McGuire
FTDNA: N109246, BigY2: N109246, BigY3: N109246Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA N109246 | BigY2 N109246 | BigY3 N109246 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
3923867-G-A | 4055826-G-A | A* | ||||||||
17992855-T-C | 15880975-T-C | P7_Prx | Y | *** | A* | A* | ||||
13452628-G-A | 11296952-G-A | A* | ||||||||
4544826-C-CA | 4676785-C-CA | 13×A | A* | |||||||
22286179-G-T | 20124293-G-T | DYZ19 | A* | |||||||
4096419-A-AT | 4228378-A-AT | 10×T | A* | |||||||
56827367-G-C | A* | |||||||||
56870986-G-T | A* | |||||||||
2791295-A-C | 2923254-A-C | PR101 | ** | |||||||
7188368-C-A | 7320327-C-A | ** | ** | |||||||
17859336-C-T | 15747456-C-T | CTS8171 | ** | |||||||
6465467-A-C | 6597426-A-C | ** | ||||||||
19330394-A-T | 17218514-A-T | CTS10220 Z1344 | ** | ** | ||||||
24046564-G-T | 21900417-G-T | PR4021 | ** | |||||||
16522342-G-C | 14410462-G-C | ** | ||||||||
22432190-A-T | 20270304-A-T | DYZ19 | ** | |||||||
6992552-TC-T | 7124511-TC-T | ** | ||||||||
13870644-G-A | 11749938-G-A | FGC37974 | ** | |||||||
13889472-C-T | 11768766-C-T | ** | ||||||||
22432198-A-G | 20270312-A-G | DYZ19 | ** | |||||||
23062215-C-T | 20900329-C-T | Z13843 | ** | |||||||
26046002-CT-C | 23899855-CT-C | P1_Y1 | 13×T | ** | ||||||
5393294-GGAAGAA-G | 5525253-GGAAGAA-G | 10×GAA | ** | |||||||
24415718-TTATATA-T | 22269571-TTATATA-T | 31×TA | ** | |||||||
20692958-C-T | 18531072-C-T | P4_Prx | ** | |||||||
6892288-C-A | 7024247-C-A | ** | ||||||||
22432155-G-A | 20270269-G-A | DYZ19 | ** | |||||||
13866184-A-G | 11745478-A-G | ** | ||||||||
58891018-T-C | 56699853-A-G | ** | ||||||||
58891025-C-G | 56699846-G-C | ** | ||||||||
15180212-G-T | 13068298-G-T | ** | ||||||||
20332015-T-A | 18170129-T-A | P5_Dst | ** | |||||||
15927111-C-A | 13815231-C-A | ** | ||||||||
19318178-C-T | 17206298-C-T | 28×T | ** | |||||||
15890344-T-A | 13778464-T-A | ** | ||||||||
10748113-C-A | ** | |||||||||
7135408-T-G | 7267367-T-G | ** | ||||||||
16989967-A-G | 14878087-A-G | ** | ||||||||
12450522-CTT-C | 41×T | ** | ||||||||
9830601-C-A | 9992992-C-A | ** | ||||||||
11017398-C-A | ** | |||||||||
11018773-TCTCCA-T | ** | |||||||||
24456023-T-G | 22309876-T-G | ** | ||||||||
23048342-C-T | 20886456-C-T | ** | ||||||||
59006761-A-T | 56860614-A-T | ** | ||||||||
10949186-G-T | ** | |||||||||
7664291-C-A | 7796250-C-A | FT167463 | ** | |||||||
16938209-C-A | 14826329-C-A | ** | ||||||||
5215783-C-A | 5347742-C-A | ** | ||||||||
20579347-C-T | 18417461-C-T | P5_Dst | ** | |||||||
10958848-A-C | ** | |||||||||
9666614-T-A | 9829005-T-A | IR3_Prx | ** | |||||||
10682690-C-A | ** | |||||||||
10950303-A-T | ** | |||||||||
10950304-T-C | ** | |||||||||
11017258-G-C | ** | |||||||||
11017263-C-T | ** | |||||||||
23047616-C-A | 20885730-C-A | ** | ||||||||
25932822-T-A | 23786675-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
14387711-C-A | 12267007-C-A | ** | ||||||||
9957970-C-A | 10120361-C-A | ** | ||||||||
17135824-C-A | 15023944-C-A | ** | ||||||||
10975765-C-G | ** | |||||||||
10975774-T-A | ** | |||||||||
10975778-T-G | ** | |||||||||
15380060-G-T | 13268180-G-T | ** | ||||||||
56839862-A-G | ** | |||||||||
24637405-T-TC | 22491258-T-TC | P3_t2 | ** | |||||||
6626855-C-A | 6758814-C-A | ** | ||||||||
10789062-TTCCAC-T | ** | |||||||||
14356407-C-CT | 12235702-C-CT | 10×T | ** | |||||||
19415689-C-A | 17303809-C-A | ** | ||||||||
18565030-C-A | 16453150-C-A | ** | ||||||||
19529203-T-C | 17417323-T-C | ** | ||||||||
14529206-C-A | 12417407-C-A | ** | ||||||||
20570242-C-A | 18408356-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
10929122-T-A | ** | |||||||||
10929123-G-T | ** | |||||||||
10929140-C-A | ** | |||||||||
10929150-T-C | ** | |||||||||
10929153-C-CA | ** | |||||||||
10929161-C-T | ** | |||||||||
4871853-C-A | 5003812-C-A | ** | ||||||||
14538009-CA-C | 12426210-CA-C | 9×A | ** | |||||||
23434314-C-A | 21272428-C-A | ** | ||||||||
10678615-T-C | ** | |||||||||
20920782-C-A | 18758896-C-A | P4_Dst | ** | |||||||
17675562-G-A | 15563682-G-A | ** | ||||||||
14352916-C-A | 12232211-C-A | ** | ||||||||
10678596-T-C | ** | |||||||||
11026065-C-G | ** | |||||||||
10032868-C-A | 10195259-C-A | ** | ||||||||
15844818-C-A | 13732938-C-A | ** | ||||||||
10754727-T-G | ** | |||||||||
10958818-C-T | ** | |||||||||
18858611-GAAA-G | 16746731-GAAA-G | 14×A | ** | |||||||
14566598-C-A | 12454798-C-A | ** | ||||||||
10843958-C-A | FT433742 | ** | ||||||||
10989569-T-A | ** | |||||||||
21709191-C-T | 19547305-C-T | ** | ||||||||
11001556-C-T | ** | |||||||||
5966275-C-A | 6098234-C-A | ** | ||||||||
10929178-G-A | ** | |||||||||
10929181-G-C | ** | |||||||||
10929198-C-A | ** | |||||||||
13798673-G-T | 11677967-G-T | ** | ||||||||
10024307-C-A | 10186698-C-A | ** | ||||||||
22263870-G-T | 20101984-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
17950825-A-T | 15838945-A-T | FTB11909 | 27×AT | ** | ||||||
18636703-C-A | 16524823-C-A | ** | ||||||||
10929118-A-C | ** | |||||||||
10929168-A-T | ** | |||||||||
10929171-C-CCA | ** | |||||||||
10929185-T-A | ** | |||||||||
10929186-C-T | ** | |||||||||
10929194-C-G | ** | |||||||||
17440473-C-A | 15328593-C-A | ** | ||||||||
13460971-A-T | 11305295-A-T | ** | ||||||||
13461001-A-G | 11305325-A-G | ** | ||||||||
11036155-C-A | ** | |||||||||
9996089-C-A | 10158480-C-A | ** | ||||||||
10996092-T-A | ** | |||||||||
9852758-C-A | 10015149-C-A | ** | ||||||||
18749357-C-A | 16637477-C-A | ** | ||||||||
15070411-C-A | 12958502-C-A | FT180233 | ** | |||||||
5274191-C-CA | 5406150-C-CA | 9×A | ** | |||||||
18042773-C-A | 15930893-C-A | ** | ||||||||
10828731-T-A | ** | |||||||||
10828759-C-G | ** | |||||||||
17928949-C-A | 15817069-C-A | ** | ||||||||
10682696-T-C | ** | |||||||||
3592590-C-A | 3724549-C-A | ** | ||||||||
6491461-C-A | 6623420-C-A | ** | ||||||||
14046756-C-A | 11926050-C-A | ** | ||||||||
19377142-G-A | 17265262-G-A | ** | ||||||||
21379878-C-A | 19217992-C-A | ** | ||||||||
20579309-TAC-T | 18417423-TAC-T | P5_Dst | ** | |||||||
9732895-C-CAA | 9895286-C-CAA | IR3_Prx | 20×A | ** | ||||||
7422407-C-A | 7554366-C-A | ** | ||||||||
19330390-A-C | 17218510-A-C | ** | ||||||||
11036172-C-T | ** | |||||||||
14755770-C-A | 12643839-C-A | ** | ||||||||
4580626-C-A | 4712585-C-A | ** | ||||||||
13253396-GT-G | 11097720-GT-G | 12×T | ** | |||||||
13866182-C-A | 11745476-C-A | ** | ||||||||
18390071-C-A | 16278191-C-A | P6_Gap | ** | |||||||
10939006-C-A | ** | |||||||||
16040967-A-ATT | 13929087-A-ATT | 14×T | ** | |||||||
10961407-A-T | ** | |||||||||
21281622-C-A | 19119736-C-A | ** | ||||||||
10796634-T-C | FT431600 | ** | ||||||||
16033534-C-A | 13921654-C-A | ** | ||||||||
19330404-A-G | 17218524-A-G | ** | ||||||||
16829205-C-T | 14717325-C-T | ** | ||||||||
13213245-C-A | 11057569-C-A | ** | ||||||||
11649215-C-A | ** | |||||||||
5710027-C-A | 5841986-C-A | ** | ||||||||
22880778-C-A | 20718892-C-A | ** | ||||||||
10782703-C-A | ** | |||||||||
19701525-C-A | 17589645-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
17159020-A-G | 15047140-A-G | ** | ||||||||
18006577-C-A | 15894697-C-A | P7_Gap | ** | |||||||
18997143-C-A | 16885263-C-A | ** | ||||||||
17103394-G-T | 14991514-G-T | ** | ||||||||
2729648-CTTTT-C | 2861607-CTTTT-C | 25×T | ** | |||||||
19155529-G-T | 17043649-G-T | ** | ||||||||
15495167-C-CAA | 13383287-C-CAA | 14×A | ** | |||||||
10996071-G-C | ** | |||||||||
14203430-CAAAA-C | 12082724-CAAAA-C | 23×A | ** | |||||||
11651219-C-A | ** | |||||||||
17074637-G-GTT | 14962757-G-GTT | 34×T | ** | |||||||
5937301-C-A | 6069260-C-A | ** | ||||||||
13710031-A-G | 11554355-A-G | ** | ||||||||
13234963-C-A | 11079287-C-A | ** | ||||||||
14501779-C-G | 12389984-C-G | ** | ||||||||
14501796-G-A | 12390001-G-A | FTB6843 | ** | |||||||
14531311-C-A | 12419512-C-A | ** | ||||||||
2665521-A-T | 2797480-A-T | ** | ||||||||
2833348-A-AT | 2965307-A-AT | 9×T | ** | |||||||
2977745-C-A | 3109704-C-A | ** | ||||||||
2981493-T-C | 3113452-T-C | ** | ||||||||
2985978-C-A | 3117937-C-A | ** | ||||||||
3091974-G-C | 3223933-G-C | ** | ||||||||
3111642-T-A | 3243601-T-A | ** | ||||||||
3186690-C-A | 3318649-C-A | ** | ||||||||
3275309-G-T | 3407268-G-T | ** | ||||||||
3275475-T-A | 3407434-T-A | ** | ||||||||
3308749-G-T | 3440708-G-T | ** | ||||||||
3344961-G-T | 3476920-G-T | ** | ||||||||
3347642-A-T | 3479601-A-T | ** | ||||||||
3347717-C-A | 3479676-C-A | ** | ||||||||
3385182-T-G | 3517141-T-G | ** | ||||||||
3463747-C-A | 3595706-C-A | ** | ||||||||
3515774-G-T | 3647733-G-T | ** | ||||||||
3515857-G-C | 3647816-G-C | ** | ||||||||
3550574-CAAAAA-C | 3682533-CAAAAA-C | 24×A | ** | |||||||
3560533-A-G | 3692492-A-G | ** | ||||||||
3560545-C-T | 3692504-C-T | ** | ||||||||
3626449-C-A | 3758408-C-A | ** | ||||||||
3650624-G-T | 3782583-G-T | ** | ||||||||
3732001-C-A | 3863960-C-A | ** | ||||||||
3851637-C-A | 3983596-C-A | ** | ||||||||
3851752-C-A | 3983711-C-A | ** | ||||||||
3995201-C-A | 4127160-C-A | ** | ||||||||
4063150-C-A | 4195109-C-A | ** | ||||||||
4144228-T-C | 4276187-T-C | ** | ||||||||
4145348-A-G | 4277307-A-G | ** | ||||||||
4370772-G-T | 4502731-G-T | ** | ||||||||
4372030-C-A | 4503989-C-A | ** | ||||||||
4418341-C-A | 4550300-C-A | ** | ||||||||
4429875-T-C | 4561834-T-C | ** | ||||||||
4429878-T-C | 4561837-T-C | ** | ||||||||
4429891-T-G | 4561850-T-G | ** | ||||||||
4544514-C-A | 4676473-C-A | ** | ||||||||
4659097-C-A | 4791056-C-A | ** | ||||||||
4672308-C-A | 4804267-C-A | ** | ||||||||
4685094-G-C | 4817053-G-C | ** | ||||||||
4702960-C-A | 4834919-C-A | ** | ||||||||
4838016-AAC-A | 4969975-AAC-A | ** | ||||||||
4857978-T-C | 4989937-T-C | ** | ||||||||
5021966-C-A | 5153925-C-A | ** | ||||||||
5078079-G-T | 5210038-G-T | ** | ||||||||
5091041-C-A | 5223000-C-A | ** | ||||||||
5107982-C-A | 5239941-C-A | ** | ||||||||
5126177-G-A | 5258136-G-A | ** | ||||||||
5186527-G-T | 5318486-G-T | ** | ||||||||
5231170-C-A | 5363129-C-A | ** | ||||||||
5246329-T-C | 5378288-T-C | 16×AC | ** | |||||||
5368361-C-T | 5500320-C-T | ** | ||||||||
5658769-G-T | 5790728-G-T | ** | ||||||||
5722965-T-G | 5854924-T-G | ** | ||||||||
5723136-A-C | 5855095-A-C | ** | ||||||||
5723240-C-A | 5855199-C-A | ** | ||||||||
5869493-C-A | 6001452-C-A | ** | ||||||||
5885994-A-T | 6017953-A-T | ** | ||||||||
5980850-C-A | 6112809-C-A | ** | ||||||||
6012928-C-A | 6144887-C-A | ** | ||||||||
6029142-T-C | 6161101-T-C | FTB32227 | ** | |||||||
6039566-C-A | 6171525-C-A | ** | ||||||||
6092334-C-A | 6224293-C-A | ** | ||||||||
6164230-A-T | 6296189-A-T | IR3_Dst | ** | |||||||
6179512-T-A | 6311471-T-A | IR3_Dst | ** | |||||||
6357950-C-T | 6489909-C-T | ** | ||||||||
6523791-A-T | 6655750-A-T | ** | ||||||||
6630595-C-A | 6762554-C-A | ** | ||||||||
6752335-TG-T | 6884294-TG-T | 8×G | ** | |||||||
6756055-C-A | 6888014-C-A | ** | ||||||||
6756429-T-C | 6888388-T-C | ** | ||||||||
6772328-C-A | 6904287-C-A | ** | ||||||||
6776169-C-T | 6908128-C-T | ** | ||||||||
6784585-A-G | 6916544-A-G | ** | ||||||||
6784591-C-A | 6916550-C-A | ** | ||||||||
6791031-C-T | 6922990-C-T | ** | ||||||||
6816723-A-G | 6948682-A-G | ** | ||||||||
6828609-C-A | 6960568-C-A | ** | ||||||||
6830594-C-A | 6962553-C-A | ** | ||||||||
6918580-T-A | 7050539-T-A | ** | ||||||||
6977149-C-A | 7109108-C-A | ** | ||||||||
6978267-G-A | 7110226-G-A | ** | ||||||||
7076335-C-A | 7208294-C-A | ** | ||||||||
7099312-T-G | 7231271-T-G | ** | ||||||||
7111741-G-T | 7243700-G-T | ** | ||||||||
7135409-GA-G | 7267368-GA-G | ** | ||||||||
7135417-G-C | 7267376-G-C | ** | ||||||||
7183781-T-A | 7315740-T-A | ** | ||||||||
7201497-G-A | 7333456-G-A | ** | ||||||||
7208193-C-A | 7340152-C-A | ** | ||||||||
7235157-C-T | 7367116-C-T | ** | ||||||||
7239453-C-A | 7371412-C-A | ** | ||||||||
7282234-G-A | 7414193-G-A | ** | ||||||||
7308200-C-A | 7440159-C-A | ** | ||||||||
7313644-T-C | 7445603-T-C | ** | ||||||||
7322902-T-G | 7454861-T-G | ** | ||||||||
7333047-C-A | 7465006-C-A | ** | ||||||||
7384827-C-A | 7516786-C-A | ** | ||||||||
7656755-G-A | 7788714-G-A | ** | ||||||||
7756294-C-A | 7888253-C-A | ** | ||||||||
8345189-G-A | 8477148-G-A | ** | ||||||||
8679325-A-G | 8811284-A-G | ** | ||||||||
8735325-C-A | 8867284-C-A | ** | ||||||||
8983017-C-T | 9145408-C-T | ** | ||||||||
8988567-C-T | 9150958-C-T | ** | ||||||||
9040411-A-G | 9202802-A-G | ** | ||||||||
9040418-C-A | 9202809-C-A | ** | ||||||||
9040420-G-C | 9202811-G-C | ** | ||||||||
9499200-A-T | 9661591-A-T | ** | ||||||||
9583299-G-T | 9745690-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9639099-T-TG | 9801490-T-TG | IR3_Prx | ** | |||||||
9639107-T-TCTGTG | 9801498-T-TCTGTG | IR3_Prx | ** | |||||||
9666614-T-TTA | 9829005-T-TTA | IR3_Prx | ** | |||||||
9983110-C-A | 10145501-C-A | ** | ||||||||
9996338-T-C | 10158729-T-C | ** | ||||||||
10032363-C-A | 10194754-C-A | ** | ||||||||
10652777-G-T | ** | |||||||||
10657471-C-A | ** | |||||||||
10659250-C-A | ** | |||||||||
10659518-A-T | ** | |||||||||
10666949-C-T | ** | |||||||||
10678020-T-C | ** | |||||||||
10682682-T-C | ** | |||||||||
10682701-T-C | ** | |||||||||
10682707-T-C | ** | |||||||||
10690779-C-A | ** | |||||||||
10690829-A-T | ** | |||||||||
10692129-C-A | ** | |||||||||
10692383-A-G | ** | |||||||||
10745028-C-A | ** | |||||||||
10745158-T-A | ** | |||||||||
10752676-A-G | ** | |||||||||
10770447-C-T | ** | |||||||||
10775837-C-A | ** | |||||||||
10776278-C-A | ** | |||||||||
10776297-G-T | ** | |||||||||
10780882-C-A | ** | |||||||||
10781343-C-A | ** | |||||||||
10786230-C-T | ** | |||||||||
10794460-A-G | ** | |||||||||
10799582-C-A | ** | |||||||||
10816582-G-C | ** | |||||||||
10821621-C-A | ** | |||||||||
10825229-C-CCTCTG | ** | |||||||||
10828766-C-G | ** | |||||||||
10839553-TTTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCCA-T | ** | |||||||||
10845713-T-A | ** | |||||||||
10851886-T-C | ** | |||||||||
10867849-C-A | ** | |||||||||
10867909-C-A | ** | |||||||||
10870284-C-A | ** | |||||||||
10870842-C-A | ** | |||||||||
10876222-A-T | ** | |||||||||
10878409-C-A | ** | |||||||||
10880867-C-A | ** | |||||||||
10884749-C-A | ** | |||||||||
10896359-ATTCCATTCCC-A | ** | |||||||||
10916023-G-T | ** | |||||||||
10927344-G-T | ** | |||||||||
10929089-A-G | ** | |||||||||
10929174-C-CAAT | ** | |||||||||
10935660-G-T | ** | |||||||||
10946866-C-A | ** | |||||||||
10946892-C-A | ** | |||||||||
10949218-T-C | ** | |||||||||
10949232-T-C | ** | |||||||||
10958801-C-A | ** | |||||||||
10958811-C-T | ** | |||||||||
10958827-ATTC-A | ** | |||||||||
10958832-A-ACAT | ** | |||||||||
10958853-T-G | ** | |||||||||
10961397-ACTC-A | ** | |||||||||
10967935-C-T | ** | |||||||||
10969259-T-C | ** | |||||||||
10977003-C-A | ** | |||||||||
10981046-C-A | ** | |||||||||
10981877-T-C | ** | |||||||||
10983065-C-A | ** | |||||||||
10983894-TAATTC-T | ** | |||||||||
10983920-CACTGCACTCT-C | ** | |||||||||
10984001-A-C | ** | |||||||||
10985287-T-C | ** | |||||||||
10986969-C-A | ** | |||||||||
10996022-TCTTTA-T | ** | |||||||||
10996033-A-C | ** | |||||||||
10996038-C-T | ** | |||||||||
10996050-A-T | ** | |||||||||
10996051-C-G | ** | |||||||||
10996054-T-C | ** | |||||||||
10996055-CGATAAG-C | ** | |||||||||
10996086-C-G | ** | |||||||||
10996093-G-C | ** | |||||||||
10997277-C-A | ** | |||||||||
11001352-C-A | ** | |||||||||
11001563-C-CCAGTG | ** | |||||||||
11001574-A-T | ** | |||||||||
11001591-C-T | ** | |||||||||
11001596-A-T | ** | |||||||||
11007904-G-T | ** | |||||||||
11017256-T-G | ** | |||||||||
11017343-C-T | ** | |||||||||
11017351-TTCCATTAAAC-T | ** | |||||||||
11022367-T-C | ** | |||||||||
11031773-C-A | ** | |||||||||
11033069-G-T | ** | |||||||||
11033107-G-T | ** | |||||||||
11033303-C-A | ** | |||||||||
11035544-C-A | ** | |||||||||
11036149-C-G | ** | |||||||||
11036159-C-A | ** | |||||||||
11036206-A-C | ** | |||||||||
11036212-C-T | ** | |||||||||
11036214-C-G | ** | |||||||||
11036215-C-A | ** | |||||||||
11036222-T-C | ** | |||||||||
11036242-T-C | ** | |||||||||
13218583-C-A | 11062907-C-A | ** | ||||||||
13226592-A-G | 11070916-A-G | ** | ||||||||
13298204-C-A | 11142528-C-A | ** | ||||||||
13307228-C-A | 11151552-C-A | ** | ||||||||
13307674-C-A | 11151998-C-A | ** | ||||||||
13323302-C-A | 11167626-C-A | ** | ||||||||
13460989-C-A | 11305313-C-A | ** | ||||||||
13469457-T-C | 11313781-T-C | ** | ||||||||
13570751-C-A | 11415075-C-A | ** | ||||||||
13587616-C-T | 11431940-C-T | ** | ||||||||
13587617-C-T | 11431941-C-T | ** | ||||||||
13587618-A-G | 11431942-A-G | ** | ||||||||
13587624-CT-C | 11431948-CT-C | ** | ||||||||
13593270-C-A | 11437594-C-A | ** | ||||||||
13602251-A-G | 11446575-A-G | ** | ||||||||
13602255-C-A | 11446579-C-A | ** | ||||||||
13637753-C-A | 11482077-C-A | ** | ||||||||
11643554-G-A | FT449691 | ** | ||||||||
11662272-A-G | ** | |||||||||
11663483-C-A | ** | |||||||||
13804112-T-C | 11683406-T-C | ** | ||||||||
13821543-C-A | 11700837-C-A | ** | ||||||||
13866154-C-G | 11745448-C-G | ** | ||||||||
13866156-A-C | 11745450-A-C | ** | ||||||||
13866167-ATTAAT-A | 11745461-ATTAAT-A | ** | ||||||||
13878712-T-C | 11758006-T-C | ** | ||||||||
13884230-T-C | 11763524-T-C | ** | ||||||||
13896808-C-A | 11776102-C-A | ** | ||||||||
13927544-C-A | 11806838-C-A | FT346050 | ** | |||||||
13936323-C-A | 11815617-C-A | ** | ||||||||
13937933-T-C | 11817227-T-C | ** | ||||||||
13968750-C-A | 11848044-C-A | ** | ||||||||
13987226-C-A | 11866520-C-A | ** | ||||||||
13993607-C-A | 11872901-C-A | ** | ||||||||
13994883-G-T | 11874177-G-T | ** | ||||||||
14017642-C-A | 11896936-C-A | ** | ||||||||
14041234-C-A | 11920528-C-A | ** | ||||||||
14055617-AC-A | 11934911-AC-A | ** | ||||||||
14080007-G-T | 11959301-G-T | ** | ||||||||
14085921-A-T | 11965215-A-T | ** | ||||||||
14099880-C-G | 11979174-C-G | ** | ||||||||
14118405-C-T | 11997699-C-T | ** | ||||||||
14163713-T-C | 12043007-T-C | ** | ||||||||
14174700-C-A | 12053994-C-A | ** | ||||||||
14179394-A-G | 12058688-A-G | ** | ||||||||
14204433-A-G | 12083727-A-G | ** | ||||||||
14270057-C-A | 12149351-C-A | ** | ||||||||
14284072-C-A | 12163366-C-A | ** | ||||||||
14284178-C-A | 12163472-C-A | ** | ||||||||
14301988-T-A | 12181282-T-A | ** | ||||||||
14427380-C-A | 12306655-C-A | FT420509 | ** | |||||||
14468359-C-A | 12347628-C-A | ** | ||||||||
14468399-A-G | 12347668-A-G | ** | ||||||||
14471770-C-A | 12351039-C-A | ** | ||||||||
14483484-C-A | 12362753-C-A | ** | ||||||||
14485299-C-T | 12364568-C-T | ** | ||||||||
14501768-T-C | 12389973-T-C | ** | ||||||||
14501792-G-A | 12389997-G-A | ** | ||||||||
14505784-A-C | 12393989-A-C | ** | ||||||||
14539556-C-A | 12427757-C-A | ** | ||||||||
14566588-C-A | 12454788-C-A | ** | ||||||||
14567189-C-A | 12455389-C-A | ** | ||||||||
14635154-G-A | 12523223-G-A | FT70912 | ** | |||||||
14649405-C-A | 12537470-C-A | ** | ||||||||
14717933-A-T | 12606001-A-T | ** | ||||||||
14722494-C-A | 12610562-C-A | ** | ||||||||
14722537-C-A | 12610605-C-A | ** | ||||||||
14726379-G-T | 12614447-G-T | ** | ||||||||
14785044-T-C | 12673114-T-C | ** | ||||||||
14960177-C-A | 12848252-C-A | ** | ||||||||
15049377-G-A | 12937468-G-A | ** | ||||||||
15084585-C-A | 12972675-C-A | FT121879 | ** | |||||||
15092592-C-A | 12980681-C-A | ** | ||||||||
15129820-G-T | 13017907-G-T | ** | ||||||||
15142194-C-A | 13030281-C-A | ** | ||||||||
15157735-G-A | 13045822-G-A | ** | ||||||||
15202237-G-T | 13090323-G-T | ** | ||||||||
15210890-T-C | 13098976-T-C | ** | ||||||||
15210893-A-C | 13098979-A-C | ** | ||||||||
15391289-C-A | 13279409-C-A | ** | ||||||||
15394855-C-A | 13282975-C-A | ** | ||||||||
15399374-C-A | 13287494-C-A | ** | ||||||||
15429602-C-A | 13317722-C-A | ** | ||||||||
15442522-C-A | 13330642-C-A | ** | ||||||||
15452315-C-A | 13340435-C-A | ** | ||||||||
15468361-C-T | 13356481-C-T | FT416045 | ** | |||||||
15574850-C-A | 13462970-C-A | ** | ||||||||
15682927-C-A | 13571047-C-A | ** | ||||||||
15698628-C-T | 13586748-C-T | ** | ||||||||
15699896-C-A | 13588016-C-A | ** | ||||||||
15728803-A-G | 13616923-A-G | ** | ||||||||
15803466-A-G | 13691586-A-G | ** | ||||||||
15823982-T-C | 13712102-T-C | Y51188 | ** | |||||||
15890319-T-G | 13778439-T-G | ** | ||||||||
15890341-A-G | 13778461-A-G | ** | ||||||||
15928648-G-A | 13816768-G-A | ** | ||||||||
15962754-T-G | 13850874-T-G | ** | ||||||||
16001644-G-T | 13889764-G-T | ** | ||||||||
16002265-G-A | 13890385-G-A | ** | ||||||||
16022663-G-T | 13910783-G-T | ** | ||||||||
16059747-T-G | 13947867-T-G | ** | ||||||||
16059845-G-T | 13947965-G-T | ** | ||||||||
16060490-C-A | 13948610-C-A | ** | ||||||||
16062314-C-A | 13950434-C-A | FTA5990 | ** | |||||||
16096085-C-A | 13984205-C-A | ** | ||||||||
16102023-GTTTTGTTTT-G | 13990143-GTTTTGTTTT-G | P8_Prx | ** | |||||||
16274146-C-A | 14162266-C-A | FT346907 | ** | |||||||
16467817-G-T | 14355937-G-T | ** | ||||||||
16479924-C-A | 14368044-C-A | ** | ||||||||
16705520-T-C | 14593640-T-C | ** | ||||||||
16705529-C-A | 14593649-C-A | ** | ||||||||
16705531-T-A | 14593651-T-A | ** | ||||||||
16745255-C-A | 14633375-C-A | ** | ||||||||
16941710-C-A | 14829830-C-A | ** | ||||||||
17043007-C-A | 14931127-C-A | ** | ||||||||
17379809-C-A | 15267929-C-A | ** | ||||||||
17402542-C-A | 15290662-C-A | ** | ||||||||
17449276-T-A | 15337396-T-A | ** | ||||||||
17481273-T-C | 15369393-T-C | ** | ||||||||
17502503-G-T | 15390623-G-T | ** | ||||||||
17545496-G-A | 15433616-G-A | ** | ||||||||
17597760-C-A | 15485880-C-A | ** | ||||||||
17639313-G-T | 15527433-G-T | FTB17771 | ** | |||||||
17641050-T-C | 15529170-T-C | ** | ||||||||
17775148-T-G | 15663268-T-G | ** | ||||||||
17812047-C-A | 15700167-C-A | ** | ||||||||
17859741-A-G | 15747861-A-G | ** | ||||||||
18006615-C-A | 15894735-C-A | P7_Gap | ** | |||||||
18071969-C-A | 15960089-C-A | FTA19603 | ** | |||||||
18089296-C-A | 15977416-C-A | ** | ||||||||
18152884-G-A | 16041004-G-A | ** | ||||||||
18191356-T-C | 16079476-T-C | ** | ||||||||
18194247-T-C | 16082367-T-C | ** | ||||||||
18212427-G-C | 16100547-G-C | ** | ||||||||
18544829-A-C | 16432949-A-C | ** | ||||||||
18580266-C-A | 16468386-C-A | ** | ||||||||
18659896-T-C | 16548016-T-C | ** | ||||||||
18687461-C-G | 16575581-C-G | ** | ||||||||
18756264-C-A | 16644384-C-A | ** | ||||||||
18789739-G-A | 16677859-G-A | ** | ||||||||
18859180-C-A | 16747300-C-A | ** | ||||||||
18925488-T-G | 16813608-T-G | ** | ||||||||
18928692-C-A | 16816812-C-A | ** | ||||||||
18974606-C-A | 16862726-C-A | ** | ||||||||
18976384-C-A | 16864504-C-A | ** | ||||||||
19062482-C-A | 16950602-C-A | ** | ||||||||
19067998-T-A | 16956118-T-A | ** | ||||||||
19075090-C-A | 16963210-C-A | ** | ||||||||
19138772-C-A | 17026892-C-A | ** | ||||||||
19246994-C-A | 17135114-C-A | ** | ||||||||
19248307-C-A | 17136427-C-A | ** | ||||||||
19299514-A-G | 17187634-A-G | ** | ||||||||
19330376-G-A | 17218496-G-A | ** | ||||||||
19330400-T-G | 17218520-T-G | ** | ||||||||
19330420-T-C | 17218540-T-C | ** | ||||||||
19330430-G-C | 17218550-G-C | ** | ||||||||
19330435-A-C | 17218555-A-C | ** | ||||||||
19465611-G-A | 17353731-G-A | ** | ||||||||
19537984-C-A | 17426104-C-A | ** | ||||||||
19547631-G-T | 17435751-G-T | ** | ||||||||
19609493-T-A | 17497613-T-A | P5_Prx | ** | |||||||
19753875-C-A | 17641995-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
20350302-CT-C | 18188416-CT-C | P5_Dst | ** | |||||||
20470424-T-C | 18308538-T-C | P5_Dst | ** | |||||||
20570275-G-A | 18408389-G-A | P5_Dst | ** | |||||||
20579337-A-G | 18417451-A-G | P5_Dst | ** | |||||||
20603856-G-T | 18441970-G-T | P5_Dst | ** | |||||||
20637682-G-T | 18475796-G-T | P4_Prx | ** | |||||||
21042142-C-A | 18880256-C-A | ** | ||||||||
21042997-C-A | 18881111-C-A | ** | ||||||||
21115825-A-G | 18953939-A-G | ** | ||||||||
21162728-C-A | 19000842-C-A | ** | ||||||||
21162970-A-T | 19001084-A-T | ** | ||||||||
21163135-A-G | 19001249-A-G | ** | ||||||||
21201328-C-A | 19039442-C-A | ** | ||||||||
21418695-G-T | 19256809-G-T | ** | ||||||||
21418788-A-G | 19256902-A-G | ** | ||||||||
21526934-C-A | 19365048-C-A | ** | ||||||||
21543204-A-T | 19381318-A-T | ** | ||||||||
21582296-G-T | 19420410-G-T | ** | ||||||||
21624566-C-A | 19462680-C-A | ** | ||||||||
21708242-G-A | 19546356-G-A | ** | ||||||||
21708247-T-C | 19546361-T-C | ** | ||||||||
21770023-A-G | 19608137-A-G | ** | ||||||||
21795500-G-C | 19633614-G-C | ** | ||||||||
21824781-C-G | 19662895-C-G | ** | ||||||||
21920654-C-A | 19758768-C-A | ** | ||||||||
21991439-G-A | 19829553-G-A | FGC58182 | ** | |||||||
22170233-G-T | 20008347-G-T | ** | ||||||||
22173498-G-T | 20011612-G-T | ** | ||||||||
22432189-T-G | 20270303-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
22436810-G-T | 20274924-G-T | DYZ19 | ** | |||||||
22779210-G-T | 20617324-G-T | ** | ||||||||
22857769-C-A | 20695883-C-A | ** | ||||||||
22864422-G-C | 20702536-G-C | ** | ||||||||
22864425-C-T | 20702539-C-T | ** | ||||||||
22880588-G-A | 20718702-G-A | ** | ||||||||
22951166-C-A | 20789280-C-A | ** | ||||||||
23005599-C-A | 20843713-C-A | ** | ||||||||
23007159-C-T | 20845273-C-T | ** | ||||||||
23007160-A-T | 20845274-A-T | ** | ||||||||
23184898-G-T | 21023012-G-T | ** | ||||||||
23185425-G-A | 21023539-G-A | FT414596 | ** | |||||||
23185980-CTTT-C | 21024094-CTTT-C | 13×T | ** | |||||||
23198383-T-G | 21036497-T-G | ** | ||||||||
23206933-C-T | 21045047-C-T | ** | ||||||||
23435826-C-A | 21273940-C-A | ** | ||||||||
23449260-T-C | 21287374-T-C | ** | ||||||||
23516597-A-G | 21354711-A-G | ** | ||||||||
23818450-G-T | 21656564-G-T | ** | ||||||||
23818485-C-G | 21656599-C-G | ** | ||||||||
24071345-C-A | 21925198-C-A | P3_b1 | ** | |||||||
24074201-A-G | 21928054-A-G | P3_b1 | ** | |||||||
25556083-C-T | 23409936-C-T | P1_gr1 | ** | |||||||
26133076-A-G | 23986929-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26167731-T-TATAC | 24021584-T-TATAC | P1_Y1 | ** | |||||||
26224235-T-A | 24078088-T-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26325354-C-A | 24179207-C-A | P1_Y1 | ** | |||||||
26427164-T-C | 24281017-T-C | P1_Y1 | ** | |||||||
27466675-G-A | 25320528-G-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27762780-C-CATATATATAT | 25616633-C-CATATATATAT | P1_Y2 | ** | |||||||
27873091-C-A | 25726944-C-A | P1_Y2 | ** | |||||||
27902215-T-A | 25756068-T-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28465939-C-A | 26319792-C-A | ** | ||||||||
28483773-A-G | 26337626-A-G | ** | ||||||||
28492879-C-A | 26346732-C-A | ** | ||||||||
28533761-G-C | 26387614-G-C | ** | ||||||||
28589283-T-C | 26443136-T-C | ** | ||||||||
28589301-G-C | 26443154-G-C | ** | ||||||||
28600353-C-A | 26454206-C-A | ** | ||||||||
28612023-TA-T | 26465876-TA-T | ** | ||||||||
28650752-C-A | 26504605-C-A | ** | ||||||||
28655316-T-C | 26509169-T-C | ** | ||||||||
28656822-C-G | 26510675-C-G | ** | ||||||||
28656855-C-A | 26510708-C-A | ** | ||||||||
28659972-C-A | 26513825-C-A | ** | ||||||||
28688954-C-A | 26542807-C-A | ** | ||||||||
28697985-C-A | 26551838-C-A | ** | ||||||||
28700740-T-C | 26554593-T-C | ** | ||||||||
28728386-C-A | 26582239-C-A | ** | ||||||||
28768575-C-A | 26622428-C-A | ** | ||||||||
56828146-C-A | ** | |||||||||
56838727-G-A | ** | |||||||||
56838732-A-G | ** | |||||||||
56875428-A-G | ** | |||||||||
16097574-T-G | 13985694-T-G | P8_Prx | ** | |||||||
3790921-T-C | 3922880-T-C | ** | ||||||||
3999856-T-TAC | 4131815-T-TAC | ** | ||||||||
19599295-C-A | 17487415-C-A | P5_Prx | ** | |||||||
23484325-T-A | 21322439-T-A | ** | ||||||||
23721615-G-A | 21559729-G-A | ** | ||||||||
18577-C-A | ** | |||||||||
8466194-A-AAAAT | 8598153-A-AAAAT | 11×AAAT | *** | |||||||
13469755-A-C | 11314079-A-C | *** | ||||||||
13647474-T-A | 11491798-T-A | *** | ||||||||
9654405-G-A | 9816796-G-A | BY30119 | IR3_Prx | *** | ||||||
13469730-C-T | 11314054-C-T | *** | ||||||||
13647495-C-T | 11491819-C-T | *** | ||||||||
14486432-CTG-C | 12365701-CTG-C | *** | ||||||||
9371480-A-G | 9533871-A-G | *** | ||||||||
58979335-TTCCACTCTACTTCTC-T | 56833188-TTCCACTCTACTTCTC-T | *** | ||||||||
18390083-C-A | 16278203-C-A | P6_Gap | 19×A | *** | ||||||
13476120-G-A | 11320444-G-A | *** | ||||||||
15882074-C-CA | 13770194-C-CA | 25×A | *** | |||||||
7167274-C-A | 7299233-C-A | Y9593 Z8758 | *** | |||||||
58979428-C-T | 56833281-C-T | *** | ||||||||
9654352-T-TAGAAAGAA | 9816743-T-TAGAAAGAA | IR3_Prx | 10×AGAA | *** | ||||||
16251740-C-A | 14139860-C-A | *** | ||||||||
8565786-AT-A | 8697745-AT-A | 10×T | *** | |||||||
13450104-CTCCACTCCACCCCATCCCATCCCATTCTATTCCAT-C,CTCCACTCCATTCCATTCCAT | 11294428-CTCCACTCCACCCCATCCCATCCCATTCTATTCCAT-C,CTCCACTCCATTCCATTCCAT | *** | *** | |||||||
20105742-TTATCTATCTATCTATC-T,TTATCTATCTATC | 17993862-TTATCTATCTATCTATC-T,TTATCTATCTATC | P5_Dst | 14×TATC | *** | ||||||
14867083-G-T | 12755153-G-T | *** | ||||||||
9654401-A-G | 9816792-A-G | IR3_Prx | *** | |||||||
14887781-G-GT | 12775847-G-GT | 9×T | *** | |||||||
19172799-G-GTT | 17060919-G-GTT | 17×T | *** | |||||||
13446531-ATTC-A | 11290855-ATTC-A | *** | ||||||||
13838447-G-A | 11717741-G-A | *** | ||||||||
15572586-GA-G | 13460706-GA-G | 9×A | *** | |||||||
58976434-C-G | 56830287-C-G | *** | ||||||||
16327271-ATT-A | 14215391-ATT-A | 14×T | *** | |||||||
10677357-ACTCCT-A,ACTCCACTACT | *** | |||||||||
14970258-C-CT | 12858333-C-CT | 10×T | *** | |||||||
10824197-CA-C | *** | |||||||||
10824214-C-T | *** | |||||||||
10824220-TCA-T | *** | |||||||||
56734787-C-T | *** | |||||||||
14316186-CTTT-C | 12195480-CTTT-C | 14×T | *** | |||||||
56734788-T-A | *** | |||||||||
10841911-C-A | *** | |||||||||
10824224-T-TTG | *** | |||||||||
10658430-C-T | *** | |||||||||
4540459-C-A | 4672418-C-A | *** | ||||||||
17321158-A-G | 15209278-A-G | *** | ||||||||
10992285-C-A | *** | |||||||||
10992318-T-G | *** | |||||||||
14771649-CTTTT-C,CTTT | 12659718-CTTTT-C,CTTT | 17×T | *** | |||||||
10746941-T-TCCGTA | *** | |||||||||
9798081-C-T | 9960472-C-T | *** | ||||||||
10662169-C-A,T | *** | |||||||||
11677416-C-A | *** | |||||||||
10992286-C-G | *** | |||||||||
10992303-T-G | *** | |||||||||
16620125-T-C | 14508245-T-C | *** | ||||||||
4241562-G-T | 4373521-G-T | *** | ||||||||
5186823-A-G | 5318782-A-G | *** | ||||||||
6664063-G-T | 6796022-G-T | *** | ||||||||
6768885-CTTTTT-C,CTTT | 6900844-CTTTTT-C,CTTT | 17×T | *** | |||||||
6903032-C-T | 7034991-C-T | *** | ||||||||
7141784-TC-T | 7273743-TC-T | *** | ||||||||
8326498-C-G | 8458457-C-G | *** | ||||||||
9079298-T-A | 9241689-T-A | *** | ||||||||
10057454-C-A | 10219845-C-A | *** | ||||||||
10658428-C-A | *** | |||||||||
10658433-C-T | *** | |||||||||
10748020-C-G | *** | |||||||||
10754782-TTTTAC-T,TTCCTCTTTAC | *** | |||||||||
10796747-C-A | *** | |||||||||
10896360-T-A | *** | |||||||||
10954686-C-A | *** | |||||||||
10969837-T-C | *** | |||||||||
11022962-A-C,T | *** | |||||||||
13236439-TACAC-T,TACACAC | 11080763-TACAC-T,TACACAC | 11×AC | *** | |||||||
13474760-G-C | 11319084-G-C | *** | ||||||||
14517362-C-A | 12405563-C-A | *** | ||||||||
15676830-G-T | 13564950-G-T | *** | ||||||||
16179695-C-A | 14067815-C-A | *** | ||||||||
16719794-C-A | 14607914-C-A | *** | ||||||||
17246709-C-A | 15134829-C-A | *** | ||||||||
17321154-A-G | 15209274-A-G | *** | ||||||||
18017142-TATATATATATACAC-T | 15905262-TATATATATATACAC-T | *** | ||||||||
18185236-C-T | 16073356-C-T | *** | ||||||||
18838757-C-A | 16726877-C-A | *** | ||||||||
19054352-T-C | 16942472-T-C | *** | ||||||||
19329468-C-T | 17217588-C-T | *** | ||||||||
19505351-T-G | 17393471-T-G | *** | ||||||||
21853412-C-A | 19691526-C-A | *** | ||||||||
22962187-ATT-A,AT | 20800301-ATT-A,AT | 14×T | *** | |||||||
23097048-T-C | 20935162-T-C | *** | ||||||||
23205057-A-T | 21043171-A-T | *** | ||||||||
24660559-G-A | 22514412-G-A | P3_b2 | *** | |||||||
26526566-G-GTT | 24380419-G-GTT | P1_Y1 | 16×T | *** | ||||||
56827751-G-C | *** | |||||||||
56835525-CCATTA-C | *** | |||||||||
13478975-T-C | 11323299-T-C | *** | ||||||||
56837272-C-T | *** | |||||||||
13488450-G-A | 11332774-G-A | *** | ||||||||
28534940-CTTT-C,CTT | 26388793-CTTT-C,CTT | 18×T | *** | |||||||
13606942-T-A | 11451266-T-A | *** | ||||||||
13478976-G-T | 11323300-G-T | *** | ||||||||
13478990-C-G | 11323314-C-G | *** | ||||||||
3967557-A-T | 4099516-A-T | *** | ||||||||
8690208-ATTTTT-A,ATT | 8822167-ATTTTT-A,ATT | 29×T | *** | |||||||
14764914-ATT-A,ATTTTT | 12652983-ATT-A,ATTTTT | 23×T | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.