Groover
FTDNA: 536250, BigY3: 536250, BigY2: 536250Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 536250 | BigY3 536250 | BigY2 536250 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
22455949-T-A | 20294063-T-A | DYZ19 | *** | A* | ||||||
26218615-C-T | 24072468-C-T | P1_Y1 | *** | A* | A* | |||||
5626506-C-CT | 5758465-C-CT | 10×T | A* | |||||||
20417349-C-CA | 18255463-C-CA | P5_Dst | A* | |||||||
13448544-C-A | 11292868-C-A | A* | ||||||||
28817872-G-C | 26671725-G-C | A* | A* | |||||||
20492878-T-TC | 18330992-T-TC | P5_Dst | 9×C | A* | ||||||
10828576-C-T | FT225380 | + | ||||||||
17670783-A-C | 15558903-A-C | Y99883 | Y | Y | + | + | + | |||
15344290-C-A | 13232409-C-A | Y93576 | Y | Y | + | + | + | |||
8469593-G-T | 8601552-G-T | Y86985 | Y | Y | + | + | + | |||
23546106-A-G | 21384220-A-G | Y111835 | Y | Y | + | + | + | |||
17949402-C-T | 15837522-C-T | Y100743 | Y | Y | + | + | + | |||
13334055-C-T | 11178379-C-T | FT443079 | + | |||||||
6502636-C-G | 6634595-C-G | FT110784 | + | |||||||
10995985-C-T | FT225379 | + | ||||||||
11670170-G-T | ** | |||||||||
13594539-C-A | 11438863-C-A | ** | ||||||||
13597407-C-A | 11441731-C-A | ** | ||||||||
24241281-G-C | 22095134-G-C | P3_b1 | ** | |||||||
11667812-T-A | ** | |||||||||
11666964-G-T | ** | |||||||||
23779805-G-T | 21617919-G-T | ** | ||||||||
13692774-G-A | 11537098-G-A | ** | ||||||||
11663759-A-C | ** | |||||||||
11658957-A-T | ** | |||||||||
11644348-A-G | ** | |||||||||
11647437-A-C | ** | |||||||||
11648860-C-A | ** | |||||||||
11651222-G-T | ** | |||||||||
11648968-T-G | ** | |||||||||
10863856-G-T | ** | |||||||||
13594398-G-T | 11438722-G-T | ** | ||||||||
13306071-C-A | 11150395-C-A | ** | ||||||||
13226483-A-G | 11070807-A-G | ** | ||||||||
13226498-A-G | 11070822-A-G | ** | ||||||||
13235660-C-G | 11079984-C-G | ** | ||||||||
13235693-T-G | 11080017-T-G | ** | ||||||||
13292816-G-T | 11137140-G-T | ** | ||||||||
13293588-G-A | 11137912-G-A | ** | ||||||||
13303381-A-C | 11147705-A-C | ** | ||||||||
13322150-C-A | 11166474-C-A | ** | ||||||||
13588601-C-A | 11432925-C-A | ** | ||||||||
13360921-C-A | 11205245-C-A | ** | ||||||||
13361425-G-C | 11205749-G-C | ** | ||||||||
13421028-G-C | 11265352-G-C | ** | ||||||||
13421045-C-A | 11265369-C-A | ** | ||||||||
13442921-A-G | 11287245-A-G | ** | ||||||||
13460870-A-C | 11305194-A-C | ** | ||||||||
13859797-A-T | 11739091-A-T | ** | ||||||||
24389232-C-A | 22243085-C-A | ** | ||||||||
11670172-G-T | FGC78132 | ** | ||||||||
23460301-C-G | 21298415-C-G | ** | ||||||||
13896895-G-C | 11776189-G-C | ** | ||||||||
14506719-G-T | 12394924-G-T | ** | ||||||||
14451834-G-C | 12331107-G-C | ** | ||||||||
14451853-C-A | 12331126-C-A | ** | ||||||||
14451856-C-G | 12331129-C-G | ** | ||||||||
14470380-C-A | 12349649-C-A | ** | ||||||||
14483145-G-A | 12362414-G-A | ** | ||||||||
12379408-A-G | ** | |||||||||
14492618-G-T | 12380815-G-T | ** | ||||||||
14502559-C-A | 12390764-C-A | ** | ||||||||
14525111-G-T | 12413312-G-T | ** | ||||||||
14391692-A-T | 12270988-A-T | ** | ||||||||
14528433-C-A | 12416634-C-A | ** | ||||||||
14552989-C-A | 12441190-C-A | ** | ||||||||
14592118-G-A | 12480318-G-A | ** | ||||||||
14614649-G-T | 12502847-G-T | ** | ||||||||
14626962-A-C | 12515030-A-C | ** | ||||||||
14648719-C-A | 12536784-C-A | ** | ||||||||
14736100-C-A | 12624168-C-A | ** | ||||||||
14774282-GTC-A | 12662351-GTC-A | ** | ||||||||
14413042-C-A | 12292339-C-A | ** | ||||||||
14372028-T-G | 12251324-T-G | ** | ||||||||
13898783-C-T | 11778077-C-T | ** | ||||||||
14019422-T-C | 11898716-T-C | ** | ||||||||
13919685-A-T | 11798979-A-T | ** | ||||||||
13963413-T-G | 11842707-T-G | ** | ||||||||
11031515-CTCTG-C | ** | |||||||||
13974674-A-T | 11853968-A-T | ** | ||||||||
13981792-T-C | 11861086-T-C | ** | ||||||||
23439887-G-T | 21278001-G-T | ** | ||||||||
14000040-A-T | 11879334-A-T | ** | ||||||||
14007534-G-A | 11886828-G-A | ** | ||||||||
14031868-G-T | 11911162-G-T | ** | ||||||||
14308062-C-A | 12187356-C-A | ** | ||||||||
14035110-G-T | 11914404-G-T | ** | ||||||||
14054070-A-T | 11933364-A-T | ** | ||||||||
14054107-A-C | 11933401-A-C | ** | ||||||||
14069124-C-A | 11948418-C-A | ** | ||||||||
14196263-T-A | 12075557-T-A | ** | ||||||||
14219519-C-T | 12098813-C-T | ** | ||||||||
14219544-C-A | 12098838-C-A | ** | ||||||||
14266441-T-G | 12145735-T-G | ** | ||||||||
14297983-C-T | 12177277-C-T | ** | ||||||||
13202544-A-T | 11046868-A-T | ** | ||||||||
11008212-C-A | ** | |||||||||
11027003-C-A | ** | |||||||||
10818553-C-A | ** | |||||||||
10800564-C-A | ** | |||||||||
10801510-T-A | ** | |||||||||
10801531-T-G | ** | |||||||||
10801539-T-C | ** | |||||||||
10801549-T-G | ** | |||||||||
10808933-C-A | ** | |||||||||
10818523-C-A | ** | |||||||||
10826191-C-A | ** | |||||||||
10798446-T-C | ** | |||||||||
10831591-C-A | ** | |||||||||
10846361-C-A | ** | |||||||||
10849843-T-A | ** | |||||||||
10852598-G-T | ** | |||||||||
24475032-G-T | 22328885-G-T | ** | ||||||||
10867455-C-T | FT434747 | ** | ||||||||
24468954-T-G | 22322807-T-G | ** | ||||||||
10878181-A-T | ** | |||||||||
24512497-C-A | 22366350-C-A | ** | ||||||||
24875483-C-G | 22729336-C-G | g1 | ** | |||||||
10892625-T-C | ** | |||||||||
10748963-A-C | ** | |||||||||
10672051-T-C | ** | |||||||||
10677747-C-A | ** | |||||||||
10693440-C-A | ** | |||||||||
10747877-TCCATC-T | ** | |||||||||
10748756-C-A | ** | |||||||||
10748772-C-A | ** | |||||||||
10748943-A-C | ** | |||||||||
10761879-C-A | ** | |||||||||
10796585-T-G | ** | |||||||||
10769774-G-C | ** | |||||||||
10771711-C-A | ** | |||||||||
10771790-A-C | ** | |||||||||
10773569-C-A | ** | |||||||||
10777349-A-G | ** | |||||||||
10777375-A-G | ** | |||||||||
10781526-C-A | ** | |||||||||
10788589-C-A | ** | |||||||||
10887761-A-C | ** | |||||||||
10892638-A-C | ** | |||||||||
11026163-A-ATG | ** | |||||||||
10999191-G-C | ** | |||||||||
10982233-C-T | ** | |||||||||
10982282-G-A | ** | |||||||||
10982304-C-G | ** | |||||||||
10982307-A-C | ** | |||||||||
10986857-C-CATTCAATTCT | ** | |||||||||
10990140-C-T | ** | |||||||||
10991095-C-A | ** | |||||||||
24402001-A-G | 22255854-A-G | ** | ||||||||
10977142-G-C | ** | |||||||||
11001879-A-C | ** | |||||||||
11006246-C-A | ** | |||||||||
11006766-A-C | ** | |||||||||
11022430-A-C | ** | |||||||||
11022460-T-C | ** | |||||||||
11025348-G-T | ** | |||||||||
11026162-A-T | ** | |||||||||
11026163-A-T | ** | |||||||||
10977495-C-A | ** | |||||||||
10974515-A-G | ** | |||||||||
10914600-A-G | ** | |||||||||
10940917-A-G | ** | |||||||||
10917000-A-G | ** | |||||||||
10918083-A-G | ** | |||||||||
10918084-C-G | ** | |||||||||
10918085-A-G | ** | |||||||||
10931262-T-G | ** | |||||||||
10933186-A-C | ** | |||||||||
10935906-C-A | ** | |||||||||
10939559-A-C | ** | |||||||||
10940979-T-C | ** | |||||||||
10970910-C-A | ** | |||||||||
10943817-C-A | ** | |||||||||
10950097-C-A | ** | |||||||||
10953935-C-T | ** | |||||||||
10955888-G-T | ** | |||||||||
10956593-CCAT-C | ** | |||||||||
10961422-A-C | ** | |||||||||
10962694-A-C | ** | |||||||||
10963258-C-A | ** | |||||||||
14785205-A-G | 12673275-A-G | ** | ||||||||
15179259-C-A | 13067345-C-A | FT216570 | ** | |||||||
14823431-C-T | 12711498-C-T | ** | ||||||||
20569392-G-T | 18407506-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
19598821-A-AC | 17486941-A-AC | P5_Prx | ** | |||||||
19598834-A-T | 17486954-A-T | P5_Prx | ** | |||||||
19705259-T-A | 17593379-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19709592-C-A | 17597712-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19847693-C-T | 17735813-C-T | P5_Prx | ** | |||||||
19888747-T-A | 17776867-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
20352379-C-A | 18190493-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
20612201-G-T | 18450315-G-T | P4_Prx | ** | |||||||
19486914-A-G | 17375034-A-G | ** | ||||||||
23034334-A-G | 20872448-A-G | ** | ||||||||
20840392-C-A | 18678506-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
20917328-T-C | 18755442-T-C | P4_Dst | ** | |||||||
21054263-C-A | 18892377-C-A | ** | ||||||||
21095822-C-A | 18933936-C-A | ** | ||||||||
21135070-C-A | 18973184-C-A | ** | ||||||||
23019208-A-G | 20857322-A-G | ** | ||||||||
21146418-C-A | 18984532-C-A | ** | ||||||||
19558442-C-A | 17446562-C-A | ** | ||||||||
19444157-G-A | 17332277-G-A | ** | ||||||||
21297312-G-T | 19135426-G-T | ** | ||||||||
18989818-C-A | 16877938-C-A | ** | ||||||||
18480340-C-T | 16368460-C-T | P6_Dst | ** | |||||||
18611733-G-T | 16499853-G-T | FT154609 | ** | |||||||
23127041-C-A | 20965155-C-A | ** | ||||||||
18780322-C-A | 16668442-C-A | ** | ||||||||
18890901-G-T | 16779021-G-T | ** | ||||||||
18933590-A-C | 16821710-A-C | ** | ||||||||
18971088-C-A | 16859208-C-A | ** | ||||||||
19044636-C-A | 16932756-C-A | ** | ||||||||
19416810-G-T | 17304930-G-T | ** | ||||||||
19097280-G-A | 16985400-G-A | ** | ||||||||
19183929-C-T | 17072049-C-T | ** | ||||||||
19213585-C-A | 17101705-C-A | ** | ||||||||
19231343-T-G | 17119463-T-G | ** | ||||||||
19231344-GA-G | 17119464-GA-G | ** | ||||||||
23111817-C-T | 20949931-C-T | ** | ||||||||
23035830-C-A | 20873944-C-A | ** | ||||||||
19382298-T-C | 17270418-T-C | ** | ||||||||
21268661-G-T | 19106775-G-T | ** | ||||||||
22995823-C-A | 20833937-C-A | ** | ||||||||
18328765-G-A | 16216885-G-A | P6_Prx | ** | |||||||
22297810-T-A | 20135924-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
22123126-AC-A | 19961240-AC-A | ** | ||||||||
22146569-C-A | 19984683-C-A | ** | ||||||||
22150002-A-C | 19988116-A-C | ** | ||||||||
22167327-C-A | 20005441-C-A | ** | ||||||||
22170564-C-T | 20008678-C-T | ** | ||||||||
22172683-C-A | 20010797-C-A | ** | ||||||||
22205529-G-T | 20043643-G-T | ** | ||||||||
22311254-C-T | 20149368-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
22055309-C-A | 19893423-C-A | ** | ||||||||
22311280-C-A | 20149394-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22447691-C-A | 20285805-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22452791-T-A | 20290905-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
22954776-G-A | 20792890-G-A | ** | ||||||||
22551347-C-T | 20389461-C-T | ** | ||||||||
22564593-C-A | 20402707-C-A | ** | ||||||||
22602412-T-G | 20440526-T-G | ** | ||||||||
22766007-G-T | 20604121-G-T | ** | ||||||||
22075916-C-A | 19914030-C-A | ** | ||||||||
22055280-C-A | 19893394-C-A | M8472 | ** | |||||||
21351075-T-C | 19189189-T-C | ** | ||||||||
21464418-G-A | 19302532-G-A | ** | ||||||||
21353235-T-C | 19191349-T-C | ** | ||||||||
22965797-G-T | 20803911-G-T | ** | ||||||||
21367683-C-A | 19205797-C-A | ** | ||||||||
21388660-T-G | 19226774-T-G | ** | ||||||||
21443491-C-A | 19281605-C-A | ** | ||||||||
21443508-T-A | 19281622-T-A | ** | ||||||||
21459799-A-G | 19297913-A-G | ** | ||||||||
21554778-A-C | 19392892-A-C | ** | ||||||||
22041610-T-G | 19879724-T-G | ** | ||||||||
21555395-C-A | 19393509-C-A | ** | ||||||||
22962158-C-T | 20800272-C-T | ** | ||||||||
21584859-G-T | 19422973-G-T | ** | ||||||||
21584979-T-G | 19423093-T-G | ** | ||||||||
21602837-C-A | 19440951-C-A | ** | ||||||||
21827862-A-C | 19665976-A-C | ** | ||||||||
21863796-C-A | 19701910-C-A | ** | ||||||||
21954434-C-A | 19792548-C-A | ** | ||||||||
18462548-A-C | 16350668-A-C | P6_Dst | ** | |||||||
18278110-G-T | 16166230-G-T | P6_Prx | ** | |||||||
14926436-C-G | 12814501-C-G | ** | ||||||||
15835025-C-T | 13723145-C-T | FT282104 | ** | |||||||
15424291-T-A | 13312411-T-A | ** | ||||||||
15477835-C-A | 13365955-C-A | ** | ||||||||
15533756-C-A | 13421876-C-A | ** | ||||||||
15717996-TG-T | 13606116-TG-T | ** | ||||||||
15729194-C-A | 13617314-C-A | ** | ||||||||
15793434-C-A | 13681554-C-A | ** | ||||||||
15834187-T-C | 13722307-T-C | ** | ||||||||
15843058-C-A | 13731178-C-A | ** | ||||||||
15376078-C-G | 13264198-C-G | ** | ||||||||
15888174-C-A | 13776294-C-A | ** | ||||||||
15890034-C-A | 13778154-C-A | ** | ||||||||
15899023-C-A | 13787143-C-A | ** | ||||||||
15918403-G-T | 13806523-G-T | ** | ||||||||
15995525-C-A | 13883645-C-A | ** | ||||||||
16009179-G-T | 13897299-G-T | ** | ||||||||
16041958-A-C | 13930078-A-C | ** | ||||||||
23304476-C-A | 21142590-C-A | ** | ||||||||
15391243-C-A | 13279363-C-A | ** | ||||||||
15297895-C-T | 13185994-C-T | ** | ||||||||
16181352-G-A | 14069472-G-A | ** | ||||||||
15193544-T-C | 13081630-T-C | ** | ||||||||
14926457-C-CA | 12814522-C-CA | ** | ||||||||
14926458-GTCT-G | 12814523-GTCT-G | ** | ||||||||
15073237-C-A | 12961327-C-A | ** | ||||||||
15103725-G-A | 12991813-G-A | ** | ||||||||
15127062-C-A | 13015149-C-A | ** | ||||||||
10664731-A-C | ** | |||||||||
15179477-C-A | 13067563-C-A | ** | ||||||||
15197556-C-A | 13085642-C-A | ** | ||||||||
15290953-A-T | 13179052-A-T | ** | ||||||||
15239818-C-A | 13127904-C-A | ** | ||||||||
23381101-C-A | 21219215-C-A | ** | ||||||||
15259278-C-A | 13147362-C-A | FT21892 | 15×A | ** | ||||||
23368655-C-T | 21206769-C-T | ** | ||||||||
23358518-T-G | 21196632-T-G | ** | ||||||||
23316012-C-A | 21154126-C-A | ** | ||||||||
15285983-C-A | 13174082-C-A | ** | ||||||||
15290952-T-G | 13179051-T-G | ** | ||||||||
16085715-C-A | 13973835-C-A | ** | ||||||||
23274014-T-A | 21112128-T-A | ** | ||||||||
18278099-C-T | 16166219-C-T | P6_Prx | ** | |||||||
17714724-G-A | 15602844-G-A | ** | ||||||||
17518757-C-A | 15406877-C-A | ** | ||||||||
17518860-C-A | 15406980-C-A | ** | ||||||||
17538713-A-G | 15426833-A-G | ** | ||||||||
17539432-A-C | 15427552-A-C | ** | ||||||||
23188239-T-C | 21026353-T-C | ** | ||||||||
17581795-G-A | 15469915-G-A | ** | ||||||||
17634609-T-C | 15522729-T-C | ** | ||||||||
17802088-T-A | 15690208-T-A | ** | ||||||||
17367753-C-A | 15255873-C-A | ** | ||||||||
18019923-T-G | 15908043-T-G | ** | ||||||||
18053486-C-A | 15941606-C-A | ** | ||||||||
18071498-A-C | 15959618-A-C | ** | ||||||||
18098894-A-C | 15987014-A-C | ** | ||||||||
18100985-G-C | 15989105-G-C | ** | ||||||||
18185363-C-A | 16073483-C-A | ** | ||||||||
18256206-T-C | 16144326-T-C | ** | ||||||||
18263901-C-A | 16152021-C-A | ** | ||||||||
17512600-A-G | 15400720-A-G | ** | ||||||||
17297255-C-A | 15185375-C-A | ** | ||||||||
16278481-T-C | 14166601-T-C | ** | ||||||||
16572773-C-T | 14460893-C-T | ** | ||||||||
16297011-G-A | 14185131-G-A | ** | ||||||||
16351541-C-A | 14239661-C-A | ** | ||||||||
16438009-T-C | 14326129-T-C | ** | ||||||||
16503727-G-C | 14391847-G-C | ** | ||||||||
16506250-C-A | 14394370-C-A | ** | ||||||||
16559750-C-A | 14447870-C-A | ** | ||||||||
16571967-C-A | 14460087-C-A | ** | ||||||||
16572752-A-T | 14460872-A-T | ** | ||||||||
16605595-T-C | 14493715-T-C | ** | ||||||||
17224487-C-T | 15112607-C-T | ** | ||||||||
16676867-C-A | 14564987-C-A | ** | ||||||||
16689940-C-A | 14578060-C-A | ** | ||||||||
16729354-C-T | 14617474-C-T | ** | ||||||||
16938337-C-A | 14826457-C-A | ** | ||||||||
23253302-G-T | 21091416-G-T | ** | ||||||||
17088033-G-T | 14976153-G-T | ** | ||||||||
17151354-C-A | 15039474-C-A | ** | ||||||||
17151407-T-C | 15039527-T-C | ** | ||||||||
10672045-G-A | ** | |||||||||
9944167-G-C | 10106558-G-C | ** | ||||||||
25114731-C-A | 22968584-C-A | g1 | ** | |||||||
28076479-TTTTTC-T | 25930332-TTTTTC-T | P1_Y2 | ** | |||||||
28773834-T-A | 26627687-T-A | ** | ||||||||
28745088-A-G | 26598941-A-G | ** | ||||||||
6582810-C-A | 6714769-C-A | ** | ||||||||
28716287-A-C | 26570140-A-C | ** | ||||||||
28660031-C-A | 26513884-C-A | ** | ||||||||
16271829-C-A | 14159949-C-A | ** | ||||||||
17159008-G-T | 15047128-G-T | Y71156 | ** | |||||||
13545059-C-A | 11389383-C-A | ** | ||||||||
17375193-G-T | 15263313-G-T | ** | ||||||||
56851408-G-T | ** | |||||||||
15642888-T-C | 13531008-T-C | ** | ||||||||
7238938-CTTT-C | 7370897-CTTT-C | 13×T | ** | |||||||
15012763-C-A | 12900851-C-A | ** | ||||||||
10884662-C-A | ** | |||||||||
7866066-C-A | 7998025-C-A | ** | ||||||||
28659868-G-A | 26513721-G-A | ** | ||||||||
7229131-C-A | 7361090-C-A | ** | ||||||||
28625899-C-A | 26479752-C-A | ** | ||||||||
28605883-A-G | 26459736-A-G | ** | ||||||||
28775417-C-T | 26629270-C-T | ** | ||||||||
18059690-C-A | 15947810-C-A | ** | ||||||||
18704240-C-A | 16592360-C-A | ** | ||||||||
56823038-A-T | ** | |||||||||
10764575-C-CA | ** | |||||||||
7723544-C-A | 7855503-C-A | ** | ||||||||
10669116-G-T | ** | |||||||||
10982238-C-G | ** | |||||||||
7414273-G-A | 7546232-G-A | ** | ||||||||
15866177-T-A | 13754297-T-A | ** | ||||||||
15044294-C-A | 12932384-C-A | ** | ||||||||
19213774-C-A | 17101894-C-A | ** | ||||||||
2888860-G-A | 3020819-G-A | ** | ||||||||
20409561-G-T | 18247675-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
15622616-T-A | 13510736-T-A | ** | ||||||||
5214807-A-G | 5346766-A-G | ** | ||||||||
10986841-C-T | ** | |||||||||
13881345-C-A | 11760639-C-A | ** | ||||||||
18933561-C-A | 16821681-C-A | ** | ||||||||
6791188-G-A | 6923147-G-A | ** | ||||||||
9034579-T-C | 9196970-T-C | ** | ||||||||
10659542-C-CATTCTCTTCT | ** | |||||||||
18060299-TATGTAC-T | 15948419-TATGTAC-T | ** | ||||||||
21677548-G-T | 19515662-G-T | ** | ||||||||
16874765-C-A | 14762885-C-A | ** | ||||||||
23188211-C-A | 21026325-C-A | ** | ||||||||
28547500-C-A | 26401353-C-A | ** | ||||||||
14563554-C-A | 12451754-C-A | ** | ||||||||
28599006-C-A | 26452859-C-A | ** | ||||||||
6445002-C-A | 6576961-C-A | ** | ||||||||
10828766-C-G | ** | |||||||||
6264811-CCA-C | 6396770-CCA-C | IR3_Dst | ** | |||||||
11037674-G-T | ** | |||||||||
28580389-G-T | 26434242-G-T | ** | ||||||||
2788293-C-A | 2920252-C-A | ** | ||||||||
10033080-C-A | 10195471-C-A | ** | ||||||||
13692779-G-A | 11537103-G-A | ** | ||||||||
24241286-A-AC | 22095139-A-AC | P3_b1 | ** | |||||||
9063772-G-A | 9226163-G-A | ** | ||||||||
8153557-C-A | 8285516-C-A | ** | ||||||||
19391313-G-T | 17279433-G-T | ** | ||||||||
17127348-C-A | 15015468-C-A | ** | ||||||||
10921367-AC-A | ** | |||||||||
22159519-A-G | 19997633-A-G | ** | ||||||||
13461123-T-G | 11305447-T-G | ** | ||||||||
28006560-G-T | 25860413-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
2683330-T-G | 2815289-T-G | ** | ||||||||
17492077-T-C | 15380197-T-C | ** | ||||||||
28659985-C-A | 26513838-C-A | ** | ||||||||
10924308-A-C | ** | |||||||||
28103950-T-TC | 25957803-T-TC | P1_Y2 | ** | |||||||
28591136-T-A | 26444989-T-A | ** | ||||||||
28485834-C-A | 26339687-C-A | ** | ||||||||
4159877-C-A | 4291836-C-A | ** | ||||||||
10689500-TTTCCA-T | ** | |||||||||
16897639-G-A | 14785759-G-A | ** | ||||||||
28586760-C-G | 26440613-C-G | ** | ||||||||
19847697-A-C | 17735817-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
10990114-T-A | ** | |||||||||
15622615-A-G | 13510735-A-G | ** | ||||||||
20332001-T-A | 18170115-T-A | P5_Dst | ** | |||||||
10748956-G-C | FT429500 | ** | ||||||||
10877859-A-G | ** | |||||||||
2745858-C-A | 2877817-C-A | ** | ||||||||
27423997-C-A | 25277850-C-A | P1_g3 | ** | |||||||
27847933-T-TC | 25701786-T-TC | P1_Y2 | ** | |||||||
10964761-C-A | ** | |||||||||
2718907-C-G | 2850866-C-G | ** | ||||||||
23439880-A-C | 21277994-A-C | ** | ||||||||
23439886-A-C | 21278000-A-C | ** | ||||||||
22023226-C-G | 19861340-C-G | ** | ||||||||
16505962-T-C | 14394082-T-C | ** | ||||||||
16745217-C-A | 14633337-C-A | ** | ||||||||
3347486-C-A | 3479445-C-A | ** | ||||||||
15918408-G-T | 13806528-G-T | ** | ||||||||
8977013-A-G | 9139404-A-G | ** | ||||||||
18447645-G-T | 16335765-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
2892571-C-T | 3024530-C-T | ** | ||||||||
26100545-GGTG-T | 23954398-GGTG-T | P1_Y1 | ** | |||||||
11658128-C-A | ** | |||||||||
23831290-T-C | 21669404-T-C | ** | ||||||||
14774300-G-C | 12662369-G-C | ** | ||||||||
21968623-G-A | 19806737-G-A | ** | ||||||||
17989585-TAC-T | 15877705-TAC-T | P7_Prx | 9×AC | ** | ||||||
7108963-G-T | 7240922-G-T | ** | ||||||||
15259276-T-A | 13147360-T-A | ** | ||||||||
17355557-C-A | 15243677-C-A | ** | ||||||||
3790876-GTGTA-G | 3922835-GTGTA-G | ** | ||||||||
21700552-C-A | 19538666-C-A | ** | ||||||||
22193261-T-C | 20031375-T-C | ** | ||||||||
19531490-C-A | 17419610-C-A | ** | ** | |||||||
16727641-A-C | 14615761-A-C | ** | ||||||||
9602693-T-G | 9765084-T-G | IR3_Prx | ** | |||||||
18050306-C-A | 15938426-C-A | ** | ||||||||
21964288-A-G | 19802402-A-G | ** | ||||||||
17870824-C-A | 15758944-C-A | ** | ||||||||
23293598-GTATATATATATATA-G | 21131712-GTATATATATATATA-G | 20×TA | ** | |||||||
14025706-GAAGA-G | 11905000-GAAGA-G | 4×AAGA | ** | |||||||
20886889-A-C | 18725003-A-C | P4_Dst | ** | |||||||
16727644-T-A | 14615764-T-A | ** | ||||||||
10801534-C-T | ** | |||||||||
23231632-TAA-T | 21069746-TAA-T | 12×A | ** | |||||||
4898420-C-A | 5030379-C-A | ** | ||||||||
8901194-T-C | 9033153-T-C | ** | ||||||||
18108642-C-A | 15996762-C-A | ** | ||||||||
21410197-C-A | 19248311-C-A | ** | ||||||||
16602627-G-T | 14490747-G-T | ** | ||||||||
25884053-T-A | 23737906-T-A | BY226449 | P1_Y1 | ** | ||||||
8661148-C-A | 8793107-C-A | ** | ||||||||
10982279-C-A | ** | |||||||||
10748030-C-TGATGA | ** | |||||||||
7139219-C-A | 7271178-C-A | ** | ||||||||
27952160-G-T | 25806013-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
20853199-T-TCAG | 18691313-T-TCAG | P4_Dst | ** | |||||||
13885891-C-T | 11765185-C-T | ** | ||||||||
18423902-A-G | 16312022-A-G | P6_Gap | ** | |||||||
10828759-C-G | ** | |||||||||
9623314-GA-G | 9785705-GA-G | IR3_Prx | 9×A | ** | ||||||
14054978-C-A | 11934272-C-A | FT70872 | ** | |||||||
20853188-ACTG-A | 18691302-ACTG-A | P4_Dst | ** | |||||||
9034570-T-G | 9196961-T-G | ** | ||||||||
7417504-G-A | 7549463-G-A | ** | ||||||||
14161743-A-G | 12041037-A-G | ** | ||||||||
13926888-C-A | 11806182-C-A | ** | ||||||||
9498970-C-A | 9661361-C-A | ** | ||||||||
13461052-A-T | 11305376-A-T | ** | ||||||||
22023241-T-G | 19861355-T-G | ** | ||||||||
28581465-G-GT | 26435318-G-GT | 9×T | ** | |||||||
2718903-GA-G | 2850862-GA-G | ** | ||||||||
7101047-C-T | 7233006-C-T | ** | ||||||||
25246480-T-TG | 23100333-T-TG | P2_r1 | ** | |||||||
10964776-C-A | ** | |||||||||
21082189-C-A | 18920303-C-A | ** | ||||||||
2759992-C-A | 2891951-C-A | ** | ||||||||
20326055-G-C | 18164169-G-C | P5_Dst | ** | |||||||
10817912-C-T | ** | |||||||||
17455917-C-A | 15344037-C-A | ** | ||||||||
6816736-C-A | 6948695-C-A | ** | ||||||||
16298350-C-A | 14186470-C-A | ** | ||||||||
4136924-C-A | 4268883-C-A | ** | ||||||||
13303399-A-C | 11147723-A-C | ** | ||||||||
56756820-A-G | ** | |||||||||
28498010-C-A | 26351863-C-A | ** | ||||||||
28462202-G-T | 26316055-G-T | ** | ||||||||
7391821-C-A | 7523780-C-A | ** | ||||||||
7333867-C-A | 7465826-C-A | ** | ||||||||
7342161-C-A | 7474120-C-A | ** | ||||||||
7359821-A-G | 7491780-A-G | ** | ||||||||
7359955-G-C | 7491914-G-C | ** | ||||||||
7360423-C-T | 7492382-C-T | ** | ||||||||
7380738-G-T | 7512697-G-T | ** | ||||||||
7380921-A-T | 7512880-A-T | ** | ||||||||
7422982-G-T | 7554941-G-T | ** | ||||||||
7281884-C-A | 7413843-C-A | ** | ||||||||
7469900-C-A | 7601859-C-A | IR1_L | ** | |||||||
7649124-A-T | 7781083-A-T | ** | ||||||||
7864199-G-A | 7996158-G-A | ** | ||||||||
7873862-CA-C | 8005821-CA-C | ** | ||||||||
7897636-C-T | 8029595-C-T | ** | ||||||||
7996285-T-A | 8128244-T-A | ** | ||||||||
7996950-C-A | 8128909-C-A | ** | ||||||||
7285089-C-A | 7417048-C-A | ** | ||||||||
7269873-C-A | 7401832-C-A | ** | ||||||||
8067257-C-G | 8199216-C-G | ** | ||||||||
7138416-T-C | 7270375-T-C | ** | ||||||||
6976542-G-T | 7108501-G-T | ** | ||||||||
7021007-G-T | 7152966-G-T | ** | ||||||||
7033442-G-C | 7165401-G-C | ** | ||||||||
8135710-A-C | 8267669-A-C | ** | ||||||||
7094393-A-G | 7226352-A-G | ** | ||||||||
7114894-A-C | 7246853-A-C | ** | ||||||||
7135442-G-T | 7267401-G-T | ** | ||||||||
7139279-C-A | 7271238-C-A | ** | ||||||||
7240865-A-G | 7372824-A-G | ** | ||||||||
7141037-C-A | 7272996-C-A | ** | ||||||||
7164172-C-A | 7296131-C-A | ** | ||||||||
7181916-C-A | 7313875-C-A | ** | ||||||||
7218284-G-T | 7350243-G-T | ** | ||||||||
7225771-TG-T | 7357730-TG-T | ** | ||||||||
7231525-A-T | 7363484-A-T | ** | ||||||||
7236500-A-G | 7368459-A-G | ** | ||||||||
7236510-C-G | 7368469-C-G | ** | ||||||||
26130129-A-T | 23983982-A-T | P1_Y1 | ** | |||||||
8135676-T-G | 8267635-T-G | ** | ||||||||
6929512-T-A | 7061471-T-A | ** | ||||||||
9941397-C-G | 10103788-C-G | ** | ||||||||
9602671-T-G | 9765062-T-G | IR3_Prx | ** | |||||||
9624602-A-C | 9786993-A-C | IR3_Prx | ** | |||||||
9824020-G-C | 9986411-G-C | ** | ||||||||
9836888-GTTTTTTT-G | 9999279-GTTTTTTT-G | 20×T | ** | |||||||
9852713-T-A | 10015104-T-A | ** | ||||||||
25533488-T-A | 23387341-T-A | P1_gr1 | ** | |||||||
25508357-G-A | 23362210-G-A | P1_gr1 | ** | |||||||
9944095-A-T | 10106486-A-T | ** | ||||||||
9502532-G-T | 9664923-G-T | ** | ||||||||
9944100-G-A | 10106491-G-A | ** | ||||||||
22820319-C-A | 20658433-C-A | ** | ||||||||
9963185-C-A | 10125576-C-A | ** | ||||||||
9975103-G-C | 10137494-G-C | ** | ||||||||
9975122-G-T | 10137513-G-T | ** | ||||||||
9975138-T-C | 10137529-T-C | ** | ||||||||
9976171-A-T | 10138562-A-T | ** | ||||||||
9522561-TC-T | 9684952-TC-T | ** | ||||||||
25849163-T-TG | 23703016-T-TG | P1_Y1 | ** | |||||||
8281751-C-A | 8413710-C-A | ** | ||||||||
8673974-C-G | 8805933-C-G | ** | ||||||||
8290910-T-G | 8422869-T-G | ** | ||||||||
25977322-TTATTATTATTA-T | 23831175-TTATTATTATTA-T | P1_Y1 | ** | |||||||
8387652-A-G | 8519611-A-G | ** | ||||||||
8481385-A-T | 8613344-A-T | ** | ||||||||
8665703-C-A | 8797662-C-A | ** | ||||||||
8672025-C-A | 8803984-C-A | ** | ||||||||
8673891-C-A | 8805850-C-A | ** | ||||||||
25850862-C-A | 23704715-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
9421358-A-C | 9583749-A-C | ** | ||||||||
8806960-T-A | 8938919-T-A | ** | ||||||||
8985911-G-T | 9148302-G-T | ** | ||||||||
9034569-T-C | 9196960-T-C | ** | ||||||||
9034596-A-G | 9196987-A-G | ** | ||||||||
9063765-C-G | 9226156-C-G | ** | ||||||||
9353239-C-A | 9515630-C-A | ** | ||||||||
9385083-A-T | 9547474-A-T | ** | ||||||||
9418986-AT-A | 9581377-AT-A | ** | ||||||||
6929546-G-A | 7061505-G-A | ** | ||||||||
7054140-C-A | 7186099-C-A | ** | ||||||||
6926266-C-A | 7058225-C-A | ** | ||||||||
4088345-C-A | 4220304-C-A | ** | ||||||||
3818002-C-A | 3949961-C-A | A18761 | ** | |||||||
3831127-C-A | 3963086-C-A | ** | ||||||||
3965383-A-G | 4097342-A-G | ** | ||||||||
4023120-G-T | 4155079-G-T | ** | ||||||||
28484407-C-A | 26338260-C-A | ** | ||||||||
4063764-G-A | 4195723-G-A | ** | ||||||||
28159122-A-T | 26012975-A-T | P1_b4 | ** | |||||||
4132646-C-A | 4264605-C-A | ** | ||||||||
3620717-C-A | 3752676-C-A | ** | ||||||||
4139034-G-T | 4270993-G-T | ** | ||||||||
28076531-C-T | 25930384-C-T | P1_Y2 | ** | |||||||
4208168-C-A | 4340127-C-A | ** | ||||||||
4269555-G-T | 4401514-G-T | ** | ||||||||
4270705-G-T | 4402664-G-T | ** | ||||||||
27862620-A-C | 25716473-A-C | P1_Y2 | ** | |||||||
26314764-G-T | 24168617-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
4437974-C-T | 4569933-C-T | ** | ||||||||
3650773-G-T | 3782732-G-T | ** | ||||||||
3530757-C-A | 3662716-C-A | ** | ||||||||
4648735-G-T | 4780694-G-T | ** | ||||||||
2768056-GA-G | 2900015-GA-G | ** | ||||||||
18779074-C-A | 16667194-C-A | ** | ||||||||
27287-G-A | ** | |||||||||
3178277-C-A | 3310236-C-A | ** | ||||||||
10967763-G-T | ** | |||||||||
26328581-C-A | 24182434-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26834724-G-A | 24688577-G-A | P1_g2 | ** | |||||||
2718906-A-C | 2850865-A-C | ** | ||||||||
2746013-A-G | 2877972-A-G | ** | ||||||||
2768316-C-A | 2900275-C-A | ** | ||||||||
3492877-G-T | 3624836-G-T | ** | ||||||||
2791544-G-T | 2923503-G-T | ** | ||||||||
2817267-C-A | 2949226-C-A | ** | ||||||||
2865844-A-G | 2997803-A-G | ** | ||||||||
2865857-C-A | 2997816-C-A | ** | ||||||||
3252905-A-C | 3384864-A-C | ** | ||||||||
3252955-T-C | 3384914-T-C | ** | ||||||||
3280431-A-T | 3412390-A-T | ** | ||||||||
3286645-C-A | 3418604-C-A | ** | ||||||||
4527460-G-A | 4659419-G-A | ** | ||||||||
4417558-T-C | 4549517-T-C | ** | ||||||||
4756561-C-A | 4888520-C-A | ** | ||||||||
6714574-G-A | 6846533-G-A | ** | ||||||||
6251988-T-G | 6383947-T-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6308224-A-G | 6440183-A-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6357744-G-T | 6489703-G-T | ** | ||||||||
26328593-T-G | 24182446-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
6453771-G-T | 6585730-G-T | ** | ||||||||
6501224-A-G | 6633183-A-G | ** | ||||||||
6582716-AT-A | 6714675-AT-A | ** | ||||||||
6714595-C-A | 6846554-C-A | ** | ||||||||
5847200-T-A | 5979159-T-A | ** | ||||||||
6714598-G-A | 6846557-G-A | ** | ||||||||
6714622-G-A | 6846581-G-A | ** | ||||||||
6720448-C-A | 6852407-C-A | ** | ||||||||
6791177-A-G | 6923136-A-G | ** | ||||||||
6791183-C-T | 6923142-C-T | ** | ||||||||
6791194-A-C | 6923153-A-C | ** | ||||||||
6825506-C-T | 6957465-C-T | ** | ||||||||
6833316-TA-T | 6965275-TA-T | ** | ||||||||
5976358-T-G | 6108317-T-G | ** | ||||||||
22855416-G-C | 20693530-G-C | ** | ||||||||
5796113-C-A | 5928072-C-A | ** | ||||||||
5190724-G-A | 5322683-G-A | ** | ||||||||
4788537-T-A | 4920496-T-A | ** | ||||||||
4908704-C-G | 5040663-C-G | ** | ||||||||
4908706-T-G | 5040665-T-G | ** | ||||||||
4908708-T-G | 5040667-T-G | ** | ||||||||
4958301-G-T | 5090260-G-T | ** | ||||||||
27423999-G-T | 25277852-G-T | P1_g3 | ** | |||||||
5068670-C-G | 5200629-C-G | ** | ||||||||
5189357-A-T | 5321316-A-T | ** | ||||||||
5200192-G-T | 5332151-G-T | ** | ||||||||
5220530-C-A | 5352489-C-A | ** | ||||||||
5494615-T-C | 5626574-T-C | ** | ||||||||
5658469-G-T | 5790428-G-T | ** | ||||||||
5449298-A-G | 5581257-A-G | ** | ||||||||
5587864-C-A | 5719823-C-A | ** | ||||||||
3962434-T-TA | 4094393-T-TA | 10×A | *** | |||||||
8822749-A-G | 8954708-A-G | *** | ||||||||
16084109-C-T | 13972229-C-T | *** | ||||||||
24406992-C-A | 22260845-C-A | *** | ||||||||
22001381-G-T | 19839495-G-T | *** | ||||||||
21697558-G-A | 19535672-G-A | *** | ||||||||
5532646-CTTT-C,CT | 5664605-CTTT-C,CT | 15×T | *** | |||||||
18766831-A-G | 16654951-A-G | *** | ||||||||
16000946-A-G | 13889066-A-G | *** | ||||||||
12903343-CTTTTT-C,CTTT | 25×T | *** | ||||||||
23435717-G-T | 21273831-G-T | *** | ||||||||
21697574-A-C | 19535688-A-C | *** | ||||||||
15683627-TC-T | 13571747-TC-T | *** | ||||||||
13448915-A-ACTCCT | 11293239-A-ACTCCT | *** | ||||||||
22829644-CAAAAAAA-C | 20667758-CAAAAAAA-C | 18×A | *** | |||||||
15057731-A-T | 12945823-A-T | *** | ||||||||
10935539-T-A,C | *** | |||||||||
19333254-A-T | 17221374-A-T | *** | ||||||||
15057352-C-A | 12945444-C-A | *** | ||||||||
23609568-C-A | 21447682-C-A | *** | ||||||||
13488850-G-T | 11333174-G-T | *** | ||||||||
15859455-G-T | 13747575-G-T | *** | ||||||||
23775446-A-T | 21613560-A-T | *** | ||||||||
6674465-ATTT-A,ATT | 6806424-ATTT-A,ATT | 16×T | *** | |||||||
10652899-ACACTC-A | *** | |||||||||
2860016-C-T | 2991975-C-T | BY56874 | *** | |||||||
6878056-G-A | 7010015-G-A | *** | ||||||||
9941132-C-A | 10103523-C-A | *** | ||||||||
24406246-G-T | 22260099-G-T | *** | ||||||||
22587954-CAA-C,CA | 20426068-CAA-C,CA | 13×A | *** | |||||||
10807069-A-C,T | *** | |||||||||
10659275-C-A | *** | |||||||||
17678660-A-G | 15566780-A-G | *** | ||||||||
10670837-G-A,A | *** | |||||||||
56831681-G-C,T | *** | |||||||||
4062769-A-T | 4194728-A-T | *** | ||||||||
20019588-G-C | 17907708-G-C | P5_Prx | *** | |||||||
13866840-T-A | 11746134-T-A | *** | ||||||||
21574544-TTTA-T | 19412658-TTTA-T | 6×TTA | *** | |||||||
13410932-C-G | 11255256-C-G | *** | ||||||||
7195265-G-A | 7327224-G-A | *** | ||||||||
13461709-C-A,G | 11306033-C-A,G | *** | ||||||||
13857557-AATGGAATGG-A | 11736851-AATGGAATGG-A | *** | ||||||||
15416830-GAA-G | 13304950-GAA-G | 12×A | *** | |||||||
13736866-T-A | 11581190-T-A | *** | ||||||||
22243122-A-C | 20081236-A-C | DYZ19 | *** | |||||||
11018773-T-A | *** | |||||||||
22275657-G-A | 20113771-G-A | DYZ19 | *** | *** | ||||||
13938882-CAAA-C | 11818176-CAAA-C | 13×A | *** | |||||||
13488835-C-T | 11333159-C-T | *** | ||||||||
13489410-T-C | 11333734-T-C | *** | ||||||||
13489412-C-A | 11333736-C-A | *** | ||||||||
15252010-A-G | 13140096-A-G | *** | ||||||||
13960976-CAA-C,CA | 11840270-CAA-C,CA | 14×A | *** | |||||||
21149544-C-A | 18987658-C-A | *** | ||||||||
8379396-A-T | 8511355-A-T | *** | ||||||||
4080947-C-A | 4212906-C-A | *** | ||||||||
22810102-C-A | 20648216-C-A | *** | ||||||||
17551886-G-A | 15440006-G-A | *** | ||||||||
14151503-C-A | 12030797-C-A | *** | ||||||||
15258606-C-A | 13146690-C-A | *** | ||||||||
15263551-C-A | 13151641-C-A | *** | ||||||||
15268763-C-A | 13156852-C-A | *** | ||||||||
15276857-C-A | 13164946-C-A | *** | ||||||||
16076042-C-A | 13964162-C-A | *** | ||||||||
16245406-T-C | 14133526-T-C | *** | ||||||||
16940874-AT-A | 14828994-AT-A | *** | ||||||||
18717854-G-A | 16605974-G-A | *** | ||||||||
13963802-C-A | 11843096-C-A | *** | ||||||||
19298864-C-A | 17186984-C-A | *** | ||||||||
19313727-C-A | 17201847-C-A | *** | ||||||||
20640333-C-A | 18478447-C-A | P4_Prx | *** | |||||||
21139193-C-A | 18977307-C-A | *** | ||||||||
21318476-T-A | 19156590-T-A | *** | ||||||||
21365420-TC-T | 19203534-TC-T | *** | ||||||||
21565058-C-A | 19403172-C-A | *** | ||||||||
22526459-A-G | 20364573-A-G | *** | ||||||||
13992219-G-C | 11871513-G-C | *** | ||||||||
11650884-A-G | *** | |||||||||
4179147-T-A | 4311106-T-A | *** | ||||||||
9873624-C-A | 10036015-C-A | *** | ||||||||
4302155-T-C | 4434114-T-C | *** | ||||||||
5022059-T-A | 5154018-T-A | *** | ||||||||
6402478-C-A | 6534437-C-A | *** | ||||||||
6867829-T-C | 6999788-T-C | *** | ||||||||
8013234-A-G | 8145193-A-G | *** | ||||||||
8350561-T-C | 8482520-T-C | *** | ||||||||
8742706-C-A | 8874665-C-A | *** | ||||||||
9461949-G-T | 9624340-G-T | *** | ||||||||
9940278-C-A | 10102669-C-A | *** | ||||||||
13604655-G-T | 11448979-G-T | *** | ||||||||
10654366-C-A,T | *** | |||||||||
10796672-C-CG | *** | |||||||||
10798822-C-A | *** | |||||||||
9177929-TTG-T | 9340320-TTG-T | 15×TG | *** | |||||||
10877808-CA-C | *** | |||||||||
11001437-T-C,TTCC | *** | |||||||||
11001493-TC-T | *** | |||||||||
13488845-C-CCA | 11333169-C-CCA | *** | ||||||||
22537526-G-T | 20375640-G-T | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: 536250 | 10622029 | 7702704 | 7786929 |
Kit: 536250 | 9661072 | 7852084 | 7738660 |
Kit: 536250 | 14973373 | 9366263 | 8309497 |
Used in age calculations | 14973373 | 9366263 | 8309497 |
Counts of SNPs | 5 | 5 |
Big Tree Main Page