Cahoo
FTDNA: 169776, BigY2: 169776, BigY3: 169776Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 169776 | BigY2 169776 | BigY3 169776 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
15881188-C-A | 13769308-C-A | Y | Y | A* | ||||||
4687108-G-A | 4819067-G-A | A* | ||||||||
15374592-C-T | 13262712-C-T | FT73843 | Y | Y | ** | + | ||||
18721740-T-A | 16609860-T-A | BY123418 | Y | Y | + | + | + | |||
22228541-G-T | 20066655-G-T | BY10351 | DYZ19 | + | + | + | ||||
22470264-G-A | 20308378-G-A | BY222386 | DYZ19 | + | + | |||||
22471760-G-A | 20309874-G-A | BY222652 | DYZ19 | + | + | |||||
10982027-A-ATCCAT | + | |||||||||
5328910-C-T | 5460869-C-T | FT73756 | + | |||||||
5424650-TTG-T | 5556609-TTG-T | + | ||||||||
10747333-A-G | FT429422 | + | ||||||||
8426377-G-GCTTCTTCTTCTTCTT | 8558336-G-GCTTCTTCTTCTTCTT | 22×CTT | *** | * | ||||||
18039398-C-T | 15927518-C-T | ** | ||||||||
3853378-A-G | 3985337-A-G | Z8543 | ** | |||||||
14685840-C-T | 12573906-C-T | CTS3151 | ** | ** | ||||||
5860975-C-A | 5992934-C-A | ** | ||||||||
13110016-G-A | 10599502-G-A | ** | ||||||||
22436879-C-A | 20274993-C-A | A5397 | BY46639 | DYZ19 | *** | ** | ||||
13228871-T-C | 11073195-T-C | ** | ||||||||
18956171-C-A | 16844291-C-A | Y103169 | ** | |||||||
22811905-C-G | 20650019-C-G | ** | ||||||||
17081288-AATAT-A | 14969408-AATAT-A | 11×AT | ** | |||||||
13205593-AAAAT-A | 11049917-AAAAT-A | ** | ||||||||
14331155-TTGC-T | 12210449-TTGC-T | ** | ||||||||
7534661-G-GA | 7666620-G-GA | ** | ||||||||
3112484-C-A | 3244443-C-A | ** | ||||||||
10866137-C-A | ** | |||||||||
10837907-C-A | ** | |||||||||
10892563-C-A | ** | |||||||||
11673216-C-A | ** | |||||||||
15748058-G-A | 13636178-G-A | ** | ||||||||
10762273-T-C | ** | |||||||||
18747102-C-T | 16635222-C-T | ** | ||||||||
18747144-ATT-A | 16635264-ATT-A | ** | ||||||||
17455942-C-A | 15344062-C-A | ** | ||||||||
15619417-C-A | 13507537-C-A | ** | ||||||||
15423453-C-G | 13311573-C-G | ** | ||||||||
22253230-A-T | 20091344-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
13273026-T-C | 11117350-T-C | ** | ||||||||
10669428-C-A | ** | |||||||||
3923257-C-A | 4055216-C-A | ** | ||||||||
7140997-C-A | 7272956-C-A | ** | ||||||||
10879707-C-A | ** | |||||||||
14490929-C-A | 12370198-C-A | ** | ||||||||
15655594-C-A | 13543714-C-A | ** | ||||||||
10937402-T-G | ** | |||||||||
17527342-A-G | 15415462-A-G | ** | ||||||||
15495259-C-A | 13383379-C-A | ** | ||||||||
17581864-A-G | 15469984-A-G | ** | ||||||||
13872120-C-A | 11751414-C-A | ** | ||||||||
11015242-C-T | ** | |||||||||
15288074-C-A | 13176173-C-A | ** | ||||||||
16336860-C-A | 14224980-C-A | ** | ||||||||
2730018-C-A | 2861977-C-A | ** | ||||||||
19544133-C-A | 17432253-C-A | ** | ||||||||
7383694-C-A | 7515653-C-A | ** | ||||||||
13631270-C-A | 11475594-C-A | ** | ||||||||
16826581-T-A | 14714701-T-A | ** | ||||||||
17355718-C-A | 15243838-C-A | ** | ||||||||
10892564-A-AG | ** | |||||||||
10892567-CC-G | ** | |||||||||
10892584-A-C | ** | |||||||||
10892587-C-A | ** | |||||||||
10892593-C-A | ** | |||||||||
8786732-T-C | 8918691-T-C | ** | ||||||||
23025228-G-A | 20863342-G-A | ** | ||||||||
5172158-C-A | 5304117-C-A | ** | ||||||||
15202255-C-A | 13090341-C-A | ** | ||||||||
5289030-C-CTT | 5420989-C-CTT | ** | ||||||||
15740847-C-A | 13628967-C-A | ** | ||||||||
7141880-C-A | 7273839-C-A | ** | ||||||||
10912060-C-A | ** | |||||||||
8481466-TTA-T | 8613425-TTA-T | ** | ||||||||
7255080-C-A | 7387039-C-A | ** | ||||||||
2790100-C-A | 2922059-C-A | ** | ||||||||
13888717-G-T | 11768011-G-T | ** | ||||||||
17735432-G-A | 15623552-G-A | ** | ||||||||
18483374-TAAAA-T | 16371494-TAAAA-T | P6_Dst | 27×A | ** | ||||||
3849273-C-A | 3981232-C-A | ** | ||||||||
56842321-C-A | ** | |||||||||
27523264-C-A | 25377117-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
18747046-C-T | 16635166-C-T | ** | ||||||||
5828962-C-A | 5960921-C-A | ** | ||||||||
14785525-C-A | 12673595-C-A | ** | ||||||||
11021319-C-A | ** | |||||||||
14613859-C-A | 12502057-C-A | ** | ||||||||
3550574-CAAAAA-C | 3682533-CAAAAA-C | 24×A | ** | |||||||
18747169-G-A | 16635289-G-A | ** | ||||||||
28530870-C-A | 26384723-C-A | ** | ||||||||
16351867-C-A | 14239987-C-A | ** | ||||||||
27007875-G-T | 24861728-G-T | P1_r4 | ** | |||||||
18747064-G-A | 16635184-G-A | FTB60758 | ** | |||||||
16037314-G-T | 13925434-G-T | ** | ||||||||
10779348-C-A | ** | |||||||||
5888133-C-A | 6020092-C-A | ** | ||||||||
16493116-G-T | 14381236-G-T | ** | ||||||||
10900165-C-A | ** | |||||||||
17367753-C-A | 15255873-C-A | ** | ||||||||
6955212-A-G | 7087171-A-G | ** | ||||||||
8746225-C-A | 8878184-C-A | ** | ||||||||
17548643-C-A | 15436763-C-A | ** | ||||||||
27596003-C-A | 25449856-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28506375-C-A | 26360228-C-A | ** | ||||||||
11013207-C-G | ** | |||||||||
10753040-T-C | ** | |||||||||
16492938-G-T | 14381058-G-T | ** | ||||||||
5449446-G-T | 5581405-G-T | ** | ||||||||
17629763-C-A | 15517883-C-A | ** | ||||||||
14554431-C-A | 12442632-C-A | ** | ||||||||
16479995-C-A | 14368115-C-A | ** | ||||||||
24877638-A-C | 22731491-A-C | g1 | ** | |||||||
4958273-G-T | 5090232-G-T | ** | ||||||||
5317569-G-T | 5449528-G-T | ** | ||||||||
11651685-G-T | ** | |||||||||
28591085-C-A | 26444938-C-A | ** | ||||||||
3610314-C-A | 3742273-C-A | ** | ||||||||
14357782-C-A | 12237077-C-A | ** | ||||||||
14425560-C-A | 12304835-C-A | ** | ||||||||
3599591-C-A | 3731550-C-A | ** | ||||||||
17211538-C-A | 15099658-C-A | ** | ||||||||
11015251-T-C | ** | |||||||||
7153001-C-A | 7284960-C-A | ** | ||||||||
22164444-A-G | 20002558-A-G | ** | ||||||||
15320736-C-A | 13208854-C-A | ** | ||||||||
22164435-T-C | 20002549-T-C | ** | ||||||||
18071655-C-A | 15959775-C-A | ** | ||||||||
10772378-C-A | ** | |||||||||
28722698-C-A | 26576551-C-A | ** | ||||||||
11675620-C-A | FT451366 | ** | ||||||||
11020859-C-A | ** | |||||||||
18728721-GAAA-G | 16616841-GAAA-G | 16×A | ** | |||||||
22811090-C-A | 20649204-C-A | ** | ||||||||
13228862-A-C | 11073186-A-C | ** | ||||||||
4571069-C-A | 4703028-C-A | 13×A | ** | |||||||
13486880-CTTTTT-C | 11331204-CTTTTT-C | 26×T | ** | |||||||
13567250-C-A | 11411574-C-A | ** | ||||||||
3112544-C-A | 3244503-C-A | ** | ||||||||
13495890-C-A | 11340214-C-A | ** | ||||||||
10904684-G-T | ** | |||||||||
16786236-C-T | 14674356-C-T | ** | ||||||||
21677326-C-A | 19515440-C-A | ** | ||||||||
24595279-G-T | 22449132-G-T | P3_t2 | ** | |||||||
14867092-CTTTTTT-C | 12755162-CTTTTTT-C | 17×T | ** | |||||||
14067200-C-A | 11946494-C-A | ** | ||||||||
15290175-C-A | 13178274-C-A | ** | ||||||||
16084242-C-A | 13972362-C-A | ** | ||||||||
8735292-C-A | 8867251-C-A | ** | ||||||||
14283833-G-C | 12163127-G-C | FT156998 | ** | |||||||
14283834-G-A | 12163128-G-A | ** | ||||||||
13324673-C-A | 11168997-C-A | ** | ||||||||
15742433-A-G | 13630553-A-G | ** | ||||||||
15231132-C-A | 13119218-C-A | ** | ||||||||
4897997-G-T | 5029956-G-T | ** | ||||||||
10671263-C-A | ** | |||||||||
14559319-C-A | 12447520-C-A | ** | ||||||||
10974643-C-A | ** | |||||||||
14926290-C-A | 12814355-C-A | ** | ||||||||
23199808-C-A | 21037922-C-A | ** | ||||||||
17513995-C-A | 15402115-C-A | ** | ||||||||
16445868-C-A | 14333988-C-A | ** | ||||||||
19132487-C-A | 17020607-C-A | ** | ||||||||
6384703-G-T | 6516662-G-T | ** | ||||||||
10875811-C-A | ** | |||||||||
26328836-G-T | 24182689-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
10653679-G-C | ** | |||||||||
14785531-ACTT-A | 12673601-ACTT-A | ** | ||||||||
10822069-C-A | ** | |||||||||
22882112-C-A | 20720226-C-A | ** | ||||||||
14931925-C-A | 12819990-C-A | ** | ||||||||
9442340-C-A | 9604731-C-A | ** | ||||||||
28479022-C-A | 26332875-C-A | ** | ||||||||
4067402-G-A | 4199361-G-A | ** | ||||||||
9987622-T-C | 10150013-T-C | ** | ||||||||
10993852-C-A | ** | |||||||||
17346262-C-A | 15234382-C-A | ** | ||||||||
17716872-C-A | 15604992-C-A | ** | ||||||||
17479125-C-A | 15367245-C-A | ** | ||||||||
4302495-T-A | 4434454-T-A | ** | ||||||||
5448787-C-A | 5580746-C-A | ** | ||||||||
10859647-C-T | ** | |||||||||
19066020-C-A | 16954140-C-A | ** | ||||||||
10023347-C-A | 10185738-C-A | ** | ||||||||
3229597-C-A | 3361556-C-A | ** | ||||||||
23459667-C-A | 21297781-C-A | ** | ||||||||
20801514-C-T | 18639628-C-T | P4_Prx | ** | |||||||
17175488-G-T | 15063608-G-T | ** | ||||||||
21100925-G-A | 18939039-G-A | ** | ||||||||
16663658-G-T | 14551778-G-T | ** | ||||||||
10855911-C-A | ** | |||||||||
5644538-C-A | 5776497-C-A | ** | ||||||||
21283093-C-A | 19121207-C-A | FT246867 | ** | |||||||
18708101-C-A | 16596221-C-A | ** | ||||||||
9967093-C-A | 10129484-C-A | ** | ||||||||
13960882-C-A | 11840176-C-A | ** | ||||||||
24876753-G-T | 22730606-G-T | g1 | ** | |||||||
56842306-C-A | ** | |||||||||
24241203-C-CAA | 22095056-C-CAA | P3_b1 | ** | |||||||
10990804-C-A | ** | |||||||||
5292838-C-A | 5424797-C-A | ** | ||||||||
2775500-C-A | 2907459-C-A | ** | ||||||||
2928236-A-G | 3060195-A-G | ** | ||||||||
2975613-C-A | 3107572-C-A | ** | ||||||||
3033899-T-A | 3165858-T-A | ** | ||||||||
3151355-G-A | 3283314-G-A | ** | ||||||||
3178112-C-A | 3310071-C-A | ** | ||||||||
3219249-G-T | 3351208-G-T | ** | ||||||||
3246385-T-C | 3378344-T-C | ** | ||||||||
3254036-T-A | 3385995-T-A | ** | ||||||||
3285838-CT-C | 3417797-CT-C | ** | ||||||||
3337787-C-A | 3469746-C-A | ** | ||||||||
3435723-C-A | 3567682-C-A | ** | ||||||||
3549605-C-T | 3681564-C-T | ** | ||||||||
3648704-C-A | 3780663-C-A | ** | ||||||||
3662734-C-A | 3794693-C-A | ** | ||||||||
3725705-A-G | 3857664-A-G | ** | ||||||||
3752226-G-T | 3884185-G-T | ** | ||||||||
3774981-A-G | 3906940-A-G | ** | ||||||||
3775031-C-T | 3906990-C-T | ** | ||||||||
3775229-G-C | 3907188-G-C | ** | ||||||||
3775309-T-C | 3907268-T-C | ** | ||||||||
3775324-A-T | 3907283-A-T | ** | ||||||||
3846780-G-A | 3978739-G-A | ** | ||||||||
3987945-T-A | 4119904-T-A | ** | ||||||||
4144473-C-A | 4276432-C-A | ** | ||||||||
4244952-G-C | 4376911-G-C | ** | ||||||||
4321820-C-A | 4453779-C-A | ** | ||||||||
4341839-A-G | 4473798-A-G | ** | ||||||||
4356995-T-C | 4488954-T-C | ** | ||||||||
4367116-G-A | 4499075-G-A | ** | ||||||||
4687530-T-G | 4819489-T-G | ** | ||||||||
4937070-T-C | 5069029-T-C | ** | ||||||||
4969235-C-A | 5101194-C-A | ** | ||||||||
4998922-CAA-C | 5130881-CAA-C | 12×A | ** | |||||||
4999689-C-A | 5131648-C-A | ** | ||||||||
5000539-C-A | 5132498-C-A | ** | ||||||||
5084713-A-ATT | 5216672-A-ATT | 10×T | ** | |||||||
5187488-C-A | 5319447-C-A | ** | ||||||||
5214692-C-A | 5346651-C-A | ** | ||||||||
5248967-C-A | 5380926-C-A | ** | ||||||||
5275499-T-C | 5407458-T-C | ** | ||||||||
5336074-C-A | 5468033-C-A | ** | ||||||||
5459129-A-G | 5591088-A-G | ** | ||||||||
5727139-T-C | 5859098-T-C | ** | ||||||||
5785693-ATCCTG-A | 5917652-ATCCTG-A | ** | ||||||||
5799734-G-A | 5931693-G-A | ** | ||||||||
5863065-C-A | 5995024-C-A | ** | ||||||||
5966381-A-C | 6098340-A-C | ** | ||||||||
5977042-T-C | 6109001-T-C | ** | ||||||||
6010502-C-A | 6142461-C-A | ** | ||||||||
6096125-T-C | 6228084-T-C | ** | ||||||||
6102431-C-A | 6234390-C-A | ** | ||||||||
6148034-C-A | 6279993-C-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6163593-GA-G | 6295552-GA-G | IR3_Dst | ** | |||||||
6369027-T-C | 6500986-T-C | ** | ||||||||
6582652-T-C | 6714611-T-C | ** | ||||||||
6619578-C-T | 6751537-C-T | ** | ||||||||
6688561-C-A | 6820520-C-A | ** | ||||||||
6807067-C-A | 6939026-C-A | ** | ||||||||
6830752-AT-A | 6962711-AT-A | ** | ||||||||
6882366-G-C | 7014325-G-C | ** | ||||||||
6922406-CAGG-C | 7054365-CAGG-C | ** | ||||||||
7019291-C-A | 7151250-C-A | ** | ||||||||
7091215-T-C | 7223174-T-C | ** | ||||||||
7115471-T-G | 7247430-T-G | ** | ||||||||
7162299-G-T | 7294258-G-T | ** | ||||||||
7209867-T-C | 7341826-T-C | FGC9520 | ** | |||||||
7285577-A-G | 7417536-A-G | ** | ||||||||
7364038-CT-C | 7495997-CT-C | ** | ||||||||
7381824-A-T | 7513783-A-T | ** | ||||||||
7390174-C-A | 7522133-C-A | ** | ||||||||
7444044-T-C | 7576003-T-C | ** | ||||||||
7582005-C-G | 7713964-C-G | ** | ||||||||
7590676-T-A | 7722635-T-A | ** | ||||||||
7664603-C-A | 7796562-C-A | FT426380 | ** | |||||||
7861563-T-C | 7993522-T-C | ** | ||||||||
7897279-A-T | 8029238-A-T | ** | ||||||||
8016610-G-C | 8148569-G-C | ** | ||||||||
8091809-T-C | 8223768-T-C | ** | ||||||||
8735174-T-C | 8867133-T-C | ** | ||||||||
8816954-G-T | 8948913-G-T | ** | ||||||||
8976848-T-C | 9139239-T-C | ** | ||||||||
9030389-GA-G | 9192780-GA-G | ** | ||||||||
9030396-A-G | 9192787-A-G | ** | ||||||||
9033002-G-T | 9195393-G-T | ** | ||||||||
9507917-G-T | 9670308-G-T | ** | ||||||||
9810776-C-A | 9973167-C-A | ** | ||||||||
9826105-AAC-A | 9988496-AAC-A | ** | ||||||||
9839495-C-A | 10001886-C-A | ** | ||||||||
9907449-T-C | 10069840-T-C | ** | ||||||||
9915015-C-A | 10077406-C-A | ** | ||||||||
9938495-T-G | 10100886-T-G | ** | ||||||||
9943647-T-A | 10106038-T-A | ** | ||||||||
10654544-C-T | ** | |||||||||
10669630-G-T | ** | |||||||||
10745905-G-A | ** | |||||||||
10758247-T-G | ** | |||||||||
10758310-A-T | ** | |||||||||
10760584-A-G | ** | |||||||||
10760817-C-A | ** | |||||||||
10775694-A-G | ** | |||||||||
10777758-C-A | ** | |||||||||
10783042-A-G | ** | |||||||||
10793647-C-A | ** | |||||||||
10830785-T-G | ** | |||||||||
10833931-T-C | ** | |||||||||
10848037-C-A | ** | |||||||||
10859633-T-C | ** | |||||||||
10867775-C-T | ** | |||||||||
10868933-C-T | ** | |||||||||
10888203-ACACC-A | ** | |||||||||
10889278-CAT-C | ** | |||||||||
10889281-TCCA-T | ** | |||||||||
10912440-G-A | ** | |||||||||
10920835-G-A | ** | |||||||||
10937431-AAT-A | ** | |||||||||
10940803-C-A | ** | |||||||||
10959451-C-A | ** | |||||||||
10980306-A-G | ** | |||||||||
10980312-C-G | ** | |||||||||
10990790-T-C | ** | |||||||||
10990818-G-A | ** | |||||||||
10990818-GATTGC-G | ** | |||||||||
10993822-C-A | ** | |||||||||
11008408-C-A | ** | |||||||||
11015206-A-T | ** | |||||||||
11015224-CCATCCATTT-C | ** | |||||||||
11015241-T-A | ** | |||||||||
11021369-C-A | ** | |||||||||
11021418-A-C | ** | |||||||||
11021667-C-A | ** | |||||||||
11038202-C-T | ** | |||||||||
13196663-G-A | 11040987-G-A | ** | ||||||||
13212712-G-A | 11057036-G-A | ** | ||||||||
13222103-A-G | 11066427-A-G | ** | ||||||||
13237645-T-C | 11081969-T-C | ** | ||||||||
13237969-C-A | 11082293-C-A | ** | ||||||||
13242865-T-G | 11087189-T-G | ** | ||||||||
13242868-T-G | 11087192-T-G | ** | ||||||||
13255153-G-A | 11099477-G-A | ** | ||||||||
13275275-AGCTGGG-A | 11119599-AGCTGGG-A | ** | ||||||||
13309517-C-A | 11153841-C-A | ** | ||||||||
13326060-T-TAA | 11170384-T-TAA | 14×A | ** | |||||||
11653781-G-T | ** | |||||||||
11663481-G-T | ** | |||||||||
11663721-GCAAGT-G | ** | |||||||||
11663736-T-G | ** | |||||||||
11663745-T-C | ** | |||||||||
11663747-A-G | ** | |||||||||
11663753-T-A | ** | |||||||||
13872844-A-T | 11752138-A-T | ** | ||||||||
13872844-A-AAC | 11752138-A-AAC | ** | ||||||||
13903089-G-T | 11782383-G-T | ** | ||||||||
14059240-A-G | 11938534-A-G | ** | ||||||||
14181533-A-C | 12060827-A-C | ** | ||||||||
14239382-A-G | 12118676-A-G | ** | ||||||||
14283816-AAG-A | 12163110-AAG-A | ** | ||||||||
14283825-A-G | 12163119-A-G | ** | ||||||||
14324486-A-T | 12203780-A-T | ** | ||||||||
14328091-C-A | 12207385-C-A | ** | ||||||||
14450376-AT-A | 12329649-AT-A | ** | ||||||||
12379301-T-A | ** | |||||||||
14518650-T-C | 12406851-T-C | ** | ||||||||
14552283-C-A | 12440484-C-A | ** | ||||||||
14564026-T-A | 12452226-T-A | ** | ||||||||
14685831-G-GACAA | 12573897-G-GACAA | ** | ||||||||
14685841-G-C | 12573907-G-C | ** | ||||||||
14685865-G-T | 12573931-G-T | ** | ||||||||
14685868-G-A | 12573934-G-A | ** | ||||||||
14685883-A-AC | 12573949-A-AC | ** | ||||||||
14761004-C-A | 12649073-C-A | ** | ||||||||
14761290-G-A | 12649359-G-A | BY14580 | ** | |||||||
14911990-C-A | 12800057-C-A | ** | ||||||||
14926304-A-G | 12814369-A-G | ** | ||||||||
15111557-A-T | 12999644-A-T | ** | ||||||||
15113676-G-A | 13001763-G-A | ** | ||||||||
15174786-A-G | 13062872-A-G | ** | ||||||||
15177961-CCA-C | 13066047-CCA-C | ** | ||||||||
15445482-C-G | 13333602-C-G | ** | ||||||||
15495249-G-A | 13383369-G-A | ** | ||||||||
15622498-T-A | 13510618-T-A | ** | ||||||||
15641674-C-A | 13529794-C-A | ** | ||||||||
15642985-T-A | 13531105-T-A | ** | ||||||||
15748045-C-G | 13636165-C-G | ** | ||||||||
15748057-T-A | 13636177-T-A | ** | ||||||||
15767288-C-A | 13655408-C-A | ** | ||||||||
15790321-C-G | 13678441-C-G | ** | ||||||||
15792966-C-T | 13681086-C-T | ** | ||||||||
15891083-A-C | 13779203-A-C | ** | ||||||||
15986558-T-C | 13874678-T-C | ** | ||||||||
16044115-A-G | 13932235-A-G | ** | ||||||||
16048438-A-G | 13936558-A-G | ** | ||||||||
16344521-TCTTCTTCTTCTC-T | 14232641-TCTTCTTCTTCTC-T | ** | ||||||||
16424708-T-A | 14312828-T-A | ** | ||||||||
16620129-C-G | 14508249-C-G | ** | ||||||||
16652201-C-A | 14540321-C-A | ** | ||||||||
16847946-G-T | 14736066-G-T | ** | ||||||||
16848027-G-T | 14736147-G-T | ** | ||||||||
16929581-T-C | 14817701-T-C | ** | ||||||||
17087037-C-A | 14975157-C-A | ** | ||||||||
17100479-C-A | 14988599-C-A | ** | ||||||||
17124600-A-AT | 15012720-A-AT | ** | ||||||||
17217151-C-T | 15105271-C-T | ** | ||||||||
17257353-C-A | 15145473-C-A | ** | ||||||||
17270641-A-G | 15158761-A-G | ** | ||||||||
17428385-G-A | 15316505-G-A | ** | ||||||||
17481100-C-A | 15369220-C-A | ** | ||||||||
17481104-A-G | 15369224-A-G | ** | ||||||||
17581859-T-C | 15469979-T-C | ** | ||||||||
17581860-G-A | 15469980-G-A | ** | ||||||||
17604941-T-C | 15493061-T-C | ** | ||||||||
17669716-T-A | 15557836-T-A | ** | ||||||||
17701819-G-A | 15589939-G-A | ** | ||||||||
17702552-G-T | 15590672-G-T | ** | ||||||||
17716949-A-G | 15605069-A-G | ** | ||||||||
17716993-T-G | 15605113-T-G | ** | ||||||||
17735414-C-T | 15623534-C-T | ** | ||||||||
17735416-A-T | 15623536-A-T | ** | ||||||||
17859894-A-T | 15748014-A-T | ** | ||||||||
17870901-T-G | 15759021-T-G | ** | ||||||||
17920941-CA-C | 15809061-CA-C | 45×A | ** | |||||||
17929624-T-C | 15817744-T-C | ** | ||||||||
18042929-G-A | 15931049-G-A | ** | ||||||||
18071727-T-A | 15959847-T-A | ** | ||||||||
18094154-T-C | 15982274-T-C | ** | ||||||||
18210983-G-A | 16099103-G-A | ** | ||||||||
18411974-C-T | 16300094-C-T | FTB82700 | P6_Gap | ** | ||||||
18579172-C-A | 16467292-C-A | ** | ||||||||
18626003-G-T | 16514123-G-T | ** | ||||||||
18645991-A-T | 16534111-A-T | ** | ||||||||
18661695-G-A | 16549815-G-A | ** | ||||||||
18747034-G-A | 16635154-G-A | ** | ||||||||
18747045-T-C | 16635165-T-C | ** | ||||||||
18747051-C-A | 16635171-C-A | ** | ||||||||
18747132-C-A | 16635252-C-A | ** | ||||||||
18747153-T-C | 16635273-T-C | ** | ||||||||
18747157-T-A | 16635277-T-A | ** | ||||||||
18795150-T-A | 16683270-T-A | ** | ||||||||
18951982-A-T | 16840102-A-T | ** | ||||||||
19053290-A-G | 16941410-A-G | ** | ||||||||
19112584-C-A | 17000704-C-A | ** | ||||||||
19303480-T-G | 17191600-T-G | ** | ||||||||
19531265-G-T | 17419385-G-T | ** | ||||||||
19531540-C-A | 17419660-C-A | ** | ||||||||
19544108-G-T | 17432228-G-T | ** | ||||||||
19609428-G-T | 17497548-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
19982170-G-A | 17870290-G-A | P5_Prx | ** | |||||||
19982174-C-A | 17870294-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
20025596-C-A | 17913716-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
20454476-T-G | 18292590-T-G | P5_Dst | ** | |||||||
20854380-A-G | 18692494-A-G | P4_Dst | ** | |||||||
21042896-C-A | 18881010-C-A | ** | ||||||||
21077130-T-A | 18915244-T-A | ** | ||||||||
21133413-C-A | 18971527-C-A | ** | ||||||||
21202321-G-T | 19040435-G-T | ** | ||||||||
21442951-T-C | 19281065-T-C | ** | ||||||||
21488748-A-T | 19326862-A-T | ** | ||||||||
21514055-G-A | 19352169-G-A | FT140478 | ** | |||||||
21583874-T-C | 19421988-T-C | ** | ||||||||
21602800-TG-T | 19440914-TG-T | ** | ||||||||
21789853-T-C | 19627967-T-C | ** | ||||||||
21966549-G-T | 19804663-G-T | 16×T | ** | |||||||
22165160-T-A | 20003274-T-A | ** | ||||||||
22170985-G-A | 20009099-G-A | ** | ||||||||
22214808-G-C | 20052922-G-C | ** | ||||||||
22325413-A-G | 20163527-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
22480631-A-T | 20318745-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
22517247-C-T | 20355361-C-T | ** | ||||||||
22651067-A-T | 20489181-A-T | ** | ||||||||
22651136-C-A | 20489250-C-A | ** | ||||||||
22996081-T-A | 20834195-T-A | ** | ||||||||
23056147-G-T | 20894261-G-T | ** | ||||||||
23186088-C-A | 21024202-C-A | ** | ||||||||
23188422-C-A | 21026536-C-A | ** | ||||||||
23260701-T-C | 21098815-T-C | ** | ||||||||
23438901-C-TT | 21277015-C-TT | ** | ||||||||
23997208-T-C | 21851061-T-C | ** | ||||||||
24349916-C-A | 22203769-C-A | P3_t1 | ** | |||||||
24404916-T-A | 22258769-T-A | ** | ||||||||
24407145-AT-A | 22260998-AT-A | ** | ||||||||
24407161-A-G | 22261014-A-G | ** | ||||||||
24668122-T-C | 22521975-T-C | P3_b2 | ** | |||||||
25533540-T-C | 23387393-T-C | P1_gr1 | ** | |||||||
25885944-T-A | 23739797-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26328842-G-C | 24182695-G-C | P1_Y1 | ** | |||||||
26971077-C-A | 24824930-C-A | P1_r4 | ** | |||||||
28478395-C-A | 26332248-C-A | ** | ||||||||
28598985-C-A | 26452838-C-A | ** | ||||||||
28625574-A-G | 26479427-A-G | ** | ||||||||
28645060-C-T | 26498913-C-T | ** | ||||||||
28654197-C-A | 26508050-C-A | ** | ||||||||
28655583-C-A | 26509436-C-A | ** | ||||||||
28660467-C-A | 26514320-C-A | ** | ||||||||
28665424-G-T | 26519277-G-T | ** | ||||||||
28734855-GT-G | 26588708-GT-G | ** | ||||||||
28750373-A-C | 26604226-A-C | ** | ||||||||
28755874-T-C | 26609727-T-C | ** | ||||||||
28763493-C-G | 26617346-C-G | ** | ||||||||
30186-T-C | ** | |||||||||
19839597-G-T | 17727717-G-T | P5_Prx | ** | |||||||
27546141-CTTTT-C | 25399994-CTTTT-C | P1_Y2 | 24×T | ** | ||||||
10599499-T-C | ** | |||||||||
22303426-G-A | 20141540-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
25993993-C-A | 23847846-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
27039129-G-T | 24892982-G-T | P1_r4 | ** | |||||||
22229731-T-C | 20067845-T-C | DYZ19 | *** | |||||||
22240994-C-G | 20079108-C-G | DYZ19 | *** | |||||||
14938018-C-T | 12826093-C-T | PR1645 | *** | |||||||
17187566-C-CA | 15075686-C-CA | 28×A | *** | |||||||
9852973-G-A | 10015364-G-A | *** | ||||||||
23128122-C-A | 20966236-C-A | FGC52998 | *** | |||||||
12943228-CAAA-C | 16×A | *** | ||||||||
13865659-C-A | 11744953-C-A | *** | ||||||||
23055126-C-A | 20893240-C-A | *** | ||||||||
23435746-C-A | 21273860-C-A | *** | ||||||||
10755898-C-A | *** | |||||||||
13468269-G-T | 11312593-G-T | *** | ||||||||
19531280-C-A | 17419400-C-A | *** | ||||||||
22170377-G-T | 20008491-G-T | *** | ||||||||
15405307-C-A | 13293427-C-A | *** | ||||||||
2721876-ATT-A,AT | 2853835-ATT-A,AT | 14×T | *** | |||||||
6644597-CTTT-C,CTT | 6776556-CTTT-C,CTT | 15×T | *** | |||||||
6916359-C-A | 7048318-C-A | *** | ||||||||
7610338-GT-G,GTT | 7742297-GT-G,GTT | 12×T | *** | |||||||
8291129-C-A | 8423088-C-A | *** | ||||||||
8437591-C-A | 8569550-C-A | *** | ||||||||
10887908-G-A | *** | |||||||||
13854353-G-T | 11733647-G-T | *** | ||||||||
14460639-C-A | 12339912-C-A | *** | ||||||||
14494614-T-C | 12382811-T-C | *** | ||||||||
14701077-T-C | 12589143-T-C | *** | ||||||||
16602915-C-A | 14491035-C-A | *** | ||||||||
17500721-A-G | 15388841-A-G | *** | ||||||||
18864918-C-A | 16753038-C-A | *** | ||||||||
21229947-C-A | 19068061-C-A | *** | ||||||||
24673165-G-A | 22527018-G-A | P3_b2 | *** | |||||||
10687314-A-G | *** | |||||||||
11009117-TC-T | *** | |||||||||
14727319-ATT-A,ATTT | 12615387-ATT-A,ATTT | 23×T | *** | |||||||
15290982-CTT-C,CT | 13179081-CTT-C,CT | 17×T | *** | |||||||
17250010-TAAA-T | 15138130-TAAA-T | 13×A | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.