Helm
FTDNA: 44592, BigY2: 44592, BigY3: 44592, YFull-BigY: YF06356Tree Position
Unique Mutations
The mutations unique to this man are summarized in the table below. Those with a '+' or '*' confidence level are considered by FamilyTreeDNA or FullGenomesCorp to be high quality SNPs/INDELs. For completeness, all other mutations of lesser confidence are included as well. These additional mutations may be useful for distinguishing between very closely related men.
Occasionally, some of the mutations listed here will be thought to be shared with other men in which case they might appear in upstream blocks on the tree. When this happens, the 'Blocks' field will indicate what block they appear in. Such a situation might arise with BigY men if the BED data suggests another man may be positive for a SNP, even though it doesn't appear in his VCF data. It might also happen if Chromo2 testing or Sanger sequencing of other men not on the tree show the SNP to be shared.
POS-REF-ALT (hg19) | POS-REF-ALT (hg38) | Blocks | Names | Region | McDonald BED | combBED | STR | FTDNA 44592 | BigY2 44592 | BigY3 44592 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
18338213-T-C | 16226333-T-C | P6_Prx | *** | A* | A* | |||||
10824193-A-C | A* | |||||||||
18712661-C-A | 16600781-C-A | Y | Y | A* | ||||||
22282405-T-A | 20120519-T-A | DYZ19 | A* | |||||||
21018971-C-CA | 18857085-C-CA | P4_Dst | 9×A | A* | ||||||
19709133-T-G | 17597253-T-G | P5_Prx | A* | |||||||
20488661-A-G | 18326775-A-G | P5_Dst | A* | |||||||
20540089-A-G | 18378203-A-G | P5_Dst | A* | |||||||
20546195-A-T | 18384309-A-T | P5_Dst | A* | |||||||
20977278-C-CT | 18815392-C-CT | P4_Dst | 8×T | A* | ||||||
25552623-C-A | 23406476-C-A | P1_gr1 | A* | |||||||
18127219-C-T | 16015339-C-T | FGC33975 | Y | Y | + | + | + | |||
7210592-T-C | 7342551-T-C | PF2438 | Y10543 Z21071 | Y | + | |||||
8343835-C-A | 8475794-C-A | FGC55735 | Y | Y | ** | + | ||||
13940818-A-C | 11820112-A-C | FT81845 | Y | ** | + | |||||
3091698-C-T | 3223657-C-T | + | ||||||||
3181978-GAGGA-G | 3313937-GAGGA-G | + | ||||||||
3321467-T-TA | 3453426-T-TA | + | ||||||||
3448111-G-A | 3580070-G-A | + | ||||||||
5776538-C-T | 5908497-C-T | + | ||||||||
6077336-A-C | 6209295-A-C | + | ||||||||
6089433-G-A | 6221392-G-A | + | ||||||||
16090843-G-A | 13978963-G-A | FT81981 | Y | + | ||||||
23092621-G-T | 20930735-G-T | FT58726 | Y | + | ||||||
56862990-A-G | + | |||||||||
13706033-AGAATGGAATG-A | 11550357-AGAATGGAATG-A | DYZ17 | 10×GAATG | * | * | |||||
10648958-TTCCATTCCAT-T,TTCCATTCCAC | * | |||||||||
10821869-TTCCAC-T | * | |||||||||
13143889-T-C | 10633375-T-C | ** | ||||||||
13936205-GAAGA-G | 11815499-GAAGA-G | 14×AAGA | ** | |||||||
13203980-T-A | 11048304-T-A | ** | ||||||||
13503619-A-G | 11347943-A-G | BY86298 | *** | ** | ** | |||||
19065642-A-C | 16953762-A-C | DF98 AMM487 | ** | |||||||
23315961-C-T | 21154075-C-T | CTS11852 M2295 | ** | |||||||
24709467-AT-A | 22563320-AT-A | P3_b2 | ** | |||||||
27336712-A-G | 25190565-A-G | P1_g3 | ** | |||||||
28580237-T-G | 26434090-T-G | ** | ||||||||
16019140-G-T | 13907260-G-T | ** | ||||||||
23311216-C-T | 21149330-C-T | ** | ||||||||
16162122-G-A | 14050242-G-A | P8_Dst | ** | |||||||
18008709-A-T | 15896829-A-T | P7_Dst | ** | |||||||
23421018-T-A | 21259132-T-A | ** | ||||||||
15871635-C-A | 13759755-C-A | ** | ||||||||
17317684-A-G | 15205804-A-G | Z1816 CTS7142 | ** | |||||||
23128617-C-A | 20966731-C-A | ** | ||||||||
8988684-C-A | 9151075-C-A | ** | ||||||||
20809476-C-A | 18647590-C-A | P4_Gap | ** | |||||||
58992400-G-A | 56846253-G-A | ** | ||||||||
16834792-T-A | 14722912-T-A | ** | ||||||||
7416723-C-A | 7548682-C-A | ** | ||||||||
2758254-C-A | 2890213-C-A | ** | ||||||||
20332015-T-A | 18170129-T-A | P5_Dst | ** | |||||||
7969346-G-T | 8101305-G-T | ** | ||||||||
18085413-A-G | 15973533-A-G | FGC82961 | ** | |||||||
3627428-C-A | 3759387-C-A | ** | ||||||||
19416642-C-A | 17304762-C-A | ** | ||||||||
13803419-C-G | 11682713-C-G | DYZ17 | ** | |||||||
15218700-C-A | 13106786-C-A | ** | ||||||||
10655096-T-C | ** | |||||||||
23954205-C-A | 21808058-C-A | ** | ||||||||
13216448-C-A | 11060772-C-A | ** | ||||||||
13885611-C-A | 11764905-C-A | ** | ||||||||
15178916-C-A | 13067002-C-A | ** | ||||||||
17876277-C-A | 15764397-C-A | Y9188 FGC1419 | ** | |||||||
19739343-C-CAAA | 17627463-C-CAAA | P5_Prx | ** | |||||||
19042661-T-C | 16930781-T-C | ** | ||||||||
24884194-G-T | 22738047-G-T | g1 | ** | |||||||
10655097-T-A | ** | |||||||||
13996070-C-A | 11875364-C-A | ** | ||||||||
22868690-C-A | 20706804-C-A | ** | ||||||||
4078642-G-T | 4210601-G-T | ** | ||||||||
10958468-C-A | ** | |||||||||
9040112-C-A | 9202503-C-A | ** | ||||||||
10937462-TTCCAA-T | ** | |||||||||
14347964-C-A | 12227259-C-A | ** | ||||||||
10892443-C-A | ** | |||||||||
10655059-T-G | ** | |||||||||
10655060-T-G | ** | |||||||||
10821867-C-A | ** | |||||||||
13975823-C-A | 11855117-C-A | ** | ||||||||
2790299-G-T | 2922258-G-T | ** | ||||||||
8314181-C-T | 8446140-C-T | ** | ||||||||
23819103-C-A | 21657217-C-A | ** | ||||||||
13631257-C-A | 11475581-C-A | ** | ||||||||
4533537-C-A | 4665496-C-A | ** | ||||||||
23009418-C-A | 20847532-C-A | ** | ||||||||
15862553-C-A | 13750673-C-A | ** | ||||||||
16605042-C-A | 14493162-C-A | ** | ||||||||
10953962-A-T | ** | |||||||||
14764903-A-T | 12652972-A-T | ** | ||||||||
16018313-C-A | 13906433-C-A | ** | ||||||||
13588783-C-A | 11433107-C-A | ** | ||||||||
23186235-T-C | 21024349-T-C | ** | ||||||||
10827948-T-A | ** | |||||||||
17363141-C-A | 15251261-C-A | ** | ||||||||
11031615-C-A | ** | |||||||||
15927734-C-A | 13815854-C-A | ** | ||||||||
8723739-C-A | 8855698-C-A | ** | ||||||||
19138606-C-A | 17026726-C-A | FT131605 | ** | |||||||
9700812-C-A | 9863203-C-A | IR3_Prx | ** | |||||||
28811870-C-A | 26665723-C-A | ** | ||||||||
11017495-G-T | ** | |||||||||
4175060-A-T | 4307019-A-T | ** | ||||||||
15218954-G-A | 13107040-G-A | ** | ||||||||
10965297-G-T | ** | |||||||||
14910792-A-G | 12798859-A-G | ** | ||||||||
23127911-C-A | 20966025-C-A | ** | ||||||||
15138103-C-A | 13026190-C-A | ** | ||||||||
8314172-A-G | 8446131-A-G | ** | ||||||||
27971717-T-A | 25825570-T-A | P1_Y2 | ** | |||||||
19206733-T-A | 17094853-T-A | ** | ||||||||
14036007-C-A | 11915301-C-A | ** | ||||||||
15576941-C-A | 13465061-C-A | ** | ||||||||
10759792-T-C | ** | |||||||||
24264571-A-C | 22118424-A-C | P3_b1 | ** | |||||||
56850722-G-T | ** | |||||||||
22167258-C-A | 20005372-C-A | ** | ||||||||
16881593-C-A | 14769713-C-A | ** | ||||||||
5221122-C-A | 5353081-C-A | ** | ||||||||
27971720-G-A | 25825573-G-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28460864-C-A | 26314717-C-A | ** | ||||||||
13953276-C-A | 11832570-C-A | ** | ||||||||
17246847-C-A | 15134967-C-A | ** | ||||||||
15735383-C-A | 13623503-C-A | A19206 | ** | |||||||
7012361-C-A | 7144320-C-A | ** | ||||||||
18937334-C-A | 16825454-C-A | ** | ||||||||
26089839-CT-C | 23943692-CT-C | P1_Y1 | ** | |||||||
28660043-T-TA | 26513896-T-TA | 8×A | ** | |||||||
17318307-C-A | 15206427-C-A | ** | ||||||||
14471769-C-A | 12351038-C-A | ** | ||||||||
28758105-C-A | 26611958-C-A | ** | ||||||||
14566580-C-A | 12454780-C-A | ** | ||||||||
5409941-C-A | 5541900-C-A | ** | ||||||||
16044783-C-A | 13932903-C-A | ** | ||||||||
8501709-C-A | 8633668-C-A | ** | ||||||||
13461159-A-T | 11305483-A-T | ** | ||||||||
22008359-C-A | 19846473-C-A | ** | ||||||||
6580073-C-T | 6712032-C-T | ** | ||||||||
21438377-C-A | 19276491-C-A | ** | ||||||||
56861100-C-A | ** | |||||||||
10693828-C-A | ** | |||||||||
9183742-G-T | 9346133-G-T | ** | ||||||||
17839844-C-A | 15727964-C-A | ** | ||||||||
4472392-C-A | 4604351-C-A | ** | ||||||||
14446651-C-A | 12325924-C-A | ** | ||||||||
23419254-C-A | 21257368-C-A | ** | ||||||||
6899-A-G | ** | |||||||||
5567848-C-A | 5699807-C-A | ** | ||||||||
14485307-G-T | 12364576-G-T | ** | ||||||||
21297757-C-A | 19135871-C-A | ** | ||||||||
13311758-C-A | 11156082-C-A | ** | ||||||||
10787531-T-C | ** | |||||||||
10821880-T-G | ** | |||||||||
16921338-C-A | 14809458-C-A | ** | ||||||||
6978230-C-A | 7110189-C-A | ** | ||||||||
16930768-G-T | 14818888-G-T | ** | ||||||||
14272914-C-A | 12152208-C-A | ** | ||||||||
14485952-C-A | 12365221-C-A | ** | ||||||||
17318286-C-A | 15206406-C-A | ** | ||||||||
3271471-C-A | 3403430-C-A | ** | ||||||||
28688366-C-A | 26542219-C-A | ** | ||||||||
17749352-C-A | 15637472-C-A | ** | ||||||||
26248116-G-A | 24101969-G-A | P1_Y1 | ** | |||||||
10812493-G-T | ** | |||||||||
21862971-C-A | 19701085-C-A | ** | ||||||||
17157589-C-A | 15045709-C-A | ** | ||||||||
2773358-G-T | 2905317-G-T | ** | ||||||||
28506786-C-A | 26360639-C-A | ** | ||||||||
21133368-C-A | 18971482-C-A | ** | ||||||||
6698957-C-A | 6830916-C-A | ** | ||||||||
7402134-C-A | 7534093-C-A | ** | ||||||||
8314192-G-C | 8446151-G-C | ** | ||||||||
5576665-C-A | 5708624-C-A | ** | ||||||||
3876139-C-A | 4008098-C-A | ** | ||||||||
9957989-C-A | 10120380-C-A | ** | ||||||||
10677321-C-A | ** | |||||||||
28514706-A-G | 26368559-A-G | ** | ||||||||
13870726-C-A | 11750020-C-A | ** | ||||||||
14300153-C-A | 12179447-C-A | ** | ||||||||
5205344-C-A | 5337303-C-A | ** | ||||||||
28496998-C-A | 26350851-C-A | ** | ||||||||
23421034-AC-A | 21259148-AC-A | ** | ||||||||
18966112-C-A | 16854232-C-A | ** | ||||||||
17104067-C-A | 14992187-C-A | ** | ||||||||
16243026-C-A | 14131146-C-A | ** | ||||||||
6923114-C-A | 7055073-C-A | ** | ||||||||
15231055-C-A | 13119141-C-A | ** | ||||||||
22356774-T-G | 20194888-T-G | DYZ19 | ** | |||||||
14564113-C-A | 12452313-C-A | ** | ||||||||
8130586-C-A | 8262545-C-A | ** | ||||||||
14499532-G-T | 12387737-G-T | ** | ||||||||
14485329-A-C | 12364598-A-C | ** | ||||||||
13975801-C-A | 11855095-C-A | ** | ||||||||
10900007-A-C | ** | |||||||||
15477290-T-C | 13365410-T-C | ** | ||||||||
11518-A-G | ** | |||||||||
14784721-TTTG-T | 12672791-TTTG-T | ** | ||||||||
17584160-A-G | 15472280-A-G | ** | ||||||||
17095277-C-A | 14983397-C-A | ** | ||||||||
7255330-T-C | 7387289-T-C | ** | ||||||||
24595385-AC-A | 22449238-AC-A | P3_t2 | ** | |||||||
10673247-C-A | ** | |||||||||
11646216-T-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11646256-T-C | DYZ17 | ** | ||||||||
7402076-C-A | 7534035-C-A | ** | ||||||||
15420163-T-A | 13308283-T-A | ** | ||||||||
21939580-C-A | 19777694-C-A | FT400613 | ** | |||||||
17300665-A-T | 15188785-A-T | ** | ||||||||
15218979-C-T | 13107065-C-T | ** | ||||||||
16971411-C-A | 14859531-C-A | ** | ||||||||
14553254-C-A | 12441455-C-A | ** | ||||||||
13309744-C-A | 11154068-C-A | ** | ||||||||
19465635-C-A | 17353755-C-A | ** | ||||||||
15220942-C-A | 13109028-C-A | ** | ||||||||
7045663-T-G | 7177622-T-G | ** | ||||||||
5858450-C-A | 5990409-C-A | ** | ||||||||
19873-G-T | ** | |||||||||
28507312-C-A | 26361165-C-A | ** | ||||||||
22659637-C-A | 20497751-C-A | ** | ||||||||
27889298-T-TAA | 25743151-T-TAA | P1_Y2 | ** | |||||||
19609518-C-T | 17497638-C-T | P5_Prx | ** | |||||||
14802978-C-A | 12691049-C-A | ** | ||||||||
14500219-C-A | 12388424-C-A | ** | ||||||||
19079126-C-A | 16967246-C-A | ** | ||||||||
18997168-C-A | 16885288-C-A | ** | ||||||||
16980085-C-A | 14868205-C-A | ** | ||||||||
17346306-C-A | 15234426-C-A | ** | ||||||||
24509309-C-A | 22363162-C-A | ** | ||||||||
10918352-G-T | ** | |||||||||
2888869-T-C | 3020828-T-C | ** | ||||||||
6773209-C-A | 6905168-C-A | ** | ||||||||
9444676-T-G | 9607067-T-G | ** | ||||||||
10922157-T-C | ** | |||||||||
10787532-T-C | ** | |||||||||
22811033-C-A | 20649147-C-A | ** | ||||||||
21162791-C-A | 19000905-C-A | ** | ||||||||
9935404-C-A | 10097795-C-A | ** | ||||||||
20587810-T-TAC | 18425924-T-TAC | P5_Dst | ** | |||||||
14549229-A-G | 12437430-A-G | ** | ||||||||
18263810-G-A | 16151930-G-A | ** | ||||||||
6756878-C-A | 6888837-C-A | ** | ||||||||
14369144-C-A | 12248440-C-A | ** | ||||||||
17735523-C-A | 15623643-C-A | ** | ||||||||
8746392-C-A | 8878351-C-A | ** | ||||||||
10673346-T-A | ** | |||||||||
6461580-C-A | 6593539-C-A | ** | ||||||||
8736862-T-A | 8868821-T-A | ** | ||||||||
16519172-C-A | 14407292-C-A | ** | ||||||||
16783372-C-A | 14671492-C-A | ** | ||||||||
22613899-C-A | 20452013-C-A | ** | ||||||||
6177565-G-T | 6309524-G-T | IR3_Dst | ** | |||||||
27507460-G-T | 25361313-G-T | P1_Y2 | ** | |||||||
14588908-G-T | 12477108-G-T | ** | ||||||||
15767101-C-A | 13655221-C-A | ** | ||||||||
20424922-C-A | 18263036-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
10818908-C-T | ** | |||||||||
16324077-C-A | 14212197-C-A | ** | ||||||||
7422356-C-A | 7554315-C-A | ** | ||||||||
17095392-C-A | 14983512-C-A | ** | ||||||||
15906476-C-A | 13794596-C-A | ** | ||||||||
10813333-T-C | ** | |||||||||
13490442-C-A | 11334766-C-A | ** | ||||||||
9700820-A-G | 9863211-A-G | IR3_Prx | ** | |||||||
10655086-T-G | ** | |||||||||
10857214-C-A | ** | |||||||||
9899471-C-A | 10061862-C-A | ** | ||||||||
14539483-C-A | 12427684-C-A | ** | ||||||||
3649092-G-T | 3781051-G-T | ** | ||||||||
13466030-G-C | 11310354-G-C | ** | ||||||||
8119231-G-T | 8251190-G-T | ** | ||||||||
4388686-G-T | 4520645-G-T | ** | ||||||||
15420166-T-A | 13308286-T-A | ** | ||||||||
16553897-C-A | 14442017-C-A | ** | ||||||||
20711550-T-TC | 18549664-T-TC | P4_Prx | ** | |||||||
24276940-A-AT | 22130793-A-AT | P3_b1 | ** | |||||||
17367798-C-A | 15255918-C-A | ** | ||||||||
17714911-C-A | 15603031-C-A | ** | ||||||||
22775142-C-A | 20613256-C-A | ** | ||||||||
10795364-C-A | ** | |||||||||
5710539-A-T | 5842498-A-T | ** | ||||||||
11009220-T-A | ** | |||||||||
14344979-T-G | 12224274-T-G | ** | ||||||||
56822584-G-T | ** | |||||||||
28461545-C-A | 26315398-C-A | ** | ||||||||
17479239-C-A | 15367359-C-A | ** | ||||||||
17774987-C-A | 15663107-C-A | ** | ||||||||
20265276-TAC-T | 18103390-TAC-T | P5_Dst | ** | |||||||
21464477-C-A | 19302591-C-A | ** | ||||||||
11657446-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
11674428-G-T | DYZ17 | ** | ||||||||
5292123-C-A | 5424082-C-A | ** | ||||||||
3092023-C-A | 3223982-C-A | ** | ||||||||
13280071-C-A | 11124395-C-A | ** | ||||||||
11521-A-G | ** | |||||||||
15379104-A-T | 13267224-A-T | ** | ||||||||
13937435-C-A | 11816729-C-A | ** | ||||||||
7132165-C-A | 7264124-C-A | ** | ||||||||
16029165-C-A | 13917285-C-A | ** | ||||||||
14768484-C-A | 12656553-C-A | ** | ||||||||
10912602-C-A | ** | |||||||||
21073270-C-A | 18911384-C-A | ** | ||||||||
2856474-AT-A | 2988433-AT-A | ** | ||||||||
2885492-A-T | 3017451-A-T | ** | ||||||||
2888859-A-G | 3020818-A-G | ** | ||||||||
2960311-A-G | 3092270-A-G | ** | ||||||||
2970428-C-T | 3102387-C-T | ** | ||||||||
2981375-C-T | 3113334-C-T | ** | ||||||||
2990535-C-A | 3122494-C-A | ** | ||||||||
3033305-C-A | 3165264-C-A | ** | ||||||||
3058943-G-T | 3190902-G-T | ** | ||||||||
3112341-T-C | 3244300-T-C | ** | ||||||||
3131807-A-G | 3263766-A-G | ** | ||||||||
3142108-G-T | 3274067-G-T | ** | ||||||||
3148508-C-A | 3280467-C-A | ** | ||||||||
3151894-G-T | 3283853-G-T | ** | ||||||||
3229723-A-C | 3361682-A-C | ** | ||||||||
3233327-C-A | 3365286-C-A | ** | ||||||||
3285867-T-A | 3417826-T-A | ** | ||||||||
3366545-A-G | 3498504-A-G | ** | ||||||||
3425742-C-T | 3557701-C-T | ** | ||||||||
3545825-C-A | 3677784-C-A | ** | ||||||||
3696589-A-C | 3828548-A-C | ** | ||||||||
3786842-C-A | 3918801-C-A | ** | ||||||||
3804382-G-A | 3936341-G-A | ** | ||||||||
3823594-A-G | 3955553-A-G | ** | ||||||||
3937247-C-A | 4069206-C-A | ** | ||||||||
4078737-G-T | 4210696-G-T | ** | ||||||||
4112401-C-A | 4244360-C-A | ** | ||||||||
4153397-G-T | 4285356-G-T | ** | ||||||||
4154264-G-T | 4286223-G-T | ** | ||||||||
4172472-T-C | 4304431-T-C | ** | ||||||||
4200205-G-T | 4332164-G-T | ** | ||||||||
4202269-C-A | 4334228-C-A | ** | ||||||||
4251581-G-T | 4383540-G-T | ** | ||||||||
4351515-A-T | 4483474-A-T | ** | ||||||||
4442517-T-C | 4574476-T-C | ** | ||||||||
4444071-T-G | 4576030-T-G | ** | ||||||||
4470421-T-A | 4602380-T-A | ** | ||||||||
4472384-C-A | 4604343-C-A | ** | ||||||||
4482024-C-A | 4613983-C-A | ** | ||||||||
4521995-GAAAA-G | 4653954-GAAAA-G | 8×A | ** | |||||||
4534217-G-T | 4666176-G-T | ** | ||||||||
4540642-C-A | 4672601-C-A | ** | ||||||||
4542010-G-T | 4673969-G-T | ** | ||||||||
4548605-C-A | 4680564-C-A | ** | ||||||||
4561499-C-T | 4693458-C-T | ** | ||||||||
4805439-C-A | 4937398-C-A | ** | ||||||||
4840655-C-A | 4972614-C-A | ** | ||||||||
5000466-C-A | 5132425-C-A | ** | ||||||||
5011578-T-C | 5143537-T-C | ** | ||||||||
5019038-C-A | 5150997-C-A | ** | ||||||||
5119729-C-A | 5251688-C-A | ** | ||||||||
5147293-T-G | 5279252-T-G | ** | ||||||||
5157780-C-A | 5289739-C-A | ** | ||||||||
5247287-C-A | 5379246-C-A | FT323232 | ** | |||||||
5274889-AT-A | 5406848-AT-A | ** | ||||||||
5401449-C-A | 5533408-C-A | ** | ||||||||
5416599-G-T | 5548558-G-T | ** | ||||||||
5449848-G-T | 5581807-G-T | ** | ||||||||
5470271-T-C | 5602230-T-C | ** | ||||||||
5576782-C-T | 5708741-C-T | FT426237 | ** | |||||||
5648595-G-T | 5780554-G-T | ** | ||||||||
5687632-C-G | 5819591-C-G | ** | ||||||||
5726341-C-A | 5858300-C-A | ** | ||||||||
5760824-C-A | 5892783-C-A | ** | ||||||||
5858240-C-A | 5990199-C-A | ** | ||||||||
5860890-C-A | 5992849-C-A | ** | ||||||||
5888329-G-T | 6020288-G-T | ** | ||||||||
5901113-C-A | 6033072-C-A | ** | ||||||||
5944734-C-A | 6076693-C-A | ** | ||||||||
5990893-G-T | 6122852-G-T | ** | ||||||||
5990911-G-T | 6122870-G-T | ** | ||||||||
6063188-G-A | 6195147-G-A | FT44939 | ** | |||||||
6076254-G-C | 6208213-G-C | ** | ||||||||
6086114-A-C | 6218073-A-C | ** | ||||||||
6147493-G-T | 6279452-G-T | IR3_Dst | ** | |||||||
6295515-T-TTC | 6427474-T-TTC | IR3_Dst | ** | |||||||
6368283-T-C | 6500242-T-C | ** | ||||||||
6387317-C-G | 6519276-C-G | ** | ||||||||
6440266-C-T | 6572225-C-T | ** | ||||||||
6461664-A-G | 6593623-A-G | ** | ||||||||
6469351-G-T | 6601310-G-T | ** | ||||||||
6682475-C-A | 6814434-C-A | ** | ||||||||
6757126-C-A | 6889085-C-A | ** | ||||||||
6858723-C-A | 6990682-C-A | ** | ||||||||
7038499-C-A | 7170458-C-A | ** | ||||||||
7108361-G-A | 7240320-G-A | ** | ||||||||
7110647-T-C | 7242606-T-C | ** | ||||||||
7217495-C-A | 7349454-C-A | ** | ||||||||
7281953-T-A | 7413912-T-A | ** | ||||||||
7299470-G-T | 7431429-G-T | ** | ||||||||
7319891-C-A | 7451850-C-A | ** | ||||||||
7335679-A-G | 7467638-A-G | ** | ||||||||
7358223-C-A | 7490182-C-A | ** | ||||||||
7418508-G-T | 7550467-G-T | ** | ||||||||
7422432-C-A | 7554391-C-A | ** | ||||||||
7446889-T-C | 7578848-T-C | IR1_L | ** | |||||||
7709623-G-T | 7841582-G-T | ** | ||||||||
7709712-G-C | 7841671-G-C | ** | ||||||||
7864221-T-C | 7996180-T-C | ** | ||||||||
7917250-C-A | 8049209-C-A | ** | ||||||||
7969186-C-T | 8101145-C-T | ** | ||||||||
7990288-G-T | 8122247-G-T | ** | ||||||||
8067472-TG-T | 8199431-TG-T | ** | ||||||||
8109796-T-C | 8241755-T-C | ** | ||||||||
8143569-C-A | 8275528-C-A | ** | ||||||||
8158964-A-T | 8290923-A-T | ** | ||||||||
8238224-A-C | 8370183-A-C | ** | ||||||||
8723949-C-A | 8855908-C-A | ** | ||||||||
8735020-C-A | 8866979-C-A | ** | ||||||||
8736847-G-A | 8868806-G-A | ** | ||||||||
8806980-A-G | 8938939-A-G | ** | ||||||||
8822449-C-T | 8954408-C-T | ** | ||||||||
8849881-C-A | 8981840-C-A | ** | ||||||||
8849916-A-C | 8981875-A-C | ** | ||||||||
9109778-C-A | ** | |||||||||
9110414-G-T | ** | |||||||||
9124346-G-T | ** | |||||||||
9030175-G-T | 9192566-G-T | ** | ||||||||
9034684-C-A | 9197075-C-A | ** | ||||||||
9421285-C-A | 9583676-C-A | ** | ||||||||
9423057-T-C | 9585448-T-C | ** | ||||||||
9444688-TC-T | 9607079-TC-T | ** | ||||||||
9444742-A-T | 9607133-A-T | ** | ||||||||
9666637-G-T | 9829028-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9700833-T-A | 9863224-T-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9732810-G-A | 9895201-G-A | IR3_Prx | ** | |||||||
9735598-G-T | 9897989-G-T | IR3_Prx | ** | |||||||
9799508-G-T | 9961899-G-T | ** | ||||||||
9936510-T-C | 10098901-T-C | ** | ||||||||
10051422-T-C | 10213813-T-C | ** | ||||||||
10655079-C-CATTAAATTCT | ** | |||||||||
10661250-C-A | ** | |||||||||
10667557-C-A | ** | |||||||||
10679089-C-A | ** | |||||||||
10684684-A-C | ** | |||||||||
10686029-A-C | ** | |||||||||
10686733-T-C | ** | |||||||||
10760228-T-C | ** | |||||||||
10773532-C-A | ** | |||||||||
10799087-C-A | ** | |||||||||
10799348-C-T | ** | |||||||||
10800896-A-C | ** | |||||||||
10811720-C-G | ** | |||||||||
10813468-C-A | ** | |||||||||
10834129-A-G | ** | |||||||||
10839671-C-G | ** | |||||||||
10841177-C-T | ** | |||||||||
10846387-G-T | ** | |||||||||
10874465-C-A | ** | |||||||||
10874485-C-A | ** | |||||||||
10880562-T-G | ** | |||||||||
10880601-T-C | ** | |||||||||
10884739-C-A | ** | |||||||||
10902339-T-G | ** | |||||||||
10907414-C-A | ** | |||||||||
10921976-TC-T | ** | |||||||||
10922454-C-A | ** | |||||||||
10925688-C-G | FT436764 | ** | ||||||||
10969771-T-C | ** | |||||||||
10988039-C-T | ** | |||||||||
10991419-A-C | ** | |||||||||
10998930-TC-T | ** | |||||||||
11001950-C-G | ** | |||||||||
11003093-A-G | ** | |||||||||
11003145-G-T | ** | |||||||||
11012207-A-C | ** | |||||||||
11013093-T-A | ** | |||||||||
11019377-T-C | ** | |||||||||
11030321-A-C | ** | |||||||||
13196666-C-A | 11040990-C-A | ** | ||||||||
13223300-A-G | 11067624-A-G | ** | ||||||||
13257593-T-A | 11101917-T-A | ** | ||||||||
13276632-A-T | 11120956-A-T | ** | ||||||||
13352521-A-G | 11196845-A-G | ** | ||||||||
13441974-C-A | 11286298-C-A | ** | ||||||||
13469415-G-T | 11313739-G-T | ** | ||||||||
13523689-A-G | 11368013-A-G | ** | ||||||||
13601037-T-A | 11445361-T-A | ** | ||||||||
13637767-C-A | 11482091-C-A | ** | ||||||||
11653513-A-T | DYZ17 | ** | ||||||||
11664691-C-A | DYZ17 | ** | ||||||||
13860396-A-T | 11739690-A-T | DYZ17 | ** | |||||||
13860426-A-T | 11739720-A-T | DYZ17 | ** | |||||||
13919259-A-C | 11798553-A-C | ** | ||||||||
13921697-A-G | 11800991-A-G | ** | ||||||||
13940326-C-A | 11819620-C-A | ** | ||||||||
13958861-G-T | 11838155-G-T | ** | ||||||||
13958969-G-T | 11838263-G-T | ** | ||||||||
14015379-A-G | 11894673-A-G | ** | ||||||||
14054004-G-A | 11933298-G-A | ** | ||||||||
14105215-C-A | 11984509-C-A | ** | ||||||||
14174651-C-T | 12053945-C-T | ** | ||||||||
14228772-T-C | 12108066-T-C | ** | ||||||||
14316398-C-A | 12195692-C-A | ** | ||||||||
14390005-A-G | 12269301-A-G | ** | ||||||||
14421373-C-T | 12300648-C-T | ** | ||||||||
14461303-C-T | 12340576-C-T | ** | ||||||||
14463589-T-G | 12342862-T-G | ** | ||||||||
14463595-T-C | 12342868-T-C | ** | ||||||||
14463621-T-C | 12342894-T-C | ** | ||||||||
14468022-C-A | 12347291-C-A | ** | ||||||||
14468838-G-C | 12348107-G-C | ** | ||||||||
14468844-A-T | 12348113-A-T | ** | ||||||||
14485330-T-G | 12364599-T-G | ** | ||||||||
14485338-T-C | 12364607-T-C | ** | ||||||||
14518856-C-T | 12407057-C-T | ** | ||||||||
14530651-G-T | 12418852-G-T | ** | ||||||||
14588944-G-T | 12477144-G-T | ** | ||||||||
14679052-A-T | 12567118-A-T | ** | ||||||||
14815910-T-C | 12703981-T-C | ** | ||||||||
14960518-C-A | 12848593-C-A | ** | ||||||||
15034909-A-T | 12922997-A-T | ** | ||||||||
15073292-T-C | 12961382-T-C | ** | ||||||||
15168768-T-C | 13056854-T-C | ** | ||||||||
15218978-T-C | 13107064-T-C | ** | ||||||||
15259281-A-AC | 13147365-A-AC | ** | ||||||||
15288858-C-A | 13176957-C-A | ** | ||||||||
15420186-T-A | 13308306-T-A | ** | ||||||||
15422936-C-A | 13311056-C-A | ** | ||||||||
15599371-A-C | 13487491-A-C | ** | ||||||||
15606635-C-A | 13494755-C-A | ** | ||||||||
15619014-A-G | 13507134-A-G | ** | ||||||||
15773511-C-A | 13661631-C-A | ** | ||||||||
15832291-G-T | 13720411-G-T | ** | ||||||||
15873470-C-A | 13761590-C-A | ** | ||||||||
15889264-G-T | 13777384-G-T | ** | ||||||||
15893602-A-G | 13781722-A-G | ** | ||||||||
15936733-C-A | 13824853-C-A | ** | ||||||||
16028377-CCGCTAA-C | 13916497-CCGCTAA-C | ** | ||||||||
16033612-C-A | 13921732-C-A | ** | ||||||||
16070834-G-T | 13958954-G-T | ** | ||||||||
16162122-G-GA | 14050242-G-GA | P8_Dst | ** | |||||||
16162133-T-TG | 14050253-T-TG | P8_Dst | ** | |||||||
16199669-G-A | 14087789-G-A | ** | ||||||||
16214309-G-T | 14102429-G-T | ** | ||||||||
16241709-A-C | 14129829-A-C | ** | ||||||||
16271141-C-A | 14159261-C-A | ** | ||||||||
16344951-G-A | 14233071-G-A | ** | ||||||||
16351631-C-A | 14239751-C-A | ** | ||||||||
16411135-C-A | 14299255-C-A | ** | ||||||||
16411166-C-A | 14299286-C-A | ** | ||||||||
16475286-C-A | 14363406-C-A | ** | ||||||||
16624561-G-T | 14512681-G-T | ** | ||||||||
16882981-G-T | 14771101-G-T | ** | ||||||||
16942145-G-A | 14830265-G-A | ** | ||||||||
16981163-G-C | 14869283-G-C | ** | ||||||||
17046742-AG-T | 14934862-AG-T | ** | ||||||||
17065143-C-T | 14953263-C-T | ** | ||||||||
17130508-T-G | 15018628-T-G | ** | ||||||||
17201786-A-T | 15089906-A-T | ** | ||||||||
17211577-C-A | 15099697-C-A | ** | ||||||||
17231408-A-T | 15119528-A-T | ** | ||||||||
17300634-C-A | 15188754-C-A | ** | ||||||||
17306733-G-T | 15194853-G-T | ** | ||||||||
17315182-A-G | 15203302-A-G | ** | ||||||||
17504314-G-A | 15392434-G-A | FTA53601 | ** | |||||||
17538940-A-T | 15427060-A-T | ** | ||||||||
17597989-G-A | 15486109-G-A | ** | ||||||||
17716788-G-T | 15604908-G-T | ** | ||||||||
17804421-C-A | 15692541-C-A | ** | ||||||||
17812461-G-T | 15700581-G-T | ** | ||||||||
17884711-G-T | 15772831-G-T | ** | ||||||||
18183388-C-A | 16071508-C-A | ** | ||||||||
18190452-G-T | 16078572-G-T | ** | ||||||||
18238964-G-A | 16127084-G-A | ** | ||||||||
18255883-C-A | 16144003-C-A | FTB62481 | ** | |||||||
18328826-A-T | 16216946-A-T | P6_Prx | ** | |||||||
18660164-T-G | 16548284-T-G | ** | ||||||||
18703170-T-C | 16591290-T-C | ** | ||||||||
18728709-T-C | 16616829-T-C | ** | ||||||||
18733668-C-T | 16621788-C-T | ** | ||||||||
19146600-G-T | 17034720-G-T | ** | ||||||||
19202926-CTCA-C | 17091046-CTCA-C | ** | ||||||||
19302342-A-G | 17190462-A-G | ** | ||||||||
19328484-A-T | 17216604-A-T | ** | ||||||||
19340289-G-A | 17228409-G-A | ** | ||||||||
19375511-G-A | 17263631-G-A | ** | ||||||||
19416418-AC-A | 17304538-AC-A | ** | ||||||||
19546389-A-C | 17434509-A-C | ** | ||||||||
19555560-G-A | 17443680-G-A | ** | ||||||||
19853770-C-T | 17741890-C-T | P5_Prx | ** | |||||||
20128363-C-A | 18016483-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
20294266-C-A | 18132380-C-A | P5_Dst | ** | |||||||
20404490-C-T | 18242604-C-T | P5_Dst | ** | |||||||
20587792-GT-G | 18425906-GT-G | P5_Dst | ** | |||||||
20666893-A-AT | 18505007-A-AT | P4_Prx | ** | |||||||
20825589-TCAA-T | 18663703-TCAA-T | P4_Gap | ** | |||||||
21162318-A-G | 19000432-A-G | ** | ||||||||
21206886-C-A | 19045000-C-A | ** | ||||||||
21283398-G-A | 19121512-G-A | ** | ||||||||
21381992-G-A | 19220106-G-A | ** | ||||||||
21422145-A-G | 19260259-A-G | ** | ||||||||
21427710-G-T | 19265824-G-T | ** | ||||||||
21575051-G-T | 19413165-G-T | ** | ||||||||
21589481-T-A | 19427595-T-A | ** | ||||||||
21677085-C-A | 19515199-C-A | ** | ||||||||
21709170-A-C | 19547284-A-C | ** | ||||||||
21775130-G-T | 19613244-G-T | ** | ||||||||
21874818-A-T | 19712932-A-T | ** | ||||||||
22055480-G-A | 19893594-G-A | ** | ||||||||
22068667-T-C | 19906781-T-C | ** | ||||||||
22097145-T-C | 19935259-T-C | ** | ||||||||
22175944-C-G | 20014058-C-G | ** | ||||||||
22188945-C-A | 20027059-C-A | ** | ||||||||
22208915-T-C | 20047029-T-C | ** | ||||||||
22263608-G-C | 20101722-G-C | DYZ19 | ** | |||||||
22356768-C-T | 20194882-C-T | DYZ19 | ** | |||||||
22613869-C-A | 20451983-C-A | ** | ||||||||
22613917-T-G | 20452031-T-G | ** | ||||||||
22857490-A-G | 20695604-A-G | ** | ||||||||
22857505-A-T | 20695619-A-T | ** | ||||||||
22884983-A-G | 20723097-A-G | ** | ||||||||
23029906-T-G | 20868020-T-G | ** | ||||||||
23127675-A-C | 20965789-A-C | ** | ||||||||
23144066-C-A | 20982180-C-A | ** | ||||||||
23184345-G-T | 21022459-G-T | ** | ||||||||
23277335-T-G | 21115449-T-G | ** | ||||||||
23377426-C-A | 21215540-C-A | ** | ||||||||
23438978-C-T | 21277092-C-T | ** | ||||||||
23570306-C-A | 21408420-C-A | ** | ||||||||
23773667-G-A | 21611781-G-A | ** | ||||||||
24402446-C-A | 22256299-C-A | ** | ||||||||
24433063-A-G | 22286916-A-G | ** | ||||||||
24447063-G-T | 22300916-G-T | ** | ||||||||
24450499-T-G | 22304352-T-G | ** | ||||||||
24458644-T-G | 22312497-T-G | ** | ||||||||
24595348-C-A | 22449201-C-A | P3_t2 | ** | |||||||
24614207-C-T | 22468060-C-T | P3_t2 | ** | |||||||
24636470-T-A | 22490323-T-A | P3_t2 | ** | |||||||
26100424-A-G | 23954277-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26153795-G-T | 24007648-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
26248129-T-G | 24101982-T-G | P1_Y1 | ** | |||||||
27398494-G-A | 25252347-G-A | P1_g3 | ** | |||||||
27757444-G-A | 25611297-G-A | P1_Y2 | ** | |||||||
28493699-A-C | 26347552-A-C | ** | ||||||||
28515301-C-A | 26369154-C-A | ** | ||||||||
28517314-C-T | 26371167-C-T | ** | ||||||||
28556249-G-A | 26410102-G-A | ** | ||||||||
28561873-A-G | 26415726-A-G | ** | ||||||||
28614707-G-A | 26468560-G-A | ** | ||||||||
28633116-A-G | 26486969-A-G | ** | ||||||||
28650639-C-A | 26504492-C-A | ** | ||||||||
28650655-A-G | 26504508-A-G | ** | ||||||||
28659908-A-G | 26513761-A-G | ** | ||||||||
28709064-T-C | 26562917-T-C | ** | ||||||||
28730355-C-A | 26584208-C-A | ** | ||||||||
28798107-G-A | 26651960-G-A | ** | ||||||||
56824026-T-TA | 11×A | ** | ||||||||
56828163-A-G | ** | |||||||||
56838580-C-A | ** | |||||||||
56858292-G-T | ** | |||||||||
10648924-CCCATTCCATT-C | ** | |||||||||
6236014-G-T | 6367973-G-T | IR3_Dst | ** | |||||||
6268803-T-G | 6400762-T-G | IR3_Dst | ** | |||||||
7223154-C-T | 7355113-C-T | ** | ||||||||
20242533-A-C | 18080647-A-C | P5_Dst | ** | |||||||
26092581-A-G | 23946434-A-G | P1_Y1 | ** | |||||||
26336742-G-T | 24190595-G-T | P1_Y1 | ** | |||||||
13452778-C-T | 11297102-C-T | *** | ||||||||
20769010-CA-C | 18607124-CA-C | P4_Prx | 10×A | *** | ||||||
13820829-GATTCT-G | 11700123-GATTCT-G | DYZ17 | *** | |||||||
13821116-A-G | 11700410-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
22309920-C-T | 20148034-C-T | DYZ19 | *** | |||||||
13839623-ATGGAATGCAT-A | 11718917-ATGGAATGCAT-A | DYZ17 | *** | |||||||
13680891-T-C | 11525215-T-C | DYZ17 | *** | |||||||
13839679-T-A | 11718973-T-A | DYZ17 | *** | |||||||
28785682-GAATTT-G | 26639535-GAATTT-G | *** | ||||||||
13799389-T-G | 11678683-T-G | DYZ17 | *** | |||||||
13799394-T-G | 11678688-T-G | DYZ17 | *** | |||||||
13799405-G-T | 11678699-G-T | DYZ17 | *** | |||||||
13799406-A-C | 11678700-A-C | DYZ17 | *** | |||||||
13799415-A-G | 11678709-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
13799420-T-G | 11678714-T-G | DYZ17 | *** | |||||||
13822074-G-A | 11701368-G-A | DYZ17 | 6×ATGGA | *** | ||||||
13686917-G-GGATCC | 11531241-G-GGATCC | DYZ17 | *** | |||||||
13851142-C-A | 11730436-C-A | DYZ17 | *** | |||||||
13858600-T-A,G | 11737894-T-A,G | DYZ17 | *** | |||||||
10020969-C-G | 10183360-C-G | *** | ||||||||
13446711-A-T | 11291035-A-T | *** | ||||||||
13686897-C-T | 11531221-C-T | FT448434 | DYZ17 | *** | ||||||
13689189-A-T | 11533513-A-T | DYZ17 | *** | |||||||
13697797-A-G | 11542121-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
13842115-G-A | 11721409-G-A | FT236411 | DYZ17 | *** | ||||||
13140267-A-C | 10629753-A-C | *** | ||||||||
13140285-C-A | 10629771-C-A | *** | ||||||||
13838905-C-G | 11718199-C-G | DYZ17 | *** | |||||||
13858015-C-G | 11737309-C-G | DYZ17 | *** | |||||||
18378959-C-CT | 16267079-C-CT | P6_Prx | 28×T | *** | ||||||
13455699-T-C | 11300023-T-C | *** | ||||||||
13833892-C-G | 11713186-C-G | FGC71501 | DYZ17 | *** | ||||||
13699231-G-A | 11543555-G-A | BY88985 | DYZ17 | *** | ||||||
13820793-G-C | 11700087-G-C | DYZ17 | *** | |||||||
13842119-T-A | 11721413-T-A | DYZ17 | *** | |||||||
13832647-C-G | 11711941-C-G | DYZ17 | *** | |||||||
21477223-CTTA-C,CTTC | 19315337-CTTA-C,CTTC | *** | ||||||||
13802865-G-A | 11682159-G-A | DYZ17 | *** | |||||||
28787346-G-A | 26641199-G-A | 5×TGGAA | *** | |||||||
13869549-T-C,G | 11748843-T-C,G | DYZ17 | *** | |||||||
13843697-A-G | 11722991-A-G | DYZ17 | *** | |||||||
9932478-T-C | 10094869-T-C | *** | ||||||||
13664661-A-G | 11508985-A-G | BY44465 | DYZ17 | *** | ||||||
13676708-C-G | 11521032-C-G | DYZ17 | *** | |||||||
13799400-G-A | 11678694-G-A | DYZ17 | *** | |||||||
13820806-A-C | 11700100-A-C | DYZ17 | *** | |||||||
13846224-T-A,TG | 11725518-T-A,TG | DYZ17 | 11×GAATG | *** | ||||||
15255771-T-G | 13143857-T-G | BY1159 BY1160 | *** | |||||||
16482281-GTA-G,GT | 14370401-GTA-G,GT | 11×TA | *** | |||||||
22222736-A-C | 20060850-A-C | DYZ19 | *** | |||||||
22464147-G-T | 20302261-G-T | BY43920 | DYZ19 | *** | ||||||
22502903-G-C | 20341017-G-C | DYZ19 | *** | |||||||
24169212-CA-C | 22023065-CA-C | P3_b1 | *** | |||||||
58976934-T-TTCCAC | 56830787-T-TTCCAC | *** | ||||||||
58977013-T-A,G | 56830866-T-A,G | *** | ||||||||
13140275-T-A,C | 10629761-T-A,C | *** | ||||||||
13453613-CTTTTA-C,CATTCCATTCCATTCCATTCC | 11297937-CTTTTA-C,CATTCCATTCCATTCCATTCC | *** | ||||||||
13450318-T-C,G | 11294642-T-C,G | *** | ||||||||
13846205-T-C,G | 11725499-T-C,G | DYZ17 | *** | |||||||
17281991-TGATA-T,TG | 15170111-TGATA-T,TG | 7×GATA | *** | |||||||
10973924-A-C | *** | |||||||||
5172082-C-A | 5304041-C-A | *** | ||||||||
9029736-CTTTT-C | 9192127-CTTTT-C | 16×T | *** | |||||||
7148013-CTTTT-C | 7279972-CTTTT-C | 17×T | *** | |||||||
17315561-C-A | 15203681-C-A | *** | ||||||||
14252203-C-A | 12131497-C-A | *** | ||||||||
13449753-CAACCC-T | 11294077-CAACCC-T | *** | ||||||||
21946458-T-A | 19784572-T-A | *** | ||||||||
56836683-T-A,C | *** | |||||||||
10866051-C-A | *** | |||||||||
7240728-C-A | 7372687-C-A | *** | ||||||||
11031607-A-T | *** | |||||||||
3834951-G-A | 3966910-G-A | *** | ||||||||
15320737-C-A | 13208855-C-A | *** | ||||||||
10912412-C-A | *** | |||||||||
15250853-C-A | 13138939-C-A | *** | ||||||||
23098795-T-G | 20936909-T-G | *** | ||||||||
14065936-C-A | 11945230-C-A | *** | ||||||||
8321481-A-T | 8453440-A-T | *** | ||||||||
21323321-C-A | 19161435-C-A | *** | ||||||||
13880896-C-A | 11760190-C-A | *** | ||||||||
4557454-C-A | 4689413-C-A | *** | ||||||||
19529470-C-A | 17417590-C-A | *** | ||||||||
11022935-T-G | *** | |||||||||
10057311-C-A | 10219702-C-A | *** | ||||||||
6085417-C-A | 6217376-C-A | *** | ||||||||
21642856-ATGTG-A,ATG | 19480970-ATGTG-A,ATG | 16×TG | *** | |||||||
22028771-C-A | 19866885-C-A | *** | ||||||||
9524019-GTA-G,GTATA | 9686410-GTA-G,GTATA | 21×TA | *** | |||||||
19429712-C-A | 17317832-C-A | *** | ||||||||
15497348-C-A | 13385468-C-A | *** | ||||||||
6839731-C-A | 6971690-C-A | *** | ||||||||
10671068-C-A | *** | |||||||||
7142815-G-A | 7274774-G-A | *** | ||||||||
56828975-C-A,T | *** | |||||||||
4336695-ATTT-A | 4468654-ATTT-A | 30×T | *** | |||||||
8078643-G-T | 8210602-G-T | *** | ||||||||
7218363-T-C | 7350322-T-C | *** | ||||||||
7543789-TC-T | 7675748-TC-T | *** | ||||||||
9029920-G-T | 9192311-G-T | *** | ||||||||
9139837-C-A | 9302228-C-A | *** | ||||||||
10004855-G-T | 10167246-G-T | *** | ||||||||
10654422-C-A | *** | |||||||||
14424855-C-A | 12304130-C-A | *** | ||||||||
14588877-A-T | 12477077-A-T | *** | ||||||||
15197539-C-A | 13085625-C-A | *** | ||||||||
15791571-T-A | 13679691-T-A | *** | ||||||||
16482281-GTATATA-G,GTATA | 14370401-GTATATA-G,GTATA | 11×TA | *** | |||||||
17362681-T-C | 15250801-T-C | *** | ||||||||
17405805-C-A | 15293925-C-A | *** | ||||||||
17440856-G-T | 15328976-G-T | *** | ||||||||
17504239-A-C | 15392359-A-C | *** | ||||||||
17511998-C-A | 15400118-C-A | *** | ||||||||
18185271-T-A | 16073391-T-A | *** | ||||||||
18185272-A-T | 16073392-A-T | *** | ||||||||
18336154-C-A | 16224274-C-A | P6_Prx | *** | |||||||
20326036-TGCA-T,TGTT | 18164150-TGCA-T,TGTT | P5_Dst | *** | |||||||
21211953-C-A | 19050067-C-A | *** | ||||||||
22085557-C-A | 19923671-C-A | *** | ||||||||
22166535-CTTTTTTTT-C,CTTT | 20004649-CTTTTTTTT-C,CTTT | 29×T | *** | |||||||
22281793-C-A | 20119907-C-A | DYZ19 | *** | |||||||
56835303-C-A | *** | |||||||||
56835342-A-T | *** | |||||||||
56846405-G-T | *** | |||||||||
15865946-CTTTTTTT-C | 13754066-CTTTTTTT-C | 37×T | *** | |||||||
8093510-A-G | 8225469-A-G | *** | ||||||||
9866368-A-G | 10028759-A-G | *** | ||||||||
15491870-T-TAA | 13379990-T-TAA | *** | ||||||||
15658945-T-C | 13547065-T-C | *** |
In the table above, the meaning of the confidence field depends on whether the data comes from an FTDNA kit or an FGC kit. For FTDNA kits, + implies a "PASS" result with just one possible variant, * indicates a "PASS" but with multiple variants, ** indicates "REJECTED" with just a single variant, and *** indicates "REJECTED" with multiple possible variants. 'A*' are heterozygous variants not called by FTDNA, but still pulled from the VCF file. For FGC kits, + indicates over 99% likely genuine (95% for INDELs); * over 95% likely genuine (90% for INDELs); ** about 40% likely genuine; *** about 10% likely genuine. Manual entries read directly from a BAM file will be either + indicating positive, or * indicating that the data show a mixture of possible variants.
For the FTDNA kits, the BED data is encoded in the background color of the cells. Those cells with a white background have coverage, those with a grey background indicate no coverage in the BED file, and those with a pink background indicate the mutation is on the edge of a coverage region. These pink regions often indicate that the individual may be positive for a SNP even if there is no corresponding entry in the vcf file.
The combBED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the combBED region defined in Defining a New Rate Constant for Y-Chromosome SNPs based on Full Sequencing Data by Dmitry Adamov, Vladimir Guryanov, Sergey Karzhavin, Vladimir Tagankin, Vadim Urasin.
The McDonald BED column indicates whether or not the mutation is a SNP and falls in the BED region used by Dr. Iain McDonald in the age analysis he does for R-U106 men.