McKeown
FTDNA: 217586, BigY3: 217586, BigY2: 217586Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 217586 | BigY3 217586 | BigY2 217586 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
18323801-G-A | 16211921-G-A | FGC3236 Y51750 | FT401876 | P6_Prx | *** | A* | |||||
56830711-A-G | A* | ||||||||||
20637065-C-T | 18475179-C-T | P4_Prx | A* | ||||||||
8227953-G-T | 8359912-G-T | FGC40091 | Y | Y | + | + | + | ||||
4540085-AT-A | 4672044-AT-A | 9×T | + | ** | |||||||
21109320-C-T | 18947434-C-T | FT144224 | Y | + | |||||||
58866110-C-T | 56724761-G-A | ** | |||||||||
13143855-C-A | 10633341-C-A | ** | |||||||||
16784428-G-A | 14672548-G-A | 10×A | ** | ||||||||
28609552-CTTTT-C | 26463405-CTTTT-C | 17×T | ** | ||||||||
28545039-G-A | 26398892-G-A | ** | |||||||||
19604795-G-T | 17492915-G-T | P5_Prx | ** | ||||||||
10018129-TTTTA-T | 10180520-TTTTA-T | 5×TTTA | ** | ||||||||
21323048-GAC-G | 19161162-GAC-G | ** | |||||||||
6827223-G-T | 6959182-G-T | ** | |||||||||
13143819-C-A | 10633305-C-A | ** | |||||||||
10617665-C-A | ** | ||||||||||
13487713-G-C | 11332037-G-C | ** | |||||||||
28761375-T-C | 26615228-T-C | ** | |||||||||
11032203-A-G | ** | ||||||||||
11032208-A-ATTCCT | ** | ||||||||||
6264484-T-TC | 6396443-T-TC | IR3_Dst | ** | ||||||||
15536358-C-A | 13424478-C-A | ** | |||||||||
10796172-C-T | ** | ||||||||||
19775342-A-T | 17663462-A-T | P5_Prx | ** | ||||||||
17183149-TC-T | 15071269-TC-T | ** | |||||||||
2745985-G-A | 2877944-G-A | ** | |||||||||
2746028-T-C | 2877987-T-C | ** | |||||||||
2746033-A-G | 2877992-A-G | ** | |||||||||
16309169-CG-C | 14197289-CG-C | ** | |||||||||
16309175-A-G | 14197295-A-G | ** | |||||||||
10926677-CCGTTG-C | ** | ||||||||||
15333781-G-T | 13221899-G-T | ** | |||||||||
27791980-GCTTCTT-G | 25645833-GCTTCTT-G | P1_Y2 | 9×CTT | ** | |||||||
56823295-T-TAC | 13×AC | ** | |||||||||
10940763-C-A | ** | ||||||||||
21211722-C-A | 19049836-C-A | ** | |||||||||
21836476-C-A | 19674590-C-A | ** | |||||||||
2685665-G-GTT | 2817624-G-GTT | ** | |||||||||
2745979-T-A | 2877938-T-A | ** | |||||||||
2746019-G-A | 2877978-G-A | ** | |||||||||
2746019-G-GAA | 2877978-G-GAA | ** | |||||||||
2746035-C-T | 2877994-C-T | ** | |||||||||
2746037-T-G | 2877996-T-G | ** | |||||||||
2746041-G-A | 2878000-G-A | ** | |||||||||
2786174-A-T | 2918133-A-T | ** | |||||||||
2792950-A-T | 2924909-A-T | ** | |||||||||
2942253-G-T | 3074212-G-T | ** | |||||||||
2989505-G-T | 3121464-G-T | ** | |||||||||
3053592-G-T | 3185551-G-T | ** | |||||||||
3064499-C-A | 3196458-C-A | ** | |||||||||
3065289-G-T | 3197248-G-T | ** | |||||||||
3065357-G-T | 3197316-G-T | ** | |||||||||
3081947-CTAAAGAGCTAA-C | 3213906-CTAAAGAGCTAA-C | ** | |||||||||
3111646-C-A | 3243605-C-A | ** | |||||||||
3139383-C-A | 3271342-C-A | FT74371 | ** | ||||||||
3225596-G-T | 3357555-G-T | ** | |||||||||
3229144-C-A | 3361103-C-A | ** | |||||||||
3229154-CAAAAAAA-C | 3361113-CAAAAAAA-C | 20×A | ** | ||||||||
3272551-C-A | 3404510-C-A | ** | |||||||||
3327736-C-A | 3459695-C-A | ** | |||||||||
3361780-G-A | 3493739-G-A | ** | |||||||||
3391192-G-T | 3523151-G-T | ** | |||||||||
3391281-G-T | 3523240-G-T | ** | |||||||||
3391334-C-T | 3523293-C-T | ** | |||||||||
3417769-G-C | 3549728-G-C | ** | |||||||||
3440635-C-A | 3572594-C-A | ** | |||||||||
3515741-T-C | 3647700-T-C | ** | |||||||||
3528171-C-A | 3660130-C-A | ** | |||||||||
3533120-C-A | 3665079-C-A | ** | |||||||||
3535049-G-T | 3667008-G-T | ** | |||||||||
3546669-G-A | 3678628-G-A | FTB57337 | ** | ||||||||
3592494-C-A | 3724453-C-A | ** | |||||||||
3600485-G-A | 3732444-G-A | ** | |||||||||
3618478-T-C | 3750437-T-C | ** | |||||||||
3641401-C-A | 3773360-C-A | FTB84905 | ** | ||||||||
3688331-C-A | 3820290-C-A | ** | |||||||||
3705090-A-G | 3837049-A-G | ** | |||||||||
3770550-T-G | 3902509-T-G | ** | |||||||||
3820846-T-G | 3952805-T-G | ** | |||||||||
3834237-T-G | 3966196-T-G | ** | |||||||||
3962732-C-A | 4094691-C-A | ** | |||||||||
4017338-G-T | 4149297-G-T | ** | |||||||||
4108436-G-A | 4240395-G-A | ** | |||||||||
4130003-C-A | 4261962-C-A | ** | |||||||||
4235720-G-A | 4367679-G-A | ** | |||||||||
4265590-G-A | 4397549-G-A | ** | |||||||||
4366261-C-T | 4498220-C-T | ** | |||||||||
4419887-G-C | 4551846-G-C | ** | |||||||||
4426383-A-G | 4558342-A-G | ** | |||||||||
4510254-A-G | 4642213-A-G | ** | |||||||||
4563409-G-T | 4695368-G-T | ** | |||||||||
4626054-C-A | 4758013-C-A | ** | |||||||||
4755872-T-A | 4887831-T-A | ** | |||||||||
4760664-G-A | 4892623-G-A | ** | |||||||||
4835864-C-A | 4967823-C-A | ** | |||||||||
4897878-T-C | 5029837-T-C | ** | |||||||||
4902983-G-C | 5034942-G-C | ** | |||||||||
4930310-C-A | 5062269-C-A | ** | |||||||||
4937413-C-A | 5069372-C-A | ** | |||||||||
5000650-C-A | 5132609-C-A | ** | |||||||||
5061316-G-T | 5193275-G-T | ** | |||||||||
5094995-A-AT | 5226954-A-AT | 10×T | ** | ||||||||
5126442-G-A | 5258401-G-A | ** | |||||||||
5171532-T-G | 5303491-T-G | ** | |||||||||
5190793-C-A | 5322752-C-A | ** | |||||||||
5203476-G-T | 5335435-G-T | ** | |||||||||
5220361-C-A | 5352320-C-A | ** | |||||||||
5266810-G-A | 5398769-G-A | ** | |||||||||
5293479-C-A | 5425438-C-A | ** | |||||||||
5309536-C-A | 5441495-C-A | ** | |||||||||
5311263-G-A | 5443222-G-A | ** | |||||||||
5347858-C-T | 5479817-C-T | ** | |||||||||
5359887-G-T | 5491846-G-T | ** | |||||||||
5409635-C-T | 5541594-C-T | ** | |||||||||
5451640-T-G | 5583599-T-G | ** | |||||||||
5451723-G-A | 5583682-G-A | ** | |||||||||
5458576-C-A | 5590535-C-A | ** | |||||||||
5579892-A-G | 5711851-A-G | ** | |||||||||
5579949-G-T | 5711908-G-T | ** | |||||||||
5675589-C-T | 5807548-C-T | ** | |||||||||
5687289-T-A | 5819248-T-A | ** | |||||||||
5698784-G-T | 5830743-G-T | ** | |||||||||
5802913-C-A | 5934872-C-A | ** | |||||||||
5830377-C-A | 5962336-C-A | ** | |||||||||
5872049-C-T | 6004008-C-T | ** | |||||||||
5894896-C-A | 6026855-C-A | ** | |||||||||
5894919-C-A | 6026878-C-A | ** | |||||||||
5927423-T-C | 6059382-T-C | ** | |||||||||
5936044-C-A | 6068003-C-A | ** | |||||||||
5937073-T-A | 6069032-T-A | ** | |||||||||
5996424-C-A | 6128383-C-A | ** | |||||||||
6040265-C-A | 6172224-C-A | FTA43066 | ** | ||||||||
6064031-C-A | 6195990-C-A | ** | |||||||||
6064357-A-T | 6196316-A-T | ** | |||||||||
6082543-T-C | 6214502-T-C | ** | |||||||||
6133801-C-A | 6265760-C-A | ** | |||||||||
6359720-G-T | 6491679-G-T | ** | |||||||||
6368180-A-G | 6500139-A-G | ** | |||||||||
6368666-T-C | 6500625-T-C | ** | |||||||||
6414973-A-C | 6546932-A-C | ** | |||||||||
6415093-A-G | 6547052-A-G | ** | |||||||||
6461820-C-A | 6593779-C-A | ** | |||||||||
6474584-C-A | 6606543-C-A | ** | |||||||||
6474641-C-T | 6606600-C-T | ** | |||||||||
6490445-A-G | 6622404-A-G | ** | |||||||||
6516718-C-A | 6648677-C-A | ** | |||||||||
6597771-C-A | 6729730-C-A | ** | |||||||||
6682410-C-A | 6814369-C-A | ** | |||||||||
6711189-C-A | 6843148-C-A | ** | |||||||||
6822368-C-G | 6954327-C-G | ** | |||||||||
6830552-A-G | 6962511-A-G | ** | |||||||||
6830560-A-T | 6962519-A-T | ** | |||||||||
6998190-A-T | 7130149-A-T | ** | |||||||||
7020957-C-A | 7152916-C-A | ** | |||||||||
7042543-G-T | 7174502-G-T | ** | |||||||||
7048453-C-A | 7180412-C-A | ** | |||||||||
7102411-C-A | 7234370-C-A | ** | |||||||||
7107413-C-A | 7239372-C-A | ** | |||||||||
7188413-C-A | 7320372-C-A | ** | |||||||||
7218178-G-T | 7350137-G-T | ** | |||||||||
7239123-A-G | 7371082-A-G | ** | |||||||||
7304378-A-C | 7436337-A-C | ** | |||||||||
7313139-T-C | 7445098-T-C | ** | |||||||||
7423657-T-A | 7555616-T-A | ** | |||||||||
7579762-A-G | 7711721-A-G | ** | |||||||||
7590722-G-A | 7722681-G-A | ** | |||||||||
7754153-G-T | 7886112-G-T | ** | |||||||||
7821179-C-A | 7953138-C-A | ** | |||||||||
7939454-C-A | 8071413-C-A | ** | |||||||||
7996336-T-C | 8128295-T-C | ** | |||||||||
8080319-G-C | 8212278-G-C | ** | |||||||||
8174490-G-T | 8306449-G-T | ** | |||||||||
8237121-C-A | 8369080-C-A | ** | |||||||||
8345683-C-G | 8477642-C-G | ** | |||||||||
8723802-T-C | 8855761-T-C | ** | |||||||||
8725128-T-C | 8857087-T-C | ** | |||||||||
8735137-A-G | 8867096-A-G | ** | |||||||||
8776645-C-T | 8908604-C-T | ** | |||||||||
8786719-G-T | 8918678-G-T | ** | |||||||||
8812141-T-A | 8944100-T-A | ** | |||||||||
8812148-C-G | 8944107-C-G | ** | |||||||||
8851919-C-A | 8983878-C-A | ** | |||||||||
9119105-G-T | ** | ||||||||||
8986743-C-A | 9149134-C-A | ** | |||||||||
9492156-A-G | 9654547-A-G | ** | |||||||||
9492161-G-A | 9654552-G-A | ** | |||||||||
9492162-C-T | 9654553-C-T | ** | |||||||||
9492168-C-T | 9654559-C-T | ** | |||||||||
9513923-G-T | 9676314-G-T | ** | |||||||||
9799522-C-A | 9961913-C-A | ** | |||||||||
9824331-C-A | 9986722-C-A | ** | |||||||||
9941195-C-A | 10103586-C-A | ** | |||||||||
9966040-A-T | 10128431-A-T | ** | |||||||||
9990952-C-A | 10153343-C-A | ** | |||||||||
10000672-T-C | 10163063-T-C | ** | |||||||||
10026282-C-A | 10188673-C-A | ** | |||||||||
10028089-C-A | 10190480-C-A | ** | |||||||||
10044552-G-A | 10206943-G-A | ** | |||||||||
10079648-G-T | 10242039-G-T | ** | |||||||||
10632699-G-A | ** | ||||||||||
13143737-T-C | 10633223-T-C | ** | |||||||||
10633230-C-G | ** | ||||||||||
10633247-A-G | ** | ||||||||||
10633290-C-G | ** | ||||||||||
10633306-C-A | ** | ||||||||||
10633311-C-T | ** | ||||||||||
10633312-A-G | ** | ||||||||||
10652436-G-T | ** | ||||||||||
10656912-C-A | ** | ||||||||||
10658730-A-G | ** | ||||||||||
10668947-C-A | ** | ||||||||||
10669019-C-A | ** | ||||||||||
10671719-C-A | ** | ||||||||||
10677000-C-A | ** | ||||||||||
10692646-C-T | ** | ||||||||||
10692666-C-A | ** | ||||||||||
10692672-C-T | ** | ||||||||||
10748153-T-A | ** | ||||||||||
10760576-C-A | ** | ||||||||||
10766399-C-T | ** | ||||||||||
10773815-C-A | ** | ||||||||||
10778005-C-A | ** | ||||||||||
10781435-C-A | ** | ||||||||||
10783390-C-A | ** | ||||||||||
10791096-G-A | ** | ||||||||||
10792911-T-C | ** | ||||||||||
10796152-C-T | ** | ||||||||||
10800596-A-G | ** | ||||||||||
10803646-C-A | ** | ||||||||||
10803748-C-A | ** | ||||||||||
10806601-C-A | ** | ||||||||||
10811708-C-A | ** | ||||||||||
10814743-C-A | ** | ||||||||||
10815213-G-A | ** | ||||||||||
10818963-T-C | ** | ||||||||||
10822326-C-A | ** | ||||||||||
10824251-C-A | ** | ||||||||||
10834443-T-C | ** | ||||||||||
10841090-T-C | ** | ||||||||||
10842844-C-A | ** | ||||||||||
10845569-G-A | ** | ||||||||||
10848512-C-T | ** | ||||||||||
10866887-A-C | FT230049 | ** | |||||||||
10871063-A-G | ** | ||||||||||
10871068-A-C | ** | ||||||||||
10871083-A-T | ** | ||||||||||
10877885-T-C | ** | ||||||||||
10878346-T-C | ** | ||||||||||
10878349-C-G | ** | ||||||||||
10883198-C-A | ** | ||||||||||
10884054-C-T | ** | ||||||||||
10884059-C-T | ** | ||||||||||
10884062-G-C | ** | ||||||||||
10885505-C-A | ** | ||||||||||
10889516-G-A | ** | ||||||||||
10896072-C-A | ** | ||||||||||
10899032-T-C | ** | ||||||||||
10899052-T-C | ** | ||||||||||
10899057-T-A | ** | ||||||||||
10903323-G-A | FT436046 | ** | |||||||||
10903324-A-G | ** | ||||||||||
10903327-C-T | ** | ||||||||||
10903338-T-G | ** | ||||||||||
10903342-G-C | ** | ||||||||||
10903345-G-C | ** | ||||||||||
10903356-G-T | ** | ||||||||||
10903360-A-T | ** | ||||||||||
10903366-T-G | ** | ||||||||||
10903367-T-G | ** | ||||||||||
10914605-G-T | ** | ||||||||||
10921361-C-A | ** | ||||||||||
10924431-C-A | ** | ||||||||||
10932491-T-G | ** | ||||||||||
10932565-C-G | ** | ||||||||||
10939906-T-C | ** | ||||||||||
10943466-C-A | ** | ||||||||||
10945350-A-C | ** | ||||||||||
10946489-C-A | ** | ||||||||||
10947696-T-A | ** | ||||||||||
10947745-G-T | ** | ||||||||||
10953401-G-C | ** | ||||||||||
10953421-G-C | FGC80858 | ** | |||||||||
10954326-C-A | ** | ||||||||||
10960464-C-A | ** | ||||||||||
10960548-T-C | ** | ||||||||||
10974046-C-CCT | ** | ||||||||||
10976939-G-A | ** | ||||||||||
10985916-C-T | ** | ||||||||||
10987943-C-A | ** | ||||||||||
10992453-G-A | ** | ||||||||||
11009213-C-A | ** | ||||||||||
11010061-C-T | ** | ||||||||||
11012087-C-A | ** | ||||||||||
11014292-C-A | ** | ||||||||||
11020588-G-T | ** | ||||||||||
11025531-C-T | ** | ||||||||||
11025534-C-A | ** | ||||||||||
11025550-A-T | ** | ||||||||||
11025556-C-T | ** | ||||||||||
13213599-C-A | 11057923-C-A | ** | |||||||||
13214008-G-T | 11058332-G-T | ** | |||||||||
13226966-C-A | 11071290-C-A | ** | |||||||||
13244505-A-G | 11088829-A-G | ** | |||||||||
13268068-C-A | 11112392-C-A | ** | |||||||||
13305498-G-T | 11149822-G-T | ** | |||||||||
13330215-C-A | 11174539-C-A | ** | |||||||||
13427457-G-T | 11271781-G-T | ** | |||||||||
13460715-T-A | 11305039-T-A | ** | |||||||||
13460716-G-C | 11305040-G-C | ** | |||||||||
13460725-G-C | 11305049-G-C | ** | |||||||||
13460731-T-G | 11305055-T-G | ** | |||||||||
13460734-A-T | 11305058-A-T | ** | |||||||||
13460738-C-T | 11305062-C-T | ** | |||||||||
13460740-A-T | 11305064-A-T | ** | |||||||||
13468197-A-G | 11312521-A-G | ** | |||||||||
13486880-C-CTT | 11331204-C-CTT | 26×T | ** | ||||||||
13486926-T-G | 11331250-T-G | ** | |||||||||
13489407-G-T | 11333731-G-T | ** | |||||||||
13489415-G-A | 11333739-G-A | ** | |||||||||
13526468-C-A | 11370792-C-A | ** | |||||||||
13555895-C-T | 11400219-C-T | ** | |||||||||
13565402-C-A | 11409726-C-A | ** | |||||||||
13571098-A-T | 11415422-A-T | ** | |||||||||
13571665-ATTT-A | 11415989-ATTT-A | 17×T | ** | ||||||||
13615580-A-G | 11459904-A-G | ** | |||||||||
13633134-G-T | 11477458-G-T | ** | |||||||||
11644078-G-T | FT55272 | DYZ17 | ** | ||||||||
11644082-G-T | DYZ17 | ** | |||||||||
11646845-A-T | DYZ17 | ** | |||||||||
11646853-G-T | DYZ17 | ** | |||||||||
11650251-C-G | DYZ17 | ** | |||||||||
11659311-A-G | DYZ17 | ** | |||||||||
11659317-T-G | DYZ17 | ** | |||||||||
11659320-A-T | DYZ17 | ** | |||||||||
11659331-A-G | DYZ17 | ** | |||||||||
11659339-G-A | DYZ17 | ** | |||||||||
11659341-A-G | DYZ17 | ** | |||||||||
11673231-G-T | DYZ17 | ** | |||||||||
11674802-C-A | DYZ17 | ** | |||||||||
11675241-G-T | DYZ17 | ** | |||||||||
11677191-G-T | DYZ17 | ** | |||||||||
11677847-G-T | DYZ17 | ** | |||||||||
13847009-G-T | 11726303-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
13856336-T-TCAAAC | 11735630-T-TCAAAC | DYZ17 | ** | ||||||||
13900413-C-A | 11779707-C-A | ** | |||||||||
13928840-G-T | 11808134-G-T | ** | |||||||||
13938606-T-C | 11817900-T-C | ** | |||||||||
13938607-T-C | 11817901-T-C | ** | |||||||||
13943175-C-A | 11822469-C-A | ** | |||||||||
13952224-A-G | 11831518-A-G | ** | |||||||||
13952231-A-C | 11831525-A-C | ** | |||||||||
13952237-T-A | 11831531-T-A | ** | |||||||||
13952241-T-A | 11831535-T-A | ** | |||||||||
13952252-C-CAG | 11831546-C-CAG | ** | |||||||||
13984558-A-G | 11863852-A-G | ** | |||||||||
13993805-A-C | 11873099-A-C | ** | |||||||||
14070089-TA-T | 11949383-TA-T | ** | |||||||||
14099935-G-A | 11979229-G-A | ** | |||||||||
14114930-C-A | 11994224-C-A | ** | |||||||||
14118373-TG-T | 11997667-TG-T | ** | |||||||||
14192007-T-G | 12071301-T-G | ** | |||||||||
14283706-A-G | 12163000-A-G | ** | |||||||||
14283815-C-G | 12163109-C-G | ** | |||||||||
14283816-A-T | 12163110-A-T | ** | |||||||||
14283817-A-G | 12163111-A-G | ** | |||||||||
14302281-C-T | 12181575-C-T | FT420491 | ** | ||||||||
14311899-A-G | 12191193-A-G | ** | |||||||||
14311910-T-A | 12191204-T-A | ** | |||||||||
14311952-A-T | 12191246-A-T | ** | |||||||||
14339226-C-G | 12218521-C-G | ** | |||||||||
14366564-C-A | 12245859-C-A | ** | |||||||||
14384399-C-T | 12263695-C-T | ** | |||||||||
14483192-C-A | 12362461-C-A | ** | |||||||||
14483558-G-T | 12362827-G-T | ** | |||||||||
14517022-C-A | 12405223-C-A | ** | |||||||||
14530777-C-A | 12418978-C-A | ** | |||||||||
14609615-C-A | 12497817-C-A | ** | |||||||||
14618032-TG-T | 12506230-TG-T | ** | |||||||||
14784935-C-A | 12673005-C-A | ** | |||||||||
14992885-C-T | 12880970-C-T | FTB81205 | ** | ||||||||
15081415-C-A | 12969505-C-A | ** | |||||||||
15115558-G-A | 13003645-G-A | ** | |||||||||
15116537-A-C | 13004624-A-C | ** | |||||||||
15366618-C-A | 13254738-C-A | ** | |||||||||
15394879-A-G | 13282999-A-G | ** | |||||||||
15396474-C-A | 13284594-C-A | ** | |||||||||
15402520-C-A | 13290640-C-A | ** | |||||||||
15432799-T-C | 13320919-T-C | ** | |||||||||
15533557-C-A | 13421677-C-A | ** | |||||||||
15641557-C-A | 13529677-C-A | ** | |||||||||
15643274-T-G | 13531394-T-G | ** | |||||||||
15676822-C-A | 13564942-C-A | ** | |||||||||
15685624-C-A | 13573744-C-A | ** | |||||||||
15686384-T-C | 13574504-T-C | ** | |||||||||
15763362-G-T | 13651482-G-T | ** | |||||||||
15774324-G-T | 13662444-G-T | ** | |||||||||
16002317-C-A | 13890437-C-A | ** | |||||||||
16004236-G-T | 13892356-G-T | ** | |||||||||
16017332-C-A | 13905452-C-A | ** | |||||||||
16048647-C-A | 13936767-C-A | ** | |||||||||
16050369-C-A | 13938489-C-A | ** | |||||||||
16059838-C-A | 13947958-C-A | ** | |||||||||
16107444-T-TC | 13995564-T-TC | P8_Prx | ** | ||||||||
16309073-G-A | 14197193-G-A | ** | |||||||||
16309080-C-G | 14197200-C-G | ** | |||||||||
16309089-C-CA | 14197209-C-CA | ** | |||||||||
16309104-G-A | 14197224-G-A | ** | |||||||||
16309114-G-T | 14197234-G-T | ** | |||||||||
16309138-G-A | 14197258-G-A | ** | |||||||||
16309153-G-A | 14197273-G-A | ** | |||||||||
16309170-G-A | 14197290-G-A | ** | |||||||||
16424207-T-G | 14312327-T-G | ** | |||||||||
16598857-C-A | 14486977-C-A | ** | |||||||||
16721425-T-C | 14609545-T-C | ** | |||||||||
16816501-CT-C | 14704621-CT-C | 8×T | ** | ||||||||
16848243-C-A | 14736363-C-A | ** | |||||||||
17046758-C-A | 14934878-C-A | ** | |||||||||
17070934-A-C | 14959054-A-C | ** | |||||||||
17265070-G-A | 15153190-G-A | ** | |||||||||
17265110-G-T | 15153230-G-T | ** | |||||||||
17270510-C-A | 15158630-C-A | ** | |||||||||
17378293-A-G | 15266413-A-G | ** | |||||||||
17486011-T-C | 15374131-T-C | ** | |||||||||
17501865-G-T | 15389985-G-T | ** | |||||||||
17505358-C-A | 15393478-C-A | ** | |||||||||
17567486-C-A | 15455606-C-A | ** | |||||||||
17568242-C-A | 15456362-C-A | ** | |||||||||
17622585-C-A | 15510705-C-A | ** | |||||||||
17628761-T-G | 15516881-T-G | ** | |||||||||
17628764-A-G | 15516884-A-G | ** | |||||||||
17629776-C-A | 15517896-C-A | ** | |||||||||
17682624-T-C | 15570744-T-C | ** | |||||||||
17716996-C-A | 15605116-C-A | ** | |||||||||
17722679-C-A | 15610799-C-A | ** | |||||||||
17722726-A-G | 15610846-A-G | ** | |||||||||
17728423-C-A | 15616543-C-A | ** | |||||||||
17728489-C-A | 15616609-C-A | ** | |||||||||
17728671-C-G | 15616791-C-G | ** | |||||||||
17730563-C-A | 15618683-C-A | ** | |||||||||
17739955-C-A | 15628075-C-A | FT337639 | ** | ||||||||
18008645-CTTTTT-C | 15896765-CTTTTT-C | P7_Dst | 30×T | ** | |||||||
18053719-G-T | 15941839-G-T | ** | |||||||||
18130796-C-A | 16018916-C-A | ** | |||||||||
18325703-T-TC | 16213823-T-TC | P6_Prx | ** | ||||||||
18355287-T-C | 16243407-T-C | P6_Prx | ** | ||||||||
18401083-C-A | 16289203-C-A | P6_Gap | ** | ||||||||
18407387-A-T | 16295507-A-T | P6_Gap | ** | ||||||||
18565955-C-A | 16454075-C-A | ** | |||||||||
18577738-C-A | 16465858-C-A | ** | |||||||||
18577977-C-A | 16466097-C-A | ** | |||||||||
18624922-A-G | 16513042-A-G | ** | |||||||||
18630733-A-C | 16518853-A-C | ** | |||||||||
18796438-G-T | 16684558-G-T | ** | |||||||||
18849354-C-G | 16737474-C-G | ** | |||||||||
18930567-A-T | 16818687-A-T | ** | |||||||||
18932509-G-A | 16820629-G-A | ** | |||||||||
18990926-T-C | 16879046-T-C | ** | |||||||||
19085642-G-A | 16973762-G-A | ** | |||||||||
19187652-C-T | 17075772-C-T | ** | |||||||||
19248608-T-A | 17136728-T-A | ** | |||||||||
19299345-C-A | 17187465-C-A | ** | |||||||||
19300172-A-G | 17188292-A-G | ** | |||||||||
19303492-G-T | 17191612-G-T | ** | |||||||||
19310915-G-GT | 17199035-G-GT | ** | |||||||||
19433288-C-A | 17321408-C-A | ** | |||||||||
19463751-T-C | 17351871-T-C | ** | |||||||||
19512448-A-G | 17400568-A-G | ** | |||||||||
19529195-G-C | 17417315-G-C | ** | |||||||||
19529199-T-C | 17417319-T-C | ** | |||||||||
19529200-G-A | 17417320-G-A | ** | |||||||||
19529203-T-C | 17417323-T-C | ** | |||||||||
19529204-T-C | 17417324-T-C | ** | |||||||||
19555604-C-T | 17443724-C-T | ** | |||||||||
20794462-G-T | 18632576-G-T | P4_Prx | ** | ||||||||
21061594-A-G | 18899708-A-G | ** | |||||||||
21187515-C-A | 19025629-C-A | ** | |||||||||
21246414-T-C | 19084528-T-C | ** | |||||||||
21482782-G-TTT | 19320896-G-TTT | ** | |||||||||
21634755-T-G | 19472869-T-G | ** | |||||||||
21669139-T-C | 19507253-T-C | ** | |||||||||
21671915-G-A | 19510029-G-A | ** | |||||||||
21746144-G-T | 19584258-G-T | ** | |||||||||
21803044-C-A | 19641158-C-A | ** | |||||||||
21886817-T-C | 19724931-T-C | ** | |||||||||
21940796-A-G | 19778910-A-G | ** | |||||||||
21991399-T-C | 19829513-T-C | ** | |||||||||
22001563-T-C | 19839677-T-C | ** | |||||||||
22058289-T-C | 19896403-T-C | ** | |||||||||
22090187-G-C | 19928301-G-C | ** | |||||||||
22203781-C-A | 20041895-C-A | ** | |||||||||
22263868-A-C | 20101982-A-C | DYZ19 | ** | ||||||||
22303609-A-G | 20141723-A-G | DYZ19 | ** | ||||||||
22303676-G-T | 20141790-G-T | DYZ19 | ** | ||||||||
22341085-T-A | 20179199-T-A | DYZ19 | ** | ||||||||
22345734-C-A | 20183848-C-A | DYZ19 | ** | ||||||||
22537188-C-A | 20375302-C-A | ** | |||||||||
22668896-A-C | 20507010-A-C | ** | |||||||||
22668897-G-A | 20507011-G-A | ** | |||||||||
22767785-A-G | 20605899-A-G | ** | |||||||||
22774892-C-CT | 20613006-C-CT | ** | |||||||||
22790962-A-G | 20629076-A-G | ** | |||||||||
22797657-G-T | 20635771-G-T | ** | |||||||||
22797662-A-T | 20635776-A-T | ** | |||||||||
22808796-C-A | 20646910-C-A | ** | |||||||||
22809196-G-T | 20647310-G-T | ** | |||||||||
22810764-A-G | 20648878-A-G | ** | |||||||||
22810948-C-A | 20649062-C-A | ** | |||||||||
22854925-T-C | 20693039-T-C | ** | |||||||||
22855514-A-T | 20693628-A-T | ** | |||||||||
22880584-C-A | 20718698-C-A | ** | |||||||||
22996991-TA-T | 20835105-TA-T | ** | |||||||||
23019179-G-T | 20857293-G-T | ** | |||||||||
23041198-GA-G | 20879312-GA-G | 34×A | ** | ||||||||
23126408-C-G | 20964522-C-G | ** | |||||||||
23127736-C-A | 20965850-C-A | ** | |||||||||
23355319-C-T | 21193433-C-T | ** | |||||||||
23355418-G-A | 21193532-G-A | ** | |||||||||
23435708-T-G | 21273822-T-G | ** | |||||||||
23447474-C-A | 21285588-C-A | ** | |||||||||
23459759-C-A | 21297873-C-A | ** | |||||||||
23465142-C-A | 21303256-C-A | ** | |||||||||
23779727-G-A | 21617841-G-A | ** | |||||||||
23786571-T-A | 21624685-T-A | ** | |||||||||
23818757-C-A | 21656871-C-A | ** | |||||||||
21752661-T-A | ** | ||||||||||
24235432-A-T | 22089285-A-T | P3_b1 | ** | ||||||||
24247415-A-ACCC | 22101268-A-ACCC | P3_b1 | ** | ||||||||
24247425-A-AC | 22101278-A-AC | P3_b1 | ** | ||||||||
24267224-C-CAA | 22121077-C-CAA | P3_b1 | ** | ||||||||
24328492-A-G | 22182345-A-G | P3_t1 | ** | ||||||||
24385117-C-A | 22238970-C-A | ** | |||||||||
24389868-G-A | 22243721-G-A | ** | |||||||||
24421095-A-C | 22274948-A-C | ** | |||||||||
24513099-T-C | 22366952-T-C | ** | |||||||||
24513174-C-A | 22367027-C-A | ** | |||||||||
24518268-A-G | 22372121-A-G | ** | |||||||||
24893406-C-G | 22747259-C-G | g1 | ** | ||||||||
24905079-A-G | 22758932-A-G | g1 | ** | ||||||||
25096405-A-G | 22950258-A-G | g1 | ** | ||||||||
25532978-G-T | 23386831-G-T | P1_gr1 | ** | ||||||||
25858418-A-G | 23712271-A-G | P1_Y1 | ** | ||||||||
25964895-G-GTTCTT | 23818748-G-GTTCTT | P1_Y1 | 23×T | ** | |||||||
26100616-G-T | 23954469-G-T | P1_Y1 | ** | ||||||||
26120183-T-TTTCTCTTTCTC | 23974036-T-TTTCTCTTTCTC | P1_Y1 | ** | ||||||||
26323500-A-G | 24177353-A-G | P1_Y1 | ** | ||||||||
27022166-A-C | 24876019-A-C | P1_r4 | ** | ||||||||
28516491-C-A | 26370344-C-A | ** | |||||||||
28532837-C-A | 26386690-C-A | ** | |||||||||
28536351-G-T | 26390204-G-T | ** | |||||||||
28543049-A-G | 26396902-A-G | ** | |||||||||
28545039-G-GA | 26398892-G-GA | ** | |||||||||
28601859-A-G | 26455712-A-G | ** | |||||||||
28611166-C-T | 26465019-C-T | ** | |||||||||
28611171-G-A | 26465024-G-A | ** | |||||||||
28611177-T-C | 26465030-T-C | ** | |||||||||
28611178-G-A | 26465031-G-A | ** | |||||||||
28625812-C-T | 26479665-C-T | ** | |||||||||
28644824-G-C | 26498677-G-C | ** | |||||||||
28654409-G-T | 26508262-G-T | ** | |||||||||
28654467-G-T | 26508320-G-T | ** | |||||||||
28656807-C-A | 26510660-C-A | ** | |||||||||
28797793-CAGTGA-C | 26651646-CAGTGA-C | ** | |||||||||
28819236-G-T | 26673089-G-T | ** | |||||||||
28819256-A-G | 26673109-A-G | ** | |||||||||
28819302-A-C | 26673155-A-C | ** | |||||||||
28819320-G-C | 26673173-G-C | ** | |||||||||
56724769-G-T | ** | ||||||||||
56724779-G-C | ** | ||||||||||
56823919-C-A | ** | ||||||||||
56825766-G-T | ** | ||||||||||
56857980-G-T | ** | ||||||||||
56870124-C-A | ** | ||||||||||
56875203-A-G | ** | ||||||||||
19686222-T-C | 17574342-T-C | P5_Prx | ** | ||||||||
9402511-T-C | 9564902-T-C | FGC78453 | ** | ||||||||
27568480-GT-G | 25422333-GT-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
7966745-G-A | 8098704-G-A | ** | |||||||||
15146592-A-G | 13034679-A-G | ** | |||||||||
16396196-G-A | 14284316-G-A | ** | |||||||||
18358978-A-T | 16247098-A-T | P6_Prx | ** | ||||||||
18762133-T-C | 16650253-T-C | ** | |||||||||
19596425-C-A | 17484545-C-A | P5_Prx | ** | ||||||||
21352006-A-G | 19190120-A-G | ** | |||||||||
22050150-T-A | 19888264-T-A | ** | |||||||||
22050158-T-A | 19888272-T-A | ** | |||||||||
22050167-A-G | 19888281-A-G | ** | |||||||||
22050174-T-A | 19888288-T-A | ** | |||||||||
23198539-A-G | 21036653-A-G | ** | |||||||||
23339152-TTCTC-T | 21177266-TTCTC-T | ** | |||||||||
26394631-T-TC | 24248484-T-TC | P1_Y1 | ** | ||||||||
28564025-A-G | 26417878-A-G | ** | |||||||||
21205186-A-G | 19043300-A-G | *** | |||||||||
9654352-T-TAGAAAGAA | 9816743-T-TAGAAAGAA | IR3_Prx | 10×AGAA | *** | |||||||
13404742-G-A | 11249066-G-A | *** | |||||||||
13463721-T-A,C | 11308045-T-A,C | *** | |||||||||
22425868-C-A | 20263982-C-A | DYZ19 | *** | ||||||||
58980830-C-T | 56834683-C-T | *** | |||||||||
17596810-A-ATC | 15484930-A-ATC | 10×TC | *** | ||||||||
7349163-T-G | 7481122-T-G | *** | |||||||||
10744324-TC-T,TA | *** | ||||||||||
10786000-T-C | *** | ||||||||||
10869017-C-A | *** | ||||||||||
10926642-CCATTCCATTC-C,CCATTCCATTG | *** | ||||||||||
10947633-A-G | *** | ||||||||||
10971046-TCTCC-T | *** | ||||||||||
10973963-CACCC-C,CAATCT | *** | ||||||||||
13489347-C-A | 11333671-C-A | *** | |||||||||
13489616-CCCAC-C,CCCCCT | 11333940-CCCAC-C,CCCCCT | *** | |||||||||
13570992-A-G | 11415316-A-G | *** | |||||||||
13938596-A-T | 11817890-A-T | *** | |||||||||
14143921-G-A | 12023215-G-A | *** | |||||||||
14324920-TG-G,T | 12204214-TG-G,T | *** | |||||||||
14344165-C-T | 12223460-C-T | *** | |||||||||
14626190-A-C,T | 12514258-A-C,T | *** | |||||||||
15366021-G-T | 13254141-G-T | *** | |||||||||
15743703-C-A | 13631823-C-A | *** | |||||||||
16245996-T-C | 14134116-T-C | *** | |||||||||
17367852-C-A | 15255972-C-A | *** | |||||||||
17551727-G-A | 15439847-G-A | *** | |||||||||
18627971-G-A | 16516091-G-A | *** | |||||||||
13465949-G-T | 11310273-G-T | *** | |||||||||
24689886-C-T | 22543739-C-T | P3_b2 | *** | ||||||||
7450359-A-G | 7582318-A-G | IR1_L | *** | ||||||||
10080386-A-G | 10242777-A-G | *** | |||||||||
14682881-A-G | 12570947-A-G | *** | |||||||||
16394878-T-C | 14282998-T-C | *** | |||||||||
16627402-A-C | 14515522-A-C | *** | |||||||||
17169350-AT-A | 15057470-AT-A | *** | |||||||||
21796101-T-C | 19634215-T-C | *** | |||||||||
22471638-A-G | 20309752-A-G | DYZ19 | *** | ||||||||
22536277-T-C | 20374391-T-C | *** | |||||||||
22536288-G-A | 20374402-G-A | *** | |||||||||
28563870-G-A | 26417723-G-A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
---|---|---|---|
Manual | 16465133-G-A | 14353253-G-A | YSEQ |