Cummings
FTDNA: N112614, BigY2: N112614, BigY3: N112614Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA N112614 | BigY2 N112614 | BigY3 N112614 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
4359437-T-C | 4491396-T-C | A+ | ||||||||
22286287-G-T | 20124401-G-T | DYZ19 | *** | A* | ||||||
28817723-C-T | 26671576-C-T | A* | ||||||||
9493671-C-A | 9656062-C-A | BY79888 | ** | + | + | |||||
19157695-A-T | 17045815-A-T | Y74772 | Y | Y | + | + | + | |||
19236664-A-G | 17124784-A-G | Y74940 | Y | Y | + | + | + | |||
22507755-G-A | 20345869-G-A | BY225401 | DYZ19 | *** | + | |||||
6405244-ATATAT-A | 6537203-ATATAT-A | + | ||||||||
58912903-CTTTGG-C | 56677962-TCCAAA-T | ** | ||||||||
22767315-C-A | 20605429-C-A | ** | ** | |||||||
13216567-C-A | 11060891-C-A | ** | ** | |||||||
13473989-C-T | 11318313-C-T | ** | ||||||||
23505158-C-A | 21343272-C-A | 20×A | ** | |||||||
8130551-C-A | 8262510-C-A | ** | ||||||||
15410626-T-C | 13298746-T-C | ** | ||||||||
23098809-T-A | 20936923-T-A | ** | ||||||||
26376477-T-A | 24230330-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
4511156-T-C | 4643115-T-C | ** | ||||||||
24283332-T-A | 22137185-T-A | P3_t1 | 27×A | ** | ||||||
20252755-C-A | 18090869-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
22446524-G-A | 20284638-G-A | DYZ19 | *** | ** | ||||||
16450461-G-A | 14338581-G-A | ** | ||||||||
18767457-G-A | 16655577-G-A | ** | ||||||||
21852574-C-A | 19690688-C-A | ** | ||||||||
10845678-T-G | ** | |||||||||
8673863-C-A | 8805822-C-A | ** | ||||||||
8807646-C-A | 8939605-C-A | ** | ||||||||
10799432-C-T | ** | |||||||||
10799446-T-A | ** | |||||||||
10934703-T-A | ** | |||||||||
14226512-C-A | 12105806-C-A | ** | ||||||||
15370928-C-A | 13259048-C-A | ** | ||||||||
27872539-CTTT-C | 25726392-CTTT-C | P1_Y2 | 25×T | ** | ||||||
10789830-C-A | ** | |||||||||
10842254-A-C | ** | |||||||||
10842257-G-T | ** | |||||||||
10845693-T-G | ** | |||||||||
10988572-T-C | ** | |||||||||
6795262-C-A | 6927221-C-A | ** | ||||||||
13573610-AT-A | 11417934-AT-A | 11×T | ** | |||||||
14743820-C-A | 12631889-C-A | ** | ||||||||
26228736-C-T | 24082589-C-T | P1_Y1 | ** | |||||||
18723138-C-A | 16611258-C-A | ** | ||||||||
10661270-T-A | ** | |||||||||
16612636-C-CTT | 14500756-C-CTT | 15×T | ** | |||||||
27733694-G-A | 25587547-G-A | P1_Y2 | ** | |||||||
18730950-C-A | 16619070-C-A | ** | ||||||||
10848711-G-T | ** | |||||||||
10889635-C-A | ** | |||||||||
22855060-G-T | 20693174-G-T | ** | ||||||||
20019186-T-C | 17907306-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
56677982-T-A | ** | |||||||||
10983956-A-C | ** | |||||||||
10983965-C-G | ** | |||||||||
10983966-A-G | ** | |||||||||
10983980-CA-C | ** | |||||||||
10925421-C-A | ** | |||||||||
9655524-C-A | 9817915-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
4932095-G-T | 5064054-G-T | ** | ||||||||
8314298-G-A | 8446257-G-A | ** | ||||||||
8314301-C-T | 8446260-C-T | ** | ||||||||
10688070-C-T | ** | |||||||||
22881463-C-A | 20719577-C-A | ** | ||||||||
3648589-C-A | 3780548-C-A | ** | ||||||||
10988603-T-A | ** | |||||||||
2981201-G-T | 3113160-G-T | ** | ||||||||
5426571-C-T | 5558530-C-T | ** | ||||||||
13586038-C-A | 11430362-C-A | ** | ||||||||
5698937-G-T | 5830896-G-T | ** | ||||||||
17865431-G-A | 15753551-G-A | ** | ||||||||
3272757-C-A | 3404716-C-A | ** | ||||||||
10909690-G-A | FT436253 | ** | ||||||||
15177490-C-A | 13065576-C-A | ** | ||||||||
8735679-C-A | 8867638-C-A | ** | ||||||||
6092280-C-A | 6224239-C-A | ** | ||||||||
13611887-A-T | 11456211-A-T | ** | ||||||||
10754976-C-T | ** | |||||||||
6827879-C-A | 6959838-C-A | ** | ||||||||
16688264-C-A | 14576384-C-A | ** | ||||||||
17277374-C-A | 15165494-C-A | ** | ||||||||
10885308-G-T | ** | |||||||||
7371791-C-A | 7503750-C-A | ** | ||||||||
8314275-C-T | 8446234-C-T | ** | ||||||||
8290823-C-A | 8422782-C-A | ** | ||||||||
10811431-A-C | ** | |||||||||
16612654-G-A | 14500774-G-A | ** | ||||||||
9993539-C-A | 10155930-C-A | ** | ||||||||
19330357-T-A | 17218477-T-A | ** | ||||||||
27971712-C-A | 25825565-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
16309059-C-A | 14197179-C-A | ** | ||||||||
28370165-A-C | 26224018-A-C | P1_gr2 | ** | |||||||
11015870-T-TTCCAC | ** | |||||||||
6454533-C-A | 6586492-C-A | ** | ||||||||
8749123-C-A | 8881082-C-A | ** | ||||||||
13860649-C-A | 11739943-C-A | DYZ17 | ** | |||||||
7371863-C-A | 7503822-C-A | ** | ||||||||
16612656-G-A | 14500776-G-A | ** | ||||||||
2701366-A-G | 2833325-A-G | ** | ||||||||
2772773-C-A | 2904732-C-A | ** | ||||||||
2845200-C-A | 2977159-C-A | ** | ||||||||
2885730-A-G | 3017689-A-G | FT35615 | ** | |||||||
2945810-C-A | 3077769-C-A | ** | ||||||||
2948462-A-G | 3080421-A-G | ** | ||||||||
2948889-C-A | 3080848-C-A | ** | ||||||||
3116151-A-T | 3248110-A-T | ** | ||||||||
3212590-G-T | 3344549-G-T | ** | ||||||||
3249104-C-A | 3381063-C-A | ** | ||||||||
3282108-G-T | 3414067-G-T | ** | ||||||||
3625064-G-T | 3757023-G-T | ** | ||||||||
3728611-ATG-A | 3860570-ATG-A | ** | ||||||||
3739626-A-T | 3871585-A-T | ** | ||||||||
3777528-C-A | 3909487-C-A | ** | ||||||||
3804757-AAAAAT-A | 3936716-AAAAAT-A | ** | ||||||||
3811856-C-A | 3943815-C-A | ** | ||||||||
3930636-C-T | 4062595-C-T | ** | ||||||||
4103084-A-G | 4235043-A-G | ** | ||||||||
4123599-T-C | 4255558-T-C | ** | ||||||||
4137526-C-A | 4269485-C-A | ** | ||||||||
4240318-C-A | 4372277-C-A | ** | ||||||||
4317018-G-T | 4448977-G-T | ** | ||||||||
4341150-A-T | 4473109-A-T | ** | ||||||||
4365767-G-C | 4497726-G-C | ** | ||||||||
4505250-A-C | 4637209-A-C | ** | ||||||||
4511145-C-A | 4643104-C-A | ** | ||||||||
4516375-A-T | 4648334-A-T | ** | ||||||||
4519340-G-T | 4651299-G-T | ** | ||||||||
4611381-C-A | 4743340-C-A | ** | ||||||||
4641711-C-A | 4773670-C-A | ** | ||||||||
4735909-G-T | 4867868-G-T | ** | ||||||||
4902065-C-T | 5034024-C-T | ** | ||||||||
4926156-G-T | 5058115-G-T | ** | ||||||||
4958769-C-A | 5090728-C-A | ** | ||||||||
4960544-C-A | 5092503-C-A | ** | ||||||||
4970057-G-T | 5102016-G-T | ** | ||||||||
4996064-C-A | 5128023-C-A | ** | ||||||||
5022001-T-G | 5153960-T-G | ** | ||||||||
5075963-C-A | 5207922-C-A | ** | ||||||||
5083141-G-T | 5215100-G-T | ** | ||||||||
5127011-C-A | 5258970-C-A | ** | ||||||||
5138261-C-A | 5270220-C-A | ** | ||||||||
5162747-T-C | 5294706-T-C | ** | ||||||||
5220549-GT-G | 5352508-GT-G | ** | ||||||||
5221055-T-C | 5353014-T-C | ** | ||||||||
5241264-C-A | 5373223-C-A | ** | ||||||||
5241330-C-A | 5373289-C-A | ** | ||||||||
5356937-C-A | 5488896-C-A | ** | ||||||||
5356976-C-G | 5488935-C-G | ** | ||||||||
5357102-T-C | 5489061-T-C | ** | ||||||||
5366647-T-A | 5498606-T-A | ** | ||||||||
5452145-C-A | 5584104-C-A | ** | ||||||||
5523738-C-A | 5655697-C-A | ** | ||||||||
5606688-C-T | 5738647-C-T | FT39714 | ** | |||||||
5666893-A-G | 5798852-A-G | ** | ||||||||
5698912-G-T | 5830871-G-T | ** | ||||||||
5891216-A-T | 6023175-A-T | ** | ||||||||
5891220-G-T | 6023179-G-T | ** | ||||||||
5897700-C-A | 6029659-C-A | ** | ||||||||
5911242-A-C | 6043201-A-C | ** | ||||||||
6013180-G-T | 6145139-G-T | ** | ||||||||
6027517-G-T | 6159476-G-T | ** | ||||||||
6096375-G-C | 6228334-G-C | FT12402 | ** | |||||||
6244486-C-CAA | 6376445-C-CAA | IR3_Dst | ** | |||||||
6277751-C-CCA | 6409710-C-CCA | IR3_Dst | ** | |||||||
6277760-G-A | 6409719-G-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6287253-T-A | 6419212-T-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6341179-C-A | 6473138-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6368078-T-C | 6500037-T-C | ** | ||||||||
6374161-C-A | 6506120-C-A | ** | ||||||||
6374198-C-A | 6506157-C-A | ** | ||||||||
6580393-C-A | 6712352-C-A | ** | ||||||||
6664445-C-G | 6796404-C-G | ** | ||||||||
6687114-G-A | 6819073-G-A | ** | ||||||||
6714251-C-A | 6846210-C-A | Y60854 | ** | |||||||
6977051-C-A | 7109010-C-A | ** | ||||||||
7000799-AT-A | 7132758-AT-A | 9×T | ** | |||||||
7021862-A-G | 7153821-A-G | ** | ||||||||
7084376-G-C | 7216335-G-C | ** | ||||||||
7093792-G-A | 7225751-G-A | ** | ||||||||
7098101-CA-C | 7230060-CA-C | ** | ||||||||
7123631-C-A | 7255590-C-A | ** | ||||||||
7142256-C-A | 7274215-C-A | ** | ||||||||
7167649-C-A | 7299608-C-A | ** | ||||||||
7170676-C-A | 7302635-C-A | ** | ||||||||
7243739-C-A | 7375698-C-A | ** | ||||||||
7256136-G-T | 7388095-G-T | ** | ||||||||
7256143-A-C | 7388102-A-C | ** | ||||||||
7274943-A-G | 7406902-A-G | ** | ||||||||
7286991-C-A | 7418950-C-A | ** | ||||||||
7294693-G-GAT | 7426652-G-GAT | ** | ||||||||
7300846-C-A | 7432805-C-A | ** | ||||||||
7411447-T-A | 7543406-T-A | ** | ||||||||
7420798-C-A | 7552757-C-A | ** | ||||||||
7621933-C-A | 7753892-C-A | ** | ||||||||
7708810-C-A | 7840769-C-A | ** | ||||||||
7939282-A-T | 8071241-A-T | ** | ||||||||
8080665-C-A | 8212624-C-A | ** | ||||||||
8253626-C-A | 8385585-C-A | ** | ||||||||
8288783-C-A | 8420742-C-A | ** | ||||||||
8314222-G-A | 8446181-G-A | ** | ||||||||
8314270-AG-A | 8446229-AG-A | ** | ||||||||
8314273-C-G | 8446232-C-G | ** | ||||||||
8314278-G-GA | 8446237-G-GA | ** | ||||||||
8314283-G-A | 8446242-G-A | ** | ||||||||
8314300-C-T | 8446259-C-T | ** | ||||||||
8556242-C-A | 8688201-C-A | F17228 | ** | |||||||
8669702-C-A | 8801661-C-A | ** | ||||||||
8690292-T-C | 8822251-T-C | ** | ||||||||
8854303-C-A | 8986262-C-A | ** | ||||||||
8908081-C-A | 9040040-C-A | ** | ||||||||
9030285-C-A | 9192676-C-A | ** | ||||||||
9030318-CA-C | 9192709-CA-C | ** | ||||||||
9040743-C-A | 9203134-C-A | ** | ||||||||
9076075-A-G | 9238466-A-G | ** | ||||||||
9116963-C-A | 9279354-C-A | ** | ||||||||
9502540-G-T | 9664931-G-T | ** | ||||||||
9700750-C-T | 9863141-C-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9823976-G-A | 9986367-G-A | ** | ||||||||
9885458-AGACTAAG-A | 10047849-AGACTAAG-A | ** | ||||||||
9961330-T-C | 10123721-T-C | ** | ||||||||
10005890-A-G | 10168281-A-G | ** | ||||||||
10012776-C-A | 10175167-C-A | ** | ||||||||
10015023-T-A | 10177414-T-A | ** | ||||||||
10040163-C-A | 10202554-C-A | ** | ||||||||
10647916-C-A | ** | |||||||||
10661293-AC-A | ** | |||||||||
10661297-C-CA | ** | |||||||||
10669327-C-T | ** | |||||||||
10677361-C-CACTAA | ** | |||||||||
10677484-C-A | ** | |||||||||
10682703-C-A | ** | |||||||||
10691530-C-A | ** | |||||||||
10692160-C-A | ** | |||||||||
10693906-T-A | ** | |||||||||
10748027-A-AT | ** | |||||||||
10748031-CA-C | ** | |||||||||
10754915-G-C | ** | |||||||||
10754925-T-C | ** | |||||||||
10754932-C-CAT | ** | |||||||||
10754935-TCC-T | ** | |||||||||
10754949-T-A | ** | |||||||||
10754987-C-T | ** | |||||||||
10755631-C-A | FT429800 | ** | ||||||||
10755843-C-A | ** | |||||||||
10760352-C-CCTT | ** | |||||||||
10775246-C-A | ** | |||||||||
10781575-C-A | ** | |||||||||
10783495-G-T | ** | |||||||||
10788665-C-A | ** | |||||||||
10793407-G-C | ** | |||||||||
10799449-A-T | ** | |||||||||
10799477-C-A | ** | |||||||||
10799968-C-A | ** | |||||||||
10822568-G-A | ** | |||||||||
10824291-GCATT-G | ** | |||||||||
10834610-C-T | ** | |||||||||
10842420-T-G | ** | |||||||||
10844720-T-C | ** | |||||||||
10844769-A-C | ** | |||||||||
10845676-C-G | ** | |||||||||
10866291-C-A | ** | |||||||||
10866407-C-A | ** | |||||||||
10869835-A-G | ** | |||||||||
10873242-C-A | ** | |||||||||
10873277-C-A | ** | |||||||||
10878904-C-A | ** | |||||||||
10899331-G-T | ** | |||||||||
10900005-C-A | ** | |||||||||
10900741-A-G | ** | |||||||||
10909642-ACTGAGCACTC-A | ** | |||||||||
10909654-C-G | ** | |||||||||
10909677-T-C | ** | |||||||||
10918233-G-T | ** | |||||||||
10933135-C-A | ** | |||||||||
10934714-T-TG | ** | |||||||||
10940064-C-A | ** | |||||||||
10940079-C-A | ** | |||||||||
10943093-A-C | ** | |||||||||
10943171-C-A | ** | |||||||||
10964763-A-T | ** | |||||||||
10973932-C-T | ** | |||||||||
10973940-C-T | ** | |||||||||
10973951-T-G | ** | |||||||||
10983915-C-T | ** | |||||||||
10983935-C-T | ** | |||||||||
10987944-C-A | ** | |||||||||
10988501-A-T | ** | |||||||||
10988504-C-A | ** | |||||||||
10988522-C-A | ** | |||||||||
10988527-C-A | ** | |||||||||
10988555-C-A | ** | |||||||||
10988563-T-A | ** | |||||||||
10988584-CTATTC-T | ** | |||||||||
10992340-C-G | ** | |||||||||
10999146-C-A | ** | |||||||||
11009588-T-A | ** | |||||||||
11012047-C-A | ** | |||||||||
11017458-C-G | ** | |||||||||
11033535-T-C | ** | |||||||||
13196697-C-A | 11041021-C-A | ** | ||||||||
13197961-A-G | 11042285-A-G | ** | ||||||||
13225752-C-T | 11070076-C-T | ** | ||||||||
13225765-A-G | 11070089-A-G | ** | ||||||||
13225771-G-C | 11070095-G-C | ** | ||||||||
13225772-T-C | 11070096-T-C | FT252939 | ** | |||||||
13226347-C-A | 11070671-C-A | ** | ||||||||
13242499-G-T | 11086823-G-T | ** | ||||||||
13304180-G-C | 11148504-G-C | ** | ||||||||
13308344-C-A | 11152668-C-A | ** | ||||||||
13309838-C-A | 11154162-C-A | ** | ||||||||
13310645-T-A | 11154969-T-A | ** | ||||||||
13466405-A-C | 11310729-A-C | ** | ||||||||
13491703-C-T | 11336027-C-T | ** | ||||||||
13493585-T-A | 11337909-T-A | ** | ||||||||
13523457-A-C | 11367781-A-C | ** | ||||||||
13550844-C-T | 11395168-C-T | ** | ||||||||
13597384-G-T | 11441708-G-T | ** | ||||||||
13601072-A-G | 11445396-A-G | ** | ||||||||
13611861-TA-T | 11456185-TA-T | ** | ||||||||
13611873-A-G | 11456197-A-G | ** | ||||||||
13710384-A-G | 11554708-A-G | DYZ17 | ** | |||||||
11656648-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11664775-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11667542-C-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11668379-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11673721-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11676342-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
13805176-G-T | 11684470-G-T | DYZ17 | ** | |||||||
13884270-C-A | 11763564-C-A | ** | ||||||||
13902745-G-T | 11782039-G-T | ** | ||||||||
13934258-A-T | 11813552-A-T | ** | ||||||||
13935210-T-C | 11814504-T-C | ** | ||||||||
13937338-T-G | 11816632-T-G | ** | ||||||||
13973239-C-A | 11852533-C-A | ** | ||||||||
14016059-G-T | 11895353-G-T | ** | ||||||||
14025536-G-T | 11904830-G-T | ** | ||||||||
14043894-C-A | 11923188-C-A | ** | ||||||||
14047623-A-G | 11926917-A-G | ** | ||||||||
14065638-C-A | 11944932-C-A | ** | ||||||||
14077971-C-A | 11957265-C-A | ** | ||||||||
14124114-C-A | 12003408-C-A | ** | ||||||||
14142434-T-G | 12021728-T-G | ** | ||||||||
14198402-T-C | 12077696-T-C | ** | ||||||||
14281103-C-A | 12160397-C-A | ** | ||||||||
14297285-C-A | 12176579-C-A | ** | ||||||||
14307978-T-C | 12187272-T-C | ** | ||||||||
14348021-C-A | 12227316-C-A | ** | ||||||||
14352145-C-A | 12231440-C-A | ** | ||||||||
14352803-C-A | 12232098-C-A | ** | ||||||||
14354512-T-A | 12233807-T-A | ** | ||||||||
14354584-C-A | 12233879-C-A | ** | ||||||||
14364135-G-T | 12243430-G-T | ** | ||||||||
14366709-G-T | 12246004-G-T | ** | ||||||||
14397819-C-A | 12277115-C-A | ** | ||||||||
14404917-C-A | 12284214-C-A | ** | ||||||||
14485489-C-A | 12364758-C-A | ** | ||||||||
14492660-G-C | 12380857-G-C | ** | ||||||||
14493534-C-A | 12381731-C-A | ** | ||||||||
14502484-C-A | 12390689-C-A | ** | ||||||||
14509444-C-T | 12397649-C-T | ** | ||||||||
14582328-G-A | 12470528-G-A | ** | ||||||||
14585679-G-T | 12473879-G-T | ** | ||||||||
14645008-C-A | 12533077-C-A | ** | ||||||||
14660390-G-T | 12548455-G-T | ** | ||||||||
14717667-G-T | 12605735-G-T | ** | ||||||||
14911749-C-A | 12799816-C-A | ** | ||||||||
14977331-T-C | 12865406-T-C | ** | ||||||||
15092696-G-T | 12980785-G-T | ** | ||||||||
15305716-T-A | 13193815-T-A | ** | ||||||||
15374540-C-A | 13262660-C-A | ** | ||||||||
15410500-G-C | 13298620-G-C | ** | ||||||||
15422891-C-A | 13311011-C-A | FTB63512 | ** | |||||||
15504041-G-A | 13392161-G-A | ** | ||||||||
15604611-C-A | 13492731-C-A | ** | ||||||||
15616680-G-C | 13504800-G-C | ** | ||||||||
15616686-G-A | 13504806-G-A | ** | ||||||||
15616689-G-T | 13504809-G-T | ** | ||||||||
15743890-G-T | 13632010-G-T | ** | ||||||||
15770125-A-G | 13658245-A-G | ** | ||||||||
15774303-G-T | 13662423-G-T | ** | ||||||||
15918472-T-C | 13806592-T-C | ** | ||||||||
15957736-C-A | 13845856-C-A | ** | ||||||||
15971203-T-A | 13859323-T-A | ** | ||||||||
15988181-C-A | 13876301-C-A | ** | ||||||||
16044296-C-A | 13932416-C-A | ** | ||||||||
16049041-C-A | 13937161-C-A | ** | ||||||||
16070095-C-A | 13958215-C-A | ** | ||||||||
16077529-C-T | 13965649-C-T | FT290671 | ** | |||||||
16077543-C-G | 13965663-C-G | 36×A | ** | |||||||
16091142-G-T | 13979262-G-T | ** | ||||||||
16095776-C-A | 13983896-C-A | ** | ||||||||
16180981-C-A | 14069101-C-A | ** | ||||||||
16318170-A-G | 14206290-A-G | ** | ||||||||
16413617-A-C | 14301737-A-C | ** | ||||||||
16437499-C-G | 14325619-C-G | ** | ||||||||
16551073-C-A | 14439193-C-A | ** | ||||||||
16619080-G-T | 14507200-G-T | ** | ||||||||
16656124-C-A | 14544244-C-A | ** | ||||||||
16823837-C-T | 14711957-C-T | ** | ||||||||
16938610-A-T | 14826730-A-T | ** | ||||||||
16980022-C-A | 14868142-C-A | ** | ||||||||
16987004-C-T | 14875124-C-T | ** | ||||||||
17042752-G-T | 14930872-G-T | ** | ||||||||
17097859-C-A | 14985979-C-A | ** | ||||||||
17118506-C-A | 15006626-C-A | ** | ||||||||
17158997-GAC-G | 15047117-GAC-G | ** | ||||||||
17187404-C-A | 15075524-C-A | ** | ||||||||
17306341-C-A | 15194461-C-A | ** | ||||||||
17306746-A-C | 15194866-A-C | ** | ||||||||
17375779-A-G | 15263899-A-G | ** | ||||||||
17375795-G-T | 15263915-G-T | ** | ||||||||
17402441-G-T | 15290561-G-T | ** | ||||||||
17428252-T-C | 15316372-T-C | ** | ||||||||
17462023-C-A | 15350143-C-A | ** | ||||||||
17462089-C-A | 15350209-C-A | ** | ||||||||
17480111-C-A | 15368231-C-A | ** | ||||||||
17605495-C-A | 15493615-C-A | ** | ||||||||
17633709-C-A | 15521829-C-A | ** | ||||||||
17713850-CTTTTTTTT-C | 15601970-CTTTTTTTT-C | 23×T | ** | |||||||
17770319-A-G | 15658439-A-G | ** | ||||||||
17786121-G-C | 15674241-G-C | ** | ||||||||
17885909-A-G | 15774029-A-G | ** | ||||||||
17900650-C-A | 15788770-C-A | ** | ||||||||
17912993-T-G | 15801113-T-G | ** | ||||||||
17929078-C-A | 15817198-C-A | ** | ||||||||
17929080-A-C | 15817200-A-C | ** | ||||||||
17950825-AATATATATATATATATATATATAT-A | 15838945-AATATATATATATATATATATATAT-A | 27×AT | ** | |||||||
18280256-A-C | 16168376-A-C | P6_Prx | ** | |||||||
18389194-C-A | 16277314-C-A | P6_Gap | ** | |||||||
18480370-C-A | 16368490-C-A | P6_Dst | ** | |||||||
18650714-C-A | 16538834-C-A | ** | ||||||||
18687527-G-A | 16575647-G-A | ** | ||||||||
18730966-C-A | 16619086-C-A | ** | ||||||||
18735209-A-G | 16623329-A-G | ** | ||||||||
18767452-A-G | 16655572-A-G | ** | ||||||||
18767458-C-T | 16655578-C-T | ** | ||||||||
18796423-G-T | 16684543-G-T | ** | ||||||||
18951280-C-A | 16839400-C-A | ** | ||||||||
18982628-T-G | 16870748-T-G | ** | ||||||||
19202880-T-G | 17091000-T-G | ** | ||||||||
19202887-A-G | 17091007-A-G | ** | ||||||||
19246989-C-A | 17135109-C-A | ** | ||||||||
19258892-C-A | 17147012-C-A | ** | ||||||||
19379445-G-T | 17267565-G-T | ** | ||||||||
19528439-C-A | 17416559-C-A | ** | ||||||||
19592313-T-C | 17480433-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
19746093-C-A | 17634213-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19829280-G-A | 17717400-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
19829300-T-TA | 17717420-T-TA | P5_Prx | ** | |||||||
19885199-C-T | 17773319-C-T | P5_Prx | ** | |||||||
19885209-G-T | 17773329-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19979174-A-AAG | 17867294-A-AAG | P5_Prx | ** | |||||||
20001345-G-T | 17889465-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
20137179-TA-T | 18025299-TA-T | P5_Dst | ** | |||||||
20242512-A-C | 18080626-A-C | P5_Dst | ** | |||||||
20377716-T-A | 18215830-T-A | P5_Dst | ** | |||||||
21012167-G-T | 18850281-G-T | P4_Dst | ** | |||||||
21056232-C-T | 18894346-C-T | ** | ||||||||
21107602-C-A | 18945716-C-A | ** | ||||||||
21123478-A-C | 18961592-A-C | ** | ||||||||
21135075-G-A | 18973189-G-A | ** | ||||||||
21279911-C-A | 19118025-C-A | ** | ||||||||
21279938-G-T | 19118052-G-T | ** | ||||||||
21279969-T-G | 19118083-T-G | ** | ||||||||
21280037-A-C | 19118151-A-C | ** | ||||||||
21371655-C-A | 19209769-C-A | ** | ||||||||
21534832-G-T | 19372946-G-T | ** | ||||||||
21920600-C-A | 19758714-C-A | ** | ||||||||
21954469-C-A | 19792583-C-A | ** | ||||||||
21975341-C-A | 19813455-C-A | ** | ||||||||
21985190-C-A | 19823304-C-A | ** | ||||||||
22088785-C-A | 19926899-C-A | ** | ||||||||
22100828-A-C | 19938942-A-C | ** | ||||||||
22100825-CAA-C | 19938939-CAA-C | 8×A | ** | |||||||
22100852-G-T | 19938966-G-T | ** | ||||||||
22100856-G-A | 19938970-G-A | ** | ||||||||
22100886-A-G | 19939000-A-G | ** | ||||||||
22155657-C-A | 19993771-C-A | ** | ||||||||
22489642-C-A | 20327756-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22505916-C-A | 20344030-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22537262-C-A | 20375376-C-A | ** | ||||||||
22546218-CT-C | 20384332-CT-C | ** | ||||||||
22579444-G-C | 20417558-G-C | ** | ||||||||
22579445-C-T | 20417559-C-T | ** | ||||||||
22614252-T-A | 20452366-T-A | ** | ||||||||
22880687-C-G | 20718801-C-G | ** | ||||||||
23009343-C-A | 20847457-C-A | ** | ||||||||
23026699-T-C | 20864813-T-C | ** | ||||||||
23188596-C-A | 21026710-C-A | ** | ||||||||
23340070-C-A | 21178184-C-A | ** | ||||||||
23357597-C-A | 21195711-C-A | ** | ||||||||
23357713-G-C | 21195827-G-C | ** | ||||||||
23377509-G-A | 21215623-G-A | ** | ||||||||
23377804-C-A | 21215918-C-A | ** | ||||||||
23465500-C-A | 21303614-C-A | ** | ||||||||
23505142-G-A | 21343256-G-A | ** | ||||||||
23505156-C-T | 21343270-C-T | ** | ||||||||
23569109-G-T | 21407223-G-T | ** | ||||||||
23801733-CAAAAAAA-C | 21639847-CAAAAAAA-C | 31×A | ** | |||||||
23817948-G-T | 21656062-G-T | ** | ||||||||
23875584-C-A | 21713698-C-A | ** | ||||||||
23961257-C-A | 21815110-C-A | ** | ||||||||
24013891-G-T | 21867744-G-T | ** | ||||||||
24407483-GC-G | 22261336-GC-G | ** | ||||||||
24409297-G-T | 22263150-G-T | ** | ||||||||
24475222-C-A | 22329075-C-A | ** | ||||||||
24634148-T-C | 22488001-T-C | P3_t2 | ** | |||||||
24905137-T-G | 22758990-T-G | g1 | ** | |||||||
25246477-T-TG | 23100330-T-TG | P2_r1 | ** | |||||||
25964728-T-TA | 23818581-T-TA | P1_Y1 | ** | |||||||
26014774-T-C | 23868627-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26120126-C-A | 23973979-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26248228-C-A | 24102081-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26249055-T-A | 24102908-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26428136-T-TA | 24281989-T-TA | P1_Y1 | ** | |||||||
26563900-G-T | 24417753-G-T | P1_g2 | ** | |||||||
26834611-G-T | 24688464-G-T | P1_g2 | ** | |||||||
27562009-G-T | 25415862-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
28432612-G-C | 26286465-G-C | P1_gr2 | ** | |||||||
28500343-A-G | 26354196-A-G | ** | ||||||||
28507322-C-A | 26361175-C-A | ** | ||||||||
28516665-C-A | 26370518-C-A | ** | ||||||||
28542999-C-A | 26396852-C-A | ** | ||||||||
28591126-C-A | 26444979-C-A | ** | ||||||||
28623285-G-A | 26477138-G-A | ** | ||||||||
28633136-C-A | 26486989-C-A | ** | ||||||||
28644428-C-A | 26498281-C-A | ** | ||||||||
28659680-G-C | 26513533-G-C | ** | ||||||||
28665443-G-T | 26519296-G-T | ** | ||||||||
28712428-G-T | 26566281-G-T | ** | ||||||||
28762729-C-A | 26616582-C-A | ** | ||||||||
28762752-TGCTA-T | 26616605-TGCTA-T | ** | ||||||||
56677977-T-C | ** | |||||||||
56836471-C-A | ** | |||||||||
56838631-G-T | ** | |||||||||
56844397-A-C | ** | |||||||||
56844512-T-C | ** | |||||||||
56844578-G-T | ** | |||||||||
56844633-G-T | ** | |||||||||
56850665-T-A | ** | |||||||||
56879708-C-A | ** | |||||||||
24828-A-T | ** | |||||||||
24853-A-T | ** | |||||||||
4427785-G-A | 4559744-G-A | ** | ||||||||
6324410-C-A | 6456369-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
13365896-G-C | 11210220-G-C | ** | ||||||||
13485700-G-C | 11330024-G-C | ** | ||||||||
18647928-C-T | 16536048-C-T | FT37429 | ** | |||||||
19683427-A-C | 17571547-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
19698806-T-C | 17586926-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
26525757-A-T | 24379610-A-T | P1_Y1 | ** | |||||||
4769547-C-A | 4901506-C-A | PR4356 | *** | *** | ||||||
58975562-G-A | 56829415-G-A | *** | ||||||||
17355768-C-A | 15243888-C-A | *** | ||||||||
58982153-C-A | 56836006-C-A | *** | ||||||||
13927768-A-G | 11807062-A-G | *** | ||||||||
13467395-T-C | 11311719-T-C | *** | ||||||||
22261845-C-T | 20099959-C-T | DYZ19 | *** | |||||||
22369024-G-A | 20207138-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
58982166-A-T | 56836019-A-T | *** | ||||||||
58982174-G-C | 56836027-G-C | *** | ||||||||
58982215-T-G | 56836068-T-G | *** | ||||||||
58982244-A-G | 56836097-A-G | *** | ||||||||
7254433-C-A | 7386392-C-A | *** | ||||||||
21553403-CTTTTTT-C | 19391517-CTTTTTT-C | 31×T | *** | |||||||
22739706-G-A | 20577820-G-A | *** | ||||||||
10657381-A-G | *** | |||||||||
14607680-G-T | 12495882-G-T | *** | ||||||||
16904584-T-A | 14792704-T-A | *** | ||||||||
10987866-C-A | *** | |||||||||
13472158-C-A,T | 11316482-C-A,T | *** | ||||||||
21211537-C-A | 19049651-C-A | *** | ||||||||
14607763-G-T | 12495965-G-T | *** | ||||||||
18742404-CA-C | 16630524-CA-C | 38×A | *** | |||||||
14036156-C-CT | 11915450-C-CT | *** | ||||||||
14036161-TC-T | 11915455-TC-T | *** | ||||||||
16041986-C-A | 13930106-C-A | *** | ||||||||
3620792-C-A | 3752751-C-A | *** | ||||||||
4470407-C-A | 4602366-C-A | *** | ||||||||
5957153-C-A | 6089112-C-A | *** | ||||||||
6459924-T-C | 6591883-T-C | *** | ||||||||
6918262-C-A | 7050221-C-A | *** | ||||||||
7020480-G-A | 7152439-G-A | *** | ||||||||
7044037-C-A | 7175996-C-A | *** | ||||||||
7338263-A-G | 7470222-A-G | *** | ||||||||
10658496-TCCA-T,TCCC | *** | |||||||||
10658501-TCA-T | *** | |||||||||
10841965-A-T | *** | |||||||||
10847077-C-A | *** | |||||||||
10921132-A-T | *** | |||||||||
10956554-C-A | *** | |||||||||
13196354-C-A | 11040678-C-A | *** | ||||||||
13202550-C-G | 11046874-C-G | *** | ||||||||
13225982-C-A | 11070306-C-A | *** | ||||||||
14421956-A-G | 12301231-A-G | *** | ||||||||
14658296-A-T | 12546361-A-T | *** | ||||||||
14910792-A-C,T | 12798859-A-C,T | *** | ||||||||
14985947-C-A | 12874015-C-A | *** | ||||||||
15320617-G-T | 13208723-G-T | *** | ||||||||
15741835-A-G | 13629955-A-G | *** | ||||||||
16621424-C-A | 14509544-C-A | FTB66762 | *** | |||||||
18092957-TGA-T | 15981077-TGA-T | *** | ||||||||
18242136-C-A | 16130256-C-A | *** | ||||||||
19037871-C-A | 16925991-C-A | *** | ||||||||
19309440-TA-T | 17197560-TA-T | *** | ||||||||
19415667-C-A | 17303787-C-A | *** | ||||||||
19486859-CTTTTTT-C | 17374979-CTTTTTT-C | 16×T | *** | |||||||
21623840-AG-A | 19461954-AG-A | *** | ||||||||
21953267-G-GTA | 19791381-G-GTA | *** | ||||||||
22611349-T-C | 20449463-T-C | *** | ||||||||
23062157-C-A | 20900271-C-A | *** | ||||||||
23293639-TG-T | 21131753-TG-T | *** | ||||||||
23742009-G-T | 21580123-G-T | *** | ||||||||
24003085-C-A | 21856938-C-A | *** | ||||||||
24052517-G-T | 21906370-G-T | P3_b1 | *** | |||||||
24472548-T-C | 22326401-T-C | *** | ||||||||
25201058-A-G | 23054911-A-G | g1 | *** | |||||||
28565989-C-A | 26419842-C-A | *** | ||||||||
28665344-C-A | 26519197-C-A | *** | ||||||||
28743107-G-T | 26596960-G-T | *** | ||||||||
56837492-G-A | *** | |||||||||
56839534-T-A | *** | |||||||||
56861658-G-T | *** | |||||||||
5231890-CTTT-C,CTT | 5363849-CTTT-C,CTT | 22×T | *** | |||||||
3606672-GT-G,GTT | 3738631-GT-G,GTT | 19×T | *** | |||||||
7199342-CTTTTTTTT-C | 7331301-CTTTTTTTT-C | 24×T | *** | |||||||
13518450-T-C | 11362774-T-C | *** | ||||||||
17485845-A-G | 15373965-A-G | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.