428-C-A | ** | ||||||||
23190036-G-A | 21028150-G-A | ** | ||||||||
23204333-C-A | 21042447-C-A | ** | ||||||||
23225207-T-C | 21063321-T-C | ** | ||||||||
23264178-C-A | 21102292-C-A | ** | ||||||||
23272553-TA-T | 21110667-TA-T | ** | ||||||||
23342020-C-A | 21180134-C-A | ** | ||||||||
23415337-T-G | 21253451-T-G | ** | ||||||||
23435946-A-G | 21274060-A-G | ** | ||||||||
23439880-A-G | 21277994-A-G | ** | ||||||||
23439890-A-T | 21278004-A-T | ** | ||||||||
23468534-A-G | 21306648-A-G | ** | ||||||||
23475794-C-A | 21313908-C-A | ** | ||||||||
23510482-C-A | 21348596-C-A | ** | ||||||||
23779891-G-T | 21618005-G-T | ** | ||||||||
23786961-C-A | 21625075-C-A | Y112314 | ** | |||||||
23801590-T-C | 21639704-T-C | ** | ||||||||
23802355-T-A | 21640469-T-A | ** | ||||||||
23802368-C-T | 21640482-C-T | ** | ||||||||
21754568-A-C | ** | |||||||||
23951826-G-T | 21805679-G-T | ** | ||||||||
24074209-T-A | 21928062-T-A | P3_b1 | ** | |||||||
24416879-G-T | 22270732-G-T | ** | ||||||||
24421877-G-T | 22275730-G-T | ** | ||||||||
24447000-C-A | 22300853-C-A | ** | ||||||||
24459387-C-T | 22313240-C-T | ** | ||||||||
24475070-G-T | 22328923-G-T | ** | ||||||||
24509310-C-G | 22363163-C-G | ** | ||||||||
24759266-G-A | 22613119-G-A | P3_b2 | ** | |||||||
24875535-G-C | 22729388-G-C | g1 | ** | |||||||
25024379-C-A | 22878232-C-A | g1 | ** | |||||||
25637769-A-T | 23491622-A-T | P1_b3 | ** | |||||||
25967687-T-TG | 23821540-T-TG | P1_Y1 | ** | |||||||
25990674-C-T | 23844527-C-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26100545-GGTG-T | 23954398-GGTG-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26130654-A-C | 23984507-A-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26225746-G-GTTT | 24079599-G-GTTT | P1_Y1 | 10×T | ** | ||||||
26292291-T-G | 24146144-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26297070-T-TAC | 24150923-T-TAC | P1_Y1 | ** | |||||||
26355417-C-A | 24209270-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26358909-C-A | 24212762-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26415668-C-A | 24269521-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26415751-T-G | 24269604-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
27435962-C-A | 25289815-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27595959-C-A | 25449812-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27733694-G-A | 25587547-G-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27733711-C-A | 25587564-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27990609-C-A | 25844462-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27996129-A-AC | 25849982-A-AC | P1_Y2 | ** | |||||||
28243659-G-A | 26097512-G-A | P1_b4 | ** | |||||||
28437731-T-C | 26291584-T-C | P1_gr2 | ** | |||||||
28469405-C-A | 26323258-C-A | ** | ||||||||
28480189-A-T | 26334042-A-T | ** | ||||||||
28496374-G-A | 26350227-G-A | ** | ||||||||
28496387-C-A | 26350240-C-A | ** | ||||||||
28533613-A-G | 26387466-A-G | ** | ||||||||
28533720-C-G | 26387573-C-G | ** | ||||||||
28539206-A-G | 26393059-A-G | ** | ||||||||
28539273-A-G | 26393126-A-G | ** | ||||||||
28611697-T-C | 26465550-T-C | ** | ||||||||
28701873-A-T | 26555726-A-T | ** | ||||||||
28719974-T-A | 26573827-T-A | ** | ||||||||
28739606-G-T | 26593459-G-T | ** | ||||||||
28756228-C-A | 26610081-C-A | ** | ||||||||
28763147-A-C | 26617000-A-C | ** | ||||||||
28763158-A-C | 26617011-A-C | ** | ||||||||
28764282-C-A | 26618135-C-A | ** | ||||||||
28781539-C-A | 26635392-C-A | ** | ||||||||
28781571-AT-A | 26635424-AT-A | ** | ||||||||
28798260-T-C | 26652113-T-C | ** | ||||||||
56823253-T-C | ** | |||||||||
56823263-A-T | ** | |||||||||
56823365-T-G | ** | |||||||||
56837325-A-G | ** | |||||||||
56837335-T-G | ** | |||||||||
56837360-A-G | ** | |||||||||
56837363-G-T | ** | |||||||||
56838380-C-T | ** | |||||||||
56842821-G-A | ** | |||||||||
56846047-G-T | ** | |||||||||
56848495-T-A | ** | |||||||||
56849569-A-C | ** | |||||||||
56871623-T-TAAAAA | 9×A | ** | ||||||||
56874157-G-T | ** | |||||||||
56887178-T-A | ** | |||||||||
5261698-CAAAA-C | 5393657-CAAAA-C | 48×A | ** | |||||||
19594576-A-C | 17482696-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
13647474-T-A | 11491798-T-A | DYZ17 | *** | |||||||
13863113-A-G | 11742407-A-G | YSC0000153 | DYZ17 | *** | ||||||
13454851-C-T | 11299175-C-T | *** | ||||||||
10036259-C-T | 10198650-C-T | BY83267 | *** | |||||||
10036262-G-A | 10198653-G-A | Y125010 | *** | |||||||
13828842-C-T | 11708136-C-T | FGC19855 | DYZ17 | *** | ||||||
13799951-C-G | 11679245-C-G | DYZ17 | *** | |||||||
13799959-C-CAT | 11679253-C-CAT | DYZ17 | *** | |||||||
13799979-C-T | 11679273-C-T | DYZ17 | *** | |||||||
13828848-T-A | 11708142-T-A | DYZ17 | *** | |||||||
13828861-A-G | 11708155-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
22450150-G-T | 20288264-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
13799955-GGA-G | 11679249-GGA-G | DYZ17 | *** | |||||||
13799964-T-C | 11679258-T-C | DYZ17 | *** | |||||||
9403180-G-A | 9565571-G-A | *** | ||||||||
6807701-TC-T | 6939660-TC-T | *** | ||||||||
7938177-G-A | 8070136-G-A | *** | ||||||||
58979103-T-TTCCAC,TTCCATTCCAC | 56832956-T-TTCCAC,TTCCATTCCAC | *** | ||||||||
14530900-GTA-G | 12419101-GTA-G | *** | ||||||||
6402331-G-A | 6534290-G-A | *** | *** | |||||||
16555167-C-A | 14443287-C-A | *** | ||||||||
13467399-T-C | 11311723-T-C | *** | ||||||||
13217502-C-A | 11061826-C-A | *** | ||||||||
13799980-A-G | 11679274-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
13799991-G-C | 11679285-G-C | DYZ17 | *** | |||||||
13468285-T-G | 11312609-T-G | *** | ||||||||
17199319-GTT-G | 15087439-GTT-G | 13×T | *** | |||||||
19517622-G-A | 17405742-G-A | PR6477 | *** | |||||||
13828860-C-T | 11708154-C-T | DYZ17 | *** | |||||||
22312019-A-T | 20150133-A-T | DYZ19 | *** | |||||||
22314493-C-T | 20152607-C-T | DYZ19 | *** | |||||||
13487892-G-T | 11332216-G-T | *** | ||||||||
13253199-G-GTT | 11097523-G-GTT | 14×T | *** | |||||||
10669404-ATCTCCATTTC-A | *** | |||||||||
11022946-C-A | *** | |||||||||
10885141-C-G | *** | |||||||||
13468196-T-A | 11312520-T-A | *** | ||||||||
17612897-G-T | 15501017-G-T | *** | ||||||||
21146275-C-T | 18984389-C-T | 17×T | *** | |||||||
2861374-A-G | 2993333-A-G | *** | ||||||||
2950254-C-CAT | 3082213-C-CAT | *** | ||||||||
3329219-C-A | 3461178-C-A | *** | ||||||||
3621920-C-A | 3753879-C-A | *** | ||||||||
4201329-ACAGT-A | 4333288-ACAGT-A | *** | ||||||||
4223020-AC-A | 4354979-AC-A | *** | ||||||||
4473400-G-T | 4605359-G-T | *** | ||||||||
6523628-G-T | 6655587-G-T | *** | ||||||||
7285711-C-A | 7417670-C-A | *** | ||||||||
7986293-G-T | 8118252-G-T | *** | ||||||||
8843581-G-C | 8975540-G-C | *** | ||||||||
9446086-G-T | 9608477-G-T | *** | ||||||||
10023391-C-A | 10185782-C-A | *** | ||||||||
10686513-C-A | *** | |||||||||
10754134-G-T | *** | |||||||||
10780170-C-T | *** | |||||||||
10783488-G-A | *** | |||||||||
10836317-C-T | *** | |||||||||
10842653-T-C | *** | |||||||||
10865062-C-A | *** | |||||||||
10883895-CCCATT-C | *** | |||||||||
10895825-C-A | *** | |||||||||
10906009-A-C | *** | |||||||||
10906017-T-C | FT436124 | *** | ||||||||
10906027-G-T | *** | |||||||||
11025995-C-A | *** | |||||||||
11026012-C-A | *** | |||||||||
13194339-C-A | 11038663-C-A | *** | ||||||||
13217495-C-G | 11061819-C-G | *** | ||||||||
13217499-C-T | 11061823-C-T | *** | ||||||||
13433364-G-A | 11277688-G-A | *** | ||||||||
13454607-C-A | 11298931-C-A | *** | ||||||||
13463881-C-A | 11308205-C-A | *** | ||||||||
13482487-C-A | 11326811-C-A | *** | ||||||||
13483195-C-A | 11327519-C-A | *** | ||||||||
13489309-G-C | 11333633-G-C | BY26218 | *** | |||||||
11643633-C-G | DYZ17 | *** | ||||||||
13844041-A-T | 11723335-A-T | DYZ17 | *** | |||||||
13891335-CA-C | 11770629-CA-C | *** | ||||||||
13976035-C-A | 11855329-C-A | *** | ||||||||
14053672-A-T | 11932966-A-T | *** | ||||||||
14103334-A-T | 11982628-A-T | *** | ||||||||
14425655-C-A | 12304930-C-A | *** | ||||||||
14509450-C-A | 12397655-C-A | *** | ||||||||
14552149-AG-A | 12440350-AG-A | *** | ||||||||
14611458-C-A | 12499664-C-A | *** | ||||||||
14946874-G-A | 12834948-G-A | *** | ||||||||
15157245-C-A | 13045332-C-A | *** | ||||||||
15180641-A-G | 13068727-A-G | *** | ||||||||
15268956-C-A | 13157045-C-A | *** | ||||||||
15280092-C-A | 13168191-C-A | *** | ||||||||
15285982-C-A | 13174081-C-A | *** | ||||||||
15310991-G-T | 13199096-G-T | *** | ||||||||
15423683-G-T | 13311803-G-T | *** | ||||||||
15723898-T-A | 13612018-T-A | *** | ||||||||
15785683-C-A | 13673803-C-A | *** | ||||||||
15865437-C-A | 13753557-C-A | *** | ||||||||
15882073-TCAA-A,T | 13770193-TCAA-A,T | *** | ||||||||
15913994-C-T | 13802114-C-T | *** | ||||||||
16505938-C-A | 14394058-C-A | *** | ||||||||
16532731-C-A | 14420851-C-A | *** | ||||||||
17374934-A-T | 15263054-A-T | *** | ||||||||
17500747-G-T | 15388867-G-T | *** | ||||||||
17789828-C-A | 15677948-C-A | *** | ||||||||
18850633-T-C | 16738753-T-C | *** | ||||||||
18850893-A-G | 16739013-A-G | *** | ||||||||
19356963-CA-C,CAA | 17245083-CA-C,CAA | 14×A | *** | |||||||
19476468-C-A | 17364588-C-A | *** | ||||||||
20459042-CAAA-C,CAA | 18297156-CAAA-C,CAA | P5_Dst | 21×A | *** | ||||||
21238717-C-A | 19076831-C-A | *** | ||||||||
21392268-C-A | 19230382-C-A | *** | ||||||||
21392287-C-A | 19230401-C-A | *** | ||||||||
21582361-G-A | 19420475-G-A | *** | ||||||||
21802615-C-A | 19640729-C-A | *** | ||||||||
21960443-A-G | 19798557-A-G | *** | ||||||||
21972084-C-A | 19810198-C-A | *** | ||||||||
22449661-T-C | 20287775-T-C | DYZ19 | *** | |||||||
22774869-C-T | 20612983-C-T | 21×T | *** | |||||||
22824931-C-A | 20663045-C-A | *** | ||||||||
23802387-C-A | 21640501-C-A | *** | ||||||||
23849798-G-A | 21687912-G-A | FT97304 | *** | |||||||
27053723-G-T | 24907576-G-T | P1_r4 | *** | |||||||
2833178-CTTTT-C,CTTT | 2965137-CTTTT-C,CTTT | 19×T | *** | |||||||
28686423-CAAA-C | 26540276-CAAA-C | 21×A | *** | |||||||
56829392-TTCCATTCGATTCCAT-T,TTCCATTCGATTGCAG | *** | |||||||||
5962117-T-C | 6094076-T-C | *** | ||||||||
18109382-G-C | 15997502-G-C | *** | ||||||||
22703595-CAAAAAAAA-C | 20541709-CAAAAAAAA-C | 30×A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.