Barry
FTDNA: 288343, BigY2: 288343, BigY3: 288343MDKA Birth: Ireland
Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 288343 | BigY2 288343 | BigY3 288343 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6196496-T-TTTA | 6328455-T-TTTA | IR3_Dst | 5×TTA | *** | A* | |||||
9551440-G-GT | 9713831-G-GT | IR3_Prx | 11×T | A* | ||||||
9716807-C-CA | 9879198-C-CA | IR3_Prx | 12×A | A* | ||||||
4988698-T-C | 5120657-T-C | FT322357 | A* | |||||||
20076959-C-A | 17965079-C-A | P5_Dst | A* | |||||||
28817035-G-A | 26670888-G-A | A* | ||||||||
20689815-ATT-A | 18527929-ATT-A | P4_Prx | 23×T | + | ||||||
14362581-G-A | 12241876-G-A | Y49437 | Y | Y | + | + | + | |||
23427634-A-ATG | 21265748-A-ATG | + | * | + | ||||||
23968637-T-G | 21822490-T-G | Y59644 | Y | + | + | + | ||||
26908736-G-C | 24762589-G-C | P1_r3 | + | |||||||
4185980-G-T | 4317939-G-T | FT81327 | + | |||||||
6409096-T-C | 6541055-T-C | FT81676 | + | |||||||
28793313-G-T | 26647166-G-T | *** | * | |||||||
6167051-C-G | 6299010-C-G | BY8648 | IR3_Dst | * | ||||||
9602654-CT-C | 9765045-CT-C | IR3_Prx | 19×T | ** | ||||||
18738827-G-GTA | 16626947-G-GTA | 10×TA | ** | |||||||
17538669-C-T | 15426789-C-T | CTS7561 | ** | ** | ||||||
9683885-T-TATA | 9846276-T-TATA | IR3_Prx | 5×ATA | ** | ||||||
7258783-C-A | 7390742-C-A | ** | ||||||||
16292787-G-A | 14180907-G-A | ** | ||||||||
16729299-C-A | 14617419-C-A | ** | ||||||||
27540976-CA-C | 25394829-CA-C | P1_Y2 | 12×A | ** | ||||||
4460944-GTC-G | 4592903-GTC-G | ** | ||||||||
18035828-C-A | 15923948-C-A | Y29511 | ** | |||||||
28531368-A-C | 26385221-A-C | FGC24558 | ** | |||||||
13909001-T-TA | 11788295-T-TA | 11×A | ** | |||||||
19206740-GTAAAA-G | 17094860-GTAAAA-G | ** | ||||||||
13223554-G-C | 11067878-G-C | ** | ||||||||
14050727-T-C | 11930021-T-C | ** | ||||||||
9414607-A-T | 9576998-A-T | ** | ||||||||
13480486-T-A | 11324810-T-A | ** | ||||||||
10925249-G-A | ** | |||||||||
10925253-A-T | ** | |||||||||
10925256-T-C | ** | |||||||||
10925266-C-T | ** | |||||||||
10925277-ATCATT-A | ** | |||||||||
10925284-G-A | ** | |||||||||
10925295-A-G | ** | |||||||||
10925311-C-T | ** | |||||||||
19544101-C-A | 17432221-C-A | ** | ||||||||
17187471-C-A | 15075591-C-A | ** | ||||||||
18626009-T-G | 16514129-T-G | ** | ||||||||
22843776-C-A | 20681890-C-A | FTB13198 | ** | |||||||
10773146-C-T | ** | |||||||||
25031173-C-A | 22885026-C-A | g1 | ** | |||||||
10684291-C-T | ** | |||||||||
11028218-TGAACT-A | ** | |||||||||
21262605-C-A | 19100719-C-A | ** | ||||||||
22218861-G-T | 20056975-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
14158262-C-A | 12037556-C-A | ** | ||||||||
13486862-T-A | 11331186-T-A | ** | ||||||||
10754788-T-G | ** | |||||||||
10754794-C-T | ** | |||||||||
10754799-C-G | ** | |||||||||
15753171-T-C | 13641291-T-C | ** | ||||||||
10754727-T-A | ** | |||||||||
10754729-C-T | ** | |||||||||
11028255-C-T | ** | |||||||||
10885275-G-C | ** | |||||||||
10885280-T-C | ** | |||||||||
20440398-G-GTTC | 18278512-G-GTTC | P5_Dst | ** | |||||||
10888505-C-A | ** | |||||||||
10971056-A-T | ** | |||||||||
20497573-T-TC | 18335687-T-TC | P5_Dst | ** | |||||||
27889319-AC-A | 25743172-AC-A | P1_Y2 | ** | |||||||
7038579-C-A | 7170538-C-A | ** | ||||||||
9702867-AACACACAC-A | 9865258-AACACACAC-A | IR3_Prx | 19×AC | ** | ||||||
10971046-T-A | FT438627 | ** | ||||||||
9398021-C-A | 9560412-C-A | ** | ||||||||
23317698-A-T | 21155812-A-T | ** | ||||||||
10927858-A-T | ** | |||||||||
10927866-C-T | ** | |||||||||
9925258-C-T | 10087649-C-T | ** | ||||||||
13585978-C-A | 11430302-C-A | ** | ||||||||
14622212-C-CA | 12510410-C-CA | 10×A | ** | |||||||
11031235-C-A | ** | |||||||||
10902246-C-A | ** | |||||||||
7269950-C-A | 7401909-C-A | ** | ||||||||
21262745-T-C | 19100859-T-C | ** | ||||||||
11038165-C-A | ** | |||||||||
3790961-C-A | 3922920-C-A | ** | ||||||||
14517721-C-A | 12405922-C-A | ** | ||||||||
10927441-C-T | ** | |||||||||
10927444-T-C | ** | |||||||||
10927461-C-A | ** | |||||||||
15323678-AAG-A | 13211796-AAG-A | ** | ||||||||
13461005-T-G | 11305329-T-G | ** | ||||||||
5214496-C-A | 5346455-C-A | ** | ||||||||
10883053-T-C | ** | |||||||||
18012135-T-TC | 15900255-T-TC | P7_Dst | ** | |||||||
13486840-C-G | 11331164-C-G | ** | ||||||||
14735086-T-A | 12623154-T-A | ** | ||||||||
14735089-G-A | 12623157-G-A | ** | ||||||||
6310830-A-T | 6442789-A-T | IR3_Dst | ** | |||||||
3116585-C-A | 3248544-C-A | ** | ||||||||
5421114-C-A | 5553073-C-A | ** | ||||||||
5960727-G-T | 6092686-G-T | ** | ||||||||
10994575-T-A | ** | |||||||||
10994578-C-A | ** | |||||||||
10994585-A-G | ** | |||||||||
10994594-T-C | FT439601 | ** | ||||||||
15115218-C-A | 13003305-C-A | ** | ||||||||
7320462-C-A | 7452421-C-A | ** | ||||||||
10971042-T-C | ** | |||||||||
21821475-T-G | 19659589-T-G | ** | ||||||||
10753545-A-T | ** | |||||||||
6150075-C-A | 6282034-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
10950465-T-A | ** | |||||||||
17475172-C-T | 15363292-C-T | ** | ||||||||
15289951-C-A | 13178050-C-A | ** | ||||||||
8762186-C-A | 8894145-C-A | ** | ||||||||
14036007-C-A | 11915301-C-A | ** | ||||||||
7432389-C-A | 7564348-C-A | ** | ||||||||
28777717-C-A | 26631570-C-A | ** | ||||||||
9442341-C-A | 9604732-C-A | ** | ||||||||
6580393-C-A | 6712352-C-A | ** | ||||||||
10831562-A-T | ** | |||||||||
22869032-C-A | 20707146-C-A | ** | ||||||||
26100562-T-C | 23954415-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
10812676-G-T | ** | |||||||||
3051896-C-A | 3183855-C-A | ** | ||||||||
13579838-T-G | 11424162-T-G | ** | ||||||||
14226586-C-A | 12105880-C-A | ** | ||||||||
56851130-G-T | ** | |||||||||
10888483-C-A | ** | |||||||||
10848908-T-A | ** | |||||||||
10848909-T-C | ** | |||||||||
10848916-C-A | ** | |||||||||
10848922-T-A | ** | |||||||||
10848926-C-T | ** | |||||||||
10848929-T-C | ** | |||||||||
10848933-A-G | ** | |||||||||
10848941-C-T | ** | |||||||||
10848951-T-C | FT219996 | ** | ||||||||
10683404-G-A | ** | |||||||||
10683406-A-T | ** | |||||||||
10683408-T-C | ** | |||||||||
14769254-C-A | 12657323-C-A | ** | ||||||||
10927433-A-G | ** | |||||||||
21082046-C-A | 18920160-C-A | ** | ||||||||
24254145-CA-C | 22107998-CA-C | P3_b1 | ** | |||||||
14413199-C-A | 12292496-C-A | ** | ||||||||
3732585-C-A | 3864544-C-A | ** | ||||||||
21495975-A-T | 19334089-A-T | ** | ||||||||
8296174-C-A | 8428133-C-A | ** | ||||||||
8296177-C-A | 8428136-C-A | ** | ||||||||
17834443-T-C | 15722563-T-C | ** | ||||||||
17834465-T-C | 15722585-T-C | ** | ||||||||
10950596-C-A | ** | |||||||||
14023035-C-A | 11902329-C-A | ** | ||||||||
19575814-C-A | 17463934-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
7866086-C-A | 7998045-C-A | ** | ||||||||
24509423-C-A | 22363276-C-A | ** | ||||||||
10655845-T-C | ** | |||||||||
21589536-C-A | 19427650-C-A | ** | ||||||||
9927340-C-A | 10089731-C-A | ** | ||||||||
10883009-A-ATTCCC | ** | |||||||||
10883034-G-A | ** | |||||||||
10883045-C-A | ** | |||||||||
10883049-A-C | ** | |||||||||
10883072-C-A | ** | |||||||||
10883090-G-T | ** | |||||||||
17834447-C-T | 15722567-C-T | ** | ||||||||
28632721-C-A | 26486574-C-A | ** | ||||||||
14297279-C-A | 12176573-C-A | ** | ||||||||
17342879-C-A | 15230999-C-A | ** | ||||||||
14715791-G-T | 12603858-G-T | ** | ||||||||
14948917-C-A | 12836991-C-A | ** | ||||||||
7252372-C-A | 7384331-C-A | ** | ||||||||
56849637-G-T | ** | |||||||||
28758118-C-A | 26611971-C-A | ** | ||||||||
10811136-T-A | ** | |||||||||
9926834-C-A | 10089225-C-A | ** | ||||||||
10950414-T-C | ** | |||||||||
28532038-A-C | 26385891-A-C | ** | ||||||||
15761802-G-T | 13649922-G-T | ** | ||||||||
2960272-C-A | 3092231-C-A | ** | ||||||||
23066250-G-T | 20904364-G-T | ** | ||||||||
19183485-A-G | 17071605-A-G | ** | ||||||||
13302360-C-A | 11146684-C-A | ** | ||||||||
11674328-A-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11674330-T-A | DYZ17 | ** | ||||||||
7437451-C-A | 7569410-C-A | ** | ||||||||
5755899-G-T | 5887858-G-T | ** | ||||||||
14286896-C-A | 12166190-C-A | ** | ||||||||
2928486-C-A | 3060445-C-A | ** | ||||||||
7188244-C-A | 7320203-C-A | ** | ||||||||
10970652-C-A | ** | |||||||||
21042942-C-A | 18881056-C-A | ** | ||||||||
10950508-A-T | ** | |||||||||
4129090-C-A | 4261049-C-A | ** | ||||||||
4416880-AAAAA-C | 4548839-AAAAA-C | ** | ||||||||
2682805-G-C | 2814764-G-C | ** | ||||||||
2682820-C-T | 2814779-C-T | ** | ||||||||
2740539-C-A | 2872498-C-A | ** | ||||||||
2865672-C-A | 2997631-C-A | ** | ||||||||
3029174-G-T | 3161133-G-T | ** | ||||||||
3048249-C-A | 3180208-C-A | ** | ||||||||
3126788-TA-T | 3258747-TA-T | ** | ||||||||
3178117-T-C | 3310076-T-C | ** | ||||||||
3229711-C-A | 3361670-C-A | ** | ||||||||
3343935-A-G | 3475894-A-G | ** | ||||||||
3374218-G-C | 3506177-G-C | ** | ||||||||
3374231-A-T | 3506190-A-T | ** | ||||||||
3374263-A-C | 3506222-A-C | ** | ||||||||
3391483-T-A | 3523442-T-A | ** | ||||||||
3436997-T-C | 3568956-T-C | ** | ||||||||
3486558-C-A | 3618517-C-A | ** | ||||||||
3552274-G-T | 3684233-G-T | ** | ||||||||
3641454-T-C | 3773413-T-C | ** | ||||||||
3836860-T-A | 3968819-T-A | ** | ||||||||
3951461-C-T | 4083420-C-T | ** | ||||||||
3951504-A-T | 4083463-A-T | ** | ||||||||
3951581-C-A | 4083540-C-A | ** | ||||||||
3966885-G-T | 4098844-G-T | ** | ||||||||
3967173-G-T | 4099132-G-T | ** | ||||||||
4063836-T-C | 4195795-T-C | ** | ||||||||
4081812-A-T | 4213771-A-T | ** | ||||||||
4112943-A-G | 4244902-A-G | 8×T | ** | |||||||
4215811-G-T | 4347770-G-T | ** | ||||||||
4241935-C-A | 4373894-C-A | ** | ||||||||
4241999-C-A | 4373958-C-A | ** | ||||||||
4245102-G-C | 4377061-G-C | ** | ||||||||
4271719-C-T | 4403678-C-T | ** | ||||||||
4357942-C-T | 4489901-C-T | ** | ||||||||
4365957-C-A | 4497916-C-A | ** | ||||||||
4370980-C-A | 4502939-C-A | ** | ||||||||
4374343-C-A | 4506302-C-A | ** | ||||||||
4374977-C-A | 4506936-C-A | ** | ||||||||
4449025-C-A | 4580984-C-A | ** | ||||||||
4557241-C-A | 4689200-C-A | ** | ||||||||
4604393-A-T | 4736352-A-T | ** | ||||||||
4604979-T-C | 4736938-T-C | ** | ||||||||
4687959-C-A | 4819918-C-A | ** | ||||||||
4712899-T-A | 4844858-T-A | ** | ||||||||
4779886-G-A | 4911845-G-A | ** | ||||||||
4779894-T-A | 4911853-T-A | ** | ||||||||
4779894-T-TC | 4911853-T-TC | ** | ||||||||
4788462-C-A | 4920421-C-A | ** | ||||||||
4873666-A-C | 5005625-A-C | ** | ||||||||
4887305-C-A | 5019264-C-A | ** | ||||||||
4888554-C-T | 5020513-C-T | ** | ||||||||
4898415-A-G | 5030374-A-G | ** | ||||||||
4999833-A-G | 5131792-A-G | ** | ||||||||
5022667-GGTGT-G | 5154626-GGTGT-G | 12×GT | ** | |||||||
5084766-C-A | 5216725-C-A | ** | ||||||||
5087453-C-A | 5219412-C-A | ** | ||||||||
5127632-C-A | 5259591-C-A | ** | ||||||||
5127890-C-A | 5259849-C-A | ** | ||||||||
5189621-AT-A | 5321580-AT-A | ** | ||||||||
5247520-G-T | 5379479-G-T | ** | ||||||||
5362601-C-A | 5494560-C-A | ** | ||||||||
5449410-C-A | 5581369-C-A | ** | ||||||||
5524718-T-A | 5656677-T-A | ** | ||||||||
5560108-AAAAT-A | 5692067-AAAAT-A | 5×AAAT | ** | |||||||
5562389-A-T | 5694348-A-T | ** | ||||||||
5601109-T-C | 5733068-T-C | ** | ||||||||
5647765-G-T | 5779724-G-T | ** | ||||||||
5669109-A-T | 5801068-A-T | ** | ||||||||
5761444-A-C | 5893403-A-C | ** | ||||||||
5796220-C-G | 5928179-C-G | ** | ||||||||
5796251-AT-A | 5928210-AT-A | 8×T | ** | |||||||
5824098-A-G | 5956057-A-G | ** | ||||||||
5861724-A-C | 5993683-A-C | ** | ||||||||
5956933-C-A | 6088892-C-A | ** | ||||||||
6037130-T-C | 6169089-T-C | ** | ||||||||
6248259-T-C | 6380218-T-C | IR3_Dst | ** | |||||||
6347569-G-T | 6479528-G-T | ** | ||||||||
6419048-G-T | 6551007-G-T | ** | ||||||||
6519605-T-G | 6651564-T-G | ** | ||||||||
6582550-C-A | 6714509-C-A | ** | ||||||||
6593272-A-G | 6725231-A-G | ** | ||||||||
6690274-T-C | 6822233-T-C | ** | ||||||||
6799127-C-A | 6931086-C-A | ** | ||||||||
6799179-A-G | 6931138-A-G | ** | ||||||||
6807915-C-A | 6939874-C-A | ** | ||||||||
6948134-T-C | 7080093-T-C | ** | ||||||||
6948259-G-C | 7080218-G-C | ** | ||||||||
6996607-G-A | 7128566-G-A | ** | ||||||||
7015293-C-A | 7147252-C-A | ** | ||||||||
7107145-A-G | 7239104-A-G | ** | ||||||||
7115294-G-T | 7247253-G-T | ** | ||||||||
7117272-G-T | 7249231-G-T | ** | ||||||||
7127458-A-G | 7259417-A-G | ** | ||||||||
7138466-A-G | 7270425-A-G | ** | ||||||||
7170768-C-A | 7302727-C-A | ** | ||||||||
7237243-C-A | 7369202-C-A | ** | ||||||||
7240874-C-A | 7372833-C-A | ** | ||||||||
7248060-A-T | 7380019-A-T | ** | ||||||||
7257785-C-A | 7389744-C-A | ** | ||||||||
7433456-C-A | 7565415-C-A | ** | ||||||||
7437417-T-G | 7569376-T-G | ** | ||||||||
7437456-A-G | 7569415-A-G | ** | ||||||||
7443961-G-A | 7575920-G-A | ** | ||||||||
7759279-C-A | 7891238-C-A | ** | ||||||||
7866812-C-A | 7998771-C-A | ** | ||||||||
7925290-C-A | 8057249-C-A | ** | ||||||||
8074244-A-C | 8206203-A-C | ** | ||||||||
8076735-G-C | 8208694-G-C | ** | ||||||||
8293359-A-C | 8425318-A-C | ** | ||||||||
8481137-T-A | 8613096-T-A | ** | ||||||||
8865954-C-A | 8997913-C-A | ** | ||||||||
9057431-C-A | ** | |||||||||
8980052-G-T | 9142443-G-T | ** | ||||||||
9340183-A-G | 9502574-A-G | ** | ||||||||
9340184-A-G | 9502575-A-G | ** | ||||||||
9442240-C-A | 9604631-C-A | ** | ||||||||
9499328-T-A | 9661719-T-A | ** | ||||||||
9499355-T-G | 9661746-T-G | ** | ||||||||
9508390-T-C | 9670781-T-C | ** | ||||||||
9702813-C-A | 9865204-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9798174-C-A | 9960565-C-A | ** | ||||||||
9839523-G-A | 10001914-G-A | ** | ||||||||
9890383-A-G | 10052774-A-G | ** | ||||||||
9928364-C-A | 10090755-C-A | ** | ||||||||
9941326-C-A | 10103717-C-A | ** | ||||||||
9985998-C-A | 10148389-C-A | ** | ||||||||
10011050-G-T | 10173441-G-T | ** | ||||||||
10050892-C-T | 10213283-C-T | ** | ||||||||
10652820-A-T | ** | |||||||||
10655764-C-T | ** | |||||||||
10655831-G-A | ** | |||||||||
10655833-T-G | ** | |||||||||
10668433-A-C | ** | |||||||||
10668438-G-C | ** | |||||||||
10668440-G-A | FT200098 | ** | ||||||||
10677636-A-C | ** | |||||||||
10679412-G-C | ** | |||||||||
10685404-T-G | ** | |||||||||
10685491-C-A | ** | |||||||||
10693770-A-G | ** | |||||||||
10750727-T-G | ** | |||||||||
10750956-C-A | ** | |||||||||
10753569-C-CACTAA | ** | |||||||||
10753609-C-G | ** | |||||||||
10757680-CT-C | ** | |||||||||
10758026-A-G | ** | |||||||||
10758029-C-CCATTG | ** | |||||||||
10763408-G-T | ** | |||||||||
10764781-C-A | ** | |||||||||
10766647-C-A | ** | |||||||||
10768618-C-A | ** | |||||||||
10773842-C-A | ** | |||||||||
10775788-G-T | ** | |||||||||
10779174-T-G | ** | |||||||||
10783580-C-A | ** | |||||||||
10784373-T-TC | ** | |||||||||
10785974-A-T | ** | |||||||||
10788615-T-C | ** | |||||||||
10791255-GCATTC-G | ** | |||||||||
10797717-C-G | ** | |||||||||
10810854-T-C | ** | |||||||||
10818410-T-C | ** | |||||||||
10828118-A-G | ** | |||||||||
10839727-C-A | ** | |||||||||
10844096-TC-T | ** | |||||||||
10847137-C-A | ** | |||||||||
10848019-C-A | ** | |||||||||
10848039-T-G | ** | |||||||||
10848059-T-C | ** | |||||||||
10864764-A-G | ** | |||||||||
10869115-C-A | ** | |||||||||
10883097-C-A | ** | |||||||||
10883098-C-T | FT189911 | ** | ||||||||
10883117-C-G | ** | |||||||||
10888742-C-A | ** | |||||||||
10900218-C-A | ** | |||||||||
10900550-C-A | ** | |||||||||
10913393-T-A | ** | |||||||||
10917045-A-T | ** | |||||||||
10917162-C-T | ** | |||||||||
10932223-G-T | ** | |||||||||
10940534-T-C | FT437457 | ** | ||||||||
10950391-C-G | ** | |||||||||
10950399-T-C | ** | |||||||||
10950424-G-GTTAAC | ** | |||||||||
10950429-C-CTCCTT | ** | |||||||||
10950473-A-T | ** | |||||||||
10951227-C-A | ** | |||||||||
10959143-A-C | ** | |||||||||
10964860-TC-T | ** | |||||||||
10974571-C-A | ** | |||||||||
10982207-T-C | ** | |||||||||
10982213-C-A | ** | |||||||||
10999445-A-G | ** | |||||||||
11003498-A-T | ** | |||||||||
11003510-G-C | ** | |||||||||
11003511-A-C | ** | |||||||||
11009152-T-G | ** | |||||||||
11033824-T-G | ** | |||||||||
13217932-T-G | 11062256-T-G | ** | ||||||||
13227903-G-A | 11072227-G-A | ** | ||||||||
13233257-C-A | 11077581-C-A | ** | ||||||||
13233381-T-C | 11077705-T-C | ** | ||||||||
13253255-C-A | 11097579-C-A | ** | ||||||||
13297250-T-G | 11141574-T-G | ** | ||||||||
13332432-C-A | 11176756-C-A | ** | ||||||||
13433254-C-A | 11277578-C-A | ** | ||||||||
13484823-A-T | 11329147-A-T | ** | ||||||||
13486811-A-T | 11331135-A-T | ** | ||||||||
13486831-G-A | 11331155-G-A | ** | ||||||||
13486844-G-T | 11331168-G-T | ** | ||||||||
13486844-GC-G | 11331168-GC-G | ** | ||||||||
13486859-G-C | 11331183-G-C | ** | ||||||||
13505016-A-G | 11349340-A-G | ** | ||||||||
13506960-A-G | 11351284-A-G | ** | ||||||||
13588565-C-A | 11432889-C-A | ** | ||||||||
13620809-G-C | 11465133-G-C | ** | ||||||||
13625217-C-A | 11469541-C-A | ** | ||||||||
11643332-A-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11650787-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11654516-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11658391-C-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11668769-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11672630-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
11673361-A-C | DYZ17 | ** | ||||||||
11674332-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
11674336-G-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11674338-A-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11674351-G-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11674353-C-G | DYZ17 | ** | ||||||||
11674955-A-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11675035-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
11676545-T-A | DYZ17 | ** | ||||||||
13856003-T-G | 11735297-T-G | DYZ17 | ** | |||||||
13886073-A-T | 11765367-A-T | ** | ||||||||
13887500-G-A | 11766794-G-A | ** | ||||||||
13936105-A-G | 11815399-A-G | ** | ||||||||
13989008-C-A | 11868302-C-A | ** | ||||||||
14020207-A-T | 11899501-A-T | ** | ||||||||
14031689-T-C | 11910983-T-C | ** | ||||||||
14035225-C-G | 11914519-C-G | ** | ||||||||
14069162-C-A | 11948456-C-A | ** | ||||||||
14074153-C-A | 11953447-C-A | ** | ||||||||
14107750-G-A | 11987044-G-A | FT57784 | ** | |||||||
14187294-C-A | 12066588-C-A | ** | ||||||||
14240416-C-A | 12119710-C-A | ** | ||||||||
14241917-G-A | 12121211-G-A | ** | ||||||||
14295559-C-A | 12174853-C-A | ** | ||||||||
14301942-C-T | 12181236-C-T | ** | ||||||||
14328329-C-A | 12207623-C-A | ** | ||||||||
14352646-C-A | 12231941-C-A | ** | ||||||||
14369130-T-C | 12248426-T-C | ** | ||||||||
14413095-T-A | 12292392-T-A | ** | ||||||||
14425035-A-C | 12304310-A-C | ** | ||||||||
14431071-G-T | 12310344-G-T | ** | ||||||||
14448263-A-T | 12327536-A-T | ** | ||||||||
14470529-C-A | 12349798-C-A | ** | ||||||||
14490274-G-C | 12369543-G-C | ** | ||||||||
14501232-T-G | 12389437-T-G | ** | ||||||||
14506065-A-G | 12394270-A-G | ** | ||||||||
14608045-G-T | 12496247-G-T | ** | ||||||||
14674071-G-A | 12562137-G-A | ** | ||||||||
14690199-T-C | 12578265-T-C | ** | ||||||||
14831808-C-A | 12719875-C-A | ** | ||||||||
14831812-C-A | 12719879-C-A | ** | ||||||||
15047823-C-A | 12935914-C-A | ** | ||||||||
15065940-C-A | 12954032-C-A | ** | ||||||||
15179288-C-A | 13067374-C-A | ** | ||||||||
15189572-C-A | 13077658-C-A | ** | ||||||||
15221261-T-A | 13109347-T-A | ** | ||||||||
15288044-A-G | 13176143-A-G | ** | ||||||||
15288109-G-A | 13176208-G-A | ** | ||||||||
15321302-G-A | 13209420-G-A | ** | ||||||||
15380442-T-A | 13268562-T-A | ** | ||||||||
15392247-C-A | 13280367-C-A | FT168917 | ** | |||||||
15397769-C-A | 13285889-C-A | ** | ||||||||
15424556-T-A | 13312676-T-A | ** | ||||||||
15424663-T-G | 13312783-T-G | ** | ||||||||
15432986-T-G | 13321106-T-G | ** | ||||||||
15446832-A-C | 13334952-A-C | ** | ||||||||
15593078-C-A | 13481198-C-A | ** | ||||||||
15631874-C-A | 13519994-C-A | ** | ||||||||
15655560-C-A | 13543680-C-A | ** | ||||||||
15728778-A-C | 13616898-A-C | ** | ||||||||
15731305-C-G | 13619425-C-G | ** | ||||||||
15746288-C-A | 13634408-C-A | ** | ||||||||
15761590-T-A | 13649710-T-A | ** | ||||||||
15763029-A-G | 13651149-A-G | ** | ||||||||
15791106-C-T | 13679226-C-T | ** | ||||||||
15901548-C-A | 13789668-C-A | ** | ||||||||
15927775-A-G | 13815895-A-G | ** | ||||||||
15932253-G-A | 13820373-G-A | ** | ||||||||
15963764-A-G | 13851884-A-G | ** | ||||||||
16037334-C-A | 13925454-C-A | ** | ||||||||
16037385-T-G | 13925505-T-G | ** | ||||||||
16059878-T-G | 13947998-T-G | ** | ||||||||
16059953-T-G | 13948073-T-G | ** | ||||||||
16085514-G-A | 13973634-G-A | ** | ||||||||
16244923-A-C | 14133043-A-C | ** | ||||||||
16342360-G-T | 14230480-G-T | ** | ||||||||
16394309-T-C | 14282429-T-C | ** | ||||||||
16417417-GT-G | 14305537-GT-G | ** | ||||||||
16624074-G-T | 14512194-G-T | ** | ||||||||
16719919-C-A | 14608039-C-A | ** | ||||||||
16727204-A-G | 14615324-A-G | ** | ||||||||
16727223-A-T | 14615343-A-T | ** | ||||||||
16765539-C-A | 14653659-C-A | ** | ||||||||
17029212-C-A | 14917332-C-A | ** | ||||||||
17032569-A-C | 14920689-A-C | ** | ||||||||
17032610-G-C | 14920730-G-C | ** | ||||||||
17084739-C-A | 14972859-C-A | ** | ||||||||
17213130-T-C | 15101250-T-C | ** | ||||||||
17213185-A-C | 15101305-A-C | ** | ||||||||
17222289-C-A | 15110409-C-A | ** | ||||||||
17228906-A-T | 15117026-A-T | ** | ||||||||
17284623-C-A | 15172743-C-A | FT423099 | ** | |||||||
17342841-A-C | 15230961-A-C | ** | ||||||||
17370915-A-T | 15259035-A-T | ** | ||||||||
17407583-C-A | 15295703-C-A | ** | ||||||||
17466954-G-C | 15355074-G-C | ** | ||||||||
17500486-C-T | 15388606-C-T | ** | ||||||||
17580946-G-T | 15469066-G-T | ** | ||||||||
17714836-C-A | 15602956-C-A | ** | ||||||||
17739916-C-T | 15628036-C-T | ** | ||||||||
17782498-G-T | 15670618-G-T | ** | ||||||||
17798869-C-A | 15686989-C-A | ** | ||||||||
17834445-T-A | 15722565-T-A | ** | ||||||||
17834453-T-C | 15722573-T-C | ** | ||||||||
17854363-A-T | 15742483-A-T | ** | ||||||||
17928903-C-A | 15817023-C-A | ** | ||||||||
17929133-G-T | 15817253-G-T | ** | ||||||||
18101904-T-C | 15990024-T-C | ** | ||||||||
18125610-C-A | 16013730-C-A | ** | ||||||||
18328820-G-T | 16216940-G-T | P6_Prx | ** | |||||||
18412392-A-T | 16300512-A-T | P6_Gap | ** | |||||||
18501376-T-TC | 16389496-T-TC | P6_Dst | ** | |||||||
18528121-G-T | 16416241-G-T | P6_Dst | ** | |||||||
18749363-A-G | 16637483-A-G | ** | ||||||||
19078974-A-C | 16967094-A-C | ** | ||||||||
19078982-C-A | 16967102-C-A | ** | ||||||||
19235679-T-G | 17123799-T-G | ** | ||||||||
19393182-C-A | 17281302-C-A | ** | ||||||||
19407606-C-CTTT | 17295726-C-CTTT | 17×T | ** | |||||||
19418204-A-T | 17306324-A-T | ** | ||||||||
19463365-C-G | 17351485-C-G | ** | ||||||||
19463587-T-C | 17351707-T-C | ** | ||||||||
19517327-C-A | 17405447-C-A | ** | ||||||||
19536836-G-C | 17424956-G-C | ** | ||||||||
19644659-C-A | 17532779-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
19681049-C-G | 17569169-C-G | P5_Prx | ** | |||||||
20003972-T-C | 17892092-T-C | P5_Prx | ** | |||||||
20440491-G-C | 18278605-G-C | P5_Dst | ** | |||||||
20493865-AT-A | 18331979-AT-A | P5_Dst | ** | |||||||
20569504-A-G | 18407618-A-G | P5_Dst | ** | |||||||
20682557-T-C | 18520671-T-C | P4_Prx | ** | |||||||
20832356-C-A | 18670470-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
21009209-T-TAG | 18847323-T-TAG | P4_Dst | ** | |||||||
21037320-C-A | 18875434-C-A | ** | ||||||||
21153891-A-G | 18992005-A-G | ** | ||||||||
21184525-G-A | 19022639-G-A | ** | ||||||||
21196549-C-A | 19034663-C-A | ** | ||||||||
21262678-C-A | 19100792-C-A | ** | ||||||||
21297714-C-A | 19135828-C-A | ** | ||||||||
21603938-C-A | 19442052-C-A | ** | ||||||||
21627073-C-A | 19465187-C-A | ** | ||||||||
21677110-G-T | 19515224-G-T | ** | ||||||||
21949999-A-T | 19788113-A-T | ** | ||||||||
21963790-C-A | 19801904-C-A | ** | ||||||||
21969522-C-G | 19807636-C-G | ** | ||||||||
22011485-G-A | 19849599-G-A | FTB1184 | ** | |||||||
22080717-C-A | 19918831-C-A | ** | ||||||||
22176373-C-A | 20014487-C-A | ** | ||||||||
22209163-T-G | 20047277-T-G | ** | ||||||||
22564838-T-A | 20402952-T-A | ** | ||||||||
22640412-A-T | 20478526-A-T | ** | ||||||||
22658959-C-A | 20497073-C-A | ** | ||||||||
22868984-A-T | 20707098-A-T | ** | ||||||||
22885956-A-G | 20724070-A-G | ** | ||||||||
23007786-T-C | 20845900-T-C | ** | ||||||||
23007791-T-C | 20845905-T-C | ** | ||||||||
23034454-C-G | 20872568-C-G | ** | ||||||||
23065591-G-A | 20903705-G-A | ** | ||||||||
23127670-T-C | 20965784-T-C | ** | ||||||||
23128567-C-A | 20966681-C-A | ** | ||||||||
23291341-C-A | 21129455-C-A | ** | ||||||||
23345829-C-T | 21183943-C-T | ** | ||||||||
23569136-C-A | 21407250-C-A | ** | ||||||||
23742209-T-C | 21580323-T-C | ** | ||||||||
23848267-G-T | 21686381-G-T | ** | ||||||||
23881803-C-T | 21719917-C-T | FGC76168 | ** | |||||||
24509386-C-A | 22363239-C-A | ** | ||||||||
24673279-A-T | 22527132-A-T | P3_b2 | ** | |||||||
25031184-G-T | 22885037-G-T | g1 | ** | |||||||
25031189-A-G | 22885042-A-G | g1 | ** | |||||||
26046095-C-A | 23899948-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26467195-G-T | 24321048-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
27484478-C-A | 25338331-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27862627-A-C | 25716480-A-C | P1_Y2 | ** | |||||||
28500267-C-A | 26354120-C-A | ** | ||||||||
28558706-A-C | 26412559-A-C | ** | ||||||||
28558737-T-C | 26412590-T-C | ** | ||||||||
28618275-A-C | 26472128-A-C | ** | ||||||||
28671283-T-C | 26525136-T-C | ** | ||||||||
28671290-T-C | 26525143-T-C | ** | ||||||||
28688433-T-A | 26542286-T-A | ** | ||||||||
28732915-T-G | 26586768-T-G | ** | ||||||||
28755127-T-G | 26608980-T-G | ** | ||||||||
28758099-C-A | 26611952-C-A | ** | ||||||||
28798480-G-T | 26652333-G-T | ** | ||||||||
28798877-A-G | 26652730-A-G | ** | ||||||||
56835920-A-T | ** | |||||||||
56843020-C-A | ** | |||||||||
56850135-G-C | ** | |||||||||
17231684-C-T | 15119804-C-T | ** | ||||||||
18343211-C-A | 16231331-C-A | P6_Prx | ** | |||||||
20689749-G-T | 18527863-G-T | P4_Prx | ** | |||||||
58981143-C-G | 56834996-C-G | *** | ||||||||
21549943-CTT-C | 19388057-CTT-C | 13×T | *** | |||||||
25110281-G-T | 22964134-G-T | g1 | *** | |||||||
58981825-CAA-C,CAATCAAT | 56835678-CAA-C,CAATCAAT | *** | ||||||||
16648115-GTT-G | 14536235-GTT-G | 29×T | *** | |||||||
22010480-G-A | 19848594-G-A | *** | ||||||||
14910798-AT-A,ATT | 12798865-AT-A,ATT | 21×T | *** | |||||||
14585828-G-T | 12474028-G-T | *** | ||||||||
10922013-C-A | *** | |||||||||
2979296-CTTTT-C | 3111255-CTTTT-C | 15×T | *** | |||||||
13226739-A-G | 11071063-A-G | *** | ||||||||
15108916-CTTT-C,CTT | 12997003-CTTT-C,CTT | 15×T | *** | |||||||
10795109-C-A | *** | |||||||||
11030183-C-G | *** | |||||||||
10693929-CATTCA-C,CATTCC | *** | |||||||||
13478180-C-A | 11322504-C-A | BY210355 | *** | |||||||
13478206-C-T | 11322530-C-T | *** | ||||||||
8221228-CTTT-C,CT | 8353187-CTTT-C,CT | 16×T | *** | |||||||
14065818-C-A | 11945112-C-A | *** | ||||||||
18984036-A-AT | 16872156-A-AT | 9×T | *** | |||||||
15439989-C-A | 13328109-C-A | *** | ||||||||
17004618-CAAAA-C | 14892738-CAAAA-C | 14×A | *** | |||||||
9028893-T-TAA | 9191284-T-TAA | 18×A | *** | |||||||
14607878-G-T | 12496080-G-T | *** | ||||||||
4108069-C-A | 4240028-C-A | *** | ||||||||
5243334-C-A | 5375293-C-A | *** | ||||||||
5603554-C-A | 5735513-C-A | *** | ||||||||
7081065-C-A | 7213024-C-A | *** | ||||||||
7095894-C-A | 7227853-C-A | *** | ||||||||
7360126-C-A | 7492085-C-A | *** | ||||||||
9516751-CT-C,CTT | 9679142-CT-C,CTT | 14×T | *** | |||||||
9516981-G-T | 9679372-G-T | *** | ||||||||
9936182-C-A | 10098573-C-A | *** | ||||||||
10632557-G-A | *** | |||||||||
10677528-G-C,T | *** | |||||||||
10869499-C-A | *** | |||||||||
10959123-C-T | *** | |||||||||
10959128-C-T | *** | |||||||||
10987964-C-A | *** | |||||||||
11030161-TCCAATCCAT-C,TTCCATTCAAT | *** | |||||||||
13543627-C-A | 11387951-C-A | *** | ||||||||
14219767-G-GAA | 12099061-G-GAA | 11×A | *** | |||||||
14458477-G-T | 12337750-G-T | *** | ||||||||
14803058-C-A | 12691129-C-A | *** | ||||||||
15126439-C-G | 13014526-C-G | *** | ||||||||
15616783-AT-A | 13504903-AT-A | *** | ||||||||
16044023-TC-T | 13932143-TC-T | *** | ||||||||
17923760-A-G | 15811880-A-G | *** | ||||||||
18987016-C-A | 16875136-C-A | A17015 | *** | |||||||
19007670-AT-A,ATT | 16895790-AT-A,ATT | 11×T | *** | |||||||
19050374-ACT-A,ATT | 16938494-ACT-A,ATT | *** | ||||||||
21994020-G-T | 19832134-G-T | *** | ||||||||
22538225-A-G | 20376339-A-G | *** | ||||||||
23056386-C-A | 20894500-C-A | *** | ||||||||
23252706-T-G | 21090820-T-G | *** | ||||||||
23360582-C-A | 21198696-C-A | *** | ||||||||
23415302-ATG-A | 21253416-ATG-A | *** | ||||||||
23564790-G-T | 21402904-G-T | 8×A | *** | |||||||
23577048-A-G | 21415162-A-G | *** | ||||||||
23773416-G-T | 21611530-G-T | *** | ||||||||
26440502-G-T | 24294355-G-T | P1_Y1 | *** | |||||||
28741326-C-A | 26595179-C-A | *** | ||||||||
56837261-A-G | *** | |||||||||
9029736-CT-C,CTT | 9192127-CT-C,CTT | 16×T | *** | |||||||
2649802-CAAAA-C,CA | 2781761-CAAAA-C,CA | 24×A | *** | |||||||
13478907-A-G | 11323231-A-G | *** | ||||||||
5519904-TT-T,TA | 5651863-TT-T,TA | *** | ||||||||
13898366-CAAA-C | 11777660-CAAA-C | 15×A | *** | |||||||
16768881-T-TA | 14657001-T-TA | *** | ||||||||
24491528-C-T | 22345381-C-T | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.