Bean
FTDNA: B3500, BigY2: B3500, BigY3: B3500, YFull-BigY: YF01486Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
| POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA B3500 | BigY2 B3500 | BigY3 B3500 | Manual Edits |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16114665-T-TTA | 14002785-T-TTA | P8_Prx | 9×TA | A* | |||||||
| 28375653-T-TA | 26229506-T-TA | P1_gr2 | 14×A | A* | |||||||
| 20368108-C-CT | 18206222-C-CT | P5_Dst | 22×T | A* | |||||||
| 6216319-G-A | 6348278-G-A | IR3_Dst | A* | ||||||||
| 19733844-G-A | 17621964-G-A | P5_Prx | A* | ||||||||
| 26501549-C-T | 24355402-C-T | P1_Y1 | A* | ||||||||
| 9172040-G-A | 9334431-G-A | FGC14732 | Y | + | + | + | |||||
| 15602633-C-A | 13490753-C-A | FGC14738 | Y | Y | + | + | + | ||||
| 19058506-G-GA | 16946626-G-GA | + | + | + | |||||||
| 22234545-C-A | 20072659-C-A | BY20168 | DYZ19 | + | |||||||
| 17275755-A-AGAAAAGG | 15163875-A-AGAAAAGG | + | |||||||||
| 3265481-G-A | 3397440-G-A | FT81162 | + | ||||||||
| 5993158-T-C | 6125117-T-C | FT81647 | + | ||||||||
| 21155080-C-A | 18993194-C-A | FT82149 | Y | + | |||||||
| 19966688-AAAGAAGAAG-A,AAAG | 17854808-AAAGAAGAAG-A,AAAG | P5_Prx | 26×AAG | * | |||||||
| 14898434-C-T | 12786500-C-T | PR5264 | Y | Y | * | ||||||
| 17860904-G-T | 15749024-G-T | Y | Y | * | |||||||
| 19112538-C-CCCTT | 17000658-C-CCCTT | 7×CCTT | * | ||||||||
| 16186676-A-AAAAC | 14074796-A-AAAAC | 5×AAAC | * | ||||||||
| 18340511-CACA-C | 16228631-CACA-C | P6_Prx | * | ||||||||
| 5876230-G-T | 6008189-G-T | ** | ** | ||||||||
| 15127307-C-A | 13015394-C-A | ** | ** | ||||||||
| 16491327-G-T | 14379447-G-T | ** | ** | ||||||||
| 14143425-C-A | 12022719-C-A | BY202224 | ** | ||||||||
| 17037302-C-T | 14925422-C-T | ZS284 | ** | ||||||||
| 7221714-C-A | 7353673-C-A | ** | |||||||||
| 26066378-G-T | 23920231-G-T | P1_Y1 | ** | ||||||||
| 13847305-CATGGA-C | 11726599-CATGGA-C | 4×ATGGA | ** | ||||||||
| 16298328-C-T | 14186448-C-T | ** | |||||||||
| 16298339-CA-C | 14186459-CA-C | ** | |||||||||
| 28773549-C-A | 26627402-C-A | ** | |||||||||
| 6179622-T-G | 6311581-T-G | IR3_Dst | ** | ||||||||
| 24376232-G-A | 22230085-G-A | ** | |||||||||
| 19464105-G-T | 17352225-G-T | ** | |||||||||
| 7538002-C-A | 7669961-C-A | ** | |||||||||
| 15654934-C-A | 13543054-C-A | ** | |||||||||
| 10663592-C-T | ** | ||||||||||
| 15358582-C-A | 13246701-C-A | ** | |||||||||
| 19517465-C-A | 17405585-C-A | ** | |||||||||
| 6948538-A-G | 7080497-A-G | ** | |||||||||
| 21200701-C-A | 19038815-C-A | ** | |||||||||
| 14408744-C-A | 12288042-C-A | ** | |||||||||
| 7127249-C-A | 7259208-C-A | ** | |||||||||
| 10673854-A-AC | ** | ||||||||||
| 16528250-C-A | 14416370-C-A | ** | |||||||||
| 7101008-A-C | 7232967-A-C | ** | |||||||||
| 15336012-T-C | 13224130-T-C | ** | |||||||||
| 9120166-C-A | ** | ||||||||||
| 8352434-C-A | 8484393-C-A | ** | |||||||||
| 16652931-C-A | 14541051-C-A | ** | |||||||||
| 10946802-C-A | ** | ||||||||||
| 13642638-C-A | 11486962-C-A | ** | |||||||||
| 14511429-G-A | 12399634-G-A | ** | |||||||||
| 13942488-C-A | 11821782-C-A | ** | |||||||||
| 6768912-T-G | 6900871-T-G | ** | |||||||||
| 19293769-TCAAA-T | 17181889-TCAAA-T | ** | |||||||||
| 22063953-C-A | 19902067-C-A | ** | |||||||||
| 18654762-C-A | 16542882-C-A | ** | |||||||||
| 22207391-C-A | 20045505-C-A | ** | |||||||||
| 21367326-C-A | 19205440-C-A | ** | |||||||||
| 17399677-C-A | 15287797-C-A | ** | |||||||||
| 19256308-C-A | 17144428-C-A | ** | |||||||||
| 2729699-T-C | 2861658-T-C | ** | |||||||||
| 2729708-C-G | 2861667-C-G | ** | |||||||||
| 2729717-TG-C | 2861676-TG-C | ** | |||||||||
| 2729720-C-CG | 2861679-C-CG | ** | |||||||||
| 2729726-T-A | 2861685-T-A | ** | |||||||||
| 2842834-T-A | 2974793-T-A | ** | |||||||||
| 2844014-G-T | 2975973-G-T | ** | |||||||||
| 2884092-T-A | 3016051-T-A | ** | |||||||||
| 2888786-G-T | 3020745-G-T | ** | |||||||||
| 2926858-C-A | 3058817-C-A | ** | |||||||||
| 2944101-C-A | 3076060-C-A | ** | |||||||||
| 2980460-T-G | 3112419-T-G | ** | |||||||||
| 2986122-G-T | 3118081-G-T | ** | |||||||||
| 3048595-A-G | 3180554-A-G | ** | |||||||||
| 3497452-G-T | 3629411-G-T | ** | |||||||||
| 3545894-G-T | 3677853-G-T | ** | |||||||||
| 3550711-C-A | 3682670-C-A | ** | |||||||||
| 3594259-C-A | 3726218-C-A | ** | |||||||||
| 3628139-G-T | 3760098-G-T | ** | |||||||||
| 3681291-G-T | 3813250-G-T | ** | |||||||||
| 3706805-G-T | 3838764-G-T | ** | |||||||||
| 3870898-C-T | 4002857-C-T | ** | |||||||||
| 3999396-G-A | 4131355-G-A | ** | |||||||||
| 4069999-C-A | 4201958-C-A | ** | |||||||||
| 4133885-C-A | 4265844-C-A | ** | |||||||||
| 4244386-A-G | 4376345-A-G | ** | |||||||||
| 4389447-C-A | 4521406-C-A | ** | |||||||||
| 4472936-C-A | 4604895-C-A | ** | |||||||||
| 4561600-C-A | 4693559-C-A | ** | |||||||||
| 4633958-G-T | 4765917-G-T | ** | |||||||||
| 4657909-C-A | 4789868-C-A | ** | |||||||||
| 4657921-C-A | 4789880-C-A | ** | |||||||||
| 4770527-T-A | 4902486-T-A | ** | |||||||||
| 4863371-G-T | 4995330-G-T | ** | |||||||||
| 4920496-G-T | 5052455-G-T | ** | |||||||||
| 4932453-G-T | 5064412-G-T | ** | |||||||||
| 4999960-T-G | 5131919-T-G | ** | |||||||||
| 5081049-C-A | 5213008-C-A | ** | |||||||||
| 5117974-C-A | 5249933-C-A | ** | |||||||||
| 5180579-A-G | 5312538-A-G | ** | |||||||||
| 5249967-T-C | 5381926-T-C | ** | |||||||||
| 5274795-C-A | 5406754-C-A | ** | |||||||||
| 5279808-C-A | 5411767-C-A | ** | |||||||||
| 5354631-C-G | 5486590-C-G | ** | |||||||||
| 5459779-T-G | 5591738-T-G | ** | |||||||||
| 5472176-T-G | 5604135-T-G | ** | |||||||||
| 5535462-A-T | 5667421-A-T | ** | |||||||||
| 5586579-C-A | 5718538-C-A | ** | |||||||||
| 5603470-T-G | 5735429-T-G | ** | |||||||||
| 5613473-C-A | 5745432-C-A | ** | |||||||||
| 5702609-C-A | 5834568-C-A | ** | |||||||||
| 5766595-A-G | 5898554-A-G | ** | |||||||||
| 5886293-C-A | 6018252-C-A | ** | |||||||||
| 5905890-C-A | 6037849-C-A | 27×A | ** | ||||||||
| 5910401-C-A | 6042360-C-A | ** | |||||||||
| 5924283-T-C | 6056242-T-C | ** | |||||||||
| 6031166-G-T | 6163125-G-T | ** | |||||||||
| 6037098-T-G | 6169057-T-G | ** | |||||||||
| 6037206-G-T | 6169165-G-T | ** | |||||||||
| 6102319-T-G | 6234278-T-G | ** | |||||||||
| 6226166-A-C | 6358125-A-C | IR3_Dst | ** | ||||||||
| 6435962-G-T | 6567921-G-T | ** | |||||||||
| 6674560-T-C | 6806519-T-C | ** | |||||||||
| 6713909-T-G | 6845868-T-G | ** | |||||||||
| 6732336-C-A | 6864295-C-A | ** | |||||||||
| 6757593-C-A | 6889552-C-A | ** | |||||||||
| 6833443-C-A | 6965402-C-A | ** | |||||||||
| 6869540-G-A | 7001499-G-A | ** | |||||||||
| 6882556-T-G | 7014515-T-G | ** | |||||||||
| 6957574-G-A | 7089533-G-A | ** | |||||||||
| 6967947-CA-C | 7099906-CA-C | 8×A | ** | ||||||||
| 6976540-C-A | 7108499-C-A | ** | |||||||||
| 7000315-G-T | 7132274-G-T | ** | |||||||||
| 7026911-C-A | 7158870-C-A | ** | |||||||||
| 7045786-C-A | 7177745-C-A | ** | |||||||||
| 7053727-G-T | 7185686-G-T | ** | |||||||||
| 7063947-C-A | 7195906-C-A | ** | |||||||||
| 7064004-C-T | 7195963-C-T | ** | |||||||||
| 7094497-C-A | 7226456-C-A | ** | |||||||||
| 7116489-C-A | 7248448-C-A | ** | |||||||||
| 7138975-C-A | 7270934-C-A | ** | |||||||||
| 7138977-C-A | 7270936-C-A | ** | |||||||||
| 7164053-C-A | 7296012-C-A | ** | |||||||||
| 7183174-G-T | 7315133-G-T | ** | |||||||||
| 7183193-G-A | 7315152-G-A | ** | |||||||||
| 7191765-A-T | 7323724-A-T | ** | |||||||||
| 7204321-C-A | 7336280-C-A | ** | |||||||||
| 7220846-C-A | 7352805-C-A | ** | |||||||||
| 7229131-C-A | 7361090-C-A | ** | |||||||||
| 7257667-A-C | 7389626-A-C | ** | |||||||||
| 7264945-G-T | 7396904-G-T | ** | |||||||||
| 7289504-C-A | 7421463-C-A | ** | |||||||||
| 7315727-G-T | 7447686-G-T | ** | |||||||||
| 7318995-T-TCTGTC | 7450954-T-TCTGTC | ** | |||||||||
| 7338995-T-G | 7470954-T-G | ** | |||||||||
| 7364065-C-A | 7496024-C-A | ** | |||||||||
| 7385265-C-A | 7517224-C-A | ** | |||||||||
| 7389906-C-A | 7521865-C-A | ** | |||||||||
| 7395166-T-G | 7527125-T-G | ** | |||||||||
| 7423891-C-T | 7555850-C-T | ** | |||||||||
| 7579123-C-A | 7711082-C-A | ** | |||||||||
| 7579740-C-A | 7711699-C-A | ** | |||||||||
| 7643217-G-A | 7775176-G-A | ** | |||||||||
| 7670755-T-G | 7802714-T-G | ** | |||||||||
| 7706370-G-T | 7838329-G-T | ** | |||||||||
| 7706546-G-T | 7838505-G-T | ** | |||||||||
| 7817168-C-A | 7949127-C-A | ** | |||||||||
| 7828871-C-A | 7960830-C-A | ** | |||||||||
| 7863309-C-A | 7995268-C-A | ** | |||||||||
| 7874758-C-A | 8006717-C-A | ** | |||||||||
| 7877292-G-T | 8009251-G-T | ** | |||||||||
| 7958375-T-C | 8090334-T-C | ** | |||||||||
| 8008880-C-A | 8140839-C-A | ** | |||||||||
| 8045434-T-C | 8177393-T-C | ** | |||||||||
| 8052114-C-A | 8184073-C-A | ** | |||||||||
| 8053460-C-A | 8185419-C-A | ** | |||||||||
| 8073286-C-A | 8205245-C-A | ** | |||||||||
| 8073435-G-T | 8205394-G-T | ** | |||||||||
| 8075364-C-A | 8207323-C-A | ** | |||||||||
| 8110041-G-T | 8242000-G-T | ** | |||||||||
| 8146266-T-C | 8278225-T-C | ** | |||||||||
| 8214036-C-A | 8345995-C-A | ** | |||||||||
| 8214038-A-C | 8345997-A-C | ** | |||||||||
| 8228256-A-T | 8360215-A-T | ** | |||||||||
| 8321532-C-A | 8453491-C-A | ** | |||||||||
| 8334216-A-C | 8466175-A-C | ** | |||||||||
| 8385773-G-T | 8517732-G-T | ** | |||||||||
| 8421541-C-A | 8553500-C-A | ** | |||||||||
| 8436833-C-A | 8568792-C-A | ** | |||||||||
| 8556375-G-A | 8688334-G-A | ** | |||||||||
| 8630350-CCTGCTGTGTCATCTGT-C | 8762309-CCTGCTGTGTCATCTGT-C | ** | |||||||||
| 8672851-C-A | 8804810-C-A | ** | |||||||||
| 8676920-C-A | 8808879-C-A | ** | |||||||||
| 8710922-C-A | 8842881-C-A | ** | |||||||||
| 8715011-C-T | 8846970-C-T | ** | |||||||||
| 8745716-A-T | 8877675-A-T | ** | |||||||||
| 8748931-C-A | 8880890-C-A | ** | |||||||||
| 8799265-C-A | 8931224-C-A | ** | |||||||||
| 8840674-G-T | 8972633-G-T | ** | |||||||||
| 8854097-C-A | 8986056-C-A | ** | |||||||||
| 9128534-C-A | 9290925-C-A | ** | |||||||||
| 9400769-C-A | 9563160-C-A | ** | |||||||||
| 9400802-C-A | 9563193-C-A | ** | |||||||||
| 9420391-C-A | 9582782-C-A | ** | |||||||||
| 9421177-C-A | 9583568-C-A | ** | |||||||||
| 9427767-G-A | 9590158-G-A | ** | |||||||||
| 9437561-C-A | 9599952-C-A | ** | |||||||||
| 9480665-C-A | 9643056-C-A | ** | |||||||||
| 9482318-A-G | 9644709-A-G | ** | |||||||||
| 9624772-G-T | 9787163-G-T | IR3_Prx | ** | ||||||||
| 9643131-TA-T | 9805522-TA-T | IR3_Prx | ** | ||||||||
| 9675167-T-G | 9837558-T-G | IR3_Prx | ** | ||||||||
| 9675174-T-C | 9837565-T-C | IR3_Prx | ** | ||||||||
| 9730316-G-A | 9892707-G-A | IR3_Prx | ** | ||||||||
| 9776143-G-T | 9938534-G-T | ** | |||||||||
| 9807904-C-A | 9970295-C-A | ** | |||||||||
| 9859122-G-T | 10021513-G-T | ** | |||||||||
| 9967936-C-A | 10130327-C-A | ** | |||||||||
| 10010679-G-T | 10173070-G-T | ** | |||||||||
| 10010702-G-T | 10173093-G-T | ** | |||||||||
| 10012430-C-A | 10174821-C-A | ** | |||||||||
| 10016841-C-A | 10179232-C-A | ** | |||||||||
| 10660445-C-A | ** | ||||||||||
| 10663550-G-T | ** | ||||||||||
| 10669706-C-A | ** | ||||||||||
| 10688145-C-A | ** | ||||||||||
| 10751063-C-G | ** | ||||||||||
| 10758368-C-A | ** | ||||||||||
| 10766177-C-A | ** | ||||||||||
| 10778262-C-A | ** | ||||||||||
| 10780237-C-A | ** | ||||||||||
| 10782787-G-T | ** | ||||||||||
| 10799565-T-A | ** | ||||||||||
| 10815048-C-A | ** | ||||||||||
| 10839002-T-C | ** | ||||||||||
| 10844415-C-A | ** | ||||||||||
| 10873133-C-A | ** | ||||||||||
| 10879230-C-T | ** | ||||||||||
| 10947090-T-C | ** | ||||||||||
| 10947097-C-T | ** | ||||||||||
| 10953951-G-T | ** | ||||||||||
| 10954328-C-T | FT438036 | ** | |||||||||
| 10969853-G-A | ** | ||||||||||
| 10971086-A-T | ** | ||||||||||
| 10971114-C-T | ** | ||||||||||
| 10971116-A-T | ** | ||||||||||
| 10987865-A-C | ** | ||||||||||
| 11003745-C-A | ** | ||||||||||
| 11007072-C-A | ** | ||||||||||
| 11031676-C-A | ** | ||||||||||
| 13218689-C-A | 11063013-C-A | ** | |||||||||
| 13307914-C-A | 11152238-C-A | ** | |||||||||
| 13316635-C-A | 11160959-C-A | ** | |||||||||
| 13327135-G-T | 11171459-G-T | ** | |||||||||
| 13329262-G-T | 11173586-G-T | ** | |||||||||
| 13329276-G-T | 11173600-G-T | ** | |||||||||
| 13456637-C-A | 11300961-C-A | ** | |||||||||
| 13468381-C-A | 11312705-C-A | ** | |||||||||
| 13479648-C-A | 11323972-C-A | ** | |||||||||
| 13484085-T-G | 11328409-T-G | ** | |||||||||
| 13507542-A-C | 11351866-A-C | ** | |||||||||
| 13556867-C-A | 11401191-C-A | ** | |||||||||
| 13578347-C-A | 11422671-C-A | ** | |||||||||
| 13587645-C-G | 11431969-C-G | ** | |||||||||
| 13587651-G-T | 11431975-G-T | ** | |||||||||
| 13588184-A-C | 11432508-A-C | ** | |||||||||
| 13594161-G-T | 11438485-G-T | FT446127 | ** | ||||||||
| 13642308-TGATGA-T | 11486632-TGATGA-T | ** | |||||||||
| 13659556-G-T | 11503880-G-T | ** | |||||||||
| 11647836-T-C | ** | ||||||||||
| 11657948-G-T | ** | ||||||||||
| 11662290-G-T | ** | ||||||||||
| 11662381-G-T | ** | ||||||||||
| 13847232-T-A | 11726526-T-A | ** | |||||||||
| 13847234-A-T | 11726528-A-T | 4×AATGG | ** | ||||||||
| 13848178-G-A | 11727472-G-A | ** | |||||||||
| 13871417-A-G | 11750711-A-G | ** | |||||||||
| 13891002-C-A | 11770296-C-A | ** | |||||||||
| 13908335-C-A | 11787629-C-A | ** | |||||||||
| 13926468-C-T | 11805762-C-T | ** | |||||||||
| 13926486-C-A | 11805780-C-A | 10×A | ** | ||||||||
| 13929766-C-A | 11809060-C-A | ** | |||||||||
| 13936572-G-T | 11815866-G-T | ** | |||||||||
| 13942439-T-A | 11821733-T-A | ** | |||||||||
| 14016543-G-T | 11895837-G-T | ** | |||||||||
| 14036320-G-T | 11915614-G-T | FT362051 | ** | ||||||||
| 14046825-C-A | 11926119-C-A | ** | |||||||||
| 14047289-A-C | 11926583-A-C | ** | |||||||||
| 14051184-C-A | 11930478-C-A | ** | |||||||||
| 14052188-G-A | 11931482-G-A | ** | |||||||||
| 14055509-A-C | 11934803-A-C | ** | |||||||||
| 14067957-G-T | 11947251-G-T | ** | |||||||||
| 14073955-C-A | 11953249-C-A | ** | |||||||||
| 14079470-C-A | 11958764-C-A | ** | |||||||||
| 14149138-C-A | 12028432-C-A | ** | |||||||||
| 14183542-C-A | 12062836-C-A | ** | |||||||||
| 14187111-G-T | 12066405-G-T | FT201406 | ** | ||||||||
| 14198803-C-A | 12078097-C-A | FGC14733 | ** | ||||||||
| 14250496-C-A | 12129790-C-A | ** | |||||||||
| 14272752-C-A | 12152046-C-A | ** | |||||||||
| 14278501-C-A | 12157795-C-A | ** | |||||||||
| 14279896-C-A | 12159190-C-A | ** | |||||||||
| 14341999-A-G | 12221294-A-G | ** | |||||||||
| 14348761-C-T | 12228056-C-T | ** | |||||||||
| 14350070-A-C | 12229365-A-C | ** | |||||||||
| 14364246-G-T | 12243541-G-T | ** | |||||||||
| 14380316-G-T | 12259612-G-T | ** | |||||||||
| 14409167-C-A | 12288464-C-A | ** | |||||||||
| 14418209-A-G | 12297484-A-G | ** | |||||||||
| 14443080-G-T | 12322353-G-T | ** | |||||||||
| 14452810-G-C | 12332083-G-C | ** | |||||||||
| 14459897-C-T | 12339170-C-T | ** | |||||||||
| 14465385-A-C | 12344658-A-C | ** | |||||||||
| 14465437-T-G | 12344710-T-G | ** | |||||||||
| 14483054-C-A | 12362323-C-A | ** | |||||||||
| 14493631-T-C | 12381828-T-C | ** | |||||||||
| 14516370-C-A | 12404571-C-A | ** | |||||||||
| 14516805-T-C | 12405006-T-C | ** | |||||||||
| 14529471-C-A | 12417672-C-A | ** | |||||||||
| 14538699-C-A | 12426900-C-A | ** | |||||||||
| 14570040-TA-T | 12458240-TA-T | ** | |||||||||
| 14571261-G-A | 12459461-G-A | ** | |||||||||
| 14602694-G-A | 12490896-G-A | ** | |||||||||
| 14645500-C-A | 12533564-C-A | ** | |||||||||
| 14761503-C-A | 12649572-C-A | ** | |||||||||
| 14775946-C-A | 12664015-C-A | ** | |||||||||
| 14781113-G-T | 12669183-G-T | ** | |||||||||
| 14831810-C-A | 12719877-C-A | ** | |||||||||
| 14925933-G-T | 12813998-G-T | ** | |||||||||
| 14943444-C-A | 12831518-C-A | ** | |||||||||
| 14965458-G-T | 12853533-G-T | ** | |||||||||
| 14980969-C-A | 12869045-C-A | ** | |||||||||
| 14985264-A-G | 12873332-A-G | ** | |||||||||
| 14995649-C-A | 12883734-C-A | ** | |||||||||
| 15011868-C-A | 12899956-C-A | ** | |||||||||
| 15066488-C-A | 12954579-C-A | ** | |||||||||
| 15107003-C-A | 12995090-C-A | ** | |||||||||
| 15156905-C-A | 13044992-C-A | ** | |||||||||
| 15167910-A-C | 13055996-A-C | ** | |||||||||
| 15176496-C-A | 13064582-C-A | ** | |||||||||
| 15212613-G-A | 13100699-G-A | ** | |||||||||
| 15220941-A-C | 13109027-A-C | ** | |||||||||
| 15264162-C-A | 13152252-C-A | ** | |||||||||
| 15285778-C-A | 13173877-C-A | ** | |||||||||
| 15357865-C-A | 13245984-C-A | ** | |||||||||
| 15454969-C-A | 13343089-C-A | ** | |||||||||
| 15454981-A-C | 13343101-A-C | ** | |||||||||
| 15477197-C-A | 13365317-C-A | ** | |||||||||
| 15490687-C-T | 13378807-C-T | ** | |||||||||
| 15500739-G-T | 13388859-G-T | ** | |||||||||
| 15546195-C-A | 13434315-C-A | ** | |||||||||
| 15585147-G-A | 13473267-G-A | ** | |||||||||
| 15596134-C-A | 13484254-C-A | ** | |||||||||
| 15608182-CT-C | 13496302-CT-C | ** | |||||||||
| 15619868-G-C | 13507988-G-C | ** | |||||||||
| 15656784-C-A | 13544904-C-A | ** | |||||||||
| 15677648-GT-G | 13565768-GT-G | ** | |||||||||
| 15707006-C-A | 13595126-C-A | ** | |||||||||
| 15733583-C-G | 13621703-C-G | ** | |||||||||
| 15744363-C-T | 13632483-C-T | ** | |||||||||
| 15770209-C-A | 13658329-C-A | ** | |||||||||
| 15801811-C-A | 13689931-C-A | ** | |||||||||
| 15824012-A-G | 13712132-A-G | ** | |||||||||
| 15834088-C-T | 13722208-C-T | ** | |||||||||
| 15834113-T-G | 13722233-T-G | ** | |||||||||
| 15870695-A-G | 13758815-A-G | ** | |||||||||
| 15871459-A-T | 13759579-A-T | ** | |||||||||
| 15874189-C-A | 13762309-C-A | ** | |||||||||
| 15878382-C-A | 13766502-C-A | ** | |||||||||
| 15917546-A-C | 13805666-A-C | ** | |||||||||
| 15918485-C-A | 13806605-C-A | ** | |||||||||
| 15963863-C-A | 13851983-C-A | ** | |||||||||
| 16034172-C-A | 13922292-C-A | 10×A | ** | ||||||||
| 16042713-A-G | 13930833-A-G | Y19067 | ** | ||||||||
| 16044143-C-A | 13932263-C-A | ** | |||||||||
| 16053610-C-A | 13941730-C-A | ** | |||||||||
| 16053622-C-T | 13941742-C-T | FT53903 | ** | ||||||||
| 16074698-C-A | 13962818-C-A | ** | |||||||||
| 16076967-A-G | 13965087-A-G | ** | |||||||||
| 16085487-T-A | 13973607-T-A | ** | |||||||||
| 16093924-G-T | 13982044-G-T | ** | |||||||||
| 16108702-C-CTTTTTTCT | 13996822-C-CTTTTTTCT | P8_Prx | 10×TTTCT | ** | |||||||
| 16108830-C-A | 13996950-C-A | P8_Prx | ** | ||||||||
| 16177252-TC-T | 14065372-TC-T | ** | |||||||||
| 16184462-C-A | 14072582-C-A | ** | |||||||||
| 16283321-C-A | 14171441-C-A | ** | |||||||||
| 16321761-C-A | 14209881-C-A | ** | |||||||||
| 16321776-AC-A | 14209896-AC-A | ** | |||||||||
| 16321779-CAAA-C | 14209899-CAAA-C | 38×A | ** | ||||||||
| 16351499-C-A | 14239619-C-A | ** | |||||||||
| 16354237-G-T | 14242357-G-T | ** | |||||||||
| 16382190-G-T | 14270310-G-T | ** | |||||||||
| 16412383-A-G | 14300503-A-G | ** | |||||||||
| 16438013-C-A | 14326133-C-A | ** | |||||||||
| 16485877-G-T | 14373997-G-T | ** | |||||||||
| 16491908-A-T | 14380028-A-T | ** | |||||||||
| 16509482-C-A | 14397602-C-A | ** | |||||||||
| 16520786-G-T | 14408906-G-T | ** | |||||||||
| 16520883-C-A | 14409003-C-A | ** | |||||||||
| 16551034-C-A | 14439154-C-A | ** | |||||||||
| 16571918-T-C | 14460038-T-C | ** | |||||||||
| 16612413-A-C | 14500533-A-C | ** | |||||||||
| 16614705-T-G | 14502825-T-G | ** | |||||||||
| 16621026-C-A | 14509146-C-A | ** | |||||||||
| 16631650-T-C | 14519770-T-C | ** | |||||||||
| 16645567-A-G | 14533687-A-G | ** | |||||||||
| 16659000-G-T | 14547120-G-T | ** | |||||||||
| 16733590-C-A | 14621710-C-A | ** | |||||||||
| 16778670-C-A | 14666790-C-A | ** | |||||||||
| 16789747-G-T | 14677867-G-T | ** | |||||||||
| 16814865-C-A | 14702985-C-A | ** | |||||||||
| 16922164-C-A | 14810284-C-A | ** | |||||||||
| 16945651-T-G | 14833771-T-G | ** | |||||||||
| 16970406-T-G | 14858526-T-G | ** | |||||||||
| 16981154-C-A | 14869274-C-A | ** | |||||||||
| 16987680-G-T | 14875800-G-T | ** | |||||||||
| 16993735-G-T | 14881855-G-T | ** | |||||||||
| 17031743-C-A | 14919863-C-A | ** | |||||||||
| 17152741-C-A | 15040861-C-A | ** | |||||||||
| 17260430-T-G | 15148550-T-G | ** | |||||||||
| 17307231-C-A | 15195351-C-A | ** | |||||||||
| 17385299-C-A | 15273419-C-A | ** | |||||||||
| 17385677-G-T | 15273797-G-T | ** | |||||||||
| 17386724-C-A | 15274844-C-A | ** | |||||||||
| 17414792-T-G | 15302912-T-G | ** | |||||||||
| 17414808-G-T | 15302928-G-T | ** | |||||||||
| 17421590-G-T | 15309710-G-T | ** | |||||||||
| 17477151-C-A | 15365271-C-A | ** | |||||||||
| 17480288-G-T | 15368408-G-T | ** | |||||||||
| 17497076-C-A | 15385196-C-A | ** | |||||||||
| 17538707-T-G | 15426827-T-G | ** | |||||||||
| 17549249-T-C | 15437369-T-C | ** | |||||||||
| 17555798-A-G | 15443918-A-G | ** | |||||||||
| 17575541-G-T | 15463661-G-T | ** | |||||||||
| 17638691-C-A | 15526811-C-A | ** | |||||||||
| 17666522-C-A | 15554642-C-A | ** | |||||||||
| 17673020-C-A | 15561140-C-A | ** | |||||||||
| 17684540-T-G | 15572660-T-G | ** | |||||||||
| 17701613-A-C | 15589733-A-C | ** | |||||||||
| 17770619-A-G | 15658739-A-G | ** | |||||||||
| 17788976-C-A | 15677096-C-A | ** | |||||||||
| 17792182-C-A | 15680302-C-A | ** | |||||||||
| 17802017-C-A | 15690137-C-A | ** | |||||||||
| 17877036-C-A | 15765156-C-A | M6231 | ** | ||||||||
| 17912950-A-G | 15801070-A-G | ** | |||||||||
| 17913575-C-A | 15801695-C-A | ** | |||||||||
| 17925313-T-G | 15813433-T-G | ** | |||||||||
| 17947114-C-A | 15835234-C-A | ** | |||||||||
| 18020843-G-T | 15908963-G-T | ** | |||||||||
| 18093802-C-A | 15981922-C-A | ** | |||||||||
| 18136259-C-A | 16024379-C-A | ** | |||||||||
| 18165694-C-A | 16053814-C-A | ** | |||||||||
| 18205814-C-A | 16093934-C-A | ** | |||||||||
| 18239037-T-A | 16127157-T-A | ** | |||||||||
| 18382966-T-A | 16271086-T-A | P6_Gap | ** | ||||||||
| 18396640-T-G | 16284760-T-G | P6_Gap | ** | ||||||||
| 18456767-G-T | 16344887-G-T | P6_Dst | ** | ||||||||
| 18634824-C-A | 16522944-C-A | ** | |||||||||
| 18650456-C-T | 16538576-C-T | ** | |||||||||
| 18673585-CCA-C | 16561705-CCA-C | ** | |||||||||
| 18693615-T-C | 16581735-T-C | ** | |||||||||
| 18704261-TTTA-T | 16592381-TTTA-T | ** | |||||||||
| 18710481-G-T | 16598601-G-T | ** | |||||||||
| 18713985-C-A | 16602105-C-A | ** | |||||||||
| 18716667-C-A | 16604787-C-A | ** | |||||||||
| 18737462-AG-A | 16625582-AG-A | ** | |||||||||
| 18737518-C-A | 16625638-C-A | ** | |||||||||
| 18739569-C-A | 16627689-C-A | ** | |||||||||
| 18752016-A-C | 16640136-A-C | ** | |||||||||
| 18762874-C-A | 16650994-C-A | ** | |||||||||
| 18778786-C-A | 16666906-C-A | ** | |||||||||
| 18785320-A-G | 16673440-A-G | ** | |||||||||
| 18825596-C-T | 16713716-C-T | ** | |||||||||
| 18864827-C-A | 16752947-C-A | ** | |||||||||
| 18948140-A-G | 16836260-A-G | ** | |||||||||
| 18963826-C-A | 16851946-C-A | ** | |||||||||
| 19020392-C-A | 16908512-C-A | ** | |||||||||
| 19042658-G-T | 16930778-G-T | ** | |||||||||
| 19053564-C-A | 16941684-C-A | FT288664 | ** | ||||||||
| 19061771-C-A | 16949891-C-A | ** | |||||||||
| 19079039-C-T | 16967159-C-T | ** | |||||||||
| 19112184-T-C | 17000304-T-C | ** | |||||||||
| 19182022-A-G | 17070142-A-G | ** | |||||||||
| 19202724-C-A | 17090844-C-A | ** | |||||||||
| 19274826-A-C | 17162946-A-C | ** | |||||||||
| 19284879-G-T | 17172999-G-T | ** | |||||||||
| 19358125-C-A | 17246245-C-A | ** | |||||||||
| 19409946-G-A | 17298066-G-A | ** | |||||||||
| 19411636-A-G | 17299756-A-G | ** | |||||||||
| 19424894-G-T | 17313014-G-T | ** | |||||||||
| 19439647-T-G | 17327767-T-G | ** | |||||||||
| 19444651-C-A | 17332771-C-A | ** | |||||||||
| 19445343-C-A | 17333463-C-A | ** | |||||||||
| 19449128-C-A | 17337248-C-A | ** | |||||||||
| 19453017-G-T | 17341137-G-T | ** | |||||||||
| 19472513-T-C | 17360633-T-C | ** | |||||||||
| 19505311-A-G | 17393431-A-G | ** | |||||||||
| 19530545-T-C | 17418665-T-C | ** | |||||||||
| 19530550-G-A | 17418670-G-A | ** | |||||||||
| 19530558-C-T | 17418678-C-T | ** | |||||||||
| 19706670-C-A | 17594790-C-A | P5_Prx | ** | ||||||||
| 20470188-G-T | 18308302-G-T | P5_Dst | ** | ||||||||
| 20834121-C-A | 18672235-C-A | P4_Gap | ** | ||||||||
| 20979250-C-A | 18817364-C-A | P4_Dst | ** | ||||||||
| 21090938-C-A | 18929052-C-A | ** | |||||||||
| 21092705-C-A | 18930819-C-A | ** | |||||||||
| 21092768-G-A | 18930882-G-A | ** | |||||||||
| 21118472-C-A | 18956586-C-A | ** | |||||||||
| 21133513-G-A | 18971627-G-A | ** | |||||||||
| 21139307-G-A | 18977421-G-A | ** | |||||||||
| 21141448-C-A | 18979562-C-A | ** | |||||||||
| 21148589-C-T | 18986703-C-T | 30×A | ** | ||||||||
| 21152788-C-A | 18990902-C-A | ** | |||||||||
| 21156953-T-C | 18995067-T-C | ** | |||||||||
| 21182431-C-A | 19020545-C-A | ** | |||||||||
| 21202668-G-T | 19040782-G-T | ** | |||||||||
| 21230144-C-A | 19068258-C-A | ** | |||||||||
| 21286214-C-T | 19124328-C-T | ** | |||||||||
| 21300077-C-A | 19138191-C-A | ** | |||||||||
| 21301430-T-C | 19139544-T-C | ** | |||||||||
| 21307099-C-A | 19145213-C-A | ** | |||||||||
| 21318392-G-T | 19156506-G-T | ** | |||||||||
| 21318402-A-C | 19156516-A-C | ** | |||||||||
| 21464437-C-T | 19302551-C-T | ** | |||||||||
| 21549230-C-A | 19387344-C-A | ** | |||||||||
| 21583797-T-C | 19421911-T-C | ** | |||||||||
| 21663254-C-A | 19501368-C-A | ** | |||||||||
| 21700319-G-A | 19538433-G-A | ** | |||||||||
| 21714618-A-C | 19552732-A-C | ** | |||||||||
| 21816439-T-G | 19654553-T-G | ** | |||||||||
| 21856611-G-A | 19694725-G-A | ** | |||||||||
| 21883462-T-C | 19721576-T-C | Y107779 | ** | ||||||||
| 21890844-T-A | 19728958-T-A | ** | |||||||||
| 21890849-G-A | 19728963-G-A | ** | |||||||||
| 21895465-T-G | 19733579-T-G | ** | |||||||||
| 21895490-G-A | 19733604-G-A | ** | |||||||||
| 21943911-G-A | 19782025-G-A | ** | |||||||||
| 21992495-C-A | 19830609-C-A | ** | |||||||||
| 22001997-C-A | 19840111-C-A | ** | |||||||||
| 22033409-A-T | 19871523-A-T | ** | |||||||||
| 22167920-G-C | 20006034-G-C | ** | |||||||||
| 22561375-C-G | 20399489-C-G | ** | |||||||||
| 22657833-C-A | 20495947-C-A | ** | |||||||||
| 22696493-G-T | 20534607-G-T | FT44006 | ** | ||||||||
| 22797491-C-A | 20635605-C-A | ** | |||||||||
| 22810140-G-T | 20648254-G-T | ** | |||||||||
| 22811606-C-A | 20649720-C-A | ** | |||||||||
| 22811669-C-A | 20649783-C-A | ** | |||||||||
| 22854650-C-A | 20692764-C-A | ** | |||||||||
| 22869700-C-A | 20707814-C-A | ** | |||||||||
| 22916719-C-T | 20754833-C-T | ** | |||||||||
| 22948179-T-C | 20786293-T-C | ** | |||||||||
| 22969025-C-A | 20807139-C-A | ** | |||||||||
| 22991324-T-G | 20829438-T-G | ** | |||||||||
| 23081951-C-A | 20920065-C-A | ** | |||||||||
| 23119981-C-A | 20958095-C-A | ** | |||||||||
| 23141062-C-A | 20979176-C-A | ** | |||||||||
| 23209731-G-A | 21047845-G-A | ** | |||||||||
| 23264143-G-A | 21102257-G-A | ** | |||||||||
| 23291292-T-C | 21129406-T-C | ** | |||||||||
| 23294224-T-G | 21132338-T-G | M4423 | ** | ||||||||
| 23355110-C-A | 21193224-C-A | ** | |||||||||
| 23373459-C-A | 21211573-C-A | ** | |||||||||
| 23377495-G-A | 21215609-G-A | ** | |||||||||
| 23393541-G-T | 21231655-G-T | FT252717 | ** | ||||||||
| 23411318-C-A | 21249432-C-A | ** | |||||||||
| 23476271-G-T | 21314385-G-T | ** | |||||||||
| 23552738-CAA-C | 21390852-CAA-C | 9×A | ** | ||||||||
| 23552763-G-A | 21390877-G-A | ** | |||||||||
| 23589223-A-T | 21427337-A-T | ** | |||||||||
| 23609158-C-A | 21447272-C-A | ** | |||||||||
| 23789506-C-T | 21627620-C-T | ** | |||||||||
| 21780476-A-C | ** | ||||||||||
| 23997742-C-A | 21851595-C-A | ** | |||||||||
| 24071829-G-T | 21925682-G-T | P3_b1 | ** | ||||||||
| 24385218-G-T | 22239071-G-T | ** | |||||||||
| 24422585-G-T | 22276438-G-T | ** | |||||||||
| 24445273-A-G | 22299126-A-G | ** | |||||||||
| 25088319-C-A | 22942172-C-A | g1 | ** | ||||||||
| 25173622-G-T | 23027475-G-T | g1 | ** | ||||||||
| 26010258-ATG-A | 23864111-ATG-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
| 26114644-CA-C | 23968497-CA-C | P1_Y1 | ** | ||||||||
| 27039077-T-C | 24892930-T-C | P1_r4 | ** | ||||||||
| 27647782-C-A | 25501635-C-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
| 28017919-G-T | 25871772-G-T | P1_Y2 | ** | ||||||||
| 28024574-C-A | 25878427-C-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
| 28476891-A-G | 26330744-A-G | ** | |||||||||
| 28484295-A-C | 26338148-A-C | ** | |||||||||
| 28505353-C-A | 26359206-C-A | ** | |||||||||
| 28510121-C-A | 26363974-C-A | ** | |||||||||
| 28513004-G-T | 26366857-G-T | ** | |||||||||
| 28513167-G-T | 26367020-G-T | ** | |||||||||
| 28544329-C-A | 26398182-C-A | ** | |||||||||
| 28548600-C-A | 26402453-C-A | ** | |||||||||
| 28596867-G-A | 26450720-G-A | FT289085 | ** | ||||||||
| 28658370-C-A | 26512223-C-A | ** | |||||||||
| 28658705-C-A | 26512558-C-A | ** | |||||||||
| 28711929-C-A | 26565782-C-A | ** | |||||||||
| 28714849-C-A | 26568702-C-A | ** | |||||||||
| 28728309-G-C | 26582162-G-C | ** | |||||||||
| 28742667-T-G | 26596520-T-G | ** | |||||||||
| 28743108-C-A | 26596961-C-A | ** | |||||||||
| 28754483-A-T | 26608336-A-T | ** | |||||||||
| 28760850-G-T | 26614703-G-T | ** | |||||||||
| 28760854-G-T | 26614707-G-T | ** | |||||||||
| 28767716-C-A | 26621569-C-A | ** | |||||||||
| 28816094-T-G | 26669947-T-G | ** | |||||||||
| 56826222-C-A | ** | ||||||||||
| 56826242-C-A | ** | ||||||||||
| 56859802-G-T | ** | ||||||||||
| 30945-C-T | ** | ||||||||||
| 30952-AG-A | ** | ||||||||||
| 30956-T-TG | ** | ||||||||||
| 30964-C-T | ** | ||||||||||
| 30978-G-T | ** | ||||||||||
| 26411961-TAAA-T | 24265814-TAAA-T | P1_Y1 | 13×A | ** | |||||||
| 6297969-T-C | 6429928-T-C | IR3_Dst | ** | ||||||||
| 23447528-T-G | 21285642-T-G | ** | |||||||||
| 17948-C-A | ** | ||||||||||
| 13846562-T-A | 11725856-T-A | *** | |||||||||
| 26152245-T-C | 24006098-T-C | P1_Y1 | *** | ||||||||
| 26152247-G-C | 24006100-G-C | P1_Y1 | *** | ||||||||
| 10017746-T-C | 10180137-T-C | *** | |||||||||
| 7651844-C-CTG | 7783803-C-CTG | *** | |||||||||
| 7651845-A-T | 7783804-A-T | *** | |||||||||
| 7651846-C-T | 7783805-C-T | *** | |||||||||
| 13847985-G-A | 11727279-G-A | *** | |||||||||
| 4243208-G-A | 4375167-G-A | FT319999 | *** | ||||||||
| 6001170-G-C | 6133129-G-C | *** | |||||||||
| 7651870-G-T | 7783829-G-T | *** | |||||||||
| 7651876-A-T | 7783835-A-T | *** | |||||||||
| 10020511-CAAAAGAAAAG-C,GAAAAGAAAAG | 10182902-CAAAAGAAAAG-C,GAAAAGAAAAG | 10×AAAAG | *** | ||||||||
| 13446527-C-CTCCATTCCATTCCAT | 11290851-C-CTCCATTCCATTCCAT | 16×TCCAT | *** | ||||||||
| 13458118-TTCCAG-T | 11302442-TTCCAG-T | *** | |||||||||
| 13459473-T-G | 11303797-T-G | *** | |||||||||
| 13812811-G-GGCCTC | 11692105-G-GGCCTC | *** | |||||||||
| 13812921-AC-A | 11692215-AC-A | *** | |||||||||
| 13862069-T-G | 11741363-T-G | *** | |||||||||
| 22227833-G-A | 20065947-G-A | DYZ19 | *** | ||||||||
| 22328821-T-G | 20166935-T-G | DYZ19 | *** | ||||||||
| 22451196-G-T | 20289310-G-T | DYZ19 | *** | ||||||||
| 25232734-A-G | 23086587-A-G | P2_r1 | *** | ||||||||
| 25284584-AG-A | 23138437-AG-A | P2_r1 | *** | ||||||||
| 25325084-CAGTA-C | 23178937-CAGTA-C | P2_r1 | *** | ||||||||
| 26170451-C-CAGA | 24024304-C-CAGA | P1_Y1 | 23×AGA | *** | |||||||
| 58865966-TC-T | 56724902-AG-A | *** | |||||||||
| 14031750-C-CTT | 11911044-C-CTT | 4×TCTT | *** | ||||||||
| 2892542-ATTTTTT-A | 3024501-ATTTTTT-A | 18×T | *** | ||||||||
| 8975252-G-T | 9137643-G-T | *** | |||||||||
| 58979499-A-T | 56833352-A-T | *** | |||||||||
| 22425336-G-C | 20263450-G-C | DYZ19 | *** | ||||||||
| 58978270-C-A | 56832123-C-A | *** | |||||||||
| 7333253-GTCTC-G | 7465212-GTCTC-G | 8×TC | *** | ||||||||
| 16174056-C-A | 14062176-C-A | *** | |||||||||
| 14825824-CTTTTTTTT-C | 12713891-CTTTTTTTT-C | 18×T | *** | ||||||||
| 10958379-C-T | *** | ||||||||||
| 10807286-T-C | *** | ||||||||||
| 8558530-CTT-C,CT | 8690489-CTT-C,CT | 13×T | *** | ||||||||
| 15359413-CA-C | 13247533-CA-C | 8×A | *** | ||||||||
| 8981199-G-T | 9143590-G-T | *** | |||||||||
| 10807241-T-A | *** | ||||||||||
| 17328941-C-A | 15217061-C-A | *** | |||||||||
| 21251885-CAA-C | 19089999-CAA-C | 11×A | *** | ||||||||
| 2755269-C-A | 2887228-C-A | *** | |||||||||
| 2888626-C-A | 3020585-C-A | *** | |||||||||
| 6694075-T-C | 6826034-T-C | *** | |||||||||
| 6882644-G-A | 7014603-G-A | *** | |||||||||
| 6953749-C-A | 7085708-C-A | *** | |||||||||
| 6978975-C-A | 7110934-C-A | *** | |||||||||
| 6979548-T-C | 7111507-T-C | *** | |||||||||
| 7056163-C-A | 7188122-C-A | *** | |||||||||
| 7142039-C-A | 7273998-C-A | *** | |||||||||
| 7197675-C-A | 7329634-C-A | *** | |||||||||
| 7519217-C-A | 7651176-C-A | *** | |||||||||
| 7700762-C-A | 7832721-C-A | *** | |||||||||
| 7708719-C-A | 7840678-C-A | *** | |||||||||
| 7920048-G-C | 8052007-G-C | FT4815 | *** | ||||||||
| 8027003-C-A | 8158962-C-A | *** | |||||||||
| 8047123-C-A | 8179082-C-A | *** | |||||||||
| 8075597-C-A | 8207556-C-A | *** | |||||||||
| 8427638-G-T | 8559597-G-T | *** | |||||||||
| 8437493-C-A | 8569452-C-A | *** | |||||||||
| 8441308-C-A | 8573267-C-A | *** | |||||||||
| 8449684-A-G | 8581643-A-G | *** | |||||||||
| 8540705-C-A | 8672664-C-A | *** | |||||||||
| 8549481-C-A | 8681440-C-A | *** | |||||||||
| 8585565-C-A | 8717524-C-A | *** | |||||||||
| 8632598-C-A | 8764557-C-A | *** | |||||||||
| 8643286-C-A | 8775245-C-A | *** | |||||||||
| 8644204-C-A | 8776163-C-A | FT115912 | *** | ||||||||
| 8770433-C-A | 8902392-C-A | *** | |||||||||
| 8852478-C-A | 8984437-C-A | *** | |||||||||
| 9136799-C-A | 9299190-C-A | *** | |||||||||
| 9983479-C-A | 10145870-C-A | *** | |||||||||
| 10008065-G-A | 10170456-G-A | *** | |||||||||
| 10038998-C-A | 10201389-C-A | *** | |||||||||
| 10807274-T-G | *** | ||||||||||
| 10807298-C-T | *** | ||||||||||
| 10807300-AG-A | *** | ||||||||||
| 10824187-CAT-AAT,C | *** | ||||||||||
| 10912499-C-A | *** | ||||||||||
| 13194838-TC-T | 11039162-TC-T | *** | |||||||||
| 13215634-C-A | 11059958-C-A | *** | |||||||||
| 13464199-C-T | 11308523-C-T | *** | |||||||||
| 13472193-C-A,T | 11316517-C-A,T | *** | |||||||||
| 13481848-C-A | 11326172-C-A | *** | |||||||||
| 13489307-C-T | 11333631-C-T | BY86239 | *** | ||||||||
| 13493989-C-G | 11338313-C-G | *** | |||||||||
| 13800015-C-A | 11679309-C-A | *** | |||||||||
| 13848072-T-G | 11727366-T-G | *** | |||||||||
| 14149077-C-A | 12028371-C-A | *** | |||||||||
| 14219132-C-A | 12098426-C-A | *** | |||||||||
| 14266167-C-A | 12145461-C-A | *** | |||||||||
| 14398556-C-A | 12277852-C-A | *** | |||||||||
| 14577173-C-A | 12465373-C-A | *** | |||||||||
| 14600365-C-A | 12488565-C-A | *** | |||||||||
| 14875618-TTTG-T | 12763688-TTTG-T | *** | |||||||||
| 15336905-C-A | 13225023-C-A | *** | |||||||||
| 15472266-G-T | 13360386-G-T | *** | |||||||||
| 15527566-C-A | 13415686-C-A | FT239743 | *** | ||||||||
| 15739191-C-A | 13627311-C-A | *** | |||||||||
| 16057442-A-T | 13945562-A-T | *** | |||||||||
| 16275230-C-A | 14163350-C-A | *** | |||||||||
| 16457866-C-A | 14345986-C-A | *** | |||||||||
| 16463270-C-T | 14351390-C-T | *** | |||||||||
| 16583501-G-T | 14471621-G-T | *** | |||||||||
| 16927091-C-A | 14815211-C-A | *** | |||||||||
| 16943552-C-A | 14831672-C-A | *** | |||||||||
| 17142021-T-C | 15030141-T-C | *** | |||||||||
| 17146505-C-T | 15034625-C-T | *** | |||||||||
| 17231590-G-A | 15119710-G-A | *** | |||||||||
| 17443121-C-A | 15331241-C-A | *** | |||||||||
| 17475905-C-A | 15364025-C-A | *** | |||||||||
| 17504827-C-G | 15392947-C-G | *** | |||||||||
| 17702730-C-A | 15590850-C-A | *** | |||||||||
| 17756625-T-C | 15644745-T-C | *** | |||||||||
| 17918936-C-A | 15807056-C-A | *** | |||||||||
| 18236734-C-A | 16124854-C-A | *** | |||||||||
| 18252026-C-A | 16140146-C-A | *** | |||||||||
| 18727693-C-T | 16615813-C-T | F22840 | *** | ||||||||
| 18767936-G-A | 16656056-G-A | BY123735 | *** | ||||||||
| 18986351-C-A | 16874471-C-A | *** | |||||||||
| 19089411-GGCTT-G | 16977531-GGCTT-G | *** | |||||||||
| 19121383-T-C | 17009503-T-C | *** | |||||||||
| 19122328-T-G | 17010448-T-G | *** | |||||||||
| 19368360-G-GA | 17256480-G-GA | 9×A | *** | ||||||||
| 19420012-C-A | 17308132-C-A | *** | |||||||||
| 19501274-C-A | 17389394-C-A | *** | |||||||||
| 20473086-C-A | 18311200-C-A | P5_Dst | *** | ||||||||
| 20839661-C-A | 18677775-C-A | P4_Gap | *** | ||||||||
| 21039356-C-A | 18877470-C-A | *** | |||||||||
| 21084681-C-A | 18922795-C-A | *** | |||||||||
| 21117389-C-A | 18955503-C-A | *** | |||||||||
| 21434937-C-A | 19273051-C-A | *** | |||||||||
| 21642906-C-A | 19481020-C-A | *** | |||||||||
| 21882903-C-A | 19721017-C-A | *** | |||||||||
| 22008478-C-A | 19846592-C-A | *** | |||||||||
| 22732870-T-C | 20570984-T-C | *** | |||||||||
| 22904959-G-A | 20743073-G-A | *** | |||||||||
| 22915242-C-A | 20753356-C-A | *** | |||||||||
| 22952322-C-A | 20790436-C-A | *** | |||||||||
| 23025724-T-C | 20863838-T-C | *** | |||||||||
| 23060795-C-A | 20898909-C-A | *** | |||||||||
| 23188810-C-A | 21026924-C-A | *** | |||||||||
| 23512112-C-A | 21350226-C-A | *** | |||||||||
| 23742229-G-T | 21580343-G-T | *** | |||||||||
| 23981738-C-A | 21835591-C-A | *** | |||||||||
| 23981767-G-T | 21835620-G-T | *** | |||||||||
| 24523593-CA-C,CAA | 22377446-CA-C,CAA | 13×A | *** | ||||||||
| 24880049-C-A | 22733902-C-A | g1 | *** | ||||||||
| 28566746-C-A | 26420599-C-A | *** | |||||||||
| 28622572-ATT-A,AT | 26476425-ATT-A,AT | 14×T | *** | ||||||||
| 28706219-C-A | 26560072-C-A | *** | |||||||||
| 56832115-C-A | *** | ||||||||||
| 23421043-ATTT-A,ATTTT | 21259157-ATTT-A,ATTTT | 22×T | *** | ||||||||
| 6688055-G-A | 6820014-G-A | *** | |||||||||
| 4583112-A-T | 4715071-A-T | *** | |||||||||
| 16818971-GTATATATATATATATATATATATATATA-G,GTATATATATATATATATATATATATA | 14707091-GTATATATATATATATATATATATATATA-G,GTATATATATATATATATATATATATA | 21×TA | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
| Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
|---|---|---|---|
| Manual | 13929725-C-T | 11809019-C-T | YFull: 2C 7T |