McRae
FTDNA: 407826, BigY3: 407826, BigY2: 407826, YFull-BigY: YF04698, ySearch: 8RQ8GTree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 407826 | BigY3 407826 | BigY2 407826 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
4976524-T-C | 5108483-T-C | YFS030521 Z7108 | A* | |||||||
58990546-T-A | 56844399-T-A | A* | ||||||||
56844408-C-A | A* | |||||||||
56844409-A-C | A* | |||||||||
56830859-C-G | A* | |||||||||
28816557-T-A | 26670410-T-A | A* | ||||||||
13451013-A-T | 11295337-A-T | A* | ||||||||
13447906-C-A | 11292230-C-A | A* | ||||||||
56837804-C-T | A* | |||||||||
14973694-A-G | 12861769-A-G | Y50129 | Y | Y | + | + | + | |||
21843209-T-C | 19681323-T-C | Y57272 | Y | Y | + | + | + | |||
22021096-C-T | 19859210-C-T | Y57523 | Y | Y | + | + | + | |||
23993471-T-C | 21847324-T-C | Y59680 | + | + | + | |||||
4033884-G-T | 4165843-G-T | * | ||||||||
24278254-GAA-G | 22132107-GAA-G | P3_b1 | ** | |||||||
16016838-A-G | 13904958-A-G | PF767 | ** | ** | ||||||
58844623-T-C | 56746248-A-G | ** | ||||||||
13484397-T-C | 11328721-T-C | ** | ||||||||
59003761-A-AAC | 56857614-A-AAC | ** | ||||||||
3732733-C-A | 3864692-C-A | ** | ||||||||
13859077-C-A | 11738371-C-A | ** | ||||||||
18253323-T-C | 16141443-T-C | FT297639 | ** | |||||||
22520787-TCA-T | 20358901-TCA-T | ** | ||||||||
5937632-CCACA-C | 6069591-CCACA-C | 14×CA | ** | |||||||
18966115-T-C | 16854235-T-C | ** | ||||||||
14785532-CTTTTTT-C | 12673602-CTTTTTT-C | 18×T | ** | |||||||
21515862-CAAAAAAA-C | 19353976-CAAAAAAA-C | 28×A | ** | |||||||
10986653-N-A | ** | |||||||||
18825668-G-A | 16713788-G-A | ** | ||||||||
10748326-A-C | ** | |||||||||
2974390-C-A | 3106349-C-A | ** | ||||||||
6828587-C-A | 6960546-C-A | ** | ||||||||
16467592-C-A | 14355712-C-A | ** | ||||||||
7183797-C-A | 7315756-C-A | ** | ||||||||
5894982-A-G | 6026941-A-G | BY50949 | ** | |||||||
10980272-C-T | FT439021 | ** | ||||||||
10980302-C-G | ** | |||||||||
14832192-T-C | 12720259-T-C | ** | ||||||||
10823992-G-T | ** | |||||||||
28815181-G-A | 26669034-G-A | ** | ||||||||
3285833-C-A | 3417792-C-A | ** | ||||||||
13902912-C-A | 11782206-C-A | ** | ||||||||
17006291-C-A | 14894411-C-A | ** | ||||||||
2730019-C-A | 2861978-C-A | ** | ||||||||
2771061-G-T | 2903020-G-T | ** | ||||||||
2795606-C-A | 2927565-C-A | ** | ||||||||
2861491-A-G | 2993450-A-G | ** | ||||||||
2906994-C-A | 3038953-C-A | ** | ||||||||
2915394-A-T | 3047353-A-T | ** | ||||||||
2915400-A-T | 3047359-A-T | ** | ||||||||
2915436-T-A | 3047395-T-A | ** | ||||||||
2928740-A-C | 3060699-A-C | ** | ||||||||
2928753-A-C | 3060712-A-C | ** | ||||||||
2970883-G-T | 3102842-G-T | ** | ||||||||
3061235-C-A | 3193194-C-A | ** | ||||||||
3093889-T-C | 3225848-T-C | ** | ||||||||
3105132-C-A | 3237091-C-A | ** | ||||||||
3105621-C-A | 3237580-C-A | ** | ||||||||
3108365-C-A | 3240324-C-A | ** | ||||||||
3110508-C-A | 3242467-C-A | ** | ||||||||
3127533-G-T | 3259492-G-T | ** | ||||||||
3204066-G-T | 3336025-G-T | ** | ||||||||
3273161-C-A | 3405120-C-A | ** | ||||||||
3276655-A-T | 3408614-A-T | ** | ||||||||
3327361-G-A | 3459320-G-A | ** | ||||||||
3340599-C-A | 3472558-C-A | ** | ||||||||
3341334-C-T | 3473293-C-T | ** | ||||||||
3389652-T-A | 3521611-T-A | ** | ||||||||
3389755-G-C | 3521714-G-C | ** | ||||||||
3404251-C-T | 3536210-C-T | ** | ||||||||
3493016-GT-G | 3624975-GT-G | ** | ||||||||
3500565-C-A | 3632524-C-A | ** | ||||||||
3515531-G-T | 3647490-G-T | ** | ||||||||
3546759-G-T | 3678718-G-T | ** | ||||||||
3564481-C-A | 3696440-C-A | ** | ||||||||
3603416-C-A | 3735375-C-A | ** | ||||||||
3635440-T-C | 3767399-T-C | ** | ||||||||
3641246-C-A | 3773205-C-A | ** | ||||||||
3650115-C-A | 3782074-C-A | ** | ||||||||
3704566-C-A | 3836525-C-A | ** | ||||||||
3758477-C-A | 3890436-C-A | ** | ||||||||
3758480-A-T | 3890439-A-T | ** | ||||||||
3763154-C-A | 3895113-C-A | ** | ||||||||
3831511-A-C | 3963470-A-C | ** | ||||||||
3836484-C-A | 3968443-C-A | ** | ||||||||
3883324-T-C | 4015283-T-C | ** | ||||||||
4014520-G-C | 4146479-G-C | ** | ||||||||
4014552-G-T | 4146511-G-T | ** | ||||||||
4031847-C-A | 4163806-C-A | ** | ||||||||
4093437-C-A | 4225396-C-A | ** | ||||||||
4103264-CA-C | 4235223-CA-C | ** | ||||||||
4108169-C-A | 4240128-C-A | ** | ||||||||
4141790-C-A | 4273749-C-A | ** | ||||||||
4201665-G-A | 4333624-G-A | ** | ||||||||
4204023-G-T | 4335982-G-T | ** | ||||||||
4207980-T-A | 4339939-T-A | ** | ||||||||
4223404-C-A | 4355363-C-A | ** | ||||||||
4256166-C-A | 4388125-C-A | ** | ||||||||
4263645-C-A | 4395604-C-A | ** | ||||||||
4271236-G-C | 4403195-G-C | ** | ||||||||
4271246-A-C | 4403205-A-C | ** | ||||||||
4271261-A-C | 4403220-A-C | ** | ||||||||
4292827-C-A | 4424786-C-A | ** | ||||||||
4374950-C-A | 4506909-C-A | ** | ||||||||
4375171-C-A | 4507130-C-A | ** | ||||||||
4444225-G-T | 4576184-G-T | ** | ||||||||
4460022-T-G | 4591981-T-G | ** | ||||||||
4461217-G-T | 4593176-G-T | ** | ||||||||
4464324-G-T | 4596283-G-T | ** | ||||||||
4506849-G-C | 4638808-G-C | ** | ||||||||
4565697-C-A | 4697656-C-A | ** | ||||||||
4578056-T-G | 4710015-T-G | ** | ||||||||
4578110-A-G | 4710069-A-G | ** | ||||||||
4578123-T-A | 4710082-T-A | ** | ||||||||
4578146-T-G | 4710105-T-G | ** | ||||||||
4605217-C-A | 4737176-C-A | ** | ||||||||
4688097-C-T | 4820056-C-T | ** | ||||||||
4719028-T-A | 4850987-T-A | ** | ||||||||
4721167-C-A | 4853126-C-A | ** | ||||||||
4767340-T-C | 4899299-T-C | ** | ||||||||
4918230-C-A | 5050189-C-A | ** | ||||||||
4957764-C-A | 5089723-C-A | ** | ||||||||
5014013-C-A | 5145972-C-A | ** | ||||||||
5014100-C-A | 5146059-C-A | ** | ||||||||
5030644-G-T | 5162603-G-T | ** | ||||||||
5046665-T-G | 5178624-T-G | ** | ||||||||
5046666-C-A | 5178625-C-A | ** | ||||||||
5046671-T-G | 5178630-T-G | ** | ||||||||
5046685-G-C | 5178644-G-C | ** | ||||||||
5058675-G-T | 5190634-G-T | ** | ||||||||
5096904-C-A | 5228863-C-A | ** | ||||||||
5125782-TA-T | 5257741-TA-T | ** | ||||||||
5126957-T-C | 5258916-T-C | ** | ||||||||
5139410-C-A | 5271369-C-A | ** | ||||||||
5141441-G-T | 5273400-G-T | ** | ||||||||
5146774-G-T | 5278733-G-T | ** | ||||||||
5159693-G-T | 5291652-G-T | ** | ||||||||
5184584-C-A | 5316543-C-A | ** | ||||||||
5195879-T-G | 5327838-T-G | ** | ||||||||
5199710-C-G | 5331669-C-G | ** | ||||||||
5214804-T-C | 5346763-T-C | ** | ||||||||
5220363-C-A | 5352322-C-A | ** | ||||||||
5249926-C-A | 5381885-C-A | ** | ||||||||
5266914-C-A | 5398873-C-A | ** | ||||||||
5378002-G-A | 5509961-G-A | ** | ||||||||
5562344-A-G | 5694303-A-G | ** | ||||||||
5573465-T-C | 5705424-T-C | ** | ||||||||
5608587-G-A | 5740546-G-A | ** | ||||||||
5625569-C-T | 5757528-C-T | ** | ||||||||
5627828-C-A | 5759787-C-A | ** | ||||||||
5659469-G-T | 5791428-G-T | ** | ||||||||
5677828-G-T | 5809787-G-T | ** | ||||||||
5698108-G-T | 5830067-G-T | ** | ||||||||
5750202-C-A | 5882161-C-A | ** | ||||||||
5753844-C-A | 5885803-C-A | ** | ||||||||
5880490-G-T | 6012449-G-T | ** | ||||||||
5880606-G-T | 6012565-G-T | ** | ||||||||
5887587-C-A | 6019546-C-A | ** | ||||||||
5892726-A-T | 6024685-A-T | ** | ||||||||
5904882-G-A | 6036841-G-A | FT69488 | ** | |||||||
5911847-T-A | 6043806-T-A | ** | ||||||||
5913295-G-T | 6045254-G-T | ** | ||||||||
5957097-CA-C | 6089056-CA-C | ** | ||||||||
5972228-C-A | 6104187-C-A | ** | ||||||||
5990361-G-T | 6122320-G-T | ** | ||||||||
6040458-G-T | 6172417-G-T | ** | ||||||||
6085485-T-G | 6217444-T-G | ** | ||||||||
6092318-T-C | 6224277-T-C | ** | ||||||||
6147422-T-C | 6279381-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6312786-T-C | 6444745-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6368552-T-A | 6500511-T-A | ** | ||||||||
6368589-T-A | 6500548-T-A | ** | ||||||||
6368610-A-G | 6500569-A-G | ** | ||||||||
6368616-T-G | 6500575-T-G | ** | ||||||||
6492554-G-A | 6624513-G-A | ** | ||||||||
6582579-A-T | 6714538-A-T | ** | ||||||||
6608156-T-C | 6740115-T-C | ** | ||||||||
6621604-A-T | 6753563-A-T | ** | ||||||||
6646460-C-A | 6778419-C-A | FT251086 | ** | |||||||
6694235-G-A | 6826194-G-A | ** | ||||||||
6731258-C-A | 6863217-C-A | ** | ||||||||
6773157-C-A | 6905116-C-A | ** | ||||||||
6776289-T-G | 6908248-T-G | ** | ||||||||
6833303-A-G | 6965262-A-G | ** | ||||||||
6922605-G-T | 7054564-G-T | ** | ||||||||
6923019-GC-G | 7054978-GC-G | ** | ||||||||
7016096-G-A | 7148055-G-A | ** | ||||||||
7123454-C-A | 7255413-C-A | ** | ||||||||
7135354-C-T | 7267313-C-T | ** | ||||||||
7149000-T-C | 7280959-T-C | ** | ||||||||
7159123-C-A | 7291082-C-A | ** | ||||||||
7162997-C-A | 7294956-C-A | ** | ||||||||
7236542-G-A | 7368501-G-A | FT36435 | ** | |||||||
7237998-T-C | 7369957-T-C | ** | ||||||||
7298278-A-T | 7430237-A-T | ** | ||||||||
7374412-C-A | 7506371-C-A | ** | ||||||||
7385525-G-T | 7517484-G-T | ** | ||||||||
7428332-C-A | 7560291-C-A | ** | ||||||||
7621597-G-C | 7753556-G-C | ** | ||||||||
7621633-C-A | 7753592-C-A | ** | ||||||||
7621687-G-A | 7753646-G-A | ** | ||||||||
7645269-G-A | 7777228-G-A | ** | ||||||||
7645277-G-A | 7777236-G-A | ** | ||||||||
7645281-G-C | 7777240-G-C | ** | ||||||||
7645285-C-T | 7777244-C-T | ** | ||||||||
7645286-T-G | 7777245-T-G | FT75796 | ** | |||||||
7670899-C-A | 7802858-C-A | ** | ||||||||
7758271-C-A | 7890230-C-A | ** | ||||||||
7758321-C-A | 7890280-C-A | ** | ||||||||
7918414-C-A | 8050373-C-A | ** | ||||||||
8078651-G-A | 8210610-G-A | ** | ||||||||
8178891-A-T | 8310850-A-T | ** | ||||||||
8344781-T-C | 8476740-T-C | ** | ||||||||
8379418-T-C | 8511377-T-C | ** | ||||||||
8385255-C-T | 8517214-C-T | ** | ||||||||
8409231-TGG-T | 8541190-TGG-T | ** | ||||||||
8731859-C-A | 8863818-C-A | ** | ||||||||
8773875-T-A | 8905834-T-A | ** | ||||||||
8848291-C-T | 8980250-C-T | ** | ||||||||
9079423-T-C | 9241814-T-C | ** | ||||||||
9220545-C-T | 9382936-C-T | Z39274 | ** | |||||||
9344995-G-A | 9507386-G-A | ** | ||||||||
9401185-C-T | 9563576-C-T | ** | ||||||||
9674772-T-A | 9837163-T-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9773507-CT-C | 9935898-CT-C | ** | ||||||||
9826083-A-G | 9988474-A-G | ** | ||||||||
9830900-C-A | 9993291-C-A | ** | ||||||||
9930857-C-A | 10093248-C-A | ** | ||||||||
9936363-C-A | 10098754-C-A | ** | ||||||||
9940535-A-G | 10102926-A-G | ** | ||||||||
9940961-C-A | 10103352-C-A | ** | ||||||||
9965662-G-T | 10128053-G-T | ** | ||||||||
9969160-T-C | 10131551-T-C | ** | ||||||||
9971696-C-A | 10134087-C-A | ** | ||||||||
9996245-C-A | 10158636-C-A | ** | ||||||||
10005980-C-A | 10168371-C-A | ** | ||||||||
10015049-A-G | 10177440-A-G | ** | ||||||||
10018330-G-C | 10180721-G-C | ** | ||||||||
10025331-G-A | 10187722-G-A | FT376460 | ** | |||||||
10040784-C-A | 10203175-C-A | ** | ||||||||
10656359-C-A | ** | |||||||||
10656757-A-G | ** | |||||||||
10662222-C-A | ** | |||||||||
10662325-C-T | ** | |||||||||
10663072-T-G | ** | |||||||||
10663074-C-G | ** | |||||||||
10671614-A-C | ** | |||||||||
10671617-C-T | ** | |||||||||
10682923-C-A | ** | |||||||||
10687551-A-T | ** | |||||||||
10744656-G-T | ** | |||||||||
10750006-C-A | ** | |||||||||
10751221-C-G | ** | |||||||||
10751499-G-T | ** | |||||||||
10757340-C-A | ** | |||||||||
10758304-C-A | ** | |||||||||
10762594-TATTCC-T | ** | |||||||||
10767733-C-A | ** | |||||||||
10767930-C-G | ** | |||||||||
10767935-C-CCATTG | ** | |||||||||
10769185-G-T | ** | |||||||||
10788009-C-A | ** | |||||||||
10789897-C-A | ** | |||||||||
10790509-C-CACTATA | ** | |||||||||
10791690-G-C | ** | |||||||||
10792827-C-T | ** | |||||||||
10796254-T-C | ** | |||||||||
10797459-A-G | ** | |||||||||
10808504-G-C | ** | |||||||||
10820753-C-A | ** | |||||||||
10832392-T-G | ** | |||||||||
10832401-C-A | ** | |||||||||
10832409-T-A | ** | |||||||||
10832412-A-G | ** | |||||||||
10832422-ACTCCC-A | ** | |||||||||
10832669-C-A | ** | |||||||||
10834430-C-A | ** | |||||||||
10840477-C-A | ** | |||||||||
10846000-C-A | ** | |||||||||
10847028-T-G | ** | |||||||||
10847034-A-T | ** | |||||||||
10847040-C-T | ** | |||||||||
10847054-A-T | ** | |||||||||
10847080-C-CTGCACTCCCT | ** | |||||||||
10847095-T-C | ** | |||||||||
10847110-T-TTTGTC | ** | |||||||||
10847485-T-A | ** | |||||||||
10848911-C-A | ** | |||||||||
10849193-C-A | ** | |||||||||
10851898-C-A | ** | |||||||||
10858104-A-G | ** | |||||||||
10858114-A-G | ** | |||||||||
10858117-C-T | ** | |||||||||
10858180-C-A | ** | |||||||||
10859720-C-A | ** | |||||||||
10867942-A-T | ** | |||||||||
10869053-T-C | ** | |||||||||
10877233-C-A | ** | |||||||||
10877311-T-C | FT435131 | ** | ||||||||
10879494-T-C | ** | |||||||||
10879534-T-G | ** | |||||||||
10884795-C-A | ** | |||||||||
10889647-C-G | ** | |||||||||
10893052-C-A | ** | |||||||||
10906918-C-T | ** | |||||||||
10909635-T-A | ** | |||||||||
10910908-A-T | ** | |||||||||
10911075-G-T | ** | |||||||||
10912054-A-C | ** | |||||||||
10921642-A-G | ** | |||||||||
10929338-A-C | ** | |||||||||
10935794-G-A | ** | |||||||||
10940151-C-A | ** | |||||||||
10943446-C-A | ** | |||||||||
10946754-C-A | ** | |||||||||
10946808-A-G | ** | |||||||||
10947532-C-T | ** | |||||||||
10949442-C-A | ** | |||||||||
10953473-G-T | ** | |||||||||
10960822-C-T | ** | |||||||||
10961111-C-A | ** | |||||||||
10973338-T-A | ** | |||||||||
10974166-T-A | ** | |||||||||
10974267-C-T | ** | |||||||||
10975898-G-T | FT438817 | ** | ||||||||
10978723-C-A | ** | |||||||||
10978748-C-A | ** | |||||||||
10980322-T-A | ** | |||||||||
10980362-T-TCTG | ** | |||||||||
10980363-TCAA-T | ** | |||||||||
10983288-C-A | ** | |||||||||
10985420-A-ATTCCC | ** | |||||||||
10985426-C-A | ** | |||||||||
10985434-A-T | ** | |||||||||
10985436-A-T | ** | |||||||||
10985449-CCCTCA-C | ** | |||||||||
10985668-C-A | ** | |||||||||
10985678-C-A | ** | |||||||||
10988763-C-A | ** | |||||||||
10992637-G-C | ** | |||||||||
10994203-C-A | ** | |||||||||
11000358-C-A | ** | |||||||||
11003657-C-A | ** | |||||||||
11003775-T-C | ** | |||||||||
11007014-T-G | ** | |||||||||
11012475-C-G | ** | |||||||||
11013864-A-C | ** | |||||||||
11018307-T-C | ** | |||||||||
11019060-A-T | ** | |||||||||
11019287-C-A | ** | |||||||||
11024677-C-A | ** | |||||||||
11025972-C-A | ** | |||||||||
11027640-T-C | ** | |||||||||
11027680-C-A | ** | |||||||||
11027687-TC-T | ** | |||||||||
11027690-C-CA | ** | |||||||||
11031723-C-T | ** | |||||||||
11031728-C-T | ** | |||||||||
13215415-C-A | 11059739-C-A | ** | ||||||||
13237638-A-T | 11081962-A-T | ** | ||||||||
13255323-C-A | 11099647-C-A | ** | ||||||||
13266236-G-C | 11110560-G-C | ** | ||||||||
13266289-A-T | 11110613-A-T | ** | ||||||||
13273115-C-A | 11117439-C-A | ** | ||||||||
13372409-C-A | 11216733-C-A | ** | ||||||||
13496229-C-A | 11340553-C-A | ** | ||||||||
13596490-C-A | 11440814-C-A | ** | ||||||||
13613508-C-A | 11457832-C-A | ** | ||||||||
11646688-G-C | ** | |||||||||
11646703-G-C | ** | |||||||||
11646768-G-T | ** | |||||||||
11659247-G-A | ** | |||||||||
11668040-T-A | ** | |||||||||
11673422-C-A | ** | |||||||||
11676089-C-A | ** | |||||||||
13856063-T-C | 11735357-T-C | ** | ||||||||
13871474-C-G | 11750768-C-G | ** | ||||||||
13891715-A-G | 11771009-A-G | ** | ||||||||
13894243-C-A | 11773537-C-A | ** | ||||||||
13907138-G-T | 11786432-G-T | ** | ||||||||
13907142-C-A | 11786436-C-A | ** | ||||||||
13907151-T-A | 11786445-T-A | ** | ||||||||
13907170-T-C | 11786464-T-C | ** | ||||||||
13907209-A-C | 11786503-A-C | ** | ||||||||
13907212-T-A | 11786506-T-A | ** | ||||||||
13922538-A-C | 11801832-A-C | ** | ||||||||
13922551-C-A | 11801845-C-A | ** | ||||||||
13932363-C-A | 11811657-C-A | ** | ||||||||
13974692-T-C | 11853986-T-C | ** | ||||||||
14007272-C-A | 11886566-C-A | FTB10390 | ** | |||||||
14051928-G-T | 11931222-G-T | ** | ||||||||
14073224-T-C | 11952518-T-C | ** | ||||||||
14076076-C-T | 11955370-C-T | ** | ||||||||
14076755-C-A | 11956049-C-A | ** | ||||||||
14077966-G-A | 11957260-G-A | ** | ||||||||
14193000-C-T | 12072294-C-T | ** | ||||||||
14269029-T-A | 12148323-T-A | ** | ||||||||
14269133-C-A | 12148427-C-A | ** | ||||||||
14295344-A-G | 12174638-A-G | ** | ||||||||
14324947-A-G | 12204241-A-G | ** | ||||||||
14372058-C-A | 12251354-C-A | ** | ||||||||
14386743-A-C | 12266039-A-C | ** | ||||||||
14421017-C-T | 12300292-C-T | ** | ||||||||
14447006-C-T | 12326279-C-T | ** | ||||||||
14474693-A-G | 12353962-A-G | ** | ||||||||
12370657-C-A | ** | |||||||||
12379135-C-A | ** | |||||||||
14499505-C-T | 12387710-C-T | ** | ||||||||
14546470-A-G | 12434671-A-G | ** | ||||||||
14552508-C-A | 12440709-C-A | ** | ||||||||
14698519-C-A | 12586585-C-A | ** | ||||||||
14715593-C-A | 12603660-C-A | ** | ||||||||
14757972-G-T | 12646041-G-T | ** | ||||||||
14789311-A-C | 12677382-A-C | ** | ||||||||
14832176-CA-C | 12720243-CA-C | ** | ||||||||
14832188-C-T | 12720255-C-T | ** | ||||||||
14832201-G-A | 12720268-G-A | ** | ||||||||
14832202-G-T | 12720269-G-T | ** | ||||||||
14832204-T-C | 12720271-T-C | ** | ||||||||
14835421-C-A | 12723488-C-A | ** | ||||||||
14844390-C-A | 12732456-C-A | ** | ||||||||
14887944-T-C | 12776010-T-C | ** | ||||||||
14911884-C-A | 12799951-C-A | ** | ||||||||
14992418-C-A | 12880503-C-A | ** | ||||||||
15092662-C-G | 12980751-C-G | ** | ||||||||
15103003-C-A | 12991091-C-A | ** | ||||||||
15127021-C-A | 13015108-C-A | ** | ||||||||
15168840-C-G | 13056926-C-G | ** | ||||||||
15210906-G-T | 13098992-G-T | ** | ||||||||
15239012-C-A | 13127098-C-A | ** | ||||||||
15259117-T-TA | 13147201-T-TA | 9×A | ** | |||||||
15366061-G-T | 13254181-G-T | ** | ||||||||
15367717-C-A | 13255837-C-A | ** | ||||||||
15380140-G-T | 13268260-G-T | ** | ||||||||
15392423-A-T | 13280543-A-T | ** | ||||||||
15394770-A-G | 13282890-A-G | ** | ||||||||
15402350-A-C | 13290470-A-C | ** | ||||||||
15438967-A-T | 13327087-A-T | ** | ||||||||
15627271-C-A | 13515391-C-A | ** | ||||||||
15676927-A-G | 13565047-A-G | ** | ||||||||
15689122-C-A | 13577242-C-A | ** | ||||||||
15698625-A-G | 13586745-A-G | ** | ||||||||
15748373-G-C | 13636493-G-C | FT5435 | ** | |||||||
15870525-A-C | 13758645-A-C | ** | ||||||||
15870526-C-A | 13758646-C-A | ** | ||||||||
15870594-A-T | 13758714-A-T | ** | ||||||||
15882046-G-A | 13770166-G-A | ** | ||||||||
15904081-A-T | 13792201-A-T | ** | ||||||||
15931512-G-T | 13819632-G-T | ** | ||||||||
15986630-G-T | 13874750-G-T | ** | ||||||||
15995378-A-T | 13883498-A-T | ** | ||||||||
16001064-C-A | 13889184-C-A | ** | ||||||||
16008577-A-G | 13896697-A-G | ** | ||||||||
16021068-T-C | 13909188-T-C | ** | ||||||||
16032284-C-A | 13920404-C-A | ** | ||||||||
16047057-C-A | 13935177-C-A | ** | ||||||||
16245074-A-G | 14133194-A-G | ** | ||||||||
16279445-C-A | 14167565-C-A | ** | ||||||||
16305817-T-G | 14193937-T-G | ** | ||||||||
16305822-G-A | 14193942-G-A | ** | ||||||||
16305824-C-T | 14193944-C-T | ** | ||||||||
16305828-G-A | 14193948-G-A | ** | ||||||||
16305844-G-C | 14193964-G-C | ** | ||||||||
16305848-C-G | 14193968-C-G | ** | ||||||||
16305849-C-T | 14193969-C-T | ** | ||||||||
16305873-C-T | 14193993-C-T | ** | ||||||||
16305880-C-A | 14194000-C-A | ** | ||||||||
16429714-G-T | 14317834-G-T | ** | ||||||||
16450303-A-T | 14338423-A-T | ** | ||||||||
16450360-T-G | 14338480-T-G | ** | ||||||||
16474761-T-A | 14362881-T-A | ** | ||||||||
16489946-G-C | 14378066-G-C | ** | ||||||||
16489962-G-C | 14378082-G-C | ** | ||||||||
16522772-A-G | 14410892-A-G | ** | ||||||||
16619803-C-T | 14507923-C-T | ** | ||||||||
16701846-C-A | 14589966-C-A | ** | ||||||||
16702104-G-T | 14590224-G-T | ** | ||||||||
16843191-G-A | 14731311-G-A | ** | ||||||||
16932783-C-A | 14820903-C-A | ** | ||||||||
16971334-A-G | 14859454-A-G | ** | ||||||||
17098768-C-A | 14986888-C-A | ** | ||||||||
17128563-T-A | 15016683-T-A | ** | ||||||||
17182465-T-A | 15070585-T-A | ** | ||||||||
17249087-T-C | 15137207-T-C | ** | ||||||||
17285070-C-A | 15173190-C-A | ** | ||||||||
17306634-C-A | 15194754-C-A | ** | ||||||||
17440882-C-A | 15329002-C-A | ** | ||||||||
17478990-C-A | 15367110-C-A | ** | ||||||||
17486284-G-A | 15374404-G-A | ** | ||||||||
17491025-AGGT-A | 15379145-AGGT-A | ** | ||||||||
17503689-C-G | 15391809-C-G | ** | ||||||||
17545179-A-G | 15433299-A-G | ** | ||||||||
17567476-G-T | 15455596-G-T | ** | ||||||||
17620416-C-G | 15508536-C-G | ** | ||||||||
17620452-C-G | 15508572-C-G | ** | ||||||||
17620477-T-G | 15508597-T-G | ** | ||||||||
17644283-T-C | 15532403-T-C | ** | ||||||||
17644310-T-A | 15532430-T-A | ** | ||||||||
17784431-C-A | 15672551-C-A | ** | ||||||||
17840217-C-A | 15728337-C-A | ** | ||||||||
17964828-C-A | 15852948-C-A | FTA3820 | ** | |||||||
18120771-T-C | 16008891-T-C | ** | ||||||||
18194473-C-T | 16082593-C-T | ** | ||||||||
18328855-T-A | 16216975-T-A | P6_Prx | ** | |||||||
18423874-CAA-C | 16311994-CAA-C | P6_Gap | 12×A | ** | ||||||
18625470-G-T | 16513590-G-T | ** | ||||||||
18728913-C-A | 16617033-C-A | ** | ||||||||
18863813-T-C | 16751933-T-C | ** | ||||||||
18932753-A-T | 16820873-A-T | ** | ||||||||
18966156-C-A | 16854276-C-A | ** | ||||||||
19064934-C-CA | 16953054-C-CA | 8×A | ** | |||||||
19071955-C-A | 16960075-C-A | ** | ||||||||
19189616-T-TTTG | 17077736-T-TTTG | ** | ||||||||
19271563-AG-A | 17159683-AG-A | ** | ||||||||
19330339-A-G | 17218459-A-G | ** | ||||||||
19377130-TGGAG-T | 17265250-TGGAG-T | 4×GGAG | ** | |||||||
19389738-AAG-A | 17277858-AAG-A | ** | ||||||||
19412463-A-C | 17300583-A-C | ** | ||||||||
19476638-C-A | 17364758-C-A | ** | ||||||||
19535574-T-C | 17423694-T-C | ** | ||||||||
19537980-A-T | 17426100-A-T | ** | ||||||||
19563211-G-A | 17451331-G-A | ** | ||||||||
19744957-A-G | 17633077-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
20041826-T-A | 17929946-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
20041941-A-G | 17930061-A-G | P5_Prx | ** | |||||||
20302111-T-TA | 18140225-T-TA | P5_Dst | ** | |||||||
20440398-G-GTTC | 18278512-G-GTTC | P5_Dst | ** | |||||||
20673814-T-TA | 18511928-T-TA | P4_Prx | ** | |||||||
20703014-G-GAC | 18541128-G-GAC | P4_Prx | 10×A | ** | ||||||
20760062-A-ATTCT | 18598176-A-ATTCT | P4_Prx | 10×T | ** | ||||||
20824985-A-G | 18663099-A-G | P4_Gap | ** | |||||||
21076983-A-T | 18915097-A-T | ** | ||||||||
21077265-G-T | 18915379-G-T | ** | ||||||||
21108175-C-A | 18946289-C-A | ** | ||||||||
21141108-TC-T | 18979222-TC-T | ** | ||||||||
21208927-C-T | 19047041-C-T | ** | ||||||||
21276768-A-T | 19114882-A-T | ** | ||||||||
21297444-A-G | 19135558-A-G | ** | ||||||||
21297450-G-A | 19135564-G-A | FT284117 | ** | |||||||
21297478-G-A | 19135592-G-A | ** | ||||||||
21352500-T-C | 19190614-T-C | ** | ||||||||
21381377-A-G | 19219491-A-G | ** | ||||||||
21427747-C-A | 19265861-C-A | ** | ||||||||
21473874-T-C | 19311988-T-C | ** | ||||||||
21473895-T-C | 19312009-T-C | ** | ||||||||
21476420-C-A | 19314534-C-A | ** | ||||||||
21668728-T-A | 19506842-T-A | ** | ||||||||
21697307-C-T | 19535421-C-T | ** | ||||||||
21714755-A-T | 19552869-A-T | ** | ||||||||
21714777-A-AC | 19552891-A-AC | ** | ||||||||
21714779-A-AT | 19552893-A-AT | ** | ||||||||
21888224-A-T | 19726338-A-T | ** | ||||||||
21888250-A-T | 19726364-A-T | ** | ||||||||
21888256-A-T | 19726370-A-T | ** | ||||||||
21888260-A-T | 19726374-A-T | ** | ||||||||
21911187-A-G | 19749301-A-G | ** | ||||||||
21966325-C-A | 19804439-C-A | ** | ||||||||
21998523-T-C | 19836637-T-C | ** | ||||||||
22028710-C-T | 19866824-C-T | ** | ||||||||
22078202-G-T | 19916316-G-T | ** | ||||||||
22080617-G-T | 19918731-G-T | ** | ||||||||
22091056-C-A | 19929170-C-A | ** | ||||||||
22124115-T-C | 19962229-T-C | ** | ||||||||
22164544-T-A | 20002658-T-A | ** | ||||||||
22168511-C-A | 20006625-C-A | ** | ||||||||
22168524-C-A | 20006638-C-A | ** | ||||||||
22169086-A-G | 20007200-A-G | ** | ||||||||
22171063-G-T | 20009177-G-T | ** | ||||||||
22319070-A-G | 20157184-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
22518359-T-C | 20356473-T-C | ** | ||||||||
22602377-T-A | 20440491-T-A | ** | ||||||||
22641254-T-C | 20479368-T-C | ** | ||||||||
22689866-A-T | 20527980-A-T | ** | ||||||||
22767410-C-A | 20605524-C-A | ** | ||||||||
22868922-C-A | 20707036-C-A | ** | ||||||||
22880708-G-A | 20718822-G-A | ** | ||||||||
23049487-A-G | 20887601-A-G | ** | ||||||||
23360743-T-C | 21198857-T-C | ** | ||||||||
23372985-C-A | 21211099-C-A | ** | ||||||||
23433607-T-C | 21271721-T-C | ** | ||||||||
23435798-A-T | 21273912-A-T | ** | ||||||||
23438878-AC-A | 21276992-AC-A | ** | ||||||||
23440634-T-C | 21278748-T-C | ** | ||||||||
23505145-C-T | 21343259-C-T | ** | ||||||||
23742410-T-C | 21580524-T-C | ** | ||||||||
21751272-G-T | ** | |||||||||
24403836-G-T | 22257689-G-T | ** | ||||||||
24432833-G-T | 22286686-G-T | ** | ||||||||
24509301-C-A | 22363154-C-A | ** | ||||||||
24633971-G-A | 22487824-G-A | P3_t2 | ** | |||||||
26122061-ATGAGCT-A | 23975914-ATGAGCT-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26740638-C-T | 24594491-C-T | P1_g2 | ** | |||||||
27576312-G-T | 25430165-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27606976-G-T | 25460829-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27861875-CAAAAAAA-C | 25715728-CAAAAAAA-C | P1_Y2 | 32×A | ** | ||||||
28429660-G-C | 26283513-G-C | P1_gr2 | ** | |||||||
28462233-A-C | 26316086-A-C | ** | ||||||||
28482921-C-A | 26336774-C-A | ** | ||||||||
28484433-T-A | 26338286-T-A | ** | ||||||||
28535576-C-A | 26389429-C-A | ** | ||||||||
28563647-G-C | 26417500-G-C | ** | ||||||||
28563648-G-A | 26417501-G-A | ** | ||||||||
28596734-T-C | 26450587-T-C | ** | ||||||||
28596744-G-T | 26450597-G-T | ** | ||||||||
28598526-A-G | 26452379-A-G | ** | ||||||||
28622027-A-C | 26475880-A-C | ** | ||||||||
28636813-C-T | 26490666-C-T | ** | ||||||||
28653366-CAAAA-C | 26507219-CAAAA-C | 12×A | ** | |||||||
28660668-C-A | 26514521-C-A | ** | ||||||||
28700496-C-A | 26554349-C-A | ** | ||||||||
28722713-CATGA-C | 26576566-CATGA-C | ** | ||||||||
28724821-C-A | 26578674-C-A | ** | ||||||||
28729346-C-A | 26583199-C-A | FTA15302 | ** | |||||||
28730159-A-T | 26584012-A-T | ** | ||||||||
28730190-C-T | 26584043-C-T | ** | ||||||||
28730223-G-T | 26584076-G-T | ** | ||||||||
28730226-G-C | 26584079-G-C | ** | ||||||||
28772097-C-G | 26625950-C-G | ** | ||||||||
28772895-C-A | 26626748-C-A | ** | ||||||||
28773910-G-GA | 26627763-G-GA | 8×A | ** | |||||||
28798666-G-A | 26652519-G-A | ** | ||||||||
28798668-G-C | 26652521-G-C | ** | ||||||||
28798671-G-C | 26652524-G-C | ** | ||||||||
28798672-T-C | 26652525-T-C | ** | ||||||||
28798673-G-C | 26652526-G-C | ** | ||||||||
28798679-G-C | 26652532-G-C | ** | ||||||||
56746254-T-TCATAC | ** | |||||||||
56746259-T-A | ** | |||||||||
56746273-A-C | ** | |||||||||
56846142-C-A | ** | |||||||||
56878800-A-G | ** | |||||||||
56878896-G-T | ** | |||||||||
22551638-A-T | 20389752-A-T | ** | ||||||||
2772464-G-A | 2904423-G-A | ** | ||||||||
9136692-T-C | 9299083-T-C | ** | ||||||||
9493100-A-G | 9655491-A-G | ** | ||||||||
10047698-A-G | 10210089-A-G | ** | ||||||||
14566958-T-C | 12455158-T-C | ** | ||||||||
17250811-C-T | 15138931-C-T | ** | ||||||||
19730867-G-T | 17618987-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
20486251-A-AG | 18324365-A-AG | P5_Dst | ** | |||||||
25567553-T-TA | 23421406-T-TA | P1_gr1 | ** | |||||||
28531039-A-C | 26384892-A-C | ** | ||||||||
22459656-G-A | 20297770-G-A | BY158454 | DYZ19 | *** | ||||||
13822316-A-G | 11701610-A-G | *** | ||||||||
15440013-G-A | 13328133-G-A | *** | ||||||||
15440017-A-G | 13328137-A-G | *** | ||||||||
24807644-C-T | 22661497-C-T | BY24928 | P3_b2 | *** | ||||||
9022244-CTT-C | 9184635-CTT-C | 14×T | *** | |||||||
2909373-CT-C | 3041332-CT-C | BY31006 | 9×T | *** | ||||||
16627676-ATC-A | 14515796-ATC-A | *** | ||||||||
18410473-G-GT | 16298593-G-GT | P6_Gap | *** | |||||||
18661298-TAC-T | 16549418-TAC-T | *** | ||||||||
19275207-TAC-T | 17163327-TAC-T | *** | ||||||||
22264552-T-C | 20102666-T-C | DYZ19 | *** | |||||||
24126657-C-T | 21980510-C-T | P3_b1 | *** | |||||||
25127280-GTTA-G | 22981133-GTTA-G | g1 | *** | |||||||
7769254-CT-C | 7901213-CT-C | 10×T | *** | |||||||
10789399-G-C | *** | |||||||||
10789147-C-A | *** | |||||||||
17459485-C-A | 15347605-C-A | 25×A | *** | |||||||
17414908-CAAAA-C | 15303028-CAAAA-C | 18×A | *** | |||||||
13466118-G-C | 11310442-G-C | *** | ||||||||
13466126-G-A | 11310450-G-A | *** | ||||||||
3547521-G-T | 3679480-G-T | *** | ||||||||
3610061-C-A | 3742020-C-A | *** | ||||||||
7142014-C-A | 7273973-C-A | *** | ||||||||
7436329-C-A | 7568288-C-A | *** | ||||||||
8350606-C-A | 8482565-C-A | *** | ||||||||
8673884-C-A | 8805843-C-A | *** | ||||||||
8673956-C-A | 8805915-C-A | FTB45177 | *** | |||||||
8870041-CTTTT-C | 9002000-CTTTT-C | 14×T | *** | |||||||
9063656-C-A | 9226047-C-A | *** | ||||||||
9960029-C-A | 10122420-C-A | *** | ||||||||
10654920-C-A | *** | |||||||||
10764546-TTTTC-T,TTTT | *** | |||||||||
10768452-ACTCCTTT-A | *** | |||||||||
10769425-CATTCCATTCC-C,CATAGCATTCG | *** | |||||||||
10781590-C-A | *** | |||||||||
10792703-CAGTCA-C,CATTCC | *** | |||||||||
10878707-T-C | *** | |||||||||
10899978-T-C | *** | |||||||||
10987873-CCA-C | *** | |||||||||
10994268-T-G | *** | |||||||||
11019400-G-A,T | *** | |||||||||
11019401-TTCCAG-T,TTCAAC | *** | |||||||||
13234295-T-A | 11078619-T-A | *** | ||||||||
13293928-T-C | 11138252-T-C | *** | ||||||||
13446526-A-T | 11290850-A-T | *** | ||||||||
13489765-T-TCG | 11334089-T-TCG | *** | ||||||||
13527354-C-A | 11371678-C-A | *** | ||||||||
11666556-G-T | *** | |||||||||
11673321-G-T | *** | |||||||||
14030664-ATTT-A | 11909958-ATTT-A | 14×T | *** | |||||||
14470649-A-G | 12349918-A-G | *** | ||||||||
14639271-C-A | 12527340-C-A | *** | ||||||||
14960373-C-A | 12848448-C-A | *** | ||||||||
15171267-C-A | 13059353-C-A | *** | ||||||||
15661078-T-C | 13549198-T-C | *** | ||||||||
16180858-C-A | 14068978-C-A | *** | ||||||||
16292828-G-A | 14180948-G-A | *** | ||||||||
16702254-C-A | 14590374-C-A | *** | ||||||||
16855372-TAAAA-T | 14743492-TAAAA-T | 17×A | *** | |||||||
17244373-C-A | 15132493-C-A | *** | ||||||||
17596395-TA-T,TAA | 15484515-TA-T,TAA | 15×A | *** | |||||||
17895196-TG-G,T | 15783316-TG-G,T | *** | ||||||||
18191827-C-A | 16079947-C-A | *** | ||||||||
18616784-GTT-G,GTTT | 16504904-GTT-G,GTTT | 15×T | *** | |||||||
19563387-C-A | 17451507-C-A | *** | ||||||||
21229862-GTT-G | 19067976-GTT-G | 12×T | *** | |||||||
22023201-CTTT-C,CTT | 19861315-CTTT-C,CTT | 20×T | *** | |||||||
23009478-C-A | 20847592-C-A | *** | ||||||||
23241971-TTTTGTA-T | 21080085-TTTTGTA-T | *** | ||||||||
24220953-C-A | 22074806-C-A | P3_b1 | *** | |||||||
27523293-C-A | 25377146-C-A | P1_Y2 | *** | |||||||
28798681-G-A | 26652534-G-A | *** | ||||||||
28798682-A-T | 26652535-A-T | *** | ||||||||
28798696-G-A | 26652549-G-A | *** | ||||||||
56848312-C-A | *** | |||||||||
23633371-CTT-C,CT | 21471485-CTT-C,CT | 21×T | *** | |||||||
13624352-GTATA-G,GTA | 11468676-GTATA-G,GTA | 11×TA | *** | |||||||
23600076-CT-C | 21438190-CT-C | *** | ||||||||
14678904-C-CT | 12566970-C-CT | 10×T | *** | |||||||
13476569-C-T | 11320893-C-T | *** | ||||||||
3121250-T-G | 3253209-T-G | *** | ||||||||
3557261-A-T | 3689220-A-T | *** | ||||||||
5354926-G-A | 5486885-G-A | *** | ||||||||
5447974-A-G | 5579933-A-G | *** | ||||||||
8281743-C-T | 8413702-C-T | *** | ||||||||
9950023-A-T | 10112414-A-T | *** | ||||||||
13207274-C-CT,CTT | 11051598-C-CT,CTT | 16×T | *** | |||||||
13420708-T-A | 11265032-T-A | *** | ||||||||
13475795-AC-A | 11320119-AC-A | *** | ||||||||
14255543-A-T | 12134837-A-T | *** | ||||||||
16973593-A-G | 14861713-A-G | *** | ||||||||
21196685-G-A | 19034799-G-A | *** | ||||||||
21196695-G-A | 19034809-G-A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.