McDonald
FTDNA: B177505, BigY3: B177505, BigY2: B177505, YSEQ: 12016Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA B177505 | BigY3 B177505 | BigY2 B177505 | Manual Edits |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
22217231-T-A | 20055345-T-A | DYZ19 | *** | A+ | |||||||
56835362-A-G | A* | ||||||||||
56829703-C-T | A* | ||||||||||
13450439-C-A | 11294763-C-A | A* | |||||||||
20013353-G-A | 17901473-G-A | P5_Prx | *** | A* | A* | ||||||
58979508-C-T | 56833361-C-T | A* | |||||||||
58979477-C-G | 56833330-C-G | A* | |||||||||
22274655-T-A | 20112769-T-A | DYZ19 | *** | A* | A* | ||||||
13450444-C-A | 11294768-C-A | A* | |||||||||
24293817-G-A | 22147670-G-A | P3_t1 | *** | A* | A* | ||||||
56829602-A-T | A* | ||||||||||
56834462-C-T | A* | ||||||||||
26290770-G-A | 24144623-G-A | P1_Y1 | A* | ||||||||
4959526-CT-C | 5091485-CT-C | + | ** | ||||||||
14688758-C-G | 12576824-C-G | Y91957 | Y | + | ** | ||||||
17491143-A-C | 15379263-A-C | Y99306 | Y | Y | + | + | + | ||||
14801391-T-A | 12689462-T-A | Y92227 | Y | Y | + | + | + | ||||
23246257-C-G | 21084371-C-G | Y111067 | Y | Y | + | + | + | ||||
23761675-A-AAGAAGAAGC | 21599789-A-AAGAAGAAGC | * | |||||||||
23761675-A-C | 21599789-A-C | FGC13662 F3530 | Y | *** | * | ||||||
13941685-C-G | 11820979-C-G | ** | |||||||||
13597463-C-A | 11441787-C-A | FT92475 | ** | ||||||||
11658987-G-T | ** | ||||||||||
11662208-C-A | ** | ||||||||||
11675320-T-C | ** | ||||||||||
11677402-G-T | ** | ||||||||||
13870785-C-A | 11750079-C-A | ** | |||||||||
13880004-A-T | 11759298-A-T | ** | |||||||||
13949324-G-T | 11828618-G-T | ** | |||||||||
13881432-C-A | 11760726-C-A | ** | |||||||||
13888533-C-A | 11767827-C-A | ** | |||||||||
13596487-C-G | 11440811-C-G | ** | |||||||||
13893315-C-A | 11772609-C-A | ** | |||||||||
13972102-C-A | 11851396-C-A | ** | |||||||||
13902914-G-A | 11782208-G-A | ** | |||||||||
13596496-A-G | 11440820-A-G | ** | |||||||||
10984721-C-A | ** | ||||||||||
13583473-C-T | 11427797-C-T | ** | |||||||||
13280649-C-A | 11124973-C-A | ** | |||||||||
10984703-C-A | ** | ||||||||||
10985916-C-CTCATG | ** | ||||||||||
10992277-A-C | ** | ||||||||||
10995263-C-A | ** | ||||||||||
11008572-T-A | ** | ||||||||||
11016421-C-CCTCTACACTG | ** | ||||||||||
11016975-C-A | ** | ||||||||||
10981037-A-C | ** | ||||||||||
11031334-T-A | ** | ||||||||||
13287940-T-C | 11132264-T-C | ** | |||||||||
13582798-T-G | 11427122-T-G | ** | |||||||||
13301992-A-T | 11146316-A-T | ** | |||||||||
13424210-C-A | 11268534-C-A | ** | |||||||||
13502391-C-A | 11346715-C-A | ** | |||||||||
13512931-G-A | 11357255-G-A | ** | |||||||||
10975440-C-A | ** | ||||||||||
13561972-C-A | 11406296-C-A | ** | |||||||||
13565556-G-A | 11409880-G-A | ** | |||||||||
13574667-C-A | 11418991-C-A | ** | |||||||||
13577848-A-C | 11422172-A-C | ** | |||||||||
10984733-C-A | ** | ||||||||||
13522104-A-T | 11366428-A-T | ** | |||||||||
14159700-G-T | 12038994-G-T | ** | |||||||||
13986986-A-C | 11866280-A-C | ** | |||||||||
14990361-C-A | 12878446-C-A | ** | |||||||||
14678893-T-A | 12566959-T-A | ** | |||||||||
14679004-A-C | 12567070-A-C | ** | |||||||||
14715445-A-T | 12603512-A-T | ** | |||||||||
14727154-GT-G | 12615222-GT-G | ** | |||||||||
14756378-A-G | 12644447-A-G | ** | |||||||||
14764912-T-C | 12652981-T-C | ** | |||||||||
14765155-G-A | 12653224-G-A | ** | |||||||||
14965161-C-A | 12853236-C-A | ** | |||||||||
14992702-G-A | 12880787-G-A | ** | |||||||||
14670738-A-C | 12558804-A-C | ** | |||||||||
15011685-A-T | 12899773-A-T | ** | |||||||||
15073297-G-A | 12961387-G-A | ** | |||||||||
15127983-T-G | 13016070-T-G | ** | |||||||||
15168291-A-G | 13056377-A-G | ** | |||||||||
15201513-A-G | 13089599-A-G | ** | |||||||||
15430038-A-AAAT | 13318158-A-AAAT | 8×AAT | ** | ||||||||
15477287-G-A | 13365407-G-A | ** | |||||||||
15627128-G-T | 13515248-G-T | ** | |||||||||
15669842-C-A | 13557962-C-A | ** | |||||||||
14675073-G-T | 12563139-G-T | ** | |||||||||
14661001-T-C | 12549066-T-C | ** | |||||||||
14017190-T-C | 11896484-T-C | ** | |||||||||
14413068-G-T | 12292365-G-T | ** | |||||||||
14017206-G-T | 11896500-G-T | ** | |||||||||
14088986-A-T | 11968280-A-T | ** | |||||||||
14134659-C-G | 12013953-C-G | ** | |||||||||
10959198-C-A | ** | ||||||||||
14180636-C-G | 12059930-C-G | ** | |||||||||
14263403-G-T | 12142697-G-T | ** | |||||||||
14269780-G-T | 12149074-G-T | ** | |||||||||
14270738-C-A | 12150032-C-A | ** | |||||||||
14383534-G-T | 12262830-G-T | ** | |||||||||
14462606-A-T | 12341879-A-T | ** | |||||||||
14622804-T-A | 12511002-T-A | ** | |||||||||
14483360-G-T | 12362629-G-T | ** | |||||||||
14512099-C-A | 12400304-C-A | ** | |||||||||
14512217-A-G | 12400422-A-G | ** | |||||||||
14518397-G-A | 12406598-G-A | ** | |||||||||
14532163-T-C | 12420364-T-C | ** | |||||||||
14533261-G-A | 12421462-G-A | ** | |||||||||
14538744-A-C | 12426945-A-C | ** | |||||||||
14549295-G-A | 12437496-G-A | FT34410 | ** | ||||||||
14559281-C-A | 12447482-C-A | ** | |||||||||
10962898-C-CACTCA | ** | ||||||||||
10914157-A-T | ** | ||||||||||
10958482-A-T | ** | ||||||||||
8912926-T-C | 9044885-T-C | ** | |||||||||
8159562-T-A | 8291521-T-A | ** | |||||||||
8167150-A-C | 8299109-A-C | ** | |||||||||
8167154-C-A | 8299113-C-A | ** | |||||||||
8167180-G-T | 8299139-G-T | ** | |||||||||
8269985-T-A | 8401944-T-A | ** | |||||||||
8732200-T-A | 8864159-T-A | ** | |||||||||
8912841-C-A | 9044800-C-A | ** | |||||||||
8912919-A-T | 9044878-A-T | ** | |||||||||
8912942-G-T | 9044901-G-T | ** | |||||||||
7829536-C-A | 7961495-C-A | ** | |||||||||
9056681-A-G | ** | ||||||||||
8976943-A-T | 9139334-A-T | ** | |||||||||
8982925-T-C | 9145316-T-C | ** | |||||||||
9171206-G-A | 9333597-G-A | ** | |||||||||
9441294-T-A | 9603685-T-A | ** | |||||||||
9498551-T-G | 9660942-T-G | ** | |||||||||
9732916-TC-T | 9895307-TC-T | IR3_Prx | ** | ||||||||
9885351-T-A | 10047742-T-A | ** | |||||||||
9890310-T-G | 10052701-T-G | ** | |||||||||
8073367-G-T | 8205326-G-T | ** | |||||||||
7723987-G-C | 7855946-G-C | ** | |||||||||
9939590-G-T | 10101981-G-T | ** | |||||||||
7160893-A-C | 7292852-A-C | ** | |||||||||
6916112-A-C | 7048071-A-C | ** | |||||||||
6917204-G-T | 7049163-G-T | ** | |||||||||
6977480-C-A | 7109439-C-A | ** | |||||||||
7076358-A-G | 7208317-A-G | ** | |||||||||
7085453-A-T | 7217412-A-T | ** | |||||||||
7100253-C-A | 7232212-C-A | ** | |||||||||
7107023-A-G | 7238982-A-G | ** | |||||||||
7143302-G-A | 7275261-G-A | ** | |||||||||
7156328-A-C | 7288287-A-C | ** | |||||||||
7160915-C-A | 7292874-C-A | ** | |||||||||
7664718-T-C | 7796677-T-C | ** | |||||||||
7195221-C-A | 7327180-C-A | ** | |||||||||
7201541-C-T | 7333500-C-T | ** | |||||||||
7225555-G-T | 7357514-G-T | ** | |||||||||
7253792-G-T | 7385751-G-T | ** | |||||||||
7303144-C-A | 7435103-C-A | ** | |||||||||
7307956-C-A | 7439915-C-A | ** | |||||||||
7314457-T-G | 7446416-T-G | ** | |||||||||
7534607-G-A | 7666566-G-A | ** | |||||||||
7621820-C-A | 7753779-C-A | ** | |||||||||
9938539-A-C | 10100930-A-C | ** | |||||||||
9955626-C-A | 10118017-C-A | ** | |||||||||
10954220-C-A | ** | ||||||||||
10880466-C-A | ** | ||||||||||
10848785-T-C | ** | ||||||||||
10849136-C-A | ** | ||||||||||
10849680-C-A | ** | ||||||||||
10858750-C-A | ** | ||||||||||
10870471-C-A | ** | ||||||||||
10874520-C-A | ** | ||||||||||
10877969-C-T | ** | ||||||||||
10878076-ACT-A | ** | ||||||||||
10890249-A-G | ** | ||||||||||
10844037-C-A | ** | ||||||||||
10895946-C-G | ** | ||||||||||
10898407-T-C | ** | ||||||||||
15697001-A-T | 13585121-A-T | ** | |||||||||
10914159-A-G | ** | ||||||||||
10933117-T-A | ** | ||||||||||
10933500-A-C | ** | ||||||||||
10943807-C-A | ** | ||||||||||
10948461-C-T | ** | ||||||||||
10952966-A-G | ** | ||||||||||
10847174-G-T | ** | ||||||||||
10841993-C-A | ** | ||||||||||
9975177-A-C | 10137568-A-C | ** | |||||||||
10673292-C-G | ** | ||||||||||
9977387-C-A | 10139778-C-A | ** | |||||||||
10051387-C-A | 10213778-C-A | ** | |||||||||
10657496-T-C | ** | ||||||||||
10657647-C-A | ** | ||||||||||
10660144-T-A | ** | ||||||||||
10666435-C-A | ** | ||||||||||
10666662-T-C | ** | ||||||||||
10673267-T-A | ** | ||||||||||
10673288-T-A | ** | ||||||||||
10673307-T-A | ** | ||||||||||
10829206-T-C | ** | ||||||||||
10690930-C-A | ** | ||||||||||
10757430-C-A | ** | ||||||||||
10775595-T-A | ** | ||||||||||
10775967-T-C | ** | ||||||||||
10776675-T-A | ** | ||||||||||
10776692-C-G | ** | ||||||||||
10789292-A-G | ** | ||||||||||
10796304-G-T | ** | ||||||||||
10823474-C-A | ** | ||||||||||
15683625-T-A | 13571745-T-A | ** | |||||||||
16058924-C-A | 13947044-C-A | ** | |||||||||
15730724-C-T | 13618844-C-T | ** | |||||||||
23092632-G-T | 20930746-G-T | ** | |||||||||
22660981-C-T | 20499095-C-T | ** | |||||||||
22768123-T-G | 20606237-T-G | ** | |||||||||
22865302-C-A | 20703416-C-A | ** | |||||||||
23004777-T-C | 20842891-T-C | ** | |||||||||
23019575-G-T | 20857689-G-T | ** | |||||||||
23041261-A-G | 20879375-A-G | ** | |||||||||
23052475-C-A | 20890589-C-A | ** | |||||||||
23062357-C-T | 20900471-C-T | ** | |||||||||
23098772-G-C | 20936886-G-C | ** | |||||||||
22587841-C-A | 20425955-C-A | ** | |||||||||
23206863-A-T | 21044977-A-T | ** | |||||||||
23290274-T-G | 21128388-T-G | ** | |||||||||
23340195-C-A | 21178309-C-A | ** | |||||||||
23341671-C-G | 21179785-C-G | ** | |||||||||
23358735-C-T | 21196849-C-T | ** | |||||||||
23564694-G-T | 21402808-G-T | ** | |||||||||
23579332-G-T | 21417446-G-T | ** | |||||||||
23898705-C-A | 21736819-C-A | ** | |||||||||
23898729-C-A | 21736843-C-A | ** | |||||||||
22649419-C-A | 20487533-C-A | ** | |||||||||
22366257-A-C | 20204371-A-C | DYZ19 | ** | ||||||||
24389735-GTT-G | 22243588-GTT-G | 14×T | ** | ||||||||
21629570-C-A | 19467684-C-A | ** | |||||||||
20692890-C-T | 18531004-C-T | P4_Prx | ** | ||||||||
21248023-C-A | 19086137-C-A | ** | |||||||||
21268316-T-A | 19106430-T-A | ** | |||||||||
21391584-C-G | 19229698-C-G | ** | |||||||||
21475045-G-T | 19313159-G-T | ** | |||||||||
21488938-C-A | 19327052-C-A | ** | |||||||||
21540688-G-T | 19378802-G-T | ** | |||||||||
21584589-T-A | 19422703-T-A | ** | |||||||||
21848713-T-A | 19686827-T-A | ** | |||||||||
22235583-A-G | 20073697-A-G | DYZ19 | ** | ||||||||
21888749-A-G | 19726863-A-G | ** | |||||||||
21939716-C-A | 19777830-C-A | ** | |||||||||
21939873-G-T | 19777987-G-T | ** | |||||||||
22164534-T-C | 20002648-T-C | ** | |||||||||
22172812-T-G | 20010926-T-G | ** | |||||||||
22172814-T-G | 20010928-T-G | ** | |||||||||
22235550-C-T | 20073664-C-T | DYZ19 | ** | ||||||||
22235562-A-T | 20073676-A-T | DYZ19 | ** | ||||||||
22235569-T-A | 20073683-T-A | DYZ19 | ** | ||||||||
24259769-G-C | 22113622-G-C | P3_b1 | ** | ||||||||
24389955-T-A | 22243808-T-A | ** | |||||||||
20692885-C-A | 18530999-C-A | P4_Prx | ** | ||||||||
56854635-A-G | ** | ||||||||||
28591803-G-T | 26445656-G-T | ** | |||||||||
28620812-C-T | 26474665-C-T | ** | |||||||||
28644486-C-A | 26498339-C-A | ** | |||||||||
28700812-A-C | 26554665-A-C | ** | |||||||||
28754387-G-A | 26608240-G-A | ** | |||||||||
28763187-C-A | 26617040-C-A | ** | |||||||||
56749999-TCGA-T | ** | ||||||||||
56844899-C-A | ** | ||||||||||
56861831-A-ACAAAC | ** | ||||||||||
28591764-G-A | 26445617-G-A | ** | |||||||||
56871029-C-A | ** | ||||||||||
56874948-T-C | ** | ||||||||||
56880854-A-T | ** | ||||||||||
32426-G-A | ** | ||||||||||
5904031-CAAAAA-C | 6035990-CAAAAA-C | 27×A | ** | ||||||||
4415368-T-C | 4547327-T-C | ** | |||||||||
6269017-G-C | 6400976-G-C | IR3_Dst | ** | ||||||||
7318586-GGT-G | 7450545-GGT-G | ** | |||||||||
23881793-G-A | 21719907-G-A | ** | |||||||||
28591765-A-C | 26445618-A-C | ** | |||||||||
28585608-A-G | 26439461-A-G | ** | |||||||||
24389961-C-G | 22243814-C-G | ** | |||||||||
27035137-C-T | 24888990-C-T | P1_r4 | ** | ||||||||
24403278-G-T | 22257131-G-T | ** | |||||||||
24403910-A-C | 22257763-A-C | ** | |||||||||
24671183-C-G | 22525036-C-G | P3_b2 | ** | ||||||||
25819513-A-AG | 23673366-A-AG | P1_b3 | ** | ||||||||
25954226-G-T | 23808079-G-T | P1_Y1 | ** | ||||||||
25954344-T-G | 23808197-T-G | P1_Y1 | ** | ||||||||
25985432-T-TG | 23839285-T-TG | P1_Y1 | ** | ||||||||
25985443-G-T | 23839296-G-T | P1_Y1 | ** | ||||||||
27035110-C-T | 24888963-C-T | P1_r4 | ** | ||||||||
27484492-TTGTGTG-T | 25338345-TTGTGTG-T | P1_Y2 | 14×TG | ** | |||||||
28570488-C-G | 26424341-C-G | ** | |||||||||
27585940-A-G | 25439793-A-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
27641460-C-A | 25495313-C-A | P1_Y2 | ** | ||||||||
27974345-T-TC | 25828198-T-TC | P1_Y2 | ** | ||||||||
28332428-G-T | 26186281-G-T | P1_b4 | ** | ||||||||
28467054-C-A | 26320907-C-A | ** | |||||||||
28507332-TA-T | 26361185-TA-T | ** | |||||||||
28515474-C-T | 26369327-C-T | ** | |||||||||
28515497-T-A | 26369350-T-A | ** | |||||||||
28551812-G-T | 26405665-G-T | ** | |||||||||
20692886-A-C | 18531000-A-C | P4_Prx | ** | ||||||||
20692881-G-T | 18530995-G-T | P4_Prx | ** | ||||||||
15733572-G-C | 13621692-G-C | ** | |||||||||
17103642-G-A | 14991762-G-A | ** | |||||||||
16676708-T-A | 14564828-T-A | ** | |||||||||
16710248-G-C | 14598368-G-C | ** | |||||||||
16860743-TC-T | 14748863-TC-T | ** | |||||||||
16932084-C-A | 14820204-C-A | ** | |||||||||
16974306-G-A | 14862426-G-A | ** | |||||||||
17030856-A-G | 14918976-A-G | ** | |||||||||
17061692-C-A | 14949812-C-A | ** | |||||||||
17095398-A-G | 14983518-A-G | ** | |||||||||
17157574-T-A | 15045694-T-A | 10×A | ** | ||||||||
16621864-A-G | 14509984-A-G | ** | |||||||||
17181929-A-T | 15070049-A-T | ** | |||||||||
17181937-T-G | 15070057-T-G | ** | |||||||||
17181940-G-C | 15070060-G-C | ** | |||||||||
17229396-T-A | 15117516-T-A | ** | |||||||||
17264979-G-T | 15153099-G-T | ** | |||||||||
17317448-C-A | 15205568-C-A | ** | |||||||||
17440478-A-G | 15328598-A-G | ** | |||||||||
17449969-G-T | 15338089-G-T | ** | |||||||||
17450143-C-T | 15338263-C-T | ** | |||||||||
16665385-T-G | 14553505-T-G | ** | |||||||||
16573035-C-A | 14461155-C-A | ** | |||||||||
17480077-T-G | 15368197-T-G | ** | |||||||||
16177073-C-G | 14065193-C-G | ** | |||||||||
15733620-A-T | 13621740-A-T | ** | |||||||||
15777150-A-G | 13665270-A-G | ** | |||||||||
15943340-C-G | 13831460-C-G | ** | |||||||||
15987919-C-A | 13876039-C-A | ** | |||||||||
16020893-A-G | 13909013-A-G | ** | |||||||||
16023380-C-A | 13911500-C-A | ** | |||||||||
16058850-CTG-C | 13946970-CTG-C | ** | |||||||||
6771474-T-C | 6903433-T-C | ** | |||||||||
16094764-G-T | 13982884-G-T | ** | |||||||||
16351829-T-G | 14239949-T-G | ** | |||||||||
16550957-C-A | 14439077-C-A | ** | |||||||||
16351830-A-C | 14239950-A-C | ** | |||||||||
16351835-C-G | 14239955-C-G | ** | |||||||||
16351913-A-G | 14240033-A-G | ** | |||||||||
16356614-C-A | 14244734-C-A | ** | |||||||||
16422120-C-G | 14310240-C-G | ** | |||||||||
16423733-C-A | 14311853-C-A | ** | |||||||||
16462522-T-C | 14350642-T-C | ** | |||||||||
16462533-A-T | 14350653-A-T | ** | |||||||||
16503669-T-C | 14391789-T-C | ** | |||||||||
17453791-CT-C | 15341911-CT-C | 9×T | ** | ||||||||
17501473-G-A | 15389593-G-A | FGC40316 | ** | ||||||||
20692877-A-C | 18530991-A-C | P4_Prx | ** | ||||||||
18988342-A-C | 16876462-A-C | ** | |||||||||
18710377-C-A | 16598497-C-A | ** | |||||||||
18710393-A-G | 16598513-A-G | ** | |||||||||
18730736-G-T | 16618856-G-T | ** | |||||||||
18791630-A-G | 16679750-A-G | ** | |||||||||
18825652-G-A | 16713772-G-A | FT283278 | ** | ||||||||
18849178-G-T | 16737298-G-T | ** | |||||||||
18925314-TATTG-T | 16813434-TATTG-T | ** | |||||||||
18988288-C-A | 16876408-C-A | ** | |||||||||
18988457-A-T | 16876577-A-T | ** | |||||||||
18701778-T-G | 16589898-T-G | ** | |||||||||
19071856-A-G | 16959976-A-G | ** | |||||||||
19073735-C-A | 16961855-C-A | ** | |||||||||
19398214-A-G | 17286334-A-G | ** | |||||||||
19424063-G-T | 17312183-G-T | ** | |||||||||
19758750-T-C | 17646870-T-C | P5_Prx | ** | ||||||||
19758760-A-G | 17646880-A-G | P5_Prx | ** | ||||||||
20376683-C-A | 18214797-C-A | P5_Dst | ** | ||||||||
20574853-T-C | 18412967-T-C | P5_Dst | ** | ||||||||
20692864-T-TG | 18530978-T-TG | P4_Prx | ** | ||||||||
18707256-C-A | 16595376-C-A | ** | |||||||||
18577960-A-C | 16466080-A-C | ** | |||||||||
17523988-T-G | 15412108-T-G | ** | |||||||||
18121739-A-C | 16009859-A-C | 8×T | ** | ||||||||
17538252-G-T | 15426372-G-T | ** | |||||||||
17546068-G-T | 15434188-G-T | ** | |||||||||
17600583-TA-T | 15488703-TA-T | ** | |||||||||
17701528-TTTCTTGC-T | 15589648-TTTCTTGC-T | ** | |||||||||
17782553-T-A | 15670673-T-A | ** | |||||||||
17782559-G-C | 15670679-G-C | ** | |||||||||
17886004-T-G | 15774124-T-G | ** | |||||||||
17933719-C-A | 15821839-C-A | ** | |||||||||
18013953-C-CAT | 15902073-C-CAT | P7_Dst | ** | ||||||||
18159352-C-A | 16047472-C-A | ** | |||||||||
18577919-G-C | 16466039-G-C | ** | |||||||||
18183764-C-T | 16071884-C-T | ** | |||||||||
18185290-A-C | 16073410-A-C | ** | |||||||||
18211658-A-G | 16099778-A-G | ** | |||||||||
18218807-G-T | 16106927-G-T | ** | |||||||||
18280258-A-T | 16168378-A-T | P6_Prx | ** | ||||||||
18291004-C-A | 16179124-C-A | P6_Prx | ** | ||||||||
18355252-A-AG | 16243372-A-AG | P6_Prx | ** | ||||||||
18427775-C-A | 16315895-C-A | P6_Dst | ** | ||||||||
18541912-C-T | 16430032-C-T | ** | |||||||||
6807997-A-T | 6939956-A-T | ** | |||||||||
7296202-G-T | 7428161-G-T | ** | |||||||||
6722009-A-T | 6853968-A-T | ** | |||||||||
13222004-AG-A | 11066328-AG-A | ** | |||||||||
11674351-G-A | ** | ||||||||||
11038169-C-A | ** | ||||||||||
10971856-G-T | ** | ||||||||||
28612210-G-T | 26466063-G-T | ** | |||||||||
14371454-C-A | 12250750-C-A | ** | |||||||||
16860747-TGCA-T | 14748867-TGCA-T | ** | |||||||||
6516822-C-A | 6648781-C-A | ** | |||||||||
23198037-C-A | 21036151-C-A | ** | |||||||||
22240959-C-CA | 20079073-C-CA | DYZ19 | ** | ||||||||
13257498-C-A | 11101822-C-A | ** | |||||||||
27808426-A-G | 25662279-A-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
10900648-T-A | ** | ||||||||||
10874860-C-A | ** | ||||||||||
6096449-A-T | 6228408-A-T | FT121164 | ** | ||||||||
7723993-A-T | 7855952-A-T | ** | |||||||||
28514763-C-A | 26368616-C-A | ** | |||||||||
18194533-C-A | 16082653-C-A | FT365876 | ** | ||||||||
15622614-G-A | 13510734-G-A | ** | |||||||||
27585952-A-C | 25439805-A-C | P1_Y2 | ** | ||||||||
10982668-A-C | ** | ||||||||||
16092736-T-C | 13980856-T-C | Z13099 | ** | ||||||||
16091296-C-A | 13979416-C-A | ** | |||||||||
20252776-C-A | 18090890-C-A | P5_Dst | ** | ||||||||
26345795-C-A | 24199648-C-A | P1_Y1 | ** | ||||||||
59000777-T-G | 56854630-T-G | ** | |||||||||
20943478-T-TGC | 18781592-T-TGC | P4_Dst | ** | ||||||||
7160892-A-C | 7292851-A-C | ** | |||||||||
18194381-C-G | 16082501-C-G | MF1370 | ** | ||||||||
10983158-A-C | ** | ||||||||||
5471846-C-A | 5603805-C-A | ** | |||||||||
9991162-C-A | 10153553-C-A | ** | |||||||||
9088957-G-T | 9251348-G-T | ** | |||||||||
18194431-A-T | 16082551-A-T | ** | |||||||||
4388468-T-A | 4520427-T-A | ** | |||||||||
21617737-C-A | 19455851-C-A | ** | |||||||||
8172722-C-A | 8304681-C-A | ** | |||||||||
10825353-G-T | ** | ||||||||||
23098783-C-A | 20936897-C-A | ** | |||||||||
15952707-C-A | 13840827-C-A | ** | |||||||||
16602696-C-A | 14490816-C-A | ** | |||||||||
3424099-C-A | 3556058-C-A | ** | |||||||||
3232017-C-T | 3363976-C-T | ** | |||||||||
3005547-C-A | 3137506-C-A | ** | |||||||||
3033409-C-A | 3165368-C-A | ** | |||||||||
3055620-C-A | 3187579-C-A | ** | |||||||||
3075248-C-A | 3207207-C-A | ** | |||||||||
3078435-C-T | 3210394-C-T | ** | |||||||||
3170039-C-A | 3301998-C-A | ** | |||||||||
3195406-G-T | 3327365-G-T | ** | |||||||||
22205030-C-A | 20043144-C-A | PF4219 | ** | ** | |||||||
2853485-G-T | 2985444-G-T | ** | |||||||||
3262282-G-T | 3394241-G-T | ** | |||||||||
3267322-T-G | 3399281-T-G | ** | |||||||||
3340743-T-G | 3472702-T-G | ** | |||||||||
3347649-C-A | 3479608-C-A | ** | |||||||||
3396505-C-G | 3528464-C-G | ** | |||||||||
3396947-C-A | 3528906-C-A | ** | |||||||||
3400733-C-A | 3532692-C-A | ** | |||||||||
3420164-C-A | 3552123-C-A | ** | |||||||||
2947864-A-G | 3079823-A-G | ** | |||||||||
2853478-G-A | 2985437-G-A | ** | |||||||||
7195307-C-A | 7327266-C-A | 16×A | ** | ||||||||
3655081-C-G | 3787040-C-G | ** | |||||||||
6485707-ATG-A | 6617666-ATG-A | ** | |||||||||
26201116-T-TG | 24054969-T-TG | P1_Y1 | ** | ||||||||
10661956-C-A | ** | ||||||||||
4661690-TA-T | 4793649-TA-T | 10×A | ** | ||||||||
9351139-C-T | 9513530-C-T | ** | |||||||||
5470326-C-A | 5602285-C-A | FGC5805 | ** | ||||||||
15180166-G-T | 13068252-G-T | ** | |||||||||
15773959-C-A | 13662079-C-A | ** | |||||||||
2812883-G-T | 2944842-G-T | ** | |||||||||
6236144-A-AC | 6368103-A-AC | IR3_Dst | ** | ||||||||
27585941-C-T | 25439794-C-T | P1_Y2 | ** | ||||||||
18905343-C-A | 16793463-C-A | ** | |||||||||
13858361-A-G | 11737655-A-G | ** | |||||||||
14933554-A-T | 12821619-A-T | ** | |||||||||
9231778-C-A | 9394169-C-A | ** | |||||||||
16033547-C-A | 13921667-C-A | ** | |||||||||
3500555-C-A | 3632514-C-A | ** | |||||||||
19271580-T-G | 17159700-T-G | ** | |||||||||
15683615-C-G | 13571735-C-G | ** | |||||||||
3507190-G-T | 3639149-G-T | ** | |||||||||
2853475-A-C | 2985434-A-C | ** | |||||||||
22167213-T-A | 20005327-T-A | ** | |||||||||
13941686-A-T | 11820980-A-T | ** | |||||||||
14933549-G-T | 12821614-G-T | ** | |||||||||
18186261-C-A | 16074381-C-A | ** | |||||||||
25733078-G-T | 23586931-G-T | P1_b3 | ** | ||||||||
9732923-C-A | 9895314-C-A | IR3_Prx | ** | ||||||||
15671149-G-T | 13559269-G-T | ** | |||||||||
28714966-G-A | 26568819-G-A | ** | |||||||||
10770692-C-T | ** | ||||||||||
19758800-T-TA | 17646920-T-TA | P5_Prx | ** | ||||||||
10766127-C-T | ** | ||||||||||
10766132-C-T | ** | ||||||||||
10766133-A-T | ** | ||||||||||
10766142-T-C | ** | ||||||||||
10766152-C-T | ** | ||||||||||
24415718-TTATATATA-T | 22269571-TTATATATA-T | 31×TA | ** | ||||||||
11016429-T-C | ** | ||||||||||
24671177-T-G | 22525030-T-G | P3_b2 | ** | ||||||||
16164476-A-AC | 14052596-A-AC | P8_Dst | ** | ||||||||
6293383-G-T | 6425342-G-T | IR3_Dst | ** | ||||||||
21584110-G-T | 19422224-G-T | ** | |||||||||
17466766-C-A | 15354886-C-A | ** | ** | ||||||||
27585950-G-T | 25439803-G-T | P1_Y2 | ** | ||||||||
10766143-G-T | ** | ||||||||||
13695704-T-C | 11540028-T-C | *** | ** | ||||||||
18196273-G-T | 16084393-G-T | ** | |||||||||
21709158-A-AT | 19547272-A-AT | 10×T | ** | ||||||||
10768531-G-T | ** | ||||||||||
10777194-G-T | FGC78762 | FGC78762 | ** | ||||||||
4357446-C-A | 4489405-C-A | ** | |||||||||
23807565-C-G | 21645679-C-G | ** | |||||||||
14719599-T-A | 12607667-T-A | ** | |||||||||
4721267-C-A | 4853226-C-A | ** | |||||||||
7109446-C-A | 7241405-C-A | ** | |||||||||
14717602-G-T | 12605670-G-T | ** | |||||||||
27872567-GAC-G | 25726420-GAC-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
10652948-T-C | ** | ||||||||||
7240932-C-A | 7372891-C-A | ** | |||||||||
16071213-C-A | 13959333-C-A | ** | |||||||||
20796384-C-A | 18634498-C-A | P4_Prx | ** | ||||||||
19745037-C-G | 17633157-C-G | P5_Prx | ** | ||||||||
9732936-C-T | 9895327-C-T | IR3_Prx | ** | ||||||||
16428023-G-T | 14316143-G-T | ** | |||||||||
18086858-C-A | 15974978-C-A | ** | |||||||||
11016419-C-G | ** | ||||||||||
27872564-T-G | 25726417-T-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
28600983-ATTTT-A | 26454836-ATTTT-A | 17×T | ** | ||||||||
17130038-C-A | 15018158-C-A | ** | |||||||||
5926847-A-G | 6058806-A-G | FT18168 | ** | ||||||||
10958678-C-T | ** | ||||||||||
19286368-C-A | 17174488-C-A | ** | |||||||||
26073060-G-GTT | 23926913-G-GTT | P1_Y1 | ** | ||||||||
14986539-C-A | 12874607-C-A | ** | |||||||||
8333623-CCTACTT-C | 8465582-CCTACTT-C | ** | |||||||||
10766155-C-A | ** | ||||||||||
16429660-G-T | 14317780-G-T | ** | |||||||||
21425363-TA-T | 19263477-TA-T | ** | |||||||||
18407033-C-A | 16295153-C-A | P6_Gap | ** | ||||||||
23898727-C-A | 21736841-C-A | ** | |||||||||
10815797-C-A | ** | ||||||||||
28581157-C-A | 26435010-C-A | ** | |||||||||
7723976-G-A | 7855935-G-A | ** | |||||||||
8403271-GC-G | 8535230-GC-G | ** | |||||||||
13963334-C-A | 11842628-C-A | ** | |||||||||
15918465-C-A | 13806585-C-A | ** | |||||||||
21953535-CTTTT-C | 19791649-CTTTT-C | 15×T | ** | ||||||||
27808429-A-G | 25662282-A-G | P1_Y2 | ** | ||||||||
6756900-C-G | 6888859-C-G | ** | |||||||||
18710320-A-G | 16598440-A-G | ** | |||||||||
10745924-A-C | ** | ||||||||||
20252746-T-A | 18090860-T-A | P5_Dst | ** | ||||||||
22767465-C-A | 20605579-C-A | ** | |||||||||
15285778-C-A | 13173877-C-A | ** | |||||||||
14696980-C-A | 12585046-C-A | ** | |||||||||
6580058-GTT-G | 6712017-GTT-G | 14×T | ** | ||||||||
19415636-C-A | 17303756-C-A | ** | |||||||||
14765154-T-C | 12653223-T-C | ** | |||||||||
10974273-C-A | ** | ||||||||||
56763523-A-G | ** | ||||||||||
27915185-A-AC | 25769038-A-AC | P1_Y2 | ** | ||||||||
3452133-A-G | 3584092-A-G | ** | |||||||||
3248401-G-T | 3380360-G-T | ** | |||||||||
3514703-G-T | 3646662-G-T | ** | |||||||||
5287490-G-T | 5419449-G-T | ** | |||||||||
5122075-G-T | 5254034-G-T | ** | |||||||||
5125800-T-C | 5257759-T-C | ** | |||||||||
5151035-T-C | 5282994-T-C | ** | |||||||||
5186627-G-T | 5318586-G-T | ** | |||||||||
5214126-C-A | 5346085-C-A | ** | |||||||||
5222095-G-T | 5354054-G-T | ** | |||||||||
5222341-C-T | 5354300-C-T | ** | |||||||||
5287941-G-T | 5419900-G-T | ** | |||||||||
5101860-G-T | 5233819-G-T | ** | |||||||||
5308278-C-A | 5440237-C-A | ** | |||||||||
5376623-C-T | 5508582-C-T | ** | |||||||||
5415149-G-T | 5547108-G-T | ** | |||||||||
5470663-G-T | 5602622-G-T | FTA32 | ** | ||||||||
5507916-C-T | 5639875-C-T | ** | |||||||||
5560042-G-A | 5692001-G-A | ** | |||||||||
5597492-CCA-C | 5729451-CCA-C | ** | |||||||||
5121726-A-G | 5253685-A-G | ** | |||||||||
5081087-C-A | 5213046-C-A | ** | |||||||||
5605003-G-T | 5736962-G-T | ** | |||||||||
4890181-A-T | 5022140-A-T | ** | |||||||||
4804711-G-A | 4936670-G-A | ** | |||||||||
4805277-C-A | 4937236-C-A | ** | |||||||||
4805284-T-G | 4937243-T-G | ** | |||||||||
4805320-A-T | 4937279-A-T | ** | |||||||||
4805351-T-A | 4937310-T-A | ** | |||||||||
4835931-C-G | 4967890-C-G | ** | |||||||||
4888450-T-A | 5020409-T-A | ** | |||||||||
4898007-G-C | 5029966-G-C | ** | |||||||||
5045904-G-T | 5177863-G-T | ** | |||||||||
4900387-T-C | 5032346-T-C | ** | |||||||||
4926165-A-T | 5058124-A-T | ** | |||||||||
4937007-C-A | 5068966-C-A | ** | |||||||||
4959942-T-C | 5091901-T-C | ** | |||||||||
4976074-T-G | 5108033-T-G | ** | |||||||||
4999393-G-T | 5131352-G-T | ** | |||||||||
5033661-A-G | 5165620-A-G | ** | |||||||||
5040437-A-T | 5172396-A-T | ** | |||||||||
5597516-T-C | 5729475-T-C | ** | |||||||||
5620104-G-A | 5752063-G-A | ** | |||||||||
4729803-C-A | 4861762-C-A | ** | |||||||||
6471686-G-A | 6603645-G-A | ** | |||||||||
6120281-A-G | 6252240-A-G | ** | |||||||||
6205614-C-G | 6337573-C-G | IR3_Dst | ** | ||||||||
6236192-T-C | 6368151-T-C | IR3_Dst | ** | ||||||||
6289168-T-C | 6421127-T-C | IR3_Dst | ** | ||||||||
6445000-G-C | 6576959-G-C | ** | |||||||||
6457141-G-T | 6589100-G-T | ** | |||||||||
6460832-C-A | 6592791-C-A | ** | |||||||||
6473205-A-T | 6605164-A-T | ** | |||||||||
6026255-A-G | 6158214-A-G | ** | |||||||||
6481366-A-G | 6613325-A-G | ** | |||||||||
6492147-T-A | 6624106-T-A | ** | |||||||||
6505044-T-C | 6637003-T-C | ** | |||||||||
6587254-G-T | 6719213-G-T | ** | |||||||||
6603332-C-T | 6735291-C-T | ** | |||||||||
6694735-T-C | 6826694-T-C | ** | |||||||||
6721968-G-T | 6853927-G-T | ** | |||||||||
6032453-A-G | 6164412-A-G | ** | |||||||||
6026194-G-T | 6158153-G-T | ** | |||||||||
5661251-C-A | 5793210-C-A | ** | |||||||||
5763240-C-A | 5895199-C-A | ** | |||||||||
5682792-A-T | 5814751-A-T | ** | |||||||||
5682794-G-T | 5814753-G-T | ** | |||||||||
5682798-A-T | 5814757-A-T | ** | |||||||||
5682811-G-A | 5814770-G-A | 12×A | ** | ||||||||
5694298-C-A | 5826257-C-A | ** | |||||||||
5743761-C-A | 5875720-C-A | ** | |||||||||
5750459-A-T | 5882418-A-T | ** | |||||||||
5772998-A-G | 5904957-A-G | ** | |||||||||
6018684-G-T | 6150643-G-T | ** | |||||||||
5828079-G-T | 5960038-G-T | ** | |||||||||
5840586-G-T | 5972545-G-T | ** | |||||||||
5871938-C-A | 6003897-C-A | ** | |||||||||
5888477-A-C | 6020436-A-C | ** | |||||||||
5926852-G-T | 6058811-G-T | ** | |||||||||
5964196-T-G | 6096155-T-G | ** | |||||||||
5969127-T-C | 6101086-T-C | ** | |||||||||
6001945-C-A | 6133904-C-A | ** | |||||||||
4794508-A-G | 4926467-A-G | ** | |||||||||
4948333-T-C | 5080292-T-C | ** | |||||||||
4712494-T-A | 4844453-T-A | ** | |||||||||
3968974-A-G | 4100933-A-G | ** | |||||||||
3862961-C-A | 3994920-C-A | ** | |||||||||
3868488-GA-G | 4000447-GA-G | ** | |||||||||
3900298-C-A | 4032257-C-A | ** | |||||||||
3900334-A-T | 4032293-A-T | ** | |||||||||
3906168-G-T | 4038127-G-T | ** | |||||||||
3914116-TCA-T | 4046075-TCA-T | ** | |||||||||
3941512-C-T | 4073471-C-T | ** | |||||||||
3969094-T-C | 4101053-T-C | ** | |||||||||
3849245-C-A | 3981204-C-A | ** | |||||||||
3971363-G-C | 4103322-G-C | ** | |||||||||
4705158-C-A | 4837117-C-A | ** | |||||||||
3996053-T-G | 4128012-T-G | ** | |||||||||
4076256-C-A | 4208215-C-A | 21×A | ** | ||||||||
4076278-T-G | 4208237-T-G | ** | |||||||||
4076282-A-G | 4208241-A-G | ** | |||||||||
4083607-G-T | 4215566-G-T | ** | |||||||||
3858441-A-T | 3990400-A-T | ** | |||||||||
3833413-C-A | 3965372-C-A | ** | |||||||||
4115131-C-A | 4247090-C-A | ** | |||||||||
3656832-G-T | 3788791-G-T | ** | |||||||||
3528010-C-A | 3659969-C-A | ** | |||||||||
3549999-G-T | 3681958-G-T | ** | |||||||||
3550027-A-G | 3681986-A-G | ** | |||||||||
3596964-G-T | 3728923-G-T | ** | |||||||||
3628037-C-G | 3759996-C-G | ** | |||||||||
3629297-C-A | 3761256-C-A | ** | |||||||||
3656788-C-G | 3788747-C-G | ** | |||||||||
3656839-G-T | 3788798-G-T | ** | |||||||||
3831636-G-T | 3963595-G-T | ** | |||||||||
3656862-G-A | 3788821-G-A | ** | |||||||||
3684379-G-A | 3816338-G-A | ** | |||||||||
3700285-G-A | 3832244-G-A | ** | |||||||||
3700316-T-G | 3832275-T-G | ** | |||||||||
3727236-C-A | 3859195-C-A | ** | |||||||||
3792834-G-T | 3924793-G-T | ** | |||||||||
3821872-C-A | 3953831-C-A | ** | |||||||||
3830928-T-C | 3962887-T-C | ** | |||||||||
4083719-G-T | 4215678-G-T | ** | |||||||||
3977653-C-T | 4109612-C-T | ** | |||||||||
4129710-C-T | 4261669-C-T | ** | |||||||||
4597970-A-T | 4729929-A-T | ** | |||||||||
4439458-T-C | 4571417-T-C | ** | |||||||||
4439825-C-A | 4571784-C-A | ** | |||||||||
4461751-C-A | 4593710-C-A | ** | |||||||||
4189716-C-A | 4321675-C-A | ** | |||||||||
4483637-G-T | 4615596-G-T | ** | |||||||||
4509244-G-T | 4641203-G-T | ** | |||||||||
4561556-A-G | 4693515-A-G | ** | |||||||||
4598050-C-G | 4730009-C-G | ** | |||||||||
4417633-C-A | 4549592-C-A | ** | |||||||||
4635112-T-C | 4767071-T-C | ** | |||||||||
4679579-T-C | 4811538-T-C | ** | |||||||||
4679595-T-C | 4811554-T-C | ** | |||||||||
4679636-C-T | 4811595-C-T | ** | |||||||||
20533423-G-T | 18371537-G-T | P5_Dst | ** | ||||||||
4679646-A-G | 4811605-A-G | ** | |||||||||
4701306-T-G | 4833265-T-G | ** | |||||||||
4424250-G-A | 4556209-G-A | ** | |||||||||
9943801-A-C | 10106192-A-C | ** | |||||||||
4373102-T-C | 4505061-T-C | ** | |||||||||
4340868-G-T | 4472827-G-T | ** | |||||||||
4209319-T-G | 4341278-T-G | ** | |||||||||
4215436-A-T | 4347395-A-T | ** | |||||||||
19013820-G-A | 16901940-G-A | CTS9650 | ** | ** | |||||||
4353938-C-A | 4485897-C-A | ** | |||||||||
28580419-C-A | 26434272-C-A | *** | |||||||||
13456400-T-C | 11300724-T-C | *** | |||||||||
13456658-G-T | 11300982-G-T | *** | |||||||||
10022156-T-C | 10184547-T-C | FGC19274 | *** | ||||||||
13456420-C-A | 11300744-C-A | *** | |||||||||
13507041-T-A | 11351365-T-A | *** | |||||||||
22312054-C-A | 20150168-C-A | DYZ19 | *** | ||||||||
13991772-CT-C | 11871066-CT-C | 10×T | *** | ||||||||
15604354-CAAAAAAA-C | 13492474-CAAAAAAA-C | 20×A | *** | ||||||||
22661484-G-T | 20499598-G-T | *** | |||||||||
9799134-CAAA-C,CA | 9961525-CAAA-C,CA | 24×A | *** | ||||||||
28549917-C-A | 26403770-C-A | *** | |||||||||
5941911-G-A | 6073870-G-A | *** | |||||||||
10018623-TACTG-T,TATTG | 10181014-TACTG-T,TATTG | *** | |||||||||
13489621-CCCCACCACCACCCACCACCCCC-CCCCACACCCACCCCCAACTCCC,T | 11333945-CCCCACCACCACCCACCACCCCC-CCCCACACCCACCCCCAACTCCC,T | *** | |||||||||
18770067-T-A | 16658187-T-A | *** | |||||||||
16849790-A-G | 14737910-A-G | *** | |||||||||
2679438-C-A | 2811397-C-A | *** | |||||||||
13866159-G-A | 11745453-G-A | *** | |||||||||
13859765-G-A | 11739059-G-A | *** | |||||||||
13832264-G-GGAATAAAAAC | 11711558-G-GGAATAAAAAC | *** | |||||||||
13829586-G-A | 11708880-G-A | *** | |||||||||
14570756-ATTT-A,AT | 12458956-ATTT-A,AT | 22×T | *** | ||||||||
13851001-G-A | 11730295-G-A | *** | |||||||||
14785532-CT-C,CTT | 12673602-CT-C,CTT | 18×T | *** | ||||||||
13808515-A-C | 11687809-A-C | *** | |||||||||
13678316-G-C | 11522640-G-C | *** | |||||||||
13832298-C-G | 11711592-C-G | *** | |||||||||
15940520-CTTTT-C | 13828640-CTTTT-C | 12×T | *** | ||||||||
10017375-G-T | 10179766-G-T | *** | |||||||||
9945223-A-AT | 10107614-A-AT | *** | |||||||||
28591158-A-G | 26445011-A-G | *** | |||||||||
13832302-A-G | 11711596-A-G | *** | |||||||||
13832259-C-G | 11711553-C-G | *** | |||||||||
3424497-T-TA | 3556456-T-TA | 8×A | *** | ||||||||
15192691-T-C | 13080777-T-C | *** | |||||||||
16217897-T-C | 14106017-T-C | *** | |||||||||
3763439-CAA-C | 3895398-CAA-C | 10×A | *** | ||||||||
13809913-A-T | 11689207-A-T | *** | |||||||||
13814146-G-T | 11693440-G-T | *** | |||||||||
13507038-AGG-A | 11351362-AGG-A | *** | |||||||||
13947521-GA-G,GAA | 11826815-GA-G,GAA | 13×A | *** | ||||||||
13585800-A-G | 11430124-A-G | *** | |||||||||
13828665-CGAATG-C | 11707959-CGAATG-C | 4×GAATG | *** | ||||||||
15786564-G-T | 13674684-G-T | *** | |||||||||
22261722-G-A | 20099836-G-A | DYZ19 | *** | ||||||||
13319573-C-A | 11163897-C-A | *** | |||||||||
6731339-G-T | 6863298-G-T | *** | |||||||||
16620339-C-A | 14508459-C-A | *** | |||||||||
15658215-GTATA-G | 13546335-GTATA-G | *** | |||||||||
13208777-GA-G | *** | ||||||||||
10821952-T-C,G | *** | ||||||||||
14934306-CTTT-C,CTT | 12822371-CTTT-C,CTT | 15×T | *** | ||||||||
14735126-G-T | 12623194-G-T | *** | |||||||||
14425543-C-T | 12304818-C-T | *** | |||||||||
14232971-TC-T | 12112265-TC-T | *** | |||||||||
13885813-C-A | 11765107-C-A | *** | |||||||||
11672498-G-A | *** | ||||||||||
11654380-A-G | *** | ||||||||||
11650531-C-T | FT258101 | *** | |||||||||
4241767-C-T | 4373726-C-T | *** | |||||||||
16929604-C-A | 14817724-C-A | FGC70263 | *** | ||||||||
10974131-T-C | *** | ||||||||||
10935548-AC-AT,T | *** | ||||||||||
10914515-G-C | *** | ||||||||||
10821848-ACTCCG-A,AATCCA | *** | ||||||||||
10808079-T-C | *** | ||||||||||
10801727-CATTCC-C,GATTCT | *** | ||||||||||
4999165-T-C | 5131124-T-C | *** | |||||||||
10693088-C-A | *** | ||||||||||
9944757-C-A | 10107148-C-A | *** | |||||||||
5409700-C-A | 5541659-C-A | *** | |||||||||
9398095-T-C | 9560486-T-C | *** | |||||||||
9221697-A-ATATG | 9384088-A-ATATG | *** | |||||||||
7363441-C-T | 7495400-C-T | *** | |||||||||
13844484-C-T | 11723778-C-T | *** | |||||||||
10808085-C-A | *** | ||||||||||
10661434-G-T | *** | ||||||||||
22442591-TC-T | 20280705-TC-T | DYZ19 | *** | ||||||||
14286816-G-A | 12166110-G-A | *** | |||||||||
22451883-G-C | 20289997-G-C | DYZ19 | *** | ||||||||
25049552-C-T | 22903405-C-T | g1 | *** | ||||||||
23590742-G-A | 21428856-G-A | *** | |||||||||
10846061-C-A | *** | ||||||||||
23498080-ATT-A,AT | 21336194-ATT-A,AT | 19×T | *** | ||||||||
8970841-T-A | 9133232-T-A | *** | |||||||||
22797913-A-T | 20636027-A-T | *** | |||||||||
13485702-C-T | 11330026-C-T | *** | |||||||||
4740758-C-A | 4872717-C-A | *** | |||||||||
10846048-G-T | *** | ||||||||||
10918457-T-C | *** | ||||||||||
21579787-TA-T | 19417901-TA-T | *** | |||||||||
21189676-A-AG | 19027790-A-AG | *** | |||||||||
10846054-T-C | *** | ||||||||||
20326037-GCA-T,TTT | 18164151-GCA-T,TTT | P5_Dst | *** | ||||||||
10918462-T-C | *** | ||||||||||
19499034-G-A | 17387154-G-A | *** | |||||||||
23997570-C-A | 21851423-C-A | *** | |||||||||
21146269-A-T | 18984383-A-T | *** | |||||||||
10986912-C-T | *** | ||||||||||
18191349-A-T | 16079469-A-T | *** | |||||||||
18567990-T-A | 16456110-T-A | *** | |||||||||
18539184-G-T | 16427304-G-T | *** | |||||||||
21700595-GA-G,GAA | 19538709-GA-G,GAA | 17×A | *** | ||||||||
7768780-C-A | 7900739-C-A | *** | |||||||||
17319880-GAAGAAAGAAAGAAAGA-G,GAAGA | 15208000-GAAGAAAGAAAGAAAGA-G,GAAGA | 16×AAGA | *** | ||||||||
17264843-C-CTTATTATTA | 15152963-C-CTTATTATTA | 15×TTA | *** | ||||||||
10796228-GTTCCA-G | *** | ||||||||||
14473763-G-A | 12353032-G-A | *** | |||||||||
10918459-A-G | *** | ||||||||||
13800613-T-G | 11679907-T-G | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.
Mutation Notes:
Kit | POSITION-REF-ALT (hg19) | POSITION-REF-ALT (hg38) | Note |
---|---|---|---|
Manual | 13979841-G-A | 11859135-G-A | YSEQ test positive |
Age Analysis Information (work in progress)
All | McDonald | YFull | |
Kit: B177505 | 10884404 | 7915756 | 8008938 |
Kit: B177505 | 10057017 | 8112323 | 7960784 |
Kit: B177505 | 14795872 | 9272207 | 8243402 |
Used in age calculations | 14795872 | 9272207 | 8243402 |
Counts of SNPs | 4 | 4 |
Big Tree Main Page