Sloan
FTDNA: 76609, BigY2: 76609, BigY3: 76609MDKA Birth:

Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 76609 | BigY2 76609 | BigY3 76609 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
19961448-C-T | 17849568-C-T | P5_Prx | *** | A* | ||||||
25916925-C-G | 23770778-C-G | P1_Y1 | *** | A* | A* | |||||
6191320-C-A | 6323279-C-A | IR3_Dst | A* | |||||||
27981650-C-G | 25835503-C-G | P1_Y2 | A* | |||||||
6194797-A-T | 6326756-A-T | IR3_Dst | A* | |||||||
22305099-A-G | 20143213-A-G | DYZ19 | A* | |||||||
25998020-A-AT | 23851873-A-AT | P1_Y1 | 9×T | A* | ||||||
5663597-G-T | 5795556-G-T | A* | ||||||||
6931105-C-T | 7063064-C-T | Y61227 | Y | Y | + | + | + | |||
7165184-T-C | 7297143-T-C | Y61632 | Y | Y | + | + | + | |||
8729751-A-G | 8861710-A-G | Y138237 | Y64399 | Y | Y | + | + | + | ||
15072639-G-T | 12960729-G-T | Y67690 | Y | Y | + | + | + | |||
17211869-G-T | 15099989-G-T | Y71257 | Y | Y | + | + | + | |||
23805718-A-G | 21643832-A-G | Y80385 | Y | + | + | + | ||||
6795927-G-GT | 6927886-G-GT | 9×T | + | + | * | |||||
4381306-T-C | 4513265-T-C | FT74846 | + | |||||||
22320048-A-C | 20158162-A-C | DYZ19 | *** | * | * | |||||
18841278-G-GTAAATAAA | 16729398-G-GTAAATAAA | 8×TAAA | * | |||||||
5573107-C-A | 5705066-C-A | * | ||||||||
22341098-T-G | 20179212-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
2866232-C-G | 2998191-C-G | ** | ||||||||
19775302-C-T | 17663422-C-T | P5_Prx | 32×T | ** | ||||||
6491367-C-A | 6623326-C-A | ** | ** | |||||||
16620480-C-G | 14508600-C-G | ** | ||||||||
21824454-G-T | 19662568-G-T | ** | ||||||||
28595450-C-G | 26449303-C-G | ** | ** | |||||||
15683126-G-A | 13571246-G-A | ** | ||||||||
17126567-A-C | 15014687-A-C | ** | ||||||||
28595457-A-G | 26449310-A-G | ** | ||||||||
16059825-C-A | 13947945-C-A | ** | ||||||||
22264284-C-T | 20102398-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
19075138-C-A | 16963258-C-A | ** | ||||||||
23512432-A-T | 21350546-A-T | ** | ||||||||
22264273-C-G | 20102387-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
22264270-C-G | 20102384-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
22264301-T-C | 20102415-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
14570947-C-G | 12459147-C-G | ** | ||||||||
14570954-A-T | 12459154-A-T | ** | ||||||||
4419988-A-G | 4551947-A-G | ** | ||||||||
19356076-G-A | 17244196-G-A | FGC27247 | ** | |||||||
22264277-T-A | 20102391-T-A | DYZ19 | ** | |||||||
2685644-CTTTTTTTT-C | 2817603-CTTTTTTTT-C | 20×T | ** | |||||||
2697595-C-A | 2829554-C-A | ** | ||||||||
2744845-C-A | 2876804-C-A | ** | ||||||||
2860191-A-G | 2992150-A-G | ** | ||||||||
2860207-T-C | 2992166-T-C | ** | ||||||||
2860208-T-A | 2992167-T-A | ** | ||||||||
2860215-T-C | 2992174-T-C | ** | ||||||||
2860218-T-C | 2992177-T-C | ** | ||||||||
2860221-T-G | 2992180-T-G | ** | ||||||||
2897640-C-A | 3029599-C-A | ** | ||||||||
3051877-C-A | 3183836-C-A | ** | ||||||||
3073734-C-A | 3205693-C-A | ** | ||||||||
3102208-G-T | 3234167-G-T | ** | ||||||||
3123209-CA-C | 3255168-CA-C | ** | ||||||||
3223160-G-A | 3355119-G-A | ** | ||||||||
3252988-C-A | 3384947-C-A | ** | ||||||||
3277634-A-G | 3409593-A-G | ** | ||||||||
3328954-C-A | 3460913-C-A | ** | ||||||||
3332694-C-A | 3464653-C-A | ** | ||||||||
3343211-C-A | 3475170-C-A | ** | ||||||||
3346388-C-A | 3478347-C-A | ** | ||||||||
3366268-C-A | 3498227-C-A | ** | ||||||||
3389211-C-G | 3521170-C-G | ** | ||||||||
3423242-C-A | 3555201-C-A | ** | ||||||||
3505378-A-G | 3637337-A-G | ** | ||||||||
3545801-G-T | 3677760-G-T | ** | ||||||||
3559772-C-G | 3691731-C-G | ** | ||||||||
3592514-C-A | 3724473-C-A | ** | ||||||||
3606316-C-A | 3738275-C-A | ** | ||||||||
3628877-G-T | 3760836-G-T | ** | ||||||||
3629042-G-T | 3761001-G-T | ** | ||||||||
3629090-G-T | 3761049-G-T | ** | ||||||||
3688388-C-A | 3820347-C-A | ** | ||||||||
3689000-C-A | 3820959-C-A | ** | ||||||||
3690487-C-A | 3822446-C-A | ** | ||||||||
3712057-A-G | 3844016-A-G | FTB8997 | ** | |||||||
3750225-G-T | 3882184-G-T | ** | ||||||||
3791213-C-A | 3923172-C-A | ** | ||||||||
3836889-C-A | 3968848-C-A | ** | ||||||||
3847326-GT-G | 3979285-GT-G | ** | ||||||||
3850354-G-A | 3982313-G-A | ** | ||||||||
3853996-C-A | 3985955-C-A | ** | ||||||||
3870584-C-A | 4002543-C-A | ** | ||||||||
3872938-C-G | 4004897-C-G | ** | ||||||||
3903552-AAG-A | 4035511-AAG-A | ** | ||||||||
3994623-C-A | 4126582-C-A | ** | ||||||||
4003148-A-G | 4135107-A-G | ** | ||||||||
4003206-T-A | 4135165-T-A | ** | ||||||||
4017138-C-A | 4149097-C-A | ** | ||||||||
4107823-T-G | 4239782-T-G | ** | ||||||||
4136485-C-A | 4268444-C-A | ** | ||||||||
4174915-C-A | 4306874-C-A | ** | ||||||||
4177957-C-A | 4309916-C-A | ** | ||||||||
4178835-A-G | 4310794-A-G | ** | ||||||||
4229300-A-G | 4361259-A-G | ** | ||||||||
4444514-C-T | 4576473-C-T | ** | ||||||||
4521976-C-A | 4653935-C-A | ** | ||||||||
4537802-T-C | 4669761-T-C | ** | ||||||||
4540911-T-C | 4672870-T-C | ** | ||||||||
4586242-C-A | 4718201-C-A | ** | ||||||||
4756699-T-C | 4888658-T-C | ** | ||||||||
4804492-T-C | 4936451-T-C | ** | ||||||||
4888555-CT-C | 5020514-CT-C | ** | ||||||||
4898361-C-A | 5030320-C-A | ** | ||||||||
4900320-C-A | 5032279-C-A | ** | ||||||||
4931504-G-T | 5063463-G-T | ** | ||||||||
4947180-T-C | 5079139-T-C | ** | ||||||||
4947186-C-T | 5079145-C-T | FT322210 | ** | |||||||
4947187-G-A | 5079146-G-A | ** | ||||||||
4947191-G-C | 5079150-G-C | ** | ||||||||
4947196-A-G | 5079155-A-G | ** | ||||||||
4947209-C-T | 5079168-C-T | ** | ||||||||
4947240-G-T | 5079199-G-T | ** | ||||||||
4957735-C-A | 5089694-C-A | ** | ||||||||
4959407-A-G | 5091366-A-G | ** | ||||||||
4959430-C-A | 5091389-C-A | ** | ||||||||
5021917-C-A | 5153876-C-A | ** | ||||||||
5156743-G-T | 5288702-G-T | ** | ||||||||
5190329-C-A | 5322288-C-A | ** | ||||||||
5190799-T-C | 5322758-T-C | ** | ||||||||
5212725-T-C | 5344684-T-C | ** | ||||||||
5233339-G-A | 5365298-G-A | ** | ||||||||
5264293-C-A | 5396252-C-A | ** | ||||||||
5274797-AT-A | 5406756-AT-A | ** | ||||||||
5316957-G-T | 5448916-G-T | ** | ||||||||
5318382-C-A | 5450341-C-A | ** | ||||||||
5318423-C-A | 5450382-C-A | ** | ||||||||
5365060-C-T | 5497019-C-T | ** | ||||||||
5420550-G-T | 5552509-G-T | ** | ||||||||
5454670-T-C | 5586629-T-C | ** | ||||||||
5522943-C-A | 5654902-C-A | ** | ||||||||
5524739-A-G | 5656698-A-G | ** | ||||||||
5566786-T-A | 5698745-T-A | ** | ||||||||
5601081-T-C | 5733040-T-C | ** | ||||||||
5613465-T-C | 5745424-T-C | ** | ||||||||
5683940-G-A | 5815899-G-A | ** | ||||||||
5687382-C-A | 5819341-C-A | ** | ||||||||
5756138-C-T | 5888097-C-T | ** | ||||||||
5756198-G-T | 5888157-G-T | ** | ||||||||
5852103-C-A | 5984062-C-A | ** | ||||||||
5958923-C-A | 6090882-C-A | ** | ||||||||
5967783-C-A | 6099742-C-A | ** | ||||||||
5990085-A-T | 6122044-A-T | ** | ||||||||
6010252-A-G | 6142211-A-G | ** | ||||||||
6010505-C-A | 6142464-C-A | ** | ||||||||
6040096-C-A | 6172055-C-A | ** | ||||||||
6252798-G-A | 6384757-G-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6252860-T-A | 6384819-T-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6252861-T-G | 6384820-T-G | IR3_Dst | 8×A | ** | ||||||
6252861-T-TAAG | 6384820-T-TAAG | IR3_Dst | 8×A | ** | ||||||
6252872-G-A | 6384831-G-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6429749-C-A | 6561708-C-A | ** | ||||||||
6454826-T-C | 6586785-T-C | ** | ||||||||
6510038-C-A | 6641997-C-A | ** | ||||||||
6510642-C-A | 6642601-C-A | ** | ||||||||
6514382-T-A | 6646341-T-A | ** | ||||||||
6535228-C-A | 6667187-C-A | ** | ||||||||
6621627-C-A | 6753586-C-A | ** | ||||||||
6623827-G-T | 6755786-G-T | ** | ||||||||
6639075-C-G | 6771034-C-G | ** | ||||||||
6714464-C-A | 6846423-C-A | ** | ||||||||
6807943-C-T | 6939902-C-T | ** | ||||||||
6827539-C-A | 6959498-C-A | ** | ||||||||
6882083-G-A | 7014042-G-A | FT159450 | ** | |||||||
6902415-T-G | 7034374-T-G | ** | ||||||||
7015368-C-A | 7147327-C-A | ** | ||||||||
7030653-C-T | 7162612-C-T | ** | ||||||||
7040374-G-T | 7172333-G-T | ** | ||||||||
7062406-T-C | 7194365-T-C | ** | ||||||||
7063640-C-G | 7195599-C-G | ** | ||||||||
7091219-C-A | 7223178-C-A | ** | ||||||||
7100657-A-G | 7232616-A-G | ** | ||||||||
7110721-C-A | 7242680-C-A | ** | ||||||||
7111621-C-A | 7243580-C-A | ** | ||||||||
7127382-C-A | 7259341-C-A | ** | ||||||||
7135225-C-T | 7267184-C-T | ** | ||||||||
7135408-T-G | 7267367-T-G | ** | ||||||||
7155555-C-A | 7287514-C-A | ** | ||||||||
7182149-G-A | 7314108-G-A | ** | ||||||||
7185241-T-C | 7317200-T-C | ** | ||||||||
7225502-C-A | 7357461-C-A | ** | ||||||||
7237876-G-C | 7369835-G-C | ** | ||||||||
7242592-T-A | 7374551-T-A | ** | ||||||||
7242596-T-C | 7374555-T-C | ** | ||||||||
7243703-C-A | 7375662-C-A | ** | ||||||||
7256260-G-T | 7388219-G-T | ** | ||||||||
7269821-T-A | 7401780-T-A | ** | ||||||||
7295894-T-C | 7427853-T-C | ** | ||||||||
7298481-A-C | 7430440-A-C | ** | ||||||||
7333991-C-A | 7465950-C-A | ** | ||||||||
7341427-TA-T | 7473386-TA-T | ** | ||||||||
7346462-T-C | 7478421-T-C | ** | ||||||||
7346871-C-A | 7478830-C-A | ** | ||||||||
7347472-T-C | 7479431-T-C | ** | ||||||||
7359642-C-A | 7491601-C-A | ** | ||||||||
7574429-T-G | 7706388-T-G | ** | ||||||||
7579934-C-A | 7711893-C-A | ** | ||||||||
7650592-A-T | 7782551-A-T | ** | ||||||||
7670723-T-C | 7802682-T-C | ** | ||||||||
7704914-C-A | 7836873-C-A | ** | ||||||||
7860826-C-A | 7992785-C-A | ** | ||||||||
7897160-A-T | 8029119-A-T | ** | ||||||||
7923776-C-A | 8055735-C-A | ** | ||||||||
8166909-C-A | 8298868-C-A | ** | ||||||||
8181387-G-A | 8313346-G-A | ** | ||||||||
8216471-C-A | 8348430-C-A | ** | ||||||||
8237218-C-A | 8369177-C-A | ** | ||||||||
8290989-C-A | 8422948-C-A | ** | ||||||||
8668381-TA-T | 8800340-TA-T | 8×A | ** | |||||||
8669628-C-A | 8801587-C-A | FTA27683 | ** | |||||||
8671851-GT-G | 8803810-GT-G | ** | ||||||||
8736366-C-T | 8868325-C-T | ** | ||||||||
8736513-C-A | 8868472-C-A | ** | ||||||||
8741702-G-T | 8873661-G-T | ** | ||||||||
8913129-G-T | 9045088-G-T | ** | ||||||||
8914674-A-C | 9046633-A-C | FT8846 | ** | |||||||
9111344-G-T | ** | |||||||||
8988367-A-C | 9150758-A-C | ** | ||||||||
9013089-T-C | 9175480-T-C | ** | ||||||||
9013093-A-G | 9175484-A-G | ** | ||||||||
9013092-TAA-T | 9175483-TAA-T | ** | ||||||||
9015519-C-A | 9177910-C-A | ** | ||||||||
9063639-C-A | 9226030-C-A | ** | ||||||||
9427500-C-A | 9589891-C-A | ** | ||||||||
9427612-A-T | 9590003-A-T | ** | ||||||||
9440608-C-A | 9602999-C-A | ** | ||||||||
9474223-G-T | 9636614-G-T | ** | ||||||||
9498714-C-A | 9661105-C-A | ** | ||||||||
9509497-T-A | 9671888-T-A | ** | ||||||||
9574448-C-A | 9736839-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9666533-G-T | 9828924-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9678190-C-A | 9840581-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9732947-G-A | 9895338-G-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9928162-C-A | 10090553-C-A | ** | ||||||||
9929590-G-T | 10091981-G-T | ** | ||||||||
9965878-G-A | 10128269-G-A | ** | ||||||||
9968490-C-A | 10130881-C-A | ** | ||||||||
9976758-C-G | 10139149-C-G | ** | ||||||||
9976772-A-G | 10139163-A-G | ** | ||||||||
9976775-A-C | 10139166-A-C | ** | ||||||||
9976781-T-G | 10139172-T-G | ** | ||||||||
9976783-G-A | 10139174-G-A | ** | ||||||||
9976795-A-T | 10139186-A-T | ** | ||||||||
9976796-G-A | 10139187-G-A | ** | ||||||||
9976801-T-G | 10139192-T-G | ** | ||||||||
9976802-T-C | 10139193-T-C | ** | ||||||||
10079881-G-T | 10242272-G-T | ** | ||||||||
10651497-G-T | ** | |||||||||
10659155-C-T | ** | |||||||||
10662055-T-C | ** | |||||||||
10663396-T-TATCCTA | ** | |||||||||
10665584-C-A | ** | |||||||||
10667864-G-C | ** | |||||||||
10667875-A-G | ** | |||||||||
10667878-C-T | ** | |||||||||
10668091-C-A | ** | |||||||||
10672108-C-A | ** | |||||||||
10678311-C-A | ** | |||||||||
10683217-C-A | ** | |||||||||
10683644-C-A | ** | |||||||||
10685958-C-A | ** | |||||||||
10686967-T-C | ** | |||||||||
10688619-C-A | ** | |||||||||
10689929-T-C | ** | |||||||||
10689940-C-A | ** | |||||||||
10694027-C-A | ** | |||||||||
10749842-A-T | ** | |||||||||
10749852-A-ATT | ** | |||||||||
10749856-CAT-C | ** | |||||||||
10755036-C-A | ** | |||||||||
10758489-T-A | ** | |||||||||
10759380-C-A | ** | |||||||||
10761232-C-A | ** | |||||||||
10763269-T-C | ** | |||||||||
10763319-T-C | ** | |||||||||
10763339-C-A | ** | |||||||||
10766612-A-C | ** | |||||||||
10766618-G-A | ** | |||||||||
10768551-A-T | ** | |||||||||
10771111-C-T | ** | |||||||||
10778917-G-T | ** | |||||||||
10781291-T-C | ** | |||||||||
10785583-G-A | FT91700 | ** | ||||||||
10785585-C-G | ** | |||||||||
10785587-ATTGC-A | ** | |||||||||
10785597-A-T | ** | |||||||||
10785599-T-TC | ** | |||||||||
10785779-T-C | ** | |||||||||
10788535-C-A | ** | |||||||||
10794198-C-G | ** | |||||||||
10794204-C-A | ** | |||||||||
10794208-G-T | ** | |||||||||
10796946-G-T | ** | |||||||||
10799432-C-T | ** | |||||||||
10799446-T-A | ** | |||||||||
10799509-C-G | ** | |||||||||
10799545-C-A | ** | |||||||||
10801244-C-T | ** | |||||||||
10801663-A-T | ** | |||||||||
10802269-T-C | ** | |||||||||
10803998-C-A | ** | |||||||||
10808576-C-G | ** | |||||||||
10809444-A-G | ** | |||||||||
10814537-C-G | ** | |||||||||
10815036-C-A | ** | |||||||||
10815046-ATCCAT-A | ** | |||||||||
10815097-T-G | ** | |||||||||
10815098-C-T | ** | |||||||||
10819053-C-A | ** | |||||||||
10821516-G-C | ** | |||||||||
10821551-T-C | ** | |||||||||
10821556-G-C | ** | |||||||||
10822838-C-T | ** | |||||||||
10828000-C-A | ** | |||||||||
10832078-A-T | ** | |||||||||
10832082-A-C | ** | |||||||||
10836301-C-T | ** | |||||||||
10840188-G-T | ** | |||||||||
10840798-T-A | ** | |||||||||
10842471-G-T | ** | |||||||||
10845543-C-A | ** | |||||||||
10845800-G-T | ** | |||||||||
10846898-C-A | ** | |||||||||
10860163-C-A | ** | |||||||||
10860943-C-A | ** | |||||||||
10868055-A-C | ** | |||||||||
10868056-T-C | ** | |||||||||
10868091-C-CTCCAT | ** | |||||||||
10874171-C-A | ** | |||||||||
10874890-C-A | ** | |||||||||
10877782-C-CCACTCCATTT | ** | |||||||||
10907759-C-A | ** | |||||||||
10907815-T-C | ** | |||||||||
10907817-G-C | ** | |||||||||
10907818-G-T | ** | |||||||||
10908105-C-T | ** | |||||||||
10908105-C-CTT | ** | |||||||||
10908117-T-A | ** | |||||||||
10908119-T-C | ** | |||||||||
10908123-T-C | ** | |||||||||
10908125-C-A | ** | |||||||||
10911719-C-A | ** | |||||||||
10913609-C-G | ** | |||||||||
10920829-T-C | ** | |||||||||
10929788-A-T | ** | |||||||||
10929797-C-T | ** | |||||||||
10930724-T-C | ** | |||||||||
10934703-T-A | ** | |||||||||
10935706-G-T | ** | |||||||||
10935969-C-A | ** | |||||||||
10939846-C-A | ** | |||||||||
10940739-C-T | FT437465 | ** | ||||||||
10942445-G-T | ** | |||||||||
10942448-CACCG-C | ** | |||||||||
10950209-C-A | ** | |||||||||
10952212-C-T | ** | |||||||||
10952227-T-G | ** | |||||||||
10952237-C-A | ** | |||||||||
10952922-C-G | ** | |||||||||
10952938-T-TCC | ** | |||||||||
10952943-T-C | ** | |||||||||
10952944-A-ATTT | ** | |||||||||
10952957-T-C | ** | |||||||||
10968977-G-T | ** | |||||||||
10970687-C-A | FT48542 | ** | ||||||||
10972278-C-A | ** | |||||||||
10974282-C-A | ** | |||||||||
10976921-T-G | ** | |||||||||
10976926-T-G | ** | |||||||||
10983929-C-T | ** | |||||||||
10983932-T-C | ** | |||||||||
10983952-T-A | ** | |||||||||
10983974-C-A | ** | |||||||||
10983979-C-CTGT | ** | |||||||||
10983980-CATT-C | ** | |||||||||
10983999-C-G | ** | |||||||||
10984805-A-G | ** | |||||||||
10984829-C-G | ** | |||||||||
10988329-ACTCCT-A | ** | |||||||||
10988344-A-C | ** | |||||||||
10988349-A-C | ** | |||||||||
10997047-C-A | ** | |||||||||
10997909-T-C | ** | |||||||||
11000076-G-T | ** | |||||||||
11000092-T-A | ** | |||||||||
11000575-A-G | ** | |||||||||
11009226-C-A | ** | |||||||||
11009264-C-A | ** | |||||||||
11010874-C-A | ** | |||||||||
11015214-G-T | ** | |||||||||
11016118-A-G | ** | |||||||||
11017362-T-C | ** | |||||||||
11020842-C-A | ** | |||||||||
11021013-T-C | ** | |||||||||
11021026-T-C | ** | |||||||||
11022333-A-G | ** | |||||||||
11025988-C-A | ** | |||||||||
11027099-C-A | ** | |||||||||
11031490-C-A | ** | |||||||||
11035477-A-T | ** | |||||||||
11035549-C-A | ** | |||||||||
11038144-C-A | ** | |||||||||
13213285-T-C | 11057609-T-C | ** | ||||||||
13213399-C-A | 11057723-C-A | ** | ||||||||
13254569-A-C | 11098893-A-C | ** | ||||||||
13271691-C-A | 11116015-C-A | ** | ||||||||
13280672-C-A | 11124996-C-A | ** | ||||||||
13421766-C-A | 11266090-C-A | ** | ||||||||
13441856-C-A | 11286180-C-A | ** | ||||||||
13461114-A-G | 11305438-A-G | ** | ||||||||
13474485-G-A | 11318809-G-A | ** | ||||||||
13496832-G-T | 11341156-G-T | ** | ||||||||
13498508-C-A | 11342832-C-A | ** | ||||||||
13509050-A-C | 11353374-A-C | ** | ||||||||
13525877-C-A | 11370201-C-A | ** | ||||||||
13544994-C-A | 11389318-C-A | ** | ||||||||
13565013-C-A | 11409337-C-A | ** | ||||||||
13565095-C-A | 11409419-C-A | ** | ||||||||
13565562-T-C | 11409886-T-C | ** | ||||||||
13598444-C-A | 11442768-C-A | ** | ||||||||
13601769-T-C | 11446093-T-C | ** | ||||||||
13624728-C-T | 11469052-C-T | ** | ||||||||
13643792-A-G | 11488116-A-G | ** | ||||||||
13705477-A-AG | 11549801-A-AG | ** | ||||||||
13705478-AT-A | 11549802-AT-A | ** | ||||||||
13705484-T-TG | 11549808-T-TG | ** | ||||||||
13705488-AT-A | 11549812-AT-A | ** | ||||||||
13705493-A-G | 11549817-A-G | ** | ||||||||
11645332-C-A | ** | |||||||||
11646241-T-C | FT449924 | ** | ||||||||
11648573-A-G | ** | |||||||||
11650980-C-A | ** | |||||||||
11659821-C-G | ** | |||||||||
11673540-C-A | ** | |||||||||
11674855-A-G | ** | |||||||||
11676479-A-C | ** | |||||||||
13801313-C-A | 11680607-C-A | ** | ||||||||
13809448-C-A | 11688742-C-A | ** | ||||||||
13809489-C-A | 11688783-C-A | ** | ||||||||
13821526-T-C | 11700820-T-C | ** | ||||||||
13855880-G-T | 11735174-G-T | ** | ||||||||
13884478-C-T | 11763772-C-T | ** | ||||||||
13888692-TTG-T | 11767986-TTG-T | 9×TG | ** | |||||||
13941225-C-A | 11820519-C-A | ** | ||||||||
13943423-C-A | 11822717-C-A | ** | ||||||||
13997756-C-A | 11877050-C-A | ** | ||||||||
14052854-G-A | 11932148-G-A | ** | ||||||||
14100153-C-A | 11979447-C-A | ** | ||||||||
14108562-C-A | 11987856-C-A | ** | ||||||||
14147920-G-A | 12027214-G-A | ** | ||||||||
14180647-T-C | 12059941-T-C | ** | ||||||||
14184508-T-A | 12063802-T-A | ** | ||||||||
14246975-G-T | 12126269-G-T | ** | ||||||||
14251608-TAA-T | 12130902-TAA-T | ** | ||||||||
14251642-C-A | 12130936-C-A | ** | ||||||||
14261300-T-C | 12140594-T-C | ** | ||||||||
14273744-G-T | 12153038-G-T | ** | ||||||||
14344310-G-T | 12223605-G-T | ** | ||||||||
14423857-C-A | 12303132-C-A | ** | ||||||||
14446695-C-A | 12325968-C-A | ** | ||||||||
14450184-T-C | 12329457-T-C | ** | ||||||||
14450352-C-A | 12329625-C-A | ** | ||||||||
14485273-A-T | 12364542-A-T | ** | ||||||||
14485402-G-T | 12364671-G-T | ** | ||||||||
14514121-T-C | 12402326-T-C | ** | ||||||||
14537918-C-A | 12426119-C-A | ** | ||||||||
14539420-A-G | 12427621-A-G | ** | ||||||||
14554711-C-A | 12442912-C-A | ** | ||||||||
14557756-C-A | 12445957-C-A | ** | ||||||||
14561734-C-A | 12449935-C-A | ** | ||||||||
14570950-A-G | 12459150-A-G | ** | ||||||||
14570959-C-T | 12459159-C-T | ** | ||||||||
14570968-T-C | 12459168-T-C | ** | ||||||||
14630629-T-A | 12518698-T-A | ** | ||||||||
14633023-G-T | 12521092-G-T | ** | ||||||||
14633945-T-A | 12522014-T-A | ** | ||||||||
14688407-G-A | 12576473-G-A | ** | ||||||||
14695916-A-T | 12583982-A-T | ** | ||||||||
14701330-C-A | 12589396-C-A | ** | ||||||||
14742168-G-T | 12630236-G-T | ** | ||||||||
15103553-T-A | 12991641-T-A | ** | ||||||||
15127937-C-A | 13016024-C-A | ** | ||||||||
15178398-C-A | 13066484-C-A | ** | ||||||||
15183891-T-C | 13071977-T-C | ** | ||||||||
15215495-G-A | 13103581-G-A | ** | ||||||||
15218748-C-A | 13106834-C-A | ** | ||||||||
15230937-C-A | 13119023-C-A | ** | ||||||||
15368684-C-A | 13256804-C-A | ** | ||||||||
15394461-C-A | 13282581-C-A | ** | ||||||||
15411237-C-A | 13299357-C-A | ** | ||||||||
15541681-C-A | 13429801-C-A | ** | ||||||||
15598928-A-G | 13487048-A-G | ** | ||||||||
15598930-A-G | 13487050-A-G | ** | ||||||||
15655346-C-A | 13543466-C-A | ** | ||||||||
15677023-C-A | 13565143-C-A | ** | ||||||||
15683171-A-G | 13571291-A-G | ** | ||||||||
15684580-C-A | 13572700-C-A | ** | ||||||||
15684587-C-A | 13572707-C-A | ** | ||||||||
15732220-C-A | 13620340-C-A | ** | ||||||||
15733798-A-T | 13621918-A-T | ** | ||||||||
15733801-T-C | 13621921-T-C | ** | ||||||||
15733803-C-T | 13621923-C-T | FTB71762 | ** | |||||||
15733804-C-T | 13621924-C-T | ** | ||||||||
15733818-T-C | 13621938-T-C | ** | ||||||||
15734252-C-A | 13622372-C-A | ** | ||||||||
15803525-C-A | 13691645-C-A | ** | ||||||||
15891456-C-A | 13779576-C-A | ** | ||||||||
15918454-T-C | 13806574-T-C | ** | ||||||||
15922489-G-T | 13810609-G-T | ** | ||||||||
15946573-C-A | 13834693-C-A | ** | ||||||||
16029615-C-T | 13917735-C-T | ** | ||||||||
16044259-T-C | 13932379-T-C | FT274265 | ** | |||||||
16046415-C-A | 13934535-C-A | ** | ||||||||
16048877-C-A | 13936997-C-A | ** | ||||||||
16059846-C-A | 13947966-C-A | ** | ||||||||
16060536-C-A | 13948656-C-A | ** | ||||||||
16062292-C-A | 13950412-C-A | ** | ||||||||
16064226-A-T | 13952346-A-T | ** | ||||||||
16065218-A-G | 13953338-A-G | ** | ||||||||
16083800-G-T | 13971920-G-T | ** | ||||||||
16084084-G-T | 13972204-G-T | ** | ||||||||
16118570-A-ATTTT | 14006690-A-ATTTT | P8_Prx | 31×T | ** | ||||||
16216465-A-C | 14104585-A-C | ** | ||||||||
16271918-C-T | 14160038-C-T | ** | ||||||||
16316877-C-A | 14204997-C-A | ** | ||||||||
16351684-A-G | 14239804-A-G | ** | ||||||||
16399763-G-C | 14287883-G-C | ** | ||||||||
16399775-A-T | 14287895-A-T | ** | ||||||||
16399777-A-G | 14287897-A-G | ** | ||||||||
16399785-A-G | 14287905-A-G | ** | ||||||||
16421207-G-T | 14309327-G-T | ** | ||||||||
16429612-A-G | 14317732-A-G | ** | ||||||||
16429628-G-C | 14317748-G-C | ** | ||||||||
16429629-T-C | 14317749-T-C | ** | ||||||||
16430949-C-A | 14319069-C-A | ** | ||||||||
16467224-G-T | 14355344-G-T | ** | ||||||||
16507024-C-A | 14395144-C-A | ** | ||||||||
16540010-G-A | 14428130-G-A | ** | ||||||||
16601407-C-T | 14489527-C-T | ** | ||||||||
16601408-C-T | 14489528-C-T | ** | ||||||||
16601419-G-C | 14489539-G-C | ** | ||||||||
16652801-A-C | 14540921-A-C | ** | ||||||||
16702168-G-T | 14590288-G-T | ** | ||||||||
16828853-G-A | 14716973-G-A | ** | ||||||||
16921519-C-A | 14809639-C-A | ** | ||||||||
17087302-G-A | 14975422-G-A | ** | ||||||||
17090803-G-C | 14978923-G-C | ** | ||||||||
17098110-A-G | 14986230-A-G | ** | ||||||||
17164143-C-G | 15052263-C-G | ** | ||||||||
17182429-C-A | 15070549-C-A | ** | ||||||||
17200062-G-T | 15088182-G-T | ** | ||||||||
17200071-G-A | 15088191-G-A | ** | ||||||||
17200086-T-C | 15088206-T-C | ** | ||||||||
17200097-C-T | 15088217-C-T | FGC38195 | ** | |||||||
17200099-C-T | 15088219-C-T | ** | ||||||||
17200117-G-A | 15088237-G-A | ** | ||||||||
17200118-A-T | 15088238-A-T | ** | ||||||||
17200123-C-T | 15088243-C-T | ** | ||||||||
17374682-G-T | 15262802-G-T | ** | ||||||||
17374937-G-T | 15263057-G-T | ** | ||||||||
17385391-C-A | 15273511-C-A | ** | ||||||||
17431854-T-C | 15319974-T-C | ** | ||||||||
17431948-C-A | 15320068-C-A | ** | ||||||||
17475180-G-A | 15363300-G-A | ** | ||||||||
17535449-T-C | 15423569-T-C | ** | ||||||||
17584248-C-T | 15472368-C-T | ** | ||||||||
17584268-A-G | 15472388-A-G | ** | ||||||||
17584286-C-G | 15472406-C-G | ** | ||||||||
17584288-G-A | 15472408-G-A | ** | ||||||||
17597920-GAA-G | 15486040-GAA-G | 11×A | ** | |||||||
17684301-C-A | 15572421-C-A | ** | ||||||||
17702436-T-C | 15590556-T-C | ** | ||||||||
17723022-A-T | 15611142-A-T | ** | ||||||||
17859758-C-A | 15747878-C-A | ** | ||||||||
17886068-C-A | 15774188-C-A | ** | ||||||||
17926462-A-G | 15814582-A-G | ** | ||||||||
17926465-T-A | 15814585-T-A | ** | ||||||||
17926467-C-G | 15814587-C-G | ** | ||||||||
17926469-G-A | 15814589-G-A | FGC32071 | FGC32062 | ** | ||||||
18090079-C-A | 15978199-C-A | ** | ||||||||
18189992-G-C | 16078112-G-C | ** | ||||||||
18196273-G-T | 16084393-G-T | ** | ||||||||
18212472-C-A | 16100592-C-A | ** | ||||||||
18231995-G-C | 16120115-G-C | ** | ||||||||
18401130-C-A | 16289250-C-A | P6_Gap | ** | |||||||
18628073-C-A | 16516193-C-A | F22735 | ** | |||||||
18682632-C-A | 16570752-C-A | ** | ||||||||
18707367-A-T | 16595487-A-T | ** | ||||||||
18733823-CT-C | 16621943-CT-C | ** | ||||||||
18749853-G-T | 16637973-G-T | ** | ||||||||
18756289-C-A | 16644409-C-A | ** | ||||||||
18767700-T-A | 16655820-T-A | ** | ||||||||
18932580-A-C | 16820700-A-C | ** | ||||||||
18933703-C-A | 16821823-C-A | ** | ||||||||
18955996-C-A | 16844116-C-A | FT105732 | ** | |||||||
18966100-T-C | 16854220-T-C | ** | ||||||||
18969357-T-G | 16857477-T-G | ** | ||||||||
18990898-C-A | 16879018-C-A | ** | ||||||||
19042637-G-T | 16930757-G-T | ** | ||||||||
19042640-A-T | 16930760-A-T | ** | ||||||||
19042648-A-T | 16930768-A-T | ** | ||||||||
19042659-T-G | 16930779-T-G | ** | ||||||||
19071049-G-A | 16959169-G-A | ** | ||||||||
19085971-A-G | 16974091-A-G | ** | ||||||||
19086107-A-G | 16974227-A-G | ** | ||||||||
19102755-G-T | 16990875-G-T | ** | ||||||||
19129049-C-T | 17017169-C-T | ** | ||||||||
19129052-GC-G | 17017172-GC-G | ** | ||||||||
19211576-C-T | 17099696-C-T | ** | ||||||||
19235284-C-A | 17123404-C-A | ** | ||||||||
19310819-C-A | 17198939-C-A | ** | ||||||||
19416836-A-T | 17304956-A-T | ** | ||||||||
19416837-G-C | 17304957-G-C | ** | ||||||||
19416842-A-G | 17304962-A-G | ** | ||||||||
19416851-G-A | 17304971-G-A | ** | ||||||||
19416854-A-C | 17304974-A-C | ** | ||||||||
19416860-T-A | 17304980-T-A | ** | ||||||||
19459343-C-A | 17347463-C-A | ** | ||||||||
19544394-C-A | 17432514-C-A | ** | ||||||||
19547645-C-A | 17435765-C-A | ** | ||||||||
19775284-G-T | 17663404-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19847682-G-T | 17735802-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19868147-T-TC | 17756267-T-TC | P5_Prx | ** | |||||||
20404467-AAAAAAAAG-A | 18242581-AAAAAAAAG-A | P5_Dst | ** | |||||||
20433617-G-T | 18271731-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20433685-G-T | 18271799-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20809847-A-G | 18647961-A-G | P4_Gap | ** | |||||||
20825104-C-A | 18663218-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
21042495-G-T | 18880609-G-T | ** | ||||||||
21096283-G-T | 18934397-G-T | ** | ||||||||
21153712-C-A | 18991826-C-A | ** | ||||||||
21170317-T-C | 19008431-T-C | ** | ||||||||
21208940-C-A | 19047054-C-A | ** | ||||||||
21234998-G-A | 19073112-G-A | FT82154 | ** | |||||||
21245135-G-T | 19083249-G-T | ** | ||||||||
21247853-C-A | 19085967-C-A | ** | ||||||||
21275297-T-C | 19113411-T-C | ** | ||||||||
21346521-C-A | 19184635-C-A | ** | ||||||||
21381648-C-A | 19219762-C-A | ** | ||||||||
21382111-G-T | 19220225-G-T | ** | ||||||||
21418007-A-G | 19256121-A-G | ** | ||||||||
21427229-C-A | 19265343-C-A | ** | ||||||||
21534828-AT-A | 19372942-AT-A | ** | ||||||||
21543537-T-G | 19381651-T-G | ** | ||||||||
21665720-TAAATA-T | 19503834-TAAATA-T | ** | ||||||||
21669559-C-G | 19507673-C-G | ** | ||||||||
21669566-T-A | 19507680-T-A | ** | ||||||||
21669586-G-A | 19507700-G-A | ** | ||||||||
21770927-C-T | 19609041-C-T | ** | ||||||||
21836514-G-A | 19674628-G-A | ** | ||||||||
21915795-T-C | 19753909-T-C | ** | ||||||||
21922080-CAAAAAAAA-C | 19760194-CAAAAAAAA-C | 23×A | ** | |||||||
21954634-C-T | 19792748-C-T | ** | ||||||||
21954645-A-T | 19792759-A-T | ** | ||||||||
21965539-A-T | 19803653-A-T | ** | ||||||||
21966240-G-T | 19804354-G-T | ** | ||||||||
22011613-T-A | 19849727-T-A | ** | ||||||||
22092866-A-G | 19930980-A-G | ** | ||||||||
22132542-C-A | 19970656-C-A | ** | ||||||||
22153683-G-T | 19991797-G-T | ** | ||||||||
22205479-C-A | 20043593-C-A | ** | ||||||||
22205509-G-A | 20043623-G-A | YP3597 FGC27597 | ** | |||||||
22240981-T-C | 20079095-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22240983-C-G | 20079097-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
22240984-T-C | 20079098-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22252471-C-T | 20090585-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
22252505-G-T | 20090619-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
22264269-A-T | 20102383-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
22264279-C-A | 20102393-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22264290-G-A | 20102404-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
22264299-C-T | 20102413-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
22295061-C-A | 20133175-C-A | DYZ19 | ** | |||||||
22341105-C-G | 20179219-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
22341106-A-T | 20179220-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
22341134-C-G | 20179248-C-G | DYZ19 | ** | |||||||
22345730-G-T | 20183844-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
22365711-A-G | 20203825-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
22365729-T-C | 20203843-T-C | DYZ19 | ** | |||||||
22580066-ATC-A | 20418180-ATC-A | ** | ||||||||
22774923-G-T | 20613037-G-T | ** | ||||||||
22800097-C-A | 20638211-C-A | ** | ||||||||
22837831-C-A | 20675945-C-A | ** | ||||||||
22837883-A-T | 20675997-A-T | ** | ||||||||
22842116-T-G | 20680230-T-G | ** | ||||||||
22842118-C-G | 20680232-C-G | ** | ||||||||
22842127-T-AA | 20680241-T-AA | ** | ||||||||
22842134-C-A | 20680248-C-A | ** | ||||||||
22842140-AT-A | 20680254-AT-A | ** | ||||||||
22842146-A-T | 20680260-A-T | ** | ||||||||
23039216-T-C | 20877330-T-C | ** | ||||||||
23052352-C-A | 20890466-C-A | ** | ||||||||
23065144-C-A | 20903258-C-A | ** | ||||||||
23078137-T-G | 20916251-T-G | ** | ||||||||
23262585-T-C | 21100699-T-C | ** | ||||||||
23262591-T-C | 21100705-T-C | ** | ||||||||
23262593-T-C | 21100707-T-C | ** | ||||||||
23262603-G-C | 21100717-G-C | ** | ||||||||
23277212-T-G | 21115326-T-G | ** | ||||||||
23311128-C-A | 21149242-C-A | ** | ||||||||
23441583-C-A | 21279697-C-A | ** | ||||||||
23459793-C-A | 21297907-C-A | ** | ||||||||
23464824-C-A | 21302938-C-A | ** | ||||||||
23512420-T-C | 21350534-T-C | ** | ||||||||
23512435-A-C | 21350549-A-C | ** | ||||||||
23512438-G-A | 21350552-G-A | ** | ||||||||
23516501-A-G | 21354615-A-G | ** | ||||||||
23818922-C-A | 21657036-C-A | ** | ||||||||
23953345-C-T | 21807198-C-T | ** | ||||||||
24221233-G-A | 22075086-G-A | P3_b1 | ** | |||||||
24403404-C-A | 22257257-C-A | ** | ||||||||
24491451-G-A | 22345304-G-A | FGC60848 | ** | |||||||
24512753-G-T | 22366606-G-T | ** | ||||||||
24512919-C-T | 22366772-C-T | ** | ||||||||
24512925-T-C | 22366778-T-C | ** | ||||||||
24512937-C-T | 22366790-C-T | ** | ||||||||
24512942-G-C | 22366795-G-C | ** | ||||||||
24870789-C-A | 22724642-C-A | IR1_R | ** | |||||||
26100555-T-C | 23954408-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26379189-C-A | 24233042-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27263249-G-T | 25117102-G-T | P1_g3 | ** | |||||||
27546761-TG-T | 25400614-TG-T | P1_Y2 | ** | |||||||
27618278-C-A | 25472131-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27756417-AT-A | 25610270-AT-A | P1_Y2 | 9×T | ** | ||||||
27791853-T-C | 25645706-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
27937813-T-C | 25791666-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28024175-T-C | 25878028-T-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28147096-G-T | 26000949-G-T | P1_b4 | ** | |||||||
28402133-C-A | 26255986-C-A | P1_gr2 | ** | |||||||
28464085-C-A | 26317938-C-A | ** | ||||||||
28481451-T-A | 26335304-T-A | ** | ||||||||
28485275-C-A | 26339128-C-A | ** | ||||||||
28498107-C-A | 26351960-C-A | ** | ||||||||
28513615-G-A | 26367468-G-A | ** | ||||||||
28515326-G-T | 26369179-G-T | ** | ||||||||
28520632-C-A | 26374485-C-A | ** | ||||||||
28530978-C-A | 26384831-C-A | ** | ||||||||
28577954-C-T | 26431807-C-T | ** | ||||||||
28594677-C-A | 26448530-C-A | ** | ||||||||
28595433-T-C | 26449286-T-C | ** | ||||||||
28595438-A-C | 26449291-A-C | ** | ||||||||
28595451-C-T | 26449304-C-T | ** | ||||||||
28595455-G-A | 26449308-G-A | ** | ||||||||
28595464-T-C | 26449317-T-C | ** | ||||||||
28595465-G-A | 26449318-G-A | ** | ||||||||
28605902-C-A | 26459755-C-A | ** | ||||||||
28609194-CTT-C | 26463047-CTT-C | 11×T | ** | |||||||
28610396-T-G | 26464249-T-G | ** | ||||||||
28640467-C-A | 26494320-C-A | ** | ||||||||
28642912-C-A | 26496765-C-A | ** | ||||||||
28653940-C-A | 26507793-C-A | ** | ||||||||
28660691-C-A | 26514544-C-A | ** | ||||||||
28665134-C-A | 26518987-C-A | ** | ||||||||
28716359-C-A | 26570212-C-A | ** | ||||||||
28742559-G-T | 26596412-G-T | ** | ||||||||
28761277-G-T | 26615130-G-T | ** | ||||||||
28761382-C-A | 26615235-C-A | 31×A | ** | |||||||
28777265-C-A | 26631118-C-A | ** | ||||||||
28796797-G-C | 26650650-G-C | ** | ||||||||
28802533-G-T | 26656386-G-T | ** | ||||||||
56825735-G-T | ** | |||||||||
56835396-C-T | ** | |||||||||
56835449-C-A | ** | |||||||||
58986175-G-T | 56840028-G-T | ** | ||||||||
56840670-A-T | ** | |||||||||
56863086-C-A | ** | |||||||||
6932-C-G | ** | |||||||||
34210-C-T | ** | |||||||||
19594605-T-A | 17482725-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
20620856-C-A | 18458970-C-A | P4_Prx | ** | |||||||
4517035-G-T | 4648994-G-T | ** | ||||||||
7506114-T-C | 7638073-T-C | IR1_L | ** | |||||||
18301806-A-C | 16189926-A-C | P6_Prx | ** | |||||||
23176777-G-GA | 21014891-G-GA | ** | ||||||||
13489629-C-A | 11333953-C-A | *** | *** | |||||||
7643329-GGA-G | 7775288-GGA-G | 9×GA | *** | |||||||
28790892-T-A | 26644745-T-A | *** | ||||||||
13869270-G-A | 11748564-G-A | *** | ||||||||
7138496-C-A | 7270455-C-A | *** | *** | |||||||
22426362-C-G | 20264476-C-G | DYZ19 | *** | |||||||
22512677-C-G | 20350791-C-G | DYZ19 | *** | |||||||
23702943-C-A | 21541057-C-A | *** | ||||||||
25262836-C-T | 23116689-C-T | P2_r1 | *** | |||||||
25310918-G-T | 23164771-G-T | P2_r1 | *** | |||||||
25393687-A-C | 23247540-A-C | P2_r2 | *** | |||||||
14589758-C-T | 12477958-C-T | F19087 | *** | |||||||
16906865-A-C | 14794985-A-C | *** | ||||||||
14609562-G-A | 12497764-G-A | *** | ||||||||
14609565-T-C | 12497767-T-C | *** | ||||||||
2787427-G-A | 2919386-G-A | *** | ||||||||
3011619-C-A | 3143578-C-A | *** | ||||||||
4408474-C-A | 4540433-C-A | *** | ||||||||
4908056-C-A | 5040015-C-A | *** | ||||||||
5534899-C-A | 5666858-C-A | *** | ||||||||
5587022-G-T | 5718981-G-T | *** | ||||||||
5720832-A-G | 5852791-A-G | *** | ||||||||
6144737-G-GA,GAA | 6276696-G-GA,GAA | IR3_Dst | 12×A | *** | ||||||
6458072-ATT-A | 6590031-ATT-A | 13×T | *** | |||||||
7348526-C-A | 7480485-C-A | *** | ||||||||
8052110-C-A | 8184069-C-A | *** | ||||||||
8466174-C-A | 8598133-C-A | *** | ||||||||
9153586-C-A | 9315977-C-A | *** | ||||||||
9952353-C-A | 10114744-C-A | *** | ||||||||
9968339-GTTTT-G,GTTT | 10130730-GTTTT-G,GTTT | 15×T | *** | |||||||
10677565-C-A | *** | |||||||||
10686721-C-T | *** | |||||||||
10845635-C-G | *** | |||||||||
10869976-C-G | *** | |||||||||
10973984-G-A,T | *** | |||||||||
10986913-A-T | *** | |||||||||
10990128-C-A | *** | |||||||||
11001427-C-CATTCA | *** | |||||||||
11001436-A-C,G | *** | |||||||||
11001448-A-G | *** | |||||||||
11001478-C-T | *** | |||||||||
11001482-G-C | *** | |||||||||
11001485-A-T | *** | |||||||||
13455941-TTCCAT-T,TTCCAC | 11300265-TTCCAT-T,TTCCAC | *** | ||||||||
13489629-CCACCCA-C,CCAGCCC | 11333953-CCACCCA-C,CCAGCCC | *** | ||||||||
13938895-AG-A | 11818189-AG-A | *** | ||||||||
14485171-G-T | 12364440-G-T | *** | ||||||||
14505250-A-G | 12393455-A-G | *** | ||||||||
14580841-CA-C | 12469041-CA-C | 9×A | *** | |||||||
14589525-C-A | 12477725-C-A | *** | ||||||||
14825883-TG-T | 12713950-TG-T | *** | ||||||||
15029495-C-CTT | 12917583-C-CTT | 16×T | *** | |||||||
15221460-C-A | 13109546-C-A | *** | ||||||||
15379565-G-A | 13267685-G-A | BY101197 | *** | |||||||
16056774-T-G | 13944894-T-G | *** | ||||||||
16274019-G-T | 14162139-G-T | *** | ||||||||
16320114-G-A | 14208234-G-A | *** | ||||||||
16428214-T-C | 14316334-T-C | *** | ||||||||
16430220-G-A | 14318340-G-A | *** | ||||||||
16747452-TTA-T | 14635572-TTA-T | *** | ||||||||
16749739-TTTG-T,TG | 14637859-TTTG-T,TG | *** | ||||||||
16921431-AT-A,ATT | 14809551-AT-A,ATT | 14×T | *** | |||||||
17843246-T-C | 15731366-T-C | *** | ||||||||
18511565-C-A | 16399685-C-A | P6_Dst | 20×AT | *** | ||||||
18873484-C-A | 16761604-C-A | *** | ||||||||
19107403-TA-T,TAA | 16995523-TA-T,TAA | 14×A | *** | |||||||
22259180-G-A | 20097294-G-A | DYZ19 | *** | |||||||
22429114-A-G | 20267228-A-G | DYZ19 | *** | |||||||
56826966-A-CCATTT | *** | |||||||||
56846267-G-C | *** | |||||||||
56861838-ACCTG-A | *** | |||||||||
7270276-CTTTTTT-C,CTTTTT | 7402235-CTTTTTT-C,CTTTTT | 25×T | *** | |||||||
7379610-CTT-C | 7511569-CTT-C | 11×T | *** | |||||||
4773481-CTTTT-C | 4905440-CTTTT-C | 25×T | *** | |||||||
4976787-CAAA-C,CAAAA | 5108746-CAAA-C,CAAAA | 21×A | *** | |||||||
10903978-T-A | *** | |||||||||
13458765-C-T | 11303089-C-T | *** | ||||||||
14565178-G-A | 12453378-G-A | FT192984 | *** | |||||||
16629335-CAAAAA-C,CA | 14517455-CAAAAA-C,CA | 19×A | *** | |||||||
22320093-G-T | 20158207-G-T | DYZ19 | *** | |||||||
22320094-A-T | 20158208-A-T | FT455811 | DYZ19 | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.