Gorman
BigY3: 579539, BigY2: 579539, FTDNA: 579539Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | BigY3 579539 | BigY2 579539 | FTDNA 579539 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
19283984-C-G | 17172104-C-G | MF5127 | Y | Y | 7×TATGG | A* | ||||
25931556-A-G | 23785409-A-G | BY30902 | P1_Y1 | 9×AAGG | A* | *** | ||||
24247881-C-A | 22101734-C-A | P3_b1 | A* | A* | *** | |||||
26176227-C-T | 24030080-C-T | P1_Y1 | A* | *** | ||||||
10950926-C-G | A* | |||||||||
25966260-C-T | 23820113-C-T | P1_Y1 | A* | |||||||
56835117-T-A | A* | |||||||||
56844033-G-A | A* | |||||||||
5930530-T-C | 6062489-T-C | FT69490 | A* | |||||||
6023459-T-C | 6155418-T-C | A* | ||||||||
20229557-T-TAC | 18067671-T-TAC | P5_Dst | 18×AC | A* | ||||||
17995187-A-G | 15883307-A-G | P7_Prx | Y | A* | ||||||
14435833-C-T | 12315106-C-T | S1251 | S1251 | Y | + | + | + | |||
14435836-G-A | 12315109-G-A | S1251 | S1252 | Y | + | + | + | |||
14435840-T-C | 12315113-T-C | S1251 | S1253 | Y | + | + | + | |||
14435843-A-G | 12315116-A-G | S1251 | S1254 | Y | + | + | + | |||
14435848-T-A | 12315121-T-A | S1255 | Y | + | + | + | ||||
18612761-A-G | 16500881-A-G | S1729 | ZS6275 BY1446 | Y | Y | + | + | |||
2886198-A-T | 3018157-A-T | Y81706 | Y | Y | + | + | + | |||
8535194-A-C | 8667153-A-C | Y87197 | Y | Y | + | + | + | |||
18029870-C-A | 15917990-C-A | Y101011 | Y | + | + | + | ||||
18171468-G-A | 16059588-G-A | Y101528 | Y | Y | + | + | + | |||
4120441-A-C | 4252400-A-C | FT214459 | + | |||||||
6418838-C-T | 6550797-C-T | FT215226 | + | |||||||
15066294-G-A | 12954385-G-A | FT216541 | Y | Y | + | |||||
22055430-C-T | 19893544-C-T | FT218115 | Y | Y | + | |||||
19284014-G-C | 17172134-G-C | Y17080 | CTS10135 M7531 | Y | Y | * | ||||
13826140-T-A | 11705434-T-A | FT209439 | * | |||||||
22185347-TAA-T | 20023461-TAA-T | 13×A | * | |||||||
9921850-T-C | 10084241-T-C | PF6725 | ** | |||||||
3956691-AAC-A | 4088650-AAC-A | 12×AC | ** | |||||||
15944350-C-A | 13832470-C-A | ** | ||||||||
10061674-C-T | 10224065-C-T | ** | ||||||||
22995376-G-T | 20833490-G-T | 21×T | ** | |||||||
10070164-G-A | 10232555-G-A | ** | ||||||||
27679477-TTA-T | 25533330-TTA-T | P1_Y2 | ** | |||||||
4474248-T-TTA | 4606207-T-TTA | 8×TA | ** | |||||||
4957120-T-C | 5089079-T-C | FGC76 Z8146 | ** | |||||||
13263885-C-G | 11108209-C-G | ** | ||||||||
13486863-A-T | 11331187-A-T | ** | ||||||||
14295541-CGT-C | 12174835-CGT-C | 8×GT | ** | |||||||
18423886-AC-A | 16312006-AC-A | P6_Gap | ** | |||||||
19438612-G-A | 17326732-G-A | FT154828 | ** | |||||||
21993827-G-A | 19831941-G-A | Z24812 | ** | |||||||
9931634-C-A | 10094025-C-A | ** | ||||||||
18511600-A-G | 16399720-A-G | P6_Dst | ** | |||||||
26204651-G-A | 24058504-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
13274622-CT-C | 11118946-CT-C | 9×T | ** | |||||||
19129053-C-T | 17017173-C-T | 16×T | ** | |||||||
6368126-C-A | 6500085-C-A | ** | ||||||||
20326039-A-AT | 18164153-A-AT | P5_Dst | ** | |||||||
13854833-G-T | 11734127-G-T | ** | ||||||||
11676816-G-T | ** | |||||||||
11676817-G-A | ** | |||||||||
7200523-C-A | 7332482-C-A | ** | ||||||||
21972144-C-A | 19810258-C-A | ** | ||||||||
21353346-C-A | 19191460-C-A | ** | ||||||||
9440269-C-A | 9602660-C-A | ** | ||||||||
10748315-T-G | ** | |||||||||
6264484-T-TC | 6396443-T-TC | IR3_Dst | ** | |||||||
15468314-T-C | 13356434-T-C | ** | ||||||||
7160914-A-C | 7292873-A-C | ** | ||||||||
8760542-GAC-G | 8892501-GAC-G | ** | ||||||||
8760547-A-G | 8892506-A-G | ** | ||||||||
15541770-G-T | 13429890-G-T | ** | ||||||||
10992309-C-A | ** | |||||||||
10992316-A-T | ** | |||||||||
10992330-CA-C | ** | |||||||||
10992336-ACTCC-A | ** | |||||||||
8760517-C-CTT | 8892476-C-CTT | 20×T | ** | |||||||
13487688-C-T | 11332012-C-T | ** | ||||||||
11032871-A-G | ** | |||||||||
11032875-T-G | ** | |||||||||
15734328-C-A | 13622448-C-A | ** | ||||||||
13485648-A-T | 11329972-A-T | ** | ||||||||
10923706-C-T | ** | |||||||||
10923719-C-A | ** | |||||||||
10923725-A-G | ** | |||||||||
10923743-C-T | ** | |||||||||
16823818-C-A | 14711938-C-A | ** | ||||||||
25995070-GGA-G | 23848923-GGA-G | P1_Y1 | ** | |||||||
13482387-G-A | 11326711-G-A | ** | ||||||||
15151502-CAAAAA-C | 13039589-CAAAAA-C | 23×A | ** | |||||||
10686931-G-T | ** | |||||||||
15860215-C-A | 13748335-C-A | ** | ||||||||
27862648-C-G | 25716501-C-G | P1_Y2 | ** | |||||||
15364056-T-C | 13252176-T-C | ** | ||||||||
10916292-T-G | ** | |||||||||
10916320-C-T | ** | |||||||||
5728016-C-A | 5859975-C-A | ** | ||||||||
13255202-C-A | 11099526-C-A | ** | ||||||||
16897642-TC-A | 14785762-TC-A | ** | ||||||||
17465056-C-A | 15353176-C-A | ** | ||||||||
10937391-A-T | ** | |||||||||
19528358-C-A | 17416478-C-A | ** | ||||||||
19887301-TACAC-T | 17775421-TACAC-T | P5_Prx | 12×AC | ** | ||||||
3817919-A-AT | 3949878-A-AT | 8×T | ** | |||||||
28570401-C-A | 26424254-C-A | ** | ||||||||
23779947-C-A | 21618061-C-A | ** | ||||||||
10689030-T-C | ** | |||||||||
21346309-C-A | 19184423-C-A | ** | ||||||||
24264741-AC-A | 22118594-AC-A | P3_b1 | ** | |||||||
6454628-C-A | 6586587-C-A | ** | ||||||||
10667029-C-T | ** | |||||||||
5937300-C-T | 6069259-C-T | ** | ||||||||
10666994-C-T | ** | |||||||||
10667028-C-A | ** | |||||||||
10785302-C-A | ** | |||||||||
10785308-C-G | ** | |||||||||
22056124-C-A | 19894238-C-A | ** | ||||||||
7461779-G-T | 7593738-G-T | IR1_L | ** | |||||||
7461786-C-A | 7593745-C-A | IR1_L | ** | |||||||
10937411-A-C | ** | |||||||||
10937411-A-ATTCAATGCCT | ** | |||||||||
10882046-A-G | ** | |||||||||
16002463-C-A | 13890583-C-A | ** | ||||||||
11004433-T-TGATA | ** | |||||||||
6948334-C-A | 7080293-C-A | ** | ||||||||
2719022-C-T | 2850981-C-T | ** | ||||||||
5968302-C-A | 6100261-C-A | ** | ||||||||
10878311-C-T | ** | |||||||||
10980786-C-A | ** | |||||||||
13482367-G-C | 11326691-G-C | ** | ||||||||
13482372-T-C | 11326696-T-C | ** | ||||||||
13482394-G-T | 11326718-G-T | ** | ||||||||
15172623-C-A | 13060709-C-A | ** | ||||||||
14136312-C-A | 12015606-C-A | ** | ||||||||
21140090-C-A | 18978204-C-A | ** | ||||||||
14228859-C-A | 12108153-C-A | FT146366 | ** | |||||||
18443489-G-C | 16331609-G-C | P6_Dst | ** | |||||||
56830361-TCTGC-T | ** | |||||||||
56830366-TC-T | ** | |||||||||
56830380-C-A | ** | |||||||||
6881268-C-A | 7013227-C-A | ** | ||||||||
15115578-C-A | 13003665-C-A | ** | ||||||||
23625489-G-T | 21463603-G-T | ** | ||||||||
15198733-C-A | 13086819-C-A | ** | ||||||||
16305923-TC-A | 14194043-TC-A | ** | ||||||||
10061668-T-A | 10224059-T-A | ** | ||||||||
10061669-A-T | 10224060-A-T | ** | ||||||||
10061670-C-G | 10224061-C-G | ** | ||||||||
7160912-A-G | 7292871-A-G | ** | ||||||||
4292780-A-G | 4424739-A-G | ** | ||||||||
21238595-G-C | 19076709-G-C | ** | ||||||||
10790224-C-A | ** | |||||||||
10689045-T-A | ** | |||||||||
10689068-C-A | ** | |||||||||
22055474-T-A | 19893588-T-A | ** | ||||||||
10963681-T-C | ** | |||||||||
28755713-C-A | 26609566-C-A | ** | ||||||||
18925240-C-A | 16813360-C-A | ** | ||||||||
21235197-C-A | 19073311-C-A | ** | ||||||||
7188376-C-A | 7320335-C-A | ** | ||||||||
28062669-G-T | 25916522-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
10050862-C-A | 10213253-C-A | ** | ||||||||
2701190-A-T | 2833149-A-T | ** | ||||||||
2719025-C-T | 2850984-C-T | ** | ||||||||
2719029-C-T | 2850988-C-T | ** | ||||||||
2788993-G-T | 2920952-G-T | ** | ||||||||
2791239-A-T | 2923198-A-T | ** | ||||||||
2858044-C-A | 2990003-C-A | ** | ||||||||
2866470-G-T | 2998429-G-T | ** | ||||||||
2906993-C-A | 3038952-C-A | ** | ||||||||
3147963-C-A | 3279922-C-A | ** | ||||||||
3240849-C-A | 3372808-C-A | ** | ||||||||
3309447-C-A | 3441406-C-A | ** | ||||||||
3323276-C-T | 3455235-C-T | ** | ||||||||
3323422-G-T | 3455381-G-T | ** | ||||||||
3407424-A-G | 3539383-A-G | ** | ||||||||
3522754-C-A | 3654713-C-A | ** | ||||||||
3530466-G-T | 3662425-G-T | ** | ||||||||
3599003-C-A | 3730962-C-A | ** | ||||||||
3696565-G-A | 3828524-G-A | ** | ||||||||
3833645-T-G | 3965604-T-G | ** | ||||||||
3833658-A-G | 3965617-A-G | ** | ||||||||
3848558-A-G | 3980517-A-G | ** | ||||||||
3865977-G-T | 3997936-G-T | ** | ||||||||
3961054-A-G | 4093013-A-G | ** | ||||||||
3986137-AAAAT-A | 4118096-AAAAT-A | 6×AAAT | ** | |||||||
4012682-C-A | 4144641-C-A | ** | ||||||||
4062672-G-A | 4194631-G-A | ** | ||||||||
4103285-C-A | 4235244-C-A | ** | ||||||||
4117322-G-T | 4249281-G-T | ** | ||||||||
4245232-G-T | 4377191-G-T | ** | ||||||||
4261928-T-G | 4393887-T-G | ** | ||||||||
4339595-C-A | 4471554-C-A | ** | ||||||||
4374700-A-C | 4506659-A-C | ** | ||||||||
4385814-G-T | 4517773-G-T | ** | ||||||||
4521611-CT-C | 4653570-CT-C | ** | ||||||||
4742654-A-T | 4874613-A-T | ** | ||||||||
4742737-C-A | 4874696-C-A | ** | ||||||||
4755458-G-T | 4887417-G-T | ** | ||||||||
4777116-C-A | 4909075-C-A | ** | ||||||||
4778509-C-A | 4910468-C-A | ** | ||||||||
4830382-A-T | 4962341-A-T | ** | ||||||||
4830388-C-T | 4962347-C-T | ** | ||||||||
4830402-A-T | 4962361-A-T | ** | ||||||||
4830404-A-T | 4962363-A-T | ** | ||||||||
4830409-A-T | 4962368-A-T | ** | ||||||||
4898426-A-T | 5030385-A-T | ** | ||||||||
4898482-A-G | 5030441-A-G | ** | ||||||||
4898550-T-C | 5030509-T-C | ** | ||||||||
4990569-A-G | 5122528-A-G | ** | ||||||||
4999907-T-C | 5131866-T-C | ** | ||||||||
5140731-C-A | 5272690-C-A | ** | ||||||||
5280967-C-A | 5412926-C-A | ** | ||||||||
5322594-G-T | 5454553-G-T | ** | ||||||||
5335919-C-A | 5467878-C-A | ** | ||||||||
5359645-G-T | 5491604-G-T | ** | ||||||||
5459152-C-A | 5591111-C-A | ** | ||||||||
5460257-C-A | 5592216-C-A | ** | ||||||||
5674607-C-A | 5806566-C-A | ** | ||||||||
5685465-CT-C | 5817424-CT-C | ** | ||||||||
5703263-A-G | 5835222-A-G | ** | ||||||||
5710575-C-A | 5842534-C-A | ** | ||||||||
5927114-A-C | 6059073-A-C | ** | ||||||||
5937285-C-A | 6069244-C-A | ** | ||||||||
5937295-A-C | 6069254-A-C | ** | ||||||||
5961259-T-G | 6093218-T-G | ** | ||||||||
5969335-A-T | 6101294-A-T | ** | ||||||||
6050244-A-G | 6182203-A-G | ** | ||||||||
6241128-C-CAT | 6373087-C-CAT | IR3_Dst | ** | |||||||
6310857-A-ACACC | 6442816-A-ACACC | IR3_Dst | ** | |||||||
6318868-C-A | 6450827-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6318929-A-AC | 6450888-A-AC | IR3_Dst | ** | |||||||
6365106-C-A | 6497065-C-A | ** | ||||||||
6367835-T-G | 6499794-T-G | ** | ||||||||
6466718-T-C | 6598677-T-C | ** | ||||||||
6580487-C-A | 6712446-C-A | ** | ||||||||
6582387-A-G | 6714346-A-G | ** | ||||||||
6592459-C-G | 6724418-C-G | ** | ||||||||
6608186-C-A | 6740145-C-A | ** | ||||||||
6646908-C-A | 6778867-C-A | ** | ||||||||
6711796-C-A | 6843755-C-A | ** | ||||||||
6720453-G-A | 6852412-G-A | ** | ||||||||
6767784-GA-G | 6899743-GA-G | 9×A | ** | |||||||
6776043-C-A | 6908002-C-A | ** | ||||||||
6816734-T-A | 6948693-T-A | ** | ||||||||
6816748-A-C | 6948707-A-C | ** | ||||||||
6826953-G-T | 6958912-G-T | ** | ||||||||
6956446-C-A | 7088405-C-A | ** | ||||||||
6981330-T-A | 7113289-T-A | ** | ||||||||
7011447-C-A | 7143406-C-A | ** | ||||||||
7018050-T-A | 7150009-T-A | ** | ||||||||
7018051-TAG-T | 7150010-TAG-T | ** | ||||||||
7019199-C-A | 7151158-C-A | ** | ||||||||
7061718-TG-T | 7193677-TG-T | ** | ||||||||
7098593-C-A | 7230552-C-A | ** | ||||||||
7111809-C-A | 7243768-C-A | ** | ||||||||
7132096-C-A | 7264055-C-A | ** | ||||||||
7160915-C-G | 7292874-C-G | ** | ||||||||
7160923-TG-T | 7292882-TG-T | ** | ||||||||
7166867-A-C | 7298826-A-C | ** | ||||||||
7183074-C-A | 7315033-C-A | ** | ||||||||
7183134-T-C | 7315093-T-C | ** | ||||||||
7183154-C-A | 7315113-C-A | ** | ||||||||
7217537-C-A | 7349496-C-A | ** | ||||||||
7224038-C-A | 7355997-C-A | ** | ||||||||
7224166-T-C | 7356125-T-C | ** | ||||||||
7236547-C-A | 7368506-C-A | ** | ||||||||
7240521-GA-G | 7372480-GA-G | ** | ||||||||
7299139-C-T | 7431098-C-T | ** | ||||||||
7314336-C-A | 7446295-C-A | ** | ||||||||
7347232-C-A | 7479191-C-A | Y83953 | ** | |||||||
7380875-C-A | 7512834-C-A | ** | ||||||||
7385635-G-A | 7517594-G-A | ** | ||||||||
7461778-A-T | 7593737-A-T | IR1_L | ** | |||||||
7469361-C-A | 7601320-C-A | IR1_L | ** | |||||||
7534570-C-T | 7666529-C-T | ** | ||||||||
7635985-C-A | 7767944-C-A | ** | ||||||||
7650230-C-A | 7782189-C-A | ** | ||||||||
7670778-C-A | 7802737-C-A | ** | ||||||||
7690024-T-C | 7821983-T-C | ** | ||||||||
7757299-C-A | 7889258-C-A | ** | ||||||||
7775087-C-A | 7907046-C-A | ** | ||||||||
7821277-A-T | 7953236-A-T | ** | ||||||||
7824883-T-A | 7956842-T-A | ** | ||||||||
7865979-G-A | 7997938-G-A | Y46537 | ** | |||||||
7866712-C-A | 7998671-C-A | ** | ||||||||
7874816-A-C | 8006775-A-C | ** | ||||||||
7874820-A-T | 8006779-A-T | ** | ||||||||
7948038-C-A | 8079997-C-A | ** | ||||||||
8119312-C-A | 8251271-C-A | ** | ||||||||
8218199-C-A | 8350158-C-A | ** | ||||||||
8369530-C-A | 8501489-C-A | ** | ||||||||
8369583-C-A | 8501542-C-A | ** | ||||||||
8385213-G-T | 8517172-G-T | ** | ||||||||
8568490-A-C | 8700449-A-C | ** | ||||||||
8748443-A-T | 8880402-A-T | ** | ||||||||
8760539-C-G | 8892498-C-G | ** | ||||||||
8760554-C-T | 8892513-C-T | ** | ||||||||
8760565-A-C | 8892524-A-C | ** | ||||||||
8842471-T-C | 8974430-T-C | ** | ||||||||
8890985-T-A | 9022944-T-A | ** | ||||||||
8897256-C-A | 9029215-C-A | ** | ||||||||
9111219-C-A | ** | |||||||||
9114190-A-G | ** | |||||||||
9124532-A-G | ** | |||||||||
9075338-C-A | 9237729-C-A | ** | ||||||||
9117238-C-A | 9279629-C-A | ** | ||||||||
9146507-C-A | 9308898-C-A | ** | ||||||||
9371481-T-A | 9533872-T-A | ** | ||||||||
9404554-C-A | 9566945-C-A | ** | ||||||||
9424501-C-A | 9586892-C-A | ** | ||||||||
9461330-C-A | 9623721-C-A | ** | ||||||||
9501065-G-C | 9663456-G-C | ** | ||||||||
9592710-A-AG | 9755101-A-AG | IR3_Prx | ** | |||||||
9592731-C-T | 9755122-C-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9736904-G-T | 9899295-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9765299-C-A | 9927690-C-A | ** | ||||||||
9874513-C-A | 10036904-C-A | ** | ||||||||
9950674-C-A | 10113065-C-A | ** | ||||||||
9986010-C-A | 10148401-C-A | ** | ||||||||
10019691-G-T | 10182082-G-T | ** | ||||||||
10026335-T-G | 10188726-T-G | ** | ||||||||
10648056-C-A | ** | |||||||||
10649017-G-T | ** | |||||||||
10666999-C-GGGTTA | ** | |||||||||
10677098-G-T | ** | |||||||||
10683506-G-A | ** | |||||||||
10684059-C-T | ** | |||||||||
10687027-G-T | ** | |||||||||
10689027-C-A | ** | |||||||||
10689037-C-T | ** | |||||||||
10689065-C-A | ** | |||||||||
10746919-A-ATTCTC | ** | |||||||||
10747819-C-CGGATG | ** | |||||||||
10747833-C-G | FT225406 | ** | ||||||||
10747846-C-T | ** | |||||||||
10772923-C-A | ** | |||||||||
10772931-G-T | ** | |||||||||
10776068-T-A | ** | |||||||||
10776493-A-G | ** | |||||||||
10778687-T-G | ** | |||||||||
10790199-A-C | ** | |||||||||
10790201-C-T | ** | |||||||||
10790229-C-A | ** | |||||||||
10790234-C-T | ** | |||||||||
10792969-G-T | ** | |||||||||
10804965-A-G | ** | |||||||||
10819303-T-C | ** | |||||||||
10824703-C-A | ** | |||||||||
10842126-T-C | ** | |||||||||
10848222-C-T | ** | |||||||||
10848741-C-A | ** | |||||||||
10863141-C-A | ** | |||||||||
10870586-C-T | ** | |||||||||
10875951-C-A | ** | |||||||||
10892502-C-G | ** | |||||||||
10916279-A-G | ** | |||||||||
10916306-T-C | ** | |||||||||
10916334-T-G | ** | |||||||||
10918414-G-T | ** | |||||||||
10921036-C-A | ** | |||||||||
10927412-C-A | ** | |||||||||
10927419-C-A | ** | |||||||||
10927421-T-TAAATC | ** | |||||||||
10927425-T-C | ** | |||||||||
10944586-C-G | ** | |||||||||
10950376-C-A | ** | |||||||||
10950398-A-G | ** | |||||||||
10976087-C-A | ** | |||||||||
10987178-A-T | ** | |||||||||
10987583-G-T | ** | |||||||||
10989853-C-T | ** | |||||||||
10989864-T-A | ** | |||||||||
10989874-T-TCAATC | ** | |||||||||
10990203-G-T | ** | |||||||||
10994067-G-T | ** | |||||||||
11003587-C-A | ** | |||||||||
11018922-C-T | ** | |||||||||
13196035-C-A | 11040359-C-A | ** | ||||||||
13221845-G-C | 11066169-G-C | FT441175 | ** | |||||||
13221904-A-C | 11066228-A-C | ** | ||||||||
13234586-C-A | 11078910-C-A | ** | ||||||||
13274606-G-T | 11118930-G-T | ** | ||||||||
13301849-C-A | 11146173-C-A | ** | ||||||||
13305568-C-A | 11149892-C-A | ** | ||||||||
13324764-C-A | 11169088-C-A | ** | ||||||||
13433556-A-G | 11277880-A-G | ** | ||||||||
13475606-C-A | 11319930-C-A | ** | ||||||||
13485627-C-A | 11329951-C-A | ** | ||||||||
13509787-C-T | 11354111-C-T | ** | ||||||||
13511472-A-T | 11355796-A-T | ** | ||||||||
13571631-C-T | 11415955-C-T | ** | ||||||||
13600642-C-A | 11444966-C-A | ** | ||||||||
13610421-G-T | 11454745-G-T | ** | ||||||||
13643524-G-T | 11487848-G-T | ** | ||||||||
11654342-C-A | ** | |||||||||
11658543-G-T | ** | |||||||||
11658567-G-A | ** | |||||||||
11674765-A-G | ** | |||||||||
13854358-C-A | 11733652-C-A | ** | ||||||||
13854365-A-G | 11733659-A-G | ** | ||||||||
13859190-G-T | 11738484-G-T | ** | ||||||||
13868655-C-A | 11747949-C-A | ** | ||||||||
13874632-C-A | 11753926-C-A | ** | ||||||||
13881233-C-A | 11760527-C-A | ** | ||||||||
13891611-A-G | 11770905-A-G | ** | ||||||||
14025566-G-GA | 11904860-G-GA | ** | ||||||||
14046590-A-G | 11925884-A-G | ** | ||||||||
14049976-C-A | 11929270-C-A | ** | ||||||||
14069095-C-A | 11948389-C-A | ** | ||||||||
14077904-C-A | 11957198-C-A | ** | ||||||||
14107714-G-T | 11987008-G-T | ** | ||||||||
14195171-G-T | 12074465-G-T | ** | ||||||||
14229814-G-C | 12109108-G-C | ** | ||||||||
14242082-C-A | 12121376-C-A | ** | ||||||||
14268816-G-T | 12148110-G-T | ** | ||||||||
14269600-G-T | 12148894-G-T | ** | ||||||||
14279841-C-A | 12159135-C-A | ** | ||||||||
14279885-C-A | 12159179-C-A | ** | ||||||||
14310334-T-C | 12189628-T-C | ** | ||||||||
14352153-G-C | 12231448-G-C | ** | ||||||||
14387109-C-A | 12266405-C-A | ** | ||||||||
14389889-C-A | 12269185-C-A | ** | ||||||||
14406705-C-A | 12286003-C-A | ** | ||||||||
14416072-C-A | 12295369-C-A | ** | ||||||||
14431093-C-A | 12310366-C-A | ** | ||||||||
14468381-C-A | 12347650-C-A | ** | ||||||||
14511454-T-A | 12399659-T-A | ** | ||||||||
14527739-C-A | 12415940-C-A | ** | ||||||||
14549274-C-A | 12437475-C-A | ** | ||||||||
14560419-G-T | 12448620-G-T | ** | ||||||||
14566951-C-A | 12455151-C-A | ** | ||||||||
14574530-A-T | 12462730-A-T | ** | ||||||||
14575903-C-A | 12464103-C-A | ** | ||||||||
14589379-C-A | 12477579-C-A | ** | ||||||||
14620852-G-A | 12509050-G-A | ** | ||||||||
14661475-C-A | 12549540-C-A | ** | ||||||||
14721844-C-A | 12609912-C-A | ** | ||||||||
14735290-T-G | 12623358-T-G | ** | ||||||||
14735313-A-G | 12623381-A-G | ** | ||||||||
14754094-T-TG | 12642163-T-TG | ** | ||||||||
14754097-GA-G | 12642166-GA-G | ** | ||||||||
14769142-T-A | 12657211-T-A | ** | ||||||||
14887887-C-A | 12775953-C-A | ** | ||||||||
14919243-T-C | 12807310-T-C | ** | ||||||||
15060558-T-C | 12948650-T-C | ** | ||||||||
15285794-C-A | 13173893-C-A | ** | ||||||||
15333912-C-A | 13222030-C-A | ** | ||||||||
15369582-C-A | 13257702-C-A | ** | ||||||||
15375975-A-T | 13264095-A-T | ** | ||||||||
15402696-C-A | 13290816-C-A | ** | ||||||||
15468325-A-G | 13356445-A-G | ** | ||||||||
15595045-C-T | 13483165-C-T | ** | ||||||||
15632080-C-A | 13520200-C-A | ** | ||||||||
15669786-C-A | 13557906-C-A | ** | ||||||||
15669803-C-A | 13557923-C-A | ** | ||||||||
15714320-G-A | 13602440-G-A | ** | ||||||||
15859439-T-C | 13747559-T-C | ** | ||||||||
15863050-C-A | 13751170-C-A | ** | ||||||||
15903953-C-A | 13792073-C-A | ** | ||||||||
15918620-A-AT | 13806740-A-AT | 8×T | ** | |||||||
15928514-A-T | 13816634-A-T | ** | ||||||||
15975294-C-G | 13863414-C-G | ** | ||||||||
16003055-C-A | 13891175-C-A | ** | ||||||||
16035760-C-A | 13923880-C-A | ** | ||||||||
16046990-C-A | 13935110-C-A | ** | ||||||||
16050032-A-T | 13938152-A-T | ** | ||||||||
16058835-G-T | 13946955-G-T | ** | ||||||||
16094871-T-C | 13982991-T-C | ** | ||||||||
16177206-T-A | 14065326-T-A | ** | ||||||||
16220736-T-A | 14108856-T-A | ** | ||||||||
16274034-G-T | 14162154-G-T | ** | ||||||||
16427666-G-T | 14315786-G-T | ** | ||||||||
16427706-C-A | 14315826-C-A | ** | ||||||||
16465376-C-T | 14353496-C-T | ** | ||||||||
16475211-C-A | 14363331-C-A | ** | ||||||||
16550956-C-A | 14439076-C-A | ** | ||||||||
16607756-C-A | 14495876-C-A | ** | ||||||||
16688399-C-A | 14576519-C-A | ** | ||||||||
16702952-C-A | 14591072-C-A | ** | ||||||||
16702965-C-A | 14591085-C-A | ** | ||||||||
16868598-C-A | 14756718-C-A | ** | ||||||||
16944875-C-A | 14832995-C-A | ** | ||||||||
17014743-T-C | 14902863-T-C | ** | ||||||||
17060899-G-T | 14949019-G-T | ** | ||||||||
17061863-C-A | 14949983-C-A | ** | ||||||||
17153419-C-A | 15041539-C-A | ** | ||||||||
17157735-C-A | 15045855-C-A | ** | ||||||||
17181969-A-T | 15070089-A-T | ** | ||||||||
17224468-C-A | 15112588-C-A | ** | ||||||||
17306757-A-G | 15194877-A-G | ** | ||||||||
17374102-C-A | 15262222-C-A | ** | ||||||||
17546309-C-A | 15434429-C-A | ** | ||||||||
17546310-A-C | 15434430-A-C | ** | ||||||||
17576213-C-A | 15464333-C-A | ** | ||||||||
17580763-C-A | 15468883-C-A | ** | ||||||||
17584320-A-G | 15472440-A-G | ** | ||||||||
17596429-C-A | 15484549-C-A | ** | ||||||||
17722409-C-A | 15610529-C-A | ** | ||||||||
17802093-T-C | 15690213-T-C | ** | ||||||||
17947035-C-A | 15835155-C-A | ** | ||||||||
18127955-C-A | 16016075-C-A | ** | ||||||||
18159869-G-C | 16047989-G-C | ** | ||||||||
18165494-A-C | 16053614-A-C | ** | ||||||||
18165507-T-C | 16053627-T-C | ** | ||||||||
18212556-A-T | 16100676-A-T | ** | ||||||||
18246390-G-T | 16134510-G-T | ** | ||||||||
18443496-T-C | 16331616-T-C | BY35135 | P6_Dst | 22×AC | ** | |||||
18589809-C-A | 16477929-C-A | ** | ||||||||
18630666-CTTTT-C | 16518786-CTTTT-C | 20×T | ** | |||||||
18682785-C-A | 16570905-C-A | ** | ||||||||
18728880-C-A | 16617000-C-A | ** | ||||||||
18752053-GC-G | 16640173-GC-G | ** | ||||||||
18858630-A-G | 16746750-A-G | ** | ||||||||
18858636-C-A | 16746756-C-A | ** | ||||||||
18948023-C-A | 16836143-C-A | ** | ||||||||
18990371-G-T | 16878491-G-T | ** | ||||||||
19043071-A-G | 16931191-A-G | ** | ||||||||
19055474-G-T | 16943594-G-T | ** | ||||||||
19056240-C-A | 16944360-C-A | ** | ||||||||
19213256-A-T | 17101376-A-T | ** | ||||||||
19313657-C-A | 17201777-C-A | ** | ||||||||
19339452-C-A | 17227572-C-A | ** | ||||||||
19376264-G-T | 17264384-G-T | ** | ||||||||
19415582-C-A | 17303702-C-A | ** | ||||||||
19436738-AAGAGAG-A | 17324858-AAGAGAG-A | 14×AG | ** | *** | ||||||
19459275-T-G | 17347395-T-G | ** | ||||||||
19464907-ACTTTGAGAGTTCAG-A | 17353027-ACTTTGAGAGTTCAG-A | ** | ||||||||
19465582-C-A | 17353702-C-A | ** | ||||||||
19479486-C-G | 17367606-C-G | ** | ||||||||
19544626-C-A | 17432746-C-A | ** | ||||||||
19560495-C-A | 17448615-C-A | ** | ||||||||
19657450-T-C | 17545570-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
19819767-A-AG | 17707887-A-AG | P5_Prx | ** | |||||||
20437699-C-G | 18275813-C-G | P5_Dst | ** | |||||||
20437790-T-G | 18275904-T-G | P5_Dst | ** | |||||||
20437805-G-A | 18275919-G-A | P5_Dst | ** | |||||||
20437810-A-AC | 18275924-A-AC | P5_Dst | ** | |||||||
20516367-C-A | 18354481-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
20516375-G-T | 18354489-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20614888-C-A | 18453002-C-A | P4_Prx | ** | |||||||
20669148-T-C | 18507262-T-C | P4_Prx | ** | |||||||
20755631-G-T | 18593745-G-T | P4_Prx | ** | |||||||
20815815-T-C | 18653929-T-C | P4_Gap | ** | |||||||
20824823-T-A | 18662937-T-A | P4_Gap | ** | |||||||
20989003-G-T | 18827117-G-T | P4_Dst | ** | |||||||
21048897-A-G | 18887011-A-G | ** | ||||||||
21152432-G-T | 18990546-G-T | ** | ||||||||
21162845-G-T | 19000959-G-T | ** | ||||||||
21189509-TA-T | 19027623-TA-T | ** | ||||||||
21209018-C-A | 19047132-C-A | ** | ||||||||
21238232-C-A | 19076346-C-A | ** | ||||||||
21238695-C-A | 19076809-C-A | ** | ||||||||
21320112-G-C | 19158226-G-C | ** | ||||||||
21336744-C-A | 19174858-C-A | ** | ||||||||
21347438-C-A | 19185552-C-A | ** | ||||||||
21391685-G-T | 19229799-G-T | ** | ||||||||
21553111-C-A | 19391225-C-A | ** | ||||||||
21603954-T-G | 19442068-T-G | ** | ||||||||
21603963-G-A | 19442077-G-A | ** | ||||||||
21625322-C-A | 19463436-C-A | ** | ||||||||
21665660-C-A | 19503774-C-A | ** | ||||||||
21790914-G-A | 19629028-G-A | ** | ||||||||
21823030-G-A | 19661144-G-A | ** | ||||||||
21853699-A-ATAT | 19691813-A-ATAT | ** | ||||||||
21899738-C-A | 19737852-C-A | ** | ||||||||
21959243-ACCTT-A | 19797357-ACCTT-A | ** | ||||||||
21994034-C-A | 19832148-C-A | ** | ||||||||
21994041-T-A | 19832155-T-A | ** | ||||||||
22132328-A-C | 19970442-A-C | ** | ||||||||
22191789-C-A | 20029903-C-A | ** | ||||||||
22194054-C-A | 20032168-C-A | ** | ||||||||
22238862-G-T | 20076976-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
22253059-C-A | 20091173-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22423233-C-A | 20261347-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22472212-G-T | 20310326-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
22520788-CAAAAA-C | 20358902-CAAAAA-C | 23×A | ** | |||||||
22615130-C-A | 20453244-C-A | ** | ||||||||
22629852-G-T | 20467966-G-T | ** | ||||||||
22693841-C-T | 20531955-C-T | ** | ||||||||
22739714-C-T | 20577828-C-T | ** | ||||||||
22774703-TA-T | 20612817-TA-T | ** | ||||||||
22868593-C-A | 20706707-C-A | ** | ||||||||
22884977-C-A | 20723091-C-A | ** | ||||||||
22962002-G-T | 20800116-G-T | ** | ||||||||
22962005-G-GT | 20800119-G-GT | ** | ||||||||
22963363-C-A | 20801477-C-A | ** | ||||||||
22963698-C-A | 20801812-C-A | ** | ||||||||
22995373-A-T | 20833487-A-T | ** | ||||||||
22997433-C-A | 20835547-C-A | ** | ||||||||
23036880-G-A | 20874994-G-A | ** | ||||||||
23039464-C-A | 20877578-C-A | ** | ||||||||
23045370-C-A | 20883484-C-A | ** | ||||||||
23065077-C-A | 20903191-C-A | ** | ||||||||
23097420-TG-T | 20935534-TG-T | ** | ||||||||
23190262-C-A | 21028376-C-A | ** | ||||||||
23241980-TTTAC-T | 21080094-TTTAC-T | ** | ||||||||
23255891-C-A | 21094005-C-A | ** | ||||||||
23419101-C-G | 21257215-C-G | F26048 | ** | |||||||
23425338-C-A | 21263452-C-A | ** | ||||||||
23439888-C-A | 21278002-C-A | ** | ||||||||
23480495-GA-G | 21318609-GA-G | ** | ||||||||
23528945-C-A | 21367059-C-A | ** | ||||||||
23723610-C-T | 21561724-C-T | ** | ||||||||
23723612-T-C | 21561726-T-C | ** | ||||||||
23754868-C-A | 21592982-C-A | ** | ||||||||
23792353-C-T | 21630467-C-T | ** | ||||||||
23831291-C-T | 21669405-C-T | ** | ||||||||
23875595-C-A | 21713709-C-A | ** | ||||||||
21754491-G-T | ** | |||||||||
24518505-C-A | 22372358-C-A | ** | ||||||||
24530868-G-C | 22384721-G-C | P3_t2 | ** | |||||||
24530891-T-C | 22384744-T-C | P3_t2 | ** | |||||||
24595385-AC-T | 22449238-AC-T | P3_t2 | ** | |||||||
25088285-C-A | 22942138-C-A | g1 | ** | |||||||
25940188-T-G | 23794041-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26066361-T-TA | 23920214-T-TA | P1_Y1 | ** | |||||||
26248077-G-T | 24101930-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26376484-T-G | 24230337-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
27883596-T-A | 25737449-T-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28369639-C-A | 26223492-C-A | P1_gr2 | ** | |||||||
28479147-G-A | 26333000-G-A | ** | ||||||||
28500257-A-G | 26354110-A-G | ** | ||||||||
28505256-C-A | 26359109-C-A | ** | ||||||||
28520719-C-A | 26374572-C-A | ** | ||||||||
28589583-C-A | 26443436-C-A | ** | ||||||||
28610175-T-C | 26464028-T-C | ** | ||||||||
28640580-C-A | 26494433-C-A | ** | ||||||||
28645805-C-A | 26499658-C-A | ** | ||||||||
28707338-A-G | 26561191-A-G | ** | ||||||||
28760243-C-A | 26614096-C-A | ** | ||||||||
28767804-G-T | 26621657-G-T | ** | ||||||||
28767818-C-A | 26621671-C-A | ** | ||||||||
28797717-A-G | 26651570-A-G | ** | ||||||||
28797766-A-C | 26651619-A-C | ** | ||||||||
56829909-G-T | ** | |||||||||
56830670-C-A | ** | |||||||||
56849196-T-C | ** | |||||||||
56857939-C-T | ** | |||||||||
15120-T-C | ** | |||||||||
18492480-GAAAA-G | 16380600-GAAAA-G | P6_Dst | 17×A | ** | ||||||
13455741-T-C | 11300065-T-C | ** | ||||||||
13455726-T-A | 11300050-T-A | ** | ||||||||
4764721-TTATA-T | 4896680-TTATA-T | 9×TA | ** | |||||||
22099821-A-G | 19937935-A-G | ** | ||||||||
4211139-A-G | 4343098-A-G | ** | ||||||||
4414719-A-G | 4546678-A-G | ** | ||||||||
5466146-T-C | 5598105-T-C | ** | ||||||||
6523081-T-C | 6655040-T-C | ** | ||||||||
9429691-AAG-A | 9592082-AAG-A | ** | ||||||||
9713200-T-C | 9875591-T-C | IR3_Prx | ** | |||||||
9768066-A-G | 9930457-A-G | ** | ||||||||
9924999-A-G | 10087390-A-G | ** | ||||||||
15921285-C-A | 13809405-C-A | ** | ||||||||
16381498-A-G | 14269618-A-G | ** | ||||||||
18022295-A-G | 15910415-A-G | ** | ||||||||
18231605-C-T | 16119725-C-T | ** | ||||||||
18738748-T-C | 16626868-T-C | ** | ||||||||
22099819-A-C | 19937933-A-C | ** | ||||||||
22099826-C-T | 19937940-C-T | ** | ||||||||
22547793-C-T | 20385907-C-T | ** | ||||||||
23455285-G-C | 21293399-G-C | ** | ||||||||
23718010-A-T | 21556124-A-T | ** | ||||||||
27997644-A-AAG | 25851497-A-AAG | P1_Y2 | ** | |||||||
28076499-CT-C | 25930352-CT-C | P1_Y2 | ** | |||||||
56707230-A-T | ** | |||||||||
58972934-C-A | 56826787-C-A | *** | ||||||||
22483441-G-A | 20321555-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
20128497-G-A | 18016617-G-A | P5_Dst | *** | *** | ||||||
15226371-T-A | 13114457-T-A | Z16219 | *** | |||||||
15226377-G-A | 13114463-G-A | A2246 | *** | |||||||
15226381-T-C | 13114467-T-C | BY22850 | *** | |||||||
15226390-C-T | 13114476-C-T | YP1053 Z16220 | *** | |||||||
15226395-T-A | 13114481-T-A | Z16221 YP1480 | *** | |||||||
58972996-T-G | 56826849-T-G | F14106 | *** | |||||||
13859996-AATGGG-A | 11739290-AATGGG-A | *** | ||||||||
13486792-G-T | 11331116-G-T | *** | ||||||||
13706152-T-G | 11550476-T-G | *** | ||||||||
58979925-C-A | 56833778-C-A | *** | ||||||||
58979954-G-T | 56833807-G-T | *** | ||||||||
16049950-A-C | 13938070-A-C | PF4723 CTS5169 | *** | *** | ||||||
58981213-C-A | 56835066-C-A | *** | ||||||||
8452192-CAAA-C | 8584151-CAAA-C | 15×A | *** | |||||||
13447100-TA-T,TC | 11291424-TA-T,TC | *** | ||||||||
8274571-CTT-C | 8406530-CTT-C | 12×T | *** | *** | ||||||
14831738-G-T | 12719805-G-T | *** | ||||||||
2757656-C-A | 2889615-C-A | *** | ||||||||
7415610-C-A | 7547569-C-A | *** | ||||||||
15060901-C-A | 12948993-C-A | *** | ||||||||
25036091-G-A | 22889944-G-A | g1 | *** | |||||||
58979951-T-A | 56833804-T-A | *** | ||||||||
58979959-C-T | 56833812-C-T | *** | ||||||||
56841819-T-A | *** | |||||||||
10887974-C-T | *** | |||||||||
15070614-C-A | 12958705-C-A | 20×A | *** | |||||||
13457797-A-T | 11302121-A-T | *** | ||||||||
13692126-A-G | 11536450-A-G | *** | ||||||||
10887984-T-A | *** | |||||||||
11676761-G-C | *** | |||||||||
18717846-T-A | 16605966-T-A | *** | ||||||||
2762705-CTTTT-C | 2894664-CTTTT-C | 16×T | *** | |||||||
10797942-CTCTTT-C,CTAGAT | *** | |||||||||
10999873-C-G | *** | |||||||||
9836888-GTTTT-G | 9999279-GTTTT-G | 20×T | *** | |||||||
11014482-C-T | *** | |||||||||
7970879-A-T | 8102838-A-T | *** | ||||||||
8154134-CTTTT-C,CTTTTT | 8286093-CTTTT-C,CTTTTT | 16×T | *** | |||||||
15749401-C-A | 13637521-C-A | *** | ||||||||
14771667-G-T | 12659736-G-T | *** | ||||||||
8479417-TC-C,TT | 8611376-TC-C,TT | *** | ||||||||
16188169-C-T | 14076289-C-T | *** | ||||||||
10887972-C-G | *** | |||||||||
10887982-C-G | *** | |||||||||
10888005-C-A | *** | |||||||||
10648074-T-A | *** | |||||||||
4567310-T-A | 4699269-T-A | *** | ||||||||
2708171-G-T | 2840130-G-T | *** | ||||||||
3961103-C-A | 4093062-C-A | *** | ||||||||
7169795-G-T | 7301754-G-T | *** | ||||||||
8379265-C-A | 8511224-C-A | *** | ||||||||
8479430-C-T | 8611389-C-T | *** | ||||||||
9029790-C-A | 9192181-C-A | FT350712 | *** | |||||||
9070180-CAT-C | 9232571-CAT-C | *** | ||||||||
9104377-C-A | 9266768-C-A | *** | ||||||||
9765452-C-A | 9927843-C-A | *** | ||||||||
9773671-C-A | 9936062-C-A | *** | ||||||||
9857351-C-A | 10019742-C-A | *** | ||||||||
10682553-A-C | *** | |||||||||
10686451-C-A | *** | |||||||||
10686635-C-A | *** | |||||||||
10694060-C-A | *** | |||||||||
10801701-CCA-C,CCT | *** | |||||||||
10884721-C-A | *** | |||||||||
10888251-C-A | *** | |||||||||
10888297-C-G | *** | |||||||||
11003738-CACT-C | *** | |||||||||
11018879-T-G | *** | |||||||||
11018881-A-C | *** | |||||||||
11018892-C-T | *** | |||||||||
11018898-T-A | *** | |||||||||
13457791-C-CAATGT | 11302115-C-CAATGT | *** | ||||||||
13459494-C-A | 11303818-C-A | *** | ||||||||
13473697-G-C | 11318021-G-C | *** | ||||||||
14453701-T-A | 12332974-T-A | *** | ||||||||
14586372-C-A | 12474572-C-A | *** | ||||||||
15947950-TC-T,TT | 13836070-TC-T,TT | *** | ||||||||
16045866-G-T | 13933986-G-T | *** | ||||||||
16188165-C-T | 14076285-C-T | *** | ||||||||
16562722-C-A | 14450842-C-A | *** | ||||||||
16703300-G-T | 14591420-G-T | FT347085 | *** | |||||||
16904631-T-A | 14792751-T-A | *** | ||||||||
17110414-C-A | 14998534-C-A | *** | ||||||||
17277459-C-A | 15165579-C-A | *** | ||||||||
17283373-G-A | 15171493-G-A | *** | ||||||||
17323600-G-A | 15211720-G-A | *** | ||||||||
17323612-G-GA | 15211732-G-GA | *** | ||||||||
17533849-T-A | 15421969-T-A | *** | ||||||||
19162126-C-A | 17050246-C-A | *** | ||||||||
19271338-C-A | 17159458-C-A | *** | ||||||||
21137725-C-A | 18975839-C-A | *** | ||||||||
21316754-C-A | 19154868-C-A | *** | ||||||||
22228173-G-T | 20066287-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
23036962-C-A | 20875076-C-A | *** | ||||||||
23076194-T-C | 20914308-T-C | *** | ||||||||
23983580-T-A | 21837433-T-A | *** | ||||||||
24446568-T-C | 22300421-T-C | *** | ||||||||
28535755-G-T | 26389608-G-T | *** | ||||||||
56860396-C-A | *** | |||||||||
8293857-C-CA | 8425816-C-CA | 8×A | *** | |||||||
8843536-ATTTTT-A,ATTT | 8975495-ATTTTT-A,ATTT | 23×T | *** | |||||||
7084547-G-A | 7216506-G-A | *** | ||||||||
22099828-G-T | 19937942-G-T | *** | ||||||||
6149963-G-A | 6281922-G-A | BY47484 | IR3_Dst | *** | ||||||
6149964-T-C | 6281923-T-C | IR3_Dst | *** | |||||||
13476642-C-T | 11320966-C-T | *** | ||||||||
7084539-A-G | 7216498-A-G | *** | ||||||||
10648078-A-T | *** | |||||||||
4028769-AT-A | 4160728-AT-A | 9×T | *** | |||||||
13476676-A-T | 11321000-A-T | *** | ||||||||
3269903-A-G | 3401862-A-G | *** | ||||||||
3588209-A-G | 3720168-A-G | *** | ||||||||
4254827-A-T | 4386786-A-T | *** | ||||||||
4522219-C-T | 4654178-C-T | *** | ||||||||
5251484-A-G | 5383443-A-G | *** | ||||||||
5350037-CTTT-C,CTT | 5481996-CTTT-C,CTT | 21×T | *** | |||||||
5388261-TAAAAA-T | 5520220-TAAAAA-T | 18×A | *** | |||||||
6345338-T-C | 6477297-T-C | *** | ||||||||
7053346-T-C | 7185305-T-C | *** | ||||||||
8505584-A-AT,ATT | 8637543-A-AT,ATT | 14×T | *** | |||||||
13302962-CAAA-C,CAA | 11147286-CAAA-C,CAA | 17×A | *** | |||||||
13340940-C-T | 11185264-C-T | *** | ||||||||
13476682-C-T | 11321006-C-T | *** | ||||||||
14826548-GTTT-G,GTT | 12714615-GTTT-G,GTT | 19×T | *** | |||||||
15179234-T-A | 13067320-T-A | *** | ||||||||
15215766-T-C | 13103852-T-C | *** | ||||||||
17147963-T-A | 15036083-T-A | *** | ||||||||
18185097-A-G | 16073217-A-G | *** | ||||||||
18268620-T-C | 16156740-T-C | *** | ||||||||
19546480-A-G | 17434600-A-G | *** | ||||||||
21238409-C-A | 19076523-C-A | *** | ||||||||
22275601-T-C | 20113715-T-C | DYZ19 | *** | |||||||
24095900-T-C | 21949753-T-C | P3_b1 | *** | |||||||
28595419-C-CCT | 26449272-C-CCT | *** | ||||||||
28747705-ATTTTTTT-A,ATTTTTT | 26601558-ATTTTTTT-A,ATTTTTT | 27×T | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.