Campbell
FTDNA: 7021, BigY3: 7021, BigY2: 7021Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 7021 | BigY3 7021 | BigY2 7021 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
5590714-G-GA | 5722673-G-GA | 10×A | A* | |||||||
56834983-C-T | A* | |||||||||
56836873-A-ACATTTCATTCCACTCCATTC | A* | |||||||||
13449112-C-G | 11293436-C-G | A* | ||||||||
56833893-G-GCCATTCCAGTCCACT | A* | |||||||||
13451010-C-T | 11295334-C-T | A* | ||||||||
4433927-C-T | 4565886-C-T | A* | ||||||||
21946164-A-G | 19784278-A-G | A12580 | Y | Y | + | + | + | |||
4312994-C-T | 4444953-C-T | FT152369 | + | |||||||
5280857-G-A | 5412816-G-A | FT273083 | + | |||||||
5862671-A-G | 5994630-A-G | FT273216 | + | |||||||
16738602-T-A | 14626722-T-A | FT274376 | Y | + | ||||||
28493679-G-C | 26347532-G-C | FT275421 | + | |||||||
6402015-CG-C | 6533974-CG-C | *** | * | |||||||
19284019-G-GTATGC | 17172139-G-GTATGC | 10×TATGC | * | |||||||
13451841-TTTA-GTAG,TTGA | 11296165-TTTA-GTAG,TTGA | * | ||||||||
8465934-T-TTG | 8597893-T-TTG | 20×TG | * | *** | ||||||
13610767-C-A | 11455091-C-A | ** | ** | |||||||
2685639-C-T | 2817598-C-T | ** | ||||||||
19775302-C-CTT | 17663422-C-CTT | P5_Prx | 32×T | ** | ||||||
7195306-GC-G | 7327265-GC-G | ** | ||||||||
17576260-T-A | 15464380-T-A | ** | ||||||||
19314707-CTA-C | 17202827-CTA-C | ** | ||||||||
13201794-G-A | 11046118-G-A | ** | ||||||||
13304893-G-A | 11149217-G-A | FT9504 | ** | |||||||
14835342-G-T | 12723409-G-T | ** | ||||||||
17616672-C-A | 15504792-C-A | ** | ||||||||
18959193-C-T | 16847313-C-T | FTB41766 | ** | |||||||
18972070-C-T | 16860190-C-T | ** | ||||||||
22252349-T-G | 20090463-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
23831331-A-G | 21669445-A-G | ** | ||||||||
13496541-C-G | 11340865-C-G | ** | ||||||||
3872673-T-G | 4004632-T-G | ** | ||||||||
6881269-C-A | 7013228-C-A | ** | ** | |||||||
15358789-C-A | 13246909-C-A | ** | ||||||||
13201780-T-C | 11046104-T-C | ** | ||||||||
19622026-C-A | 17510146-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19508173-G-T | 17396293-G-T | ** | ||||||||
10666929-C-A | ** | |||||||||
56847128-C-A | ** | |||||||||
19189597-G-A | 17077717-G-A | ** | ||||||||
13474635-C-A | 11318959-C-A | ** | ||||||||
16320114-G-A | 14208234-G-A | ** | ||||||||
10811344-C-A | ** | |||||||||
4222665-C-A | 4354624-C-A | ** | ||||||||
10825295-C-GGATTA | ** | |||||||||
14562372-C-G | 12450572-C-G | ** | ||||||||
14635644-C-A | 12523713-C-A | ** | ||||||||
10771815-T-A | ** | |||||||||
14717669-G-T | 12605737-G-T | ** | ||||||||
10826583-C-CTATTG | ** | |||||||||
9374728-C-A | 9537119-C-A | ** | ||||||||
23355319-C-T | 21193433-C-T | ** | ||||||||
10947677-C-CCCACT | ** | |||||||||
14328438-C-A | 12207732-C-A | ** | ||||||||
11652859-A-G | BY27137 | ** | ||||||||
10659641-T-C | ** | |||||||||
10659644-A-T | ** | |||||||||
10659651-C-G | ** | |||||||||
10659657-T-A | ** | |||||||||
10659665-C-T | ** | |||||||||
10659674-C-A | ** | |||||||||
10659685-A-T | ** | |||||||||
10659689-C-T | ** | |||||||||
10659690-T-G | ** | |||||||||
6282261-A-AC | 6414220-A-AC | IR3_Dst | ** | |||||||
22993389-C-T | 20831503-C-T | FT77422 | ** | |||||||
10958468-C-A | ** | |||||||||
16875006-C-A | 14763126-C-A | ** | ||||||||
10864690-T-G | ** | |||||||||
10986431-C-T | ** | |||||||||
10958555-C-G | ** | |||||||||
10998649-C-A | ** | |||||||||
10946499-T-C | ** | |||||||||
10946500-AC-A | ** | |||||||||
10946504-C-CA | ** | |||||||||
10946511-T-C | ** | |||||||||
10946516-A-G | ** | |||||||||
10946520-T-A | ** | |||||||||
10946525-C-A | ** | |||||||||
10946536-T-G | ** | |||||||||
13226213-C-A | 11070537-C-A | ** | ||||||||
10959316-C-T | ** | |||||||||
17210949-C-A | 15099069-C-A | ** | ||||||||
10836571-C-T | ** | |||||||||
10780153-C-T | FT178487 | ** | ||||||||
19130771-TG-T | 17018891-TG-T | ** | ||||||||
11009279-G-C | ** | |||||||||
27715048-C-A | 25568901-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
10977530-C-A | ** | |||||||||
21946409-C-A | 19784523-C-A | ** | ||||||||
10811317-T-C | ** | |||||||||
13488751-G-T | 11333075-G-T | ** | ||||||||
3272724-C-A | 3404683-C-A | ** | ||||||||
11020120-C-T | ** | |||||||||
9623314-GA-G | 9785705-GA-G | IR3_Prx | 9×A | ** | ||||||
15397096-G-T | 13285216-G-T | ** | ||||||||
14036075-T-C | 11915369-T-C | ** | ||||||||
14036076-T-A | 11915370-T-A | ** | ||||||||
14036077-T-A | 11915371-T-A | ** | ||||||||
14036081-C-G | 11915375-C-G | ** | ||||||||
6996696-CTTTT-C | 7128655-CTTTT-C | 15×T | ** | |||||||
7201489-C-A | 7333448-C-A | ** | ||||||||
11668622-T-C | ** | |||||||||
5421130-T-C | 5553089-T-C | ** | ||||||||
16041986-C-A | 13930106-C-A | ** | ||||||||
9333956-C-A | 9496347-C-A | ** | ||||||||
8481998-G-A | 8613957-G-A | ** | ||||||||
7239703-C-A | 7371662-C-A | ** | ||||||||
14280870-C-A | 12160164-C-A | ** | ||||||||
20438681-C-A | 18276795-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
14933746-C-A | 12821811-C-A | ** | ||||||||
10668342-C-A | ** | |||||||||
14100073-C-A | 11979367-C-A | ** | ||||||||
10842041-C-A | ** | |||||||||
10887877-C-A | ** | |||||||||
10989444-C-A | ** | |||||||||
8058528-C-A | 8190487-C-A | ** | ||||||||
15683715-C-A | 13571835-C-A | ** | ||||||||
10836500-A-G | ** | |||||||||
11016509-C-A | ** | |||||||||
20107301-A-AG | 17995421-A-AG | P5_Dst | ** | |||||||
19088523-T-TA | 16976643-T-TA | 10×A | ** | |||||||
17118395-CTTTTT-C | 15006515-CTTTTT-C | 16×T | ** | |||||||
26428102-C-A | 24281955-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
21681630-G-A | 19519744-G-A | ** | ||||||||
5935315-C-A | 6067274-C-A | ** | ||||||||
22189063-C-A | 20027177-C-A | ** | ||||||||
10836499-C-A | ** | |||||||||
16344458-GCTTCTT-G | 14232578-GCTTCTT-G | 12×CTT | ** | |||||||
14272955-C-A | 12152249-C-A | ** | ||||||||
23831291-C-T | 21669405-C-T | ** | ||||||||
6424818-C-A | 6556777-C-A | ** | ||||||||
10981962-G-T | ** | |||||||||
10677143-C-A | ** | |||||||||
17527344-G-A | 15415464-G-A | ** | ||||||||
2683404-T-C | 2815363-T-C | ** | ||||||||
2685562-C-A | 2817521-C-A | ** | ||||||||
2758797-T-A | 2890756-T-A | ** | ||||||||
2758799-T-C | 2890758-T-C | ** | ||||||||
2768959-T-C | 2900918-T-C | ** | ||||||||
2768961-C-G | 2900920-C-G | ** | ||||||||
2768969-T-C | 2900928-T-C | ** | ||||||||
2768970-G-T | 2900929-G-T | ** | ||||||||
2768977-C-A | 2900936-C-A | ** | ||||||||
2769045-C-A | 2901004-C-A | ** | ||||||||
2795574-T-C | 2927533-T-C | ** | ||||||||
2853486-C-A | 2985445-C-A | ** | ||||||||
2906750-A-T | 3038709-A-T | ** | ||||||||
2990601-T-A | 3122560-T-A | ** | ||||||||
3011453-T-G | 3143412-T-G | ** | ||||||||
3011454-C-A | 3143413-C-A | ** | ||||||||
3011503-T-A | 3143462-T-A | ** | ||||||||
3071504-A-G | 3203463-A-G | FT14869 | ** | |||||||
3096560-G-T | 3228519-G-T | ** | ||||||||
3131800-T-C | 3263759-T-C | ** | ||||||||
3218347-C-A | 3350306-C-A | ** | ||||||||
3218363-T-G | 3350322-T-G | ** | ||||||||
3275430-A-T | 3407389-A-T | ** | ||||||||
3328839-C-A | 3460798-C-A | ** | ||||||||
3366568-C-A | 3498527-C-A | ** | ||||||||
3367236-A-C | 3499195-A-C | ** | ||||||||
3389988-C-A | 3521947-C-A | ** | ||||||||
3390093-T-A | 3522052-T-A | ** | ||||||||
3437213-A-G | 3569172-A-G | ** | ||||||||
3467175-G-C | 3599134-G-C | ** | ||||||||
3578829-A-G | 3710788-A-G | ** | ||||||||
3630762-C-A | 3762721-C-A | ** | ||||||||
3644790-G-T | 3776749-G-T | ** | ||||||||
3647240-T-C | 3779199-T-C | ** | ||||||||
3661000-A-T | 3792959-A-T | ** | ||||||||
3706646-GT-G | 3838605-GT-G | ** | ||||||||
3817493-T-G | 3949452-T-G | ** | ||||||||
3849180-G-C | 3981139-G-C | ** | ||||||||
3922053-G-T | 4054012-G-T | ** | ||||||||
3923338-C-A | 4055297-C-A | ** | ||||||||
3925828-C-A | 4057787-C-A | ** | ||||||||
3965880-G-T | 4097839-G-T | ** | ||||||||
3986067-T-C | 4118026-T-C | FT319143 | ** | |||||||
3986072-C-G | 4118031-C-G | ** | ||||||||
4021669-G-T | 4153628-G-T | ** | ||||||||
4049750-C-A | 4181709-C-A | ** | ||||||||
4062618-C-A | 4194577-C-A | ** | ||||||||
4084071-C-A | 4216030-C-A | ** | ||||||||
4123755-C-A | 4255714-C-A | ** | ||||||||
4179617-A-G | 4311576-A-G | ** | ||||||||
4225148-C-A | 4357107-C-A | ** | ||||||||
4240922-T-C | 4372881-T-C | ** | ||||||||
4242891-C-G | 4374850-C-G | ** | ||||||||
4242924-T-C | 4374883-T-C | ** | ||||||||
4242933-A-G | 4374892-A-G | ** | ||||||||
4244904-G-C | 4376863-G-C | ** | ||||||||
4270751-A-G | 4402710-A-G | ** | ||||||||
4296727-A-C | 4428686-A-C | ** | ||||||||
4353979-G-C | 4485938-G-C | FTA2908 | ** | |||||||
4444127-A-C | 4576086-A-C | ** | ||||||||
4517203-C-A | 4649162-C-A | ** | ||||||||
4546422-A-T | 4678381-A-T | ** | ||||||||
4546501-C-A | 4678460-C-A | ** | ||||||||
4584033-C-A | 4715992-C-A | ** | ||||||||
4756363-C-A | 4888322-C-A | ** | ||||||||
4789185-T-A | 4921144-T-A | ** | ||||||||
4908202-T-C | 5040161-T-C | ** | ||||||||
4950686-T-G | 5082645-T-G | ** | ||||||||
4968359-C-A | 5100318-C-A | ** | ||||||||
4999729-C-A | 5131688-C-A | ** | ||||||||
5022359-A-C | 5154318-A-C | ** | ||||||||
5073323-C-A | 5205282-C-A | ** | ||||||||
5095620-G-A | 5227579-G-A | ** | ||||||||
5107916-G-A | 5239875-G-A | ** | ||||||||
5190135-C-A | 5322094-C-A | ** | ||||||||
5216307-C-A | 5348266-C-A | ** | ||||||||
5228343-G-T | 5360302-G-T | ** | ||||||||
5269334-G-T | 5401293-G-T | ** | ||||||||
5278459-C-A | 5410418-C-A | ** | ||||||||
5539217-G-T | 5671176-G-T | ** | ||||||||
5601060-C-A | 5733019-C-A | ** | ||||||||
5603872-G-A | 5735831-G-A | ** | ||||||||
5650304-G-T | 5782263-G-T | ** | ||||||||
5671328-G-T | 5803287-G-T | FT354874 | ** | |||||||
5683983-G-T | 5815942-G-T | ** | ||||||||
5704880-A-G | 5836839-A-G | ** | ||||||||
5742684-C-A | 5874643-C-A | ** | ||||||||
5769427-G-A | 5901386-G-A | FT412647 | ** | |||||||
5805668-C-A | 5937627-C-A | FGC75544 | ** | |||||||
5818795-C-T | 5950754-C-T | ** | ||||||||
5874203-T-C | 6006162-T-C | ** | ||||||||
5911306-T-C | 6043265-T-C | ** | ||||||||
5922163-C-A | 6054122-C-A | FGC62783 | ** | |||||||
5931747-T-G | 6063706-T-G | ** | ||||||||
6012564-T-C | 6144523-T-C | ** | ||||||||
6018152-A-G | 6150111-A-G | ** | ||||||||
6028386-C-A | 6160345-C-A | ** | ||||||||
6134708-A-C | 6266667-A-C | ** | ||||||||
6210905-A-AG | 6342864-A-AG | IR3_Dst | ** | |||||||
6355792-G-T | 6487751-G-T | ** | ||||||||
6374305-G-C | 6506264-G-C | ** | ||||||||
6434581-T-G | 6566540-T-G | ** | ||||||||
6434612-C-T | 6566571-C-T | ** | ||||||||
6454693-G-A | 6586652-G-A | ** | ||||||||
6474777-A-C | 6606736-A-C | ** | ||||||||
6510554-A-C | 6642513-A-C | ** | ||||||||
6533824-T-A | 6665783-T-A | ** | ||||||||
6533888-C-G | 6665847-C-G | ** | ||||||||
6618269-A-G | 6750228-A-G | ** | ||||||||
6618274-T-C | 6750233-T-C | ** | ||||||||
6618284-T-A | 6750243-T-A | ** | ||||||||
6618294-T-A | 6750253-T-A | ** | ||||||||
6618295-A-G | 6750254-A-G | ** | ||||||||
6619552-C-A | 6751511-C-A | ** | ||||||||
6619557-C-T | 6751516-C-T | ** | ||||||||
6709980-T-A | 6841939-T-A | ** | ||||||||
6713483-T-G | 6845442-T-G | ** | ||||||||
6713651-T-G | 6845610-T-G | ** | ||||||||
6731347-C-A | 6863306-C-A | ** | ||||||||
6757109-G-C | 6889068-G-C | ** | ||||||||
6776129-C-A | 6908088-C-A | ** | ||||||||
6882144-T-C | 7014103-T-C | ** | ||||||||
6920791-A-G | 7052750-A-G | ** | ||||||||
6934763-G-T | 7066722-G-T | ** | ||||||||
7002441-T-A | 7134400-T-A | ** | ||||||||
7110995-T-A | 7242954-T-A | ** | ||||||||
7111014-C-A | 7242973-C-A | ** | ||||||||
7150746-C-A | 7282705-C-A | ** | ||||||||
7188289-C-A | 7320248-C-A | ** | ||||||||
7188335-C-A | 7320294-C-A | ** | ||||||||
7241127-A-G | 7373086-A-G | ** | ||||||||
7241892-G-T | 7373851-G-T | ** | ||||||||
7296133-G-A | 7428092-G-A | ** | ||||||||
7320439-C-A | 7452398-C-A | ** | ||||||||
7340888-T-C | 7472847-T-C | ** | ||||||||
7385848-C-A | 7517807-C-A | ** | ||||||||
7451322-TTG-T | 7583281-TTG-T | IR1_L | ** | |||||||
7579730-C-T | 7711689-C-T | ** | ||||||||
7621231-G-A | 7753190-G-A | ** | ||||||||
7756864-C-A | 7888823-C-A | ** | ||||||||
7758298-C-A | 7890257-C-A | ** | ||||||||
7824721-C-T | 7956680-C-T | ** | ||||||||
7869078-G-T | 8001037-G-T | ** | ||||||||
7897713-C-A | 8029672-C-A | ** | ||||||||
7986061-TA-T | 8118020-TA-T | 8×A | ** | |||||||
8044641-C-T | 8176600-C-T | ** | ||||||||
8138044-G-A | 8270003-G-A | ** | ||||||||
8660419-C-A | 8792378-C-A | ** | ||||||||
8673239-C-A | 8805198-C-A | ** | ||||||||
8673981-C-A | 8805940-C-A | FT19954 | ** | |||||||
8725168-C-A | 8857127-C-A | ** | ||||||||
8725218-C-T | 8857177-C-T | ** | ||||||||
8725224-T-A | 8857183-T-A | ** | ||||||||
8856891-C-T | 8988850-C-T | ** | ||||||||
9056526-TA-T | ** | |||||||||
9109370-G-T | ** | |||||||||
9111468-G-T | ** | |||||||||
9030370-G-T | 9192761-G-T | ** | ||||||||
9040318-T-G | 9202709-T-G | ** | ||||||||
9414409-C-A | 9576800-C-A | ** | ||||||||
9521270-T-C | 9683661-T-C | ** | ||||||||
9639088-G-T | 9801479-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9889372-G-A | 10051763-G-A | ** | ||||||||
9900255-G-A | 10062646-G-A | ** | ||||||||
9925025-T-G | 10087416-T-G | ** | ||||||||
9925142-G-T | 10087533-G-T | ** | ||||||||
9931484-C-A | 10093875-C-A | ** | ||||||||
9955447-C-A | 10117838-C-A | ** | ||||||||
10015958-C-A | 10178349-C-A | ** | ||||||||
10028447-C-A | 10190838-C-A | ** | ||||||||
10652357-T-A | ** | |||||||||
10653873-C-A | ** | |||||||||
10654564-T-A | ** | |||||||||
10657677-A-T | ** | |||||||||
10657686-A-T | ** | |||||||||
10658127-C-T | ** | |||||||||
10659704-T-C | ** | |||||||||
10659707-T-A | ** | |||||||||
10659709-A-C | ** | |||||||||
10659713-T-C | ** | |||||||||
10659714-CAACCA-C | ** | |||||||||
10659728-G-C | ** | |||||||||
10659734-A-C | FGC80778 | ** | ||||||||
10659736-C-T | ** | |||||||||
10659745-A-T | ** | |||||||||
10659748-C-T | ** | |||||||||
10659753-T-C | ** | |||||||||
10659764-C-T | ** | |||||||||
10660770-C-G | ** | |||||||||
10660775-C-CAATCGAGTTG | ** | |||||||||
10666843-C-G | ** | |||||||||
10666993-CCG-C | ** | |||||||||
10668338-T-C | ** | |||||||||
10673451-C-T | ** | |||||||||
10673714-A-C | ** | |||||||||
10685376-C-G | ** | |||||||||
10687709-G-A | ** | |||||||||
10748199-C-G | ** | |||||||||
10748222-TG-T | ** | |||||||||
10748231-C-CG | ** | |||||||||
10752165-A-C | ** | |||||||||
10754215-A-C | ** | |||||||||
10754231-A-G | ** | |||||||||
10757256-T-C | ** | |||||||||
10761158-C-A | ** | |||||||||
10764907-C-A | ** | |||||||||
10770113-C-A | ** | |||||||||
10775323-C-A | ** | |||||||||
10778147-G-A | ** | |||||||||
10779679-C-A | ** | |||||||||
10780155-C-T | ** | |||||||||
10780257-C-A | ** | |||||||||
10782775-G-A | ** | |||||||||
10783816-C-A | ** | |||||||||
10801890-C-A | ** | |||||||||
10803419-A-G | ** | |||||||||
10805031-T-G | ** | |||||||||
10811320-CATTCA-C | ** | |||||||||
10811334-C-CGACCT | ** | |||||||||
10815682-T-A | ** | |||||||||
10815688-T-C | ** | |||||||||
10815693-T-C | ** | |||||||||
10815703-A-C | ** | |||||||||
10815705-G-C | ** | |||||||||
10818956-A-C | ** | |||||||||
10820151-A-G | ** | |||||||||
10824892-A-G | ** | |||||||||
10824922-C-A | ** | |||||||||
10829083-C-A | ** | |||||||||
10829794-T-C | ** | |||||||||
10829799-C-T | ** | |||||||||
10830964-T-C | ** | |||||||||
10833759-C-A | ** | |||||||||
10836514-C-T | ** | |||||||||
10836520-A-C | ** | |||||||||
10842049-C-T | ** | |||||||||
10842050-A-G | ** | |||||||||
10847491-C-A | ** | |||||||||
10848883-A-G | ** | |||||||||
10850783-T-C | ** | |||||||||
10866391-C-G | ** | |||||||||
10868672-T-G | ** | |||||||||
10870026-G-C | ** | |||||||||
10879550-C-A | ** | |||||||||
10882834-T-C | ** | |||||||||
10894029-T-C | ** | |||||||||
10899100-C-T | ** | |||||||||
10899891-C-A | ** | |||||||||
10900564-C-A | ** | |||||||||
10912361-G-T | ** | |||||||||
10930302-T-C | ** | |||||||||
10934707-A-T | ** | |||||||||
10941634-C-A | ** | |||||||||
10945283-A-ATCAAGTTGAT | ** | |||||||||
10945466-C-T | ** | |||||||||
10945495-C-A | ** | |||||||||
10948903-C-A | ** | |||||||||
10961466-C-A | ** | |||||||||
10968258-C-A | FT438524 | ** | ||||||||
10976247-T-C | ** | |||||||||
10985341-C-G | ** | |||||||||
10989464-C-CCACCA | ** | |||||||||
10996454-A-T | ** | |||||||||
10998398-T-C | ** | |||||||||
10998915-C-T | ** | |||||||||
10998917-C-G | ** | |||||||||
10998960-G-T | ** | |||||||||
11004162-T-C | ** | |||||||||
11006319-G-T | ** | |||||||||
11007280-C-T | ** | |||||||||
11010689-C-T | ** | |||||||||
11022984-C-CCAT | ** | |||||||||
11031308-T-A | ** | |||||||||
13201730-G-A | 11046054-G-A | ** | ||||||||
13201734-A-G | 11046058-A-G | ** | ||||||||
13201749-T-C | 11046073-T-C | ** | ||||||||
13201754-C-T | 11046078-C-T | ** | ||||||||
13201755-A-T | 11046079-A-T | ** | ||||||||
13201757-A-T | 11046081-A-T | ** | ||||||||
13201759-C-T | 11046083-C-T | ** | ||||||||
13201760-A-G | 11046084-A-G | ** | ||||||||
13201769-A-G | 11046093-A-G | ** | ||||||||
13201777-A-C | 11046101-A-C | ** | ||||||||
13201787-T-C | 11046111-T-C | ** | ||||||||
13276669-T-G | 11120993-T-G | ** | ||||||||
13290866-G-C | 11135190-G-C | ** | ||||||||
13329101-C-A | 11173425-C-A | ** | ||||||||
13429895-A-T | 11274219-A-T | ** | ||||||||
13433612-T-C | 11277936-T-C | ** | ||||||||
13442808-A-G | 11287132-A-G | ** | ||||||||
13466289-G-T | 11310613-G-T | ** | ||||||||
13466300-G-A | 11310624-G-A | ** | ||||||||
13466301-G-T | 11310625-G-T | ** | ||||||||
13487712-G-C | 11332036-G-C | ** | ||||||||
13493193-G-A | 11337517-G-A | ** | ||||||||
13577972-T-G | 11422296-T-G | ** | ||||||||
13579686-CA-C | 11424010-CA-C | ** | ||||||||
13579715-C-A | 11424039-C-A | ** | ||||||||
13588217-TATATATATTTTTTTTTTTTCCA-T | 11432541-TATATATATTTTTTTTTTTTCCA-T | ** | ||||||||
13588307-C-A | 11432631-C-A | ** | ||||||||
13624178-C-T | 11468502-C-T | ** | ||||||||
13624835-C-A | 11469159-C-A | ** | ||||||||
13633082-G-T | 11477406-G-T | ** | ||||||||
13637454-C-A | 11481778-C-A | ** | ||||||||
11644559-A-G | ** | |||||||||
11646102-C-A | ** | |||||||||
11650004-C-A | ** | |||||||||
11651210-T-G | ** | |||||||||
11651776-C-A | ** | |||||||||
11656892-A-G | ** | |||||||||
11659493-A-G | ** | |||||||||
11664507-A-T | ** | |||||||||
11668152-T-C | ** | |||||||||
11676600-A-G | ** | |||||||||
13803999-T-A | 11683293-T-A | ** | ||||||||
13854651-T-A | 11733945-T-A | ** | ||||||||
13857396-G-T | 11736690-G-T | ** | ||||||||
13885812-C-A | 11765106-C-A | ** | ||||||||
13900386-C-A | 11779680-C-A | ** | ||||||||
13963101-C-A | 11842395-C-A | ** | ||||||||
13999173-C-A | 11878467-C-A | ** | ||||||||
14012647-A-G | 11891941-A-G | ** | ||||||||
14038109-G-T | 11917403-G-T | ** | ||||||||
14067021-T-A | 11946315-T-A | ** | ||||||||
14120989-A-G | 12000283-A-G | ** | ||||||||
14187030-A-C | 12066324-A-C | ** | ||||||||
14225266-C-A | 12104560-C-A | ** | ||||||||
14251706-C-A | 12131000-C-A | ** | ||||||||
14351224-G-C | 12230519-G-C | ** | ||||||||
14353853-A-G | 12233148-A-G | ** | ||||||||
14387778-C-A | 12267074-C-A | ** | ||||||||
14431329-C-A | 12310602-C-A | ** | ||||||||
14464450-C-G | 12343723-C-G | ** | ||||||||
14519007-C-A | 12407208-C-A | ** | ||||||||
14567594-C-A | 12455794-C-A | ** | ||||||||
14575908-A-G | 12464108-A-G | ** | ||||||||
14613826-T-G | 12502024-T-G | ** | ||||||||
14721557-C-A | 12609625-C-A | ** | ||||||||
14760891-T-A | 12648960-T-A | ** | ||||||||
14823515-A-T | 12711582-A-T | ** | ||||||||
14960118-T-C | 12848193-T-C | ** | ||||||||
15132070-T-C | 13020157-T-C | ** | ||||||||
15138162-C-A | 13026249-C-A | ** | ||||||||
15168128-C-T | 13056214-C-T | ** | ||||||||
15185164-C-A | 13073250-C-A | ** | ||||||||
15209330-A-T | 13097416-A-T | ** | ||||||||
15219077-C-A | 13107163-C-A | ** | ||||||||
15220966-C-A | 13109052-C-A | ** | ||||||||
15392408-T-G | 13280528-T-G | ** | ||||||||
15396902-C-A | 13285022-C-A | ** | ||||||||
15397777-A-G | 13285897-A-G | ** | ||||||||
15403451-G-A | 13291571-G-A | ** | ||||||||
15424339-C-A | 13312459-C-A | ** | ||||||||
15541706-C-A | 13429826-C-A | ** | ||||||||
15606588-A-T | 13494708-A-T | ** | ||||||||
15629655-T-G | 13517775-T-G | ** | ||||||||
15662833-T-G | 13550953-T-G | ** | ||||||||
15682961-G-A | 13571081-G-A | ** | ||||||||
15696819-A-C | 13584939-A-C | ** | ||||||||
15770612-T-A | 13658732-T-A | ** | ||||||||
15792728-C-A | 13680848-C-A | ** | ||||||||
15816455-C-A | 13704575-C-A | ** | ||||||||
15937201-A-T | 13825321-A-T | ** | ||||||||
16002236-T-C | 13890356-T-C | ** | ||||||||
16017455-A-G | 13905575-A-G | ** | ||||||||
16040988-T-G | 13929108-T-G | ** | ||||||||
16320118-C-T | 14208238-C-T | ** | ||||||||
16354874-AAAAAAAAAG-A | 14242994-AAAAAAAAAG-A | ** | ||||||||
16354895-A-G | 14243015-A-G | ** | ||||||||
16474750-C-A | 14362870-C-A | ** | ||||||||
16503175-G-A | 14391295-G-A | ** | ||||||||
16506896-A-T | 14395016-A-T | ** | ||||||||
16635964-C-T | 14524084-C-T | ** | ||||||||
16665469-T-C | 14553589-T-C | ** | ||||||||
16682706-G-A | 14570826-G-A | ** | ||||||||
16701634-G-T | 14589754-G-T | ** | ||||||||
16743091-C-A | 14631211-C-A | FT274377 | ** | |||||||
16938381-C-A | 14826501-C-A | ** | ||||||||
17036797-T-C | 14924917-T-C | ** | ||||||||
17060739-G-A | 14948859-G-A | ** | ||||||||
17175367-CT-C | 15063487-CT-C | ** | ||||||||
17250957-A-G | 15139077-A-G | ** | ||||||||
17337616-C-A | 15225736-C-A | ** | ||||||||
17362786-C-A | 15250906-C-A | ** | ||||||||
17373314-G-T | 15261434-G-T | ** | ||||||||
17375739-C-T | 15263859-C-T | ** | ||||||||
17481279-C-A | 15369399-C-A | ** | ||||||||
17575515-T-A | 15463635-T-A | ** | ||||||||
17575530-C-T | 15463650-C-T | ** | ||||||||
17588975-G-T | 15477095-G-T | ** | ||||||||
17638304-C-A | 15526424-C-A | ** | ||||||||
17684442-A-G | 15572562-A-G | ** | ||||||||
17713944-C-A | 15602064-C-A | ** | ||||||||
17741271-C-G | 15629391-C-G | ** | ||||||||
17782607-G-T | 15670727-G-T | ** | ||||||||
17950759-T-A | 15838879-T-A | ** | ||||||||
17963631-C-A | 15851751-C-A | ** | ||||||||
18053517-C-A | 15941637-C-A | ** | ||||||||
18071878-A-G | 15959998-A-G | ** | ||||||||
18080583-C-T | 15968703-C-T | ** | ||||||||
18139546-T-C | 16027666-T-C | ** | ||||||||
18143749-C-T | 16031869-C-T | ** | ||||||||
18292870-C-A | 16180990-C-A | P6_Prx | ** | |||||||
18344527-A-AT | 16232647-A-AT | P6_Prx | ** | |||||||
18411826-A-G | 16299946-A-G | P6_Gap | ** | |||||||
18547004-C-T | 16435124-C-T | FT389407 | ** | |||||||
18625428-T-G | 16513548-T-G | ** | ||||||||
18627446-C-T | 16515566-C-T | ** | ||||||||
18650553-C-A | 16538673-C-A | ** | ||||||||
18653481-T-C | 16541601-T-C | ** | ||||||||
18793966-C-A | 16682086-C-A | ** | ||||||||
18961527-C-A | 16849647-C-A | ** | ||||||||
18961533-A-T | 16849653-A-T | ** | ||||||||
18972073-G-A | 16860193-G-A | ** | ||||||||
19012608-C-A | 16900728-C-A | ** | ||||||||
19097223-T-A | 16985343-T-A | ** | ||||||||
19189500-T-G | 17077620-T-G | ** | ||||||||
19189524-T-G | 17077644-T-G | ** | ||||||||
19189530-C-T | 17077650-C-T | ** | ||||||||
19189587-A-ACC | 17077707-A-ACC | ** | ||||||||
19189600-A-G | 17077720-A-G | ** | ||||||||
19189606-C-T | 17077726-C-T | ** | ||||||||
19218255-A-G | 17106375-A-G | ** | ||||||||
19300927-T-C | 17189047-T-C | ** | ||||||||
19310211-G-C | 17198331-G-C | ** | ||||||||
19310218-C-A | 17198338-C-A | ** | ||||||||
19409982-C-A | 17298102-C-A | MF1331 FGC70712 | ** | |||||||
19423853-C-A | 17311973-C-A | ** | ||||||||
19532551-G-A | 17420671-G-A | ** | ||||||||
19592215-T-A | 17480335-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19733249-C-A | 17621369-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19733307-C-CT | 17621427-C-CT | P5_Prx | ** | |||||||
19753848-C-A | 17641968-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19758720-T-G | 17646840-T-G | P5_Prx | ** | |||||||
19827549-C-A | 17715669-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19839943-T-A | 17728063-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19878155-A-AC | 17766275-A-AC | P5_Prx | ** | |||||||
19878182-A-C | 17766302-A-C | P5_Prx | ** | |||||||
20094661-G-GT | 17982781-G-GT | P5_Dst | ** | |||||||
20137213-G-T | 18025333-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20199908-A-T | 18038022-A-T | P5_Dst | ** | |||||||
20300937-A-G | 18139051-A-G | P5_Dst | ** | |||||||
20343239-G-A | 18181353-G-A | P5_Dst | ** | |||||||
20343242-G-GT | 18181356-G-GT | P5_Dst | ** | |||||||
20438741-C-T | 18276855-C-T | P5_Dst | ** | |||||||
20569487-A-T | 18407601-A-T | P5_Dst | ** | |||||||
20569492-A-G | 18407606-A-G | P5_Dst | ** | |||||||
20569507-C-T | 18407621-C-T | P5_Dst | ** | |||||||
20569516-G-A | 18407630-G-A | P5_Dst | ** | |||||||
20612025-A-C | 18450139-A-C | P5_Dst | ** | |||||||
20645832-T-G | 18483946-T-G | P4_Prx | ** | |||||||
20755551-C-A | 18593665-C-A | P4_Prx | ** | |||||||
20781053-C-A | 18619167-C-A | P4_Prx | ** | |||||||
21106891-C-A | 18945005-C-A | ** | ||||||||
21133489-T-C | 18971603-T-C | ** | ||||||||
21148578-T-G | 18986692-T-G | ** | ||||||||
21152300-C-A | 18990414-C-A | ** | ||||||||
21152368-A-G | 18990482-A-G | ** | ||||||||
21187827-C-T | 19025941-C-T | FT252395 | ** | |||||||
21387210-T-C | 19225324-T-C | ** | ||||||||
21438178-C-T | 19276292-C-T | ** | ||||||||
21438188-C-T | 19276302-C-T | ** | ||||||||
21438190-C-A | 19276304-C-A | ** | ||||||||
21438192-G-A | 19276306-G-A | ** | ||||||||
21554525-A-G | 19392639-A-G | Y76731 | ** | |||||||
21574078-G-C | 19412192-G-C | Y27954 | ** | |||||||
21584043-C-A | 19422157-C-A | ** | ||||||||
21614763-G-A | 19452877-G-A | ** | ||||||||
21700333-C-A | 19538447-C-A | ** | ||||||||
21773755-A-C | 19611869-A-C | ** | ||||||||
21880969-T-C | 19719083-T-C | ** | ||||||||
21890982-C-A | 19729096-C-A | ** | ||||||||
21949879-C-A | 19787993-C-A | ** | ||||||||
21958503-C-G | 19796617-C-G | ** | ||||||||
22052458-C-A | 19890572-C-A | ** | ||||||||
22176137-A-G | 20014251-A-G | ** | ||||||||
22255148-C-A | 20093262-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22263910-G-C | 20102024-G-C | DYZ19 | ** | |||||||
22263930-A-T | 20102044-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
22517797-A-T | 20355911-A-T | ** | ||||||||
22517822-T-C | 20355936-T-C | ** | ||||||||
22775095-G-T | 20613209-G-T | ** | ||||||||
22775133-T-C | 20613247-T-C | ** | ||||||||
22797970-G-T | 20636084-G-T | ** | ||||||||
22803969-G-C | 20642083-G-C | ** | ||||||||
22810795-C-A | 20648909-C-A | ** | ||||||||
22842143-C-A | 20680257-C-A | ** | ||||||||
22994743-A-C | 20832857-A-C | ** | ||||||||
23017080-A-G | 20855194-A-G | ** | ||||||||
23185967-C-A | 21024081-C-A | ** | ||||||||
23201021-C-A | 21039135-C-A | ** | ||||||||
23201165-G-T | 21039279-G-T | ** | ||||||||
23202817-A-G | 21040931-A-G | ** | ||||||||
23241975-G-C | 21080089-G-C | ** | ||||||||
23262734-G-C | 21100848-G-C | ** | ||||||||
23262742-C-T | 21100856-C-T | ** | ||||||||
23262749-A-G | 21100863-A-G | ** | ||||||||
23358755-C-T | 21196869-C-T | ** | ||||||||
23358758-T-C | 21196872-T-C | ** | ||||||||
23373118-T-A | 21211232-T-A | ** | ||||||||
23442510-A-T | 21280624-A-T | ** | ||||||||
23442631-A-G | 21280745-A-G | ** | ||||||||
23442716-T-C | 21280830-T-C | ** | ||||||||
23516457-C-A | 21354571-C-A | ** | ||||||||
23603303-A-C | 21441417-A-C | ** | ||||||||
23831309-G-A | 21669423-G-A | ** | ||||||||
23831312-C-A | 21669426-C-A | ** | ||||||||
23831307-CCGGACTG-C | 21669421-CCGGACTG-C | ** | ||||||||
23831327-G-A | 21669441-G-A | ** | ||||||||
23831330-C-T | 21669444-C-T | ** | ||||||||
23831360-C-A | 21669474-C-A | ** | ||||||||
23961251-C-A | 21815104-C-A | ** | ||||||||
24376296-G-C | 22230149-G-C | ** | ||||||||
24404986-T-C | 22258839-T-C | ** | ||||||||
24450531-A-G | 22304384-A-G | ** | ||||||||
24627794-C-T | 22481647-C-T | P3_t2 | ** | |||||||
24627798-T-TTGGGGC | 22481651-T-TTGGGGC | P3_t2 | ** | |||||||
25560752-G-T | 23414605-G-T | P1_gr1 | ** | |||||||
26036178-A-AG | 23890031-A-AG | P1_Y1 | ** | |||||||
26133086-C-T | 23986939-C-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26428077-A-G | 24281930-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26428082-T-A | 24281935-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26428090-G-A | 24281943-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26428136-T-TG | 24281989-T-TG | P1_Y1 | ** | |||||||
26722566-C-A | 24576419-C-A | P1_g2 | ** | |||||||
26928266-A-G | 24782119-A-G | P1_r3 | ** | |||||||
26928283-C-G | 24782136-C-G | P1_r3 | ** | |||||||
26928293-T-G | 24782146-T-G | P1_r3 | ** | |||||||
27964982-T-A | 25818835-T-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27982176-AT-A | 25836029-AT-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27982180-TTA-T | 25836033-TTA-T | P1_Y2 | ** | |||||||
28466400-A-G | 26320253-A-G | ** | ||||||||
28468526-A-G | 26322379-A-G | ** | ||||||||
28468531-T-C | 26322384-T-C | ** | ||||||||
28480209-CAAA-C | 26334062-CAAA-C | 12×A | ** | |||||||
28499993-A-G | 26353846-A-G | ** | ||||||||
28533878-A-T | 26387731-A-T | ** | ||||||||
28549885-G-A | 26403738-G-A | ** | ||||||||
28555516-C-A | 26409369-C-A | ** | ||||||||
28570509-C-A | 26424362-C-A | ** | ||||||||
28570560-C-A | 26424413-C-A | ** | ||||||||
28610307-T-G | 26464160-T-G | ** | ||||||||
28611557-C-A | 26465410-C-A | ** | ||||||||
28614250-G-A | 26468103-G-A | ** | ||||||||
28618339-C-A | 26472192-C-A | ** | ||||||||
28657916-GA-G | 26511769-GA-G | ** | ||||||||
28664927-C-A | 26518780-C-A | FT340765 | ** | |||||||
28674150-C-A | 26528003-C-A | ** | ||||||||
28714488-G-A | 26568341-G-A | Y129655 | ** | |||||||
28763820-T-C | 26617673-T-C | ** | ||||||||
28773737-T-C | 26627590-T-C | ** | ||||||||
56823266-G-T | ** | |||||||||
56844312-T-A | ** | |||||||||
56858717-G-T | ** | |||||||||
29469-G-A | ** | |||||||||
36498-G-A | ** | |||||||||
3980645-C-A | 4112604-C-A | ** | ||||||||
13722737-A-G | 11567061-A-G | ** | ||||||||
6112880-A-C | 6244839-A-C | ** | ||||||||
18465469-GA-G | 16353589-GA-G | P6_Dst | 26×A | ** | ||||||
26383340-CTTTT-C | 24237193-CTTTT-C | P1_Y1 | 16×T | ** | ||||||
4976638-A-C | 5108597-A-C | ** | ||||||||
5114789-A-T | 5246748-A-T | ** | ||||||||
5813697-T-C | 5945656-T-C | ** | ||||||||
8815044-T-A | 8947003-T-A | ** | ||||||||
13443723-T-G | 11288047-T-G | ** | ||||||||
13443725-C-T | 11288049-C-T | ** | ||||||||
17813179-C-G | 15701299-C-G | ** | ||||||||
18134844-G-T | 16022964-G-T | ** | ||||||||
20985822-A-AC | 18823936-A-AC | P4_Dst | ** | |||||||
21075997-T-C | 18914111-T-C | ** | ||||||||
28818188-A-G | 26672041-A-G | ** | ||||||||
13402403-C-T | 11246727-C-T | *** | ||||||||
13422516-A-AGTGTGTGT | 11266840-A-AGTGTGTGT | *** | ||||||||
13466220-C-T | 11310544-C-T | *** | ||||||||
58848117-G-T | 56742754-C-A | *** | ||||||||
13801542-CGGAAT-C | 11680836-CGGAAT-C | *** | ||||||||
13828665-C-T | 11707959-C-T | 4×GAATG | *** | |||||||
58981143-C-G | 56834996-C-G | *** | ||||||||
22464147-G-T | 20302261-G-T | BY43920 | DYZ19 | *** | ||||||
6402278-C-A | 6534237-C-A | *** | ||||||||
22464171-G-T | 20302285-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
22438780-T-G | 20276894-T-G | BY218580 | DYZ19 | *** | ||||||
22464143-C-T | 20302257-C-T | DYZ19 | *** | |||||||
15612143-C-CAT | 13500263-C-CAT | *** | ||||||||
13450508-CCACTCCACTCCACTT-C,CCACTCCACTCCAATC | 11294832-CCACTCCACTCCACTT-C,CCACTCCACTCCAATC | *** | ||||||||
3986084-A-C | 4118043-A-C | FGC65580 | *** | |||||||
13143335-C-G | 10632821-C-G | *** | ||||||||
17645557-G-A | 15533677-G-A | *** | ||||||||
22436171-G-C | 20274285-G-C | DYZ19 | *** | |||||||
58972979-GATTCCATTCCATTCGATTCCATTCCATTCA-G,GATTCTATTCCATTCTATTCCATTCAATTCG | 56826832-GATTCCATTCCATTCGATTCCATTCCATTCA-G,GATTCTATTCCATTCTATTCCATTCAATTCG | *** | ||||||||
22756061-G-A | 20594175-G-A | *** | ||||||||
15404329-GAA-G | 13292449-GAA-G | 13×A | *** | |||||||
14036101-C-T | 11915395-C-T | *** | ||||||||
14036102-G-C | 11915396-G-C | *** | ||||||||
14036105-A-C | 11915399-A-C | *** | ||||||||
10942958-T-A | *** | |||||||||
21555238-CTTTT-C | 19393352-CTTTT-C | 15×T | *** | |||||||
15479964-G-TT | 13368084-G-TT | *** | ||||||||
10653078-C-A | *** | |||||||||
10992979-C-T | *** | |||||||||
10893495-GTCCAT-G | *** | |||||||||
10946527-T-C | *** | |||||||||
5524481-ATTT-A | 5656440-ATTT-A | 13×T | *** | |||||||
8878936-TAA-T | 9010895-TAA-T | 12×A | *** | |||||||
11020145-C-A | *** | |||||||||
14036087-C-T | 11915381-C-T | *** | ||||||||
21207067-C-A | 19045181-C-A | *** | ||||||||
22542662-C-G | 20380776-C-G | *** | ||||||||
23773422-G-T | 21611536-G-T | *** | ||||||||
10942723-T-A,G | *** | |||||||||
22508643-G-C | 20346757-G-C | BY196894 | DYZ19 | *** | ||||||
2884462-G-T | 3016421-G-T | *** | ||||||||
3334417-G-T | 3466376-G-T | *** | ||||||||
3986089-T-TC | 4118048-T-TC | *** | ||||||||
3986092-G-A | 4118051-G-A | *** | ||||||||
4065399-C-A | 4197358-C-A | *** | ||||||||
4254761-T-A | 4386720-T-A | *** | ||||||||
5830171-C-A | 5962130-C-A | *** | ||||||||
6642373-C-A | 6774332-C-A | Y82216 | *** | |||||||
6751993-A-G | 6883952-A-G | *** | ||||||||
7287797-T-C | 7419756-T-C | *** | ||||||||
7298878-G-A | 7430837-G-A | *** | ||||||||
7861458-A-G | 7993417-A-G | Y62715 | *** | |||||||
8085760-A-C | 8217719-A-C | *** | ||||||||
8705698-CTTTTT-C | 8837657-CTTTTT-C | 16×T | *** | |||||||
10660996-C-A | *** | |||||||||
10679256-CCAATT-C | *** | |||||||||
10744475-ATTC-A,ACCACACTC | *** | |||||||||
10762961-C-T | *** | |||||||||
10800604-C-A | *** | |||||||||
10895898-C-A | *** | |||||||||
10918244-T-A | *** | |||||||||
10918336-G-T | *** | |||||||||
10946059-C-T | *** | |||||||||
10987473-C-A | *** | |||||||||
10989880-C-A | *** | |||||||||
13202601-C-A | 11046925-C-A | *** | ||||||||
13643378-C-T | 11487702-C-T | *** | ||||||||
13643384-G-A | 11487708-G-A | *** | ||||||||
11659975-T-G | *** | |||||||||
13801509-G-T | 11680803-G-T | *** | ||||||||
14180742-G-A | 12060036-G-A | *** | ||||||||
15073262-G-T | 12961352-G-T | *** | ||||||||
15150866-T-C | 13038953-T-C | *** | ||||||||
15368964-C-A | 13257084-C-A | *** | ||||||||
16171322-C-A | 14059442-C-A | *** | ||||||||
16245955-G-T | 14134075-G-T | *** | ||||||||
16623654-G-T | 14511774-G-T | *** | ||||||||
16719959-C-A | 14608079-C-A | *** | ||||||||
17414662-T-A | 15302782-T-A | *** | ||||||||
17707065-GA-G | 15595185-GA-G | 9×A | *** | |||||||
18121842-C-A | 16009962-C-A | *** | ||||||||
18255968-G-T | 16144088-G-T | *** | ||||||||
18627684-C-A | 16515804-C-A | *** | ||||||||
19377017-C-A | 17265137-C-A | *** | ||||||||
19377024-T-C | 17265144-T-C | *** | ||||||||
21148535-G-GCC | 18986649-G-GCC | *** | ||||||||
21148541-T-A | 18986655-T-A | *** | ||||||||
21148543-T-A | 18986657-T-A | *** | ||||||||
21153155-C-A | 18991269-C-A | *** | ||||||||
21921850-C-A | 19759964-C-A | *** | ||||||||
23200663-T-C | 21038777-T-C | *** | ||||||||
27007846-A-G | 24861699-A-G | P1_r4 | *** | |||||||
56835253-C-A | *** | |||||||||
5312310-T-TA | 5444269-T-TA | 11×A | *** | |||||||
17387651-GT-G | 15275771-GT-G | 10×T | *** | |||||||
7148013-CT-C,CTT | 7279972-CT-C,CTT | 17×T | *** | |||||||
15297284-AT-A | 13185383-AT-A | 27×T | *** | |||||||
13459057-A-G | 11303381-A-G | *** | ||||||||
17109140-AC-A | 14997260-AC-A | *** | ||||||||
3208375-A-G | 3340334-A-G | *** | ||||||||
9120876-ATTTTT-A | *** | |||||||||
9799134-CAAAAA-C,CAAAA | 9961525-CAAAAA-C,CAAAA | 24×A | *** | |||||||
10020079-T-C | 10182470-T-C | *** | ||||||||
15622642-T-C | 13510762-T-C | *** | ||||||||
19204303-G-A | 17092423-G-A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.