Kane
FTDNA: 417060, BigY3: 417060, BigY2: 417060Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 417060 | BigY3 417060 | BigY2 417060 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
13843982-A-T | 11723276-A-T | A* | ||||||||
20674376-T-C | 18512490-T-C | P4_Prx | *** | A* | ||||||
20473648-A-G | 18311762-A-G | P5_Dst | A* | |||||||
10754939-T-C | A* | |||||||||
20432328-A-G | 18270442-A-G | P5_Dst | A* | |||||||
27847931-G-GT | 25701784-G-GT | P1_Y2 | 11×T | A* | ||||||
13843984-G-C | 11723278-G-C | A* | ||||||||
56832671-T-C | A* | |||||||||
3717199-AGT-A | 3849158-AGT-A | + | + | + | ||||||
3434578-C-A | 3566537-C-A | FT112859 | + | |||||||
2964311-A-G | 3096270-A-G | FT94874 | + | |||||||
13678010-A-T | 11522334-A-T | A11542 | + | + | + | |||||
7703305-G-T | 7835264-G-T | A11540 | Y | Y | + | + | + | |||
8861860-C-T | 8993819-C-T | A11541 | Y | Y | + | + | + | |||
13811250-A-C | 11690544-A-C | BY90243 | *** | + | + | |||||
15020922-T-C | 12909011-T-C | A11543 | Y | Y | + | + | + | |||
16631771-T-G | 14519891-T-G | A11544 | Y | Y | + | + | + | |||
18769984-AATT-A | 16658104-AATT-A | + | + | |||||||
10937531-G-A | + | ** | ||||||||
6656005-C-T | 6787964-C-T | A11539 | Y | Y | + | + | + | |||
14435836-G-A | 12315109-G-A | S1251 | S1252 | Y | ** | + | + | |||
14435840-T-C | 12315113-T-C | S1251 | S1253 | Y | ** | + | + | |||
14435843-A-G | 12315116-A-G | S1251 | S1254 | Y | ** | + | + | |||
14435848-T-A | 12315121-T-A | S1255 | Y | + | + | + | ||||
14435833-C-T | 12315106-C-T | S1251 | S1251 | Y | ** | + | + | |||
17777263-C-A | 15665383-C-A | FT118099 | Y | + | ||||||
14467766-A-G | 12347035-A-G | FT116695 | Y | Y | + | ** | ||||
22303350-C-T | 20141464-C-T | DYZ19 | *** | *** | * | |||||
13453890-TTCCAA-T,TTCCAT | 11298214-TTCCAA-T,TTCCAT | * | * | |||||||
19047817-C-CGTGTGT | 16935937-C-CGTGTGT | 16×GT | * | |||||||
13684797-AAATGG-A | 11529121-AAATGG-A | 9×AATGG | *** | * | * | |||||
14239729-C-A | 12119023-C-A | ** | ||||||||
14525152-G-T | 12413353-G-T | ** | ||||||||
14527478-T-C | 12415679-T-C | ** | ||||||||
14065485-C-A | 11944779-C-A | ** | ||||||||
14488630-C-A | 12367899-C-A | ** | ||||||||
14430545-TG-T | 12309818-TG-T | ** | ||||||||
14080169-G-C | 11959463-G-C | ** | ||||||||
14284154-T-G | 12163448-T-G | ** | ||||||||
14174739-A-C | 12054033-A-C | ** | ||||||||
14174745-C-A | 12054039-C-A | ** | ||||||||
14263266-C-A | 12142560-C-A | ** | ||||||||
14181165-G-T | 12060459-G-T | ** | ||||||||
14228897-A-G | 12108191-A-G | ** | ||||||||
14035094-G-T | 11914388-G-T | Z30122 | ** | |||||||
26243523-G-A | 24097376-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
13963454-G-T | 11842748-G-T | ** | ||||||||
11671898-G-T | ** | |||||||||
13563380-C-A | 11407704-C-A | ** | ||||||||
13584248-C-A | 11428572-C-A | ** | ||||||||
13623461-T-A | 11467785-T-A | ** | ||||||||
13625154-G-T | 11469478-G-T | ** | ||||||||
13726108-T-G | 11570432-T-G | ** | ||||||||
13728586-A-C | 11572910-A-C | ** | ||||||||
11666549-A-G | ** | |||||||||
13854684-A-C | 11733978-A-C | ** | ||||||||
13957205-G-T | 11836499-G-T | ** | ||||||||
13856114-A-G | 11735408-A-G | ** | ||||||||
13878854-C-T | 11758148-C-T | ** | ||||||||
13890928-T-G | 11770222-T-G | ** | ||||||||
13894361-C-A | 11773655-C-A | ** | ||||||||
13900227-G-A | 11779521-G-A | ** | ||||||||
13909104-G-C | 11788398-G-C | ** | ||||||||
14605330-A-C | 12493532-A-C | ** | ||||||||
14539629-G-T | 12427830-G-T | ** | ||||||||
15157268-C-A | 13045355-C-A | ** | ||||||||
14605342-C-T | 12493544-C-T | ** | ||||||||
16060535-C-A | 13948655-C-A | ** | ||||||||
15735690-G-A | 13623810-G-A | ** | ||||||||
15753200-A-T | 13641320-A-T | ** | ||||||||
15773427-A-C | 13661547-A-C | ** | ||||||||
15921930-T-C | 13810050-T-C | ** | ||||||||
15971315-A-T | 13859435-A-T | ** | ||||||||
16035652-A-T | 13923772-A-T | ** | ||||||||
16062397-C-A | 13950517-C-A | ** | ||||||||
15641773-T-A | 13529893-T-A | ** | ||||||||
16119021-G-T | 14007141-G-T | P8_Prx | ** | |||||||
16241547-T-A | 14129667-T-A | ** | ||||||||
16489958-A-C | 14378078-A-C | ** | ||||||||
16612613-T-G | 14500733-T-G | ** | ||||||||
16636596-C-A | 14524716-C-A | ** | ||||||||
16668003-A-G | 14556123-A-G | ** | ||||||||
16668049-A-T | 14556169-A-T | ** | ||||||||
15648838-C-A | 13536958-C-A | ** | ||||||||
15542175-A-G | 13430295-A-G | ** | ||||||||
14608132-T-A | 12496334-T-A | ** | ||||||||
14909609-G-T | 12797676-G-T | ** | ||||||||
14681177-A-G | 12569243-A-G | ** | ||||||||
14690095-T-C | 12578161-T-C | ** | ||||||||
14714821-C-A | 12602888-C-A | ** | ||||||||
14718550-G-T | 12606618-G-T | ** | ||||||||
14778909-A-T | 12666979-A-T | ** | ||||||||
14785000-G-A | 12673070-G-A | ** | ||||||||
14793096-C-A | 12681167-C-A | ** | ||||||||
15047498-C-A | 12935589-C-A | ** | ||||||||
15542040-A-G | 13430160-A-G | ** | ||||||||
15080609-C-A | 12968699-C-A | ** | ||||||||
15147451-G-T | 13035538-G-T | ** | ||||||||
13485633-C-T | 11329957-C-T | ** | ||||||||
15276563-C-A | 13164652-C-A | ** | ||||||||
15332347-C-A | 13220465-C-A | ** | ||||||||
15342603-T-A | 13230722-T-A | ** | ||||||||
15532543-C-A | 13420663-C-A | ** | ||||||||
13526508-A-G | 11370832-A-G | ** | ||||||||
11027792-C-A | ** | |||||||||
13478588-G-A | 11322912-G-A | ** | ||||||||
10877858-C-A | ** | |||||||||
10827996-A-G | ** | |||||||||
10843850-T-C | ** | |||||||||
10844764-C-T | FT227843 | ** | ||||||||
10844769-A-T | ** | |||||||||
10848129-C-T | ** | |||||||||
10877497-C-A | ** | |||||||||
10880255-TC-T | ** | |||||||||
10826886-T-C | ** | |||||||||
10880258-G-C | ** | |||||||||
10880259-A-AT | ** | |||||||||
10880264-T-A | ** | |||||||||
10887510-G-T | ** | |||||||||
10894331-C-G | ** | |||||||||
10925738-C-A | ** | |||||||||
10933714-C-A | ** | |||||||||
10827987-C-G | ** | |||||||||
10826870-A-T | ** | |||||||||
10938558-G-T | ** | |||||||||
10759917-T-C | ** | |||||||||
10750007-A-T | ** | |||||||||
10759836-AT-A | ** | |||||||||
10759852-T-A | ** | |||||||||
10759857-A-ATCAAT | ** | |||||||||
10759880-C-CTTTCG | ** | |||||||||
10759912-T-C | ** | |||||||||
10764192-C-A | ** | |||||||||
10823557-A-G | ** | |||||||||
10764491-A-AT | ** | |||||||||
10780239-GA-G | ** | |||||||||
10786696-C-A | ** | |||||||||
10793236-A-G | ** | |||||||||
10793271-A-G | ** | |||||||||
10794577-A-T | ** | |||||||||
10823544-C-G | ** | |||||||||
10938472-C-A | ** | |||||||||
10943612-A-C | ** | |||||||||
13468999-A-T | 11313323-A-T | ** | ||||||||
13213517-A-T | 11057841-A-T | ** | ||||||||
11027071-C-G | ** | |||||||||
11027787-C-A | ** | |||||||||
16980150-G-T | 14868270-G-T | ** | ||||||||
11031337-A-T | ** | |||||||||
11033086-C-G | ** | |||||||||
13200417-C-A | 11044741-C-A | ** | ||||||||
13242893-T-C | 11087217-T-C | ** | ||||||||
11027019-C-CACTAA | ** | |||||||||
13255530-G-T | 11099854-G-T | ** | ||||||||
13289488-T-G | 11133812-T-G | ** | ||||||||
13290442-A-G | 11134766-A-G | ** | ||||||||
13319063-T-A | 11163387-T-A | ** | ||||||||
13327798-C-A | 11172122-C-A | ** | ||||||||
13331003-T-G | 11175327-T-G | ** | ||||||||
13468994-C-T | 11313318-C-T | ** | ||||||||
11027029-C-A | ** | |||||||||
11027011-T-C | ** | |||||||||
10951371-C-A | ** | |||||||||
10961418-T-A | ** | |||||||||
10953592-C-A | ** | |||||||||
10953629-C-A | ** | |||||||||
10954612-A-G | ** | |||||||||
10955045-C-A | ** | |||||||||
10959394-C-A | ** | |||||||||
10961369-T-G | ** | |||||||||
10961379-C-A | ** | |||||||||
10963851-G-T | ** | |||||||||
11026991-CTCCAATAAAG-C | ** | |||||||||
10964486-C-T | ** | |||||||||
10964695-T-A | ** | |||||||||
10974327-C-A | ** | |||||||||
10987611-C-A | ** | |||||||||
10999649-C-A | ** | |||||||||
11017709-C-A | ** | |||||||||
11026976-G-T | ** | |||||||||
16688302-T-A | 14576422-T-A | ** | ||||||||
18007228-G-A | 15895348-G-A | P7_Gap | ** | |||||||
17095494-G-T | 14983614-G-T | ** | ||||||||
24069745-G-T | 21923598-G-T | P3_b1 | ** | |||||||
23623309-A-C | 21461423-A-C | ** | ||||||||
23788217-T-C | 21626331-T-C | ** | ||||||||
23837628-T-C | 21675742-T-C | ** | ||||||||
23953128-T-C | 21806981-T-C | ** | ||||||||
23954159-C-G | 21808012-C-G | ** | ||||||||
24047419-G-T | 21901272-G-T | ** | ||||||||
24302272-C-A | 22156125-C-A | P3_t1 | ** | |||||||
23401067-C-T | 21239181-C-T | ** | ||||||||
24673293-C-A | 22527146-C-A | P3_b2 | ** | |||||||
24878868-A-C | 22732721-A-C | g1 | ** | |||||||
24878874-A-C | 22732727-A-C | g1 | ** | |||||||
25530761-C-A | 23384614-C-A | P1_gr1 | ** | |||||||
25850563-G-A | 23704416-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
25970604-G-C | 23824457-G-C | P1_Y1 | ** | |||||||
25970619-G-T | 23824472-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
23505106-C-A | 21343220-C-A | ** | ||||||||
23339568-C-G | 21177682-C-G | ** | ||||||||
27462044-G-T | 25315897-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
22800961-C-A | 20639075-C-A | ** | ||||||||
22172599-G-A | 20010713-G-A | ** | ||||||||
22188814-G-T | 20026928-G-T | ** | ||||||||
22273564-T-C | 20111678-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22542282-T-C | 20380396-T-C | ** | ||||||||
22765648-C-T | 20603762-C-T | ** | ||||||||
22781692-T-A | 20619806-T-A | ** | ||||||||
22869654-A-G | 20707768-A-G | ** | ||||||||
23291283-T-G | 21129397-T-G | ** | ||||||||
23009183-C-A | 20847297-C-A | ** | ||||||||
23009236-C-T | 20847350-C-T | ** | ||||||||
23050338-G-T | 20888452-G-T | ** | ||||||||
23082111-C-A | 20920225-C-A | ** | ||||||||
23120129-A-T | 20958243-A-T | ** | ||||||||
23126569-C-A | 20964683-C-A | ** | ||||||||
23186074-C-G | 21024188-C-G | ** | ||||||||
26205958-G-T | 24059811-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
27603717-C-A | 25457570-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
22134202-C-A | 19972316-C-A | ** | ||||||||
19714504-T-TAG | 17602624-T-TAG | P5_Prx | ** | |||||||
6182853-A-C | 6314812-A-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6214655-T-C | 6346614-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
8807321-G-A | 8939280-G-A | ** | ||||||||
8901228-A-G | 9033187-A-G | ** | ||||||||
16380239-G-A | 14268359-G-A | ** | ||||||||
17788303-A-G | 15676423-A-G | ** | ||||||||
20793116-T-C | 18631230-T-C | P4_Prx | ** | |||||||
24689914-T-A | 22543767-T-A | P3_b2 | ** | |||||||
24265301-G-T | 22119154-G-T | P3_b1 | ** | |||||||
24300787-G-T | 22154640-G-T | P3_t1 | ** | |||||||
24388548-T-G | 22242401-T-G | ** | ||||||||
24388549-C-G | 22242402-C-G | ** | ||||||||
24388554-A-G | 22242407-A-G | ** | ||||||||
24417025-AG-A | 22270878-AG-A | ** | ||||||||
26243504-A-G | 24097357-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
4422066-G-T | 4554025-G-T | ** | ||||||||
56850089-G-T | ** | |||||||||
27967255-T-G | 25821108-T-G | P1_Y2 | ** | |||||||
28550236-G-T | 26404089-G-T | ** | ||||||||
28483729-A-G | 26337582-A-G | ** | ||||||||
28485840-T-A | 26339693-T-A | ** | ||||||||
28485872-A-T | 26339725-A-T | ** | ||||||||
28486708-A-G | 26340561-A-G | ** | ||||||||
28505450-G-A | 26359303-G-A | ** | ||||||||
28518948-T-G | 26372801-T-G | ** | ||||||||
28532995-C-T | 26386848-C-T | ** | ||||||||
28630536-T-G | 26484389-T-G | ** | ||||||||
56848323-C-G | ** | |||||||||
28632969-A-T | 26486822-A-T | ** | ||||||||
28678999-A-G | 26532852-A-G | ** | ||||||||
28687058-A-G | 26540911-A-G | ** | ||||||||
28763864-C-A | 26617717-C-A | ** | ||||||||
56724869-G-T | ** | |||||||||
56833204-T-C | ** | |||||||||
56833205-C-A | ** | |||||||||
22134432-A-G | 19972546-A-G | ** | ||||||||
22097157-G-A | 19935271-G-A | ** | ||||||||
17221556-C-G | 15109676-C-G | ** | ||||||||
18735705-GA-G | 16623825-GA-G | ** | ||||||||
18491520-T-A | 16379640-T-A | P6_Dst | ** | |||||||
18577855-C-A | 16465975-C-A | ** | ||||||||
18577862-C-A | 16465982-C-A | ** | ||||||||
18630929-A-G | 16519049-A-G | ** | ||||||||
18703289-C-G | 16591409-C-G | ** | ||||||||
18728711-T-A | 16616831-T-A | ** | ||||||||
18849383-T-G | 16737503-T-G | ** | ||||||||
18412106-T-G | 16300226-T-G | P6_Gap | ** | |||||||
18906528-G-T | 16794648-G-T | ** | ||||||||
18926859-C-A | 16814979-C-A | ** | ||||||||
18963905-A-C | 16852025-A-C | ** | ||||||||
19012565-G-T | 16900685-G-T | ** | ||||||||
19031521-G-T | 16919641-G-T | ** | ||||||||
19031529-T-G | 16919649-T-G | ** | ||||||||
19145737-G-T | 17033857-G-T | ** | ||||||||
18412131-G-T | 16300251-G-T | P6_Gap | ** | |||||||
18263713-C-A | 16151833-C-A | ** | ||||||||
19301208-A-G | 17189328-A-G | ** | ||||||||
17551695-G-T | 15439815-G-T | ** | ||||||||
17224293-C-A | 15112413-C-A | ** | ||||||||
17257646-A-C | 15145766-A-C | ** | ||||||||
17297178-A-T | 15185298-A-T | ** | ||||||||
17374395-C-T | 15262515-C-T | ** | ||||||||
17377776-C-A | 15265896-C-A | ** | ||||||||
17475209-G-T | 15363329-G-T | ** | ||||||||
17685792-C-G | 15573912-C-G | ** | ||||||||
18189743-G-T | 16077863-G-T | ** | ||||||||
17692068-T-G | 15580188-T-G | ** | ||||||||
17735392-A-G | 15623512-A-G | ** | ||||||||
17963996-G-T | 15852116-G-T | ** | ||||||||
18007220-C-G | 15895340-C-G | P7_Gap | ** | |||||||
10691515-C-A | ** | |||||||||
18056996-C-A | 15945116-C-A | ** | ||||||||
18128078-C-A | 16016198-C-A | ** | ||||||||
19253066-G-T | 17141186-G-T | ** | ||||||||
19391227-T-C | 17279347-T-C | ** | ||||||||
21990393-C-G | 19828507-C-G | ** | ||||||||
21375639-C-A | 19213753-C-A | ** | ||||||||
21096201-C-T | 18934315-C-T | ** | ||||||||
21135096-A-T | 18973210-A-T | 8×T | ** | |||||||
21139385-C-A | 18977499-C-A | ** | ||||||||
21297791-T-G | 19135905-T-G | ** | ||||||||
21367650-C-G | 19205764-C-G | ** | ||||||||
21368702-G-T | 19206816-G-T | ** | ||||||||
21476291-C-A | 19314405-C-A | ** | ||||||||
20871657-T-G | 18709771-T-G | P4_Dst | ** | |||||||
21582251-T-G | 19420365-T-G | ** | ||||||||
21669067-T-A | 19507181-T-A | ** | ||||||||
21670246-C-T | 19508360-C-T | ** | ||||||||
21670878-A-C | 19508992-A-C | ** | ||||||||
21677014-C-A | 19515128-C-A | ** | ||||||||
21803699-T-C | 19641813-T-C | ** | ||||||||
21821201-G-T | 19659315-G-T | FT58595 | ** | |||||||
21096198-T-A | 18934312-T-A | ** | ||||||||
20865397-G-T | 18703511-G-T | P4_Dst | ** | |||||||
19391228-G-A | 17279348-G-A | ** | ||||||||
19529215-G-T | 17417335-G-T | ** | ||||||||
19391239-A-G | 17279359-A-G | ** | ||||||||
19391240-T-C | 17279360-T-C | ** | ||||||||
19399857-A-C | 17287977-A-C | ** | ||||||||
19438177-G-A | 17326297-G-A | ** | ||||||||
19510022-C-A | 17398142-C-A | ** | ||||||||
19517318-G-T | 17405438-G-T | ** | ||||||||
19529191-G-T | 17417311-G-T | ** | ||||||||
19529233-C-A | 17417353-C-A | ** | ||||||||
20332226-G-T | 18170340-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
19600639-CATAT-C | 17488759-CATAT-C | P5_Prx | ** | |||||||
19663396-C-A | 17551516-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19718023-A-G | 17606143-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
19839922-T-A | 17728042-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19891175-C-A | 17779295-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19891185-C-A | 17779305-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
20242515-T-G | 18080629-T-G | P5_Dst | ** | |||||||
10749034-T-C | ** | |||||||||
10759158-CTCCTT-C | ** | |||||||||
10664314-T-C | ** | |||||||||
11034574-A-T | ** | |||||||||
11034529-C-T | ** | |||||||||
11034539-T-C | ** | |||||||||
11034544-A-C | ** | |||||||||
11034550-T-C | ** | |||||||||
11034562-A-C | ** | |||||||||
11034566-A-C | ** | |||||||||
11034576-C-G | ** | |||||||||
11034514-C-A | ** | |||||||||
11034580-T-C | ** | |||||||||
11034586-C-T | ** | |||||||||
11034593-G-A | ** | |||||||||
11034596-T-G | ** | |||||||||
11034597-A-G | ** | |||||||||
11034602-A-T | ** | |||||||||
11034521-T-C | ** | |||||||||
7615364-G-A | 7747323-G-A | ** | ||||||||
9442215-C-A | 9604606-C-A | ** | ||||||||
5449194-C-A | 5581153-C-A | ** | ||||||||
3987787-C-A | 4119746-C-A | ** | ||||||||
11020591-C-A | ** | |||||||||
21367690-A-T | 19205804-A-T | 14×T | ** | |||||||
11018927-C-A | ** | |||||||||
2745002-G-T | 2876961-G-T | ** | ||||||||
15332377-C-A | 13220495-C-A | ** | ||||||||
9424592-T-G | 9586983-T-G | ** | ||||||||
28679661-C-A | 26533514-C-A | ** | ||||||||
6646781-C-A | 6778740-C-A | ** | ||||||||
15352885-T-A | 13241004-T-A | ** | ||||||||
22097178-C-A | 19935292-C-A | ** | ||||||||
5887721-C-A | 6019680-C-A | ** | ||||||||
15648786-A-G | 13536906-A-G | ** | ||||||||
18615964-C-A | 16504084-C-A | ** | ||||||||
6901123-C-A | 7033082-C-A | ** | ||||||||
11034621-A-C | ** | |||||||||
28722066-C-A | 26575919-C-A | ** | ||||||||
11005492-C-A | ** | |||||||||
3429401-A-C | 3561360-A-C | ** | ||||||||
3122411-T-G | 3254370-T-G | ** | ||||||||
3130958-C-A | 3262917-C-A | ** | ||||||||
3192037-A-G | 3323996-A-G | ** | ||||||||
3230557-T-G | 3362516-T-G | ** | ||||||||
3366438-G-C | 3498397-G-C | ** | ||||||||
3417167-G-T | 3549126-G-T | ** | ||||||||
3439964-C-T | 3571923-C-T | ** | ||||||||
3047558-G-T | 3179517-G-T | ** | ||||||||
3492659-C-A | 3624618-C-A | ** | ||||||||
3578927-G-T | 3710886-G-T | ** | ||||||||
3591039-A-T | 3722998-A-T | ** | ||||||||
3651469-C-G | 3783428-C-G | ** | ||||||||
3769263-T-C | 3901222-T-C | ** | ||||||||
3812357-G-T | 3944316-G-T | ** | ||||||||
3097331-G-T | 3229290-G-T | ** | ||||||||
3047549-G-T | 3179508-G-T | ** | ||||||||
5612661-C-A | 5744620-C-A | FGC80492 | ** | |||||||
2758416-C-A | 2890375-C-A | ** | ||||||||
17300702-C-A | 15188822-C-A | ** | ||||||||
7081065-C-A | 7213024-C-A | ** | ||||||||
13835222-A-G | 11714516-A-G | ** | ||||||||
2649776-C-G | 2781735-C-G | ** | ||||||||
2698043-C-A | 2830002-C-A | ** | ||||||||
2753808-A-C | 2885767-A-C | ** | ||||||||
2817707-TACAA-T | 2949666-TACAA-T | ** | ||||||||
3033331-T-C | 3165290-T-C | ** | ||||||||
2825324-C-A | 2957283-C-A | ** | ||||||||
2895274-C-A | 3027233-C-A | ** | ||||||||
2909188-T-A | 3041147-T-A | ** | ||||||||
2922864-C-A | 3054823-C-A | ** | ||||||||
10629710-T-C | ** | |||||||||
2999819-A-G | 3131778-A-G | ** | ||||||||
3012926-C-A | 3144885-C-A | ** | ||||||||
16270402-C-A | 14158522-C-A | ** | ||||||||
22097207-C-A | 19935321-C-A | ** | ||||||||
3922632-A-G | 4054591-A-G | ** | ||||||||
56841940-C-A | ** | |||||||||
10880268-C-A | ** | |||||||||
11022973-A-G | ** | |||||||||
16531070-C-A | 14419190-C-A | ** | ||||||||
10961378-C-T | ** | |||||||||
14610468-CCCT-C | 12498670-CCCT-C | ** | ||||||||
56724863-G-A | ** | |||||||||
10880263-G-A | ** | |||||||||
13942598-C-A | 11821892-C-A | ** | ||||||||
28611567-C-A | 26465420-C-A | ** | ||||||||
15403584-CATAAA-C | 13291704-CATAAA-C | 5×ATAAA | ** | |||||||
6512200-G-T | 6644159-G-T | ** | ||||||||
10844765-A-T | ** | |||||||||
13485639-A-C | 11329963-A-C | ** | ||||||||
10664327-C-A | ** | |||||||||
8710002-C-A | 8841961-C-A | ** | ||||||||
7359743-A-AAT | 7491702-A-AAT | 11×AT | ** | |||||||
13486911-C-G | 11331235-C-G | ** | ||||||||
24447211-C-G | 22301064-C-G | ** | ||||||||
28598307-C-T | 26452160-C-T | CTS12503 | ** | |||||||
25883630-CT-C | 23737483-CT-C | P1_Y1 | 17×T | ** | ||||||
9629231-TTG-T | 9791622-TTG-T | IR3_Prx | ** | |||||||
3439435-GT-G | 3571394-GT-G | ** | ||||||||
7898045-A-G | 8030004-A-G | PF3864 | ** | ** | ||||||
14143980-A-C | 12023274-A-C | ** | ||||||||
14384731-C-A | 12264027-C-A | ** | ||||||||
13564454-C-A | 11408778-C-A | ** | ||||||||
5180583-GAT-G | 5312542-GAT-G | ** | ||||||||
15600094-G-T | 13488214-G-T | CTS4346 | ** | ** | ||||||
17064990-G-A | 14953110-G-A | CTS6704 M8145 AM01321 | ** | |||||||
21244078-A-G | 19082192-A-G | FT338990 | ** | |||||||
8556338-A-G | 8688297-A-G | ** | ||||||||
19121920-CTTTTTT-C | 17010040-CTTTTTT-C | 17×T | ** | |||||||
14052814-T-C | 11932108-T-C | ** | ||||||||
11027316-C-A | ** | |||||||||
4416660-C-G | 4548619-C-G | ** | ||||||||
16076048-C-A | 13964168-C-A | ** | ||||||||
23061113-C-A | 20899227-C-A | ** | ||||||||
17604999-C-A | 15493119-C-A | ** | ||||||||
19053457-C-A | 16941577-C-A | ** | ||||||||
15081451-C-A | 12969541-C-A | ** | ||||||||
13975942-C-A | 11855236-C-A | ** | ||||||||
19040754-G-T | 16928874-G-T | ** | ||||||||
10938442-C-A | ** | |||||||||
11658173-GA-G | ** | |||||||||
13554224-C-A | 11398548-C-A | ** | ||||||||
6028386-C-A | 6160345-C-A | ** | ||||||||
10050827-T-C | 10213218-T-C | ** | ||||||||
22124369-C-A | 19962483-C-A | ** | ||||||||
11034623-C-T | ** | |||||||||
13480491-C-A | 11324815-C-A | ** | ||||||||
19926999-G-T | 17815119-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
16739503-C-A | 14627623-C-A | ** | ||||||||
17030605-G-T | 14918725-G-T | ** | ||||||||
4416669-A-G | 4548628-A-G | ** | ||||||||
11034728-C-A | ** | |||||||||
19324249-C-A | 17212369-C-A | ** | ||||||||
15787966-C-A | 13676086-C-A | ** | ||||||||
20364227-T-TC | 18202341-T-TC | P5_Dst | ** | |||||||
9442176-C-A | 9604567-C-A | ** | ||||||||
8911982-G-T | 9043941-G-T | ** | ||||||||
23128537-C-A | 20966651-C-A | ** | ||||||||
10759902-T-C | ** | |||||||||
22798104-T-C | 20636218-T-C | FT82220 | ** | |||||||
14701427-C-A | 12589493-C-A | ** | ||||||||
16410213-C-A | 14298333-C-A | ** | ||||||||
6359637-G-T | 6491596-G-T | ** | ||||||||
14404924-C-A | 12284221-C-A | ** | ||||||||
14331154-TTTGC-T | 12210448-TTTGC-T | ** | ||||||||
5011471-C-A | 5143430-C-A | ** | ||||||||
8296784-C-A | 8428743-C-A | ** | ||||||||
3852290-C-A | 3984249-C-A | ** | ||||||||
2986050-A-G | 3118009-A-G | ** | ||||||||
3965289-T-A | 4097248-T-A | ** | ||||||||
7243580-C-A | 7375539-C-A | ** | ||||||||
7080878-A-T | 7212837-A-T | ** | ||||||||
7105032-T-G | 7236991-T-G | ** | ||||||||
7111860-G-T | 7243819-G-T | ** | ||||||||
7138400-T-C | 7270359-T-C | 11×A | ** | |||||||
7172440-G-T | 7304399-G-T | ** | ||||||||
7217235-C-A | 7349194-C-A | ** | ||||||||
7252379-A-AC | 7384338-A-AC | ** | ||||||||
4002333-C-T | 4134292-C-T | ** | ||||||||
7255371-A-G | 7387330-A-G | ** | ||||||||
7384812-A-G | 7516771-A-G | ** | ||||||||
7384820-G-T | 7516779-G-T | ** | ||||||||
7384844-G-T | 7516803-G-T | ** | ||||||||
7457093-A-C | 7589052-A-C | IR1_L | ** | |||||||
7534499-A-C | 7666458-A-C | ** | ||||||||
7020640-C-A | 7152599-C-A | ** | ||||||||
6984570-T-G | 7116529-T-G | ** | ||||||||
7615215-A-C | 7747174-A-C | ** | ||||||||
6686685-G-T | 6818644-G-T | ** | ||||||||
6541005-GA-G | 6672964-GA-G | ** | ||||||||
6614301-T-G | 6746260-T-G | ** | ||||||||
6619620-C-A | 6751579-C-A | ** | ||||||||
6651579-C-A | 6783538-C-A | ** | ||||||||
6654929-G-T | 6786888-G-T | ** | ||||||||
6664676-C-T | 6796635-C-T | ** | ||||||||
6688707-C-A | 6820666-C-A | ** | ||||||||
6930686-C-A | 7062645-C-A | ** | ||||||||
6690238-C-A | 6822197-C-A | ** | ||||||||
6752118-A-G | 6884077-A-G | ** | ||||||||
6765692-A-C | 6897651-A-C | ** | ||||||||
6787044-G-A | 6919003-G-A | ** | ||||||||
6892527-T-C | 7024486-T-C | ** | ||||||||
6901103-T-A | 7033062-T-A | ** | ||||||||
7615184-A-T | 7747143-A-T | ** | ||||||||
7615342-G-A | 7747301-G-A | ** | ||||||||
6510149-C-G | 6642108-C-G | ** | ||||||||
9839456-G-T | 10001847-G-T | ** | ||||||||
9352953-T-C | 9515344-T-C | ** | ||||||||
9377512-C-A | 9539903-C-A | ** | ||||||||
9403176-G-T | 9565567-G-T | ** | ||||||||
9768775-C-G | 9931166-C-G | ** | ||||||||
9768969-G-T | 9931360-G-T | ** | ||||||||
9825598-C-A | 9987989-C-A | ** | ||||||||
9887690-G-A | 10050081-G-A | ** | ||||||||
9123280-A-T | ** | |||||||||
9926866-T-G | 10089257-T-G | ** | ||||||||
9936502-G-T | 10098893-G-T | ** | ||||||||
9956094-T-G | 10118485-T-G | ** | ||||||||
9986365-G-T | 10148756-G-T | ** | ||||||||
9997859-G-A | 10160250-G-A | ** | ||||||||
10018330-G-A | 10180721-G-A | ** | ||||||||
9116792-G-T | 9279183-G-T | ** | ||||||||
9120541-C-A | ** | |||||||||
7629838-C-T | 7761797-C-T | ** | ||||||||
8153736-G-T | 8285695-G-T | ** | ||||||||
7866110-G-C | 7998069-G-C | ** | ||||||||
7896892-T-C | 8028851-T-C | ** | ||||||||
8056251-C-T | 8188210-C-T | ** | ||||||||
8056255-A-C | 8188214-A-C | ** | ||||||||
8072484-T-A | 8204443-T-A | ** | ||||||||
8075242-A-G | 8207201-A-G | ** | ||||||||
8321733-T-G | 8453692-T-G | ** | ||||||||
8911980-G-C | 9043939-G-C | ** | ||||||||
8321782-T-A | 8453741-T-A | ** | ||||||||
8325433-T-G | 8457392-T-G | ** | ||||||||
8398871-A-G | 8530830-A-G | ** | ||||||||
8731196-G-T | 8863155-G-T | ** | ||||||||
8753780-C-A | 8885739-C-A | ** | ||||||||
8815205-A-C | 8947164-A-C | ** | ||||||||
8856914-G-T | 8988873-G-T | ** | ||||||||
6534450-A-G | 6666409-A-G | ** | ||||||||
7004038-G-T | 7135997-G-T | ** | ||||||||
6478470-C-G | 6610429-C-G | ** | ||||||||
4931065-T-C | 5063024-T-C | ** | ||||||||
4757298-A-G | 4889257-A-G | ** | ||||||||
4757336-C-A | 4889295-C-A | ** | ||||||||
4873820-C-A | 5005779-C-A | ** | ||||||||
4899630-T-C | 5031589-T-C | ** | ||||||||
4902403-G-T | 5034362-G-T | ** | ||||||||
4921006-T-A | 5052965-T-A | ** | ||||||||
5007094-G-T | 5139053-G-T | ** | ||||||||
4677587-G-T | 4809546-G-T | ** | ||||||||
5022034-C-A | 5153993-C-A | ** | ||||||||
5057400-T-C | 5189359-T-C | ** | ||||||||
5080578-G-T | 5212537-G-T | ** | ||||||||
5084685-G-C | 5216644-G-C | ** | ||||||||
5090301-G-T | 5222260-G-T | ** | ||||||||
5184427-A-T | 5316386-A-T | ** | ||||||||
5200832-T-C | 5332791-T-C | ** | ||||||||
4700236-C-A | 4832195-C-A | ** | ||||||||
4671780-C-A | 4803739-C-A | ** | ||||||||
5334275-G-T | 5466234-G-T | ** | ||||||||
4354160-C-A | 4486119-C-A | ** | ||||||||
4068920-G-T | 4200879-G-T | ** | ||||||||
4252909-C-A | 4384868-C-A | ** | ||||||||
4255352-C-A | 4387311-C-A | ** | ||||||||
4271907-G-T | 4403866-G-T | ** | ||||||||
4271912-C-G | 4403871-C-G | ** | ||||||||
4303080-G-C | 4435039-G-C | ** | ||||||||
4387943-C-A | 4519902-C-A | ** | ||||||||
4557739-C-A | 4689698-C-A | ** | ||||||||
4388673-C-G | 4520632-C-G | ** | ||||||||
4408222-G-T | 4540181-G-T | ** | ||||||||
4416661-A-C | 4548620-A-C | ** | ||||||||
4467425-C-A | 4599384-C-A | ** | ||||||||
4511390-T-G | 4643349-T-G | ** | ||||||||
4511400-G-T | 4643359-G-T | ** | ||||||||
4540149-T-C | 4672108-T-C | ** | ||||||||
5243649-C-A | 5375608-C-A | ** | ||||||||
4968999-T-C | 5100958-T-C | ** | ||||||||
5334486-AT-A | 5466445-AT-A | ** | ||||||||
5645292-C-A | 5777251-C-A | ** | ||||||||
5887673-T-A | 6019632-T-A | ** | ||||||||
5887706-T-A | 6019665-T-A | ** | ||||||||
5830295-C-A | 5962254-C-A | ** | ||||||||
5803052-G-T | 5935011-G-T | ** | ||||||||
5803029-G-T | 5934988-G-T | ** | ||||||||
5924837-G-T | 6056796-G-T | ** | ||||||||
5803026-A-G | 5934985-A-G | ** | ||||||||
5800590-C-A | 5932549-C-A | ** | ||||||||
5976360-G-T | 6108319-G-T | ** | ||||||||
5785866-A-C | 5917825-A-C | ** | ||||||||
5658907-G-T | 5790866-G-T | ** | ||||||||
5650599-C-A | 5782558-C-A | ** | ||||||||
6065854-A-G | 6197813-A-G | ** | ||||||||
5873532-C-A | 6005491-C-A | ** | ||||||||
6132555-C-A | 6264514-C-A | ** | ||||||||
5409935-C-T | 5541894-C-T | ** | ||||||||
5587284-A-T | 5719243-A-T | ** | ||||||||
5426404-TTTTGA-T | 5558363-TTTTGA-T | ** | ||||||||
6409766-A-T | 6541725-A-T | ** | ||||||||
5619949-A-G | 5751908-A-G | ** | ||||||||
6177376-T-G | 6309335-T-G | IR3_Dst | ** | |||||||
5577489-A-C | 5709448-A-C | ** | ||||||||
5400278-T-A | 5532237-T-A | ** | ||||||||
3451627-T-C | 3583586-T-C | *** | ||||||||
17272467-TAA-T | 15160587-TAA-T | 13×A | *** | |||||||
24417041-A-G | 22270894-A-G | *** | ||||||||
11030160-A-AA,ACTTCTC | *** | |||||||||
15226371-T-A | 13114457-T-A | Z16219 | *** | |||||||
4769363-C-A | 4901322-C-A | FT247864 | *** | |||||||
9349347-C-T | 9511738-C-T | *** | ||||||||
5387430-CAAAA-C,CAAA | 5519389-CAAAA-C,CAAA | 18×A | *** | |||||||
24417055-A-GG | 22270908-A-GG | *** | ||||||||
13446543-T-C | 11290867-T-C | *** | ||||||||
13446549-C-T | 11290873-C-T | *** | ||||||||
13454647-AATTCC-A | 11298971-AATTCC-A | 4×ATTCC | *** | |||||||
13483953-T-A | 11328277-T-A | *** | ||||||||
10020415-G-T | 10182806-G-T | *** | ||||||||
13467901-C-T | 11312225-C-T | *** | ||||||||
13479145-C-T | 11323469-C-T | *** | ||||||||
11017524-C-A | *** | |||||||||
19345123-T-A | 17233243-T-A | *** | ||||||||
22479049-G-T | 20317163-G-T | BY224152 | DYZ19 | *** | ||||||
13571665-ATTTT-A | 11415989-ATTTT-A | 17×T | *** | |||||||
13498052-G-T | 11342376-G-T | *** | ||||||||
23029397-T-C | 20867511-T-C | *** | ||||||||
28633965-T-TA | 26487818-T-TA | 10×A | *** | |||||||
25313440-G-A | 23167293-G-A | P2_r1 | *** | |||||||
19961233-T-C | 17849353-T-C | P5_Prx | *** | |||||||
17895216-C-A | 15783336-C-A | *** | ||||||||
23306125-C-A | 21144239-C-A | *** | ||||||||
22600783-G-A | 20438897-G-A | *** | ||||||||
23572542-C-A | 21410656-C-A | *** | ||||||||
10911927-C-T | FGC79267 | *** | ||||||||
8901029-G-T | 9032988-G-T | *** | ||||||||
11033838-CTCTGCTCCAT-C,CTCCACTGCAT | *** | |||||||||
10889266-GCCATTCCATTCCATTCCATTCCATT-G,GCCATTCCATTCCATT | *** | |||||||||
22788607-T-C | 20626721-T-C | *** | ||||||||
56832945-C-A,G | *** | |||||||||
13489629-CCACCCA-C,CCATCCCA | 11333953-CCACCCA-C,CCATCCCA | *** | ||||||||
24893257-G-T | 22747110-G-T | g1 | *** | |||||||
17158968-CTTTTT-C | 15047088-CTTTTT-C | 26×T | *** | |||||||
13317699-G-T | 11162023-G-T | *** | ||||||||
22611900-C-T | 20450014-C-T | 11×T | *** | |||||||
13846684-G-A | 11725978-G-A | *** | ||||||||
7269610-CTTTTT-C | 7401569-CTTTTT-C | 22×T | *** | |||||||
14023227-T-A | 11902521-T-A | *** | ||||||||
22226234-G-T | 20064348-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
56848606-A-G | *** | |||||||||
22337012-C-A | 20175126-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
24139327-G-T | 21993180-G-T | P3_b1 | *** | |||||||
24989927-A-T | 22843780-A-T | g1 | *** | |||||||
56833188-T-TTATAC | *** | |||||||||
15682427-C-A | 13570547-C-A | *** | ||||||||
11015916-T-C | *** | |||||||||
10967523-C-A | *** | |||||||||
4703452-C-A | 4835411-C-A | *** | ||||||||
10754907-C-A | *** | |||||||||
10839896-C-T | *** | |||||||||
26415676-CAA-C | 24269529-CAA-C | P1_Y1 | 20×A | *** | ||||||
22949878-C-CTT | 20787992-C-CTT | 23×T | *** | |||||||
14186816-GCA-G | 12066110-GCA-G | 8×CA | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: 417060 | 10810801 | 7843612 | 7925576 |
Kit: 417060 | 9884908 | 8008488 | 7879340 |
Kit: 417060 | 14995829 | 9380281 | 8326711 |
Used in age calculations | 14995829 | 9380281 | 8326711 |
Counts of SNPs | 12 | 6 |
Big Tree Main Page