Cain
FTDNA: 29527, BigY3: 29527, BigY2: 29527Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 29527 | BigY3 29527 | BigY2 29527 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
26359448-C-T | 24213301-C-T | P1_Y1 | A* | |||||||
13489677-C-A | 11334001-C-A | A* | ||||||||
17989585-T-TAC | 15877705-T-TAC | P7_Prx | 9×AC | A* | A* | |||||
58975843-C-T | 56829696-C-T | A* | ||||||||
10626839-A-ATTCCG | A* | |||||||||
18013954-A-ATG | 15902074-A-ATG | P7_Dst | 9×TG | A* | ||||||
13448365-C-T | 11292689-C-T | A* | ||||||||
6452332-G-A | 6584291-G-A | FT93850 | + | |||||||
22442405-G-GA | 20280519-G-GA | DYZ19 | *** | + | + | |||||
7514681-T-C | 7646640-T-C | FGC57037 | Y | + | + | + | ||||
5254482-A-G | 5386441-A-G | FT123515 | + | |||||||
5733379-C-G | 5865338-C-G | FT123618 | + | |||||||
15742485-C-A | 13630605-C-A | FGC57044 | Y | + | ** | |||||
13535727-GTATATA-G,GTA | 11380051-GTATATA-G,GTA | * | ||||||||
7115388-T-C | 7247347-T-C | ** | ||||||||
13709298-A-C | 11553622-A-C | ** | ||||||||
13588269-G-A | 11432593-G-A | ** | ||||||||
13588369-C-T | 11432693-C-T | ** | ||||||||
13611136-G-A | 11455460-G-A | ** | ||||||||
13618356-A-C | 11462680-A-C | ** | ||||||||
13623447-A-G | 11467771-A-G | ** | ||||||||
13709282-A-AATGTT | 11553606-A-AATGTT | ** | ||||||||
11650314-A-G | ** | |||||||||
13726118-A-C | 11570442-A-C | ** | ||||||||
13525747-C-A | 11370071-C-A | ** | ||||||||
11658402-G-T | ** | |||||||||
6752151-A-G | 6884110-A-G | ** | ||||||||
11658403-G-A | ** | |||||||||
11658413-T-C | ** | |||||||||
11658416-T-A | ** | |||||||||
11658422-C-G | ** | |||||||||
13528300-C-A | 11372624-C-A | ** | ||||||||
13411273-C-A | 11255597-C-A | ** | ||||||||
13504181-C-A | 11348505-C-A | ** | ||||||||
11032216-G-T | ** | |||||||||
10975305-CCATTCCATT-C | ** | |||||||||
10975903-G-A | ** | |||||||||
10996557-C-A | ** | |||||||||
11003349-A-T | ** | |||||||||
11003423-A-G | ** | |||||||||
11019074-C-A | ** | |||||||||
11031832-A-G | ** | |||||||||
11032524-C-A | ** | |||||||||
11666781-A-T | ** | |||||||||
11033021-C-T | ** | |||||||||
13207849-A-T | 11052173-A-T | ** | ||||||||
13227157-T-G | 11071481-T-G | ** | ||||||||
13227166-C-T | 11071490-C-T | ** | ||||||||
13234795-CT-C | 11079119-CT-C | ** | ||||||||
13238316-C-A | 11082640-C-A | ** | ||||||||
13238346-T-C | 11082670-T-C | ** | ||||||||
11658432-T-G | ** | |||||||||
11671452-A-T | ** | |||||||||
10964681-C-A | ** | |||||||||
15111358-C-T | 12999445-C-T | ** | ||||||||
6729054-C-T | 6861013-C-T | ** | ||||||||
14686206-C-T | 12574272-C-T | ** | ||||||||
14698354-G-C | 12586420-G-C | ** | ||||||||
14704219-A-G | 12592285-A-G | ** | ||||||||
14986392-G-T | 12874460-G-T | ** | ||||||||
15070478-G-A | 12958569-G-A | ** | ||||||||
15111367-C-T | 12999454-C-T | ** | ||||||||
14566660-CT-C | 12454860-CT-C | ** | ||||||||
15111371-C-T | 12999458-C-T | ** | ||||||||
15111372-A-G | 12999459-A-G | ** | ||||||||
15111379-T-TTTTG | 12999466-T-TTTTG | ** | ||||||||
15114138-T-C | 13002225-T-C | ** | ||||||||
15168357-A-T | 13056443-A-T | ** | ||||||||
15216219-C-A | 13104305-C-A | ** | ||||||||
15400457-A-G | 13288577-A-G | ** | ||||||||
14566665-T-TTG | 12454865-T-TTG | ** | ||||||||
14515149-C-A | 12403354-C-A | ** | ||||||||
11672012-T-C | ** | |||||||||
14068489-T-C | 11947783-T-C | ** | ||||||||
11677226-C-G | ** | |||||||||
13801253-C-CGAATG | 11680547-C-CGAATG | ** | ||||||||
13846769-C-G | 11726063-C-G | ** | ||||||||
13938512-C-A | 11817806-C-A | ** | ||||||||
13958641-A-G | 11837935-A-G | ** | ||||||||
13958908-C-A | 11838202-C-A | ** | ||||||||
13974121-T-A | 11853415-T-A | ** | ||||||||
14073455-A-G | 11952749-A-G | ** | ||||||||
14511880-C-T | 12400085-C-T | ** | ||||||||
14112258-C-A | 11991552-C-A | ** | ||||||||
14182396-A-C | 12061690-A-C | ** | ||||||||
14182421-T-C | 12061715-T-C | ** | ||||||||
14182425-A-C | 12061719-A-C | ** | ||||||||
14182426-C-T | 12061720-C-T | ** | ||||||||
14269685-C-A | 12148979-C-A | ** | ||||||||
14391571-G-A | 12270867-G-A | ** | ||||||||
10974931-C-A | ** | |||||||||
10941549-T-C | ** | |||||||||
7115268-A-C | 7247227-A-C | ** | ||||||||
9799285-G-A | 9961676-G-A | ** | ||||||||
8913677-C-G | 9045636-C-G | ** | ||||||||
9119036-G-T | ** | |||||||||
9162902-C-A | 9325293-C-A | ** | ||||||||
9440431-C-A | 9602822-C-A | ** | ||||||||
9639096-G-T | 9801487-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9764248-C-T | 9926639-C-T | ** | ||||||||
9900180-C-A | 10062571-C-A | ** | ||||||||
8216445-C-G | 8348404-C-G | ** | ||||||||
9913970-C-T | 10076361-C-T | ** | ||||||||
9923695-C-A | 10086086-C-A | ** | ||||||||
9929929-G-T | 10092320-G-T | ** | ||||||||
9951943-T-A | 10114334-T-A | ** | ||||||||
9965707-T-C | 10128098-T-C | ** | ||||||||
9991098-G-C | 10153489-G-C | ** | ||||||||
10023591-C-A | 10185982-C-A | ** | ||||||||
8293759-G-A | 8425718-G-A | ** | ||||||||
8073438-A-T | 8205397-A-T | ** | ||||||||
6818904-T-C | 6950863-T-C | ** | ||||||||
7221414-C-T | 7353373-C-T | ** | ||||||||
7117430-A-C | 7249389-A-C | ** | ||||||||
7160936-C-A | 7292895-C-A | ** | ||||||||
22263908-T-C | 20102022-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
7008043-G-T | 7140002-G-T | ** | ||||||||
7208369-C-A | 7340328-C-A | ** | ||||||||
6984410-C-T | 7116369-C-T | ** | ||||||||
7218105-G-T | 7350064-G-T | ** | ||||||||
7237176-C-A | 7369135-C-A | ** | ||||||||
7964637-C-A | 8096596-C-A | ** | ||||||||
7240962-A-G | 7372921-A-G | ** | ||||||||
7338130-A-G | 7470089-A-G | ** | ||||||||
7346497-A-G | 7478456-A-G | ** | ||||||||
7368920-C-A | 7500879-C-A | ** | ||||||||
7775015-C-A | 7906974-C-A | ** | ||||||||
7782986-G-A | 7914945-G-A | ** | ||||||||
6922679-C-A | 7054638-C-A | ** | ||||||||
10071637-A-G | 10234028-A-G | ** | ||||||||
10654372-C-G | ** | |||||||||
10937225-T-C | ** | |||||||||
10868761-T-C | ** | |||||||||
10826436-G-T | ** | |||||||||
10835941-C-G | ** | |||||||||
10861621-T-C | ** | |||||||||
10862669-T-A | ** | |||||||||
10863300-G-A | ** | |||||||||
10866696-C-A | ** | |||||||||
10869332-C-A | ** | |||||||||
10823280-A-T | ** | |||||||||
10873087-C-CCATTG | ** | |||||||||
6757666-C-A | 6889625-C-A | ** | ||||||||
10873150-T-C | ** | |||||||||
10911330-C-T | ** | |||||||||
10924732-C-A | FT255247 | ** | ||||||||
10926918-G-T | ** | |||||||||
10935390-T-G | ** | |||||||||
10825025-C-T | ** | |||||||||
10823266-C-T | ** | |||||||||
10665226-G-T | ** | |||||||||
10779368-C-A | ** | |||||||||
10667516-C-G | ** | |||||||||
10672993-C-A | ** | |||||||||
10683897-C-A | ** | |||||||||
10755291-C-A | ** | |||||||||
10764683-G-T | ** | |||||||||
10768650-TTCCAA-T | ** | |||||||||
10768669-A-ACTCCACTGCC | ** | |||||||||
10779788-C-A | ** | |||||||||
10818407-C-A | FTB59031 | ** | ||||||||
10788150-C-A | ** | |||||||||
10801264-T-C | ** | |||||||||
10804522-C-A | ** | |||||||||
10808403-C-T | ** | |||||||||
10812086-C-T | ** | |||||||||
10815216-C-A | ** | |||||||||
10818401-C-G | ** | |||||||||
10873124-A-C | ** | |||||||||
15622513-A-G | 13510633-A-G | ** | ||||||||
15440019-A-T | 13328139-A-T | ** | ||||||||
23056213-A-G | 20894327-A-G | ** | ||||||||
22729951-T-G | 20568065-T-G | ** | ||||||||
22768127-A-G | 20606241-A-G | ** | ||||||||
22778115-G-C | 20616229-G-C | ** | ||||||||
22816165-C-A | 20654279-C-A | ** | ||||||||
22874378-A-G | 20712492-A-G | ** | ||||||||
22965510-C-A | 20803624-C-A | ** | ||||||||
23007946-T-C | 20846060-T-C | ** | ||||||||
23137123-C-T | 20975237-C-T | ** | ||||||||
22447591-A-C | 20285705-A-C | DYZ19 | ** | |||||||
23137128-G-T | 20975242-G-T | ** | ||||||||
23293601-TA-T | 21131715-TA-T | ** | ||||||||
23311142-C-T | 21149256-C-T | ** | ||||||||
23476274-T-C | 21314388-T-C | ** | ||||||||
23476295-C-G | 21314409-C-G | ** | ||||||||
23875574-G-A | 21713688-G-A | ** | ||||||||
24013889-ATG-T | 21867742-ATG-T | ** | ||||||||
22601585-C-T | 20439699-C-T | ** | ||||||||
22232464-T-G | 20070578-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
24363851-A-G | 22217704-A-G | ** | ||||||||
21555426-G-T | 19393540-G-T | ** | ||||||||
21242181-T-C | 19080295-T-C | ** | ||||||||
21242182-G-A | 19080296-G-A | ** | ||||||||
21393533-A-T | 19231647-A-T | ** | ||||||||
21468129-A-C | 19306243-A-C | ** | ||||||||
21476438-AA-G | 19314552-AA-G | ** | ||||||||
21551563-A-T | 19389677-A-T | ** | ||||||||
21555406-T-C | 19393520-T-C | ** | ||||||||
21582553-G-T | 19420667-G-T | ** | ||||||||
22228126-C-T | 20066240-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
21597019-G-A | 19435133-G-A | ** | ||||||||
21597416-G-A | 19435530-G-A | ** | ||||||||
21597708-C-G | 19435822-C-G | ** | ||||||||
21691971-C-T | 19530085-C-T | ** | ||||||||
21954581-C-A | 19792695-C-A | ** | ||||||||
22080818-G-T | 19918932-G-T | ** | ||||||||
22176305-T-C | 20014419-T-C | ** | ||||||||
24305387-G-T | 22159240-G-T | P3_t1 | ** | |||||||
24363867-A-G | 22217720-A-G | ** | ||||||||
21242176-C-T | 19080290-C-T | ** | ||||||||
7346078-G-A | 7478037-G-A | ** | ||||||||
28720975-C-A | 26574828-C-A | ** | ||||||||
56845567-G-A | ** | |||||||||
56853554-C-T | ** | |||||||||
56853559-T-G | ** | |||||||||
24262334-G-C | 22116187-G-C | P3_b1 | ** | |||||||
24535250-TC-T | 22389103-TC-T | P3_t2 | ** | |||||||
5594333-T-C | 5726292-T-C | ** | ||||||||
9889022-C-G | 10051413-C-G | ** | ||||||||
28601849-A-G | 26455702-A-G | ** | ||||||||
13628104-A-G | 11472428-A-G | ** | ||||||||
18740838-T-C | 16628958-T-C | ** | ||||||||
18951669-A-G | 16839789-A-G | ** | ||||||||
19909363-C-A | 17797483-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
22640212-T-C | 20478326-T-C | ** | ||||||||
24262336-C-CACAG | 22116189-C-CACAG | P3_b1 | ** | |||||||
25870634-G-T | 23724487-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
28664732-C-A | 26518585-C-A | ** | ||||||||
28579593-G-T | 26433446-G-T | ** | ||||||||
24363877-TG-A | 22217730-TG-A | ** | ||||||||
28500264-T-A | 26354117-T-A | ** | ||||||||
24513504-C-A | 22367357-C-A | FT148081 | ** | |||||||
25988047-A-T | 23841900-A-T | P1_Y1 | ** | |||||||
25993955-C-T | 23847808-C-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26355358-A-G | 24209211-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
27633850-A-G | 25487703-A-G | P1_Y2 | ** | |||||||
28053266-T-GGGGG | 25907119-T-GGGGG | P1_Y2 | ** | |||||||
28499383-C-A | 26353236-C-A | ** | ||||||||
28507329-T-C | 26361182-T-C | ** | ||||||||
28567464-C-A | 26421317-C-A | ** | ||||||||
28507357-A-T | 26361210-A-T | ** | ||||||||
28536354-C-A | 26390207-C-A | FTA20974 | ** | |||||||
28539431-A-T | 26393284-A-T | ** | ||||||||
28539477-G-A | 26393330-G-A | ** | ||||||||
28539480-A-C | 26393333-A-C | ** | ||||||||
28555152-C-A | 26409005-C-A | ** | ||||||||
28559966-C-A | 26413819-C-A | ** | ||||||||
21242177-A-G | 19080291-A-G | ** | ||||||||
21242162-A-G | 19080276-A-G | ** | ||||||||
15440033-G-C | 13328153-G-C | FTB52227 | ** | |||||||
17228292-C-T | 15116412-C-T | ** | ||||||||
16931202-C-T | 14819322-C-T | ** | ||||||||
17014577-GT-G | 14902697-GT-G | ** | ||||||||
17083816-G-A | 14971936-G-A | ** | ||||||||
17085277-A-C | 14973397-A-C | ** | ||||||||
17085281-C-A | 14973401-C-A | ** | ||||||||
17222718-T-C | 15110838-T-C | ** | ||||||||
17228189-C-A | 15116309-C-A | ** | ||||||||
17257216-A-C | 15145336-A-C | ** | ||||||||
16720250-A-C | 14608370-A-C | ** | ||||||||
17263099-C-A | 15151219-C-A | ** | ||||||||
17433882-T-C | 15322002-T-C | ** | ||||||||
17466611-AC-A | 15354731-AC-A | ** | ||||||||
17466624-C-T | 15354744-C-T | ** | ||||||||
17486216-A-G | 15374336-A-G | ** | ||||||||
17492051-G-A | 15380171-G-A | ** | ||||||||
17492068-T-C | 15380188-T-C | ** | ||||||||
16896376-T-A | 14784496-T-A | ** | ||||||||
16676746-C-T | 14564866-C-T | ** | ||||||||
17492080-G-A | 15380200-G-A | ** | ||||||||
15676958-C-T | 13565078-C-T | ** | ||||||||
15622502-A-G | 13510622-A-G | ** | ||||||||
15622506-G-A | 13510626-G-A | ** | ||||||||
15622512-C-T | 13510632-C-T | ** | ||||||||
6729038-T-C | 6860997-T-C | ** | ||||||||
15622514-T-C | 13510634-T-C | ** | ||||||||
15622531-GA-G | 13510651-GA-G | ** | ||||||||
15622546-C-A | 13510666-C-A | ** | ||||||||
15797954-A-T | 13686074-A-T | ** | ||||||||
16659090-C-A | 14547210-C-A | ** | ||||||||
16060308-A-T | 13948428-A-T | ** | ||||||||
16095984-T-C | 13984104-T-C | ** | ||||||||
16188162-T-C | 14076282-T-C | ** | ||||||||
16277866-A-C | 14165986-A-C | ** | ||||||||
16422039-A-G | 14310159-A-G | ** | ||||||||
16503107-C-A | 14391227-C-A | FGC57045 | ** | |||||||
16622200-G-T | 14510320-G-T | ** | ||||||||
17492069-A-T | 15380189-A-T | ** | ||||||||
17504867-A-T | 15392987-A-T | ** | ||||||||
21208966-C-T | 19047080-C-T | ** | ||||||||
19529260-C-A | 17417380-C-A | ** | ||||||||
19303892-C-A | 17192012-C-A | ** | ||||||||
19324183-G-T | 17212303-G-T | ** | ||||||||
19393194-T-A | 17281314-T-A | ** | ||||||||
19459118-C-T | 17347238-C-T | ** | ||||||||
19459224-C-A | 17347344-C-A | ** | ||||||||
19459803-T-C | 17347923-T-C | ** | ||||||||
19465685-G-A | 17353805-G-A | ** | ||||||||
19745004-T-G | 17633124-T-G | P5_Prx | ** | |||||||
19043656-T-C | 16931776-T-C | ** | ||||||||
20587805-A-G | 18425919-A-G | P5_Dst | ** | |||||||
20587812-T-TAG | 18425926-T-TAG | P5_Dst | ** | |||||||
20587831-A-G | 18425945-A-G | P5_Dst | ** | |||||||
20587836-G-A | 18425950-G-A | P5_Dst | ** | |||||||
21096293-C-A | 18934407-C-A | ** | ||||||||
21151775-A-T | 18989889-A-T | ** | ||||||||
21196704-C-A | 19034818-C-A | ** | ||||||||
19088549-G-C | 16976669-G-C | ** | ||||||||
18972734-A-G | 16860854-A-G | ** | ||||||||
17624574-G-A | 15512694-G-A | ** | ||||||||
18511576-A-G | 16399696-A-G | P6_Dst | ** | |||||||
17782957-T-C | 15671077-T-C | ** | ||||||||
17982046-C-A | 15870166-C-A | ** | ||||||||
18183497-C-A | 16071617-C-A | ** | ||||||||
18192330-C-T | 16080450-C-T | ** | ||||||||
18270313-G-C | 16158433-G-C | ** | ||||||||
18462730-T-A | 16350850-T-A | P6_Dst | ** | |||||||
18465578-G-T | 16353698-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
18565887-T-C | 16454007-T-C | ** | ||||||||
18971239-C-A | 16859359-C-A | ** | ||||||||
18682669-A-T | 16570789-A-T | ** | ||||||||
18733587-C-A | 16621707-C-A | ** | ||||||||
18902714-G-A | 16790834-G-A | ** | ||||||||
18902742-A-G | 16790862-A-G | ** | ||||||||
18902754-C-A | 16790874-C-A | ** | ||||||||
18902924-C-T | 16791044-C-T | ** | ||||||||
18931912-C-A | 16820032-C-A | ** | ||||||||
6729050-T-A | 6861009-T-A | ** | ||||||||
28613701-T-C | 26467554-T-C | CTS12564 | ** | |||||||
6729031-GAGT-G | 6860990-GAGT-G | ** | ||||||||
21037273-C-A | 18875387-C-A | ** | ||||||||
21678025-C-A | 19516139-C-A | ** | ||||||||
10885230-C-T | ** | |||||||||
21464526-G-A | 19302640-G-A | ** | ||||||||
10804438-C-CCACCA | ** | |||||||||
10804466-T-A | ** | |||||||||
22100809-G-A | 19938923-G-A | ** | ||||||||
16297184-C-A | 14185304-C-A | ** | ||||||||
17702566-C-A | 15590686-C-A | ** | ||||||||
19129249-C-A | 17017369-C-A | ** | ||||||||
11003311-C-T | ** | |||||||||
20629135-G-T | 18467249-G-T | P4_Prx | ** | |||||||
10793888-T-C | ** | |||||||||
14146924-T-G | 12026218-T-G | ** | ||||||||
22816176-A-T | 20654290-A-T | ** | ||||||||
13846803-C-T | 11726097-C-T | ** | ||||||||
10783799-A-C | ** | |||||||||
16118305-A-G | 14006425-A-G | P8_Prx | ** | |||||||
10773010-C-A | ** | |||||||||
17492062-C-T | 15380182-C-T | ** | ||||||||
17058680-A-G | 14946800-A-G | FT355714 | ** | |||||||
17058683-C-T | 14946803-C-T | FT117776 | ** | |||||||
13999222-C-A | 11878516-C-A | ** | ||||||||
21754484-G-T | ** | |||||||||
23953370-C-A | 21807223-C-A | ** | ||||||||
10924417-C-A | ** | |||||||||
17492079-A-G | 15380199-A-G | ** | ||||||||
6474815-A-T | 6606774-A-T | ** | ||||||||
4353864-G-A | 4485823-G-A | ** | ||||||||
5818525-C-A | 5950484-C-A | ** | ||||||||
6839624-G-T | 6971583-G-T | ** | ||||||||
10978803-C-A | ** | |||||||||
28734936-C-A | 26588789-C-A | ** | ||||||||
10676945-C-A | ** | |||||||||
21944645-T-C | 19782759-T-C | ** | ||||||||
22787086-C-A | 20625200-C-A | ** | ||||||||
9899730-C-A | 10062121-C-A | ** | ||||||||
19547650-C-A | 17435770-C-A | ** | ||||||||
14345027-C-A | 12224322-C-A | ** | ||||||||
11014100-C-A | ** | |||||||||
10947718-C-A | ** | |||||||||
15816425-G-A | 13704545-G-A | ** | ||||||||
15622519-G-A | 13510639-G-A | ** | ||||||||
15622530-G-A | 13510650-G-A | ** | ||||||||
17014576-G-A | 14902696-G-A | ** | ||||||||
4929004-C-T | 5060963-C-T | ** | ||||||||
10807376-T-C | ** | |||||||||
4929009-T-C | 5060968-T-C | ** | ||||||||
17492050-G-A | 15380170-G-A | Y99309 | ** | |||||||
3512357-C-A | 3644316-C-A | ** | ||||||||
23293599-TA-T | 21131713-TA-T | ** | ||||||||
28781588-C-A | 26635441-C-A | ** | ||||||||
10799697-C-A | ** | |||||||||
13875634-GT-G | 11754928-GT-G | 8×T | ** | |||||||
11658414-C-A | ** | |||||||||
15475224-C-A | 13363344-C-A | ** | ||||||||
22362424-A-G | 20200538-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
10989081-C-G | ** | |||||||||
13227167-A-G | 11071491-A-G | ** | ||||||||
14266323-A-G | 12145617-A-G | ** | ||||||||
17644371-C-A | 15532491-C-A | ** | ||||||||
22263932-G-T | 20102046-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
14046794-C-A | 11926088-C-A | ** | ||||||||
28561828-C-A | 26415681-C-A | ** | ||||||||
6690257-C-A | 6822216-C-A | ** | ||||||||
10783793-G-C | ** | |||||||||
16913275-C-A | 14801395-C-A | ** | ||||||||
16848448-C-A | 14736568-C-A | ** | ||||||||
10764810-C-T | BY3231 | BY186169 | ** | |||||||
25733034-G-GTT | 23586887-G-GTT | P1_b3 | 17×T | ** | ||||||
16931694-G-T | 14819814-G-T | ** | ||||||||
11653424-C-A | ** | |||||||||
4960502-C-A | 5092461-C-A | ** | ||||||||
6729029-T-TTTAA | 6860988-T-TTTAA | ** | ||||||||
21176999-C-A | 19015113-C-A | ** | ||||||||
4094849-ATG-A | 4226808-ATG-A | ** | ||||||||
7285644-C-A | 7417603-C-A | ** | ||||||||
17588662-C-A | 15476782-C-A | ** | ||||||||
10945358-A-C | ** | |||||||||
15732188-C-A | 13620308-C-A | ** | ||||||||
13227151-C-A | 11071475-C-A | ** | ||||||||
14910798-A-T | 12798865-A-T | 21×T | ** | |||||||
10823278-G-T | ** | |||||||||
22124334-CT-C | 19962448-CT-C | ** | ||||||||
9402932-C-A | 9565323-C-A | ** | ||||||||
22662279-GT-G | 20500393-GT-G | 9×T | ** | |||||||
24513641-C-A | 22367494-C-A | ** | ||||||||
16702354-C-A | 14590474-C-A | ** | ||||||||
13234389-C-A | 11078713-C-A | ** | ||||||||
2861429-A-G | 2993388-A-G | ** | ||||||||
19044392-A-T | 16932512-A-T | ** | ||||||||
15605479-C-A | 13493599-C-A | ** | ||||||||
10793901-T-C | ** | |||||||||
10951028-C-T | ** | |||||||||
10683217-C-A | ** | |||||||||
10793925-G-C | ** | |||||||||
21141320-G-A | 18979434-G-A | M10798 | ** | |||||||
13709284-C-T | 11553608-C-T | ** | ||||||||
2790532-G-T | 2922491-G-T | PR95 | ** | ** | ||||||
15622559-T-C | 13510679-T-C | ** | ||||||||
9408432-C-T | 9570823-C-T | ** | ||||||||
6074774-T-TTA | 6206733-T-TTA | ** | ||||||||
10040126-A-G | 10202517-A-G | ** | ||||||||
16079469-C-T | 13967589-C-T | PF1957 | CTS5230 | ** | ||||||
21177056-T-A | 19015170-T-A | 11×TA | ** | |||||||
7157036-C-A | 7288995-C-A | ** | ||||||||
23311241-T-C | 21149355-T-C | ** | ||||||||
26133356-G-T | 23987209-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
23476279-G-T | 21314393-G-T | ** | ||||||||
6024572-ATG-A | 6156531-ATG-A | ** | ||||||||
58986856-G-A | 56840709-G-A | ** | ||||||||
56733875-C-G | ** | |||||||||
56733875-CA-C | ** | |||||||||
10793917-A-C | ** | |||||||||
10793926-T-C | ** | |||||||||
10660598-C-A | ** | |||||||||
16188169-C-T | 14076289-C-T | ** | ||||||||
16545410-T-G | 14433530-T-G | ** | ||||||||
13477486-T-C | 11321810-T-C | ** | ||||||||
10932565-C-A | ** | |||||||||
28500125-C-A | 26353978-C-A | ** | ||||||||
10876693-A-T | ** | |||||||||
19075274-C-A | 16963394-C-A | ** | ||||||||
25988036-A-AC | 23841889-A-AC | P1_Y1 | ** | |||||||
7175997-C-A | 7307956-C-A | ** | ||||||||
14000270-C-A | 11879564-C-A | ** | ||||||||
4888555-C-A | 5020514-C-A | ** | ||||||||
10967750-G-T | ** | |||||||||
14076759-C-A | 11956053-C-A | ** | ||||||||
14552714-G-A | 12440915-G-A | ** | ||||||||
14552715-G-C | 12440916-G-C | FT86812 | ** | |||||||
19168815-C-A | 17056935-C-A | ** | ||||||||
19506975-C-A | 17395095-C-A | ** | ||||||||
28550436-G-T | 26404289-G-T | ** | ||||||||
10793946-C-T | ** | |||||||||
10793891-A-C | ** | |||||||||
10793978-T-TCCCAA | ** | |||||||||
10942589-A-T | ** | |||||||||
15698695-T-C | 13586815-T-C | ** | ||||||||
27952124-T-C | 25805977-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
10804405-A-T | ** | |||||||||
11000011-A-C | ** | |||||||||
23052562-T-A | 20890676-T-A | ** | ||||||||
13579723-GT-G | 11424047-GT-G | ** | ||||||||
13462311-C-T | 11306635-C-T | ** | ||||||||
10768700-T-C | ** | |||||||||
9361094-C-A | 9523485-C-A | ** | ||||||||
4063860-C-A | 4195819-C-A | ** | ||||||||
22208867-CAAAA-C | 20046981-CAAAA-C | 14×A | ** | |||||||
15676954-C-T | 13565074-C-T | ** | ||||||||
28496411-G-T | 26350264-G-T | ** | ||||||||
13462304-C-T | 11306628-C-T | ** | ||||||||
10985316-C-A | ** | |||||||||
56876092-C-A | ** | |||||||||
11031148-C-A | ** | |||||||||
4447886-A-T | 4579845-A-T | ** | ||||||||
4242836-G-A | 4374795-G-A | FT287420 | ** | |||||||
4242905-GT-G | 4374864-GT-G | ** | ||||||||
4270447-A-G | 4402406-A-G | ** | ||||||||
4270503-C-A | 4402462-C-A | ** | ||||||||
4333872-A-C | 4465831-A-C | ** | ||||||||
4443150-A-G | 4575109-A-G | ** | ||||||||
4449284-A-T | 4581243-A-T | ** | ||||||||
15622529-T-C | 13510649-T-C | ** | ||||||||
4534308-T-C | 4666267-T-C | ** | ||||||||
4534323-A-T | 4666282-A-T | ** | ||||||||
4552772-G-T | 4684731-G-T | ** | ||||||||
4604072-A-G | 4736031-A-G | ** | ||||||||
4841342-G-A | 4973301-G-A | ** | ||||||||
4898927-G-C | 5030886-G-C | ** | ||||||||
4957717-A-G | 5089676-A-G | ** | ||||||||
4213054-G-C | 4345013-G-C | ** | ||||||||
4123638-T-A | 4255597-T-A | ** | ||||||||
5127886-C-A | 5259845-C-A | ** | ||||||||
3955638-C-A | 4087597-C-A | ** | ||||||||
3834191-C-A | 3966150-C-A | ** | ||||||||
3834202-C-A | 3966161-C-A | ** | ||||||||
3850184-A-G | 3982143-A-G | ** | ||||||||
3861416-G-T | 3993375-G-T | ** | ||||||||
3861552-G-T | 3993511-G-T | ** | ||||||||
3876951-A-T | 4008910-A-T | ** | ||||||||
3955572-C-A | 4087531-C-A | ** | ||||||||
3965217-A-G | 4097176-A-G | ** | ||||||||
4101123-G-T | 4233082-G-T | ** | ||||||||
3965222-T-G | 4097181-T-G | ** | ||||||||
3965257-G-T | 4097216-G-T | ** | ||||||||
3965273-A-G | 4097232-A-G | ** | ||||||||
3990750-C-A | 4122709-C-A | ** | ||||||||
4063530-G-T | 4195489-G-T | ** | ||||||||
4065152-C-A | 4197111-C-A | ** | ||||||||
4076551-G-T | 4208510-G-T | ** | ||||||||
4995958-C-G | 5127917-C-G | ** | ||||||||
5165313-T-G | 5297272-T-G | ** | ||||||||
3745090-T-C | 3877049-T-C | ** | ||||||||
6417720-C-A | 6549679-C-A | ** | ||||||||
6086094-AT-A | 6218053-AT-A | ** | ||||||||
6091205-C-A | 6223164-C-A | ** | ||||||||
6093851-C-A | 6225810-C-A | ** | ||||||||
6093943-A-G | 6225902-A-G | ** | ||||||||
6096359-T-G | 6228318-T-G | ** | ||||||||
6370337-G-T | 6502296-G-T | ** | ||||||||
6457847-C-G | 6589806-C-G | ** | ||||||||
6027726-C-A | 6159685-C-A | ** | ||||||||
6457852-A-T | 6589811-A-T | ** | ||||||||
6474780-G-A | 6606739-G-A | ** | ||||||||
6474804-A-T | 6606763-A-T | ** | ||||||||
6540997-A-G | 6672956-A-G | ** | ||||||||
6642626-G-A | 6774585-G-A | ** | ||||||||
6642687-C-A | 6774646-C-A | ** | ||||||||
6729025-A-T | 6860984-A-T | ** | ||||||||
6064128-A-C | 6196087-A-C | ** | ||||||||
6012161-T-G | 6144120-T-G | ** | ||||||||
5189290-G-C | 5321249-G-C | ** | ||||||||
5674745-C-A | 5806704-C-A | ** | ||||||||
5205388-A-T | 5337347-A-T | ** | ||||||||
5314696-C-A | 5446655-C-A | ** | ||||||||
5323872-G-T | 5455831-G-T | ** | ||||||||
5343295-C-A | 5475254-C-A | ** | ||||||||
5343571-C-T | 5475530-C-T | ** | ||||||||
5578621-C-A | 5710580-C-A | ** | ||||||||
5668913-C-A | 5800872-C-A | ** | ||||||||
5806480-C-A | 5938439-C-A | ** | ||||||||
5987583-C-A | 6119542-C-A | ** | ||||||||
5863930-C-A | 5995889-C-A | ** | ||||||||
5898412-G-T | 6030371-G-T | ** | ||||||||
5901732-G-T | 6033691-G-T | ** | ||||||||
5911953-G-A | 6043912-G-A | ** | ||||||||
5952253-G-T | 6084212-G-T | ** | ||||||||
5977074-A-G | 6109033-A-G | Z17316 | FT39945 | ** | ||||||
5980752-T-C | 6112711-T-C | ** | ||||||||
3786323-T-A | 3918282-T-A | ** | ||||||||
4128893-C-A | 4260852-C-A | ** | ||||||||
3743147-T-A | 3875106-T-A | ** | ||||||||
10983790-G-T | ** | |||||||||
24363863-C-T | 22217716-C-T | ** | ||||||||
18801491-A-G | 16689611-A-G | ** | ||||||||
13227160-A-G | 11071484-A-G | ** | ||||||||
23439011-C-A | 21277125-C-A | ** | ||||||||
6881500-C-A | 7013459-C-A | ** | ||||||||
3680575-C-A | 3812534-C-A | ** | ||||||||
10873122-C-T | ** | |||||||||
17466596-G-A | 15354716-G-A | ** | ||||||||
18779291-C-A | 16667411-C-A | ** | ||||||||
11677219-C-A | FT451482 | ** | ||||||||
3681354-G-T | 3813313-G-T | ** | ||||||||
14099812-C-A | 11979106-C-A | ** | ||||||||
4929002-T-C | 5060961-T-C | ** | ||||||||
17466616-A-G | 15354736-A-G | ** | ||||||||
24363862-T-C | 22217715-T-C | ** | ||||||||
17466594-G-C | 15354714-G-C | ** | ||||||||
9063452-C-A | 9225843-C-A | ** | ||||||||
11675204-A-T | ** | |||||||||
10924408-A-G | ** | |||||||||
14766605-TC-T | 12654674-TC-T | ** | ||||||||
14483264-C-A | 12362533-C-A | ** | ||||||||
4995485-C-A | 5127444-C-A | ** | ||||||||
11003338-G-T | ** | |||||||||
16673116-C-A | 14561236-C-A | ** | ||||||||
11675220-T-A | ** | |||||||||
4521863-C-A | 4653822-C-A | ** | ||||||||
11675221-G-C | ** | |||||||||
11675224-C-A | ** | |||||||||
11675226-C-T | ** | |||||||||
23144358-C-A | 20982472-C-A | ** | ||||||||
28500156-C-G | 26354009-C-G | ** | ||||||||
10835974-C-A | ** | |||||||||
4928992-G-A | 5060951-G-A | ** | ||||||||
17095387-C-A | 14983507-C-A | ** | ||||||||
7200556-C-A | 7332515-C-A | ** | ||||||||
3551094-G-C | 3683053-G-C | ** | ||||||||
3551076-A-C | 3683035-A-C | ** | ||||||||
3179024-C-A | 3310983-C-A | ** | ||||||||
2861428-C-T | 2993387-C-T | ** | ||||||||
2790527-G-T | 2922486-G-T | ** | ||||||||
3218155-CA-C | 3350114-CA-C | ** | ||||||||
2767926-A-C | 2899885-A-C | ** | ||||||||
2750713-C-T | 2882672-C-T | BY56247 | ** | |||||||
3552339-C-A | 3684298-C-A | ** | ||||||||
3602669-C-G | 3734628-C-G | ** | ||||||||
3275563-G-T | 3407522-G-T | ** | ||||||||
2670777-G-A | 2802736-G-A | ** | ||||||||
3283549-A-G | 3415508-A-G | ** | ||||||||
3179098-G-A | 3311057-G-A | ** | ||||||||
3328736-T-G | 3460695-T-G | ** | ||||||||
3650636-G-C | 3782595-G-C | ** | ||||||||
3501332-C-T | 3633291-C-T | ** | ||||||||
3334350-T-C | 3466309-T-C | ** | ||||||||
3329608-A-C | 3461567-A-C | ** | ||||||||
5275697-G-T | 5407656-G-T | ** | ||||||||
3329312-T-A | 3461271-T-A | ** | ||||||||
18841112-TAA-T,TAAA | 16729232-TAA-T,TAAA | 16×A | *** | |||||||
13845424-A-C | 11724718-A-C | *** | ||||||||
13468046-T-A | 11312370-T-A | *** | ||||||||
14270296-A-AT | 12149590-A-AT | 9×T | *** | |||||||
13468048-T-G | 11312372-T-G | *** | ||||||||
28784406-T-C | 26638259-T-C | *** | ||||||||
13868598-CA-C,CC | 11747892-CA-C,CC | *** | ||||||||
19949078-C-T | 17837198-C-T | P5_Prx | *** | |||||||
19949082-C-G | 17837202-C-G | P5_Prx | *** | |||||||
13468038-A-G | 11312362-A-G | *** | ||||||||
10752664-C-A | *** | |||||||||
10868752-C-A | *** | |||||||||
14481625-G-A | 12360894-G-A | CTS2786 | *** | |||||||
10885173-ACTGAACTCCA-A,ACTCCACTC | *** | |||||||||
14481603-C-T | 12360872-C-T | CTS2784 | *** | |||||||
23225867-A-G | 21063981-A-G | *** | ||||||||
14481605-C-T | 12360874-C-T | CTS2785 | *** | |||||||
21335284-C-T | 19173398-C-T | *** | ||||||||
10025644-A-C | 10188035-A-C | *** | ||||||||
24171035-C-G | 22024888-C-G | P3_b1 | *** | |||||||
16666079-ATTT-A,ATTTT | 14554199-ATTT-A,ATTTT | 25×T | *** | |||||||
5590594-T-C | 5722553-T-C | *** | ||||||||
22220681-T-G | 20058795-T-G | DYZ19 | *** | |||||||
10010370-A-C | 10172761-A-C | *** | ||||||||
10003078-A-C | 10165469-A-C | *** | ||||||||
9889051-T-G | 10051442-T-G | *** | ||||||||
9889035-G-A | 10051426-G-A | *** | ||||||||
9889026-A-G | 10051417-A-G | *** | ||||||||
3641151-T-C | 3773110-T-C | *** | ||||||||
8822550-A-G | 8954509-A-G | *** | ||||||||
13475548-G-T | 11319872-G-T | *** | ||||||||
19949096-T-C | 17837216-T-C | P5_Prx | *** | |||||||
15221609-C-T | 13109695-C-T | *** | ||||||||
6147721-G-C | 6279680-G-C | IR3_Dst | *** | |||||||
22023676-G-T | 19861790-G-T | *** | ||||||||
10624583-A-C | *** | |||||||||
10624591-A-G | *** | |||||||||
10624593-A-AG | *** | |||||||||
4687647-TGAGACAG-T | 4819606-TGAGACAG-T | *** | ||||||||
10652130-C-A | *** | |||||||||
22063295-CAA-C,CA | 19901409-CAA-C,CA | 13×A | *** | |||||||
22023665-C-T | 19861779-C-T | *** | ||||||||
10654581-T-C | *** | |||||||||
13475542-T-A | 11319866-T-A | *** | ||||||||
21924033-C-G | 19762147-C-G | *** | ||||||||
21881015-C-A | 19719129-C-A | *** | ||||||||
28772939-T-G | 26626792-T-G | *** | ||||||||
21651620-T-C | 19489734-T-C | *** | ||||||||
10624582-A-T | *** | |||||||||
10893906-C-A | *** | |||||||||
17228976-C-T | 15117096-C-T | *** | ||||||||
28536078-C-A | 26389931-C-A | *** | ||||||||
7769254-CT-C | 7901213-CT-C | 10×T | *** | |||||||
24405986-C-T | 22259839-C-T | *** | ||||||||
14052169-C-A | 11931463-C-A | *** | ||||||||
7177078-T-C | 7309037-T-C | *** | ||||||||
15221604-T-C | 13109690-T-C | *** | ||||||||
13940873-GA-G | 11820167-GA-G | *** | ||||||||
13857356-G-T | 11736650-G-T | *** | ||||||||
22755633-T-G | 20593747-T-G | *** | ||||||||
11030161-TCCAA-C | *** | |||||||||
13254796-GTT-G | 11099120-GTT-G | 12×T | *** | |||||||
17601203-G-T | 15489323-G-T | *** | ||||||||
9842582-GTT-G | 10004973-GTT-G | 14×T | *** | |||||||
7252345-T-C | 7384304-T-C | *** | ||||||||
23350678-G-A | 21188792-G-A | *** | ||||||||
4240630-C-A | 4372589-C-A | *** | ||||||||
16619992-C-A | 14508112-C-A | *** | ||||||||
21362564-G-A | 19200678-G-A | *** | ||||||||
16241711-T-C | 14129831-T-C | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: 29527 | 10895280 | 7927882 | 8013710 |
Kit: 29527 | 10005644 | 8107405 | 7963484 |
Kit: 29527 | 15015192 | 9395399 | 8325701 |
Used in age calculations | 15015192 | 9395399 | 8325701 |
Counts of SNPs | 2 | 0 |
Big Tree Main Page